Ročenka 2018-2019

Vodňany, 2020 prostranství. Letecký naMezinárodní pohled environmentální vzdělávací, poradenské a informační středisko MEVPISVodňany apřilehlé F akulta rybářs tví

ské Bu in České U Jiho niversity česk á un of děj iverzita South ovice Bohemi a

Vodňany, 2018 VÝROČNÍ ZPRÁVA 2018–2019 Vodňany, 2020 2018–2019 Výroční zpráva F akulta rybářs tví

ské Bu in České U Jiho niversity česk á un of děj iverzita South ovice Bohemi a

Fakulta rybářství Jihočeská univerzita

University of South Bohemia in České Budějovice

Výroční zpráva 2018–2019

Vodňany, 2020 OBSAH

Úvodní slovo děkana FROV JU 5 Poslání, vize a cíle Fakulty rybářství a ochrany vod 1. Fakultní management a rozvoj 6 1.1. Struktura fakulty 8 1.2. Vedení fakulty 9 1.3. Akademický senát FROV JU 9 1.4. Mezinárodní rada FROV JU a centra CENAKVA 10 1.5. Kontrolní rada centra CENAKVA 10 1.6. Vědecká rada FROV JU 11 1.7. VÝZKUMNÝ ÚSTAV RYBÁŘSKÝ A HYDROBIOLOGICKÝ 12 1.8. ÚSTAV AKVAKULTURY A OCHRANY VOD 31 1.9. ÚSTAV KOMPLEXNÍCH SYSTÉMŮ 41 1.10. CENAKVA 47 1.11. Pracoviště děkanátu fakulty, rozvoj, ekonomika a lidské zdroje 58 1.12. Habilitační a profesorská řízení 66 2. Mezinárodní a národní vztahy 67 3. Výzkum a excelence 78 4. Pedagogická činnost 118 5. Celoživotní vzdělávání na pracovišti MEVPIS Vodňany 141 6. Ze života fakulty 145 7. Seznam zaměstnanců 147

Výroční zpráva 2018–2019

Vydala: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Fakulta rybářství a ochrany vod Grafický design: Jesenické nakladatelství Jena Šumperk, www.jenasumperk.cz Použité fotografie z archivu FROV JU

Vydání 1., vydáno v roce 2020 ve Vodňanech www.frov.jcu.cz © Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Fakulta rybářství a ochrany vod ISBN 978-80-7514-101-9 FROV JU

ÚVODNÍ SLOVO DĚKANA FROV JU

Vážení a milí,

dovolte mi, abych v pár odstavcích shrnul nejzásadnější dění v životě naší instituce za uply- nulé období. V roce 2019 Fakulta rybářství a ochrany vod JU oslavila 10 let od svého založení. Za tuto relativně krátkou dobu se fakulta velmi dynamicky rozvíjela jak po stránce stavebně- technické, tak i vědecké a studijní. Nejinak tomu bylo i tyto poslední dva roky, i přes to že jsme byli ve velké nejistotě, s ohledem na končící financování udržitelnosti našeho centra CENAKVA ze strany MŠMT. Úspěšné zařazení centra CENAKVA mezi Velké výzkumné infrastruktury ČR včet- ně získání účelové podpory na podporu otevřené infrastruktury do roku 2022 je velkým úspě- chem. Další prostředky na rozvoj centra se podařilo zařadit do rozpočtu Jihočeské univerzity v rámci Dlouhodobého koncepčního rozvoje výzkumné organizace. Oba tyto strategické zdroje nám umožňují další rozvoj vědy a jsou zároveň výzvou s ohledem na propojení se s dalšími infrastrukturami v rámci Evropského výzkumného prostoru. Za další důležitý mezník považuji to, že jsme získali možnost Institucionální akreditace pro oblast vzdělávání Biologie, ekologie a životního prostředí pro všechny stupně studia a v rámci oblasti vzdělávání Zemědělství obor Rybářství pro bakalářský stupeň. Díky tomu se v závěru roku 2019 podařilo akreditovat v bakalářském stupni obor Ochrana vod a v doktorských stu- dijních programech obory Ochrana vodních ekosystémů a Protection of Aquatic Ecosystems. Rozvoj v oblasti ochrany vod velmi významně posouvá fakultu ze zaměření čistě zemědělských věd do věd přírodovědných. Získali jsme stejně jako v předchozích letech nespočet projektů, které nám umožňují roz- víjet kvalitní výzkum. Vznikla tak řada velmi významných publikací a podařilo se nám stále více se prosazovat v těch nejprestižnějších Top 10 časopisech. Zkvalitnili jsme naši infrastrukturu a zmodernizovali přístrojové vybavení. Uvedli jsme do provozu nový skleník využívající technologii akvaponie, vybudovali jsme nové recirkulační systémy, stavíme novou budovu pro laboratoř nemocí ryb, nové ubytovací zázemí pro doktorandy a vykoupili jsme strategický pozemek pro další rozvoj fakulty v blízkosti střediska MEVPIS. To vše by ale bylo zbytečné bez schopného personálního obsazení. Investovali jsme do nových pozic postdoktorandů a hostujících profeso- rů, vytvořili jsme řadu motivačních opatření pro studenty i vědce a podařilo se nám i postupně navyšovat mzdy pracovníků na všech pozicích. Pozitivní motivaci všech pracovníků i studentů stimulující chuť k práci a vytvářející pocit sounáležitosti a hrdosti k příslušnosti fakultě považuji jako jednu z nejdůležitějších priorit z pozice své funkce děkana Fakulty rybářství a ochrany vod JU. Na závěr bych chtěl tímto poděkovat všem pracovníkům za jejich obětavou práci a věřím, že další dvouleté období bude neméně úspěšné. Čeká nás v něm další důležitý milník, a tím jsou oslavy 100 let od založení mateřské instituce fakulty, a to Výzkumného ústavu rybářského a hydrobiologického v roce 2021.

prof. Ing. Pavel Kozák, Ph.D. děkan FROV JU

5 01 POSLÁNÍ, VIZE A CÍLEA CÍLE FAKULTY RYBÁŘSTVÍ A OCHRANYA OCHRANY VOD FROV JU I. Poslání fakulty • Vzdělávání na bakalářské a magisterské • Vzdělávání na úrovni Ph.D. – připravit bu- úrovni – vychovat nezávislé a vysoce kvali- doucí generaci vědců, kteří budou schopni Fakulta rybářství a ochrany vod plní roli centra vědeckých, servisních a vzdělávacích činností fi kované odborníky pro rozhodovací a řídi- řešit problémy a výzvy pro rozvoj akvakul- v oboru rybářství a ochrany vod s tím, že v daných oborech: cí pozice v oblasti rybářství a ochrany vod tury a dlouhodobě udržitelné využívání za účelem rozvoje rybářství, akvakultury životního prostředí v ČR, Evropě a světě. a pro dlouhodobě udržitelné využívání ži- • Celoživotní vzdělávání – posilovat znalosti  uchovává a rozšiřuje dosažené poznání a  přispívá k celkovému rozvoji na národní a votního prostředí, a to v praxi, orgánech odborné veřejnosti v ČR a EU o inovacích rozvíjí činnost vědeckou, výzkumnou, vý- regionální úrovni a spolupracuje s různými státní správy a samosprávy a v oblasti v rybářství, akvakultuře a nutnosti udrži- vojovou a inovační a další tvůrčí činnost, stupni státní správy a samosprávy a pod- vědy, výzkumu a inovací v ČR, Evropě a telného využívání životního prostředí.  umožňuje získání odpovídající profesní nikovou sférou, ve světě. kvalifi kace a přípravu pro výzkumnou prá-  rozvíjí mezinárodní a zvláště evropskou ci, spolupráci a podporuje společné projek- 3) Služby a komerce • poskytuje další formy vzdělávání a podílí ty s obdobnými institucemi v zahraničí a se tak na celoživotním vzdělávání, výměnu akademických pracovníků a stu- Dosažení minimálně 10% ziskovosti v oblasti realizovaného zakázkového výzkumu a ko-  hraje aktivní roli ve veřejné diskusi při dentů. merčních činností na fakultě (nebudou nadále podporovány aktivity bez přidané hodnoty), viz utváření občanské společnosti a přípravě rozhodnutí děkana. Realizovat vlastní specifi cký a cílený smluvní výzkum a ostatní komerční mladých lidí pro život, činnost v oblastech směřování výzkumu, zejména pak analytické chemii, toxikologii, chovu ryb, prodeje rybích výrobků a CŽV. Dále se zaměřit na licencování a vznik patentů. II. Vize fakulty

1) Na základě realizace výzkumného progra- 3) Jako vnitřně konsolidovaná, stabilní a fi - mu fakulty chceme porozumět procesům nančně zdravá fakulta, jednotná vnitřní probíhajícím ve sladkovodních ekosysté- kulturou, hodláme nadále podporovat mech a jejich závažnosti z hlediska zacho- a rozvíjet tvůrčí akademické prostředí, vání biodiverzity, ochrany vodního prostře- v němž akademičtí pracovníci budou po- dí, ale i ochrany vodních zdrojů pro život a souvat hranice lidského poznání a předá- činnost člověka. vat své vědomosti a poznatky studentům 2) Jako jediná fakulta tohoto typu v České a vychovávat z nich vysoce kvalifi kované republice a unikátní fakulta ve střední odborníky v oblastech rybářství a ochraně Evropě chceme být moderní, otevřená in- vod. stituce, dynamicky se rozvíjející v souladu s okolním světem.

III. Cíle na fakultě

1) Věda a výzkum

Naším cílem je dosažení excelence ve vědě a výzkumu v oblasti sladkovodního rybářství a ochrany vod, podporovat (motivovat) vznik a publikování výsledků v prestižních časopisech řazených podle oborů na WOS do Q1, produkovat aplikované výsledky jako jsou patenty, licence a smluvním výzkum. Stimulovat budoucí koordinátory evropských projektů.

2) Výuka

Chceme vychovávat odborně a společensky excelentní odborníky v oblasti rybářství a ochrany vod na úrovních bakalář, inženýr a doktor uplatnitelné na trhu práce.

6 7 01 POSLÁNÍ, VIZE A CÍLE FAKULTY RYBÁŘSTVÍ A OCHRANY VOD FROV JU FROV JU I. Poslání fakulty • Vzdělávání na bakalářské a magisterské • Vzdělávání na úrovni Ph.D. – připravit bu- úrovni – vychovat nezávislé a vysoce kvali- doucí generaci vědců, kteří budou schopni Fakulta rybářství a ochrany vod plní roli centra vědeckých, servisních a vzdělávacích činností fi kované odborníky pro rozhodovací a řídi- řešit problémy a výzvy pro rozvoj akvakul- v oboru rybářství a ochrany vod s tím, že v daných oborech: cí pozice v oblasti rybářství a ochrany vod tury a dlouhodobě udržitelné využívání za účelem rozvoje rybářství, akvakultury životního prostředí v ČR, Evropě a světě. a pro dlouhodobě udržitelné využívání ži- • Celoživotní vzdělávání – posilovat znalosti  uchovává a rozšiřuje dosažené poznání a  přispívá k celkovému rozvoji na národní a votního prostředí, a to v praxi, orgánech odborné veřejnosti v ČR a EU o inovacích rozvíjí činnost vědeckou, výzkumnou, vý- regionální úrovni a spolupracuje s různými státní správy a samosprávy a v oblasti v rybářství, akvakultuře a nutnosti udrži- vojovou a inovační a další tvůrčí činnost, stupni státní správy a samosprávy a pod- vědy, výzkumu a inovací v ČR, Evropě a telného využívání životního prostředí.  umožňuje získání odpovídající profesní nikovou sférou, ve světě. kvalifi kace a přípravu pro výzkumnou prá-  rozvíjí mezinárodní a zvláště evropskou ci, spolupráci a podporuje společné projek- 3) Služby a komerce • poskytuje další formy vzdělávání a podílí ty s obdobnými institucemi v zahraničí a se tak na celoživotním vzdělávání, výměnu akademických pracovníků a stu- Dosažení minimálně 10% ziskovosti v oblasti realizovaného zakázkového výzkumu a ko-  hraje aktivní roli ve veřejné diskusi při dentů. merčních činností na fakultě (nebudou nadále podporovány aktivity bez přidané hodnoty), viz utváření občanské společnosti a přípravě rozhodnutí děkana. Realizovat vlastní specifi cký a cílený smluvní výzkum a ostatní komerční mladých lidí pro život, činnost v oblastech směřování výzkumu, zejména pak analytické chemii, toxikologii, chovu ryb, prodeje rybích výrobků a CŽV. Dále se zaměřit na licencování a vznik patentů. II. Vize fakulty

III. Cíle na fakultě

1) Věda a výzkum

2) Výuka

Chceme vychovávat odborně a společensky excelentní odborníky v oblasti rybářství a ochrany vod na úrovních bakalář, inženýr a doktor uplatnitelné na trhu práce.

6 7 7 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

1.1. Struktura fakulty

Akademický senát Kontrolní rada Mezinárodní rada Vědecká rada fakulty CENAKVA FROV a CENAKVA FROV

DĚKAN Proděkani

Tajemník Studijní pracoviště

Ekonomické Mezinárodní enviromentální vzděláva- Pracoviště vědy pracoviště cí, poradenské a informační středisko a výzkumu fakulty ochrany vod (MEVPIS) Ředitel Jihočeského výzkumného centra akvakultury a biodiverzity Pracoviště Pracoviště projektových hydrocenóz (CENAKVA) správy fakulty manažerů

VP 1: Reprodukční Ředitel Výzkumného Ředitel Ústavu akva- Ředitel Ústavu kom- a genetické postupy ústavu rybářského kultury a ochrany plexních systémů pro uchování biodi- a hydrobiologického vod (ÚAOV) (ÚKS) verzity ryb a akva- (VÚRH) kulturu Laboratoř řízené Laboratoř experi- Experimentální ry- reprodukce a inten- mentálních komplex- VP 2: „Nové“ po- bochovné pracoviště zivního chovu ryb ních systémů (LEKS) lutanty v životním a pokusnictví (ERPP) (LRRICHR) prostředí a jejich vliv Laboratoř zpracování na ekosystémy Genetické rybářské Laboratoř výživy signálu a obrazu centrum (GRC) (LV) (LZSO) VP 3: Dlouhodobě udržitelná akvakul- Laboratoř molekulár- Laboratoř aplikované tura s odpovědným ní, buněčné a kvan- hydrobiologie (LAH) hospodařením titativní genetiky s vodou a živinami (LMBKG) Prodejna ryb a rybích výrobků (PRRV) VP 4: Biologie v mě- Laboratoř fyziologie nících se podmín- reprodukce (LFR) kách sladkovodních systémů Laboratoř zárodeč- ných buněk (LZB)

Laboratoř intenzivní akvakultury (LIA)

Laboratoř etologie ryb a raků (LERR)

Laboratoř envi- ronmentální chemie a biochemie (LECHB)

Laboratoř vodní toxikologie a ichtyopatologie (LVTI)

Laboratoř aplikované hydrobiologie zanikla ke dni 31. 12. 2019.

8 FROV JU

1.2. Vedení fakulty

prof. Ing. Pavel Kozák, Ph.D. Ing. Petr Císař, Ph.D. děkan proděkan pro rozvoj [email protected] [email protected]

doc. Ing. Martin Kocour, Ph.D. MVDr. Veronika Piačková, Ph.D. proděkan pro pedagogickou čin- proděkanka pro vnější vztahy nost, zástupce děkana (od 15. 10. 2018 – 31. 12. 2019) [email protected] [email protected]

doc. Ing. Vladimír Žlábek, Ph.D. Ing. Michal Hojdekr, MBA proděkan pro zahraniční vztahy tajemník [email protected] [email protected]

Ing. Antonín Kouba, Ph.D. Milada Vazačová proděkan pro vědu a výzkum asistentka děkana [email protected] [email protected]

1.3. Akademický senát FROV JU

Pro období 6. 11. 2017 – 6. 11. 2020

Akademičtí pracovníci Předseda MVDr. Eliška Zusková, Ph.D., VÚRH; [email protected] Členové doc. Ing. Tomáš Policar, Ph.D., VÚRH; [email protected] doc. Mgr. Roman Grabic, Ph.D., VÚRH; [email protected] Ing. David Gela, Ph.D., VÚRH; [email protected] dr hab. Ing. Josef Velíšek, Ph.D., VÚRH; [email protected] MVDr. Veronika Piačková, Ph.D., VÚRH, [email protected] (do 14. 10. 2018) RNDr. Bořek Drozd, Ph.D., ÚAOV; [email protected] (od 1. 11. 2018) Ing. Vlastimil Stejskal, Ph.D., ÚAOV; [email protected] Ing. Petr Dvořák, Ph.D., ÚAOV; [email protected]

Studenti Bc. Vít Profant; [email protected] Ing. Radek Gebauer, [email protected] (do 30. 9. 2018) Ing. Martin Hubálek; [email protected] (od 1. 10. 2018) Bc. Alžběta Strouhová; [email protected] Tomáš Doležal, [email protected] (do 30. 9. 2018) Oldřich Pecha; [email protected] (od 1. 10. 2018)

9 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

1.4. Mezinárodní rada FROV JU a centra CENAKVA

Předseda Prof. Sadasivam Kaushik Prof. Johan Verreth INRA, Francie Wageningen University, Graduate School WIAS, Nizozemí

Prof. Mats Tysklind Prof. Achim Kohler Umea University, Department of Norwegian University of Life Chemistry, Švédsko Sciences, Norsko

Assoc. Prof. Bela Urbanyi Prof. Dr. Werner Kloas Szent István University, Maďarsko Leibniz-Institute of Freshwater Eco- logy and Inland Fisheries, Německo

Dr. Marc Vandeputte INRA-IFREMER, Francie

1.5. Kontrolní rada centra CENAKVA

RNDr. Pavel Punčochář, CSc. prof. MVDr. Ivo Pavlík, CSc. Ministerstvo zemědělství Mendelova univerzita v Brně, Fakul- Sekce vodního hospodářství ta regionálního rozvoje a meziná- [email protected] rodních studií [email protected]

doc. Ing. Jiří, Krechl, CSc. Ing. Jaromír Slíva CzechInvest Starosta města České Velenice [email protected] [email protected]

Mgr. Jan Radoš prof. RNDr. Ivo Frébort, CSc., Ph.D. Ministerstvo zemědělství (od 8/2018) Národní agentura pro zemědělský Centrum regionu Haná pro biotech- výzkum nologický a zemědělský výzkum [email protected]

10 FROV JU

1.6. Vědecká rada FROV JU

Předseda prof. Ing. Pavel Kozák, Ph.D., FROV JU, Vodňany Tajemník Ing. Antonín Kouba, Ph.D., FROV JU, Vodňany Interní členové doc. Ing. Tomáš Policar, Ph.D., FROV JU, Vodňany doc. Ing. Vladimír Žlábek, Ph.D., FROV JU, Vodňany prof. Ing. Otomar Linhart, DrSc., FROV JU, Vodňany prof. Ing. Martin Flajšhans, Dr.rer.agr., FROV JU, Vodňany prof. Ing. Tomáš Randák, Ph.D., FROV JU, Vodňany doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D., FROV JU, České Budějovice doc. Ing. Martin Kocour, Ph.D., FROV JU, Vodňany prof. RNDr. Dalibor Štys, CSc., FROV JU, Nové Hrady Ing. Petr Císař, Ph.D., FROV JU, Nové Hrady doc. Mgr. Roman Grabic, Ph.D., FROV JU, Vodňany prof. RNDr. Tomáš Polívka, Ph.D., Přírodovědecká fakulta JU doc. RNDr. Josef Matěna, CSc., Přírodovědecká fakulta JU a Biologické centrum AV ČR, v.v.i., České Budějovice Externí členové prof. Ing. Petr Ráb, DrSc. Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v.v.i., Liběchov prof. RNDr. Luděk Bláha, Ph.D. Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita Brno doc. RNDr. Milan Gelnar, CSc. Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita, Brno prof. Ing. Lukáš Kalous, Ph.D. Fakulta agrobiologie, potravinových a přírodních zdrojů, Česká země- dělská univerzita v Praze prof. Mgr. Ondřej Slavík, Ph.D. Fakulta agrobiologie, potravinových a přírodních zdrojů, Česká země- dělská univerzita v Praze prof. Ing. Radka Kodešová, CSc. Fakulta agrobiologie, potravinových a přírodních zdrojů, Česká země- dělská univerzita v Praze Ing. Dr. Pavel Jurajda Ústav biologie obratlovců AV ČR, v.v.i., Brno doc. Mgr. Pavel Drozd, Ph.D., Přírodovědecká fakulta, Ostravská univerzita, Ostrava

11 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

1.7. VÚRH VÝZKUMNÝ ÚSTAV RYBÁŘSKÝ A HYDROBIOLOGICKÝ

Výzkumný ústav rybářský a hydrobiologický (VÚRH) ve Vodňanech je v současné době nej- větším a nejkomplexnějším pracovištěm fakulty, jehož hlavní náplní je realizace kvalitního me- zinárodně uznávaného výzkumu v oblastech biologických, environmentálních a akvakulturních. K hlavním směrům výzkumu VÚRH, které zabezpečuje v současné době celkem sedm vý- zkumných laboratoří podporovaných dvěma experimentálními pracovišti, patří studium gene- tické diverzity hospodářsky významných druhů ryb a raků, studium reprodukce hospodářsky významných a ohrožených druhů ryb a raků včetně vývoje postupů pro jejich umělé rozmnožová- ní, prevence a terapie chorob ryb, sledování výskytu cizorodých látek ve vodních ekosystémech a hodnocení vlivu znečištění na exponované organizmy. Zabýváme se i vývojem systémů monitoringu kvality vody využívajících ryby a raky jako bioindikátory. Pro realizaci kvalitního výzku- mu je nezbytná špičková infrastruktura včetně moderních technologií a přístrojového vybavení. Rozsáhlá modernizace v tomto směru proběhla v rámci projektu Jihočeské výzkumné centrum akvakultury a biodiverzity hydrocenóz (CENAKVA) a v současnosti již průběžně probíhá obměna klíčových přístrojů, zařízení a instalace nových technologií potřebných k dalšímu výzkumu. VÚRH prostřednictvím jednotlivých výzkumných týmů úzce spolupracuje s aplikační sférou, a to na bázi projektových i komerčních aktivit včetně transferu znalostí. Akademičtí pracovníci ústavu zabezpečují výuku studijních programů fakulty ve všech stupních, tj. bakalářském, magi- sterském i doktorském.

prof. Ing. Tomáš Randák, Ph.D. doc. Ing. Vladimír Žlábek, Ph.D ředitel ústavu zástupce ředitele ústavu [email protected] [email protected]

Ing. Josef Příborský Pavlína Nováková asistent ředitele pro provoz asistentka ředitele [email protected] [email protected]

Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Fakulta rybářství a ochrany vod, Výzkumný ústav rybářský a hydrobiologický, Zátiší 728/II, 389 25 Vodňany, tel.: +420 387 774 666, e-mail: [email protected]

12 FROV JU

Vybrané projekty z NAZV – QK1710310 Využití nových biotechnologických postupů v podmínkách české akvakultury s cílem dosáhnout efektivní, kvalitní a ekologicky šetrné produkce ryb (2017–2021, odpovědný řešitel doc. Ing. Tomáš Policar, Ph.D.) z NAZV – QK1910430 Inovace technologických prvků v chovu kapra obecného za účelem maximálního využití vysokého potenciálu selekčních programů v podmínkách rybničního hospodaření (2019–2023, odpovědný řešitel doc. Ing. Martin Kocour, Ph.D.) z GAČR – 17-19714Y Jaderný transfer u ryb: šance pro obnovení mizejících druhů jeseterů (2017–2019, odpovědný řešitel doc. Ing. Martin Pšenička Ph.D.) z GAČR – 18-03712S Je nová generace herbicidů bezpečnější alternativou i pro vodní bezobratlé? (2018– 2020, odpovědný řešitel dr hab. Ing. Josef Velíšek, Ph.D.) z GAČR – 18-15802S Transformace farmak v prostředí běžného recipientu vyčištěných komunálních odpadních vod (2018–2020, odpovědný řešitel doc. Ing. Vladimír Žlábek, Ph.D.) z GAČR – 18-12465Y Výzkum naváděcích mechanismů spermií u sladkovodních ryb (2018–2020, odpovědný řešitel M.Sc. Sergii Boryshpolets, Ph.D.) z GAČR – 19-04431S Teplotou ovlivněné změny v interakcích a ekologických rolích prominentních invazivních raků (2019–2021, odpovědný řešitel Ing. Antonín Kouba, Ph.D.)

