Herpetofauna Terrestre
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A New Skink Fauna from Caribbean Islands (Squamata, Mabuyidae, Mabuyinae)
Zootaxa 3288: 1–244 (2012) ISSN 1175-5326 (print edition) www.mapress.com/zootaxa/ Monograph ZOOTAXA Copyright © 2012 · Magnolia Press ISSN 1175-5334 (online edition) ZOOTAXA 3288 A new skink fauna from Caribbean islands (Squamata, Mabuyidae, Mabuyinae) S. BLAIR HEDGES1 & CAITLIN E. CONN Department of Biology, 208 Mueller Lab, University Park, PA 16802, USA 1Corresponding author. E-mail: [email protected] Magnolia Press Auckland, New Zealand Accepted by L.L. Grismer: 17 Feb. 2012; published: 30 Apr. 2012 S. BLAIR HEDGES & CAITLIN E. CONN A new skink fauna from Caribbean islands (Squamata, Mabuyidae, Mabuyinae) (Zootaxa 3288) 244 pp.; 30 cm. 30 Apr. 2012 ISBN 978-1-86977-893-4 (paperback) ISBN 978-1-86977-894-1 (Online edition) FIRST PUBLISHED IN 2012 BY Magnolia Press P.O. Box 41-383 Auckland 1346 New Zealand e-mail: [email protected] http://www.mapress.com/zootaxa/ © 2012 Magnolia Press All rights reserved. No part of this publication may be reproduced, stored, transmitted or disseminated, in any form, or by any means, without prior written permission from the publisher, to whom all requests to reproduce copyright material should be directed in writing. This authorization does not extend to any other kind of copying, by any means, in any form, and for any purpose other than private research use. ISSN 1175-5326 (Print edition) ISSN 1175-5334 (Online edition) 2 · Zootaxa 3288 © 2012 Magnolia Press HEDGES & CONN Table of Contents Abstract . 4 Introduction . 5 Materials and methods. 8 Molecular analyses . 8 Morphological analyses . 9 Systematic accounts. 16 Results . 16 Molecular analyses . 16 Systematic Accounts . -
(Sqcl): a Unified Set of Conserved Loci for Phylogenomics and Population Genetics of Squamate Reptiles
Received: 14 October 2016 | Revised: 5 March 2017 | Accepted: 3 April 2017 DOI: 10.1111/1755-0998.12681 RESOURCE ARTICLE Squamate Conserved Loci (SqCL): A unified set of conserved loci for phylogenomics and population genetics of squamate reptiles Sonal Singhal1 | Maggie Grundler1 | Guarino Colli2 | Daniel L. Rabosky1 1Museum of Zoology and Department of Ecology and Evolutionary Biology, Abstract University of Michigan, Ann Arbor, MI, USA The identification of conserved loci across genomes, along with advances in target 2Departamento de Zoologia, Universidade capture methods and high-throughput sequencing, has helped spur a phylogenomics de Brasılia, Brasılia, Brazil revolution by enabling researchers to gather large numbers of homologous loci Correspondence across clades of interest with minimal upfront investment in locus design. Target Sonal Singhal, Museum of Zoology and Department of Ecology and Evolutionary capture for vertebrate animals is currently dominated by two approaches—anchored Biology, University of Michigan, Ann Arbor, hybrid enrichment (AHE) and ultraconserved elements (UCE)—and both approaches MI, USA. Email: [email protected] have proven useful for addressing questions in phylogenomics, phylogeography and population genomics. However, these two sets of loci have minimal overlap with Funding information Conselho Nacional do Desenvolvimento each other; moreover, they do not include many traditional loci that that have been Cientıfico e Tecnologico – CNPq; used for phylogenetics. Here, we combine across UCE, AHE and traditional phyloge- Coordenacß~ao de Apoio a Formacßao~ de Pessoal de Nıvel Superior – CAPES; netic gene locus sets to generate the Squamate Conserved Loci set, a single inte- Fundacßao~ de Apoio a Pesquisa do Distrito grated probe set that can generate high-quality and highly complete data across all Federal – FAPDF; Directorate for Biological Sciences, Grant/Award Number: DBI three loci types. -
