DOCSLIB.ORG

Tesis Doctoral Reducida

Total Page：16

File Type：pdf, Size：1020Kb

Download full-text PDF Read full-text

Load more

Tesis Doctoral Caracterización de cepas de Acinetobacter baumannii que no producen lipopolisacárido, y su uso en el desarrollo preclínico de anticuerpos monoclonales terapéuticos Marta Claudia Carretero Ledesma Sevilla 2018 Programa Doctoral en Biología Molecular, Biomedicina e Investigación Clínica Departamento de Medicina Univesidad de Sevilla Director 1: Dr. Jerónimo Pachón Díaz Director 2: Dr. Michael J. McConnell PRODUCCIONES CIENTÍFICAS FRUTO DE LA TESIS DOCTORAL Publicaciones 1. Meritxell García-Quintanilla, Marta Carretero-Ledesma, Patricia Moreno-Martínez, Reyes Martín-Peña, Jerónimo Pachón, Michael J. McConnell. Lipopolysaccharide loss produces partial colistin dependence and collateral sensitivity to azithromycin, rifampicin and vancomycin in Acinetobacter baumannii. International Journal of Antimicrobial Agents. Volumen: 46. 696 -702. Mayo 2015. 2. Marta Carretero-Ledesma, Meritxell García-Quintanilla, Reyes Martín-Peña, Marina R. Pulido1, Jerónimo Pachón and Michael J. McConnell. Phenotypic Changes Associated with Colistin Resistance due to Lipopolysaccharide Loss in Acinetobacter baumannii. Virulence. Abril 2018. Comunicaciones a congresos 1. Marta Carretero-Ledesma, Meritxell García-Quintanilla, Jerónimo Pachón, Michael J. McConnell. Colistin dependence and phenotypic changes in Acinetobacter baumannii acquiring colistin resistance due to loss of lipopolysaccharide. European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID 2015), 25 - 28 Abril del 2015, Copenhagen, Dinamarca. Tipo de participación: Póster. Publicación: P0281. 2. Marta Carretero-Ledesma, Meritxell García-Quintanilla, Jerónimo Pachón and Michael J. McConnell. Loss of lipopolysaccharide produces alters growth, biofilm production, disinfectant susceptibility and motility in Acinetobacter baumannii. 10th International Symposium on the Biology of Acinetobacter. (Junio de 2015). Atenas, Grecia. Tipo de participación: Comunicación oral. Publicación: 0-10. 3. Cebrero-Cangueiro T, Mazzotta S, Carretero-Ledesma M, Iglesias-Guerra F, Jiménez-Baus A, Sánchez Céspedes J, Vega-Holm M, Smani Y, Candela-Lena JI, Labrador-Herrera G, Vega-Pérez JM, Pachón J, Pachón-Ibáñez ME. In vitro activity of a library of piperazine derivatives against two clinical strain of colistin resistant Acinetobacter baumannii. 11th International Symposium on the Biology of Acinetobacter. (Septiembre de 2017). Sevilla, España. Tipo de participación: Póster. Publicación: P7-6. 3 4. Juan Domínguez-Herrera, Marta Carretero-Ledesma, Pilar Pérez-Romero, Jerónimo Pachón, Michael J. McConnell, Juan José Infante. A unique vaccine candidate against Acinetobacter baumannii based on lipopolysaccharide-deficient whole cells. 11th International Symposium on the Biology of Acinetobacter. (Septiembre de 2017). Sevilla, España. Tipo de participación: Póster. Publicación: P7-7. PUBLICACIONES ASOCIADAS A LA LÍNEA DE INVESTIGACIÓN 1. Meritxell García-Quintanilla, Marina R. Pulido, Marta Carretero-Ledesma, and Michael J. McConnell. Vaccines for Antibiotic-Resistant Bacteria: Possibility or Pipe Dream?. Trends in Pharmacological Sciences. Volumen: 37. 