DOCSLIB.ORG

Inventarizace Molekulární Biodiverzity Vybraných Druhů Ryb Čeledi Cyprinidae a Umbridae

Total Page：16

File Type：pdf, Size：1020Kb

Download full-text PDF Read full-text
Inventarizace Molekulární Biodiverzity Vybraných Druhů Ryb Čeledi Cyprinidae a Umbridae MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE Inventarizace molekulární biodiverzity vybraných druhů ryb čeledi Cyprinidae a Umbridae Disertační práce Soňa Stierandová Školitel: Mgr. Jan Mendel, Ph.D. Brno 2015 Bibliografický záznam Autor: Mgr. Soňa Stierandová Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita Ústav experimentální biologie Inventarizace molekulární biodiverzity Název práce: vybraných druhů ryb čeledi Cyprinidae a Umbridae Studijní program: Biologie Studijní obor: Obecná a molekulární genetika Mgr. Jan Mendel, Ph.D. Vedoucí práce: Ústav biologie obratlovců AV ČR, v.v.i Akademický rok: 2015/2016 Počet stran: 97 Klíčová slova: barcoding, cytochrom b, čeleď Cyprinidae, čeleď Umbridae, fylogeografie, genetická diverzita, inventarizace, mikrosatelity, mtDNA, ochranářská genetika, rod Alburnoides, sekvenování Bibliographic Entry Author: Mgr. Soňa Stierandová Faculty of Science, Masaryk University Department of Experimental Biology Molecular biodiversity inventory of selected Title of Thesis: fish species from families Cyprinidae and Umbridae Degree Biology Programme: Field of Study: General and Molecular Genetics Mgr. Jan Mendel, Ph.D. Supervisor: Institute of Vertebrate Biology, Academy of Sciences of the Czech Republic, v.v.i Academic Year: 2015/2016 Number of Pages: 97 Keywords: barcoding, consevation genetics, cytochrome b, family Cyprinidae, family Umbridae, phylogeography, genetic diversity, genus Alburnoides, inventory, microsatellites, mtDNA, sequencing Abstrakt Doktorská práce se zabývá inventarizací molekulární diverzity vybraných taxonů dvou čeledí Cyprinidae a Umbridae na národní i evropské úrovni. Spojovacími prvky jsou rozsáhlá molekulárně-genetická analýza zahrnující analýzy jaderných i mitochondriálních markerů a vývoj mikrosatelitových lokusů. Práce je tematicky složená ze čtyř volně navazujících částí. Inventarizace biodiverzity ichtyofauny ČR byla založena na sekvenační analýze mitochondriálního a jaderného markeru. Projekt byl zpracován pod záštitou iniciativy Barcode of Life metodou „DNA barcoding“ a významně rozšířil mezinárodní databázi BoLD. Poskytl důležité informace pro monitorovací systém NATURA 2000 i novou druhovou kolekci pro Národní muzeum ČR. Fylogeografická studie vybraných druhů rodu Alburnoides odhalila 17 evropsko-asijských linií. Byl nalezen vhodný linijně-identifikační klíč složený z analýzy mitochondriálního markeru a indelové diagnostiky dvou jaderných genů. Byla potvrzena druhová podhodnocenost tohoto rodu. Byla podpořena validita 11 morfologicky uznaných druhů a čtyři nové linie byly předloženy jako „species-in-waiting“. Pro nominotypický druh Alburnoides bipunctatus s. stricto byl vymezen nový distribuční areál. Pro populační studie rodu Alburnoides byla připravena nová knihovna polymorfních mikrosatelitových lokusů. Použitelnost těchto lokusů byla testována při cross-species amplifikacích zástupců rodu Alburnoides a dalších čtyř ohrožených cyprinidů. Při rozlišování vybraných druhů ouklejky se některé testované mikrosatelity projevily jako diagnostické. Konstrukcí knihovny nových STR lokusů pro blatňáka tmavého jsme se významně podíleli na doplnění malého již publikovaného mikrosatelitového setu. Tyto mikrosatelitové lokusy jsou použitelné pro budoucí repatriační a populační studie na českém a evropském území. Abstract The doctoral thesis is focused on molecular biodiversity inventory of selected fish species from two families, Cyprinidae and Umbridae. Linking elements are extensive molecular- genetic analysis concluding testing of nuclear and mitochondrial markers