RAPPORTR
Analyse bibliométrique de la littérature scientifique mondiale sur la recherche en Apidologie
1975-2013
Collette Savajol
Juin 2014
ITSAP--Institut de l’abeille 149 rue de Bercy – 75595 PARIS CEDEX 12 Tél. + 33 (0)1 40 04 50 29 – Fax. +33 (0)1 40 04 51 48 www.itsap.asso.fr
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REMERCIEMENTS à l’Institut National de la Recherche Agronomique (Inra) et plus particulièrement à l’Unité Abeilles et Environnement – Inra Paca, pour son appui technique.
Étude financée avec le soutien du Compte d’affectation spécial pourle développement agricole et rural du ministère de l’Agriculture, de l’Agroalimentaire et de la Forêt.
Pour citer ce rapport :
SAVAJOL C., PELISSIER C., DECOURTYE A., LE CONTE Y., THYBAUD E., FOURNIER D., CLUZEAU-MOULAY S. (2014). Analyse bibliométrique des publications scientifiques mondiale sur la recherche en apidologie 1975-2013. ITSAP-Institut de l’abeille.
Analyse bibliométrique de la littérature scientifique mondiale sur la recherche en apidologie 1975-2013, SAVAJOL C., ITSAP-Institut de l’abeille, 2014 3 SOMMAIRE
Résumé ...... 7
Introduction ...... 9
PARTIE 1 – Définition du corpus et méthodologie ...... 11 1.1. Constitution du corpus ...... 11 1.2. Traitement et analyse du corpus ...... 13 1.2.1. Nettoyage du corpus ...... 13 1.2.2. Manipulation et analyse des données ...... 13 1.2.3. Méthodologie de calcul ...... 14 1.2.4. Cadre de l’étude ...... 14 1.3. Récapitulatif ...... 15
PARTIE 2 – Principales caractéristiques du corpus « abeilles » mondial ...... 17 2.1. Typologie des publications ...... 17 2.2. Évolution de la production mondiale ...... 17 2.3. Journaux de publications ...... 18 2.4. Classements thématiques des journaux ...... 20 2.5. Notoriété des journaux de publication ...... 23 2.6. Citations des publications ...... 24 2.7. Origine géographique des publications ...... 27 2.8. Les collaborations entre pays ...... 31 2.9. Les institutions européennes de recherche ...... 32
PARTIE 3 – Domaines de recherche et sujets abordés ...... 35 3.1. Familles d’abeilles ...... 35 3.1.1. Répartition par famille ...... 35 3.1.2. Répartition des publications sur les abeilles non-Apidae par zones géographiques et pays ...... 36 3.2. Domaines de recherche...... 37 3.2.1. Évolution du nombre de publications par domaine de recherche et sous-domaine ...... 37 3.2.2. Les domaines de recherche des publications par zone géographique et par pays ...... 39 3.2.3. Les institutions européennes par domaines de recherche ...... 41 3.2.4. Zoom sur les publications relatives à Varroa sp...... 42 3.2.5. Évolution du nombre de publications ...... 42 3.2.6. Journaux de publication ...... 43 3.2.7. Notoriété des journaux ...... 43 3.2.8. Citations des publications ...... 43 3.2.9. Les zones géographiques et pays publiant sur Varroa sp...... 44 3.2.10. Les institutions publiant sur Varroa sp...... 45 3.3. Zoom sur les publications concernant l’étude de Nosema sp...... 46 3.3.1. Évolution du nombre de publications ...... 46 3.3.2. Journaux de publication ...... 47 3.3.3. Notoriété des journaux ...... 47 3.3.4. Citations des publications ...... 47 3.3.5. Les zones géographiques et pays publiant sur Nosema sp...... 49 3.3.6. Les institutions publiant sur Nosema sp...... 50 3.4. Zoom sur les publications relatives aux pesticides ...... 51 3.4.1. Évolution du nombre de publications ...... 51 3.4.2. Journaux de publication ...... 54 3.4.3. Notoriété des journaux ...... 54 3.4.4. Citations des publications ...... 54 3.4.5. Les différentes familles de pesticides ...... 56 3.4.6. Les zones géographiques et pays publiant sur les pesticides ...... 57 3.4.7. Les institutions publiant sur les pesticides ...... 59
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3.5. Zoom sur les publications relatives à l’étude des virus ...... 60 3.5.1. Évolution du nombre de publications ...... 60 3.5.2. Journaux de publication ...... 61 3.5.3. Notoriété des journaux ...... 61 3.5.4. Citations des publications ...... 61 3.5.5. Les différents virus ...... 62 3.5.6. Les zones géographiques et pays publiant sur les virus ...... 63 3.5.7. Les institutions publiant sur les virus ...... 64 3.6. Zoom sur la France ...... 65 3.6.1. Évolution du nombre de publications ...... 65 3.6.2. Journaux de publication ...... 66 3.6.3. Notoriété des journaux ...... 66 3.6.4. Citations des publications ...... 67 3.6.5. Publications internationales : la France et les autres ...... 67 3.6.6. Les institutions françaises de recherche ...... 69 3.6.7. Les domaines de recherche en France ...... 71 3.6.8. La France et la recherche sur Varroa sp. et Nosema sp...... 73 3.6.9. La France et la recherche sur les pesticides ...... 74