143-152. Febrero 2016. 2. Mazzota, Sarah; Cebrero-Cangueiro, Tania; Vega-Holm, Margarita; Sanchez- Cespedes, Javier; AIELLO, Francesca; Fernández, Inmaculada; Carretero-Ledesma, Marta; Vega-Pérez, José; Smani, Younes; Pachón, Jerónimo; Iglesias-Guerra, Fernando; Pachón-Ibáñez, Mª Eugenia. Piperazin-derived thioureas against clinical isolates of colistin-resistant Acinetobacter baumannii. Synthesis and in vitro biological evaluation. Future Medicinal Chemistry. EN PREPARACIÓN. 4 5 INDICE Abreviaciones 10 INTRODUCCIÓN 13 1. Taxonomía y biología de Acinetobacter 14 1.1 Taxonomía 14 1.2. Biología de A. baumannii 16 1.2.1 Características de la membrana externa 17 1.2.2 Lipopolisacárido 18 1.2.3 Síntesis del lípido A 19 1.2.4 Importancia biológica del LPS 20 1.2.5 Implicaciones biológicas en A. baumannii por la pérdida del LPS 22 1.3 Patogénesis del microorganismo 23 1.3.1 La producción de biofilm 23 1.3.2 La motilidad en superficies semisólidas 25 1.3.3 La adquisición de hierro 25 1.3.4 La presencia de la OmpA en la membrana 26 2. Implicación clínica de A. baumannii 28 2.1 Importancia clínica 28 2.2 Manifestaciones clínicas e infecciones más frecuentes 29 2.2.1 Infecciones respiratorias 30 2.2.2 Bacteriemias 31 2.2.3 Infecciones del tracto urinario 31 2.2.4 Infecciones del sistema nervioso central 32 2.2.5 Otras infecciones 32 3. Resistencia antibiótica en A. baumannii 33 3.1. Perspectiva histórica del desarrollo de resistencias en A. baumannii y emergencia de cepas multirresistentes 33 3.2. Principales grupos de antibióticos utilizados como tratamiento de infecciones causadas por A. baumannii 36 3.2.1 Betalactámicos 36 3.2.2. Fluoroquinolonas 38 3.2.3 Aminoglucósidos 38 3.2.4 Tetraciclinas 39 3.2.5 Glicilciclinas. 40 3.2.6 Sulbactam 40 3.2.7 Rifamicinas 41 3.2.8 Polimixinas 41 6 INDICE 3.2.8.1 Colistina 42 4. Desarrollo de nuevas estrategias de prevención. Inmunoterapia 45 4.1. Potencial terapéutico de anticuerpos monoclonales. 46 4.2 Anticuerpos monoclonales humanizados 48 4.3 Anticuerpos en uso y desarrollo para el tratamiento de enfermedades infecciosas 50 4.4 Inmunoterapia para A. baumannii 53 5. Fundamento 55 HIPÓTESIS 57 Capítulo 1 58 Capítulo 2 58 OBJETIVOS 59 OBJETIVO GENERAL 60 OBJETIVOS ESPECÍFICOS POR CAPÍTULO 60 Capítulo 1 60 Capítulo 2 61 MATERIALES Y REACTIVOS 62 1. Material invariable 63 2. Material fungible 64 2.1 Material de laboratorio 64 2.2. Medios de cultivo 65 2.3. Antimicrobianos para estudios in vitro 65 2.4. Material para experimentación animal 67 2.5 Reactivos y Kits de experimentación 67 3. Material biológico 69 3.1 Cepas bacterianas 69 3.2 Línea celular en cultivo 70 3.3 Animales de experimentación 70 METODOLOGÍA 71 1. Aislamiento de cepas con mutación en LPS 72 2. Niveles de endotoxina 73 3. Determinación de la concentración mínima inhibitoria (CMI) de diversos antibióticos 73 4. Estudio de permeabilidad de la membrana bacteriana 74 5. Curva de crecimiento en presencia de péptidos antimicrobianos 75 7 INDICE 6. Ensayos E-test de colistina 75 7. Ensayo de supervivencia 76 8. Curva de crecimiento 76 9. Curva de crecimiento en Mueller Hinton Broth y suero humano 77 10. Tiempo de generación 77 11. Determinación del índice de competencia 78 12. Producción de biofilm 79 13. Determinación de la CMI de