and testing of microsatellite loci. This thesis is thematically composed of four freely follow-up parts. The biodiversity inventory of ichthyofauna of the Czech Republic was based on analyses of the mitochondrial and nuclear markers. The project was processed under the auspices of the initiative Barcode of Life by method “DNA barcoding” and widened the database BoLD. This project also contributed to the monitoring system NATURA 2000 and for National Museum. Phylogeographical study of selected species of the genus Alburnoides revealed 17 Eurasian lineages. A good lineage-identification key composed of mitochondrial marker and indel diagnostics of nuclear genes was determined. Species underestimation within this genus was confirmed. The validity of 11 morphological valid species of genus Alburnoides was supported. Four lineages are considered as “species-in-waiting”. A new distribution area was determined for nominotypical species Alburnoides bipunctatus s. stricto. The new microsatellite library of polymorphic microsatellite loci for population studies was constructed. Usability of the loci was tested in the cross-species amplifications with individuals of genus Alburnoides and another four endangered cyprinids. Chosen species of spirlin are recognisable by using some microsatellites which were proved as diagnostic. We constructed the library of STR loci from the genome of European mudminnow and enriched the published small set of microsatellite loci. These microsatellites will be possible to use for repatriation and population studies in the Czech Republic and also widely in Europe. © Soňa Stierandová, Masarykova univerzita, 2015 Poděkování Na tomto místě bych ráda poděkovala svému školiteli Mgr. Janu Mendelovi, Ph.D. za jeho ochotu a možnost získat rozsáhlé laboratorní dovednosti a životní zkušenosti. Nemalý dík patří Mgr. Blance Urbánkové za pomoc při formálním zpracování disertační práce. Manželovi a rodině za jejich morální podporu, cenné rady a optimismus. OBSAH 1 ÚVOD 10 2 SOUČASNÝ STAV ŘEŠENÉ PROBLEMATIKY 11 2.1 Inventarizace ichtyofauny a DNA barcoding iniciativa 11 2.2 Taxonomický status vybraných druhů/poddruhů rodu Alburnoides v evropsko-asijském kontextu 12 2.3 Mikrosatelitové lokusy pro druhy rodu Alburnoides a Umbrides 14 3 CÍLE PRÁCE 15 4 MATERIÁL A METODIKA 16 4.1 Použitý materiál 16 4.1.1 Sběr vzorků vybraných druhů ichtyofauny ČR 16 4.1.2 Sběr vzorků rodu Alburnoides 17 4.1.3 Příprava a testování knihovny mikrosatelitů ouklejky pruhované a blatňáka tmavého 17 4.2 Analýza a hodnocení vnitrodruhové diverzity 17 4.2.1 Využití jaderného markeru 18 4.2.2 Využití mitochondriálního markeru 18 4.2.3 Využití mikrosatelitových lokusů 19 4.3 Použitá metodika 19 4.3.1 Metoda přímého sekvenování obecně 19 4.3.2 Metody použité při inventarizaci ichtyofauny ČR 20 4.3.3 Metody použité při inventarizaci evropských druhů rodu Alburnoides 20 4.3.4 Analýza mikrosatelitových lokusů obecně 21 4.3.5 Příprava knihovny mikrosatelitů 21 4.3.6 Zaklonování DNA řetězců heterozygotních jedinců u jaderných markerů 22 4.4 Použité statistické nástroje 23 4.4.1 Statistické nástroje použité při inventarizaci ichtyofauny ČR 23 8 4.4.2 Statistické nástroje pro vyhodnocení fylogeneze evropských ouklejek 23 4.4.3 Vyhodnocovací nástroje použité při přípravě mikrosatelitové knihovny 24 5 VÝSLEDKY 25 5.1 Inventarizace ichtyofauny České republiky 25 5.2 Fylogeneze a taxonomický status evropských ouklejek rodu Alburnoides 26 5.3 Mikrosatelitové lokusy využitelné pro studium ouklejky pruhované a dalších kriticky ohrožených cyprinidů 27 5.4 Mikrosatelitové lokusy pro populační studii rodu Umbra na území České republiky – nepublikovaný výsledek 27 6 DISKUZE 29 6.1 Inventarizace ichtyofauny České republiky 29 6.2 Taxonomický status evropských druhů rodu Alburnoides 30 6.3 Mikrosatelitové lokusy využitelné pro studium populací ouklejky