A Comprehensive Dna Barcoding Inventory Shows Taxonomic Warnings at the Holarctic Scale
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ITALIAN ODONATES IN THE PANDORA'S BOX: A COMPREHENSIVE DNA BARCODING INVENTORY SHOWS TAXONOMIC WARNINGS AT THE HOLARCTIC SCALE Andrea Galimberti*, Giacomo Assandri, Davide Maggioni, Fausto Ramazzotti, Daniele Baroni, Gaia Bazzi, Ivan Chiandetti, Andrea Corso, Vincenzo Ferri, Mirko Galuppi, Luca Ilahiane, Gianandrea La Porta, Lorenzo Laddaga, Federico Landi, Fabio Mastropasqua, Samuele Ramellini, Roberto Santinelli, Giovanni Soldato, Salvatore Surdo, Maurizio Casiraghi APPENDIX S4: M ulti-approach species delimitation of the 31 Zygoptera and 57 Anisoptera species investigated in this study based on Holarctic COI DNA barcode sequences from DS2. A Bayesian tree is used as base to summarize the two threshold-based (OT and ABGD) and four character explicit-based (PTP, MPTP, GMYC, bGMYC) approaches. Specimen haplotype identifiers are reported on tips (see Appendix S1 and S2 for further details) and the number of specimens sharing each haplotype is reported within brackets. Numbers above nodes represent BPP and BS, respectively, whereas asterisks correspond to maximal node support (BPP ≥ 0.99 and BS ≥ 95). Vertical colored solid boxes delimit putative species identified by the different approaches. Black: delimitation congruent with the identified morphospecies; Red: intraspecific delimitation; Light Blue: no interspecific delimitation; Yellow: Mixed species delimitation. In case of intraspecific delimitation, each lineage has been numbered with Roman numerals. This tree was created with BEAST 1.8.2. ABGDOT PTP MPTPGMYCbGMYC Z161 (1) Z155 (2) Z156 (1) Z151 (27) Z173 (1) Z162 (1) Z172 (1) Z163 (1) Z180 (1) Z157 (1) Z160 (1) Z159 (2) Z171 (1) * Z170 (1) Coenagrion mercuriale I Z149 (1) Z164 (29) Z169 (1) Z168 (1) 1/95 Z166 (2) Z167 (1) Z165 (11) Z158 (1) Z176 (1) Z152 (6) Z154 (1) Z177 (1) .91/82 Z150 (1) Z178 (1) Z153 (26) Z175 (1) Z179 (1) Z181 (9) Z182 (1) Coenagrion mercuriale II Z174 (5) Z184 (1) 1/95 Z185 (1) Z183 (1) Z38 (21) Z42 (1) Z36 (7) Z40 (1) Coenagrion mercuriale III Z39 (4) * Z37 (2) Z41 (1) Z44 (1) (a) Z189 (1) (a) Z195 (5) (a) Z187 (3) (a, c) Z192 (1) (a) Z186 (4) (c) Z198 (1) (a) Z45 (18) (a, b, c) Z193 (1) (a) Z52 (1) (a) (a) Z196 (1) (a) Coenagrion puella / Z188 (1) (c) (b) Z46 (1) (a) Z201 (2) (b) Coenagrion pulchellum / (c) Z51 (3) (a, b) Z200 (1) (b) Coenagrion ornatum Z199 (1) (b) Z53 (3) (a) Z197 (2) (a) Z58 (7) (b) .99/96 Z59 (1) (b) Z43 (3) (c) Z57 (1) (c) Z49 (2) (a) Z202 (1) (b) Z190 (1) Z191 (3) Coenagrion puella Z194 (1) * Z148 (1) Z34 (4) Coenagrion hastulatum Z35 (1) * Z144 (1) Z145 (1) Z143 (1) Z146 (1) Z32 (2) Z31 (1) Coenagrion caerulescens Z30 (1) * Z28 (1) Z26 (2) Z29 (1) Z27 (1) Z61 (5) Z64 (1) Z63 (1) Coenagrion scitulum * Z60 (1) Z216 (1) Z214 (1) Z213 (1) Z77 (1) Z83 (1) Z88 (1) Z71 (10) Erythromma lindenii I Z86 (1) Z85 (1) Z80 (1) * Z78 (1) Z217 (1) Z72 (3) Z81 (2) Z79 (1) Z215 (1) Z74 (5) Erythromma lindenii II Z75 (1) * Z73 (5) Z90 (1) Z227 (1) Z220 (1) Z219 (24) Z228 (1) Z226 (1) Z234 (1) Z236 (1) Z222 (6) Z224 (7) Z225 (1) Erythromma najas Z233 (1) Z89 (1) Z230 (1) Z235 (1) Z221 (5) * Z223 (1) Z232 (1) Z218 (33) Z231 (1) Z229 (1) Z93 (2) Z91 (1) Z237 (1) Z95 (1) Erythromma viridulum Z92 (3) * Z94 (1) Z97 (3) (b) Z98 (1) (b) Z239 (1) (b) Z242 (3) (b) Z241 (5) (b) Z238 (1) (b) Z240 (1) (b) Z243 (1) (b) Z96 (2) (b) Z245 (1) (b) Z244 (1) (b) (a) Z256 (1) (b) Ischnura genei / Z255 (4) (b) (b) Z254 (1) (b) Ischnura elegans Z99 (1) (a) Z101 (1) (a) 1/98 Z100 (1) (a) Z247 (1) (b) Z249 (1) (b) Z251 (1) (b) Z250 (1) (b) Z253 (1) (b) Z248 (1) (b) Z252 (1) (b) Z210 (1) Z66 (2) Z208 (4) Z212 (1) Z69 (1) Z65 (3) Z205 (1) Enallagma cyathigerum Z206 (1) Z209 (1) 97/99 Z204 (2) Z203 (1) Z67 (3) Z211 (1) Z102 (7) Z258 (1) Ischnura pumilio Z257 (2) * Z125 (5) Z128 (1) Z129 (1) Z124 (1) Platycnemis pennipes Z281 (1) * Z280 (1) Z289 (1) Z284 (1) Z282 (1) Z130 (3) Z285 (1) Z283 (1) Z281 (3) Z287 (1) Pyrrhosoma nymphula Z293 (1) Z286 (1) Z292 (1) Z288 (1) * Z131 (1) Z290 (2) Z274 (1) Z270 (1) Z272 (1) Z271 (1) Z279 (1) Z122 (1) Z273 (1) Nehalennia speciosa Z123 (1) Z275 (1) * Z277 (1) Z278 (1) Z276 (1) Z14 (4) Z15 (3) Z139 (3) Ceriagrion tenellum * Z140 (2) Z6 (5) (a, b) (a) Z13 (2) (a, b) Calopteryx splendens / * Z8 (1) (b) Z5 (1) Calopteryx xanthostoma Z9 (4) Z138 (1) Z136 (1) Calopteryx virgo Z137 (1) Z10 (2) * Z3 (2) Z1 (5) Calopteryx haemorrhoidalis Z2 (1) * Z261 (1) Z264 (1) Z260 (1) Z262 (1) 1/95 Z259 (14) Lestes dryas I Z265 (1) Z267 (1) Z263 (2) 1/97 Z266 (1) Z112 (1) Z108 (1) Z111 (1) Z109 (2) Lestes dryas II 1/96 Z110 (1) Z107 (1) Z116 (1) Z115 (1) Lestes sponsa Z114 (1) * Z118 (1) Z268 (1) Z121 (1) Z117 (3) Lestes virens Z269 (1) Z119 (3) * Z104 (2) Z106 (1) * Z105 (1) Lestes barbarus Z113 (1) Lestes macrostigma Z301 (1) 0.02 Z298 (3) Z299 (1) Z295 (1) Z300 (1) Sympecma paedisca * Z135 (1) Z297 (1) Z296 (1) Z133 (2) Z294 (2) Z132 (7) Sympecma fusca 1/98 Z134 (1) Z23 (1) Z19 (5) Z20 (1) Z142 (1) Z141 (1) Chalcolestes viridis * Z24 (1) Z21 (1) (a) Z17 (4) (a) Chalcolestes parvidens / * Z22 (1) (b) Chalcolestes viridis(b) ABGDOT PTP MPTPGMYCbGMYC A196 (1) A198 (2) A202 (20) A215 (1) A203 (1) A204 (1) A205 (1) A7 (2) A206 (1) A8 (5) Aeshna grandis A199 (1) A207 (1) A209 (1) A214 (1) A208 (1) A210 (1) * A211 (1) A212 (1) A213 (1) A5 (1) A189 (8) A190 (2) A191 (1) A6 (2) A192 (1) Aeshna cyanea A193 (1) A194 (2) 1/98 A197 (1) A196 (1) A195 (8) A249 (2) A245 (1) A16 (1) A247 (1) A248 (2) Aeshna mixta A15 (1) 1/97 A246 (1) A238 (1) A229 (1) A224 (4) A232 (1) A228 (1) A240 (1) A231 (1) A243 (1) A236 (1) A227 (1) A233 (1) A244 (1) A235 (1) Aeshna juncea I A234 (1) A220 (4) A230 (1) A239 (1) A221 (2) A219 (1) .95/70 A222 (1) A226 (1) A237 (1) A242 (2) A223 (2) A217 (1) A225 (1) A12 (1) .98/82 A13 (1) Aeshna juncea II A241 (1) * A14 (1) A218 (1) A255 (1) A18 (1) A250 (1) A17 (1) A254 (1) Aeshna subarctica .98/79 A252 (1) A251 (1) A253 (1) A4 (1) A9 (1) Aeshna caerulea A10 (1) A11 (1) Aeshna isoceles * A264 (4) (a) A263 (1) (a) A268 (1) (a) A267 (2) (a) A272 (1) (b) A273 (1) (b) A271 (1) (b) A264 (14) (a) (a) A270 (2) (a) A21 (4) (a) Anax imperator / A266 (2) (a) (b) A22 (1) (a) Anax parthenope A23 (1) (a) A24 (1) (a) * A269 (1) (a) A25 (2) (a, b) A274 (1) (b) A27 (1) (b) A28 (1) (b) A20 (1) A257 (3) A262 (1) A260 (1) A261 (1) Anax ephippiger A256 (2) A19 (1) * A259 (1) A258 (1) A276 (4) A34 (2) * A33 (1) Brachytron pratense A35 (1) A1 (1) A3 (1) A2 (2) Aeshna affinis * A188 (1) A29 (1) Boyeria irene * A30 (2) A47 (4) A43 (2) A301 (1) A48 (2) A295 (1) A288 (1) A303 (1) A44 (1) A46 (1) A45 (5) A302 (1) Cordulegaster boltonii A298 (1) A297 (1) A299 (1) A294 (1) .99/98 A49 (1) A293 (1) A300 (1) A291 (1) A292 (1) A290 (1) A53 (1) A63 (1) A59 (1) A65 (1) A55 (2) A64 (1) A62 (1) Cordulegaster trinacriae A57 (1) A60 (1) A56 (1) A54 (1) .99/92 A61 (1) A58 (1) A51 (2) A50 (1) A305 (1) Cordulegaster heros * A304 (1) A286 (1) A36 (2) A285 (1) A279 (1) A280 (1) A277 (1) A278 (1) A281 (1) A283 (1) A282 (1) Cordulegaster bidentata A284 (1) A42 (1) A40 (1) A41 (1) 1/90 A38 (1) A37 (1) A287 (1) A39 (1) A359 (2) A360 (1) A364 (2) A361 (1) A363 (1) Onychogomphus forcipatus I .6/88 A362 (1) A97 (3) A365 (1) A102 (1) * A96 (7) A103 (1) Onychogomphus forcipatus II A366 (1) .95/59 A104 (1) A94 (1) A358 (1) * A92 (2) Lindenia tetraphylla A93 (4) A141 (1) A381 (1) A280 (1) Paragomphus genei A139 (2) A382 (1) * A108 (3) A107 (1) Onychogomphus uncatus * A367 (1) A109 (2) Ophiogomphus cecilia A319 (1) A318 (1) A317 (1) Gomphus vulgatissimus * A76 (3) A316 (3) * A315 (1) Stylurus flavipes I A162 (1) Stylurus flavipes II * A348 (1) A325 (1) A354 (1) A340 (1) A347 (1) A333 (5) A326 (1) A328 (1) A329 (2) A352 (1) A327 (1) A349 (2) A331 (1) A336 (1) A356 (1) A339 (1) A357 (1) A346 (1) A337 (1) Libellula quadrimaculata A355 (1) A350 (1) A343 (1) A330 (1) A351 (1) A353 (1) A332 (1) A335 (1) A345 (1) A344 (1) A341 (1) A334 (1) A338 (1) * A91 (1) A90 (2) A324 (1) A323 (1) A89 (1) A342 (1) A88 (1) A85 (1) * A86 (1) Libellula fulva A87 (1) A81 (1) A84 (1) A82 (4) Libellula depressa * A118 (2) A123 (1) A121 (1) A373 (1) A117 (1) A122 (1) Orthetrum cancellatum .99/96 A120 (1) A374 (1) A119 (1) A369 (1) A368 (1) Orthetrum albistylum I A110 (2) A372 (1) .99/93 A370 (1) Orthetrum albistylum II A371 (1) Orthetrum albistylum III A131 (3) A124 (9) A375 (1) A128 (6) A378 (1) * A377 (6) Orthetrum coerulescens A376 (1) A129 (1) A132 (1) A112 (2) A111 (1) A115 (1) * A116 (1) Orthetrum brunneum A114 (2) A133 (2) A134 (1) Orthetrum nitidinerve A379 (10) A135 (2) Orthetrum trinacria A415 (1) A414 (1) A420 (1) A418 (1) A416 (6) A421 (1) A413 (1) Sympetrum vulgatum A417 (1) * A410 (1) A419 (2) A412 (1) A411 (1) A183 (8) A407 (1) A180 (5) A409 (1) Sympetrum striolatum A182 (1) * A408 (1) A405 (1) A178 (2) A404 (1) A406 (1) Sympetrum sanguineum * A179 (2) A177 (1) A173 (1) A401 (1) A174 (1) Sympetrum meridionale A172 (1) * A398 (1) A166 (2) Sympetrum flaveolum A168 (1) * A394 (1) A397 (1) A393 (1) A396 (1) A389 (8) A390 (1) Sympetrum danae I A395 (1) * A391 (1) A387 (5) A392 (1) * A386 (1) A163 (1) A164 (1) Sympetrum danae II A388 (2) * A165 (2) Sympetrum depressiusculum A402 (1) A175 (1) A176 (1) Sympetrum pedemontanum A403 (2) * A69 (1) A311 (4) A73 (1) A72 (1) A70 (1) A71 (1) A309 (2) Crocothemis erythraea A307 (1) A313 (2) * A308 (1) A312 (2) A314 (1) A310 (4) A78 (1) A320 (1) .98/100 A321 (1) A322 (1) Leucorrhinia dubia A79 (3) A80 (1) Leucorrhinia pectoralis A169 (2) A399 (1) A170 (2) Sympetrum fonscolombii A400 (1) * A75 (1) A74 (1) Diplacodes lefebvrii * A384 (1) (a) A157 (1) (a) A385 (3) (b) (a) A160 (3) (b) Somatochlora meridionalis / A154 (2) (a) A161 (1) (b) (b) A155 (1) (a) Somatochlora metallica * A158 (1) (a) A159 (1) (a) 1/94 A145 (5) A147 (1) Somatochlora alpestris A149 (1) A150 (1) Somatochlora arctica * A153 (1) A383 (1) A152 (1) Somatochlora flavomaculata A151 (2) * A67 (2) A306 (1) A68 (3) Cordulia aenea * A422 (1) A424 (2) A423 (1) * A186 (1) Trithemis annulata A185 (2) A184 (1) A31 (3) A275 (1) Brachythemis impartita * A143 (1) A144 (1) Selysiothemis nigra * A142 (1) A187 (1) 0.03 A426 (1) Zygonyx torridus .96/100 A425 (3) A137 (1) A138 (1) Oxygastra curtisii * A136 (1).