Conclusion ...... 77
Références ...... 83
Bibliographie ...... 83
Liste des figures ...... 84
Liste des tableaux ...... 85
Annexes ...... 87 Annexe 1 : Exemples de dictionnaires utilisés pour l’analyse lexicale ...... 87 Annexe 2 : Regroupements géographiques des pays ayant publiés ...... 89 Annexe 3 : Liste des 452 journaux ayant publié au moins dix articles sur la période 1975-2013 et leur meilleure notoriété pour la période 2007-2012 ...... 90 Annexe 4 : Liste des 138 pays ayant publié durant la période 1975-2013 ...... 96 Annexe 5 : Nombre d’institutions par pays européens ayant publié entre 2007 et 2013 ...... 98 Annexe 6 : Liste des principales institutions européennes publiant en apidologie ...... 99 Annexe 7 : Listes des mots recherchés dans les différents domaines et sous-domaines...... 102 Annexe 8 : Nombre de publications par institution française et domaine de recherche (2007-2013)...... 106
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Analyse bibliométrique de la littérature scientifique mondiale sur la recherche en apidologie 1975-2013, SAVAJOL C., ITSAP-Institut de l’abeille, 2014 6 RÉSUMÉ
Dans le but de positionner ses travaux dans le contexte général de la recherche scientifique en apidologie, l’ITSAP-Institut de l’abeille, avec l’aide technique de l’Inra, a réalisé une analyse bibliométrique originale et exhaustive sur la recherche en apidologie depuis près de 40 ans.
Cette analyse de la littérature scientifique internationale permet de dégager les grandes tendances de la recherche et les pays impliqués dans la recherche apicole. Le corpus étudié comprend 29 340 publications.
En nombre de publications, les États-Unis occupent la première position des pays devant l’Allemagne et le Brésil. Mais si nous considérons l’Union Européenne des 27, celle-ci se classe devant les États-Unis. Deux pays, la Chine et la Turquie, ont connu une croissance importante de leur nombre de publications et se classent respectivement au 4e et au 7e rang sur la période 2007-2013 contre 32e et 44e sur la période 1975-1996, ce qui les positionne maintenant devant la France (11e en nombre de publications).
La comparaison du taux de croissance annuel (TCAM) de la recherche en apidologie et de celui de l’ensemble du WoSTM a permis de constater que la recherche en apidologie mondiale se caractérise par un dynamisme important. Ce qui se vérifie également en France, où la recherche apicole est plus dynamique que l’ensemble de la recherche française. Une part importante (40 %) des publications « abeilles » du corpus mondial se fait dans des revues de notoriété « exceptionnelle » ou « excellente ». La recherche française publie une majorité de ses travaux (61 %) dans ce même type de revues.
En Europe, vingt-quatre institutions ont participé à un tiers des publications européennes. Parmi elles se trouvent trois institutions françaises (l’Inra, le CNRS et l’Université de Toulouse). L’Inra est l’institution européenne publiant le plus dans le domaine de l’apidologie.
La France est très engagée dans les travaux de recherche relatifs à l’écotoxicologie (3e place en nombre de publications pour la période 2007-2013), à l’épidémiologie (5e) et à la règlementation (2e). Elle est moins bien classée dans la recherche sur la pollinisation (15e), les produits du rucher et leur qualité (14 e) et la modélisation (14e).
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Analyse bibliométrique de la littérature scientifique mondiale sur la recherche en apidologie 1975-2013, SAVAJOL C., ITSAP-Institut de l’abeille, 2014 8 INTRODUCTION
L’actualité récente met régulièrement en avant les problèmes de déclin des populations d’abeilles et de pollinisateurs sauvages. Ce déclin, qui touche les abeilles domestiques et sauvages, a bien sûr un impact négatif sur l’apiculture mais il touche aussi le service de pollinisation rendu par ces insectes, qui concerne les espèces végétales cultivées et la flore sauvage.