pruhované a dalších cyprinidů 32 6.4 Mikrosatelitové lokusy využitelné pro repatriační program blatňáka tmavého 33 7 SHRNUTÍ 35 8 SEZNAM LITERATURY 37 9 SEZNAM ZKRATEK 42 10 PŘÍLOHY 44 Příloha I 44 Příloha II 73 Příloha III 86 9 1 ÚVOD Genetická diverzita je jedním ze znaků všech živých organismů. Tento proces je přirozenou protiváhou neustále se měnícímu životnímu prostředí. Genetická variabilita se tak stává zásadním faktorem pro adaptaci a přežití organismů. Zástupci ryb jsou vázáni k vodním zdrojům. Nemohou se volně pohybovat napříč územími, jsou tedy limitováni koryty řek, jezery, tůněmi. Během prehistorického vývoje docházelo k oddělování či spojování vodních ploch. Tyto procesy probíhají kontinuálně. Důsledkem lidské činnosti a s nástupem umělé regulace vodních toků vzniká nový činitel působící na obyvatele vodní říše. Tyto a další faktory jsou nedílnou součástí vývoje prostředí a působí jak pozitivně tak i negativně na genofond populací. Je proto snahou vědců a výzkumných týmů zjistit, jaké zákonitosti platí a pokusit se zachytit co největší množství této variability. Získané informace slouží při záchranných projektech a udržování populací. Při populačních výzkumech se využívají metodické přístupy jako sekvenace jaderných a mitochondriálních markerů nebo fragmentační analýza. Sekvenační analýza se uplatňuje při fylogenetických a fylogeografických studiích, při mapování aktuální diverzity na úrovni druhů, rodů, atd. Zatímco fragmentační analýza se používá při pozorování populací a příbuzenských vztahů uvnitř. Tato metoda vychází z vyšší mutační četnosti mikrosatelitů ve srovnání s bodovými mutacemi u jaderných či mitochondriálních markerů. Ochranářské aktivity se realizují jak na lokální tak i na celosvětové úrovni. Dobrými příklady mohou být iniciativy NATURA 2000, která se snaží o periodický monitoring a ochranu lokálních biotopů a populací nebo také iniciativa iBOL (International Barcode of Life project) sdružující největší databázi genetické diverzity na světě. Udržování a zachování biodiverzity je klíčovou spojnicí všech níže popsaných a vypracovaných studií. Navazuje
Load more

Recommended publications
  • The Ichthyofauna of the Moksha River, a Tributary of the Volga River Basin, Russia
    13 4 185 Artaev and Ruchin ANNOTATED LIST OF SPECIES Check List 13 (4): 185–202 https://doi.org/10.15560/13.4.185 The ichthyofauna of the Moksha River, a tributary of the Volga river basin, Russia Oleg N. Artaev, Alexander B. Ruchin Mordovia State Nature Reserve, Pushta settlement, Mordovia, Russia 431230. Corresponding author: Oleg N. Artaev, [email protected] Abstract The results of an 11-year study of the ichthyofauna in the Moksha River (central part of European Russia) are de- scribed here. Thirty-seven species were recorded, including 34 present in rivers and 26 in lake systems. Relative abundance and the occurrence of fish species from different types of water bodies are provided and the diversity of the ichthyofauna for this region is discussed. Key words Diversity; fish; lakes; Oka River. Academic editor: Bárbara Calegari | Received 18 January 2017 | Accepted 27 March 2017 | Published 28 July 2017 Citation: Artaev ON, Ruchin AB (2017) The ichthyofauna of the Moksha River, a tributary of the Volga river basin, Russia. Check List 13 (4): 185–202. https://doi.org/10.15560/13.4.185 Introduction 2013, Kuznetsov and Barkin 2003, Lysenkov et al. 2010, Lysenkov and Pjanov 2015) with some level of The Moksha River is one of the largest tributaries of the information of fish diversity for this region, but they did Oka River drainage, and the largest right-bank tributary not provide a complete scenario of fish abundance and of the Volga river basin. As a result, there is fragmentary distribution extension of the species in the Moksha river information on the diversity of ichthyofauna in this basin.
