Identification Et Caractérisation Fonctionnelle De Gènes Impliqués Dans La Voie De Biosynthèse Des Furocoumarines Chez Les Végétaux Supérieurs Guilhem Vialart

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Identification Et Caractérisation Fonctionnelle De Gènes Impliqués Dans La Voie De Biosynthèse Des Furocoumarines Chez Les Végétaux Supérieurs Guilhem Vialart Identification et caractérisation fonctionnelle de gènes impliqués dans la voie de biosynthèse des furocoumarines chez les végétaux supérieurs Guilhem Vialart To cite this version: Guilhem Vialart. Identification et caractérisation fonctionnelle de gènes impliqués dans la voiede biosynthèse des furocoumarines chez les végétaux supérieurs. Agronomie. Université de Lorraine, 2012. Français. NNT : 2012LORR0390. tel-01750069 HAL Id: tel-01750069 https://hal.univ-lorraine.fr/tel-01750069 Submitted on 29 Mar 2018 HAL is a multi-disciplinary open access L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est archive for the deposit and dissemination of sci- destinée au dépôt et à la diffusion de documents entific research documents, whether they are pub- scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, lished or not. The documents may come from émanant des établissements d’enseignement et de teaching and research institutions in France or recherche français ou étrangers, des laboratoires abroad, or from public or private research centers. publics ou privés. AVERTISSEMENT Ce document est le fruit d'un long travail approuvé par le jury de soutenance et mis à disposition de l'ensemble de la communauté universitaire élargie. Il est soumis à la propriété intellectuelle de l'auteur. Ceci implique une obligation de citation et de référencement lors de l’utilisation de ce document. D'autre part, toute contrefaçon, plagiat, reproduction illicite encourt une poursuite pénale. Contact : [email protected] LIENS Code de la Propriété Intellectuelle. articles L 122. 4 Code de la Propriété Intellectuelle. articles L 335.2- L 335.10 http://www.cfcopies.com/V2/leg/leg_droi.php http://www.culture.gouv.fr/culture/infos-pratiques/droits/protection.htm UMR 1121, Université de Lorraine-INRA, RP2E Laboratoire Agronomie et Environnement Thèse de recherche Identification et caractérisation fonctionnelle de gènes impliqués dans la voie de biosynthèse des furocoumarines chez les végétaux supérieurs. Présentée pour l’obtention du titre de Docteur de l’Université de Lorraine En Sciences Agronomiques Guilhem VIALART Thèse soutenue publiquement le 06 avril 2012, devant un jury composé de : Mr. P.Hugueney : Directeur de recherche INRA Colmar. Rapporteur. Mr. H. Schaller : Directeur de recherche au CNRS à IBMP Strasbourg. Rapporteur. Mme N. Guivarc’h : Professeur. Université François Rabelais Tours. Examinateur. Mr. E. Gelhaye : Professeur. Université de Lorraine. Nancy. Examinateur Mr. F.Bourgaud : Professeur, Université de Lorraine, Directeur de thèse. Nancy Mr. A. Hehn : Maitre de conférences, Université de Lorraine, Co-Directeur. Nancy 2 Remerciements Je souhaite remercier Mr Hugueney Philippe, directeur de recherche de INRA Colmar, ainsi que Mr Schaller Hubert, chargés de recherche au CNRS à l’IBMP de Strasbourg, d’avoir accepté d’être les rapporteurs de cette thèse. Je remercie aussi Gelhaye Eric, professeur à la faculté des sciences de l’université de Lorraine, et Mme Guivarc’h Nathalie, professeur à l’université de François Rabelais de Tours, d’avoir accepté d’être les examinateurs de cette thèse. Je les remercie d’avoir jugé mon travail. Je tiens à remercier l’ancien directeur du Laboratoire Agronomie et Environnement, le Pr. Sylain Plantureux, de m’avoir accueilli au sein de son équipe, lorsqu’il était encore directeur. Je remercie évidemment le nouveau directeur du Laboratoire Agronomie et Environnement, le Pr Frédéric Bourgaud, qui m’a « conservé » dans son laboratoire. Par cette occasion, j’en profite pour te remercier cette fois-ci en tant que directeur de thèse pour tout ce que tu as fait pour moi. Déjà en tant qu’étudiant de l’école d’ingénieur ENSAIA, j’appréciais les cours « d’art et création » que tu nous prodiguais à travers la musique et la peinture. Et je suis content d’avoir pu te connaître un peu plus durant ces trois années de thèse. Je n’oublierai jamais le fabuleux voyage au pays « du soleil levant », dont tu es en grande partie responsable. De même que les francs moments de surprise et de rigolade qu’on a passé ensemble à découvrir les coutumes de ce pays. Ils restent et resteront un souvenir important à mes yeux. Sans oublier le séminaire à Manchester où l’équipe de choc était au rendez-vous. Bien entendu, je te remercie de m’avoir accordé ta confiance, ton soutien quand les résultats des manips étaient laborieux (microsomes…) et aussi ton enthousiasme quand, au contraire, tout fonctionnait bien. Un grand merci Fred. Mes remerciements vont aussi à mon codirecteur de thèse, alias Alain Hehn, qui a été d’un très grand soutien durant ces années de thésard. Merci maître Alain pour tous les conseils techniques que tu as pu me donner au laboratoire et pour m’avoir initié à la magie de la biologie moléculaire. Tu as su me transmettre la passion qui