desinfectantes 80 14. Determinación de la motilidad 80 15. Curvas de crecimiento en presencia del quelante de hierro 2,2'- Bipyridyl (Bip) 81 RESULTADOS 82 CAPÍTULO 1. Caracterización microbiológica de cepas de A. baumannii deficientes en LPS y la dependencia a colistina 83 1. Aislamiento de cepas de A. baumannii resistentes a colistina y comprobación de la deficiencia en LPS 83 2. Determinación de la concentración mínima inhibitoria (CMI) de diversos antibióticos 87 3. Análisis de la permeabilidad de la membrana bacteriana 90 4. Estudio de la actividad de péptidos antimicrobianos frente a dichas cepas 91 5. Análisis del crecimiento en presencia de colistina mediante el ensayo E-Test 98 6. Efecto del sobrecrecimiento bacteriano de las cepas de A. baumannii deficientes en LPS en ausencia y en presencia de colistinA 100 7. Análisis del crecimiento monitorizado durante 24 horas en presencia y ausencia de colistina 101 CAPÍTULO 2. Caracterización del fenotipo de cepas de A. baumannii deficientes en LPS y comparación con las cepas silvestres. 109 8. Estudio del crecimiento in vitro en medio enriquecido y suero humano 110 9. Caracterización del tiempo de generación 111 10. Estudio del índice de competencia in vitro e in vivo 112 11. Determinación de la producción de biofilm 113 12. Determinación de la CMI de diversos desinfectantes 114 13. Determinación de la motilidad 116 14. Determinación de la capacidad de crecimiento en condiciones de baja concentración de hierro 118 8 INDICE DISCUSIÓN 133 CAPÍTULO 1. Caracterización microbiológica de cepas de A. baumannii deficientes en LPS y la dependencia a colistina 134 CAPÍTULO 2. Caracterización del fenotipo de cepas de A. baumannii deficientes en LPS y comparación con las cepas silvestres. 136 CONCLUSIONES 141 CAPÍTULO 1 142 CAPÍTULO 2 142 REFERENCIAS 143 9 ABREVIACIONES Abreviaciones AAC: Acetiltransferasa ABMDR: A. baumannii multirresistentes ADN: Ácido desoxirribonucleico AFLP: Polimorfismos en la amplitud de fragmentos amplificados AMK: Amikacina AMP: Ampicilina ANT: Adenililtranferasa APH: Fosfotanferasa AZM: Azitromicina ARN: Ácido ribonucleico Bap: Proteína asociada al biofilm Bip: 2,2’-Bipyridyl BLEE: Betalactamasas de amplio especto BrEt: Bromuro de etidio CAZ: Ceftazidima CIP: Ciprofloxacino CST: Colistina CC: Clonal Complex CDR: Región Determinante de Complementariedad CI I, II, III: Clon Internacional I, II, III. CLSI: Clinical Laboratory Standards Institute D: Diferencia de susceptibilidad DO: Densidad Óptica ELISA: Enzyme-linked immunosorbent assay FEP: Cefepime 10 ABREVIACIONES GEIH: Grupo de Estudio de Infección Hospitalaria GEN: Gentamicina IPM: Imipenem IROMPs: Proteínas de Regulación del Hierro en la Membrana Externa LAL: Limulus Amebocyte Assay LB: Luria-Bertani LC-MS/MS: Cromatografía líquida- Espectrometría de masas LPS: Lipopolisacárido MAC: Complejo de ataque de membrana MBL: Metalobetalactamasas MDR: Multirresistencia MEM: Meropenem MHA: Mueller Hinton Agar MHB: Mueller Hinton Broth MLST: Multilocus Sequence Typing MoAb: Anticuerpo Monoclonal NucAb: Nucleasa de la Membrana Externa OMC: Complejos de la Membrana Externa Celular OMP: Proteinas de la Membrana
Recommended publications
  • Etude De L'épidémiologie Moléculaire Et De L'écologie D'acinetobacter Spp