Vybrané publikace

Červený, D., Grabic, R., Fedorova, G., Grabicová, K., Turek, J., Žlábek, V., Randák, T., 2018. Fate of perfluoroalkyl substances within a small stream food web affected by sewage effluent. Water Research 134: 226–233. (IF 2017 = 7,051) Šauer, P., Stará, A., Golovko, O., Valentová, O., Grabic, R., Bořík, A., Kocour Kroupová, H., 2018. Two synthetic progestins and natural progesterone are responsible for most of the progestagenic activities in municipal wastewater treatment plant effluents in the Czech and Slovak republics. Water Research 137: 64–71. (IF 2017 = 7,051) Kouba, A., Lunda, R., Hlaváč, D., Kuklina, I., Hamáčková, J., Randák,T., Kozák,P., Koubová, A., Buřič, M., 2018. Vermicomposting of sludge from recirculating aquaculture system using Eisenia andrei: technological feasibility and quality assessment of end-products. Journal of Cleaner Production 177: 665–673. (IF 2017 = 5,651) Prchal, M., Bugeon, J., Vandeputte, M., Kause, A., Vergnet, A., Zhao, J., Gela, D., Genestout, L., Bestin, A., Haffray, P., Kocour, M., 2018. Potential for genetic improvement of the main slaughter yields in common carp with in vivo morphological predictors. Frontiers in Genetics 9: 283. (IF 2017 = 4,151) Saito, T., Pšenička, M., 2018. Způsob značení zárodečných buněk, zejména primordiálních gonocytů chrupa- včitých ryb. Úřad průmyslového vlastnicí ČR, patent č. 307467.

Letecký snímek Výzkumného Ústavu rybářského a hydrobiologického FROV JU ve Vodňanech.

13 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

LABORATOŘ ETOLOGIE RYB A RAKŮ

Ing. Miloš Buřič, Ph.D. Ing. Filip Ložek vedoucí laboratoře doktorand akademický pracovník [email protected] [email protected]

Ing. Antonín Kouba, Ph.D. M.Sc. Md Shakhawate Hossain zástupce vedoucího, doktorand akademický pracovník [email protected] [email protected]

prof. Ing. Pavel Kozák, Ph.D. M.Sc. Wei Guo akademický pracovník doktorand [email protected] [email protected]

Ing. Martin Bláha, Ph.D. M.Sc. Sara Roje akademický pracovník doktorandka [email protected] [email protected]

M.Sc. Iryna Kuklina, Ph.D. Ing. Marek Let vědecká pracovnice (do 9/2019) doktorand (od 10/2018) [email protected] [email protected]

M.Sc. Hamid Niksirat Hashjin, Ph.D. M.Sc. Viktoriia Malinovska vědecký pracovník doktorandka (od 2/2019) [email protected] [email protected]

Ing. Mgr. Lukáš Veselý, Ph.D. Ing. Martin Musil vědecký pracovník doktorand (od 10/2019) [email protected] [email protected]

doc. RNDr. Zdeněk Adámek, CSc. M.Sc. Kifayatullah akademický pracovník (od 3/2019) doktorand (od 10/2019) [email protected]. [email protected]

Ing. Jan Kubec, Ph.D. doktorand (do 9/2019), vědecký pracovník (od 10/2019) [email protected]

14 FROV JU

Mgr. Boris Lipták, Ph.D. Mgr. Martin Fořt externí doktorand (do 9/2019) externí doktorand (do 10/2019)

Hlavním cílem laboratoře je komplexní výzkum sladkovodních ekosystémů s použitím multidisci- plinárních přístupů. Kromě ryb a raků jsou využívány i ostatní vodní organizmy pro studie v kontextu biotických a abiotických faktorů, které současné sladkovodní ekosystémy výrazně ovlivňují. Hlavními studovanými aspekty jsou vlivy klimatických změn, antropogenního poškození prostředí a biologic- ké invaze. Mezi používané metody patří např. etologická sledování vnitro- i mezidruhových interakcí, analýza vztahů na úrovni predátor-kořist, analýzy stabilních izotopů nebo monitoring srdeční aktivity, včetně využití těchto přístupů při ekotoxikologických studiích během spoluprací. Klíčovou skupinou organizmů využívanou ve výzkumné a aplikační práci laboratoře jsou původní, ale recentně zejména nepůvodní druhy raků. Ve výzkumu pak zohledňujeme jejich vztahy s jinými bezobratlými a rybami v kontextu výše zmíněným změn prostředí. Laboratoř se snaží cílit jak na základní výzkum biologických zákonitostí, tak na porozumění procesům vyskytujícím se v přírodních podmínkách. Některé aktivity laboratoře se zároveň dotýkají problematiky udržitelné akvakultury nebo studia reprodukce a chovu říčních druhů ryb. V neposlední řadě jsou naše aktivity zaměřeny na osvětovou činnost pro školy a ve- řejnost, biologický monitoring či záchranné transfery měkkýšů, korýšů a ryb. Příkladem zajímavého a významného poznatku dosaženého v posledních letech je popsání schopnosti vysoce invazivního raka mramorovaného úspěšně inkubovat svá vajíčka a prodělávat časný post- embryonální vývoj mimo vodní prostředí, a to pouze ve vysoké vzdušné vlhkosti, která se vyskytuje v norách budovaných v období dlouhodobého sucha. V porovnání s původními druhy raků v Evropě se jedná o významnou konkurenční výhodu v době častých klimatických extrémů. Kromě důležitých poznatků základního výzkumu zaměřených na porozumění fungování sladko- vodních ekosystémů se laboratoř podílí na zdokonalování a aplikaci systému pro monitorování kvality vody založeného na sledování pohybové a srdeční aktivity raků využívající neinvazivní systém sle- dování. Biologický monitoring lokalit a záchranné transfery jsou kromě svého daného cíle využívány i ke komunikaci s veřejností a osvětě. Laboratoř se snaží být aktivní ve zvyšování povědomí o ochraně klíčových vodních organizmů a vodního prostředí obecně. Věříme, že také díky těmto aktivitám se podaří více zapojit veřejnost do problematiky ochrany přírody.

Rak mramorovaný (Procambarus virginalis) s ráčaty připevněnými na spodní straně abdomenu.

Zpracoval: Ing. Miloš Buřič, Ph.D.

15 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

LABORATOŘ INTENZIVNÍ AKVAKULTURY

doc. Ing. Tomáš Policar, Ph.D. M.Sc. Nima Hematyar, Ph.D. vedoucí laboratoře, vědecký pracovník (od 9/2019) akademický pracovník [email protected] [email protected]

Ing. Miroslav Blecha, Ph.D. M.Sc. Hadiseh Dadras Asyabar, Ph.D. zástupce vedoucího laboratoře, vědecká pracovnice (od 10/2018) akademický pracovník (do 10/2018) [email protected]

M.Sc. Azin Mohagheghi Samarin, Ph.D. M.Sc. Aiman Imentai vědecká pracovnice doktorandka (od 10/2016) [email protected] [email protected]

Ing. Jiří Křišťan, Ph.D. M.Sc. Swapnil Gorakh Waghmare vědecký pracovník doktorand [email protected] [email protected]

MVDr. Jitka Kolářová Filip Kupka vědecká pracovnice technik (od 3/2018) [email protected] [email protected]

M.Sc. Yanes-Roca Carlos, Ph.D. Bc. Petr Dobrovolný, DiS. vědecký pracovník vedoucí experimentální haly [email protected] (od 9/2018) [email protected]

M.Sc. Oleksandr Malinovskyi, Ph.D. Bc. Vít Profant doktorand (do 9/2019), odborný asistent (od 10/2019) vědecký pracovník (od 10/2019) [email protected] [email protected]

M.Sc. Azadeh Mohagheghi Samarin, Ing. Jan Hampl Ph.D. odborný pracovník (do 4/2018) doktorandka (do 9/2018), vědecká pracovnice (od 10/2018) [email protected]

M.Sc. Samad Rahimnejad, Ph.D. vědecký pracovník (od 7/2019) [email protected]

16 FROV JU

Hlavním cílem laboratoře je aplikovaný výzkum a vývoj týkající se efektivních metod inten- zivní produkce hospodářsky a sportovně významných druhů ryb. Při tomto výzkumu je přede- vším optimalizována technologie recirkulačních akvakulturních systémů (RAS) s cílem dosahovat kontinuální, kvalitní a rentabilní produkce ryb, jako je: candát obecný (Sander lucioperca), okoun říční (Perca fluviatilis), keříčkovec červenolemý (Clarias gariepinus), okounek pstruho- vý (Micropterus salmoides), parma obecná (Barbus barbus), lipan podhorní (Thymallus thymallus) a další. Vedle optimalizace provozu RAS jsou inovovány a optimalizovány jednotlivé produkční protokoly týkající se inkubace oplozených jiker, odchovu larev, juvenilních, tržních a generačních ryb s cílem zefektivnit celý produkční systém, který současně musí rybám po- skytovat vysoký welfare. Zmíněný technologický výzkum je logicky doplňován výzkumem, který studuje řízenou reprodukci, kvalitu gamet a vylíhnutých larev, domestikaci, produkci polyploid- ních a monosexních populací, stres a fyziologický stav chovaných ryb v různých podmínkách prostředí v závislosti na kvalitě vody, světelném režimu, hustotě obsádky, managementu krme- ní, popřípadě třídění a jiné manipulaci s rybami. Vedle chovu ryb je v laboratoři také studována biologie a chov původních evropských druhů raků a potravních organizmů (vířníků a drobných korýšů). Veškeré aktivity a získané výsledky výzkumu jsou pracovníky laboratoře využívány při výuce studentů všech stupňů vysokoškolské výuky, školení produkčních rybářů či popularizaci rybářského výzkumu mezi širokou odbornou a laickou veřejností. Příkladem zajímavého základního výzkumu je studie popisující buněčné a molekulární změ- ny v kvalitě ovulovaných oocytů různých druhů ryb v průběhu jejich procesu stárnutí. Cílem výzkumu je negativní změny zpomalit či významně eliminovat vlivem výživy generačních ryb či využití různých antioxidantů využívaných při inkubaci oocytů. Snahou je umožnit dlouhodobé uchovávání neoplozených oocytů v průběhu transportu, při různých experimentech nebo s cí- lem synchronizovat oplození získaných oocytů v různých rybářských provozech. Tyto výsled- ky výzkumu mohou najít uplatnění v humánní medicíně při uchovávání získávaných oocytů při in vitro oplodnění. Laboratoř rozvíjí širokou spolupráci s českými a zahraničními produkčními podniky s cílem zefektivnit intenzivní chov ryb, a dosahovat tak rentabilního provozu u daných podniků. Vědečtí pracovníci spolupracují s Evropskou akvakulturní společností se sídlem v Belgii na organizaci mezinárodních vědeckých rybářských konferencí. Pracovníci provádí a nabízí odborné poraden- ství při výstavbě a provozu intenzivních chovů ryb a jiných vodních organizmů využívajících RAS. Laboratoř dále produkuje kvalitní násadový materiál dravých a reofilních druhů ryb, které ve spo- lupráci s Českým rybářským svazem či jinými subjekty využívají k zarybňování volných vod.

Generační ryby lipana podhorního odchovaného v RAS.

Zpracoval: doc. Ing. Tomáš Policar, Ph.D.

17 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

LABORATOŘ FYZIOLOGIE REPRODUKCE

M.Sc. Sergii Boryshpolets, Ph.D. M.Sc. Yevhen Horokhovatskyi, akademický pracovník, Ph.D. vedoucí laboratoře doktorand (do 8/2018) [email protected]

Ing. Marek Rodina, Ph.D. M.Sc. Vitaliy Kholodnyy, Ph.D. akademický pracovník, doktorand zástupce vedoucího [email protected] [email protected]

prof. Ing. Otomar Linhart, DrSc. M.Sc. Deepali Rahi akademický pracovník doktorandka (od 1/2018) [email protected] [email protected]

Jacky Cosson, Ph.D., Dr.h.c. M.Sc. Francisco Fabio Herrera akademický pracovník (do 12/2018) Rodríguez doktorand (od 5/2018) [email protected]

doc. M.Sc. Borys Dzyuba, Ph.D. M.Sc. Yu Cheng akademický pracovník doktorandka (od 10/2018) [email protected] [email protected]

M.Sc. Ping Li, Ph.D. M.Sc. Anatolii Sotnikov akademická pracovnice doktorand (od 10/2019) (do 12/2018) [email protected]

M.Sc. Olga Bondarenko, Ph.D. Mgr. Vladimíra Tučková akademická pracovnice odborná pracovnice [email protected] [email protected]

M.Sc. Viktoryia Dzyuba, Ph.D. M.Sc. Volodymyr Bondarenko, Ph.D. akademická pracovnice odborný pracovník (do 12/2019) [email protected] [email protected]

M.Sc. Hermes Augusto Buarque prof. MSc. William L. Shelton, Ph.D. Gadelha, Ph.D. mentor vědecký pracovník (od 7/2018) [email protected] [email protected]

M.Sc. Xin MiaoMiao, Ph.D. doktorandka (do 9/2019), vědecká pracovnice (od 10/2019) [email protected]

18 FROV JU

Laboratoř fyziologie reprodukce se zabývá studiem fungování rybích gamet jako faktoru, který od základů ovlivňuje reprodukční úspěch, obzvláště u druhů s vnějším oplozením. U těchto druhů je úspěšné oplození vysoce závislé na kvalitě spermatu a jeho schopnosti dostat se k jikře během velmi krátké doby. Naše laboratoř v současné době studuje různé aspekty fyziologie spermií před i během motility: spotřebu energie a metabolické dráhy, pohyb spermie a bičíku, chování spermie za různých podmínek prostředí a kryokonzervaci vzorků spermatu pro další vy- užití. Hlavním cílem tohoto výzkumu je popsat a porozumět procesům, které nastávají ve spermatu během cesty k vajíčku, vedoucím k úspěšnému oplození. Soustřeďujeme se nyní spíše na interakci mezi jikrou a spermií než na oddělené studium spermií a jiker. V posledních letech jsme rozšířili spektrum našich tradičních modelových rybích druhů (jeseter, kapr) o pstruha, kostlína, kaprouna, candáta, mníka, ale také o trnuchy (sladkovodní rejnoky) a živorodky, jako zástupce ryb s vnitřním oplozením a paryb. Tímto způsobem můžeme sledovat změny v repro- dukčních strategiích a chování spermií, které se vyvinuly za různých podmínek prostředí u růz- ných druhů ryb. Ve výzkumu využíváme klasické i moderní metody biochemické analýzy metabolizmu, sledování a analýzu pohybu spermií a jejího bičíku a v neposlední řadě např. proteomiku. Příkladem zajímavého a významného zjištění z poslední doby je pozorování shlukování sper- mií v blízkosti zdroje „signálu“ uvolňovaného jikrou nebo ovariální tekutinou u sladkovodních ryb (obr. níže). Tento jev indikuje přítomnost specifického interakčního mechanizmu mezi jikrou a spermatem, který může ovlivňovat cestu spermií k jikře a v důsledku toho reprodukční úspěch. Tento mechanizmus by mohl být druhově specifický, spojený s reprodukční strategií a podmín- kami výtěru. Navíc může také fungovat jako selekční mechanizmus, který selektuje více či méně odpovídající buňky z celkové populace spermií. Výzkumná data a publikace naší laboratoře jsou běžně využívána jako data v základním vý- zkumu v celosvětovém měřítku. Máme jedno z prioritních postavení v celosvětové komunitě laboratoří, které se zabývají rybími gametami. Aktivně se podílíme na organizování praktických workshopů, stejně jako na vědeckých setkáních. Vyvinuli jsme také několik metodik pro rozlič- né aspekty technologie reprodukce různých sladkovodních druhů ryb a kryokonzervaci jejich spermií, které mohou být volně využívány pro uchování diverzity rybích druhů a plemen. Naše výsledky umožňující lepší adaptaci chovu sladkovodních ryb na měnící se klimatické podmínky a jsou také samozřejmě využívány rybářskými praktiky v České republice i Evropě.

Shlukování spermií jesetera malého v čase 0 a 25 s poté, co byl mikroinjektorem přidán extrakt z jiker: A – snímek z videozáznamu; B – odpovídající dvousekundové trajektorie pohybu spermií; C – mapa relativního počtu spermií na pozorovací pole.

Zpracoval: M.Sc. Serhii Boryshpolets, Ph.D.

19 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

LABORATOŘ MOLEKULÁRNÍ, BUNĚČNÉ A KVANTITATIVNÍ GENETIKY

prof. Ing. Martin Flajšhans, M.Sc. Jinfeng Zhao Dr.rer.agr. doktorandka vedoucí laboratoře, fakultní koordiná- [email protected] tor kvality, akademický pracovník [email protected]

doc. Ing. Martin Kocour, Ph.D. Ing. Martin Hubálek zástupce vedoucího, doktorand (od 10/2018) akademický pracovník [email protected] [email protected]

Ing. Vojtěch Kašpar, Ph.D. MUDr. Eva Šálková akademický pracovník externí doktorandka [email protected] [email protected]

M.Sc. Ievgen Lebeda, Ph.D. M.Sc. Olena Shaliutina vědecký pracovník doktorandka (do 4/2019), [email protected] externí doktorandka (od 5/2019) [email protected]

M.Sc. Anna Kolešová, Ph.D. Mgr. Eva Prášková, Ph.D. vědecká pracovnice technička (od 8/2019) [email protected] [email protected]

M.Sc. Ievgenia Gazo, Ph.D. Marie Pečená vědecká pracovnice technička [email protected] [email protected]

Ing. Martin Prchal, Ph.D. Ivana Samková doktorand (do 9/2018), technička vědecký pracovník (od 10/2018) [email protected] [email protected]

M.Sc. Sahana Shivaramu, Ph.D. doktorandka (do 9/2019), vědecká pracovnice (od 10/2019) [email protected]

20 FROV JU

Hlavním cílem naší laboratoře je výzkum zaměřující se na molekulární biologii a proteomiku, cytogenetiku, průtokovou a obrazovou cytometrii a kvantitativní genetiku sladkovodních druhů ryb. Dále se zabýváme ochranou genetických zdrojů ryb včetně ochrany diverzity jedenácti dru- hů jeseterovitých a zvyšováním užitkovosti hospodářsky významných druhů ryb České republiky – kapra obecného (Cyprinus carpio) 15 plemen, lína obecného (Tinca tinca) 11 plemen a sumce velkého (Silurus glanis) dvou plemen a albinotické formy. Laboratoř dále provádí základní i aplikovaný výzkum zaměřený na genetické, biologické a fyziologické aspekty polyploidních a monosexních populací ryb jak volně žijících, tak chovaných v akvakultuře. V poslední době se činnost laboratoře výrazněji zaměřila na studium molekulárních, cytogenetických i hemato- logických aspektů polyploidie u jeseterovitých ryb a jejich další využití v akvakultuře. Členové laboratoře i nadále pokračují ve studiu spontánní polyploidie a významu celogenomových dupli- kací v evoluci jeseterovitých ryb. Ve spolupráci se zahraničními vědeckými institucemi, ale i tu- zemskými rybářskými subjekty rozvíjíme moderní šlechtitelské programy založené na stanovení genetického potenciálu nově vyšlechtěného plemene Amurského lysce. Naše laboratoř se zaměřuje na základní i aplikovaný výzkum spojený s vysokoškolskou vý- ukou a konzultační činností v oblasti udržování genetických zdrojů a zvyšováním genetického potenciálu hospodářsky významných druhů ryb. Příkladem významného objevu posledních let je nově vyšlechtěné a uznané plemeno kapra Amurského lysce, který se vyznačuje dobrým růstem a zejména vyšší odolností vůči Koi herpesviróze, a jehož F1 hybridi jsou rybářskou praxí žádaní. Aplikovaný výzkum vychází zejména z praktického ověřování moderních šlechtitelských metod pro produkci vysoce užitkových obsádek v podmínkách českého rybářství. I nadále se věnujeme šlechtění plemen, linií a kříženců kapra a lína obecného pomocí celoplošných testů užitkovosti ve spolupráci s českými rybářstvími a statisticky zpracováváme tyto údaje pro potře- by Rybářského sdružení ČR. Kromě toho se podílíme na vývoji nových poznatků v biologii a užit- kovém chovu jeseterů a na in situ a ex situ ochraně těchto celosvětově ohrožených druhů ryb.

Měření hloubky břišní dutiny Amurského lysce ultrazvukem za účelem selekce ke zvýšení podílu jedlých části těla.

Zpracoval: prof. Ing. Martin Flajšhans, Dr.rer.agr.

21 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

LABORATOŘ ZÁRODEČNÝCH BUNĚK

doc. Ing. Martin Pšenička, Ph.D. Mgr. Tomáš Tichopád vedoucí laboratoře, doktorand akademický pracovník [email protected] [email protected]

Ing. Roman Franěk, Ph.D. M.Sc. Mujahid Ali Shah doktorand (do 9/2019), doktorand (od 8/2018) zástupce vedoucího, vědecký pra- [email protected] covník (od 10/2019) [email protected]

M.Sc. Hilal Güralp, Ph.D. Ing. Zuzana Bláhová vědecká pracovnice doktorandka (od 6/2018) [email protected] [email protected]

M.Sc. Viktoriia Iegorova, Ph.D. M.Sc. Fatira Effrosyni doktorandka (do 12/2018) externí doktorandka (od 8/2018) [email protected]

M.Sc. Abdul Rasheen Khanzai Bc. Michaela Fučíková Baloch, Ph.D. technička doktorand (do 9/2019) [email protected]

M.Sc. Xuan Xie Mgr. Eva Prášková, Ph.D. doktorandka technička (do 7/2019) [email protected] [email protected]

Laboratoř se zabývá především studiem biologie zárodečných kmenových buněk ryb (pre- kurzory gamet) a jejich využitím pro moderní biotechnologické přístupy. V této oblasti výzkumu provádíme metodu reprodukce pomocí náhradních rodičů s cílem efektivnější reprodukce. Záro- dečné kmenové buňky jsou izolovány z druhů, které mají obecně horší reprodukční vlastnosti, a jsou transplantovány do příbuzných druhů s výhodnějšími reprodukčními charakteristikami. Příkladem je naše dlouholetá snaha o náhradní reprodukci vyzy velké pomocí jesetera malého nebo reprodukce plně homozygotního kapra pomocí náhradního rodiče karase. Předpokladem pro efektivní náhradní reprodukci je izolace, případně kultivace a zamrazování zárodečných bu- něk a sterilizace náhradního rodiče. Další aktivitou laboratoře je snaha o jaderný transfer ze somatické buňky do oocytu a injek- ce spermie do oocytu ryb. Přestože jsou obě metody obtížné a u ryb obecně velice málo úspěš- né, tak jsme na modelovém druhu jesetera malého dosáhli zajímavých výsledků a oba postupy mohou být do budoucna zamýšleny jako případný nástroj pro obnovu genetických zdrojů. V dalších experimentech jsme začali využívat recentní techniky CRISPR/Cas9 editace genomu, pomocí které zkoumáme funkce jednotlivých genů. Zaměřujeme se především na geny odpovědné za vývoj zárodečných buněk s následným využitím pro sterilizaci recipienta, ale ne- vyhýbáme se ani dalším oblastem výzkumu, jako například studium syntézy mastných nenasy- cených kyselin.

