Biodegradación De Haps Durante La Biorremediación Aeróbica De Suelos Contaminados Con Hidrocarburos Del Petróleo
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Biodegradación de HAPs durante la biorremediación aeróbica de suelos contaminados con hidrocarburos del petróleo. Análisis de poblaciones bacterianas y genes funcionales Andrés Ricardo Izquierdo Romero ADVERTIMENT. La consulta d’aquesta tesi queda condicionada a l’acceptació de les següents condicions d'ús: La difusió d’aquesta tesi per mitjà del servei TDX (www.tdx.cat) i a través del Dipòsit Digital de la UB (diposit.ub.edu) ha estat autoritzada pels titulars dels drets de propietat intel·lectual únicament per a usos privats emmarcats en activitats d’investigació i docència. No s’autoritza la seva reproducció amb finalitats de lucre ni la seva difusió i posada a disposició des d’un lloc aliè al servei TDX ni al Dipòsit Digital de la UB. No s’autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX o al Dipòsit Digital de la UB (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant al resum de presentació de la tesi com als seus continguts. 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Facultad de Biología Departamento de Microbiología Programa de doctorado Microbiología Ambiental y Biotecnología Biodegradación de HAPs durante la biorremediación aeróbica de suelos contaminados con hidrocarburos del petróleo. Análisis de poblaciones bacterianas y genes funcionales Memoria presentada por Andrés Ricardo Izquierdo Romero para optar al grado de Doctor por la Universitat de Barcelona Tesis realizada bajo la dirección de la Dra. Magdalena Grifoll Ruiz (Profesora Titular) y el Dr. Joaquim Vila Grajales (Profesor Asociado e Investigador) del Departamento de Microbiología, Facultad de Biología, Universitat de Barcelona Directora y Tutora, Director, Magdalena Grifoll Ruiz Joaquim Vila Grajales Autor, Andrés Ricardo Izquierdo Romero Barcelona, Noviembre 2013 Está tesis ha sido financiada por el Gobierno Nacional de la República del Ecuador, a través de una beca de la Secretaria de Educación Superior, Ciencia, Tecnología e Innovación (Senescyt), convocatoria Francia 2008, para estudios de postgrado de master y doctorado, y del proyecto financiado por el Ministerio de Ciencia e Innovación del Gobierno de España, Identificación, evaluación y explotación de las funciones catabólicas de la rizosfera para la recuperación de suelos contaminados con hidrocarburos aromáticos policíclicos (CGL2010-22068-CO2-02). Cubierta: Andrés Izquierdo Romero (2013) A toda mi familia, mis hermanos, mis tíos y tías, mi abuelita y en especial a mis padres, por el amor y apoyo incondicional que he recibido durante todos estos años de sacrificio. A mi país, Ecuador. Agradecimientos Quiero comenzar dando gracias a Dios y a mi Madre Dolorosa, por darme esta oportunidad de terminar mis estudios de doctorado, son muchas personas e instituciones que me han ayudado y me han permitido terminar esta etapa de mi vida, espero nombrarles a todos, primeramente a la Secretaria Nacional de Educación Superior, Ciencia y Tecnología (Senescyt) y al Gobierno del Ecuador, por brindarme la oportunidad de realizar mis estudios de postgrado en el extranjero por medio de una beca, a la Escuela Politécnica del Ejército (ESPE, Quito-Ecuador), por formarme como Ingeniero en Biotecnología y su auspicio para poder acceder a la beca. A los profesores del Master en Contaminación y Toxicología Ambientales y compañeros del laboratorio de Biología Celular Histología de la Universidad de País Vasco (Bilbao, España), Dr. Ibon Cancio, Dr. Ionan Marigomez, Amaia, Oihane, Eider, a mis amigos en Bilbao, Alberto, Diana, Vinicio, Edwin, Miguel, Fabrice, Pilar por compartir su amistad durante mi estancia durante un año en Bilbao, una etapa previa para comenzar mi investigación doctoral en la Universidad de Barcelona. Ya en la etapa de mi doctorado, quiero agradecer primeramente y de manera muy especial a la Dra. Magdalena Grifoll por aceptarme en su grupo de investigación y ser mi directora de tesis, por permitirme realizar mi investigación doctoral en biorremediación de suelos contaminados por hidrocarburos, una prioridad y una necesidad en mi país, por impartirme sus conocimientos, su