    Etude De L'épidémiologie Moléculaire Et De L'écologie D'acinetobacter Spp

    Etude de l’épidémiologie moléculaire et de l’écologie d’Acinetobacter spp au Liban Ahmad Al Atrouni To cite this version: Ahmad Al Atrouni. Etude de l’épidémiologie moléculaire et de l’écologie d’Acinetobacter spp au Liban. Médecine humaine et pathologie. Université d’Angers; Université libannaise de Beyrouth, 2017. Français. NNT : 2017ANGE0004. tel-01599268 HAL Id: tel-01599268 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01599268 Submitted on 2 Oct 2017 HAL is a multi-disciplinary open access L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est archive for the deposit and dissemination of sci- destinée au dépôt et à la diffusion de documents entific research documents, whether they are pub- scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, lished or not. The documents may come from émanant des établissements d’enseignement et de teaching and research institutions in France or recherche français ou étrangers, des laboratoires abroad, or from public or private research centers. publics ou privés. AHMAD AL ATROUNI Mémoire présenté en vue de l’obtention du grade de Docteur de l'Université d'Angers sous le sceau de l’Université Bretagne Loire École doctorale : Ecole Doctorale Biologie Santé Discipline : Microbiologie Spécialité : Microbiologie Unité de recherche : ATOMycA, Inserm Atip-Avenir Team, CRCNA, Inserm U892, 6299 CNRS, Angers, France ET L’Université Libanaise École doctorale : Sciences et Technologie Spécialité :Microbiologie Medicale et Alimentaire Unité de recherche: Laboratoire de Microbiologie Santé et Environnement Soutenue le 19 Mai 2017
  • CARACTERIZAÇÃO DE Acinetobacter Spp. MULTIRRESISTENTES PRODUTORES DE CARBAPENEMASES, DOS TIPOS OXA E NDM, ISOLADOS DE DIFERENTES REGIÕES DO BRASIL

    CARACTERIZAÇÃO DE Acinetobacter Spp. MULTIRRESISTENTES PRODUTORES DE CARBAPENEMASES, DOS TIPOS OXA E NDM, ISOLADOS DE DIFERENTES REGIÕES DO BRASIL

    MINISTÉRIO DA SAÚDE FUNDAÇÃO OSWALDO CRUZ INSTITUTO OSWALDO CRUZ Doutorado no Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical CARACTERIZAÇÃO DE Acinetobacter spp. MULTIRRESISTENTES PRODUTORES DE CARBAPENEMASES, DOS TIPOS OXA E NDM, ISOLADOS DE DIFERENTES REGIÕES DO BRASIL THIAGO PAVONI GOMES CHAGAS Rio de Janeiro Outubro de 2015 INSTITUTO OSWALDO CRUZ Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical THIAGO PAVONI GOMES CHAGAS Caracterização de Acinetobacter spp. multirresistentes produtores de carbapenemases, dos tipos OXA e NDM, isolados de diferentes regiões do Brasil Tese apresentada ao Instituto Oswaldo Cruz como parte dos requisitos para obtenção do título de Doutor em Ciências (Medicina Tropical). Orientador: Profª. Drª. Marise Dutra Asensi RIO DE JANEIRO Outubro de 2015 Ficha catalográfica elaborada pela Biblioteca de Ciências Biomédicas/ ICICT / FIOCRUZ - RJ C433 Chagas, Thiago Pavoni Gomes Caracterização de Acinetobacter spp. multirresistentes produtores de carbapenemases, dos tipos OXA e NDM, isolados de diferentes regiões do Brasil / Thiago Pavoni Gomes Chagas. – Rio de Janeiro, 2015. xiii, 118 f. : il. ; 30 cm. Tese (Doutorado) – Instituto Oswaldo Cruz, Pós-Graduação em Medicina Tropical, 2015. Bibliografia: f. 70-104 1. Acinetobacter spp.. 2. Resistência aos antimicrobianos. 3. Carbapenemases. 4. OXA-23. 5. NDM. 6. PFGE. 7. MLST. I. Título. CDD 616.92 INSTITUTO OSWALDO CRUZ Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical AUTOR: THIAGO PAVONI GOMES CHAGAS Caracterização de Acinetobacter spp. multirresistentes produtores de carbapenemases, dos tipos OXA e NDM, isolados de diferentes regiões do Brasil ORIENTADOR: Profª. Drª. Marise Dutra Asensi Aprovada em: 26/10/2015 REVISÃO: Profª Drª. Ana Paula D’Allincourt Carvalho Assef Instituto Oswaldo Cruz (IOC - FIOCRUZ) EXAMINADORES: Prof.
  • ACINETOBACTER Nozioni Fondamentali