    [Show full text]
  • 199 Удк (038)597.2/.5(477) Українські Назви Міног І Риб
    УКРАЇНСЬКІ НАЗВИ МІНОГ І РИБ ФАУНИ УКРАЇНИ ДЛЯ НАУКОВОГО ВЖИТКУ 199 Biol. Stud. 2012: 6(2); 199–220 • DOI: https://doi.org/10.30970/sbi.0602.208 www.http://publications.lnu.edu.ua/journals/index.php/biology УДК (038)597.2/.5(477) УКРАЇНСЬКІ НАЗВИ МІНОГ І РИБ ФАУНИ УКРАЇНИ ДЛЯ НАУКОВОГО ВЖИТКУ Ю. Куцоконь1, Ю. Квач2 1Інститут зоології ім. І.І. Шмальгаузена НАН України, вул. Б.Хмельницького, 15, Київ 01601, Україна e-mail: [email protected] 2Одеський філіал Інституту біології південних морів НАН України, вул. Пушкінська, 37, Одеса 65011, Україна У роботі обговорені й перелічені українські вернакулярні назви видів, родів, рядів та класів міног і риб фауни України. Перелік наукових назв латиною наведе- но з урахуванням поточних таксономічних ревізій, українські назви подані з ураху- ванням сучасного українського правопису та критичного аналізу назв у літератур- них джерелах, починаючи з початку ХХ ст. Ключові слова: українські назви, риби, міноги, фауна України. ВСТУП Спроби вирішити питання національного називництва риб в Україні робилися неодноразово. Українські назви риб були представлені у монографіях і зведеннях В. Владикова [5], Ф.Д. Великохатька [3], А.М. Нікольського [18], Д.Є. Белінга [1, 2], Д.К. Третьякова [23], І.І. Колюшева [8], О.П. Маркевича, Й.І. Короткого [9], К.О. Ви- ноградова [4] тощо. Значним досягненням стало видання словників М. Шарлеманя і К. Татарка [27], О.П. Маркевича, К.I. Татарка [10]. Українські назви видів риб і ви- щих таксономічних категорій наведені в серії монографій „Фауна України” [11, 16, 17, 19, 21, 28]. Серед праць останнього часу слід відзначити зведення української номенклатури А.Я. Щербухи [29], серію праць Ю.В.
    [Show full text]
  • First Note on Fish Parasites in Polissky Nature Reserve, Northern Ukraine
    Vestnik Zoologii, 52(1): 53–58, 2018 DOI 10.2478/vzoo-2018-0007 UDC 591.619:597.42/55(477.41/42) FIRST NOTE ON FISH PARASITES IN POLISSKY NATURE RESERVE, NORTHERN UKRAINE N. Yu. Rubtsova*1, Yu. K. Kutsokon2 1 Institute of Parasitic Diseases (IPD), 11455 East Via Linda, #2-419, 85259, Scottsdale, Arizona, USA 2Schmalhausen Institute of Zoology, NAS of Ukraine, vul. B. Khmelnytskogo, 15, Kyiv, 01030 Ukraine *Corresponding author E-mail: [email protected] First Note on Fish Parasites in Polissky Nature Reserve, Northern Ukraine. Rubtsova, N. Yu., Kutsokon, Yu. K. — Nineteen species of parasites belonging to seven taxonomical groups were detected in nine species of fi sh (Gobio gobio (Linnaeus, 1758), Cobitis taenia Linnaeus, 1758, Squalius cephalus (Linnaeus, 1758), Rutilus rutilus (Linnaeus, 1758), Misgurnus fossilis (Linnaeus, 1758), Sabanejewia baltica Witkowski, 1994, Barbatula barbatula (Linnaeus, 1758), Esox lucius Linnaeus, 1758 and Perca fl uviatilis Linnaeus, 1758) from two small rivers in Polissky Nature Reserve in the northern part of Ukraine. Th e highest species richness of parasites was registered for G. gobio (7 species). Four species of parasites were found in S. cephalus. Th ree parasite species were found in E. lucius. Two parasite species were detected in R. rutilus and P. fl uviatilis. C. taenia, M. fossilis, and S. baltica harboured each one species of parasites. Gyrodactylus sp. from S. baltica was reported for the fi rst time. All parasites represent new geographical fi nding for the north of Ukraine. Key words: Polissky Nature Reserve, freshwater fi sh parasites, small rivers, Ukrainian inland waters. Polissky Nature Reserve occupies about 20,104 hectares between the Ubort and Bolotnytsya Rivers in the northwestern part of Zhytomyr Region in the north of Ukraine.
