Analyse de la migration catadrome de l'anguille européenne <Anguilla anguilla> (L. 1758) dans les lagunes septentrionales de Tunisie : caractéristiques et état de santé des individus, quantification du phénomène. Item Type Thesis/Dissertation Authors Derouiche, Emna Publisher Faculté des Sciences de Tunis Download date 07/10/2021 16:04:37 Link to Item http://hdl.handle.net/1834/10379 UNIVERSITE DE TUNIS EL MANAR INSTITUT NATIONAL DES SCIENCES FACULTE DES SCIENCES DE TUNIS ET TECHNOLOGIES DE LA MER Thèse de doctorat pour l’obtention du titre de Docteur en Sciences Biologiques Présentée par Emna DEROUICHE ANALYSE DE LA MIGRATION CATADROME DE L'ANGUILLE EUROPEENNE ANGUILLA ANGUILLA (L. 1758) DANS LES LAGUNES SEPTENTRIONALES DE TUNISIE : CARACTERISTIQUES ET ETAT DE SANTE DES INDIVIDUS, QUANTIFICATION DU PHENOMENE Soutenue le 08 /09/2016 devant le jury d’examen composé de : Mr. M. El CAFSI (Pr. FST) Président Mme. L. GARGOURI (Pr. FST) Rapporteur Mr. H. MISSAOUI (Pr. INSTM) Rapporteur Mr. M.M. KRAÏEM (Pr. INSTM) Encadreur Mr. P. ELIE (DR. IRSTEA, Bdx) Examinateur Mr. L. CHOUBA (MR. INSTM) Invité 2016 Johannes Schmidt. Océanographe et biologiste danois (1877-1933) DEDICACE A mon pays bien aimé, la Tunisie, qui fête cette année 60 ans d’indépendance A mon papa d’amour et à ma maman chérie, ma source intarissable de bonheur et de tendresse, mes sponsors officiels, qui ont toujours cru en moi et qui m’ont poussé à aller de l’avant A ma petite sœur Amel que je n’ai pas cessé de tourmenter avec mes petites histoires de labo A ma famille, proche et éloignée A mes ami(e)s avec qui j’ai partagé les joies et les peines de ces années de Doctorat A tous ceux que j’aime Cette thèse vous est dédiée AVANT PROPOS Je tiens avant tout à exprimer mes remerciements à tous ceux et celles qui, de près ou de loin, m’ont accordé leur appui et ont contribué à la réalisation de ce travail. Cette thèse a été réalisée dans le cadre d’un programme de recherche d’appui au Plan National Anguille de la Tunisie. Elle a été menée au sein du Laboratoire d’Aquaculture de l’Institut National des Sciences et Technologies de la Mer de Salammbô et a été partiellement financée par le projet européen ProEEL (FP7). Mes sincères remerciements s’adressent au Pr. Hechmi MISSAOUI le Directeur Général de l’INSTM ainsi qu’à son prédécesseur Pr. Ridha M’RABET pour l’intérêt qu’ils portent à la recherche scientifique et pour avoir mis à ma disposition les moyens techniques et humains de l’INSTM afin de faciliter mes recherches. Je remercie profondément les honorables membres du jury pour l’honneur qu’ils me font d’avoir accepté d’évaluer ce travail et ce, malgré leur emploi du temps surchargé : Pr. M’hamed EL CAFSI, Professeur à la Faculté des Sciences de Tunis en tant que président du jury ; Pr. Hechmi MISSAOUI, Directeur Général de l’Institut National des Sciences et Technologies de la Mer (INSTM) et Mme Lamia GARGOURI, Maître de Conférences à la Faculté des Sciences de Tunis en tant que rapporteurs ; Dr. Pierre ELIE, Directeur de Recherches à l’Institut national de recherche en sciences et technologies pour l’environnement et l’agriculture (Irstea-Bordeaux) en tant qu’examinateur ; mon encadrant Pr. Mohamed Mejdeddine KRAIEM et Dr. Lassaâd CHOUBA, Maître de Recherches à l’Institut National des Sciences et Technologies de la Mer en tant que membre invité. Il m’est agréable d’adresser mes vifs remerciements à mon directeur de thèse Mr. le Professeur Mohamed Mejdeddine KRAÏEM, qui m’a fait bénéficier de sa grande expérience depuis mes débuts dans la recherche scientifique. Je lui suis particulièrement reconnaissante pour sa rigueur scientifique, ses critiques constructives et ses précieux conseils qui ont contribué à la réalisation de ce travail. J'espère que le noyau de l'équipe anguille (Besma et moi-même) qu'il a constitué s’agrandira et aura encore de beaux jours devant lui ! Toute ma reconnaissance s’adresse à mon co-encadreur de thèse, le Dr. Pierre ELIE. Son aide précieuse, ses encouragements et ses conseils utiles m’ont permis de réaliser ce travail avec beaucoup de passion. Je le remercie d’avoir facilité mon stage à l’Irstea de Bordeaux. Pierre, merci surtout de m’avoir immergée dans le monde merveilleux des anguilles et de m’avoir fait bénéficier de ton immense expérience. Les mots ne sauront jamais exprimer ma profonde gratitude. Ce travail n’aurait jamais pu aboutir sans ton soutien sans faille. Durant cette thèse, j’ai dû effectuer une migration d’un laboratoire à un autre afin de pouvoir effectuer toutes les parties de ce travail. Ainsi, j’exprime ma profonde gratitude au Dr. Lamia GARGOURI pour m’avoir accueillie à l’Unité de Recherche en Bio-Ecologie et Systématique Evolutive à la Faculté des Sciences de Tunis et d’avoir