Ecologia E Conservação De Comunidades De Lagartos Em Três Parques Nacionais Do Cerrado No Planalto Central Brasileiro”
ECOLOGIA E CONSERVAÇÃO DE COMUNIDADES DE LAGARTOS EM TRÊS PARQUES NACIONAIS DO CERRADO NO PLANALTO CENTRAL BRASILEIRO Guilherme Ramalho Chagas Cataldi Santoro Brasília - DF 2016 GUILHERME RAMALHO CHAGAS CATALDI SANTORO ECOLOGIA E CONSERVAÇÃO DE COMUNIDADES DE LAGARTOS EM TRÊS PARQUES NACIONAIS DO CERRADO NO PLANALTO CENTRAL BRASILEIRO Orientador: Reuber Albuquerque Brandão Coorientador: Daniel Oliveira Mesquita Tese apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Zoologia da Universidade de Brasília como requisito para a obtenção do título de Doutor em Zoologia Brasília - DF 2016 Tese de Doutorado Título: “Ecologia e conservação de comunidades de lagartos em três Parques Nacionais do Cerrado no Planalto Central brasileiro” Banca Examinadora: Prof. Dr. Reuber Albuquerque Brandão Presidente FT/Unb Prof. Dr.Frederico Gustavo França Prof. Dr.Jader Marinho-Filho Membro titular Membro titular UFPB ZOO/ Unb Prof. Dr. Emerson Monteiro Vieira Prof. Dr. Fabricius M. C. Bicalho Domingos Membro titular Membro titular ECL/Unb ECL/Unb Prof. Dr. Pedro De Podestà Uchoa Aquino Suplente ZOO/Unb Brasília, 28 de Novembro de 2016. Agradecimentos Primeiro gostaria de agradecer a toda minha família que sempre me apoia em todas minhas iniciativas. Minha mãe, Angela, que não só hoje, como ao longo de toda minha vida, tem tornado tudo mais simples, através de incontáveis boas ações que talvez eu nunca seja capaz de retribuir. Porém, espero muito poder fazer o mesmo por ela ao longo dos anos com o mesmo amor que ela sempre tem para me confortar. Ao meu pai Carlos Magno que é uma fonte de inspiração para moldar minha personalidade e me tornar o melhor homem que eu puder. -
Nematode Infection Patterns in a Neotropical Lizard Species from an Insular Mountain Habitat in Brazil
Journal of Helminthology (2017) 91, 578–582 doi:10.1017/S0022149X16000754 © Cambridge University Press 2016 Nematode infection patterns in a Neotropical lizard species from an insular mountain habitat in Brazil A.B.H.P. Václav1,3, L.A. Anjos2, M.S. Queiróz2, L.B. Nascimento3 and C.A.B. Galdino3* 1PET Biologia PUC Minas – MEC/SESu, Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais, 30535-901, Belo Horizonte, Brazil: 2Departamento de Biologia e Zootecnia, Laboratório de Parasitologia e Zoologia, UNESP, Universidade Estadual Paulista, FEIS, Passeio Monção 226, CEP 15385-000, Ilha Solteira, Brazil: 3Programa de Pós-graduação em Biologia de Vertebrados, Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais, 30535-610, Belo Horizonte, Brazil (Received 12 July 2016; Accepted 27 September 2016; First published online 28 October 2016) Abstract Neotropical lizards are known to harbour rich nematode parasite faunas; how- ever, knowledge of the diversity and patterns of infection are still lacking for many species. This is true for the genus Tropidurus, in which data on patterns of parasitism are known for only approximately 11 of its 30 species. We show that the nematode fauna associated with a population of Tropidurus montanus is composed of three species of host-generalist parasites with high overall preva- lence. Male and female lizards did not differ in infection pattern and there was no relationship between host body size and intensity of infection for the most prevalent parasite species. Nevertheless, overall prevalence changed seasonally, with a higher proportion of parasitized individuals being found in the dry period than in the rainy period. We discuss our findings in the context of diet patterns of T. -