    [Show full text]
  • Biodiversity and Fishery Resources. Washington, DC : Island Press, 2007
    DOI https://doi.org/10.30525/978-9934-588-45-7.11 FISH DIVERSITY UNDER HUMAN IMPACT: A CASE STUDY OF THE PRIPYAT RIVER BASIN IN UKRAINE Grokhovska Yu. R., Konontsev S. V. INTRODUCTION The growing direct and indirect human impact on water bodies leads to a change in the hydrological and hydrochemical regime, violation of the living conditions of aquatic organisms and fish fauna in particular, and, in some cases, to complete degradation of aquatic ecosystems. The main threats to the ecosystems and fishes are habitat loss (including disruption of the bottom, removal of structure, water withdrawal, hydrologic alterations, eutrophication, and sediment deposition), introduced species, pollution, human population and consumption (the ultimate cause of everything), and overexploitation. These are the so-called HIPPO1, and Montgomery (2003)2 added another H: history – that is, our inability to learn from past mistakes. In addition, global climate change is recognized as a growing threat to aquatic ecosystems and fishes (IPCC 2007)3;4. Fish communities change quantitatively (decrease in abundance, patrticularly species with high commercial value) and qualitatively (decrease in biodiversity, particularly in endemic native species)5. The decrease in abundance and diversity of fishes is a reflection of humans’ attitude towards biological resources; neglect to act according to basic rules for conservation of biotic productivity and diversity. These negative trends are fully inherent in the fish fauna of the Rivne Oblast (region), which is one of the richest in freshwater bodies, in recent years provides only 1,1–2,1% of the total extraction of fish resources in Ukrainian inland waters (the fish have been growed in ponds by farming) (table 1).
    [Show full text]
  • Fish Occurrence in the Middle Volga and Upper Don Regions (Russia)
    Biodiversity Data Journal 8: e54959 doi: 10.3897/BDJ.8.e54959 Data Paper Fish occurrence in the middle Volga and upper Don regions (Russia) Oleg Artaev‡, Alexander Ruchin§, Victor Ivanchev |, Elena Ivancheva|, Vladimir Sarychev¶, Olga Moreva#, Vyacheslav Mikheev¤, Dmirty Medvedev«, Alexey Klevakin# ‡ Papanin Institute for Biology of Inland Waters Russian Academy of Sciences, Borok, Russia § Joint Directorate of the Mordovia State Nature Reserve and National Park "Smolny", Saransk, Russia | Oka Nature Reserve, Ryazan, Russia ¶ Galichya Gora Reserve, Lipetsk, Russia # Nizhny Novgorod branch of State Research Institute on Lake and River Fisheries, Nizhny Novgorod, Russia ¤ Ulyanovsk State Pedagogical University, Ulyanovsk, Russia « Severtsov Institute of Ecology and Evolution, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russia Corresponding author: Oleg Artaev ([email protected]) Academic editor: Dmitry Schigel Received: 01 Jun 2020 | Accepted: 24 Sep 2020 | Published: 08 Oct 2020 Citation: Artaev O, Ruchin A, Ivanchev V, Ivancheva E, Sarychev V, Moreva O, Mikheev V, Medvedev D, Klevakin A (2020) Fish occurrence in the middle Volga and upper Don regions (Russia). Biodiversity Data Journal 8: e54959. https://doi.org/10.3897/BDJ.8.e54959 Abstract Background In ichthyological publications from both Russia as a whole, and from the study region, lack of data indicating the actual results of observations in a specific place all result in publication of a generalised analysis. Although our publications contain such data, they are, however, not convenient for users performing global analysis. The main purpose of publishing a database is to make our data available in the global biodiversity system to a wide range of users. Dataset represents a significant addition to the distribution of species in this area.