22 FROV JU

Nově se laboratoř začala zabývat studiem rozložení mateřské mRNA ve vajíčkách ryb a čas- ným vývojem embryí. Již na začátku tohoto výzkumu jsme zjistili, že jeseteří embrya představují unikátní model přechodu z holoblastického rýhování (jak známe např. u obojživelníků) na me- roblastické (typické např. pro kostnaté ryby). Kromě řešení otázek základního výzkumu se dlouhodobě snažíme vyvíjet nové přístupy v reprodukci ryb, včetně využití kryokonzervace zárodečných buněk za účelem zefektivnění managementu genových zdrojů ryb.

Transplantace spermatogonií kapra do břišní dutiny karase za účelem náhradní reprodukce (suspenze buněk je barvená trypanovou modří).

Zpracoval: doc. Ing. Martin Pšenička, Ph.D.

23 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

LABORATOŘ ENVIRONMENTÁLNÍ CHEMIE A BIOCHEMIE

prof. Ing. Tomáš Randák, Ph.D. M.Sc. Oksana Golovko, Ph.D. vedoucí laboratoře, vědecká pracovnice akademický pracovník [email protected] [email protected]

doc. Ing. Vladimír Žlábek, Ph.D. M.Sc. Viktoriia Burkina, Ph.D. zástupce vedoucího, vědecká pracovnice akademický pracovník [email protected] [email protected]

doc. Mgr. Roman Grabic, Ph.D. M.Sc. Sidika Sakalli, Ph.D. akademický pracovník doktorandka (do 9/2018), [email protected] vědecká pracovnice (10–12/2019)

MVDr. Jitka Kolářová Ing. Helena Švecová, Ph.D. vědecká pracovnice vědecká pracovnice [email protected] [email protected]

Ing. Jan Turek, Ph.D. RNDr. Andrea Vojs Staňová, Ph.D. akademický pracovník vědecká pracovnice [email protected] [email protected]

Ing., Bc. Kateřina Grabicová, Ph.D. M.Sc. Pavlo Fedorov, Ph.D. akademická pracovnice vědecký pracovník (do 12/2018) [email protected]

Ing. Daniel Červený, Ph.D. M.Sc. Pham Thai Giang vědecký pracovník doktorand (do 9/2018) [email protected]

M.Sc. Zhihua Li, Ph.D. Ing. Adam Bořík akademický pracovník (do 12/2018) doktorand [email protected]

M.Sc. Ganna Fedorova, Ph.D. M.Sc. Eugenia Sancho Santos akademická pracovnice doktorandka [email protected] [email protected]

24 FROV JU

Ing. Petra Nováková Ing. Marie Šandová doktorandka laborantka [email protected] [email protected]

M.Sc. Mladen Avramovič Ing. Jana Martynková doktorand laborantka (od 8/2018) [email protected] [email protected]

M.Sc. Tuyen Van Nguyen doktorand (od 11/2019) [email protected]

Hlavním cílem laboratoře je studovat ekologické a fyziologické dopady výskytu a působení širokého spektra různých environmentálních polutantů antropogenního původu ve vodním pro- středí. Základem našeho výzkumu je vývoj a aplikace maximálně efektivních postupů a technik pro odběr vzorků a stopovou analýzu různých složek vodního prostředí. Vysoce automatizované metody pozitivně ovlivňující rychlost analýz v kombinaci s pokročilými vyhodnocujícími softwary nadále pomáhají zvyšovat výkonnost laboratoře. Využití hmotnostní spektrometrie s vysokým rozlišením (HRMS) umožnilo rozvoj v oblasti detekce mikropolutantů a jejich degradačních pro- duktů v různých složkách životního prostředí. Distribuce mateřské sloučeniny a jejích metaboli- tů v různých tkáních spolu s biochemickou reakcí organizmu pomáhají komplexně objasnit problematiku chronické expozice znečišťujícím látkám. Dalším náročným, ale velmi perspektivním směrem výzkumu laboratoře je zjišťování osudu nových znečišťujících látek a jejich vlivu na ex- ponované organizmy v reálném prostředí s využitím širokospektrálních screeningových metod. Dále studujeme, jak efektivně nádrže rybničního typu, které se často používají k dočišťová- ní komunálních odpadních vod, odbourávají léčiva a další chemikálie, které ve vodě zůstanou i po procesu čištění v současných čistírenských technologiích. V průběhu dlouhodobých sledo- vání bylo zjištěno, že v tomto prostředí dochází ke snížení koncentrací významného množství cizorodých sloučenin ve vodě, nicméně některé z nich dále ve vodě a v sedimentu zůstávají. Tato skutečnost může být problematická s ohledem na potenciální využití sedimentů pocházejících z dočišťovacích nádrží v zemědělství – tzn. pro jejich aplikaci na zemědělskou půdu. Aktuální vědecké studie upozorňují, že se kontaminanty mohou ze sedimentů pomocí dešťových srážek uvolňovat a následně pronikat do půdy, podzemních vod a též do pěstovaných plodin. Laboratoř jako smluvní partner aktivně spolupracuje v českém a slovenském národním programu monitoringu kontaminace vodního prostředí a je smluvním partnerem i pro zahraniční firmy a agentury zabývající se environmentální problematikou. Ve spolupráci s privátním sektorem zkoumáme možnosti odstranění širokého spektra biologicky aktivních látek během procesů úpravy vody. Spolupracujeme také s institucemi a organizacemi zabývajícími se ochranou život- ního prostředí, posuzováním ekologických rizik a hodnocením kontaminace prostředí.

Zpracoval: prof. Ing. Tomáš Randák, Ph.D.

25 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

LABORATOŘ VODNÍ TOXIKOLOGIE A ICHTYOPATOLOGIE

dr hab. Ing. Josef Velíšek, Ph.D. Ing. Pavel Šauer, Ph.D. vedoucí laboratoře, akademický doktorand (do 3/2019), pracovník vědecký pracovník (od 4/2019) [email protected] [email protected]

doc. Ing. Hana Kocour Kroupová, M.Sc. Mehrak Mohammadi Ph.D. doktorandka (do 4/2019) zástupce vedoucího, akademická pracovnice [email protected] Ing. Olga Valentová M.Sc. Bernard Erasmus akademická pracovnice doktorand (od 6/2018) [email protected] [email protected]

MVDr. Eliška Zusková, Ph.D. M.Sc. Ali Asghar Baloch akademická pracovnice doktorand (od 9/2018) [email protected] [email protected]

MVDr. Veronika Piačková, Ph.D. Mgr. Aleš Pospíchal, Ph.D. akademická pracovnice externí doktorand (do 9/2019) [email protected]

Ing. Alžběta Stará, Ph.D. Ing. Dalibor Koutnik, Ph.D. akademická pracovnice externí doktorand (do 3/2019) [email protected]

Ing. Jana Máchová, Ph.D. Ing. Josef Příborský vědecká pracovnice externí doktorand [email protected] [email protected]

prof. MVDr. Zdeňka Svobodová, Ing. Jaroslava Lidová DrSc. externí doktorandka vědecká pracovnice [email protected] [email protected]

Dipl. Biol. Christoph Steinbach, Ing. Marie Šandová Ph.D. technička vědecký pracovník [email protected] [email protected]

M.Sc. Latifeh Chupani, Ph.D. Ilona Prokopová vědecká pracovnice technička [email protected] [email protected]

26 FROV JU

Laboratoř soustřeďuje odborníky z oblasti veterinárního lékařství, vodní toxikologie, hyd- rochemie a biochemie, kteří se zabývají základním a aplikovaným výzkumem, vysokoškolskou výukou a konzultační a poradenskou činností. Výzkumná činnost pracovníků laboratoře je za- měřena na tři hlavní oblasti. Tou první je studium vlivu nově se objevujících znečišťujících látek na vodní organizmy s důrazem na sledování chronických účinků jak jednotlivých látek, tak jejich směsí. Nedílnou částí tohoto výzkumu je vyhledávání nových modelových organizmů, které by mohly být využívány v testech toxicity i při biomonitoringu zátěže vodního prostředí cizorodými látkami. S komerční společností zabývající se technologickými úpravami vody je řešen projekt zaměřený na úsporu vody při sádkování ryb a s tím související snížení zátěže recipientů odpadní- mi vodami ze sádek. Třetí oblastí zájmu je prevence a léčba nemocí ryb, vývoj nových léčebných postupů v chovech ryb a ověřování jejich účinnosti i případných vedlejších účinků. Příkladem zajímavého a významného poznatku dosaženého v posledních letech je zmapo- vání výskytu syntetických progestinů ve vodním prostředí a s tím souvisejících hormonálních (progestagenních) aktivit na vybraných lokalitách v České republice. Významnou skupinu těchto látek představují progestiny (či progestageny), které jsou obsaženy například v hormonální antikoncepci, ale i v jiných hormonálních preparátech. Výzkum byl zaměřen na „rizikové“ lokality, ke kterým patří odtoky z čistíren komunálních odpadních vod a dále místa pod zaústěním vyčiš- těných odpadních vod, kde dochází k jejich naředění říční vodou. Díky tomuto výzkumu již dnes víme, že koncentrace sledovaných hormonů na odtoku z českých čistíren odpadních vod zatím nedosahují tak vysokých hodnot, jaké byly zaznamenány v jiných evropských či asijských stá- tech. Vzhledem k neustále narůstající spotřebě hormonálních preparátů a k jejich rozšiřujícímu se spektru je třeba i nadále věnovat této problematice náležitou pozornost. Kromě základního výzkumu zaměřeného na sledování účinků xenobiotik na vodní organizmy a prevence a léčby nemocí ryb se laboratoř podílí na sledování účinků pesticidů na necílové vod- ní organizmy a zaznamenává akutní úhyny ryb v České republice ve spolupráci s Ministerstvem zemědělství ČR. Vyvinuli jsme léčebné a technologické postupy zaměřené na minimalizaci ztrát způsobených různými patogeny. Tyto postupy jsou určeny pro chovatele ryb podle jejich indi- viduálních potřeb. Pracovníci laboratoře také spolupracují s policií, rybářskými svazy, obecními úřady a výzkumnými ústavy v České republice a zahraničí při řešení příčin havarijních úhynů ryb. Věříme, že také díky těmto aktivitám se podaří více zapojit veřejnost do problematiky ochrany vodních ekosystémů.

Fixace dekalcifikované tkáně voskem pomocí zalévací linky LEICA EG 1150 H.

Zpracoval: dr hab. Ing. Josef Velíšek, Ph.D.

27 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

GENETICKÉ RYBÁŘSKÉ CENTRUM

Ing. David Gela, Ph.D. Daniel Kvapil vedoucí centra technik (od 9/2018) [email protected] [email protected]

Bc. Martin Kahanec, DiS. Ing. Ondřej Palíšek technik technik [email protected] [email protected]

Ing. Milan Aldorf Jana Veselá technik (do 9/2019) uklízečka [email protected] [email protected]

Lukáš Vojík Bc. Petr Dobrovolný, DiS. technik provozní asistent (od 9/2018) [email protected] [email protected]

Kamil Kuneš technik (do 5/2018)

Pro Genetické rybářské centrum je jednou z hlavních dlouholetých činností šlechtitelský a testační program užitkovosti kapra obecného a lína obecného s návazností na uchovávání genetických zdrojů stávajících plemen a populací ryb dle Zákona o šlechtění, plemenitbě a evi- denci hospodářských zvířat. Příslušné dostatečně početné in situ populace genových zdrojů rozmnožované pomocí umělé skupinové reprodukce jsou udržované také formou ex situ, tj. v bance zamraženého spermatu. U kmenových hejn genetických zdrojů jsou pravidelně sledo- vány reprodukční parametry v kontrole užitkovosti ve vztahu k hromadné reprodukci, a tedy k uchování co nejširší genetické variability. Tato nejen finančně náročná činnost je dotačně pod- porována, a to na kmenových hejnech kapra obecného, lína obecného, sumce velkého, jesetera malého a vyzy velké. O vědeckých cílech, metodách a získaných výsledcích je referováno především na stránkách Laboratoře molekulární, buněčné a kvantitativní genetiky, Laboratoře fyziologie reprodukce a Laboratoře zárodečných buněk, pro které pracoviště GRC poskytuje funkční základnu. Prostory centra s vybavením jsou rovněž pravidelně využívány při terénních a blokových cvičení studentů FROV JU. Studenti zde pod odborným pedagogickým vedením provádí praktické experimenty, které potřebují k vypracování a ke zdárné obhajobě zadaných absolventských prací. Realizovány jsou i exkurze s odborným výkladem a ukázkami chovaných ryb. Od září 2018 pracoviště disponuje nově vybudovaným venkovním komplexem chovných ná- drží bez termoregulace vody, který je tvořen šesti menšími nádržemi vnějších rozměrů 7 x 4,5 m a jedné velké nádrže 15 x 4,5 m o jednotné hloubce 1,4 m. Bazény jsou určeny k celoročnímu odchovu jeseterovitých ryb a k předvýtěrové přípravě ryb generačních. Systém je možno napou- štět průsakovou nebo říční vodou. V případě výpadku dodávky elektrické energie je instalován dieselagregát s automatickým náběhem, který zajistí optimální podmínky pro obsádku ryb. Komerčně našim zákazníkům z rybářské praxe nabízíme a dodáváme z produkce naší rybí líhně váčkový plůdek kapra, lína a sumce. Jesetery lze na našem pracovišti objednávat od stadia oplozené jikry a rozkrmeného plůdku. Zpracoval: Ing. David Gela, Ph.D.

28 FROV JU

EXPERIMENTÁLNÍ RYBOCHOVNÉ PRACOVIŠTĚ A POKUSNICTVÍ

Ing. Pavel Lepič, Ph.D. Petra Martínková vedoucí pracoviště technička [email protected] [email protected]

Ing. Jiří Hajíček Pavel Svoboda zástupce vedoucího pracoviště technik [email protected] [email protected]

Ing. Andrea Lepičová Luboš Borovka odborná pracovnice technik (do 12/2018) [email protected]

Ing. Vítězslav Plička Petr Řezníček technik (od 3/2018) technik [email protected] [email protected]

Jiří Kasl, DiS. Eva Šimoníková technik uklízečka [email protected] [email protected]

Ing. Jitka Hamáčková technička (do 12/2019) [email protected]

Experimentální rybochovné pracoviště a pokusnictví slučuje komplex 50 experimentálních rybníčků o celkové rozloze téměř 7 ha, venkovní žlabovou odchovnu s 90 nádržemi různého typu a rybochovné objekty využívající jak průtočné, tak recirkulační systémy. Pracoviště disponuje také rozsáhlými laboratorními a výukovými prostory. Hlavním zaměřením pracoviště je realizace experimentů v poloprovozních podmínkách rybniční akvakultury, recirkulačních systémů nebo vzájemné kombinace obou systémů. Pracoviště je využíváno pracovníky a studenty jednotlivých laboratoří fakulty k realizaci experimentů zaměřených převážně na výzkum chovatelských tech- nologií v akvakultuře, přičemž značná pozornost je věnována především těmto oblastem: • intenzivní metody akvakultury včetně recirkulačních systémů, • reprodukce ryb včetně hormonální a environmentální stimulace, • odchov raných stadií hospodářských a ohrožených druhů ryb včetně optimalizace podmí- nek prostředí a výživy, • aplikovaná rybářská hydrobiologie, • potravní biologie ryb v rybnících i volných vodách, • působení rybožravých predátorů na rybochovných objektech, • biologie a monitoring původních i nepůvodních druhů raků.

29 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

Velká pozornost byla v průběhu několika posledních let věnována chovatelským technolo- giím zaměřeným na chov dravých (okoun říční, candát obecný) a říčních (parma říční, podoustev říční, ostroretka stěhovavá) druhů ryb v recirkulačních systémech. Také v oblasti záchranných chovů raků bylo na pracovišti realizováno mnoho experimentů, které přispěly k získání nových poznatků postupně zaváděných do praxe. Další z mnoha aktivit pracoviště jsou různá praktická cvičení studentů FROV JU a exkurze pro zájemce z řad široké veřejnosti. Vzhledem k prostoro- vým možnostem pro odchov různých druhů ryb se pracoviště stalo významným dodavatelem násadového materiálu zejména říčních druhů ryb pro jednotlivé místní organizace Českého ry- bářského svazu a jiné chovatele ryb nejen u nás, ale i v zahraničí.

Experimentální rybochovné pracoviště a pokusnictví.

Zpracoval: Ing. Pavel Lepič, Ph.D.

30 FROV JU

1.8. ÚAOV ÚSTAV AKVAKULTURY A OCHRANY VOD

Ústav akvakultury a ochrany vod (ÚAOV) v Českých Budějovicích je aplikačně orientovaný ústav, jenž se skládá ze 3 laboratoří, zpracovny ryb a prodejny rybích výrobků. Laboratoře se zabývají širokou paletou výzkumné, vzdělávací a poradenské činnosti v oblastech rybniční a intenzivní akvakultury, zpracování a kvality masa ryb, rybářství ve volných vodách, hydrobiologie a ochrany vod a dalších témat jako např. problematikou invazních druhů. Ve společné budově FROV JU a ZF JU v ulici Na Sádkách 1780 probíhá většina teoretické a praktické výuky bakalářských studijních oborů, v budově na Husově třídě 458/102 probíhá většina teoretické a praktické výuky magisterských studijních oborů. Součástí budovy na Husově třídě v Českých Budějovicích je zpracovna ryb a prodejna rybích výrobků Ryby pro zdraví. Prodejna byla v roce 2019 nově zrekonstruována a slouží zejména k propagaci a uplatnění kvalitních rybích výrobků a ryb produkovaných fakultou. V rámci projektu CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_017/0002614 „Výzkumná infrastruktura pro vzdě- lávací účely FROV JU“ byla v roce 2018 vybudována akvaponická hala sloužící pro výzkum a vývoj dlouhodobě udržitelných technologií produkce potravin s minimální spotřebou vody, energie a živin a minimální produkcí odpadních látek.

doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D. Ing. Ján Regenda, Ph.D. ředitel ústavu (do 2/2019) vedoucí praxí [email protected] [email protected]

Ing. Jan Kašpar Ing. Vítězslav Plička ředitel ústavu (od 3/2019) technik pro výuku (do 2/2018) [email protected] [email protected]

Petra Tesařová Elek Varga asistentka ředitele asistent pro provoz (od 4/2018) [email protected] [email protected]

Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Fakulta rybářství a ochrany vod, Ústav akvakultury a ochrany vod, Na Sádkách 1780, 370 05 České Budějovice, tel.: +420 387 774 654, e-mail: [email protected]

31 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

Erik Werner Ing. Jana Kopecká technik (od 9/2019) asistentka pro provoz (8/2018 – [email protected] 7/2019) [email protected]

Josef Ertl, DiS. Mgr. Hana Ash technik (od 12/2019) lektorka (anglický jazyk) [email protected] [email protected]

Ing. Kateřina Zánová Mgr. Monika Peka Kolafová asistentka pro provoz lektorka (anglický jazyk) (od 5–6/2018) [email protected]

Vybrané projekty

z 17-09310S Rybníky jako modely pro studium diversity a dynamiky planktonu hypetrofních mělkých jezer (2017–2019, odpovědný řešitel za FROV JU doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D.) z NAZV – QK1810296 Alternativní komponenty a inovativní postupy ve výživě ryb (2018–2022, odpovědný řešitel Ing. Vlastimil Stejskal, Ph.D.) z Program aplikovaného výzkumu a vývoje národní a kulturní identity (NAKI II DG18P02OVV057) – Kulturní tradice českého rybářství ve světle jejího využití v cestovním ruchu a krajinotvorbě (2018–2022, odpovědný řešitel za FROV JU doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D.)

Vybrané publikace

Shah, B.R., Mráz, J., 2019. Advances in nanotechnology for sustainable aquaculture and fisheries. Reviews in Aquaculture, doi: 10.1111/raq.12356 (IF 2018 = 7,190) Vanina, T., Gebauer, R., Stejskal, V., Toomey, L., Rutegwa, M., Kouřil, J., Bláha, M., Lecocq, T., 2019. Genetic and aquaculture performance differentiation among wild allopatric populations of European perch (Perci- dae, Perca fluviatilis). Aquaculture 503: 139–145. (IF 2018 = 3,022) Gebauer, R., Veselý, L., Vanina, T., Buřič, M., Kouba, A., Drozd, B., 2019. Prediction of ecological impact of two alien gobiids in habitat structures of differing complexity. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences 76: 1954–1961. (IF 2018 = 2,567) Rutegwa, M., Gebauer, R., Vesely, L., Regenda, J., Strunecky, O., Hejzlar, J., Drozd B., 2019. Diffusive methane emissions from temperate semi-intensive carp ponds. Aquaculture Environment Interactions 11: 19–30. (IF 2018 = 2,380)

32 FROV JU

Letecký snímek budovy Ústavu akvakultury a ochrany vod FROV JU na Husově třídě v Českých Budě- jovicích.

Letecký snímek společné budovy FROV JU A ZF JU Na Sádkách v Českých Budějovicích.

33 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

LABORATOŘ APLIKOVANÉ HYDROBIOLOGIE Laboratoř zanikla ke dni 31. 12. 2019. Její členové jsou rozmístěni do jiných laboratořích FROV JU.