    ACINETOBACTER Nozioni Fondamentali

    ASP CATANZARO ACINETOBACTER Nozioni fondamentali. PARTE I Autore: Dottor ArcangeloDRAFT DELFINO 16 Delfino A., ACINETOBACTER. Nozioni fondamentali, PARTE I, febbraio 2016 2 ACINETOBACTER NOZIONI FONDAMENTALI Autore: Arcangelo Delfino Responsabile Unità Operativa “Prevenzione Infezioni Ospedaliere” DRAFT Febbraio 2016 Delfino A., ACINETOBACTER. Nozioni fondamentali, PARTE I, febbraio 2016 3 INDICE CAPITOLO 1 – PARTE INTRODUTTIVA pag. 6 1 PRESENTAZIONE pag. 7 2 PREMESSE pag. 8 3 AZIONI CHIAVE pag. 9 4 ACRONIMI ED ABBREVIAZIONI pag. 10 5 GLOSSARIO pag. 11 CAPITOLO 2 – ASPETTI GENERALI pag. 16 1 INFORMAZIONI GENERALI pag. 17 2 SISTEMATICA pag. 19 3 TASSONOMIA pag. 21 A. Aspetti storici della tassonomia pag. 21 B. Stato tassonomico attuale pag. 25 4 DELINEAZIONE DELLE SPECIE pag. 29 5 BIOTIPIZZAZIONE DELLA SPECIE A. BAUMANNII pag. 31 6 SPECIE CLINICAMENTE RILEVANTI pag. 32 7 SUDDIVISIONE IN A. BAUMANNII / NON BAUMANNII pag. 35 CAPITOLO 3 – ASPETTI MICROBIOLOGICI pag. 36 1 CARATTERISTICHE GENERALI pag. 37 2 CARATTERISTICHE MORFOLOGICHE - FUNZIONALI pag. 39 A. Forma pag. 39 B. Dimensioni pag. 39 C. Spore pag. 39 D. Capsula pag. 39 E. Tossine pag. 40 F Mobilità / Motilità pag. 40 3 CARATTERISTICHE TINTORIALI pag. 41 4 CARATTERISTICHE COLTURALI pag. 41 A. Acinetobacter baumannii DRAFT pag. 42 B. Acinetobacter ursingii pag. 42 5 CARATTERISTICHE ENZIMATICHE E BIOCHIMICHE pag. 42 A. Acinetobacter baumannii pag. 43 B. Acinetobacter ursingii pag. 43 6 IDENTIFICAZIONE pag. 43 A. Identificazione di genere pag. 44 B. Identificazione di specie pag. 44 7 ISOLAMENTO DA CAMPIONI CLINICI pag. 46 A. Modalità di richiesta pag. 46 B. Standard da utilizzare per gli esami pag. 46 C. Standard per le risposte pag.
  • Acinetobacter Baumannii NCIMB8209

    Acinetobacter Baumannii NCIMB8209

    bioRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.04.30.071514; this version posted May 2, 2020. The copyright holder for this preprint (which was not certified by peer review) is the author/funder, who has granted bioRxiv a license to display the preprint in perpetuity. It is made available under aCC-BY-NC-ND 4.0 International license. 1 Acinetobacter baumannii NCIMB8209: A rare environmental strain displaying 2 extensive insertion sequence-mediated genome remodeling resulting in the loss of exposed 3 cell structures and defensive mechanisms 4 5 Guillermo D. Repizoa#, Martín Espariza, Joana L. Seravallea, Juan Ignacio Díaz Miloslavicha, 6 Bruno A. Steimbrücha, Howard A. Shumanb and Alejandro M. Vialea#. 7 (a) Instituto de Biologia Molecular y Celular de Rosario (IBR, CONICET), Departamento de 8 Microbiologia, Facultad de Ciencias Bioquimicas y Farmaceuticas, Universidad Nacional de 9 Rosario, Rosario, Argentina 10 (b) Department of Microbiology, University of Chicago, Chicago, Illinois, USA. 11 12 # Address correspondence to Guillermo D. Repizo, [email protected]; Alejandro M. 13 Viale, [email protected]. 14 Running title: A. baumannii NCIMB8209 genomic analysis 15 Keywords: Environmental Acinetobacter baumannii, pre-antibiotic era Acinetobacter 16 baumannii, environmental reservoirs, comparative genomics, insertion sequences, virulence 17 factors, comparative genomics. 18 Word count: 250 (abstract), 145 (impact), 9,016 (text without references). 19 20 21 1 bioRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.04.30.071514; this version posted May 2, 2020. The copyright holder for this preprint (which was not certified by peer review) is the author/funder, who has granted bioRxiv a license to display the preprint in perpetuity.
  • Phylogenomics Reveals Clear Cases of Misclassification and Genus-Wide Phylogenetic Markers for Acinetobacter