La préservation des abeilles dans l’environnement est donc un enjeu fort, dont se sont emparés les gouvernants au niveau national et européen. Plus particulièrement, la Commission européenne et le Parlement européen ont pris des mesures pour soutenir la production apicole et encourager la mise en œuvre de moyens de recherche pour améliorer la santé du cheptel. Le ministre de l’Agriculture a mis en œuvre un Plan de développement durable de l’apiculture, plan global visant à développer la filière apicole française.
L’ITSAP-Institut de l’abeille est un jeune institut, mis en place en 2010, et qui a pour objectif de mener des actions de recherche appliquée pour répondre aux problématiques techniques de la filière apicole. Les sujets abordés par la recherche appliquée de l’ITSAP doivent s’accorder avec les problématiques rencontrées sur le terrain, tout en étant placés dans un état de l’art scientifique et technique connu. Il a donc souhaité faire un recensement concernant la recherche en apidologie1 afin d’éclairer ses décisions en matière de programmation d’actions, en réalisant une analyse bibliométrique originale et exhaustive sur près de 40 ans, soit la totalité de la période couverte par la base de données internationale de référence, « Web of Science » (1975-2013), à laquelle il avait accès grâce à l’appui technique fournit par l’Inra.
L’ITSAP-Institut de l’abeille a réalisé une analyse bibliométrique sur la recherche en apidologie pour la période 1975-2013.
Cette étude porte sur les abeilles au sens large (insectes hyménoptères de la superfamille des Apoidea), la majorité d’entre elles ne produisant pas de miel, mais ayant un rôle important pour la pollinisation.
Étymologiquement, la bibliométrie est définie comme étant la mesure des écrits ; scientifiquement, elle se définie comme étant l’application de méthodes mathématiques ou statistiques à un ensemble de références bibliographiques.
Cette analyse de la littérature scientifique internationale vise à donner un éclairage sur les domaines abordés par la recherche en apidologie et les pays impliqués dans ces recherches, et a pour objectif de répondre aux questions suivantes qui intéressent la filière :
- Quels sont les principaux domaines de recherche étudiés ? - Quels sont les principaux pays où se fait cette recherche ? - Comment les pays collaborent entre eux ? - Comment se positionne la France par rapport au reste du Monde ? - Quels sont les acteurs de la recherche française ? - Comment la recherche reflète les problématiques de la filière ?
1 Apidologie : Partie de la zoologie qui traite des abeilles (Larousse).
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Analyse bibliométrique de la littérature scientifique mondiale sur la recherche en apidologie 1975-2013, SAVAJOL C., ITSAP-Institut de l’abeille, 2014 10 PARTIE 1 – DÉFINITION DU CORPUS ET MÉTHODOLOGIE
Ce travail a été effectué, entre octobre 2012 et mars 2013 et mis à jour entre février et mai 2014, par Colette Savajol avec les conseils thématiques de Colette Pélissier (Documentaliste – Unité Abeilles et Environnement – Inra Avignon), les conseils techniques de Dominique Fournier (Documentaliste du centre Inra Montpellier) et en étroite collaboration avec un conseil scientifique2 comprenant des représentants de l’Acta, de l’Ineris, de l’Inra et de l’ITSAP–Institut de l’abeille.
Les publications scientifiques étant le reflet des travaux de recherche, leur analyse permet d’identifier les acteurs (institutions, pays…), les domaines de recherche, les journaux publiant et leurs thématiques et l’évolution des publications au cours du temps et ce à un niveau, national ou international.
Cette étude a pour objet d’analyser les publications scientifiques mondiales relatives à la recherche en apidologie, en prenant comme référence le Web of ScienceTM (WoSTM). Une attention toute particulière a été portée à la constitution du corpus. Un corpus est un ensemble de documents disponibles d’un genre ou d’un sujet donné réuni en vue de leur étude scientifique.
Ce corpus a été créé en faisant une recherche exhaustive des articles utilisant les termes liés aux abeilles (Figure 1) dans leur titre, résumé, mots clés. Avant analyse, il a été enrichi, en attribuant à chaque référence, un domaine de recherche, une localisation géographique et pour l’Europe, les institutions de recherche.
1.1. Constitution du corpus
Les références bibliographiques sont issues de l’interrogation du Web of ScienceTM (WoSTM) produit par Thomson Reuters, cette base couvre tous les domaines de la science et rassemble plusieurs dizaines de millions de références dans plus de 15 000 journaux à comité de lecture.