guidé mes premiers pas en parasitologie. Je remercie également son équipe, notamment Dr. Rym ANTAR et Nessrine GHANMI, ainsi que le joyeux technicien, toujours souriant, si Hichem LOUNIS de m’avoir intégrée rapidement et mis à ma disposition tout les moyens techniques nécessaires à mes recherches. Je tiens également à exprimer mon profond respect au Dr. Lassaâd CHOUBA de m’avoir accueillie au laboratoire d’analyses des métaux traces à l’annexe de l’INSTM au port de la Goulette. Je remercie également Mme Chrifa TISSAOUI, technicienne principale, pour son assistance et son aide précieuse. Je souhaite témoigner mon immense gratitude au Pr. Saloua SADOK qui m’a permis de réaliser la partie biochimique au laboratoire de Biodiversité et Biotechnologie Marine à l’annexe de l’INSTM au port de la Goulette. Sans oublier les techniciens, Brahim AOUN et Héla ARFAOUI pour leur aide précieuse ainsi que tous les étudiants en PFE, Mastère ou Doctorat qui sont passés par ce labo pour l’ambiance de ruche joyeuse qui y règne, en particulier Dr. Nadia BESBES LAARIDH et Boutheina BESSADOK. Ma gratitude va également au Dr. Elsa AMILHAT du Centre de Formation et de Recherche sur les Environnements Méditerranéens à l’Université de Perpignan Via Domitia (France) pour m’avoir initiée aux techniques de marquage-recapture des anguilles et familiarisée avec le fonctionnement du logiciel SPAS durant mon séjour express à Perpignan. Mes remerciements s’adressent aussi à l’équipe de l’Irstea (ex Cemagref) de Bordeaux pour l’accueil chaleureux qu’ils m’ont réservé lors de mon séjour parmi eux ainsi que pour leur assistance matérielle et scientifique, particulièrement Chantal GARDES pour son extrême gentillesse et son sourire radieux. Je suis aussi heureuse de pouvoir exprimer mes chaleureux remerciements à Mr. Mehrez BASTA, Directeur de l’exploitation ainsi qu’à sa collègue Ines BEN HAFSIA Chef de Service de la transformation et de l’exportation à la Direction Générale de la Pêche et de l’Aquaculture (DGPA) pour m’avoir fourni les statistiques de pêche. Asma BEN ABDA ingénieur principal à l’Arrondissement de la Pêche et de l’Aquaculture du Port de la Goulette m’a toujours accueillie avec sympathie et a répondu à mes nombreuses questions sur le lac de Tunis avec bonne humeur et ce, malgré son emploi du temps surchargé. Je lui suis profondément reconnaissante. Ce travail n’aurait jamais pu se concrétiser sans la précieuse collaboration des différents pêcheurs que j’ai côtoyés sur le terrain. Je remercie particulièrement Am Hédi du lac nord de Tunis, Amen Allah et Samir de la lagune de Ghar El Melh et Chokri du lac Ichkeul, pour leur patience et leur bienveillance à mon égard. Mr. Alfonso DAPOTE mareyeur au lac de Tunis m’a aidée à m’immerger dans le monde des anguilles au début de ma thèse, je l’en remercie beaucoup. Mr. Riadh BEN NSIR et Fathi LAZZEZ, gérants de la Société Tunisie Lagune m’ont gratuitement fourni des anguilles du lac Ichkeul. Je leur témoigne ici toute ma reconnaissance. Mes remerciements s’adressent aussi au personnel de l’INSTM, particulièrement les chauffeurs dont certains m’ont aidée depuis mon mastère et avec qui j’ai passé des moments agréables à parcourir les routes à la recherche de l’anguille : d’abord Mourad le chef de parc, feu Am Mahmoud, Sofiène, Mehdi, Khaled et Moez. Sans oublier les techniciens : Oussama, Sana, Wajdi et Montassar qui ont contribué significativement à la réalisation de ce travail ainsi que le personnel administratif : Tahya, Saida, Hasna, Hédia, Rim, Malika, Salwa…et tant d’autres pour leur gentillesse, leur bonne humeur et leur coup de main en cas de besoin. J’exprime toute ma gratitude à mes collègues et voisines de bureau à l’INSTM, Besma HIZEM-HABBECHI, Sana BEN ISMAIL, Rakia AYARI-KLITI et Tahéni DKHIL-ABBES. Qu’elles trouvent ici le témoignage sincère de mon amitié. L’épreuve du doctorat n’aurait jamais été supportable sans la présence de mes formidables amies. Je tiens à exprimer ma profonde reconnaissance à mes copines de calvaire avec qui j’ai partagé les bons et les mauvais moments de la thèse ! Merci les filles pour le café rituel du matin, mais surtout pour m’avoir supportée, fait rire et remonté le moral pendant toutes ces années. Merci Amina de m’avoir accompagnée en musique durant les dissections. Merci Héla, Wafa et Boutheina notamment pour votre aide pendant le marquage. Merci Kalthoum pour nos longues discussions qui, invariablement, tournent toutes autour de la thèse ! Bonne chance les filles, je vous souhaite beaucoup de succès ! Je ne puis oublier mon mentor junior et amie, Dr. Rym ENNOURI qui m’a beaucoup aidée grâce à son expérience d’ancienne doctorante et qui a toujours su trouver les mots justes pour me booster quand mon moral flanchait.