    [Show full text]
  • Сова Вухата (Asio Otus), Повзик (Sitta Europaea), Дрізд-Горобинник (Turdus Pilaris), Омелюх (Bombycillа Garrulous)
    tetrix); кочових – 4: Сова вухата (Asio otus), Повзик (Sitta europaea), Дрізд-горобинник (Turdus pilaris), Омелюх (Bombycillа garrulous). Решта займають проміжне положення відносно вищеперелічених груп. Видовий склад птахів лісового масиву околиць смт Нова Борова представлений переважно перелітними птахами – 21 вид; кочових птахів налічується 3 види: Сова вухата (Asio otus), Повзик (Sitta europaea), Дрізд-горобинник (Turdus pilaris); осілих – 3: Яструб великий (Accipiter gentilіs), Сорока (Pica pica), Горлиця кільчаста (Streptopelia decaocto). Орнітофауна лісового масиву смт Нова Борова складається здебільшого з птахів кронників і дуплогніздників відповідно по 16 видів. Орнітофауна лісу околиць села Кропивня переважно складається з птахів кронників – 20 видів. Одним із значущих факторів, що впливають на чисельність птахів на придорожніх територіях, є шум транспорту. Меншу видову різноманітність, меншу кількість рядів і родин на території лісового масиву околиць смт Нова Борова порівняно з територією лісового масиву околиць с. Кропивня можна пояснити тим, що в околиці смт Нова Борова проходить автодорога сполученням Житомир – Коростень. Тобто дана територія підвержена більшому антропогенному впливу. Отримані дані можуть бути використані у подальших дослідженнях лісового орнітонаселення, у дослідженнях на виявлення впливу такого антропогенного чинника як автотранспорт на видову різноманітність птахів. ІХТІОФАУНА ЖИТОМИРСЬКОГО ПОЛІССЯ Ляшевич О. Ю., Вискушенко А. П., Шевчук С. Ю. Кафедра зоології Житомирського державного університету імені
    [Show full text]
  • European Red List of Freshwater Fishes Jörg Freyhof and Emma Brooks Published by the European Commission
    European Red List of Freshwater Fishes Jörg Freyhof and Emma Brooks Published by the European Commission This publication has been prepared by IUCN (International Union for Conservation of Nature). The designation of geographical entities in this book, and the presentation of the material, do not imply the expression of any opinion whatsoever on the part of the European Commission or IUCN concerning the legal status of any country, territory, or area, or of its authorities, or concerning the delimitation of its frontiers or boundaries. The views expressed in this publication do not necessarily reflect those of the European Commission or IUCN. Citation: Freyhof, J. and Brooks, E. 2011. European Red List of Freshwater Fishes. Luxembourg: Publications Office of the European Union. Design & Layout by: Tasamim Design - www.tasamim.net Printed by: The Colchester Print Group, United Kingdom Picture credits on cover page: The European Mudminnow (Umbra krameri) is a European endemic found in the Danube and Dniestr basin. Its population has declined by more than 30% in the past 10 years due to river regulation and drainage of wetlands for agriculture which resulted in a reduced number of backwaters. This species is therefore classed as Vulnerable. Photograph © Andreas Hartl. All photographs used in this publication remain the property of the original copyright holder (see individual captions for details). Photographs should not be reproduced or used in other contexts without written permission from the copyright holder. Available from: Publications Office of the European Union, http://bookshop.europa.eu IUCN Publications Services, www.iucn.org/publications A catalogue of IUCN publications is also available.
    [Show full text]
  • FAMILY Leuciscidae Bonaparte, 1835 - Chubs, Daces, True Minnows, Roaches, Shiners, Etc