paciencia, su tiempo y su ayuda durante todos estos años, especialmente en la fase de escritura de la tesis, muchas gracias por todo. En segundo lugar al Dr. Joaquim Vila por ser mi codirector, por su ayuda recibida durante toda la investigación de la tesis, especialmente en la fase de laboratorio, por su gran experiencia, sus enseñanzas y de igual manera en la etapa de escritura de la tesis, gracias por su tiempo y su paciencia. También a su novia Aintzane por su ayuda. Al Dr. José María Nieto, por sus saludos día a día, sus consejos, ánimos, sus conversaciones en el laboratorio, su manera de ser y su ayuda brindada durante todo este tiempo. i A la empresa Geotecnia 2000, a Lina Ortega, por brindarme la oportunidad de trabajar con la empresa privada, especialmente por la facilidad de las muestras de suelos contaminados de un emplazamiento real y poder trabajar con ellas en mi investigación y por la ayuda brindada durante todo este tiempo. Al Dr. Pierre Peyret y la Dra. Corinne Petit por permitirme realizar mi estancia doctoral fuera de Barcelona, en su grupo de investigación en el Laboratory Microorganisms, Genome and Environment (LMGE) - UMR CNRS 6023, Clermont- Ferrand, France, y la oportunidad de trabajar en su grupo de investigación, un tiempo muy productivo y muy importante para mi investigación, además de la posibilidad de recordar y practicar el francés. Agradecer también a mis compañeros del laboratorio 5, a Salva, Laia, Sara G., William, Naiara por compartir buenos momentos en el laboratorio, a Sara M. por su amistad durante mi primer año de investigación y a Marga Tauler por su ayuda en el laboratorio, durante la investigación y su compañía durante estos tres años de estancia en el laboratorio. Al personal administrativo del Departamento de Microbiología, a los amigos y compañeros de la fase 1 y 2, por compartir saludos, conversaciones en el pasillo, Mónica, Lily, Susana, Silvia, Amanda, Tania, Frank, Lucia, Nerea, Ivania, Raquel, Silvia C., Tarik, Anna, Marta, Xavi, Laura, Byron, Julia, Alex, Byron y Sandra, y más. Un agradecimiento especial al Doctor Ayalke y al Dr.Jesús (Chus) por brindarme una verdadera amistad y compartir buenos momentos fuera y dentro del laboratorio, especialmente por ser los primeros en invitarme a tomarme unas cervezas en el lab, y la oportunidad de conocer a mas buenos amigos como Daniel y Meritxell. A mis amigos y compañeros de mi convocatoria de beca, que compartimos la experiencia de estudiar fuera del país, Marco, Mauricio, Tony, Luis, Danilo, Esteben, Marjorie, Miguel y más. A mis compañeros y amigos becarios de la Senescyt en Barcelona, Andrés, Juan Carlos, Willian, David, Luis, Yani, Lourdes, Santiago, Gliset, Liliana, Pablo, por los gratos momentos compartidos fuera de las aulas y su amistad. A mis amigos en Barcelona, con los que compartimos buenos momentos, salidas, viajes y cervezas, a Juan Pablo cuantos años de amigos, Antonio, Rui, Ines, Jorge, Marco, Agata, Marta, Isabel, Helena, Irina, Ana y a toda la gente de Pokaż cycki. A Sandra e Igor mis amigos y compañeros de piso. Por tantos buenos momentos y salidas durante este tiempo en Barcelona. ii A mis amigos de mi colegio y de la universidad en Ecuador, Pablo, Francisco, José, Juan Pablo, Geovanny, Alejandra, Rommel, Ricardo y muchas más. A mis amigos en Ecuador, Carlos, Juan Francisco, Juan Carlos, Jorge, Byron, Paul y muchos más y en especial a Alberto y José Sánchez por tantos años de amistad y experiencias vividas juntos, gracias hermanos. Por ultimo agradecer a lo que me impulso y me dio aliento durante todo este tiempo fuera de mi país, lo más importante en mi vida, toda mi familia, a mi padre Carlos y mi madre Magdalena, por su amor y ejemplo, y su gran sacrificio por permitirme estudiar y ser lo que soy, a mis hermanos, Juan Carlos por su entrega y ayuda a toda mi familia, María y Nicole mi hermana pequeña que espero lo mejor para ella. A mi abuelita un ejemplo de vida, por sus bendiciones y ser la unión de toda la familia, a mis tías Carmelita, Mónica, Silvia por su apoyo y cariño, a mis tíos Carlos, Eduardo, Marcelo por su ayuda en la obtención de mi beca y creer en mí, a Geovanny por ser mi tío y profesor en el colegio e introducirme el gusto a la Biología.