    Phylogenomics Reveals Clear Cases of Misclassification and Genus-Wide Phylogenetic Markers for Acinetobacter

    GBE Phylogenomics Reveals Clear Cases of Misclassification and Genus-Wide Phylogenetic Markers for Acinetobacter Valeria Mateo-Estrada, Lucıa Grana-Miraglia*,~ Gamaliel Lopez-Leal, and Santiago Castillo-Ramırez* Programa de Genomica Evolutiva, Centro de Ciencias Genomicas, Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Cuernavaca, Mexico *Corresponding authors: E-mails: [email protected]; [email protected]. Accepted: August 11, 2019 Abstract The Gram-negative Acinetobacter genus has several species of clear medical relevance. Many fully sequenced genomes belonging to the genus have been published in recent years; however, there has not been a recent attempt to infer the evolutionary history of Acinetobacter with that vast amount of information. Here, through a phylogenomic approach, we established the most up-to-date view of the evolutionary relationships within this genus and highlighted several cases of poor classification, especially for the very closely related species within the Acinetobacter calcoaceticus–Acinetobacter baumannii complex (Acb complex). Furthermore, we determined appropriate phylogenetic markers for this genus and showed that concatenation of the top 13 gives a very decent reflection of the evolutionary relationships for the genus Acinetobacter. The intersection between our top markers and previously defined universal markers is very small. In general, our study shows that, although there seems to be hardly any universal markers, bespoke phylogenomic approaches can be used to infer the phylogeny of different bacterial genera. We expect that ad hoc phylogenomic approaches will be the standard in the years to come and will provide enough information to resolve intricate evolutionary relationships like those observed in the Acb complex. Key words: phylogenomics, Acinetobacter, bacterial species, evolutionary biology.
  • Mueller Online.Pdf

    Mueller Online.Pdf

    Aus dem Institut für Mikrobiologie und Tierseuchen des Fachbereichs Veterinärmedizin der Freien Universität Berlin Molecular and functional typing of isolates of the Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii complex with emphasis on multi-drug resistant Acinetobacter baumannii Inaugural-Dissertation zur Erlangung des Grades eines Doktors der Veterinärmedizin an der Freien Universität Berlin vorgelegt von Stefanie Müller Tierärztin aus Jena Berlin 2017 Journal-Nr.: 3964 Gedruckt mit Genehmigung des Fachbereichs Veterinärmedizin der Freien Universität Berlin Dekan: Univ.-Prof. Dr. Jürgen Zentek Erster Gutachter: Univ.-Prof. Dr. Lothar H. Wieler Zweiter Gutachter: PD Dr. Gottfried Wilharm Dritter Gutachter: Univ.-Prof. Dr. Thomas Alter Deskriptoren (nach CAB-Thesaurus): Acinetobacter calcoaceticus; Acinetobacter baumannii; antibiotics; multiple drug resistance; Carbapenems; zoonoses; restriction fragment length polymorphism; genome analysis Tag der Promotion: 19.09.2017 Bibliografische Information der Deutschen Nationalbibliothek Die Deutsche Nationalbibliothek verzeichnet diese Publikation in der Deutschen Nationalbibliografie; detaillierte bibliografische Daten sind im Internet über <http://dnb.ddb.de> abrufbar. ISBN: 978-3-86387-758-3 Zugl.: Berlin, Freie Univ., Diss., 2017 Dissertation, Freie Universität Berlin D 188 Dieses Werk ist urheberrechtlich geschützt. Alle Rechte, auch die der Übersetzung, des Nachdruckes und der Vervielfältigung des Buches, oder Teilen daraus, vorbehalten. Kein Teil des Werkes darf ohne schriftliche Genehmigung des Verlages in irgendeiner Form reproduziert oder unter Verwendung elektronischer Systeme verarbeitet, vervielfältigt oder verbreitet werden. Die Wiedergabe von Gebrauchsnamen, Warenbezeichnungen, usw. in diesem Werk berechtigt auch ohne besondere Kennzeichnung nicht zu der Annahme, dass solche Namen im Sinne der Warenzeichen- und Markenschutz-Gesetzgebung als frei zu betrachten wären und daher von jedermann benutzt werden dürfen. This document is protected by copyright law.
  • Gut Bacterial Inhabitants of Open Nested Honey Bee, Apis Florea