    FAMILY Leuciscidae Bonaparte, 1835 - chubs, daces, true minnows, roaches, shiners, etc. SUBFAMILY Leuciscinae Bonaparte, 1835 - chubs, daces, true minnows, roaches, shiners, etc. [=Leuciscini, Scardinii, ?Brachyentri, ?Pachychilae, Chondrostomi, Alburni, Pogonichthi, Abramiformes, ?Paralabeonini, Cochlognathi, Laviniae, Phoxini, Acanthobramae, Bramae, Aspii, Gardonini, Cochlobori, Coelophori, Epicysti, Mesocysti, Plagopterinae, Campostominae, Exoglossinae, Graodontinae, Acrochili, Orthodontes, Chrosomi, Hybognathi, Tiarogae, Luxili, Ericymbae, Phenacobii, Rhinichthyes, Ceratichthyes, Mylochili, Mylopharodontes, Peleci, Medinae, Pimephalinae, Notropinae, Pseudaspinini] Notes: Leuciscini Bonaparte, 1835:[14] [ref. 32242] (subfamily) Leuciscus [genus inferred from the stem, Article 11.7.1.1; also Bonaparte 1837:[7] [ref. 32243]] Scardinii Bonaparte, 1839:fasc. 24, puntate 125 [ref. 4895] (no family-group name) [also Bonaparte 1841:Introduzione [18] [ref. 515]] ?Brachyentri Heckel, 1843:64 [ref. 2066] (Abtheilung) ? Leuciscus [no stem of the type genus, not available, Article 11.7.1.1] ?Pachychilae Heckel, 1847:280 [ref. 2068] (Abtheilung) ? Exoglossum [no stem of the type genus, not available, Article 11.7.1.1] Chondrostomi Agassiz, 1855:94 [ref. 71] (tribe) Chondrostoma [stem corrected to Chondrostomat- by Jordan 1877:59 [ref. 2374], confirmed by Jordan 1878:786 [ref. 2377] and by Meek 1904:43 [ref. 2958]] Alburni Girard, 1858:255 [ref. 4911] (tribe) Alburnus Pogonichthi Girard, 1858:242 [ref. 4911] (tribe) Pogonichthys [correct stem is Pogonichthy-] Abramiformes Dybowski, 1862:33, 35, 314 [ref. 1168] (subfamily) Abramis [stem changed to Abramid- by Günther 1868:299 [ref. 1990], confirmed by Jordan 1878:790 [ref. 2377] and by Weber & de Beaufort 1916:44 [ref. 4604]; senior objective synonym of Bramae Bleeker, 1863] ?Paralabeonini Bleeker, 1863–64:29 [ref. 4859] (stirps) ? Cochlognathus [also Bleeker 1863b:204 [ref. 397]; no stem of the type genus, not available, Article 11.7.1.1] Cochlognathi Bleeker, 1863–64:29 [ref.
    [Show full text]
  • Zoogeographical Freshwater Divisions of the Caucasus As a Part of the West Asian Transitional Region
    Proceedings of the Zoological Institute RAS Vol. 314, No. 4, 2010, рр. 469–492 УДК 597.2/.5:574.9 ZOOGEOGRAPHICAL FRESHWATER DIVISIONS OF THE CAUCASUS AS A PART OF THE WEST ASIAN TRANSITIONAL REGION A.M. Naseka Zoological Institute of the Russian Academy of Sciences, Universitetskaya Emb. 1, 199034 Saint Petersburg, Russia; e-mail: [email protected] ABSTRACT The Caucasus, together with Anatolia, Mesopotamia, internal Iranian and Afghan drainages form a region of ex- tremely high heterogeneity and transitional character between the “true” Holarctic, Sino-Indian and African re- gions sensu Berg (e.g. 1934, 1949). Its zoogeographical delineation is therefore of considerable interest. The goal of this study was to analyse zoogeographical affinities of the Caucasian ecoregions in terms of fish distribution and estimate the rank of the zoogeographical boundaries between the Caucasus and the drainages of north-eastern Europe (eastern Baltic, Dnieper, Don and Volga), and between the Caucasus and the Iranian basins. Based on a be- ta-diversity index and cluster analyses of lists of taxa (over 500) by the ecoregions, it is shown that faunas of the true freshwater fishes of the Caucasus displays a clear boundary with the eastern Europe, and that the ecoregions of the Ciscaucasia and the Transcaucasia exhibit striking dissimilarities from each other and from the Middle East basins. The Caucasus and neighbouring drainages of the southern coasts of the Black and Caspian seas are merged into the Caucasian Province which is included into the West Asian Transitional Region sensu Bănărescu (1991). The results also support delineation of six zoogeographical subdivisions, defined as districts of the Caucasian Province, namely, the West Ciscaucasian District, West Transcaucasian District, East Ciscaucasian District, East Transcaucasian District, the North Anatolian District, and Urmia District.