RNDr. Bořek Drozd, Ph.D. Ing. David Hlaváč, Ph.D. vedoucí laboratoře, vědecký pracovník akademický pracovník [email protected] [email protected]

Ing. Ján Regenda, Ph.D. Ing. Radek Gebauer, Ph.D. akademický pracovník, doktorand (do 9/2018), zástupce vedoucího, vědecký pracovník (od 10/2018) vedoucí praxí [email protected] [email protected]

doc. RNDr. Zdeněk Adámek, CSc. Ing. Kateřina Francová akademický pracovník (do 2/2019) doktorandka (do 9/2019) [email protected]

Mgr. Otakar Strunecký, Ph.D. M.Sc. Marcellin Rutegwa akademický pracovník doktorand [email protected] [email protected]

Ing. Jan Potužák, Ph.D. M.Sc. Anna Pavlovna Ivanova vědecký pracovník doktorandka [email protected] [email protected]

RNDr. Jindřich Duras, Ph.D. Ing. Pavel Franta vědecký pracovník doktorand (od 2/2018) [email protected] [email protected]

Ing. Pavel Hartman, CSc. Ing. Martin Šindler vědecký pracovník externí doktorand (od 10/2018) [email protected] [email protected]

34 FROV JU

Nosným programem laboratoře je výzkum rybničních ekosystémů. Zvláštní zřetel je kladen na vliv chovu ryb a jeho technologií na tyto ekosystémy a kvalitu okolního vodního prostředí s cílem nalézt metody minimalizace negativních vlivů chovu ryb v rybnících na životní prostředí. Dále je studován metabolizmus významných makronutrientů a uvolňování vybraných skleníko- vých plynů z rybničního dna. Ve spolupráci s rybníkářskou a vodohospodářskou praxí jsou také řešeny otázky kvality vypouštěné vody a eliminace výskytu nežádoucích „plevelných“ ryb. Sou- částí výzkumu je také monitoring vodních makrofyt s ohledem na intenzitu chovu ryb. Druhým klíčovým výzkumným zaměřením laboratoře je studium biologických invazí sladkovodních eko- systémů nepůvodními druhy hydrobiontů, se zvláštním zřetelem na ryby. Výzkum probíhá jak v terénních, tak i laboratorních podmínkách. Příkladem významného výzkumu jsou tři patenty na zařízení zlepšující kvalitu vody. Dalším zajímavým výstupem je poznání potravní a habitatové preference a intenzity příjmu potravy u některých nepůvodních druhů hlaváčovitých ryb, a to v interakci jak s původními, tak s nepů- vodními druhy. V posledních letech se podařilo otestovat technologii budování dočasných barier z přírod- ních materiálů ve stoce pod rybníky během výlovů. Díky tomu opatření je dosahováno zlep-

šení kvality odtékající vody (z hlediska NL105, TP, TOC) o 60–90 %. Zachycené sedimenty spolu s bariérami jsou následně odtěženy a opětovně využity k živinovému obohacení zemědělských půd. Členové laboratoře se také podílí na objasnění dopadu nepůvodních druhů akvatické fauny na sladkovodní ekosystémy a vývoji aplikace pro včasnou detekci invazí v těchto ekosystémech. Pracovníci laboratoře se rovněž snaží aktivně popularizovat výsledky své práce pro širokou veřej- nost a podílí se na řadě prezentačních a školicích akcích pro širokou veřejnost.

Ichtyologický monitoring na Labi v Ústí nad Labem zaměřený na potenciální šíření hlaváče černoústé- ho (Neogobius melanostomus) z řeky Labe do jejích přítoků.

Zpracoval: RNDr. Bořek Drozd, Ph.D.

35 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

LABORATOŘ ŘÍZENÉ REPRODUKCE A INTENZIVNÍHO CHOVU RYB

Ing. Vlastimil Stejskal, Ph.D. M.Sc. Tran Quang Hung vedoucí laboratoře, doktorand (od 9/2018) akademický pracovník [email protected] [email protected]

Mgr. Peter Podhorec, Ph.D. M.Sc. Mahyar Zare akademický pracovník, zástupce doktorand (od 11/2018) vedoucího [email protected] [email protected]

prof. Ing. Jan Kouřil, Ph.D. M.Sc. Katsiaryna Lundová (Novi- akademický pracovník kava) [email protected] externí doktorandka (od 6/2018) [email protected]

Mgr. Tomáš Korytář, Ph.D. Ing. Pavel Šablatura vědecký pracovník technik [email protected] [email protected]

Ing. Markéta Prokešová, Ph.D. Ing. Jan Matoušek vědecká pracovnice technik [email protected] [email protected]

Ing. Roman Šebesta, Ph.D. Bc. Jan Dofek doktorand (do 12/2018) technik (od 1/2018) [email protected]

M.Sc. Tatyana Gebauer (Vanina), B.Sc. Tram Nguyen Thi Ph.D. technička (od 12/2019) doktorandka (do 9/2019), [email protected] vědecká pracovnice (od 10/2019) [email protected]

Ing. Jindřiška Knowles (Matějková) doktorandka (do 12/2019)

Laboratoř se věnuje optimalizaci a vývoji nových metod umělé reprodukce u hospodářsky významných konzumních a okrasných druhů ryb. Výzkumné aktivity také zahrnují vývoj nových metod umělé reprodukce u druhů s nízkou nebo žádnou odezvou na běžné hormonálním ošet- ření. V současné době je jedním z primárních cílů vývoj účinných preparátů na bázi mikročástic kopolymeru kyseliny mléčné a glykolové schopných udržet terapeuticky efektivní hladinu lutei- nizačního hormonu bez nutnosti opakovaného injekčního podání.

36 FROV JU

Dalším směrem výzkumu je technologie intenzivního chovu ryb se zvláštním zřetelem na vy- užití recirkulačních systémů (RAS) pro chov širokého druhového spektra ryb. Oblast zájmu zahrnuje studium metabolizmu (spotřeby kyslíku a exkrece metabolitů), hodnocení rychlosti růstu, hmotnostní heterogenity, přežití, morfometrických změn, efektivity využití krmiva, fitness cho- vaných ryb a jejich chování. Studie jsou prováděny především v kontextu různých abiotických faktorů. Cílem experimentů je testovat krmiva s optimální úrovní biologicky aktivních látek, rostlinných produktů (extraktů), vedlejších produktů z potravinářství, hmyzích mouček apod. pro zajištění dostatečného růstu, přežití, a dobrého fyziologického a imunologického stavu cho- vaných ryb. Experimenty zahrnující tržní velikosti ryb jsou vyhodnocovány včetně vlivu na kvalitu finálního produktu. V neposlední řadě se pracovníci laboratoře soustřeďují na základní i apliko- vaný výzkum v komparativní imunologii. Důraz je kladen zejména na studium vlivu biotických a abiotických faktorů na imunitní systém ryb chovaných v RAS a také na studium imunomodu- lačních krmiv pro prevenci onemocnění. Příkladem významného poznatku je studie, ze které vyplývá, že zootechnické vlastnosti se mohou výrazně lišit mezi různými geograficky odlišnými populacemi okouna říčního při jejich chovu v kontrolovaných podmínkách. Výběr vhodných populací okouna říčního s následnou apli- kací biotechnologických metod tak může v blízké budoucnosti výrazně zvýšit produkci tohoto druhu. Kromě důležitých poznatků aplikovaného výzkumu a intenzivní akvakultury včetně reprodukce ryb se laboratoř zapojuje do poradenství v oblasti intenzivního chovu ryb, plánování RAS a odstranění reprodukčních dysfunkcí významných druhů ryb. V rámci smluvního výzkumu do- chází ke spolupráci s výrobci krmiv a testování produkční účinnosti kompletních krmných směsí. V rámci kurzů a workshopů se laboratoř snaží být aktivní ve zvyšování povědomí o možnostech a inovacích v rámci reprodukce a intenzivního chovu ryb.

Hormonální stimulace generačních štik obecných (vlevo nahoře), variabilita ve zbarvení okounů říč- ních (vpravo nahoře) a protokol pro vyhodnocení imunitní reakce ryb.

Zpracoval: Ing. Vlastimil Stejskal, Ph.D.

37 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

LABORATOŘ VÝŽIVY

doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D. Ing. Zuzana Bláhová vedoucí laboratoře, akademický doktorandka (do 5/2018) pracovník [email protected] [email protected]

Mgr. Zuzana Linhartová, Ph.D. M.Sc. Koushik Roy akademická pracovnice doktorand (od 2/2018) [email protected] [email protected]

Ing. Petr Dvořák, Ph.D. M.Sc. Ruoyi Hao akademický pracovník doktorandka (od 5/2018) [email protected] [email protected]

Ing. Radek Gebauer, Ph.D. M.Sc. Folorunso Ewumi Azeez vědecký pracovník (od 1/2019) doktorand (od 6/2019) [email protected] [email protected]

M.Sc. Bakht Ramin Shah, Ph.D. M.Sc. Hui Jia vědecký pracovník (od 8/2018) doktorandka (od 11/2019) [email protected] [email protected]

RNDr. Aleš Tomčala, Ph.D. M.Sc. Dubbala Prshanthi Divya Vani vědecký pracovník (od 4/2019) doktorandka (1–11/2018) [email protected]

M.Sc. Jinfeng Pan, Ph.D. Ing. Roman Lunda vědecký pracovník externí doktorand [email protected] [email protected]

RNDr. Jan Kolek Ing. Kristýna Havrdová vědecký pracovník (do 8/2018) technička (do 10/2018) [email protected]

M.Sc. Nima Hematyar, Ph.D. Ing. Zdeňka Machová doktorand (do 9/2019) technička (od 6/2018) [email protected] [email protected]

M.Sc. Sarvenaz Khalili Bc. Mario Prečanica doktorandka (do 7/2019) technik (od 11/2018) [email protected]

38 FROV JU

Hlavním cílem laboratoře je komplexní výzkum výživy a kvality masa ryb a technologií pro dlouhodobě udržitelný rozvoj akvakultury. V oblastí výživy ryb se laboratoř zaměřuje na výzkum alternativních krmiv pro náhradu rybí moučky a oleje. Výzkum je cílen na zvyšování udržitel- nosti akvakultury a zvyšování/udržení nutriční kvality rybího masa pro konzumenty. Moderním směrem výzkumu je studium vlivu biologicky aktivních látek obsažených v rostlinných krmivech na metabolizmus ryb a kvalitu jejich masa. V oblasti kvality rybího masa se laboratoř zabývá faktory ovlivňující kvalitu masa v průběhu celého produkčního řetězce, tzv. od rybníka po vid- ličku. Laboratoř se také zabývá zpracováním ryb a rybích výrobků, především pak jejich kvalitou a stabilitou v průběhu skladování. Vyvíjí rybí výrobky s bioaktivními látkami využívající hůře ob- chodovatelné části ryb či vedlejší produkty. Neméně důležité je i hodnocení vlivu kuchyňských úprav na výslednou kvalitu rybích výrobků. Laboratoř se dále zabývá technologiemi pro efektivní a dlouhodobě udržitelné využívání vody a živin v akvakultuře. Rozvíjí využití odpadní vody a živin z intenzivního chovu ryb např. pro hydroponickou produkci rostlin (akvaponie), mikrobiálního proteinu (bioflok) či kvalitního vermikompostu a žížal. Příkladem zajímavého a významného výzkumu laboratoře je vývoj patentované technologie omega-3 kapra. Pomocí speciálního krmiva na bázi řepkových výlisků a lněného semínka a úprav v technologii chovu je dosahováno vysokého množství omega-3 mastných kyselin v mase kapra. Společně s Institutem klinické a experimentální medicíny byl ověřen pozitivní vliv tohoto masa při léčbě a prevenci kardiovaskulárních chorob. Laboratoř zvyšuje udržitelnost akvakultury a kvalitu masa ryb a rybích produktů pro konzumenty. Naším cílem je zlepšení ekologické udržitelnosti například pomocí snížení objemu odpadní vody, navrhování krmiv se sníženým vyplavování živin do vody a předcházení eutrofizaci vod. Snažíme se zvýšit povědomí společnosti o nutriční hodnotě ryb a rybích výrobků a o tom, jak s rybou zacházet během celého výrobního řetězce. K dosažení těchto cílů úzce spolupracujeme s producenty ryb, zpracovnami a zdravotními institucemi a výsledky prezentujeme široké odborné i laické veřejnosti.

Nově vybudovaná výzkumná akvaponická hala v univerzitním kampusu.

Zpracoval: doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D.

39 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

PRODEJNA RYB A RYBÍCH VÝROBKŮ

Ing. Jan Kašpar Bc. Josef Vobr vedoucí pracoviště zástupce vedoucího pro kamennou [email protected] prodejnu [email protected]

Ing. Eduard Levý Bc. Pavlína Gápová zástupce vedoucího pro gastro- zástupce vedoucího pro provozní nomii administrativu (od 3/2019) [email protected] [email protected]

Hlavním cílem Prodejny ryb a rybích výrobků je vzdělávání a propagace v oblasti zpracování ryb a přípravy rybích výrobků, inovace technologických postupů se zaměřením na minimalizaci použití konzervačních látek a využití přirozených antioxidantů a zdraví prospěšných látek při přípravě rybích pokrmů. Vzdělávání studentů nejen Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích, ale i široké veřejnosti v oblasti zpracování ryb se setkává s velmi pozitivním ohlasem především díky důrazu na praktickou výuku samotných postupů a finanční podpoře OP Rybářství. Osvojení základních dovedností umožňuje široké veřejnosti vlastní zpracování ryb, a tedy jejich častější zařazení na běžný jídelníček. Mimo propagaci a vzdělání je věnována pozornost i historii rybí gastronomie. Ve spolupráci s externími partnery probíhají činnosti spojené s mapováním a zá- znamem staročeských jídel a jejich uplatnění v běžném životě, např. spojení s církevními svátky. Prodejna ryb a rybích výrobků dále spolupracuje na realizacích projektů zaměřených na stano- vení výtěžnosti ryb a posuzování organoleptických vlastností rybí svaloviny jako výstupu inovací produkčních technologií a na praktických inovacích v rámci sledovatelnosti potravin. Pro širokou veřejnost je mimo kurzů k dispozici prodejna rybích výrobků a specialit z vlastní produkce, stej- ně jako možnost objednávky rybího rautu. Nízká spotřeba sladkovodních ryb a ryb obecně je z různých důvodů dlouhodobým problé- mem nejen v České republice. Jsme přesvědčeni, že konstruktivním předáváním teoretických i praktických znalostí, seznámením veřejnosti s historií rybích pokrmů a přizpůsobením složení výrobků modernímu zdravému životnímu stylu lze tento deficit snížit. Naše prostory jsou vyba- veny veškerým nezbytným vybavením pro úspěšnou výuku a realizaci vědecko-výzkumné čin- nosti. Věříme, že zapojením studentů a široké veřejnosti do problematiky zpracování ryb a rybí gastronomie odstraníme nebo zmírníme dopady dlouhodobých předsudků a rybí maso najde své pevné místo v jídelníčku většiny z nás.

Země Živitelka 2018.

Zpracoval: Ing. Jan Kašpar

40 FROV JU

1.9. ÚKS ÚSTAV KOMPLEXNÍCH SYSTÉMŮ

Ústav komplexních systémů v Nových Hradech vznikl v roce 2012. Hlavním cílem ústavu je základní a aplikovaný výzkum v oblasti rybářství a světelné mikroskopie. Ústav se zaměřuje na využívání poznatků z oblasti fyziky, chemie, kybernetiky a technických řešení v biologii. Tyto poznatky se uplatňují především v návrhu systémů pro monitorování chování ryb a raků v závis- losti na přítomnosti znečišťujících látek či systémů pro optickou analýzu kvality vody. Jsou vyu- žívány moderní snímací přístroje pro automatizovanou analýzu změn zbarvení ryb pro detekci diet či satelitní snímky pro určení kvalitativních parametrů vody v rybnících a nádržích. Pomocí simulačních nástrojů je odhadováno proudění vody v nádržích či dostupnost potravy v recirku- lačních systémech. Tento komplex metod sleduje moderní cíl rybářství, kterým je tzv. přesný chov ryb. Aplikací metod informační teorie a počítačového vidění ústav vytváří nová technická řešení v oblasti světelné mikroskopie, která vedou k super rozlišeným obrazům, ze kterých je možné automaticky detekovat buňky a parametrizovat jejich chování například pro analýzu bio- kompatibility nových materiálů. Ústav spolupracuje na mezinárodních projektech fakulty a má vlastní spolupráce především v Norsku a Rakousku. Ústav také implementuje řešení pro management dat a otevřený přístup k datům a snaží se o popularizaci vědy prostřednictvím letních škol.

Ing. Petr Císař, Ph.D. Ing. Markéta Mlčáková ředitel ústavu asistentka ředitele (do 8/2018) [email protected] [email protected]

prof. RNDr. Dalibor Štys, CSc. Ing. Svatava Trnavská zástupce ředitele ústavu asistentka ředitele (od 9/2018) [email protected] [email protected]

Michal Macho, DiS. IT pracovník [email protected]

Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Fakulta rybářství a ochrany vod, Ústav komplex- ních systémů, Zámek 136, 373 33 Nové Hrady, tel.: +420 387 773 801 e-mail: [email protected]

41 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

Vybrané projekty

z AQUAEXCEL 2020 – 652831 Aquaculture infrastructures for excellence in European fish research (2015– 2020, INRA, odpovědný řešitel za FROV JU prof. Ing. Otomar Linhart, DrSc.) z INTERREG V-A Rakousko – Česká republika – Kompetenzzentrum MechanoBiologie in Regenerativer Medizin ATCZ133 – Kompetenzzentrum MechanoBiologie (2017–2019, odpovědný řešitel prof. RNDr. Dalibor Štys, CSc.) z NAZV – QK1920102 Automatizace a objektivizace monitoringu rybožravých predátorů (2019–2021, odpovědný řešitel Ing. Petr Císař, Ph.D.)

Vybrané publikace

Císař, P., Saberioon, M., Kozák, P., Pautsina, A., 2018. Fully contactless system for crayfish heartbeat monitoring: Undisturbed crayfish as bio-indicator. Sensors and Actuators B: Chemical 255: 29−34. (IF 2017 = 5,667) Steinbach, C., Císař, P., Šauer, P., Klicnarová, J., Schmidt-Posthaus, H., Golovko, O., Kocour Kroupová, H., 2019. Synthetic progestin etonogestrel negatively affects mating behavior and reproduction in Endler‘s guppies (Poecilia wingei). Science of the Total Environment 663: 206–215. (IF 2018 = 5,589) Kindermann, S., Papáček, Š., 2019. Optimization of the shape (and topology) of the initial conditions for diffusion parameter identification. Computers and Mathematics Applications 77: 3102–3116. (IF 2018 = 2,811) Saberioon, M., Císař, P., Labbé, L., Souček, P., Pelisser, P., Kerneis, T., 2018. Comparative performance analysis of support vector machine, random forest, logistic regression and k-nearest neighbours in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) classification using image-based features. Sensors 18: 1027. (IF 2017 = 2,475) Saberioon, M., Císař, P., 2018. Automated within tank fish mass estimation using infrared reflection system. Computers and Electronics in Agriculture 150: 484–492. (IF 2017 = 2,427)

Letecký snímek Ústavu komplexních systémů FROV JU v Nových Hradech.

42 FROV JU

LABORATOŘ EXPERIMENTÁLNÍCH KOMPLEXNÍCH SYSTÉMŮ

prof. RNDr. Dalibor Štys, CSc. M.Sc. Daria Malakhova vedoucí laboratoře, akademický doktorandka pracovník [email protected]

Ing. Štěpán Papáček Ph.D. M.Sc. Anushree Bachhar zástupce vedoucího, akademický doktorandka pracovník [email protected] [email protected]

Mgr. Jiří Jablonský, Ph.D. Šárka Beranová akademický pracovník laborantka [email protected] [email protected]

Ing. Bc. Renata Štysová Rychtári- Pavlína Tláskalová ková, Ph.D. laborantka akademická pracovnice [email protected] [email protected]

M.Sc. Ganna Platonova Ing. Jan Novák doktorandka technik [email protected] [email protected]

M.Sc. Kirill Lonhus Vladimír Kotal doktorand technik (do 1/2019) [email protected] [email protected]

M.Sc. Ali Ghaznavi doktorand (od 3/2019) [email protected]

Hlavním cílem laboratoře je vývoj experimentálních zařízení pro studium komplexních sys- témů, jako jsou živé buňky (lidské, savčí i jiné) a společenstva organizmů, zejména ryb a lidí. Při zpracování dat pak využíváme i nové teoretické přístupy, přičemž se nám daří i otevírat matema- ticky zcela nové cesty, jako jsou nelineární diskrétní systémy se šumem, entropie zohledňující okolí objektu. Naši pracovníci se zabývají též fluidní dynamikou a metabolickým modelováním sinic. Zapojujeme se rovněž do výuky v základních kurzech bakalářského studia. Součástí laboratoře je pracoviště tkáňových kultur, které slouží odborníkům z oborů bio- medicínské technologie. Mezinárodním projektem zaměřeným na živé buňky je česko-rakouské Kompetenční centrum pro mechanobiologii. Laboratoř zastupuje Jihočeskou univerzitu v Čes- kém optickém klastru, kde spolupracuje s řadou firem z oblasti optiky a jemné mechaniky. Příkladem zajímavého výsledku je nový mikroskop NanoTruth (na obr. str. 44, vlevo), kte- rý v mnoha technických detailech překonává všechny dosavadní optické mikroskopy. Zatímco

43 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

optické prvky a optická dráha jsou standardní, pohyb stolku, který je z důvodů hmotnosti a tu- hosti vyroben z uhlíkového kompozitního materiálu, je s krokem 4±nm. Digitální kamera má čip o rozlišení 47 Mpx při velikosti 36 x 25 mm, a umožňuje tak velmi přesnou lokalizaci objektů za zachování velkého zorného pole. Mikroskop je řízen nejnovějším mikro-superpočítačem Jet- son Xavier firmy Nvidia a umožňuje sledování živých buněk ve třech rozměrech v čase. Na vývoji mikroskopu jsme spolupracovali s firmami Optax (Praha), Image Code (Brloh) a Synchronics Emgineering (Heidenreichstein). Mikroskop NanoTruth umožňuje získávat unikátní výsledky aplikovatelné v medicínské dia- gnostice i výzkumu, vývoji nanostrukturovaných materiálů i v základním výzkumu v buněčné biologii. Dalším zajímavým výsledkem je analýza dat z přístroje 5iD viewer, který umožňuje objektiv- ně analyzovat hejnové chování. Software pro zpracování umožňuje identifikaci jednotlivců, čímž je zajištěna nulová propagace chyb. Žádné jiné podobné zařízení neumožňuje analýzu chování až na úroveň hierarchie jedinců v hejnu. 5iD viewer tak dosahuje větší citlivosti, důvěryhodnosti dané paralelními měřeními a specificity s mnohem nižšími náklady, než je tomu u dosavadních monitorovacích řešení. Některé metody analýzy vyvinuté pro 5iD viewer jsou používány i pro analýzy chování lidí, kde spolupracujeme s jedním z největších světových správců budov, firmou Cushman and Wakefield.

Mikroskop Nanotruth (vlevo) a zařízení 5iD viewer (vpravo).

Zpracoval: prof. RNDr. Dalibor Štys, CSc.