12S Rrna 16S Rrna Cmos Cytb Enol Gapdh Gpr149 Myh
12S rRNA 16S rRNA cmos cytb enol gapdh gpr149 myh Ablepharus 34821616 49476602 2760966 49476366 - - - - Acontias 33385521 33385469 334903274 238867256 - 39545954 - 82549050 Afroablepharus 34821618 34821532 158121080 158121062 - - - - Amphiglossus 38884825 255766973 38884934 38884885 40068155 39545962 392936187 - Anomalopus 321271330 30691204 334903276 - - - - - Aspronema cochabambae 17221682 17221687 - - - - - - Aspronema dorsivittatum 82548850 387166131 82548407 82548729 82549024 82548569 - 82549054 Ateuchosaurus 61102831 - 61102774 238867260 - - - - Bassiana 61102827 - 334903280 61102873 - - - - Bellatorias - - 334903282 - - - - - Brachymeles 55831606 34821426 61102788 238867262 321494418 - 392936207 - Brasiliscincus agilis 82548827 33334964 82548501 185179442 82548926 82548588 - 82549090 Brasiliscincus caissara 33334946 33334963 - - - - - - Brasiliscincus heathi 82548852 33334961 82548489 82548771 82548970 82548609 - 82549170 Caledoniscincus 190147915 190147906 334903284 190147817 - - - - Calyptotis 30691165 34821427 - 24110612 - - - - Carlia 30691152 56567390 61102768 5881289 - 85692054 - - Celatiscincus - - 113015800 - - - - - Chalcides 55831607 410111711 410111633 238867264 - - 410111646 - Chioninia coctei 22657712 - - 18000927 - - - - Chioninia delalandii 27447024 27447041 13446889 13624817 - - - - Chioninia fogoensis 22657706 37722632 13446893 18000906 - - - - Chioninia nicolauensis - - - 18000911 - - - - Chioninia spinalis 27447007 27447028 13446895 13624793 - - - - Chioninia stangeri 22657695 37722630 13446901 13624799 - - - -
I Online Supplementary Data – Henle, K. & A. Grimm-Seyfarth (2020
Online Supplementary data – Henle, K. & A. Grimm-Seyfarth (2020): Exceptional numbers of occurrences of bifurcated, double, triple, and quintuple tails in an Australian lizard community, with a review of supernumerary tails in natural populations of reptiles. – Salamandra, 56: 373–391 Supplementary document S1. Database on bifurcation, duplication and multiplication of tails in natural populations of reptiles. We considered only data that were provided at least at the genus level and that explicitly originated from natural populations or for which this was likely, as either the authors indicated for other specimens that they were captive animals, or because museum series were examined (even if data were provided only for the specimens with accessory tails). We relaxed these criteria for pre-1900 publications and included also individuals without determination and data that were not explicitly stated as applying to wild individuals if such an origin was plausible. We extracted the following data (if available): species name, number of individuals with accessory tails, number of individuals with bifurcation, duplication, trifurcation, quadruplication, quintuplication and hexaplication, sample size, geographic origin (usually country but may also be oceanic islands), microhabitat, and the year of publication. Nomenclature follows Cogger (2014) for Australian reptiles and Uetz et al. (2019) for other species regarding generic names, name changes due to priorities and synonymies, and for subspecies identified in the source reference that have been elevated later to full species rank. Name changes due to splitting of taxa into several species were made only if allocation of the data to the new species was obvious from morphological or geographic information provided by the assessed source reference or was already done by other authors. -
