B-Chrom: a Database on B-Chromosomes of Plants, Animals and Fungi Ugo D'ambrosio, M. Pilar Alonso-Lifante, Karina Barros, Aleš
Total Page:16
File Type:pdf, Size:1020Kb
C1: Average number of Bs vs. Chromosome number (2n) Rho: Spearman's rank correlation coefficient C2: Average number of Bs vs. Ploidy level pval: p value C3: Average number of Bs vs. Genome size (2C) N C1Rho C1pval C2Rho C2pval C3Rho C3pval Animalia 751 0,1266 0,0005 0,0819 0,0672 0,0028 0,9780 Plantae 2334 0,0570 0,0059 0,0703 0,0009 0,1391 0,0036 N C1Rho C1pval C2Rho C2pval C3Rho C3pval Monocots 966 0,0271 0,3996 0,0413 0,2042 -0,0306 0,6611 Eudicots 1320 0,0820 0,0029 0,0796 0,0047 0,1190 0,0845 C1: Average number of Bs vs. Chromosome number (2n) Rho: Spearman's rank correlation coefficient C2: Average number of Bs vs. Ploidy level pval: p value C3: Average number of Bs vs. Genome size (2C) Kingdom Division Ang/Gym Class Order Mon/Eud Family N C1Rho C1pval C2Rho C2pval C3Rho C3pval Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Asterales Eudicots Asteraceae 469 -0,0042 0,9277 0,0428 0,3691 0,0006 0,9960 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Poales Monocots Poaceae 397 0,0675 0,1796 0,0705 0,1639 0,1022 0,3581 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Asparagales Monocots Amaryllidaceae 158 -0,0111 0,8903 -0,0344 0,6688 0,1748 0,2806 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Fabales Eudicots Fabaceae 145 0,1399 0,0932 0,0712 0,4210 -0,0261 0,8910 Animalia ArthropodaNA Insecta Orthoptera NA Acrididae 125 0,0506 0,5749 NA NA 0,2509 0,3002 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Asparagales Monocots Asparagaceae 119 -0,0259 0,7799 0,0180 0,8462 -0,1903 0,3623 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Lamiales Eudicots Lamiaceae 117 0,2748 0,0027 0,0073 0,9381 0,5000 0,1173 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Liliales Monocots Liliaceae 90 -0,1949 0,0656 -0,1346 0,2060 0,0478 0,8413 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Asparagales Monocots Orchidaceae 67 -0,1837 0,1368 -0,1383 0,2683 0,0338 0,9493 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Ranunculales Eudicots Ranunculaceae 52 0,0340 0,8111 0,0345 0,8084 0,0222 0,9455 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Brassicales Eudicots Brassicaceae 49 0,2879 0,0448 0,5214 0,0002 0,0203 0,9555 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Asterales Eudicots Campanulaceae 35 0,4297 0,0100 0,0102 0,9550 -1,0000 1,0000 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Caryophyllales Eudicots Caryophyllaceae 34 -0,0003 0,9985 0,1301 0,4635 0,2582 0,7418 Animalia Chordata NA Mammalia Rodentia NA Cricetidae 33 0,2318 0,1943 NA NA NA NA Animalia ArthropodaNA Insecta Coleoptera NA Chrysomelidae 32 0,1260 0,4922 NA NA - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Alismatales Monocots Araceae 31 0,3122 0,0873 0,0450 0,8166 -0,5270 0,3615 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Commelinales Monocots Commelinaceae 31 0,0498 0,7903 0,2396 0,2023 -0,1970 0,4996 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Saxifragales Eudicots Crassulaceae 31 0,1948 0,2937 -0,0446 0,8219 - - Animalia Chordata NA Mammalia Rodentia NA Muridae 30 0,3838 0,0363 NA NA 0,2512 0,4839 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Apiales Eudicots Apiaceae 29 0,4993 0,0058 0,4517 0,0158 -0,7746 0,2254 Animalia ArthropodaNA Insecta Diptera NA Simuliidae 28 NA NA NA NA - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Lamiales Eudicots Scrophulariaceae 27 -0,2837 0,1516 0,1853 0,3548 1,0000 0,3333 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Asparagales Monocots Iridaceae 25 -0,2273 0,2745 0,2600 0,2974 0,8660 0,3333 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Liliales Monocots Melanthiaceae 24 0,1903 0,3731 0,2250 0,2905 -0,7906 0,0343 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Myrtales Eudicots Onagraceae 23 -0,0951 0,6659 -0,3043 0,1581 0,2582 0,7418 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Solanales Eudicots Solanaceae 23 0,0385 0,8615 0,1775 0,4177 0,0000 1,0000 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Boraginales Eudicots Boraginaceae 22 0,2651 0,2332 0,1701 0,4492 - - Animalia ArthropodaNA Insecta Orthoptera NA Tettigoniidae 20 NA NA NA NA - - Animalia Chordata NA Actinopterygii Characiformes NA Characidae 19 -0,1203 0,6236 NA NA -0,5000 0,5000 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Cucurbitales Eudicots Begoniaceae 17 0,1756 0,5002 NA NA - - Animalia Chordata NA Actinopterygii Perciformes NA Cichlidae 16 0,5873 0,0168 - - - - Plantae Pinophyta Gymnosperms Pinopsida Pinales NA Pinaceae 15 NA NA NA NA 0,1309 0,8047 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Santalales Eudicots Loranthaceae 15 0,1400 0,6188 NA NA - - Animalia ArthropodaNA Insecta Diptera NA Chironomidae 14 0,2132 0,4643 NA NA - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Lamiales Eudicots Plantaginaceae 13 0,2723 0,3682 0,4292 0,1434 0,5345 0,2164 Animalia Chordata NA Amphibia Caudata NA Plethodontidae 13 NA NA - - 0,0381 0,9287 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Dipsacales Eudicots Caprifoliaceae 13 -0,1453 0,6358 0,4260 0,1466 - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Solanales Eudicots Convolvulaceae 12 0,5461 0,0662 0,5774 0,0493 0,2582 0,7418 Animalia PlatyhelminthesNA Rhabditophora Tricladida NA Dugesiidae 12 0,0810 0,8023 0,1809 0,5944 - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Geraniales Eudicots Geraniaceae 12 -0,0911 0,7783 -0,1081 0,7380 - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Ericales Eudicots Polemoniaceae 12 0,0682 0,8332 0,0462 0,8867 - - Animalia Chordata NA Mammalia Artiodactyla NA Cervidae 12 0,2475 0,4380 - - - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Rosales Eudicots Rosaceae 12 -0,0697 0,8297 -0,3986 0,2246 NA NA Animalia ArthropodaNA Insecta Coleoptera NA Coccinellidae 11 -0,3445 0,2995 NA NA - - Kingdom Division Ang/Gym Class Order Mon/Eud Family N C1Rho C1pval C2Rho C2pval C3Rho C3pval Animalia ArthropodaNA Insecta Orthoptera NA Gryllidae 11 -0,2241 0,5077 NA NA - - Animalia ArthropodaNA Insecta Coleoptera NA Carabidae 10 0,5448 0,1034 NA NA - - Animalia ArthropodaNA Insecta Diptera NA Syrphidae 10 -0,2653 0,4589 NA NA - - Animalia Chordata NA Actinopterygii Siluriformes NA Heptapteridae 10 0,2304 0,5219 NA NA - - Animalia Chordata NA Actinopterygii Characiformes NA Curimatidae 10 NA NA - - NA NA Animalia Chordata NA Mammalia Carnivora NA Canidae 9 -0,2760 0,4722 NA NA 0,0000 1,0000 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Caryophyllales Eudicots Polygonaceae 9 0,2466 0,5224 NA NA -0,5000 1,0000 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Ericales Eudicots Primulaceae 9 -0,3057 0,4237 -0,6847 0,0419 - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Saxifragales Eudicots Saxifragaceae 9 -0,2099 0,5879 -0,5034 0,1671 - - Animalia ArthropodaNA Insecta