44 FROV JU

LABORATOŘ ZPRACOVÁNÍ SIGNÁLU A OBRAZU

Ing. Jan Urban, Ph.D. M.Sc. Dinara Bekkozhayeva vedoucí laboratoře, akademický doktorandka pracovník [email protected] [email protected]

Ing. Petr Císař, Ph.D. M.Sc. Oleksandr Movchan zástupce vedoucího, akademický doktorand (od 5/2018) pracovník [email protected] [email protected]

M.Sc. Aliaksandr Pautsina, Ph.D M.Sc. Hassan Nazari vědecký pracovník doktorand (od 11/2018) [email protected] [email protected]

M.Sc. Mohammadmehdi M.Sc. Oleksandr Mashchenko Saberioon, Ph.D. doktorand (od 6/2019) vědecký pracovník [email protected] [email protected]

Mgr. Pavla Urbanová Ing. Pavel Souček doktorandka technik [email protected] [email protected]

M.Sc. Vladyslav Bozhynov Antonín Bárta doktorand technik (do 3/2019) [email protected]

Činnost laboratoře je zaměřena na vývoj a implementaci automatických řešení pro sledování a hodnocení stavu ryb, raků a prostředí v intenzivní akvakultuře s využitím znalostí moderních metod biofyziky, kybernetiky a umělé inteligence. Naším cílem je zjednodušit akvizici dat bě- hem biologických experimentů i následné zpracování, analýzu a vytěžení informace. Využíváme široké spektrum softwarových i hardwarových prostředků, které z větší části sami navrhujeme, sestavujeme i programujeme. Hlavními oblastmi využití jsou úlohy biomonitoringu, biometriky, kolorimetrie, akvafotomiky a multispektrální analýzy. Sledování chování rybího hejna, identifikace jednotlivců, parametrizace vybarvení, třídění do skupin a korelace s kvalitou vody jsou typické otázky, kterými se laboratoř zabývá od úrovně přesné a správné definice problému, matematic- ké podmíněnosti a návrhu experimentu, přes testování senzoriky, mikroelektroniky, konstrukci měřicího systému a kalibraci, po statistické zpracování dat, algoritmizaci, modelování a databázi protokolů měření. Získané poznatky mají sloužit například k předvídání abnormálních situací, jako jsou znečištění, biologická kontaminace, výskyt nákazy, nedostatek kyslíku, deficient nut- rientů apod. Dalšími příklady použití výstupů laboratoře jsou inteligentní akvakultura, dálkové sledování a automatizace řízení. Laboratoř se vedle aplikovaného zabývá rovněž základním vý- zkumem teorie měření v mikroskopii a v hmotnostní spektrometrii. Podílí se na výuce a jejím zkvalitňování, vede doktorandy tří fakult.

45 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

Příkladem výstupů výzkumu a vývoje laboratoře jsou software pro stanovení chlorofylu ve vodě z dat ESA satelitů Sentinel či mikropočítačem řízená fotokomora pro analýzu vybarvení ryb ve viditelné i blízké infračervené oblasti. Automatizace, umělá inteligence a internet věcí jsou klíčové oblasti Průmyslu 4.0, trend proniká i do odvětví rybářství a ochrany vod. Zdokonalování měřicích principů, postupů, zjed- nodušování obsluhy, údržby, online přístup a sofistikované řízení jsou nezbytné předpoklady k zachování podmínek života a zdraví zvířat před negativními činiteli, zajištění šetrného hos- podaření s vodou, ekonomické a ekologické udržitelnosti. Výchovou studentů a popularizací činnosti laboratoř přispívá k rozšíření znalostí problematiky v akademické, komerční, i laické sféře. Laboratoř spolupracuje v rámci mezinárodního sdružení výzkumných zařízení a podílí se na organizaci mezinárodní bioinformatické konference.

Aplikace RemoteGuard, vlevo výběr lokality na mapě, vpravo analýza příslušného satelitního snímku (volitelné datum).

Zpracoval: Ing. Jan Urban, Ph.D.

46 FROV JU

1.10. CENAKVA JIHOČESKÉ VÝZKUMNÉ CENTRUM AKVAKULTURY A BIODIVERZITY HYDROCENÓZ

Jihočeské výzkumné centrum akvakultury a biodiverzity hydrocenóz (CENAKVA) vzniklo v roce 2010 za podpory Operačního programu Výzkum a vývoj pro inovace (OP VaVpI) a ná- sledně Národního programu udržitelnosti (NPU I) na půdorysu Fakulty rybářství a ochrany vod a Biofyzikálního ústavu Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích.

Hlavním vědeckým cílem centra je plně porozumět probíhajícím procesům ve sladkovodních ekosystémech a jejich celospolečenské závažnosti z hlediska zachování biodiverzity, ochrany vodního prostředí a ochrany vodních zdrojů pro život a činnost člověka.

CENAKVA je jedinou velkou výzkumnou infrastrukturou (VVI) v ČR zabývající se globálně procesy ve sladkovodních ekosystémech, koloběhem látek ve vodě, včetně sledování nových polutantů v životním prostředí. Unikátní rybniční, experimentální a vědecké zázemí spolu s úz- kými vazbami na rybářskou veřejnost v ČR, Evropě a ve světě, které CENAKVA má, vytváří jedineč- ný celek, který je schopen plánovat a ověřovat budoucí návrhy úprav rybářského hospodaření s vodními zdroji, vzhledem k změnám klimatu v ČR a Evropě. V budoucnu nebude hlavním úko- lem rybářů produkce ryb, ale udržení kvalitní vody v kvalitní krajině s vytvářením regionálního klimatu omezující sucho a záplavy. Výzkumné zaměření centra CENAKVA je soustředěno do čtyř stěžejních vědeckých multidisciplinárních výzkumných programů (VP). Tyto čtyři strategické programy představují mezinárodně uznávaný základní, aplikovaný i cílený výzkum se zaměřením na vodu, biodiverzitu, vodní ekologii a akvakulturu. Naším dlouhodobým strategickým cílem je rovněž přizpůsobit aktivity v rámci centra s ohledem na minimalizaci produkce uhlíku.

Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeské vý- zkumné centrum akvakultury a biodiverzity hydrocenóz, Zátiší 728/II, 389 25 Vodňany

4747 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

KLÍČOVÉ MILNÍKY

2010 – vznik centra (dotace z OP VaVpI), 2012 – plné přístrojové vybavení a kolaudace tří nově vybudovaných či rekonstruovaných budov, 2013 – zahájení plného provozu centra a úspěšné mezinárodní evaluační řízení projektu, 2014 – získání podpory z Národního programu udržitelnosti (129 mil. Kč do roku 2018), 2015 – ustanovení poradních a evaluačních orgánů (Kontrolní rada centra CENAKVA a Meziná- rodní rada FROV JU a centra CENAKVA), 2017 – změna struktury centra CENAKVA – vytvoření čtyř nových výzkumných programů namís- to původních šesti; 2018 – úspěšné ukončení a evaluace projektu NPU I, 2019 – úspěšná mezinárodní evaluace a zařazení centra na Mapu velkých infrastruktur ČR, 2019 – získání účelové podpory na provoz velké výzkumné infrastruktury CENAKVA (69 mil. Kč do roku 2022), 2019 – vytvoření sdílené infrastruktury DANUBIUS-CZ ve spolupráci s centrem CzechGlobe ori- entované na environmentální výzkum v celoevropském kontextu v budoucím DANUBIUS- ERIC od roku 2020–2021.

prof. Ing. Otomar Linhart, DrSc. Ing. Martin Vlček ředitel centra (do 31. 12. 2019) manažer centra [email protected] [email protected]

prof. Ing. Pavel Kozák, Ph.D. Ing. Michal Hojdekr, MBA zástupce ředitele centra, manažer centra ředitel centra (od 1. 1. 2020) [email protected] [email protected]

POSLÁNÍ

Posláním centra CENAKVA je na základě rostoucího know-how řešitelského týmu, jeho in- strumentálního a experimentálního zázemí a intenzivní spolupráce s výzkumnou i aplikační sfé- rou, včetně státní správy v ČR i ve světě významně přispět k: • poznání v oblasti sladkovodní akvakultury a ochrany vod, • zlepšení kvality vody a vodního prostředí, • uchování biodiverzity, • rozvoji sladkovodní akvakultury pro maximální produkci kvalitních potravin s minimální spotřebou vody, energie a minimální produkcí odpadních látek.

Role centra CENAKVA jako velké výzkumné infrastruktury (VVI) spočívá taktéž v poskytová- ní otevřeného přístupu k jejím jedinečným zařízením, expertízám a souvisejícím službám. VVI CENAKVA má charakter strategické a dlouhodobé investice do VaV učiněné vládou ČR na návrh Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy.

48 FROV JU

STRATEGIE

Prostřednictvím centra výzkumu CENAKVA se statutem velké výzkumné infrastruktury s bu- doucí účastí v DANUBIUS-ERIC soustředit potenciál čtyř stěžejních vědeckých multidisciplinár- ních výzkumných programů k naplnění celosvětových klíčových VaV témat základního i aplikova- ného výzkumu se zaměřením na vodu, biodiverzitu, vodní ekologii a akvakulturu:

• VP 1 Reprodukční a genetické postupy pro uchování biodiverzity ryb a akvakulturu • VP 2 „Nové“ polutanty v životním prostředí a jejich vliv na sladkovodní ekosystémy • VP 3 Dlouhodobě udržitelná akvakultura s odpovědným hospodařením s vodou a živinami • VP 4 Biologie v měnících se podmínkách sladkovodních ekosystémů

Strategicky budeme vytvářet takové podmínky v rámci centra, aby naše každodenní aktivity nezatěžovaly životní prostředí a aktivně jsme se zapojili do celosvětového trendu snižování množství uhlíku v ovzduší.

AKTIVITY CENAKVA

Aktivity CENAKVA řešíme ve spolupráci s centry, výzkumnými infrastrukturami a dalšími subjekty výzkumu v ČR a Evropě, které od vzniku centra využívají naši jedinečnou infrastrukturu a know-how. Centrum CENAKVA má smluvně dohodnutou spolupráci a sdílení infrastruktur s velkými centry v ČR, a to např. CEITEC, CzechGlobe a BIOCEV, a dále s regionálními centry, a to např. Centrum Haná, ADMIREVET a ALGATECH. Smyslem této spolupráce je možnost vzájemného využití jedinečného výzkumného zařízení s odpovídající finanční a technologickou náročností prováděné VaV činnosti. Na evropské úrovni je infrastruktura CENAKVA od svého vzniku propo- jena a využívána konsorciem 22 výzkumných ústavů a fakult v Evropě zaměřených na rybářství a ochranu vod v síti projektu AQUAEXCEL a s naší účastí v ESFRI ELIXIR, EMBRC a DANUBIUS-RI. S ohledem na rostoucí význam enviromentálního výzkumu bylo taktéž vytvořeno konsorcium DANUBIUS-CZ ve spolupráci center CENAKVA a CzechGlobe, které by od roku 2020–21 měly být součástí DANUBIUS-ERIC. Zároveň probíhá snaha o zařazení do celosvětové sítě sdílení dlouho- dobých datových řad v rámci ELTER/ILTER ESFRI. CENAKVA taktéž navazuje spolupráci s řadou významných tuzemských a zahraničních subjektů prostřednictvím realizace otevřeného přístupu ke svým kapacitám v rámci velké výzkumné infrastruktury. Centrum nadále vytváří silná zahraniční strategická partnerství a podporuje specifickou ko- merční činnost licencováním a patenty s cílem dosáhnout efektivních inovací. Komerčně plní centrum ukazatele smluvního výzkumu na úrovni cca 5 mil. Kč ročně ve spolupráci s partnery v ČR a EU. Je součástí řady výzkumných konsorcií v rámci EU projektů, které představují prestižní zahraniční spolupráce. CENAKVA nepatří k velkým centrům co do velikosti, ale co do důležitosti jeho aktivit, jedinečnosti a ambice. Velikost je úměrná společenské poptávce po výstupech a je základním předpokladem udržitelnosti její činnosti. Důkazem významnosti CENAKVA je součas- né postavení mezi ostatními centry a zejména jasně kvantifikovatelný poměr nákladů na zříze- ní/provoz vs. dosahované výstupy a jejich kvalita. CENAKVA lze označit jako leadera mezi centry zbudovanými v rámci OP VaVpI (včetně porovnání s velkými excelentními centry s investičními náklady v řádech miliard Kč), ačkoliv investičně patří naše centrum k těm nejmenším.

EVROPSKÝ TECHNOLOGICKÝ UNIKÁT CENAKVA

Infrastruktura CENAKVA je celosvětově unikátní s ohledem na možnost efektivního sdílení technologických a experimentálních zázemí formou otevřených přístupů a sdíleného výzkumu. CENAKVA využívá dvě experimentálně-technická zázemí, a to Genetické rybářské centrum a Ex- perimentální rybochovné pracoviště se specializovanými akvarijními, recirkulačními a akvaponic- kými technologiemi. Pracoviště společně se specializovanými technologiemi umožňují provádět

49 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

komplexní experimenty v řízených podmínkách dle potřeb plánovaných pokusů v návaznosti na čtyři výzkumné programy. Z externích vodních ploch v rámci Vodňanska obhospodařujeme necelých 40 ha rybníků s chovem 23 druhů sladkovodních ryb všech věkových kategorií v po- čtu okolo 250 000 kusů (45 t). Například u kapra obecného (Cyprinus carpio) od roku 1953 chováme a udržujeme 21 plemen, linií a hybridních populací, 11 plemen a barevných variet od roku 1981 u lína obecného (Tinca tinca), u sumce velkého (Silurus glanis) od roku 1997 dvě plemena a albinotickou formu. Naší chloubou je od roku 2001 úspěšný chov 11 druhů celosvětově ohrožených chrupavčitých ryb, zejména jeseterů. Celkem využíváme 71 vlastních rybníků od 0,01 do 12 ha vodní plochy a k tomu v pronájmu dalších 50 ha. Pro výzkumné účely jsme vybudovali 3 200 m2 různých rybochovných hal a akvarijních místností s 18 recirkulačními nízkoodpadovými systémy s termoregulací o celkovém objemu téměř 82 m3. Dále disponujeme venkovními či průtočnými odchovnými žlaby a bazény pro sezónní odchovy ryb a raků o celko- vém objemu 260 m3. V rámci laboratorních podmínek udržujeme chov několika druhů nepůvod- ních raků a modelových druhů ryb. Tyto unikátní podmínky pro výzkum akvakultury a udržitelný systém managementu sladkých vod, které v Evropě v podobném rozsahu, ale jiného zaměření, najdete pouze v Norsku či Španělsku, jsou doplněny nezbytným přístrojovým vybavením s ná- vazností na výzkumné programy CENAKVA.

VELKÁ VÝZKUMNÁ INFRASTRUKTURA CENAKVA

V roce 2018 prošlo centrum CENAKVA úspěšnou mezinárodní evaluací a bylo zařazeno na Cestovní mapu ČR velkých infrastruktur pro výzkum, experimentální vývoj a inovace. Náplní velké výzkumné infrastruktury CENAKVA je stejně jako v případě celého centra CENAKVA po- rozumění změnám ve sladkovodních ekosystémech a jejich celospolečenské závažnosti z hlediska zachování biodiverzity, ochrany vodního prostředí a vodních zdrojů důležitých pro život a činnost člověka. Velká výzkumná infrastruktura CENAKVA pokrývá infrastrukturní, znalostní a expertní zázemí Fakulty rybářství a ochrany vod a Jihočeského výzkumného centra akvakultury a biodiverzity hydrocenóz a umožňuje otevřený přístup k 25 % jejich kapacity.

Velká výzkumná infrastruktura CENAKVA funguje na principu otevřené infrastruktury pro experimentální činnost, která zahrnuje celkem 14 konkrétních laboratoří a výzkumných praco- višť. Služby a infrastrukturu mohou využívat vědci z celého světa prostřednictvím otevřeného přístupu. Otevřený přístup umožňuje zdarma realizovat experiment a využít expertíz, kterými infrastruktura disponuje. Pro realizaci experimentu stačí připravit projekt přístupu, který je hodnocen ve dvou stupních z pohledu kvality výzkumu, technické způsobilosti a dostupnosti infrastruktury. Úspěšné projekty jsou pak realizovány za technické a vědecké asistence zaměstnanců infrastruktury.

50 FROV JU

Výběr a realizace experimentu:

http://www.frov.jcu.cz/cs/veda-a-vyzkum/vvi-cenakva

Celkový sumář výsledků od vzniku centra, tzn. od roku 2010

Publikace – impaktované časopisy (Jimp) 846 Publikace v časopisech – ostatní 123 Patenty národní 16 Patenty mezinárodní 2 Aplikované výsledky výzkumu (ověřená technologie, certifikovaná metodi- 133 ka, poloprovoz ...) Uznané plemeno (amurský lysec) 1 Počet licencí 10 Prostředky z prodaných licencí 376 tis. Kč Prostředky ze smluvního výzkumu 58 872 tis. Kč

FINANCOVÁNÍ CENAKVA

V roce 2018 a 2019 tvořily zdroje financování CENAKVA příjmy ze smluvního výzkumu, z ná- rodních a mezinárodních grantů, z institucionálních zdrojů, z komercializace výsledků výzkumu, z Národního programu udržitelnosti (2018) a z účelové podpory na řešení projektu velké vý- zkumné infrastruktury (2019).

Financování podle jednotlivých zdrojů v roce 2018 a 2019 je uvedeno v tabulce. Příjmy v roce 2018 Částka (v mil. Kč) Prostředky z NPU 20,82 Institucionální příjmy vč. příjmů za výuku 25,95 Příjmy z národních grantů 14,51 Příjmy ze smluvního výzkumu 4,04 Příjmy z mezinárodních grantů 1,57 Příjmy celkem 66,89

Příjmy v roce 2019 Částka (v mil. Kč) Účelové podpora na řešení projektu velké výzkumné infrastruktury 17,20 Institucionální příjmy vč. příjmů za výuku 29,87 Příjmy z národních grantů 16,70 Příjmy ze smluvního výzkumu 4,98 Příjmy z mezinárodních grantů 1,66 Příjmy celkem 70,41

51 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

PĚT NEJVÝZNAMNĚJŠÍ PUBLIKACÍ CENAKVA 2018–2019

Šauer, P., Stará, A., Golovko, O., Valentová, O., Bořík, A., Grabic, R., Kocour Kroupová, H., 2018. Two synthetic progestins and natural progesterone are responsible for most of the progestagenic activities in municipal wastewater treatment plant effluents in the Czech and Slovak republics. Water Research 137: 64–71. (IF 2017 = 7,051; AIS 2017 = 1,500)

Červený, D., Grabic, R., Fedorova, G., Grabicová, K., Turek, J., Žlábek, V., Randák, T., 2018. Fate of perfluoroalkyl substances within a small stream food web affected by sewage effluent. Water Research 134: 226–233. (IF 2017 = 7,051; AIS 2017 = 1,500)

Císař, P., Saberioon, M., Kozák, P., Pautsina, A., 2018. Fully contactless system for crayfish heartbeat monitoring: Undisturbed crayfish as bio-indicator. Sensors and Actuators B: Chemical 255: 29–34. (IF 2017 = 5,667; AIS 2017 = 0,787)

Palíková, M., Piačková, V., Navrátil, S., Zusková, E., Papežíková, I., Kolářová, J., Pojezdal, Ľ., Dyková, I., Scholz, T., Gelnar, M., Svobodová, S., Řehulková, E., Mareš, J., Modrá, H., Blažek, R., Veselý, T., 2019. Nemoci a chorobné stavy ryb. FROV JU, Vodňany, 462 s.

Guo, W., Kubec, J., Veselý, L., Hossain, S.Md., Buřič, M., McClain, R., Kouba, A., 2019. High air humidity is sufficient for successful egg incubation and early post-embryonic development in the marbled crayfish Procambarus( virginalis). Freshwater Biology 64: 1603–1612. (IF 2018 = 3,404; AIS 2018 = 1,016)

PĚT NEJVÝZNAMNĚJŠÍCH PROJEKTŮ CENAKVA V LETECH 2018–2019

z LO1205 Udržitelnost excelence centra akvakultury a biodiverzity hydrocenóz (2014–2018, odpovědný řešitel prof. Ing. Otomar Linhart, DrSc.) z AQUAEXCEL 2020 Aquaculture infrastructures for excellence in European fish research (2015–2020, odpovědný řešitel za FROV JU prof. Ing. Otomar Linhart, DrSc.) z 613611 FishBOOST – Improving European aquaculture by advancing selective breeding to the next level for the six main finfish species (2014–2018, odpovědný řešitel doc. Ing. Martin Kocour, Ph.D.) z LM2018099 Velké výzkumné infrastruktury: CENAKVA – Jihočeské výzkumné centrum akvakultury a biodiverzity hydrocenóz (2019–2022, odpovědný řešitel prof. Ing. Otomar Linhart, DrSc.) z CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_017/0002614, Výzkumná infrastruktura pro vzdělávací účely FROV JU (2017–2022, odpovědný řešitel doc. Ing. Vladimír Žlábek, Ph.D.)

VÝZNAMNÉ POČINY V RÁMCI CENAKVA 2018–2019

z Byly podány celkem 4 patenty se zaměřením na rybníkářství a čištění odpadních vod. Dále jeden patent na bezkontaktní detekci zdravotního stavu ryb byl přijat. z Získání certifikátu HR AWARD (HR Excellence in Research Award), kterou uděluje Evropská komise výzkumným organizacím, které se cíleně snaží podporovat a vytvářet mezinárodní a transparentní pracovní prostředí. z Oficiální schválení projektu AQUAEXCEL 3.0 k realizaci (Horizon 2020, 22 partnerů, 60 měsíců). z Zapojení se do přípravy projektu ENVI THREATS (rozpočet 2 mld. Kč, žadatel Biologické centrum AV ČR, v.v.i.). z Pokračovala produkce kvalitního násadového materiálu candáta obecného do recirkulačních akvakulturních systémů s odběrateli v celé Evropě a produkce Omega3kapra pro trh v ČR. z Uzavření obchodní a licenční smlouvy s firmou Ceskykaviar.cz s.r.o., která se stala exkluzivním prodejcem dříve vyvinuté Sturgeon friendly caviar kosmetiky. z U vyšlechtěného plemene kapra Amurského lysce pokračovaly pro velký zájem ze strany odběratelů dodávky F1 hybridů pro chov tržních ryb.

52 FROV JU z COWI – úspěch v mezinárodním tendru zaměřeném na identifikaci nových polutantů ve složkách životního prostředí v Norsku

Odlov ryb pomocí elektrického agregátu na rybníku Čežarka, který slouží k dočišťování odpadních vod města Vodňany.

Zpracovali: prof. Ing. Otomar Linhart, DrSc., Ing. Martin Vlček, doc. Ing. Vladimír Žlábek Ph.D., Ing. Petr Císař, Ph.D., Ing. Michal Hojdekr, MBA

53 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

VÝZKUMNÝ PROGRAM (VP) 1: REPRODUKČNÍ A GENETICKÉ POSTUPY PRO UCHOVÁNÍ BIODIVERZITY RYB A AKVAKULTURU

Vize

Vizí výzkumného programu je uchování biodiverzity a rozvoj konkurenceschopné sladko- vodní akvakultury využitím multidisciplinárního přístupu na základě syntézy poznatků dosa- vadních vědeckovýzkumných směrů rozvíjených na jednotlivých pracovištích centra. Jedná se o rozvoj reprodukční fyziologie a technologie, molekulární, buněčné, kvantitativní a konzer- vační genetiky jednotlivých druhů nebo vyšších taxonů, o rozvoj reprodukčních technologií a bioinženýrství zárodečných kmenových buněk, o jejich zdokonalování pomocí nových přístu- pů a vývojem nových metod.