Herpetologia Brasileira
Volume 7 - Número 1 - Fevereiro de 2018 ISSN: 2316-4670 I NFORMAÇÕES GERAIS A revista eletrônica Herpetologia Brasileira é quadrimestral (com números em março, julho e novembro) e publica textos sobre assun- tos de interesse para a comunidade herpetológica brasileira. Ela é disponibilizada apenas online, na página da Sociedade Brasileira de Herpetologia; ou seja, não há versão impressa em gráfica. Entretanto, qualquer associado pode imprimir este arquivo. SEÇÕES Editores Gerais: Marcio Martins Magno Segalla Notícias da Sociedade Brasileira de Herpetologia: Esta seção Délio Baêta apresenta informações diversas sobre a SBH e é de responsabili- Bianca Von Muller Berneck dade da diretoria da Sociedade. Notícias da SBH: Giovanna G. Montingelli Fausto Erritto Barbo Notícias Herpetológicas Gerais: Esta seção apresenta informa- Notícias Herpetológicas Gerais: Cinthia Aguirre Brasileiro ções e avisos sobre os eventos, cursos, concursos, fontes de financia- Paulo Bernarde mento, bolsas, projetos, etc., de interesse para nossa comunidade. Notícias de Conservação: Luis Fernando Marin Débora Silvano Notícias de Conservação: Esta seção apresenta informações e Yeda Bataus avisos sobre a conservação da herpetofauna brasileira ou de fa- Dissertações & Teses: Giovanna G. Montingelli tos de interesse para nossa comunidade. Resenhas: José P. Pombal Jr. (anfíbios) Renato Bérnils (répteis) Dissertações & Teses: Esta seção apresenta as informações so- Trabalhos Recentes: Ermelinda Oliveira bre as dissertações e teses sobre qualquer aspecto da herpetolo- Rafael -
Fauna De Lagartos De Hábitats De Caatinga Do Campus Ciências Agrárias Da Universidade Federal Do Vale Do São Francisco, Petrolina-Pe, Brasil
ISSN 1517-6770 COMUNICAÇÃO CIENTÍFICA Fauna de lagartos de hábitats de Caatinga do Campus Ciências Agrárias da Universidade Federal Do Vale Do São Francisco, Petrolina-Pe, Brasil Kariny de Souza1,2; Rafael Damasceno Fernandes Coelho1,2; Camila Pimentel Sobrinho1,2; Joana Paula Bispo Nascimento1; Melissa Gogliath2 & Leonardo Barros Ribeiro1,2,* 1Universidade Federal do Vale do São Francisco - UNIVASF, Campus Ciências Agrárias, CEP 56300-990, Petrolina, Brasil 2Centro de Conservação e Manejo de Fauna da Caatinga (CEMAFAUNA-CAATINGA), Universidade Federal do Vale do São Francisco - UNIVASF, Campus Ciências Agrárias, Rodovia BR 407, km 12, Lote 543, s/nº - C1, CEP 56300-990, Petrolina, Brasil *E-mail: [email protected] Abstract. The lizard fauna of caatinga habitats at the Agrarian Science Campus of the Universidade Federal do Vale do São Francisco, Petrolina-PE, Brazil. Studies that characterize the fauna composition are crucial for increasing knowledge of diversity present in a given area. The increase of studies on the herpetofauna of Caatingas has allowed the description of a large number of species and the recognition of local endemisms. This study aimed to know the composition of the lizard fauna of the Campus Ciências Agrárias (CCA) of the Federal University of San Francisco Valley (UNIVASF), Pernambuco; compare it with that of other four Caatinga areas and investigate the microhabitats used by lizards. Field works were carried out weekly from September through November 2011. Four study sites were previously selected for sampling lizards using both pitfall traps and active searches. Local richness comprised 14 species of lizards, distributed in eight families. The fauna of lizards of the CCA showed a high similarity with those recorded in three areas: Ecological Station of Seridó, RN (0.70), Exu, PE (0.60), and the locality of Nascimento, RN (0.59). -