Elle est la base de référence pour la communauté scientifique mondiale. Elle permet, de plus, une analyse par pays, par institutions, car elle est une des seules bases mentionnant l’adresse de tous les auteurs.
L’interrogation du WoSTM a été réalisée en prenant en compte les deux séries SCI-Expanded (Science Citation Index Expanded) et SSCI (Social Science Citation Index), ce sont les séries qui couvrent la plus grande période, elles concernent principalement les articles et sont les plus adaptées au sujet visé.
L’équation de recherche pour l’interrogation du WoSTM a été définie au mieux pour couvrir l’ensemble de la thématique de la recherche en apidologie. Le choix des mots clés est important pour obtenir une équation de recherche qui permette de recueillir le maximum de références tout en minimisant le bruit de fond, à savoir la littérature hors sujet.
L’équation (Figure 1) établie pour finaliser notre requête dans le WoSTM associe différents termes liés à la recherche en apidologie :
- un premier ensemble concerne les modèles animaux (1) ; - un deuxième ensemble se rapporte à l’apiculture (2), - le dernier ensemble (3), quant à lui, représente quelques faux amis identifiés au départ, APIS et BEE étant les acronymes de nombreuses expressions extérieures au champ concerné.
2 Philippe Vissac (Acta), Eric Thybaud (Ineris), Yves Le Conte (Inra – UMT PrADE), Axel Decourtye (Acta/ITSAP–Institut de l’abeille – UMT PrADE), Sophie Cluzeau-Moulay (ITSAP–Institut de l’abeille).
Analyse bibliométrique de la littérature scientifique mondiale sur la recherche en apidologie 1975-2013, SAVAJOL C., ITSAP-Institut de l’abeille, 2014 11 Tous ces termes sont connectés entre eux par des opérateurs booléens3.
Ils ont été recherchés dans le champ « topic » (TS) du WoSTM qui correspond à une recherche dans les mots du titre (title), le résumé (abstract), les mots clés auteurs (keywords) et les « keywords plus® »4.
La recherche a été faite pour l’ensemble des années de publication auxquelles nous avions accès, soit à partir de 1975, et jusqu’en décembre 2013. Elle a été limitée aux types de documents suivants : articles et articles de synthèse (reviews). L’interrogation du WoSTM a été faite le 25 février 2014, il manque des références pour 2013, le référencement dans le WoSTM n’étant pas encore terminé en début d’année 2014 (ex. les colloques de 2013 dont les actes mettent du temps à sortir mais qui seront datés 2013 date du colloque ; décalage entre la sortie d’un numéro de journal et son indexation dans le WoSTM).
TS = (bee OR bees OR apis OR apiforme* OR apidae OR apoidea* OR honeybee* OR « a mellifera » OR Megachilidae OR Megachile OR Melittidae OR Halictidae OR Andrenidae OR
Colletidae OR Stenotritidae OR Xylocopa OR osmia OR Melipona OR Trigona OR Andrena OR 1 Eucera OR Meliturga OR Colletes OR Dasypodaidae OR Meganomiidae OR bumblebee* OR bombus)
OR
TS = (varroa OR « nosema ceranae»)1
OR 2 TS = (honey OR « royal jelly » OR propolis)
OR
TS = (apiculture* OR beekeep*) 3 OR
TS = (hive OR hives) AND WC=ENTOMOLOGY2
NOT
Figure 1 – Équation de recherche pour l’interrogation du WoSTM.
Le corpus obtenu par cette requête est constitué de 42 261 publications.
3 Les opérateurs booléens permettent de combiner des recherches afin de les expliciter et/ou de les affiner. Le moteur de recherche du portail documentaire utilise les trois principaux opérateurs « ET/AND » (opérateur d’intersection), « OU/OR » (opérateur d’union), « SAUF/NOT » (opérateur d’exclusion). L’astérisque (*) représente la troncature. 4 Keywords Plus® : mots clés rajoutés par le WoSTM, dérivés des titres et des références citées. 1 Il a été recherché « Nosema ceranae » et non « Nosema apis » qui était déjà récolté avec « Apis », ni « Nosema » seul qui peut s’appliquer à d’autres hôtes que l’abeille. 2 Le terme « hive(s) » (ruche(s)) a été recherché uniquement dans la catégorie du WoSTM « Entomology », pour éviter la sélection de références non apicoles (hives pouvant se traduire en français par urticaire).