Cíl VP

Hlavním cílem výzkumného programu je zajistit udržení a rozvoj excelence výzkumu a transferu vědomostí v oblastech genetiky ryb, reprodukční fyziologie a biotechnologie do praxe za účelem udržení biodiverzity ryb, vytváření mezinárodně uznávané genobanky a zlepšení konkurenceschopnosti evropské akvakultury s významným podílem ČR. Z něho se vymezilo pět oblastí excelentního výzkumu reprodukčních a genetických postupů, které pova- žujeme za klíčové pro udržení biodiverzity ryb a pro rozvoj české a evropské akvakultury, a to výzkum rybích gamet a jejich interakcí v oplozovacím procesu; studium poruch gametogeneze, biologie takto vzniklých polyploidních organizmů a optimalizace biotechnologie reprodukce; optimalizace technik a protokolů pro mezinárodní genobanku; bioinženýrství zárodečných kme- nových buněk a uplatnění principů molekulární biologie ve šlechtění ryb.

Výsledky

V rámci vývoje alternativních strategií uchování a následného obnovení genetického mate- riálu ryb tým projektu publikoval metodu uchování samičích genetických zdrojů pomocí manipulace s oogoniálními zárodečnými buňkami. V oblasti selekčního šlechtění kapra obecného bylo publikováno zásadní zjištění, že podíly jedlých částí těla se dají s vysokou přesností předpovídat na živých rybách, a lze je tak nepřímo zvyšovat selekcí na hodnoty kalkulované na základě mě- ření vybraných parametrů pomocí ultrazvuku. U jeseterů, kde během oplození vajíčka dochází vlivem vyššího počtu mikropylárních otvorů k proniknutí více spermií do cytoplazmy vajíčka, bylo zjištěno, že spermie, které nefúzovaly s prvojádrem vajíčka a unikly degradačním mecha- nizmům, se mohou dále účastnit vývoje, dát vzniknout tzv. polyspermní mozaice a tento objev umožnil vytvořit první životaschopné hybridy, vzniklé ze tří rodičů různých druhů. Současná živá genová banka jeseterovitých ryb zahrnuje 11 druhů – vyzu velkou, jesetera malého, j. sibiřského, j. ruského, j. hladkého, j. hvězdnatého, j. jadranského, j. krátkorypého, j. bílého, j. atlantského a veslonosa amerického. Od uznání plemene Amurského lysce na konci roku 2014 Genetické rybářské centrum dosud vyprodukovalo více než 88 mil. ks plůdku F1 hybridů s tímto plemenem pro české rybářství. Velký zájem vzbudilo toto plemeno rovněž při vyžádaných přednáškách v Maďarsku, Německu a na workshopu FAO OSN o rybniční akvakultuře.

Zpracoval vedoucí VP: prof. Ing. Martin Flajšhans, Dr.rer.agr.

54 FROV JU

VP 2: „NOVÉ“ POLUTANTY V ŽIVOTNÍM PROSTŘEDÍ A JEJICH VLIV NA SLAD- KOVODNÍ EKOSYSTÉMY

Vize

Vizí výzkumného programu je pomocí multioborového přístupu, na základě rostoucího know-how řešitelského týmu, jeho instrumentálního a experimentálního zázemí a intenzivní spolupráce s výzkumnou i aplikační sférou včetně státní správy významně přispět ke zlepšení kvality vody a vodního prostředí v ČR.

Cíl VP

Cílem výzkumného programu je excelentní komplexní výzkum osudu „nových“ cizorodých sloučenin ve vodních a půdních ekosystémech a kritické hodnocení jejich vlivu na exponova- né organizmy a jejich společenstva. V průběhu řešení jsou získávány unikátní poznatky z vý- znamných oblastí identifikace, výskytu, osudu a komplexních účinků cizorodých sloučenin typu PPCP, pesticidů a jejich transformačních produktů v podmínkách reálných ekosystémů. Tyto dosud chybějící informace mají klíčový význam pro ekonomicky smysluplné strategické plánování v oblastech čištění odpadních vod, úpravy pitné vody a managementu hospodaření v krajině. Zároveň jsou uživatelské praxi dávány k dispozici moderní metodiky pro použití pasivních vzor- kovačů v oblasti národních programů monitoringu kontaminace vodního prostředí a efektivní analytické metody pro sledování širokého spektra mikropolutantů v různých složkách životního prostředí a v pasivních vzorkovačích.

Výsledky

Řešitelský tým se aktivně a pravidelně podílí na realizaci národního programu monitoringu kvality povrchových vod, který je koordinován Českým hydrometeorologickým ústavem, a in- tenzivně spolupracuje s podniky Povodí, společnostmi provozujícími čistírny odpadních vod a s úpravnami pitné vody v oblasti sledování mikropolutantů. Společně s norským (COWI) a švédským (ExposMeter AB) partnerem jsme opakovaně uspěli v mezinárodních tendrech zaměřených na identifikaci nových polutantů ve složkách životního prostředí. Výsledky vý- zkumných aktivit řešitelského týmu jsou pravidelně publikovány ve špičkových mezinárodních vědeckých časopisech. V roce 2018 byly publikovány dvě práce ve špičkovém časopisu Water Research. Studie Červený a kol. (2018) přinesla nové poznatky o výskytu a osudu emergentních polutantů – perfluoralkylovaných sloučenin (PFC) – v reálném vodním ekosystému ovlivněném výtokem z ČOV. Byla použita unikátní metodika terénního experimentu a nově vyvinuté efektiv- ní analytické LC-HRMS metody pro detekci PFC ve vodě, biotě a v pasivních vzorkovačích. Bylo potvrzeno, že výtoky z ČOV představují významný zdroj kontaminace vodního prostředí PFC. Studie Šauer a kol. (2018) přinesla důležité informace o výskytu progestinů, které jsou obsa- ženy například v hormonální antikoncepci, ale i v jiných hormonálních preparátech, v komunál- ních odpadních vodách v ČR. Výsledky studie rovněž naznačily, které z těchto sledovaných látek lze v našich podmínkách označit za nejvíce rizikové. Získané poznatky jsou využitelné v oblasti ochrany životního prostředí.

Zpracoval vedoucí VP: prof. Ing. Tomáš Randák, Ph.D.

55 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

VP 3: DLOUHODOBĚ UDRŽITELNÁ AKVAKULTURA S ODPOVĚDNÝM HOS- PODAŘENÍM S VODOU A ŽIVINAMI Vize

Vizí výzkumného programu je akvakultura jako řešení budoucnosti pro maximální produkci kvalitních potravin pro rostoucí lidskou populaci s minimální spotřebou vody a energie, mini- mální produkcí odpadních látek, „food mile“ a minimální konkurencí o zdroje se spotřebou lidí a hospodářských zvířat. Dále aby se akvakultura z průmyslu, který je závislý na dodávce ryb z oceánů a znečišťuje vodní zdroje, stala průmyslem nezávislým na mořském rybolovu a spo- třebovala více odpadních látek, než jich sama vytvoří.

Cíl VP

Cílem výzkumného programu je vývoj technologií umožňujících maximální využití živin, odpadů, včetně městských odpadů rostlinného a živočišného původu a energie pro produkci ryb a rostlin s minimem vypouštěných odpadních látek a skleníkových plynů do životního pro- středí. Klíčovým výstupem VP je vzájemné propojení technologií k produkci ryb, rostlin a dalších organizmů se zpracováním a využitím odpadu, které umožňuje maximálně využít živiny přímo na akvakulturní či akvaponické farmě s minimem vypouštěných odpadních látek do životního prostředí. Výsledky tak mají velký dopad pro celou společnost – především pro zajištění dostat- ku kvalitních potravin, minimalizaci produkce skleníkových plynů, využití odpadů, snížení vzdále- nosti mezi produkcí a spotřebou potravin a tím snížení potřeby fosilních paliv, snížení spotřeby vody a produkce odpadů, snížení eutrofizace vod a snížení závislosti akvakultury na rybolovu.

Výsledky

Řešitelský tým díky svému aplikovanému výzkumu a široké národní a mezinárodní spolu- práci pravidelně přispívá k technické a technologické inovaci a optimalizaci intenzivního chovu cenných druhů ryb, jako je candát obecný (Sander lucioperca), okoun říční (Perca fluviatilis), mník jednovousý (Lota lota) a dalších. Dále došlo k popisu umělé indukce produkce triploid- ních candátů a optimalizaci počáteční exogenní výživy u larev candáta pomocí vířníků druhu Brachionus plicatilis zvyšující přežívání odchovávaných ryb o 30 až 40 %. Řešitelský tým se za- býval výzkumem závažných virových nemocí kaprovitých ryb, které se v posledních letech podílí na zvýšené mortalitě kaprů v jarním a podzimním období. Tým zkoumal využitelnost různých složek potravy kapra obecného v rybnících a jejich vliv na kvalitu vody. Byly provedeny studie zkoumající ekosystémové služby a ekologickou zátěž rybniční akvakultury. Pro další rozvoj dlou- hodobě udržitelné akvakultury bylo vybudováno centrum pro výzkum akvaponie a dalších tech- nologií efektivně využívajících vodu a živiny. Byly vyvinuty rybí výrobky pro různé cílové skupiny (např. pro předškolní děti), lépe využívající rybí surovinu.

Zpracoval vedoucí VP: doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D.

56 FROV JU

VP 4: BIOLOGIE V MĚNÍCÍCH SE PODMÍNKÁCH SLADKOVODNÍCH EKOSYS- TÉMŮ Vize

Vizí výzkumného programu Biologie v měnících se podmínkách sladkovodních ekosystémů je aplikace multidisciplinárního přístupu k problematice evaluace změn ve vodním prostředí vyvolaných změnou klimatu, fyzikální, chemickou a biologickou kontaminací prostředí a sou- visejícím narušením habitatů. Vize programu vychází jak z předchozích vědecko-výzkumných směrů pracovišť centra, tak z potřeby reakce na nové procesy ve vodním prostředí a potřeby nových přístupů umožňujících získání podstatně většího spektra informací s vyšší vypovídací schopností. Konkrétně se jedná o rozvoj ekologických, etologických, fyziologických, a ekotoxi- kologických přístupů a jejich zdokonalování pomocí doposud rutinně neaplikovaných přístupů a vývojem nových metod při studiu širokého spektra vodních organizmů.

Cíl VP

Cílem je porozumění probíhajícím a predikovaným procesům ve sladkovodních ekosysté- mech způsobených zejména klimatickými vlivy, antropogenními vlivy (změny habitatů, zne- čištění, zemědělská činnost apod.) nebo sílícím vlivem biologických invazí, které v důsledku vedou ke změnám v druhovém složení sladkovodní bioty a ve fungování sladkovodních eko- systémů. V neposlední řadě je cílem posouzení celospolečenské závažnosti výše zmíněných vlivů a jejich důsledků a aplikace výsledků pro limitaci negativních vlivů na vodní ekosystémy i na vodní zdroje z hlediska jejich využití člověkem. Klíčové bude získání podkladů pro management sladkých vod s důrazem na problematiku biologických invazí a ochranu vodních eko- systémů jako celku. Ambicí je schopnost predikce ekologických a ekonomických dopadů klima- tických, antropogenních a biologických změn na fungování ekosystémů, ale i jejich monitoring či pochopení působení biologických invazí, stejně jako reakcí zájmových vodních organizmů na dané situace z hlediska jejich fyziologického stavu či jejich výsledné odpovědi vyjádřené např. adaptabilní změnou chování, potravních návyků, změnou reprodukčních ukazatelů či využitím alternativních strategií. Úspěšně realizovaným směrem je kombinace a propojení terénních sle- dování s experimentální činností spolu s vývojem nových metod sledování vodních organizmů a vodních ekosystémů včetně využití dálkového průzkumu Země.

Výsledky

Řešitelský tým trvale rozšiřuje portfolio své činnosti o další metody výzkumu a přístupy spolu s využitím širšího spektra studovaných organizmů. Díky tomu se kvantita i kvalita pub- likací v tomto období zvyšuje, což zesiluje naši atraktivnost na poli mezinárodních spoluprací. Výsledky týmu se dotýkají všech výše zmíněných cílů, a rozvíjejí tak jednotlivé přístupy. Kromě jiných je vhodné zmínit průkazné behaviorální či fyziologické reakce vodních organizmů vysta- vených environmentálně relevantním koncentracím vybraných polutantů, schopnost inkubace a raného postembryonálního vývoje mimo vodní prostředí u raků, vysokou úspěšnost nových invazních druhů v kompetici s již etablovanými nepůvodními druhy a jejich vysokou adaptabilitu vůči podmínkám prostředí. Mezi další výsledky můžeme zařadit využití analýzy obrazu ve výživě ryb, odhadu biomasy obsádek nebo pro odhad kvalitativních parametrů vodních ploch pomocí satelitních snímků metodami dálkového průzkum Země. Dosažené výsledky vytvářejí prostor pro rozvoj dotčených témat s potenciálem pro minimálně udržení vysokého publikačního stan- dardu s možnostmi aplikace dosažených výsledků v praxi.

Zpracoval vedoucí VP: Ing. Miloš Buřič, Ph.D.

57 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

1.11. Pracoviště děkanátu fakulty, ekonomika, lidské zdroje a rozvoj

Děkanát je výkonným útvarem, který po hospodářské a administrativní stránce zajišťuje chod fakulty. Jeho pracoviště zajišťují např. podpůrnou činnost v rámci studijní a VaV oblasti, administraci projektů, ekonomickou agendu, technickou správu budov a zařízení, celoživotní vzdělávání atd.

1.11.1. Pracoviště projektových manažerů

Jedním z klíčových pracovišť Fakulty rybářství a ochrany vod Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích je Pracoviště projektových manažerů. Mezi hlavní činnosti pracoviště patří zejména zpracování projektových žádostí a projektové řízení v souladu s plánovanými aktivitami projektu a podmínkami poskytovatele dotace. Vyjma větších investičních projektů se pracoviště dále po- dílí na administrativní podpoře ostatních projektů realizovaných na fakultě. V letech 2018–2019 jsme připravili, administrovali a realizovali řadu projektů (více již podkapitola 1.11.4. Investiční rozvoj fakulty, kompletní seznam projektů je uveden na str. 80–87).

Ing. Martin Vlček Bc. Eliška Plachtová vedoucí pracoviště, projektová manažerka (do 8/2018) projektový manažer [email protected] [email protected]

PaedDr. Jiří Koleček Lenka Tesařová zástupce vedoucího, projektová manažerka (od 10/2018) projektový manažer [email protected] [email protected]

Ing. Samanta Pajerová Bc. Monika Malkusová, DiS. asistentka tajemníka, projektová manažerka projektová manažerka (do 1/2018) [email protected] [email protected]

Bc. Nikola Šulcová (roz. Jelínková) Mgr. Michaela Šmídová asistentka tajemníka, projektová manažerka (od 2/2018) projektová manažerka (od 1/2018) [email protected] [email protected]

Bc. Vojtěch Havlis projektový manažer (do 4/2019)

58 FROV JU

1.11.2. Pracoviště správy fakulty

Toto pracoviště zajišťuje běžný provozní chod fakulty (údržba majetku, vozový park, IT servis apod.), a to včetně přípravy a realizace stavebních aktivit. Pracoviště je dislokováno na hlavní budově v Zátiší ve Vodňanech s přímou vazbou na své spolupracovníky v Českých Budějovicích a v Nových Hradech.

Ing. Vladimír Nedopil Eva Šimoníková vedoucí pracoviště (do 9/2019), uklízečka ERPP, MEVPIS (do 9/2019) investiční manažer (od 10/2019) [email protected] [email protected]

Milada Vazačová Jana Veselá vedoucí pracoviště (od 10/2019) uklízečka GRC (do 9/2019) [email protected]

Ing. Václav Nebeský, Ph.D. Lukáš Vlk (JH Soft, s.r.o.) zástupce vedoucího, externí správce informačních manažer obchodu technologií [email protected] [email protected]

Ing. Július Szabó Bc. Viktor Čapek (JH Soft, s.r.o.) technik externí správce informačních [email protected] technologií [email protected]

Pavel Fořt Ing. Marek Rodina, Ph.D. technik (do 3/2019) asistent pro informační technologie [email protected]

Ing. Jaroslav Frajman, DiS. technik (od 7/2019) [email protected]

59 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

1.11.3. Ekonomické pracoviště

I v roce 2018 a 2019 pokračovala fakulta v úspěšně započatém vývoji, a to jak z pohledu vědeckého, tak i finančního. V roce 2018 měla fakulta k dispozici prostředky v objemu 292 496,63 tis. Kč, v roce 2019 pak 262 275,52 tis. Kč. Rozdíl ve výši 30 mil. Kč je způsoben snížením prostředků na investice o 51 mil. Kč a oproti tomu navýšením provozních prostředků o 21 mil. Kč. Vědecký profil fakulty se odráží také ve skladbě zdrojů financování, kdy VaV zdroje činí cca 65 % z objemu financí, které fakulta získá.

Ing. Jaromíra Vondrášková Bc. Zuzana Vavrušková vedoucí pracoviště, referentka ekonomiky, zástupce tajemníka pokladní (do 3/2019) [email protected] [email protected]

Ing. Ivana Kobernová Magdalena Zíková, DiS. referentka ekonomiky, referentka ekonomiky, pokladní zástupkyně vedoucí pracoviště (od 1/2019) [email protected] [email protected]

Ing. Eva Bílá Jaroslava Dubová, BBus. odborná referentka na úseku eko- referentka ekonomického oddělení nomickém (od 4/2019) [email protected] [email protected]

Jana Langová, DiS. Ing. Mirka Průšová referentka práce a mezd personalistka [email protected] [email protected]

Šárka Kocmichová, DiS. referentka ekonomiky, pokladní [email protected]

60 FROV JU

Zdroje nancování r. 2018 vč. čerpání FÚUP/FPP v tis. Kč (292 496,63) Zdroje financování v letech 2018 a 2019 jsou podrobněji zachyceny v následujících grafech. 20Zdroje 674,35; nancování 7 % r. 2018 vč. čerpání FÚUP/FPP v tis. Kč (292 496,63)

Zdroje nancování r. 2018 vč. čerpání FÚUP/FPP v tis. KčÚčelová (292 496,63podpora )VaV 13 811,60; 420 % 674,35; 7 % 73 821,27; 24 % Podpora na DKRVO 20 674,35; 7 % Účelová podpora VaV 2 142,34;13 811,60; 1 % 4 % Příspěvek na vzdělávací 73 821,27; 24 % činnostPodpora na DKRVO 13 811,60; 4 % Účelová podpora VaV 2 142,34; 1 % 73 821,27; 24 % Dotace ostatní MŠMT PříspěvekPodpora na na DKRVO vzdělávací 90 123,89; 30 % činnost Dotace ostatní mimo 2 142,34; 1 % 51 320,69; 17 % Příspěvek na vzdělávací MŠMT) Dotacečinnost ostatní MŠMT 90 123,89; 30 % Dotace EU 51 320,69; 17 % Dotace ostatní mimoMŠMT MŠMT) 90 123,89; 30 % Vlastní zdroje 51 320,69; 17 % Dotace ostatní mimo DotaceMŠMT) EU Vlastní zdroje 50 341,37; 17 % Dotace EU Vlastní zdroje 50 341,37; 17 %

50 341,37; 17 %

Vynaložení zdrojů r. 2018 v tis. Kč (291 335,33)

Vynaložení zdrojů r. 2018 v tis. Kč106 (291 127,23; 335,33) 36 % Osobní náklady (mzdy, DPP, odvody, stipendia) 88 546,50; 30Vynaložení % zdrojů r. 2018 v tis. Kč (291 335,33) 106 127,23; 36 % ProvozníOsobní náklady náklady (mzdy, (mate- riál,DPP, DrHNM, odvody, služby, stipendia) 88 546,50; 30 % 106 127,23; 36 % energie…)Osobní náklady (mzdy, ProvozníDPP, odvody, náklady stipendia) (mate- Provozní náklady ostatní 88 546,50; 30 % riál, DrHNM, služby, energie…)Provozní náklady (mate- Tvorba fondů (FPP, FÚUP) riál, DrHNM, služby, Provozní náklady ostatní Režieenergie…) – REK 10 004,33; 4 % Tvorba fondů (FPP, FÚUP) InvesticeProvozní (investicenáklady ostatní dotace, odpisy maj. RežieTvorba – fondůREK (FPP, FÚUP) 10 21004,33; 644,95; 4 %7 % z vl. zdrojů) InvesticeRežie – REK (investice 10 004,33; 4 % 54 291,88; 19 % dotace, odpisy maj. 21 644,95; 710 % 720,45; 4% zInvestice vl. zdrojů) (investice dotace, odpisy maj. 21 644,95; 7 % 54 291,88; 19 % z vl. zdrojů) 10 720,45; 4% 54 291,88; 19 % 10 720,45; 4%

Zdroje nancování r. 2019 vč. čerpání FÚUP/FPP v tis. Kč (262 275,53)

23 381,62;Zdroje 8nancování % r. 2019 vč. čerpání FÚUP/FPP v tis. Kč (262 275,53) Účelová podpora VaV 8 025,02; 3 % Zdroje nancování r. 2019 vč. čerpání FÚUP/FPP v tis. Kč (262 275,53) 23 381,62; 8 % 73 447,83; 27 % Podpora na DKRVO Účelová podpora VaV Příspěvek na vzdělávací 10 678,02; 4 %23 381,62; 8 % 8 025,02; 3 % činnost 73 447,83; 27 % PodporaÚčelová podporana DKRVO VaV 8 025,02; 3 % DotacePříspěvek ostatní na vzdělávací MŠMT 10 678,02; 4 % 73 447,83; 27 % Podpora na DKRVO činnost Dotace ostatní mimo 37 670,58; 14 % Příspěvek na vzdělávací 10 678,02; 4 % MŠMT) Dotacečinnost ostatní MŠMT Dotace EU 37 670,58; 14 % Dotace ostatní mimoMŠMT MŠMT) 67 458,80; 25 % Vlastní zdroje 37 670,58; 14 % Dotace ostatní mimo DotaceMŠMT) EU 67 458,80; 25 % VlastníDotace zdrojeEU 52 373,64; 19 % 67 458,80; 25 % Vlastní zdroje

52 373,64; 19 %

52 373,64; 19 % 61

Vynaložení zdrojů r. 2019 v tis. Kč (261 330,60)

37 915,72; 15Vynaložení % zdrojů r. 2019 v tis. Kč (261 330,60) 118 171,80; 45 % Osobní náklady (mzdy, Vynaložení zdrojů r. 2019 v tis. Kč (261 330,60) DPP, odvody, stipendia) 37 915,72; 15 % 118 171,80; 45 % 10 671,73; 4 % ProvozníOsobní náklady náklady (mzdy, (mate- riál, DrHNM, služby, 37 915,72; 15 % DPP, odvody, stipendia) 118 171,80; 45 % energie…)Osobní náklady (mzdy, 10 671,73; 4 % ProvozníDPP, odvody, náklady stipendia) (mate- 22 572,86; 9 % Provozníriál, DrHNM, náklady služby, ostatní energie…)Provozní náklady (mate- 10 671,73; 4 % Tvorba fondů (FPP, FÚUP) riál, DrHNM, služby, 22 572,86; 9 % Provozní náklady ostatní Režieenergie…) – REK 11 476,99; 4 % Tvorba fondů (FPP, FÚUP) 22 572,86; 9 % InvesticeProvozní (investicenáklady ostatní dotace, odpisy maj. RežieTvorba – fondůREK (FPP, FÚUP) 11 476,99; 4 % z vl. zdrojů) InvesticeRežie – REK (investice 11 476,99; 4 % 60 521,49; 23 % dotace, odpisy maj. zInvestice vl. zdrojů) (investice dotace, odpisy maj. 60 521,49; 23 % z vl. zdrojů)