Reptiles in an Ecotonal Area in Northern State of Piauí, Brazil
Bol. Mus. Biol. Mello Leitão (N. Sér.) 37(4):437-455. Outubro-Dezembro de 2015 437 Reptiles in an ecotonal area in northern State of Piauí, Brazil Marcelia Basto da Silva1,*, Leonardo Sousa Carvalho2,3 & Valdemar Rodrigues4 RESUMO: (Répteis em uma área ecotonal no norte do estado do Piauí, Brasil) Nós apresentamos os resultados de um inventário de répteis de uma área de ecótono Cerrado/Caatinga, localizada no município de Batalha, estado do Piauí. Realizamos o estudo entre maio de 2004 e janeiro de 2007, na área da Fazenda Paquetá. Utilizamos armadilhas de interceptação e queda, procura limitada por tempo, manzuá (armadilha feita de madeira, em forma de um cesto, usada na captura de lagostas e peixes) e encontros ocasionais para amostragem. Listamos um total de 31 espécies de répteis, sendo 14 espécies de serpentes, 14 espécies de lagartos, uma de anfisbena, uma de quelônio e uma de crocodiliano. O método amostral mais eficiente foi o das armadilhas de interceptação e queda, com 10 espécies, representadas principalmente por lagartos terrestres. A fauna de répteis registrada na área de estudo consta de representantes que ocorreram em mais de uma fisionomia, porém, 16% (n=5) dos répteis foram amostrados apenas em áreas de florestas estacionais semidecíduas. Assim, a manutenção de fragmentos preservados de florestas estacionais semidecíduas tais como os encontrados na Fazenda Paquetá podem assegurar a existência de espécies de habitats florestais no âmbito deste ecótono Cerrado/Caatinga. Palavras-chave: Conservação, Florestas Estacionais Semidecíduas, Lagartos, Serpentes. 1 Museu Paraense Emílio Goeldi, Coordenação de Zoologia-CZO, Programa de Pós- Graduação em Zoologia, Caixa Postal 399. -
Lizard Fauna from the State of Paraíba, Northeastern Brazil: Current Knowledge and Sampling Discontinuities
Herpetology Notes, volume 12: 749-763 (2019) (published online on 09 July 2019) Lizard fauna from the state of Paraíba, northeastern Brazil: current knowledge and sampling discontinuities Lissa Dellefrate Franzini1,*, Izabel Regina Soares da Silva1, Daniel Oliveira Santana1, Fagner Ribeiro Delfim, Gustavo Henrique Calazans Vieira1, and Daniel Oliveira Mesquita1 Abstract. We compiled a list of lizard species from the state of Paraíba, Northeast Brazil to systematize and widen the knowledge about the lizard fauna in that state, which is still poorly known in most of its municipalities and has never been systematized in a species list. We considered data from the literature and the major scientific collections that house specimens from the state of Paraíba and we gathered a total of 2,767 records for 48 municipalities, corresponding to 36 lizard species of 27 genera and 12 families. The capital, municipality of João Pessoa, presented the highest number of species records. This number of records is a result of a high sampling effort, which is probably a consequence of the higher number of reptile specialists working in this municipality, which have for long contributed to the scientific knowledge on the region. Most of the records come from municipalities with protected areas near research centres, which are usually more accessible. In the remaining municipalities, sampling is still deficient, mainly in regions of the Caatinga domain. We calculated the evolutionary distinctiveness (ED) of the lizard species compiled in the study and verified that Diploglossus lessonae, Coleodactylus meridionalis, Lygodactylus kuglei, Iguana iguana, and Salvator merianae represent important evolutionary histories in the biodiversity of the state. -