t’anime chaque jour au laboratoire, et je dois dire que, si ces trois années m’ont paru aussi rapides, c’est en partie 1 grâce à toi. Tu as aussi fait partie du voyage au Japon et j’ai beaucoup apprécié ton regard innocent sur cette culture totalement dépaysante. Le goût du voyage va-t-il aussi finir par te tomber dessus ? Dans tous les cas, merci pour toute l’aide que tu m’as apportée, que ce soit sur le plan professionnel comme personnel! J’ai sincèrement beaucoup apprécié de travailler avec toi et d’avoir été ton thésard. Et j’ai même fini dans ton bureau! Si ce n’est pas une preuve ça! La collaboration effectuée avec l‘équipe des professeurs Sugimotto et Mizutani n’aurait jamais pu être aussi riche tant sur un point de vue professionnel que sur un point de vue personnel, sans cet accueil formidable qu’ils m’ont réservé. Je ne remercierai jamais assez toute cette équipe de m’avoir fait découvrir les mystères de la culture japonaise. Je remercie tout particulièrement le professeur Mizutani pour son humour et sa gentillesse à toute épreuve (je me souviendrai des yeux de poissons…quel farceur!). Je remercie aussi Kyoko qui m’a épaulé dans le Labo, mais aussi dans ma vie de tous les jours. Et franchement, les premiers pas au Japon ne sont pas si faciles pour un non-initié : Merci, merci, merci…Sans toi, je ne serai peut-être jamais revenu du Japon (Passeport égaré)! Je remercie ensuite la Dream-team des mecs en furie du Labo (Ben, Alex, Romain, Sandro) avec qui j’ai vraiment bien rigolé (et travaillé aussi à l’occasion) : un peu plus matures que moi, selon eux … surtout plus vieux selon moi!! Au niveau des blagues, je ne crois pas être le plus « gamin »…n’est-ce pas Alex ? C’était vraiment cool cette ambiance quotidienne que j’ai un peu de difficulté à décrire d’ailleurs… c’est peut-être mieux ainsi….« Holalalala, tu l’as vu celle-là?...Où ça ?? » Merci aussi à tous les permanents du labo, ceux qui étaient là avant moi et qui y seront après moi : merci Bernard, Sophie, Séverine, Chhoy, Christophe, Armand, Francoise, Jean, Nadia, Beatrice pour votre accueil. De même, je remercie aussi tous les vieux thésards de l’époque qui sont devenus maintenant des post-doc et qui m’ont appris plein de choses durant ces années. Un grand merci particulièrement à Flore qui a eu la patience de supporter mes blagues vaseuses et mon « énergie » qui doit parfois être fatigante. 2 Évidemment, je remercie tous les thésards qui ont partagé mon bureau pendant un temps. Merci Fazeelat pour toutes les discussions qu’on a pu avoir concernant le Pakistan et ta culture (au fait, ne répète pas tous les gros mots que je t’ai appris!!!) ; merci aussi à Matilde d’avoir supporté mon état électrique dès le matin. Un merci aussi à Celia, la madame plante du bureau, qui a contribué à « végétaliser » notre bureau… Je remercie aussi tous les autres jeunes thésards, Aline, Simon, Nico, Abdelaak, Charles, et je leur souhaite une bonne fin de thèse. Je n’oublierai pas non plus toute l’équipe de PAT SAS et notamment Sissi, Cindy, Nath, Paul, Estelle, Léonor, Jean-Paul, Jean-marc, Hinde. De même je remercie aussi Martine, Ségolène, Aude, Élodie, Claude, pour leur aide précieuse dans la préparation du matériel au laboratoire. Tout comme les différents stagiaires que j’ai pu encadrer durant cette thèse. Merci a Björn et Adeline. Merci aussi à Thamara de ne pas m’avoir laissé tomber dans les profondeurs obscures des papiers administratifs et de me rappeler, toujours en temps et en heure, les petits trucs que j’avais oublié de signer ou de compléter! Je souhaiterais aussi remercier la bande d’Hérouville-Saint-Clair! « wouaich »! Les copains et copines de primaire et de collège qui ont toujours été présents durant ces longues années!! Il y en a des souvenirs à raconter jusqu'à nos 30 ans !!! Merci Greg, Pichon, Flo, Sophie, Yanous, Marioul, Guidoo, Valentine, Laurène, Erwan, Vinz, Stéphane… 13 ans déjà qu’on fête chaque année le réveillon du jour de l’an ensemble, et ce n’est pas près de se terminer!!! Merci aussi à la Pharma-team avec Romano, Pierro, Lolo, Vivi, Nono, Dalinda, Cahuetos, Franchess, Matmut… mais j’aurai l’occasion de vous remercier à nouveau dans ma prochaine thèse de pharma! La suite dans un prochain épisode donc… Un grand merci aussi à la carabine-team avec Franky, Marcouillé, Lolo…vivement qu’on se refasse des sorties wakeboard et qu’on retrouve notre cygne!!! 3 Nancy n’aurait sans doute pas eu la même saveur si je n’avais pas rencontré ici aussi des super amis qui savent faire la fête comme il se doit!! Un grand merci a vous, Torlot et Jimos, mes anciens colocataires et précieux amis. Merci aussi à mes compagnons de sortie, de soirée, de ski vosgien, de musique, de pêche, de sport et j’en passe… Merci Tonio, Ben, Olivier, Nico, Aude, Jéjé, Caro, Trusty, Camille…Petite dédicace à Jeannot qui devra me rendre la coupe de squash et de tennis dès que j’aurai soutenu cette thèse! T’es foutu mec! Merci à tous de m’avoir fait découvrir cette région où il fait bon vivre!!! Mes prochains remerciements s’adresseront ensuite à ma famille : mes Mamys et Papys que j’embrasse de tout cœur là-haut.
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