60 521,49; 23 % Zdroje nancování r. 2018 vč. čerpání FÚUP/FPP v tis. Kč (292 496,63)

20 674,35; 7 %

13 811,60; 4 % Účelová podpora VaV 73 821,27; 24 % Podpora na DKRVO 2 142,34; 1 % Příspěvek na vzdělávací činnost Dotace ostatní MŠMT 90 123,89; 30 % 51 320,69; 17 % Dotace ostatní mimo MŠMT) Dotace EU Vlastní zdroje

50 341,37; 17 %

Vynaložení zdrojů r. 2018 v tis. Kč (291 335,33)

106 127,23; 36 % Osobní náklady (mzdy, DPP, odvody, stipendia) 88 546,50; 30 % Provozní náklady (mate- riál, DrHNM, služby, energie…) Provozní náklady ostatní Tvorba fondů (FPP, FÚUP) Režie – REK 10 004,33; 4 % Investice (investice dotace, odpisy maj. 21 644,95; 7 % z vl. zdrojů) 54 291,88; 19 % 10 720,45; 4%

Zdroje nancování r. 2019 vč. čerpání FÚUP/FPP v tis. Kč (262 275,53)

23 381,62; 8 % Účelová podpora VaV 8 025,02; 3 % 73 447,83; 27 % Podpora na DKRVO Příspěvek na vzdělávací 10 678,02; 4 % činnost Dotace ostatní MŠMT

37 670,58; 14 % Dotace ostatní mimo MŠMT) Dotace EU 67 458,80; 25 % Vlastní zdroje

52 373,64; 19 %

01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

Vynaložení zdrojů r. 2019 v tis. Kč (261 330,60)

37 915,72; 15 % 118 171,80; 45 % Osobní náklady (mzdy, DPP, odvody, stipendia)

10 671,73; 4 % Provozní náklady (mate- riál, DrHNM, služby, energie…) 22 572,86; 9 % Provozní náklady ostatní Tvorba fondů (FPP, FÚUP) Režie – REK 11 476,99; 4 % Investice (investice dotace, odpisy maj. z vl. zdrojů)

60 521,49; 23 %

Lidské zdroje Průměrný evidenční počet zaměstnanců přepočtený k 31. 12. 2018 (140,9) Průměrný evidenční počet zaměstnanců přepočtený k 31. 12. 2018 (140,9) 21,6; 15 % 31,5; 22 % akademický pracovník (muž) 21,6; 15 % akademický pracovník (žena) 8,1; 6 % 31,5; 22 % akademický pracovník (muž) vědecký pracovník(muž) akademický pracovník (žena) 8,1; 6 % vědecký pracovník(žena) vědecký pracovník(muž) 16,8; 12 % 8,9; 6 % Ph.D. studenti (muži) vědecký pracovník(žena) Ph.D. studenti (žena) 16,8; 12 % 8,9; 6 % Ph.D. studenti (muži) technici (muž) Ph.D. studenti (žena) 9,8; 7 % technici (žena) technici (muž) adm. pracovníci (muž) 9,8; 7 % technici (žena) 25,3; 18 % 10,1; 7 % adm. pracovníci (žena) adm. pracovníci (muž) 25,3; 18 % 3,6; 3 % 5,1; 4 % 10,1; 7 % adm. pracovníci (žena) 3,6; 3 % 5,1; 4 %

Průměrný evidenční počet zaměstnanců přepočtený k 31. 12. 2019 (145,2)

Průměrný21,6; evidenční 15 % počet zaměstnanců přepočtený k 31. 12. 2019 (145,2) 32; 22 % akademický pracovník (muž) 21,6; 15 % akademický pracovník (žena) 32; 22 % akademický pracovník (muž) 4,8; 3 % vědecký pracovník(muž) akademický pracovník (žena) 4,8; 3 % vědecký pracovník(žena) vědecký pracovník(muž) 8,4; 6 % Ph.D. studenti (muži) 17,7; 12 % vědecký pracovník(žena) 8,4; 6 % Ph.D. studenti (žena) Ph.D. studenti (muži) 17,7; 12 % technici (muž) 13,3; 9 % Ph.D. studenti (žena) technici (žena) technici (muž) 13,3; 9 % adm. pracovníci (muž) technici (žena) 27,6; 19 % 11,7; 8 % adm. pracovníci (žena) adm. pracovníci (muž) 27,6; 19 % 3; 2 % 5,1; 4 % 11,7; 8 % adm. pracovníci (žena) 3; 2 % 5,1; 4 %

62 FROV JU

1.11.4. Investiční rozvoj fakulty (nejvýznamnější stavební aktivity)

V roce 2018–2019 byla vykonána celá řada investičních aktivit v řádu desítek milionů korun českých. Koordinaci těchto aktivit zajišťovalo Pracoviště správy fakulty a z nejvýznamnějších sta- veb lze například uvést:

Akvaponický skleník u Ústavu akvakultury a ochrany vod v Českých Budějovicích

Akvaponická výzkumná hala byla postavena v kampusu Jihočeské univerzity v Českých Bu- dějovicích. Jejím hlavním účelem je provoz unikátní moderní technologie produkce potravin, která symbioticky propojuje chov ryb a pěstování rostlin bez půdy a použití chemikálií k ošetření rostlin. Termín realizace byl od 7/2018 do 10/2018, celkové náklady činily 14 974 447 Kč bez DPH, zhotovitelem byla firma AEROLUX, s.r.o.

Recirkulační akvakulturní systém u Genetického rybářského centra ve Vodňanech

Venkovní recirkulační systém byl vybudován u Genetického rybářského centra ve Vodňa- nech. Jedná se v České republice o ojedinělý dánský typ RAS, který byl upraven pro naše klimatic- ké podmínky a je využíván pro celoroční chov jeseterovitých ryb. Termín realizace byl od 2/2018 do 9/2018, celkové náklady činily 7 394 900 Kč bez DPH, zhotovitelem byla firma VHS – Vodo- hospodářské stavby, spol. s r.o.

63 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

Nové laboratoře a kanceláře v budově Experimentálního rybochovného pracoviště ve Vodňanech

Ve 3. patře budovy Experimentálního rybochovného pracoviště ve Vodňanech byly pro studenty a zaměstnance fakulty vybudovány nové laboratoře a kanceláře. Termín realizace byl od 4/2018 do 9/2018, celkové náklady činily 5 207 645 Kč bez DPH, zhotovitelem byla firma INTESTA CZ, s.r.o.

Aktivity zahájené v roce 2019, jejichž realizace bude dokončena do poloviny roku 2020:

Rekonstrukce ubytovacího zázemí pro studenty a zaměstnance FROV JU ve Vodňa- nech („stodola“)

Stavba vznikla rekonstrukcí bývalé „stodoly“ v Říční ulici ve Vodňanech, jež dříve slouži- la Městskému rybářství Vodňany. Objekt disponuje třemi bytovými jednotkami pro studenty a technickým zázemím. Termín realizace byl od 8/2019 do 4/2020, celkové náklady činily 7 591 095 Kč bez DPH, zhotovitelem byla firma David Štefan.

Aktuální foto stavby.

Vizualizace stavby po dokončení.

64 FROV JU

Vybudování zázemí Laboratoře nemocí ryb ve Vodňanech

Nové zázemí laboratoře s akvarijními místnostmi vznikne u hlavní budovy FROV JU v Zá- tiší ve Vodňanech. Po dokončení stavby otevřeme unikátní prostory pro výzkum infekčních nemocí sladkovodních ryb. Termín realizace byl od 9/2019 do 9/2020, celkové náklady činily 13 113 112,20 Kč bez DPH, zhotovitel zhotovitelem byla firma ROBRO s.r.o.

Aktuální foto stavby. Vizualizace stavby po dokončení.

Zpracoval: Ing. Michal Hojdekr, MBA

65 01 FAKULTNÍ MANAGEMENT A ROZVOJ

1.12 HABILITAČNÍ A PROFESORSKÁ ŘÍZENÍ

Doc. Ing. Hana Kocour Kroupová, Ph.D., byla s účinností od 1. června 2019 jmenována docentkou oboru Rybářství. Před Vědeckou radou Fakulty rybářství a ochrany vod prezentovala přednášku „Dusík ve vodním prostředí – hlavní formy výskytu a přeměny“ a obhájila habilitační práci na téma „Vybrané přírodní a antro- pogenní faktory způsobující endokrinní disrupci u ryb“. Doc. H. Kocour Kroupová (*1980) absolvovala Gymnázium ve Strakonicích. Po maturitě získala titul inženýr na Fakultě technologie ochrany prostředí, Vysoké školy chemicko-technologické v Praze, kde obhájila diplomovou práci na téma „Posouzení toxického vlivu dusitanů na rybí obsádku“. Doktorské studium absolvovala v roce 2007 ve Výzkumném ústavu rybářském a hydrobiologickém ve Vodňanech s tématem dizertační práce „Sledování vlivu dusi- tanů na ryby s cílem minimalizovat jejich negativní účinky“. Krátce po obhájení dizertační práce odjela na dvouletou postdoktorandskou stáž do Leibniz-Institut für Gewässerökologie und Bi- nnenfischerei (IGB) v Berlíně v Německu. Po návratu ze stáže v roce 2010 nastoupila na pozici akademického pracovníka na nově vzniklé Fakultě rybářství a ochrany vod Jihočeské univerzity, kde působí doposud. V rámci své výzkumné a pedagogické činnosti se věnuje různým tématům týkajícím se vodní toxikologie, environmentální chemie a fyziologie ryb.

Prof. Ing. Tomáš Randák, Ph.D., byl s účinností od 14. června 2018 jmenován profesorem oboru Rybářství. Před Vědeckou radou Fakulty rybářství a ochrany vod JU a Vědeckou radou Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích prezentoval přednášku „Cizorodé látky ve vodním prostředí a jejich vliv na vodní organismy“. Prof. T. Randák (*1975) absolvoval Gymnázium v Prachaticích. Po maturitě získal titul inženýr na Zemědělské fakultě Jihočeské univerzity v Českých Budě- jovicích, kde obhájil diplomovou práci na téma „Monitoring cizorodých látek v ekosystému po- vrchových vod“. Doktorské studium absolvoval v roce 2006 na Jihočeské univerzitě dizertační prací „Možnosti zvyšování produkce násad pstruha obecného (Salmo trutta) a lipana podhor- ního (Thymallus thymallus) pro zarybňování volných vod“ a v roce 2011 se na Fakultě rybář- ství a ochrany vod JU habilitoval obhajobou práce „Vliv kontaminace vodního prostředí na ryby v České republice“. Jeho profesní kariéra započala v roce 1998 ve Výzkumném ústavu rybářském a hydrobio- logickém ve Vodňanech (VÚRH), kde se postupně vypracoval až na akademického pracovníka. V roce 2009 se stal zástupcem ředitele a následně v roce 2017 samotným ředitelem VÚRH. V rámci své výzkumné a pedagogické činnosti se věnuje různým tématům týkajícím se vý- skytu cizorodých látek v ekosystémech povrchových vod a studium jejich vlivu na exponované organizmy.

66 FROV JU

2. MEZINÁRODNÍ A NÁRODNÍ VZTAHY

Proděkan pro zahraniční vztahy zodpovídá za oblast zahraničních vztahů na Fakultě ry- bářství a ochrany vod Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích (FROV JU), tzn. navazování a udržování zahraničních spoluprací, programy pro studijní pobyty a pracovní stáže studentů a zaměstnanců fakulty, administrace vzájemných návštěv odborníků a stáží studentů, dále me- zinárodní srovnání a hodnocení.

doc. Ing. Vladimír Žlábek, Ph.D. Lucie Kačerová proděkan pro zahraniční vztahy referentka pro Ph.D. studium a za- [email protected] hraniční činnost [email protected]

2.1. Mezinárodní projekty

Na Fakultě rybářství a ochrany vod byla v průběhu let 2018–2019 realizována celá řada mezinárodních projektů. Z projektů 7. rámcového programu EU a HORIZON 2020 byly řešeny projekty FishBOOST (Improving European aquaculture by advancing selective breeding to the next level for the six main finfish species, 2014–2019). Výzkumné aktivity realizované společným vzděláváním stu- dentů v doktorském studijním programu jsou financovány z projektu Horizon 2020 – ITN IMPRE- SS (Improved production strategies for endangered freshwater species, 2015–2018). Spoluprá- ce 21 předních evropských výzkumných institucí v oblasti akvakultury je podpořena z projektu AQUAEXCEL 2020 – Aquaculture infrastructures for excellence in European fish research. V roce 2019 byl rovněž zpracován a schválen navazující AQUAculture infrastructures for EXCELlence in European fish research 3.0.

Další významnou spolupráci jsme navázali prostřednictvím programů INTERREG V-A. Z vel- kých projektů jsou řešeny Kompetenzzentrum MechanoBiologie in Regenerativer Medizin – Kompetenzzentrum MechanoBiologie v programu INTERREG V-A Rakousko – Česká republika a MoBI-aqua: Přeshraniční monitoring biologických invazí jako nástroj pro ochranu sladkovodní biodiverzity INTERREG V-A Česká republika – Svodný stát Sasko 2014–2020. Během spolupráce s Rakouskem bylo řešeno celkem sedm projektů v rámci Fondu malých projektů.

V roce 2018 a 2019 se Fakulta rybářství a ochrany vod JU podílela na řešení Centrálních rozvojových projektů (CRP) Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy, jež podporují systé- mové nastavení a rozvoj absorpční kapacity pro realizaci mezinárodních projektů. Konkrétně se jednalo o „Zvýšení absorpční kapacity pro mezinárodní VaV projekty“ – H2020 Umbrella v r. 2018 a následně „Podpora kapacit pro mezinárodní VaV projekty“ – H2020 Umbrella II. Spolupracovali jsme s partnery z MENDELU a Veterinární a farmaceutické univerzity Brno.

V letech 2018 a 2019 bylo rozpracováno celkem 39 žádostí o grant z mezinárodních sché- mat, z nichž 23 bylo skutečně podáno. Do konce r. 2019 máme informaci, že jich bylo podpoře- no celkem 7, s tím že 9 je stále v hodnocení. Do programu H2020 bylo podáno celkem 7 žádostí a do programů INTERREG V-A také 7, z toho 2 projekty do velkých schémat a 5 do Fondu malých projektů. Mezi další grantová schémata, kde se FROV JU ucházela o podporu, patří INTER-ACTI- ON – LTAUSA, LTAIN – ČR INDIA Inter-excelence, EEA and Norway Grants Fund for Regional Coo- peration anebo COST. U žádostí do H2020 byla nejčastější role našich odborných týmů partner, task leader, popřípadě WP leader, u žádostí do INTERREG V-A vždy koordinátor, a to i u velkých projektů, u Norway Grants jsme jak v roli partnerů, tak i koordinátorů.

67 02 MEZINÁRODNÍ A NÁRODNÍ VZTAHY

CENAKVA se stala členem DANUBIUS RI (International Centre for Advanced Studies on River-Sea Systems) Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích včetně Jiho- českého výzkumného centra akvakultury a biodiversity hydrocenóz (CENAKVA) a Ústav výzku- mu globální změny, Akademie věd ČR (CzechGlobe) podepsaly Memorandum o porozumění o národní a mezinárodní spolupráci v rámci DANUBIUS Research Infrastructure dne 26. dubna 2019. Národní úroveň zahrnuje spolupráci CENAKVA RI a CzechGlobe RI zřizující národní konsorcium DANUBIUS CZ pro koordinaci činností na národní úrovni. Dosavadní spolupráce českých vý- zkumných subjektů s DANUBIUS_RI spočívá v účasti na mezinárodních aktivitách přípravné fáze koordinovaných projektem DANUBIUS-PP H2020 (2016–2019, Grant Agreement No 739562). CzechGlobe je stálým členem konsorcia již od začátku řešení projektu DANUBIUS-PP (12/2016), CENAKVA se stala partnerskou institucí v závěru roku 2018. Obě instituce se aktivně podílejí na aktivitách přípravné fáze vedoucí ke vzniku DANUBIUS-ERIC v 2020. Současné výzkumné aktivity se týkají aktivní spolupráce v rámci již existujících komponent (např. ICOS, EMSO, Helmholtz Water Network, Technische Universitat Dresden atd.). Významný rozvoj spolupráce v oblasti udržitelné akvakultury a ochrany vodních ekosystémů (CENAKVA) a toků skleníkových plynů ve vztahu ke sladkovodním ekosystémům (CzechGlobe) bude plně rozvinut v průběhu implemen- tační a provozní fáze DANUBIUS-ERIC.

2.2. Mezinárodní letní školy Vodňany, ČB a Nové Hrady

Fakulta rybářství a ochrany vod JU v letech 2018 a 2019 pokračovala v pořádání Mezinárodní letní rybářské školy určené pro studenty vysokých škol – studenty bakalářského, magisterského nebo doktorského stupně studia z ČR i zahraničí. Během čtyřtýdenního kurzu měli studenti letní školy možnost vyslechnout celou řadu odborných přednášek našich i zahraničních vědeckých pracovníků, navštívit pracoviště Fakulty rybářství a ochrany vod JU, ale i jiné rybářské provozy v ČR a pod vedením doktorandů řešit malý vědecký projekt v laboratořích fakulty. V roce 2018 se letní školy zúčastnilo 15 studentů a studentek z Turecka, Nepálu, Spojených států amerických, Španělska, Japonska, Chorvatska, Ukrajiny a Polska. V roce 2019 to pak bylo 17 účastníků z USA, Turecka, Íránu, Španělska, Polska, Ruska a Ukrajiny. V roce 2019 se poprvé zúčastnilo i 6 studen- tů rakouské školy Höhere Lehranstalt für Umwelt un Wirtschaft z Yspertalu v průběhu projektu spolupráce JU a HLUW Yspertal. Ústav komplexních systémů Fakulty rybářství a ochrany vod JU realizoval Letní školu Schola ludus pro studenty vysokých škol z ČR i zahraničí. Během čtyř týdnů měli účastníci akce možnost navštívit zajímavá místa prostřednictvím exkurzí (JU v Českých Budějovicích, FROV Vodňany, Linec), zúčastnit se odborných přednášek, a především pracovat na krátkých vědeckých projektech pod dohledem odborníků v konkrétních laboratořích a výsledky své práce obhajovat před odbornou komisí.

68 FROV JU

2.3. Spolupráce se zahraničními institucemi a podniky

Tato spolupráce je založena na smluvních dohodách mezi FROV JU a příslušnými zahranič- ními institucemi, vyměňujeme zkušenosti především prostřednictvím krátkodobých pobytů při řešení blízkých výzkumných úkolů. V období 2018–2019 jsme měli platné smlouvy s těmito institucemi: Bavorské státní výzkumné středisko pro zemědělství, Freising, Německo Biologická stanice kanadského rybářství a oceánografie, New Brunswick, Kanada Department de la Moselle, Metz, Francie Helénské centrum mořského výzkumu, Ústav akvakultury, Heraklion, Řecko Henan univerzita, Henan, Čína Hokkaido univerzita, Hokkaido, Japonsko Iránský rybářský vědecký institut IFSRI, Teherán, Írán Jihozápadní univerzita přírodních věd, Chongqing, Čína Khersonova státní zemědělská univerzita, Kherson, Ukrajina Leibnitzův ústav sladkovodní ekologie a vnitrozemského rybolovu, Berlín, Německo Memorial univerzita Newfoundland, Newfoundland, Kanada Michoacanská univerzita, Michoacan, Mexiko Noakhali vědecká a technologická univerzita, Noakhali, Bangladéš Organizace pro výživu a zemědělství (Food and Agriculture Organization, FAO Polská akademie věd, Mezinárodní centrum pro ekologii, Dziekanów Leœny, Polsko Polská akademie věd, Ústav ichtyologie a akvakultury, Golysz, Polsko Polytechnická univerzita obchodu, Ancona, Itálie Ruská akademie věd, Vědecko-výzkumné centrum ochrany ekologie, Petrohrad, Rusko Spolkový úřad vodního hospodářství, Ekologická stanice, Schrems, Rakousko Státní výzkumné a výrobní centrum rybolovu „gosrybcenter“, Tyumeń, Rusko Švédská univerzita zemědělských věd, Uppsala, Švédsko Univerzita Calgary, Calgary, Kanada Univerzita California, Riverside, USA Univerzita Charkov, Charkov, Ukrajina Univerzita KAHO St. Lieven, St. Niklaas, Belgie Univerzita Kragujevac, Kragujevac, Srbsko Univerzita Nha Trang, Fakulta akvakultury, Nha Trang, Vietnam Univerzita Nong Lam, Fakulta rybářství, Ho Chi Minh City, Vietnam Univerzita Novi Sad, Novi Sad, Srbsko Univerzita Oklahoma, Oklahoma, USA Univerzita přírodních zdrojů a věd, Vídeň, Rakousko Univerzita v Bělehradu, Bělehrad, Srbsko Univerzita v Johannesburgu, Johannesburg, Jihoafrická republika Univerzita v Lisabonu, Fakulta přírodních věd, Lisabon, Portugalsko Univerzita ve Valencii, Ústav živočišné výroby, Valencie, Španělsko Univerzita Warmia a Mazury, Olštýn, Polsko Univerzita Tokyo, Tokyo, Japonsko Univerzita Záhřeb, Záhřeb, Chorvatsko Univerzita Parma, Parma, Itálie Univerzita Messina, Sicílie, Itálie

69 02 MEZINÁRODNÍ A NÁRODNÍ VZTAHY

Univerzita Padova, Padova, Itálie Univerzita Estadual Paulista, Sao Paulo, Brazílie Výzkumný ústav rybářství a akvakultury (HAKI), Szarvas, Maďarsko Výzkumný ústav rybářství řeky Jang c´, Čínská akademie rybářských věd, Wuhan, Čína Výzkumný ústav pro akvakulturu, No. 1, Vietnam Výzkumný ústav rybářství Yangtze River, Čína Zemědělská univerzita Hanoi, Fakulta zoologie a akvakultury, Hanoi, Vietnam Zemědělská univerzita Huazhong, Wuhan, Čína

Dne 16. 5. 2019 byla uzavřená smlouva o spolupráci s Organizací pro výživu a zemědělství (Food and Agriculture Organization of the United Nations; FAO) a FROV JU. První společnou akcí po podpisu smlouvy bylo uspořádání odborného mezinárodního workshopu FAO na Fakultě rybářství a ochrany vod Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích, který proběhl pod záštitou Ministerstva zemědělství ČR ve středisku MEVPIS Vodňany od 30. 9. do 4. 10. 2019. Workshop byl zaměřen na intenzivní chov ryb, umělou reprodukci ryb, genetiku a chov ryb, zachování ge- netických zdrojů, historii a současnost českého rybníkářství a zahrnoval jak teoretické části s od- bornými přednáškami, tak praktické části a exkurze. Akce se zúčastnilo 18 osob z 10 zemí.

První odborný mezinárodní workshop FAO uspořádaný na MEVPIS Vodňany.

