Effect of the Functional Diversity of Communities of Herbivorous Insects on the Diversity and Functioning of a Grassland Ecosystem Hélène Deraison
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Effect of the functional diversity of communities of herbivorous insects on the diversity and functioning of a grassland ecosystem Hélène Deraison To cite this version: Hélène Deraison. Effect of the functional diversity of communities of herbivorous insects onthe diversity and functioning of a grassland ecosystem. Sciences de l’environnement. UNIVERSITE DE POITIERS, 2014. Français. tel-01360659 HAL Id: tel-01360659 https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01360659 Submitted on 13 Feb 2020 HAL is a multi-disciplinary open access L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est archive for the deposit and dissemination of sci- destinée au dépôt et à la diffusion de documents entific research documents, whether they are pub- scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, lished or not. 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THESE Pour l’obtention du Grade de DOCTEUR DE L’UNIVERSITE DE POITIERS Faculté des sciences fondamentales et appliquées (Diplôme National – Arrêté du 7 aout 2006) Ecole doctorale : Sciences pour l’environnement Gay Lussac Secteur de recherche : Biologie de l’environnement, des populations, écologie Présentée par : Hélène DERAISON Effet de la diversité fonctionnelle de communautés d’insectes herbivores sur la diversité et le fonctionnement d’un écosystème prairial Directrice de thèse : Isabelle Badenhausser Co-Directeur de thèse : Nicolas Gross Effectuée au Centre D’études Biologiques de Chizé - Equipe AGRIPOP Soutenue le 16 décembre 2014 devant la commission d’examen : David BOHAN, Directeur de recherches, INRA de Dijon Rapporteur Hervé JACTEL, Directeur de recherches, INRA de Bordeaux Rapporteur Marco MORETTI, Directeur de recherches, Swiss Federal Research Institute WSL Rapporteur Didier BOUCHON, Professeur, Université de Poitiers Examinateur Sébastien IBANEZ, Maitre de conférences, Université de Savoie Examinateur Richard MICHALET, Professeur, Université de Bordeaux 1 Examinateur Isabelle BADENHAUSSER, Ingénieur de recherches, INRA-CEB Chizé Directrice Nicolas GROSS, Chargé de recherches, INRA-CEB Chizé Co-Directeur Cette thèse a été conduite au Centre d’Etudes Biologiques de Chizé (Unité Mixte de Recherche 7372 du Centre National de la Recherche Scientifique et de l’Université de La Rochelle), dans l’équipe Agripop, grâce au soutien financier de la Région Poitou-Charentes, et de l’Institut National de la Recherche Agronomique. Cette thèse a été effectuée dans l’Ecole Doctorale Gay Lussac - Sciences pour l'environnement, et l’Université de Poitiers (département Sciences Fondamentales et Appliquées). REMERCIEMENTS Je tiens tout d’abord à remercier les membres de mon jury de thèse : David Bohan, Hervé Jactel, Marco Moretti, Didier Bouchon, Sébastien Ibanez et Richard Michalet, pour le temps que vous m’avez accordé afin d’examiner mon travail. Merci aux membres de mon comité de thèse : Christophe Scherber, Nicolas Loeuille, Juliette Bloor, Pierre Liancourt et Cyrille Violle pour l’intérêt que vous avez porté à mon travail, et pour votre aide précieuse afin de cadrer mon sujet de thèse. Les échanges que nous avons eus autour de la manip criquets furent enrichissants. Un remerciement particulier à Christoph Scherber, Nicolas Loeuille et Pierre Liancourt pour la relecture de mon premier article. Je tiens tout particulièrement à remercier mes directeurs de thèse Isabelle Badenhausser et Nicolas Gross. Merci à Nicolas pour ton aide et ta patience ; pour l’énergie positive transmise au quotidien, et pour ton encadrement qui a été stimulant et encourageant. Merci à Isabelle : ta rigueur, ta précision, et ton expérience m’ont inspirée, notamment dans l’initiation au monde des criquets que tu connais tant. Merci à tous les deux pour votre disponibilité, votre aide sur le terrain et pour votre investissement dans le bon déroulement de cette thèse. Merci à Vincent Bretagnolle de m’avoir accueillie en stage de M2 au CEBC et de m’avoir initiée au monde la recherche. Merci également pour l’opportunité que tu m’as donnée en me permettant de rester au CEBC après mon stage. J’ai ainsi pu découvrir le « terrain », si prépondérant dans le déroulement d’une thèse. Sans ton investissement, ce doctorat n’aurait pu avoir lieu. Merci à Patrick Ducan, Bertrand Gauffre, Sylvie Houte, et David Pinaud pour les échanges intéressants et constructifs durant les séminaires. Merci à Luca Börger pour tes conseils, ton positivisme et de m’avoir apporté tes connaissances en statistiques. Merci à Philippe Barre, Corinne Melun, Catherine Leveque et Nathalie Moynet pour votre accueil à L’INRA de Lusignan. Votre aide dans la réalisation et l’explication des protocoles de mesures de carbone et d’azote foliaires fût déterminante. Merci tout simplement pour votre gentillesse et votre investissement. Merci