    [Show full text]
  • CHECKLIST of the FISHES and FISH-LIKE VERTEBRATES on the EUROPEAN CONTINENT and ADJACENT SEAS Seznam Ryb a Rybovitých Obratlovců Evropy a Okolních Moří
    ZO ČSOP VLAŠIM, 2009 CHECKLIST OF THE FISHES AND FISH-LIKE VERTEBRATES ON THE EUROPEAN CONTINENT AND ADJACENT SEAS Seznam ryb a rybovitých obratlovců Evropy a okolních moří LUBOMÍR HANEL 1), Ji ř í PLíŠTiL 2) & Ji n d ř i c h nOVÁK 3) 1) Charles University in Prague, Faculty of Education, Department of Biology and Envi- ronmental Education; Management of Protected Landscape Area Blaník 2) Trávník, Rychnov nad Kněžnou, Czech Republic 3) Czech Environmental Inspectorat, Prague Abstract: The complete list of registered species of the European ichtyofauna is pre- sented in this review. This list includes all European species of hagfishes (Myxini), lampreys (Petromyzontida), cartilaginous fishes (Chondrichthyes) and ray-finned fishes (Actinopterygii) living in inland European waters and adjacent seas. Native and intro- duced species are included. Each species account begins with the scientific name, author of that scientific name, and currently used common English and Czech name. Designations of general distribution in freshwater, estuarine (brackish) and marine waters are given in all mentioned species. Key words: Ichtyofauna (Myxini, Petromyzontida, Chondrichthyes, Actinopterygii), list of species, Europe and adjacent seas Introduction The complete Elementary list of European ichtyofauna (European continent and adja- cent seas) was still this time not compiled. Fr O e s e & Pa u L y ´s (2009) review of world´s ich- tyofauna is separated into several different European geographical areas in relation to salt and fresh waters. Fr e y h of & Kott e L a T (2007) summarized data about freshwater species recording from European inland waters together with diadromous and sporadic euryhaline species.
    [Show full text]
  • View/Download
    CYPRINIFORMES (part 15) · 1 The ETYFish Project © Christopher Scharpf and Kenneth J. Lazara COMMENTS: v. 12.0 - 20 Aug. 2021 Order CYPRINIFORMES (part 15 of 16) Family LEUCISCIDAE Minnows (part 1 of 2) Subfamily Pseudaspininae 3 genera · 24 species/subspecies Oreoleuciscus Warpachowski 1889 oreo-, mountain, referring to distribution in short upland streams that drain southern slopes of Tanny-Ula and Hangayin (Hangay), and northen slopes of the Mongolian Altai mountain ranges; leuciscus, possibly referring to similarity to and/ or perceived affinity with European Leuciscus, or possibly used as a generic suffix for dace (hence English vernacular, “mountain daces”) Oreoleuciscus angusticephalus Bogutskaya 2001 angustus, narrow; cephalus, head, referring to long, narrow neurocranium Oreoleuciscus dsapchynensis Warpachowski 1889 -ensis, suffix denoting place: Dsapchyn (also spelled Dsabchyn) River, northwestern Mongolia, type locality Oreoleuciscus humilis Warpachowski 1889 low, allusion not explained, perhaps referring to low body compared to known congeners at time of description Oreoleuciscus potanini (Kessler 1879) in honor of Grigory Nikolayaevich Potanin (1835-1920), Russian explorer of Inner Asia, who collected type Pseudaspius Dybowski 1869 pseudo-, false, i.e., although this genus may superficially resemble Aspius (which also has a wedge-shaped head), such an appearance is false Pseudaspius brandtii brandtii (Dybowski 1872) patronym not identified but probably in honor of German naturalist Johann Friedrich von Brandt (1802-1879)
    [Show full text]
  • Fisheries and Aquaculture Sector Study of Ukraine
    First draft on 20 October 2016 FISHERIES AND AQUACULTURE SECTOR STUDY OF UKRAINE Photos by courtesy of K. Demianenko, A. Didenko and V. Bekh FAO REU, 2016 The designations employed and the presentation of material in this information product do not imply the expression of any opinion whatsoever on the part of the Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO) concerning the legal or development status of any country, territory, city or area or of its authorities, or concerning the delimitation of its frontiers or boundaries. The mention of specific companies or products of manufacturers, whether or not these have been patented, does not imply that these have been endorsed or recommended by FAO in preference to others of a similar nature that are not mentioned. The views expressed in this information product are those of the author(s) and do not necessarily reflect the views of FAO. 2 Contents Preparation of this document Abstract Acknowledgement Abbreviations and acronyms EXECUTIVE SUMMARY 1. INTRODUCTION 1.1. Geography and climate 1.2. Agriculture 1.3. Role of fisheries and aquaculture 2. INLAND FISHERIES AND AQUACULTURE 2.1. Inland water resources 2.1.1. Rivers 2.1.2. Natural freshwater lakes 2.1.3. Coastal lakes 2.1.4. Water reservoirs 2.1.5. Pond fish farms 2.1.6. Canals 2.1.7. Underground waters 2.2. Inland fisheries resources 2.3. Inland fisheries 2.3.1. Commercial inland fisheries 2.3.2. Recreational fisheries on inland waters 2.3.3. Management of fish stocks in inland waters 2.4.
    [Show full text]