Analyse bibliométrique de la littérature scientifique mondiale sur la recherche en apidologie 1975-2013, SAVAJOL C., ITSAP-Institut de l’abeille, 2014 12 1.2. Traitement et analyse du corpus
1.2.1. Nettoyage du corpus
Du fait du caractère non spécialisé de la base WoSTM et de l’homonymie de certains termes utilisés beaucoup de publications issues de la requête d’origine ne correspondent pas au domaine recherché. Par exemple « bee » ou « apis » sont les acronymes de beaucoup d’expression ; « Honey » ne représente pas toujours le miel produit du rucher, etc., il faut donc nettoyer la base.
Les publications sélectionnées par les « keywords plus® » 5 qui répondent à la requête de départ, mais dont le sujet principal ne se situe pas dans le domaine de la recherche apicole, ont été identifiées et éliminées.
Pour rendre le corpus homogène et ne pas sortir du domaine de l’étude, il a fallu supprimer les références sans rapport avec la recherche en apidologie, notamment en trouvant les « faux-amis » tels que : « honey locust », « honey moon », « honey creek », « Academic Performance Incentive System » (Apis), etc.
D’autre part, la requête de départ a été enrichie par les termes liés à la pollinisation. Les termes ayant trait à la pollinisation (pollinator(s), pollination…) n’ont pas été cherché dans le WoSTM, la pollinisation n’étant pas toujours liée aux abeilles. Par contre une fois le corpus de base constitué, ces termes ont été rajoutés à l’équation, lors des étapes de nettoyage.
Les publications ont été conservées si au moins un terme de la recherche était présent dans le titre ou les mots-clés auteurs, sinon si deux termes de la recherche étaient présents dans le résumé.
Pour vérifier l’exactitude du processus de nettoyage, il aurait fallu réaliser un pointage exhaustif de toutes les publications. Compte tenu de leur nombre (plus de 42 000), une approche par sondage au moyen de listes aléatoires a été entreprise. Celle-ci permet d’estimer une marge d’erreur de 2 %. Ces erreurs correspondent à, d’une part, des articles maintenus dans la base et dont le sujet ne concerne pas l’abeille, et d’autre part, des articles traitant de l’abeille et écartés de la base.
Après nettoyage du corpus de départ de 42 261 publications, le corpus final « abeilles » est de 29 340 publications.
1.2.2. Manipulation et analyse des données
Le logiciel d’enquête Le Sphinx® Plus² Lexica, outil d’analyse quantitative et qualitative de données tant numériques que textuelles, nous a permis le recodage et le traitement de nos variables.
Le module d’analyse lexicale du logiciel Le Sphinx® Plus² Lexica appliqué aux variables textuelles (titre, mots clés, résumé, adresses) a permis de repérer des références, grâce au marquage de mots issus de dictionnaires6, et de les regrouper par pays, institutions, domaines de recherche.
Une forte valeur ajoutée a été apportée au corpus initial importé du WoSTM, en créant et analysant de nouvelles variables, correspondant aux regroupements suivants :
- À partir des informations des champs « titre (title), mots clés (keywords), résumé (abstract) », il a été créé des variables relatives aux domaines de recherche. - À partir des informations du champ « adresses des auteurs » (author address), il a été créé des variables relatives aux régions, aux pays et aux institutions.
5 Voir note 4 6 Dictionnaires Sphinx : listes de termes ou d’expressions, voir en annexe 1.
Analyse bibliométrique de la littérature scientifique mondiale sur la recherche en apidologie 1975-2013, SAVAJOL C., ITSAP-Institut de l’abeille, 2014 13 Le corpus a également été enrichi, avec des indicateurs relatifs à la qualité des journaux (facteur d’impact, notoriété) et des données de citation. Cet enrichissement a été réalisé grâce à l’application Noria 7 développée par l’Inra.
1.2.3. Méthodologie de calcul
PRINCIPE DE COMPTAGE
Le principe de comptage utilisé dans cette étude est le « compte de présence ». Il traduit une logique de participation à l’activité scientifique : par exemple, lorsque deux pays collaborent à une même publication, celle-ci est comptée deux fois (une fois pour chaque pays). De même, lorsqu’une publication implique deux institutions, chaque institution est créditée d’une participation unitaire.
Par conséquent, ce mode de comptage donne lieu à des sommes d’effectifs observés supérieures au nombre de références du corpus.
TAUX DE CROISSANCE ANNUEL MOYEN
Le taux de croissance annuel moyen (TCAM) a été choisi pour évaluer l’évolution du nombre de publications sur la période étudiée. Cette méthode permet le calcul d’une variation moyenne au cours d’une période de temps donnée. Le taux de croissance annuel moyen, exprimé en pourcentage, sur n périodes (années, mois…) est calculé avec la formule suivante :