aussi à Fernando Maestre de m’avoir accueillie pendant quelques semaines au sein de son laboratoire afin de réaliser les protocoles d’analyse de sol de la manip criquets. Merci pour ces échanges qui donneront de belles perspectives à cette manip. Un grand merci à Vicky, Dani, Bea et Enrique pour votre incroyable gentillesse et votre accueil si chaleureux. Merci pour votre aide et votre investissement dans la réalisation des nombreux protocoles que j’ai eus à faire en peu de temps. Une pensée particulière pour Vicky et Dario avec qui j’ai visité Madrid. Merci également aux thésards du labo pour votre bonne humeur pendant ces quelques semaines et pour cette soirée « Madrid by night ». Sans oublier toutes les personnes qui ont participé au bon déroulement de la manip criquets : Merci à Valérie Bost de nous avoir fourni la prairie expérimentale. Un grand merci à Louis pour ton aide et ton investissement notamment lors de la première année d’expérimentation alors que je découvrais l’ampleur de la tâche qui m’attendait. Merci aussi d’avoir veillé au bon déroulement de la manip en deuxième année alors que je devais me concentrer sur la rédaction de mon premier article. Merci à Marilyn et Nadine pour votre savoir-faire technique et votre expérience qui n’ont pas de prix. Un merci particulier à Marilyn pour les prélèvements de criquets et pour ton aide dans leur identification. Merci à Nadine pour ton aide dans les mesures de traits de plantes. 5 Merci à Edo pour les comptages et les pesées de criquets et pour les broyages d’échantillons et de feuilles de plantes. Merci à Gaëtane pour ton aide précieuse dans la manip criquets. Merci aussi pour ces passages en « coups de vent » dans le bureau, toujours réconfortants. C’était également un plaisir et une fierté d’encadrer ton stage de M2. Merci aussi à Edouard, Yannick, Nicolas S., Adrien et Vincent C. pour votre aide dans l’installation et la désinstallation des cages de la manip. Merci aux membres de l’atelier : Simon, Christian et Patrice pour vos nombreux coups de main, et pour la fabrication du matériel terrain, souvent dans l’urgence ! Un immense merci à vous tous d’avoir accepté de vous « plier en quatre » et de passer de longues journées en pleine chaleur ou sous la pluie à compter et prélever les criquets, à passer l’aspirateur et mettre du scotch dans les cages ou encore à prélever de la biomasse... Sans vous cette manip n’aurait jamais fonctionné aussi bien ! Merci à Orianne pour ton amitié depuis le M2. Merci pour ton positivisme et ton énergie encourageants. C’est toujours un plaisir de se remémorer la vie Chizéenne que j’ai découverte à tes côtés, la vie en communauté, le terrain et les rencontres que nous avons faites. Avec toi, c’est toujours des fous rires garantis accompagnés parfois d’un peu de mélancolie. Merci aussi pour ton aide pendant ces quelques soirées d’été à photographier des feuilles de plantes pour les mesures de traits. Quelle efficacité ce soir-là, on aurait fait un bon binôme sur le terrain !!! Un grand merci à Ronan, mon collègue de bureau et ami ! Merci pour ton soutien, pour toutes ces conversations enrichissantes que nous avons eues pendant trois ans. Je n’oublierai pas les Chansons Du Jour que nous avons partagées pendant un an, qui égayaient notre quotidien et qui vont faire un bel album souvenir ! Les longs échanges sur nos analyses de données ont constitué un partage d’expérience motivant. Ne t’inquiète pas, je ne te tiendrai pas rigueur de nos différences de point du vue sur la maroquinerie ! Un grand merci à Titi. Merci pour ta bonne humeur et ton dynamisme. Merci pour toutes les soirées barbecue passées chez toi, les parties enflammées de Mölkky et pour les ballades du dimanche après-midi. Merci aussi pour tous ces très bons gâteaux. Un jour, je t’inscrirai au concours du Meilleur Pâtissier, c’est promis ! En te rencontrant, j’ai trouvé un excellent ami. Merci à Gaël pour ces quelques temps de covoiturage qui nous ont permis de nous connaître. Merci pour ton honnêteté et ta franchise qui permettent de prendre du recul, chose précieuse quand on est thésard ! Tu m’as apporté un regard neuf sur la vie d’un doctorant. Merci à Carine ma deuxième collègue de bureau. C’est toujours appréciable de pouvoir échanger avec simplicité sur des sujets sympas qui nous sortent du quotidien d’un thésard ! Merci à l’équipe administrative : Annie, Delphine, Evelyse et Martine. Sans oublier André et Arnaud pour l’équipe informatique. Merci à Mina, d’avoir évité que notre petit bureau ne devienne un champ de bataille ! Merci à Sabrina Biais et Sylvie Pérez membres de l’université et de l’école doctorale de Poitiers pour votre aide dans les démarches administratives. Merci également aux thésards, postdocs, contractuels et stagiaires de Chizé pour votre bonne humeur et la bonne ambiance que vous instaurez au labo : Adriana, Alexis, Aurélie, Carine, Cécile B., Damien, Elsa, Fabrice, Gaël, Gaëtane, Kevin, Laura, Licia, Paul D., Paul M., Pierrick, Ronan, Stefaniya, Vincent D.