1 Universidade Estadual De Santa Cruz – Uesc
1 UNIVERSIDADE ESTADUAL DE SANTA CRUZ – UESC PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM ZOOLOGIA GABRIEL NOVAES E FAGUNDES PREENCHENDO LACUNAS: HERPETOFAUNA INSULAR E PENINSULAR NA APA BAÍA DE CAMAMU, SUL DA BAHIA, BRASIL ILHÉUS – BAHIA 2018 1 GABRIEL NOVAES E FAGUNDES PREENCHENDO LACUNAS: HERPETOFAUNA INSULAR E PENINSULAR NA APA BAÍA DE CAMAMU, SUL DA BAHIA, BRASIL Dissertação apresentada à Universidade Estadual de Santa Cruz como parte das exigências para obtenção do título de Mestre em Zoologia Orientador: Prof. Dr. Mirco Solé Kienle Co-orientadora: Profª Drª Juliana Zina Pereira Ramos ILHÉUS – BAHIA 2018 2 GABRIEL NOVAES E FAGUNDES PREENCHENDO LACUNAS: HERPETOFAUNA INSULAR E PENINSULAR NA APA BAÍA DE CAMAMU, SUL DA BAHIA, BRASIL Dissertação apresentada à Universidade Estadual de Santa Cruz como parte das exigências para obtenção do título de Mestre em Zoologia Ilhéus, 23 de março de 2018. __________________________________________________ Prof. Dr. Mirco Solé Kienle UESC (Orientador) __________________________________________________ Prof. Dr. Hélio Ricardo da Silva UFRRJ __________________________________________________ Prof. Dr. Iuri Ribeiro Dias UESC 3 À minha família, que sempre me apoiou em tudo. À todos os seres vivos, somos Um. 4 AGRADECIMENTOS Primeiramente, fora Temer! Agora, sim, aos agradecimentos... Muitas pessoas contribuíram, direta ou indiretamente, para a realização deste trabalho. Eu sei, esta frase é um clichê dos agradecimentos, mas não há como fugir dela - é a mais pura verdade. A Ciência, mais do que intelectual, é uma atividade social. Não se faz Ciência sozinho. Mesmo o mais solitário dos cientistas terá, ao menos, a presença imaterial dos autores das referências consultadas, e terá a (grande) expectativa de ser lido por outros. -
The High-Level Classification of Skinks (Reptilia, Squamata, Scincomorpha)
Zootaxa 3765 (4): 317–338 ISSN 1175-5326 (print edition) www.mapress.com/zootaxa/ Article ZOOTAXA Copyright © 2014 Magnolia Press ISSN 1175-5334 (online edition) http://dx.doi.org/10.11646/zootaxa.3765.4.2 http://zoobank.org/urn:lsid:zoobank.org:pub:357DF033-D48E-4118-AAC9-859C3EA108A8 The high-level classification of skinks (Reptilia, Squamata, Scincomorpha) S. BLAIR HEDGES Department of Biology, Pennsylvania State University, 208 Mueller Lab, University Park, PA 16802, USA. E-mail: [email protected] Abstract Skinks are usually grouped in a single family, Scincidae (1,579 species) representing one-quarter of all lizard species. Oth- er large lizard families, such as Gekkonidae (s.l.) and Iguanidae (s.l.), have been partitioned into multiple families in recent years, based mainly on evidence from molecular phylogenies. Subfamilies and informal suprageneric groups have been used for skinks, defined by morphological traits and supported increasingly by molecular phylogenies. Recently, a seven- family classification for skinks was proposed to replace that largely informal classification, create more manageable taxa, and faciliate systematic research on skinks. Those families are Acontidae (26 sp.), Egerniidae (58 sp.), Eugongylidae (418 sp.), Lygosomidae (52 sp.), Mabuyidae (190 sp.), Sphenomorphidae (546 sp.), and Scincidae (273 sp.). Representatives of 125 (84%) of the 154 genera of skinks are available in the public sequence databases and have been placed in molecular phylogenies that support the recognition of these families. However, two other molecular clades with species that have long been considered distinctive morphologically belong to two new families described here, Ristellidae fam. nov. (14 sp.) and Ateuchosauridae fam. nov.