Hemiptera NA Aphididae 9 0,1316 0,7358 NA NA - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Malpighiales Eudicots Linaceae 9 NA NA NA NA - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Malvales Eudicots Malvaceae 8 0,2582 0,5370 0,5774 0,1340 - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Malpighiales Eudicots Euphorbiaceae 8 -0,4528 0,2600 0,1528 0,7437 - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Malpighiales Eudicots Violaceae 8 -0,1584 0,7079 -0,0570 0,8933 - - Animalia ArthropodaNA Insecta Hemiptera NA Psyllidae 8 -0,6614 0,0741 - - - - Animalia ArthropodaNA Insecta Coleoptera NA Curculionidae 8 -0,4410 0,2741 NA NA - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Poales Monocots Bromeliaceae 8 -0,0090 0,9831 NA NA - - Animalia Chordata NA Actinopterygii Characiformes NA Crenuchidae 7 -0,3536 0,4366 - - - - Animalia Chordata NA Amphibia Anura NA Hylidae 7 0,2941 0,5220 NA NA - - Animalia ArthropodaNA Insecta Lepidoptera NA Pieridae 7 0,0000 1,0000 NA NA - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Myrtales Eudicots Lythraceae 6 0,3151 0,5430 -0,3333 0,6667 - - Animalia ArthropodaNA Insecta Hemiptera NA Nabidae 6 NA NA - - - - Animalia ArthropodaNA Insecta Coleoptera NA Scarabaeidae 6 NA NA NA NA - - Animalia Chordata NA Actinopterygii Characiformes NA Prochilodontidae 6 NA NA NA NA NA NA Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Ranunculales Eudicots Papaveraceae 5 0,4104 0,4925 -0,0556 0,9444 -1,0000 1,0000 Animalia ArthropodaNA Insecta Hymenoptera NA Apidae 5 0,2500 0,6850 - - - - Animalia Chordata NA Actinopterygii Siluriformes NA Loricariidae 5 0,0000 1,0000 - - - - Animalia ArthropodaNA Insecta Hemiptera NA Coreidae 5 0,5774 0,4226 NA NA - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Cucurbitales Eudicots Cucurbitaceae 5 0,0000 1,0000 NA NA - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Saxifragales Eudicots Grossulariaceae 5 NA NA NA NA - - Animalia ArthropodaNA Insecta Orthoptera NA Tetrigidae 5 NA NA NA NA - - Animalia Chordata NA Actinopterygii Siluriformes NA Callichthyidae 4 0,7379 0,2621 NA NA 0,2722 0,7278 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Caryophyllales Eudicots Amaranthaceae 4 0,0000 1,0000 0,5774 0,4226 - - Animalia Chordata NA Amphibia Anura NA Ascaphidae 4 -0,2000 0,9167 0,2582 0,7418 - - Plantae PteridophytaNA Psilotopsida Ophioglossales NA Ophioglossaceae 4 NA NA - - - - Animalia Chordata NA Actinopterygii Siluriformes NA Pimelodidae 4 NA NA - - - - Animalia ArthropodaNA Insecta Coleoptera NA Cerambycidae 4 0,8165 0,1835 NA NA - - Animalia ArthropodaNA Malacostraca Amphipoda NA Gammaridae 4 0,7746 0,2254 NA NA - - Animalia ArthropodaNA Insecta Hymenoptera NA Formicidae 4 0,1054 0,8946 NA NA - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Dipsacales Eudicots Dipsacaceae 4 0,0000 1,0000 NA NA - - Animalia ArthropodaNA Insecta Orthoptera NA Eumastacidae 4 NA NA NA NA - - Animalia ArthropodaNA Insecta orthoptera NA Eumastacidae 4 NA NA NA NA - - Animalia ArthropodaNA Insecta Diptera NA Drosophilidae 4 -0,8333 0,1667 NA NA NA NA Animalia Chordata NA Actinopterygii Cypriniformes NA Cyprinidae 4 NA NA NA NA NA NA Animalia Chordata NA Mammalia Rodentia NA Geomyidae 3 0,0000 1,0000 NA NA -1,0000 1,0000 Animalia ArthropodaNA Insecta Coleoptera NA Tenebrionidae 3 0,0000 1,0000 NA NA -1,0000 1,0000 Plantae MagnoliophytaAngiosperms NA Laurales Eudicots Lauraceae 3 1,0000 0,0000 1,0000 0,0000 - - Plantae MagnoliophytaAngiosperms