    Gut Bacterial Inhabitants of Open Nested Honey Bee, Apis Florea

    Gut Bacterial Inhabitants of Open Nested Honey Bee, Apis Florea D.N. Ganeshprasad Mangalore University Kunal Jani National Centre for Cell Science Yogesh S. Shouche National Centre for Cell Science A H Sneharani ( [email protected] ) Mangalore University https://orcid.org/0000-0001-7209-7540 Research Article Keywords: dwarf honey bee, Apis orea, gut microbiota, MALDI-TOF MS, 16S rRNA, next generation sequencing Posted Date: April 16th, 2021 DOI: https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-225332/v1 License: This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License. Read Full License Page 1/16 Abstract Honey bees are complex social system, which are highly dynamic having close interactions with their surrounding environment. Gut microbiota of honey bees has a major role in interaction behavior with its environment and health. Apis orea is the primitive among all the honey bees and are indigenous to Indian subcontinent. The study reports the identication and analysis of bacteria in the gut of wild species of honey bee, Apis orea, by culture-based and culture-independent methods. Cultured bacteria were identied and characterized by MALDI-TOF MS and 16S rRNA sequencing. A comprehensive analysis and identication of non-culturable bacteria were performed by 16S rRNA amplicon next generation sequencing. The sequence analysis approach classied gut bacteria into 5 bacterial phyla, 8 families and 10 genera in major. The dominant bacterial taxa identied in Apis orea belonged to Prevotellaceae (52.1%), Enterobacteriaceae (42.7%) and Halobacteriaceae (1.3%). The dominant bacteria belonged to genera of Prevotella, Escherichia-Shigella, Natronomonas, Methylobacterium, Pantoea, Bidobacterium, Enterobacter, Klebsiella, Lactobacillus and Nitrobacter belonging to phyla Bacteroidetes, Proteobacteria, Euryarchaeota, Actinobacteria, and Firmicutes.
  • TESE Lilian Rodrigues Alves.Pdf

    TESE Lilian Rodrigues Alves.Pdf

    UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO - UFPE CENTRO DE CIÊNCIAS DA SAÚDE - CCS DEPARTAMENTO DE MEDICINA TROPICAL PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM MEDICINA TROPICAL LILIAN RODRIGUES ALVES PERFIL DE RESISTÊNCIA, VIRULÊNCIA E PESQUISA DE SISTEMAS DE EFLUXO EM ISOLADOS CLÍNICOS DE Acinetobacter spp. PROVENIENTES DE PACIENTES ONCOLÓGICOS Orientadora: Profª. Drª. Maria Amélia Vieira Maciel Co-orientadora: Profª. Drª. Ana Catarina de Souza Lopes Recife – PE 2017 LILIAN RODRIGUES ALVES PERFIL DE RESISTÊNCIA, VIRULÊNCIA E PESQUISA DE SISTEMAS DE EFLUXO EM ISOLADOS CLÍNICOS DE Acinetobacter spp. PROVENIENTES DE PACIENTES ONCOLÓGICOS Tese de doutorado apresentada ao curso de Pós-Graduação em Medicina Tropical da Universidade Federal de Pernambuco, como parte dos requisitos para obtenção do título de Doutora em Medicina Tropical. Orientadora: Profª. Drª. Maria Amélia Vieira Maciel Co-orientadora: Profª. Drª. Ana Catarina de Souza Lopes Recife – PE 2017 UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO (UFPE) CENTRO DE CIÊNCIAS DA SAÚDE (CCS) PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM MEDICINA TROPICAL (PPGMEDTROP)1 LILIAN RODRIGUES ALVES PESQUISA DOS SISTEMAS DE EFLUXO MULTIDROGA EM ISOLADOS CLÍNICOS DE Acinetobacter spp. PROVENIENTES DE PACIENTES ONCOLÓGICOS INTERNADOS EM UM HOSPITAL DE RECIFE-PE Tese apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical da Universidade Federal de Pernambuco, como requisito parcial para a obtenção do título de Doutora em Medicina Tropical. Aprovada em: 20/02/2017. BANCA EXAMINADORA _________________________________________ Profª. Drª. Maria