V oblasti smluvního výzkumu se zahraničím převažují zakázky pro privátní sféru (viz násle- dující obrázek). I nadále byla v období 2018–2019 prohlubována spolupráce se švédskou firmou Nya ExposMeter AB, a to v oblasti specializovaných analýz. Na Slovensku pak pokračovala spo- lupráce s firmou Analytical Science, s.r.o. V oblasti smluvního výzkumu pro zahraniční akademickou sféru pokračovala spolupráce na stanovení obsahu nelegálních drog a farmak ve vzorcích odpadních vod pro Slovenskou technickou univerzitu v Bratislavě. Smluvní výzkum na mezinárodní úrovni FROV JU navázala s následujícími podniky: Analytical Science, s.r.o., Modra, Slovensko; Nya ExposMeter AB, Tavelsjo, Švédsko; Slovenská technická univerzita v Bratislavě, Slovensko.

70 FROV JU

eter AB osm xp E a y N € 59 000

tech ká nic ns k ybársk e á r y ký z v u v o s n

ä l n i z S

e € 15 600 v

v e

o z

l i

S a

v SK

a l

B s i r t

€ 50 500 a

SK nalyt A ica l S c

€ 3 000 n

SK . r . o .

Objem zakázek s nejvýznamnějšími evropskými partnery v období 2018–2019.

Zpracovali: Lucie Kačerová, Ing. Václav Nebeský, Ph.D., doc. Ing. Vladimír Žlábek, Ph.D.

71 02 MEZINÁRODNÍ A NÁRODNÍ VZTAHY

2.4. Spolupráce s českými institucemi a podniky

V oblasti smluvního výzkumu na národní úrovni lze spolupráci rozdělit na dvě hlavní podka- tegorie. První je spolupráce s privátní sférou, další pak s akademickou sférou a státní správou. Pro privátní sféru nadále FROV JU spolupracovala na testování užitkovosti ryb s Rybářstvím Třeboň, a.s., Rybářstvím Nové Hrady, s.r.o., Rybářstvím Hluboká cz, s.r.o., Klatovským rybářstvím, a.s., a Rybníkářstvím Pohořelice, a.s.; hydrobiologický a hydrochemický monitoring byl proveden pro firmu Aquatest, a.s.; byl optimalizován nitrifikační a denitrifikační proces v intenzivním chovu ryb pro Tilapia, s.r.o.; provozně bylo ověřeno využití ozónu v intenzivním chovu ryb pro FISH Farm Bohemia, s.r.o.; byly provedeny analýzy pstruhů duhových pro Želivská Provozní, a.s.; a další. V oblasti smluvního výzkumu pro akademickou sféru a státní správu byly realizovány zakáz- ky zaměřené na přípravu a analýzu vzorků z hlediska testů kolonizace a ověření na skenovacím elektronovém mikroskopu pro České vysoké učení technické v Praze, dále testování biokompa- tibility pro Vysoké učení technické v Brně, rovněž jsme spolupracovali s podnikem Povodí Labe, s.p., na analýzách vzorků pevných matric a odlovu ryb pro značkování a zjištění stavu populací ryb ve Vltavskému luhu pro Českou zemědělskou univerzitu v Praze, experimentální krmný re- žim u kapra obecného byl realizován pro Biologické centrum AV ČR, v.v.i. Pro město Písek byly monitorovány lokality s výskytem raků říčních. V roce 2019 byl ve spolupráci s Ministerstvem zemědělství ČR proveden monitoring hygienické kvality ryb ve významných rybářských revírech. Smluvní výzkum na národní úrovni FROV JU navázala s následujícími podniky

Aquatest, a.s., Praha Biologické centrum AV ČR, v.v.i., České Budějovice FISH Farm Bohemia, s.r.o., Rokytno Česká zemědělská univerzita, Praha České vysoké učení technické, Praha Český hydrometeorologický ústav, Praha Jihočeský vědeckotechnický park, a.s., České Budějovice Hofmeister, s.r.o., Plzeň Klatovské rybářství, a.s., Klatovy Krajské školní hospodářství České Budějovice, Protivín Technická univerzita v Liberci Masarykova univerzita, Brno Město Písek Ministerstvo zemědělství ČR, Praha Povodí Labe, s.p., Hradec Králové Pražské vodovody a kanalizace, a.s. Rybářství Hluboká cz, s.r.o. Rybářství Nové Hrady, s.r.o. Rybářství Třeboň, a.s. Spolana, a.s., Neratovice Sudoměřské proudy, z.s., Čejetice Tilapia, s.r.o., Tábor Ústecký kraj, Ústí nad Labem Vysoké učení technické v Brně Želivská provozní, a.s., Praha

72 FROV JU

stvo zem er ěd st ě i l n s i t v

M í

Č € 42 400 R olana Sp teorol me og o ic r k € 14 000 d ý

ú h

s dí La

ý t o b a v e

k € 21 400 o , v

s P s.

e p Č . € 34 600

ářství, a.s. yb r é k s v

l € 31 000 K

ářství No yb vé R H r a d € 4500 y ,

€ 29 000 .

o .

Objem zakázek s nejvýznamnějšími tuzemskými partnery v období 2018–2019.

Zpracoval: Ing. Václav Nebeský, Ph.D.

2.5. Členství FROV JU v mezinárodních a národních sítích a organizacích

Asociace kuchařů a cukrářů ČR* Český optický klastr, z.s.* EPFC-CG (EPFC Core Group) European Aquaculture Society (EAS) GS1 (mezinárodní organizace pro registraci čárových kódů) Krajská síť environmentálních center Krasec, z.s.* MAS Vodňanská ryba, z.s.* Rybářské sdružení ČR* Síť středisek ekologické výchovy Pavučina, z.s.* W.S.C.S. (Mezinárodní společnost na ochranu jeseterů) Pozn.*česká sdružení

2.6. Členství pracovníků FROV JU v mezinárodních a národních organiza- cích a radách

doc. RNDr. Zdeněk Adámek, CSc. Česká limnologická společnost PhDr. Vladimíra Bendová European Association of Aquatic and Marine Science Libraries and Information Centers (EURASLIC) Ing. Martin Bláha, Ph.D. Česká limnologická společnost M.Sc. Olga Bondarenko, Ph.D. National System of Researchers, CONACYT, Mexico M.Sc. Viktoriia Burkina, Ph.D. Center for Reproductive Biology in Uppsala (CRU) Federation of European Biochemical Societies (FEBS) Society of Environmental Toxicology and Chemistry (SETAC)

73 02 MEZINÁRODNÍ A NÁRODNÍ VZTAHY

RNDr. Bořek Drozd, Ph.D. Česká limnologická společnost Český svaz ochránců přírody (ČSOP) doc. M.Sc. Borys Dzyuba, Ph.D. Society for Cryobiology UNESCO Chair in Cryobiology M.Sc. Viktoriya Dzyuba, Ph.D. The Ukrainian Biochemical Society (member of FEBS – Federation of European Biochemical Societies); Ukrainian Gerontology and Geriatrics Society (member organization of International Association for Geronto- logy and Geriatrics) International Embryo Technology Society (IETS) prof. Ing. Martin Flajšhans, Dr.rer.agr. Česká společnost pro analytickou cytometrii (ČSAC) Jihočeská univerzita – Rada pro vnitřní hodnocení Jihočeská univerzita – Vědecká rada Výzkumný ústav živočišné výroby – Rada genetických živočišných zdrojů Mgr. Markéta Flajšhansová Asociace učitelů češtiny jako cizího jazyka pod Ústa- vem jazykové odborné přípravy Univerzity Karlovy (AUČCJ ÚJOP UK) Česká a slovenská asociace jazykových center pod Cen- trem jazykového vzdělávání MU (CASAJC) Ing. Kateřina Francová Česká limnologická společnost doc. Mgr. Roman Grabic, Ph.D. Grantová agentura České republiky – Odborný panel Ing. Michal Hojdekr, MBA Ústav zemědělské ekonomiky a informací – Vědecká rada M.Sc. Aiman Imentai European Aquaculture Society (EAS) – National coordi- nator of EAS student group in Czech Republic Kazakhstan National Committee for the UNESCO programme “Man and Biosphere” – Scientific secretary MVDr. Jitka Kolářová Česká ichtyopatologická společnost (ČIS) European Association of Fish Pathologists (EAFP) prof. Ing. Pavel Kozák, Ph.D. Česká zemědělská univerzita Praze, Fakulta agrobiologie a potravinových zdrojů – Vědecká rada Grantová agentura České republiky – Odborný panel International Association of Astacology (IAA) – Výkon- ný výbor Jihočeská univerzita – Vědecká rada OP Rybářství – Monitorovací výbor Ústav živočišné fyziologie a genetiky AVČR, v.v.i. – Rada prof. Ing. Jan Kouřil, Ph.D. Česká limnologická společnost Česká zemědělská akademie prof. Ing. Otomar Linhart, DrSc. Biological Resource Centers for Domestic Animals (INRA), Francie – Mezinárodní rada Leibniz-Institute of Freshwater Ecology and Inland Fis- heries (IGB Berlín) – Mezinárodní rada Grantová agentura České republiky – člen odborného panelu Jihočeská univerzita – Vědecká rada Národní akreditační úřad pro vysoké školství ČR – hod- notitel MVDr. Veronika Piačková, Ph.D. Česká ichtyopatologická společnost (ČIS) European Association of Fish Pathologists (EAFP) Resortní komise MŠMT pro schvalování projektů poku- sů (REKOZ) doc. Ing. Tomáš Policar, Ph.D. European Aquaculture Society (EAS) European Percid Fish Culture (EPFC) Monitorovací výbor OP Rybářství 2014–2020

74 FROV JU

Ing. Markéta Prokešová, Ph.D. Česká limnologická společnost Ing. Ján Regenda, Ph.D. Česká limnologická společnost prof. Ing. Tomáš Randák, Ph.D. Hydrobiologický ústav, Biologické centrum AV ČR – Vě- decká rada Jihočeská univerzita – Oborová rada GAJU Národní agentura pro zemědělský výzkum – Odborný panel Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity – Oboro- vá komise oboru Ekotoxikologie doktorského studijní- ho programu Biologie Society of Environmental Toxicology and Chemistry (SETAC) M.Sc. Saberioon Mohammadmehdi, The Institute of Electrical and Electronics Engineers Ph.D. (IEEE) IEEE life science technical community (LSTC) Ing. Bc. Renata Rychtáriková Štysová, Československá mikroskopická společnost Ph.D. Dipl. Biol. Christoph Steinbach, Ph.D. Evropská mikroskopická společnost European Association of Fish Pathologists (EAFP) International Zebrafish Society (IZFS) prof. MVDr. Zdeňka Svobodová, DrSc. European Association of Fish Pathalogists (EAFP) OECD-Ecotoxicology MUDr. Eva Šálková Česká společnost patologů Kooperativní lymfomová skupina prof. RNDr. Dalibor Štys, CSc. Československá mikroskopická společnost Český optický klastr – zástupce JU Assembly member of the Mission Healthy Oceans, Seas, Coastal and Inland Waters of the Horizon Euro- pe program Ing. Jan Urban, Ph.D. Česká společnost pro hmotnostní spektrometrii Československá mikroskopická společnost MVDr. Eliška Zusková, Ph.D. European Association of Fish Pathologists (EAFP) doc. Ing. Vladimír Žlábek, Ph.D. Danubius PP – Board of Governmental representatives Grantová agentura České republiky – Odborný panel Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta – Obo- rová komise oboru Ekotoxikologie doktorského studij- ního programu Biologie Národní agentura pro zemědělský výzkum – Odborný panel Národní akreditační úřad pro vysoké školství ČR – hod- notitel Society of Environmental Toxicology and Chemistry (SETAC)

75 02 MEZINÁRODNÍ A NÁRODNÍ VZTAHY

2.7. Členství pracovníků FROV JU v mezinárodních a národních redakčních radách

doc. RNDr. Zdeněk Adámek, CSc. Aquaculture International Croatian Journal of Fisheries Pakistan Journal of Scientific and Industrial Research prof. Ing. Pavel Kozák, Ph.D. Journal of Limnology and Freshwater Fisheries Research prof. Ing. Otomar Linhart, DrSc. Journal of Applied Ichthyology Czech Journal of Animal Science Ing. Václav Nebeský, Ph.D. Rybníkářství doc. Ing. Tomáš Policar, Ph.D. Turkish Journal of Fisheries and Aquatic Sciences prof. MVDr. Zdeňka Svobodová, DrSc. Acta Veterinaria Brno dr hab. Ing. Josef Velíšek, Ph.D. Current Life Sciences Environmental Biotechnology International Aquatic Research International Journal of Zoological Investigations World Journal of Anesthesiology World Journal of Immunology doc. Ing. Vladimír Žlábek, Ph.D. Aquatic Environmental Health and Toxicology (AE- HAT)

Zpracovala: Zuzana Dvořáková 2.8. Vyžádané přednášky zaměstnanců fakulty v zahraničí

Adámek, Z., 2018. The impact of topmouth gudgeon Pseudorasbora( parva, Schlegel, 1842) on the aquatic environment in invaded fishponds. In: 8th International Conference Water and Fish, Faculty of Agriculture, Bělehrad, Srbsko, 13.–15. 6. 2018. Adámek, Z., 2018. Fischzucht in der Tschechischen Republik – jetziger Zustand, Probleme und Aussicht. In: Fischereifachtagung 2018, Bundesamt für Wasserwirtschaft, Mondsee, Rakous- ko, 22.–23. 11. 2018. Drozd, B., 2019. One of the 100 most wanted European aliens – the round goby (Neogobius melanostomus) in the Czech / Saxonian parts of the Elbe River: results of our field surveys and lab experiments. In: Aquatic Invasive Species Meeting – Neozoa 2019, Univerzita Koblenz- Landau, Německo, 25. –27. 2. 2019. Flajšhans, M., 2019. The use of flow cytometry for study of polyploidy in freshwater fish. In: The First International Workshop on Exotic Flow CytoMetry, ENEA Casaccia, Řím, Itálie, 12.–15. 11. 2019. Flajšhans, M., 2019. Amur mirror carp and its perspectives for commercial breeding programme. In: 9th Meeting of Fisheries, Aquaculture and Angling Professionals, Szent István University, Gödöllö, Maďarsko, 30. 1.–1. 2. 2019. Gazo, I., 2018. Invertebrate Phallusia mammillata as a marine model for toxicity screening Uni- versity of Vienna, Vídeň, Rakousko, 22.–24. 4. 2018. Herrera, F., 2019. Osmoregulation in Fish Spermatozoa: Involvement in motility activation and impact on short-term storage outcomes. In: 7th International Workshop on the fish Gametes, Rennes, France, 2. –6. 9. 2019. Kouba, A., 2018. Non-native crayfish species in the region and their effects on the environment. In: Regional Conference on River Habitat Restoration for Inland Fisheries in the Danube River Basin and Adjacent Black Sea Areas, Bukurešť, Rumunsko, 13.–15. 11. 2018. Kouba, A., 2018. Research on marbled crayfish at the University of South Bohemia, Czech Republic. 1. Division of Epigenetics, DKFZ-ZMBH Alliance, German Cancer Research Center (DKFZ), Heidelberg, Německo, 18. 9. 2018. Kouba, A., 2019. Crayfish species in Europe. In: The first Irish Crayfish Seminar, Galway, Irsko, 21.–23. 5. 2019.

76 FROV JU

Kouba, A., 2019. Recent situation with alien crayfish species in Europe. In: The Crustacean So- ciety Mid-Year Meeting 2019, Hong Kong, 26.–30. 5. 2019. Kozák, P., 2019. Crayfish species in Europe. In: Active tools for crayfish protection: rescue trans- fers, breeding, restocking, some examples from practice, Galway, Irsko, 21.–23. 5. 2019. Linhart O., Mraz, J., 2019. La consommation et production de la carpe en République Tchèque, avec un focus sur les carpes oméga-3. In: Atelier de l´Association Francaise des Pisciculture d’Etang, Chateau-Gontier, Francie, 5.–7. 4. 2019. Policar, T., 2019. Innovation of culture in selected predatory fish. In: Bűsum Fishday workshop, Bűsum, Německo, 6. 6. 2019. Pšenička, M., Baloch, R., Saito, T., 2019. Germ cells technologies in sturgeons. In: 4th Interna- tional Conference on Agriculture, Food, and Animal Sciences, Tandojam, Pakistán, 21. –22. 1. 2019. Sabberioon, M., 2018. Application of machine vision system in aquaculture. In: The Norwegian colour and computing laboratory, NTNU, Gjvik, Norsko, 3.–5. 11. 2018. Stejskal, V., 2019. Aquamona fish farm project. In: Aquavlan2 Meeting, INAGRO Kruishoutem, Belgie, 21.–22. 3. 2019. Štys, D., 2019. The use of changes in fish school hierarchy in the sensitive detection of psychoactive compounds. In: 1. International and 6. National Veterinary Pharmacology and Toxi- cology Congress, Kayseri, Turecko, 4.–7. 9. 2019. Štysová Rychtárikova, R., 2018. Superresolution using ordinary microscopes. In: 15th Interna- tional Life Science Meeting at IMC Krems, Krems an der Donau, Rakousko, 18.–19. 4. 2018. Stysova Rychtarikova, R., 2019. Use of intracellular dynamics in sensitive detection of xenobiotics in water. In: 1. International and 6. National Veterinary Pharmacology and Toxicology Congress, Kayseri, Turecko, 4.–7. 9. 2019.

2.9. Přednášky zahraničních vědců na fakultě

Breithaupt, T.H., University of Hull, Velká Británie, 18. 7. 2018. Chemical communication in aquatic crustaceans. Brooks, B.W., Baylor University, Texas, USA Brian, 10. 6. 2019. Towards sustainable environmental quality: Identifying priority global research questions in environmental toxicology and chemistry. Ercoli, F., Estonian University of Life Sciences, Estonsko, 25. 9. 2018. Stable isotopes in freshwater ecology. Lutz, I., Leibnitz-Institute of Freshwater Ecology and Inland Fisheries, Německo, 4. 9. 2018. Ecotoxicological effect and risk assessment: Significance of mechanism-based research. Oca, J., Universitat Politècnica de Catalunya, Španělsko, 11. 4. 2018. Integration of seaweed cultivation and fish production in recirculating aquaculture systems (IMTA-RAS). Pickova, J., Swedish University of Agricultural Sciences, Švédsko, 30. 10. 2018. Comparison of nutritional values for freshwater and marine fish. Prokop, P., Trnavská univerzita v Trnave, Slovensko, 8. 6. 2018. Evolution of reproductive con- flicts between males and females. Reynolds, J., University of Dublin, Irsko, 6. 12. 2018. Ecology of crustaceans and Ecology of molluscs. Ruokonen, T.J., University of Jyväskylä, Finsko, 25. 9. 2018. Migrations of freshwater animals as revealed by stable isotope analysis. Sammalkorpi, I., Finnish Environment Institute, Finsko, 27. 3. 2019. Lessons learnt from case studies of biomanipulation in restoration of eutrophic northern lakes; Implementation of fish removal in biomanipulation of lakes – basic principles and methods. Sentis, A., IRSTEA, Francie, 18. 12. 2018. Influence of temperature and nutrients on trophic interactions: the role of plastic responses. Taylor, R., Baylor University, Texas, USA, 10. 6. 2019. An LC-HRMS top-down approach to visua- lizing and interpreting differences in the chemical ‘fingerprints’ of complex mixtures. Van, P.T., Svennevig, N., Research Institute for Aquaculture No.1, Vietnam, 21. 9. 2018. Aqua- culture perspectives in South East Asia.

Zpracovala: Lucie Kačerová

77 03 VÝZKUM A EXCELENCE

3. VÝZKUM A EXCELENCE

Ing. Antonín Kouba, Ph.D. Pavlína Nováková proděkan pro vědu a výzkum asistentka ředitele [email protected] [email protected] [email protected]

Mgr. Michaela Šmídová Zuzana Dvořáková projektová manažerka redaktorka Redakční rady [email protected] (od 12/2019) [email protected]

Fakulta rybářství a ochrany vod JU si zachovává charakter především výzkumné instituce, přičemž na vědecké aktivity fakulty a centra CENAKVA je celkem alokováno přibližně 65 % fi- nančních prostředků celkového rozpočtu. Vědecko-výzkumná činnost klade důraz na v České republice jedinečný základní a aplikovaný výzkum se špičkovým laboratorním a technickým zá- zemím. Vědecká úroveň činností fakulty je dána rozsahem mezinárodně uznávané publikační činnosti především v oblasti rybářství a ochrany vod a rovněž centrem výzkumu CENAKVA, které jako jedna z mála fakult v ČR má ve své struktuře. Centrum CENAKVA je od roku 2019 zároveň velkou výzkumnou infrastrukturou s otevřený přístupem do svého infrastrukturního, znalostní- ho a expertního zázemí (str. 47–57). Vědečtí pracovníci fakulty v posledních dvou letech v průměru publikovali přes 130 článků v prestižních vědeckých časopisech, z nichž více než třetina připadá na časopisy spadající do prv- ního kvartilu dle impakt faktoru. Fakulta a centrum se snaží vytvářet silná zahraniční strategická partnerství a podporuje cílenou komerční činnost prostřednictvím licencí, softwarů, metodik, technologií a patentů za účelem dosažení efektivních inovací. O blízkosti fakulty ke komerční sféře svědčí i náš podíl podnikatelské činnosti, který generuje přibližně 8 % rozpočtu. Fakulta má významné vědecké zapojení ve společných evropských projektech, které tvořily 3,3 % roz- počtu fakulty. Vysoká úspěšnost fakulty při získávání národních a mezinárodních vědeckých grantů je také výsledkem práce týmu projektových manažerů zajišťujících nezbytnou administ- rativní podporu. Prestižní mezinárodní vědecké renomé se také odráží ve složení Ph.D. studen- tů. Dvě třetiny z nich přicházejí ze zahraničí.

160 1 1 5 140 1 8 5 120 1 1 100 5 1 2 8 153 80 134 139 130 60 103 105 91 40

0 2013 2014 2015 2016 2017 2018 2019 Patenty, registrovaná plemena Knihy Články

Vývoj publikační aktivity pracovníků Fakulty rybářství a ochrany vod JU v letech 2013–2019 (články na Web of Science a Scopus).

78 FROV JU

3.1. Vydavatelská a redakční činnost

Pod hlavičkou Fakulty rybářství a ochrany vod JU je realizována i vydavatelská činnost. V ob- dobí 2018–2019 se jednalo zejména o vydání obsáhlé odborné knihy „Nemoci a chorobné stavy ryb“ kolektivu autorů pod vedením docentky Miroslavy Palíkové. Dále byly vydávány metodické a technologické příručky pro praxi. Zabezpečení kvalitativní úrovně titulů vydávaných na fakul- tě zajišťuje Redakční rada řízená hlavním editorem. Administrativní činnost redakce zajišťuje redaktorka, jež je dále nápomocna při tisku dalších materiálů na fakultě (např. dizertační práce a konferenční sborníky).

Redakční rada (RR)

Ing. Antonín Kouba, Ph.D. MVDr. Jitka Kolářová hlavní editor (do 6/2019), člen RR, člen RR, VÚRH VÚRH [email protected] [email protected]

dr hab. Ing. Josef Velíšek, Ph.D. RNDr. Bořek Drozd, Ph.D. hlavní editor (od 7/2019), člen RR, člen RR, ÚAOV VÚRH [email protected] [email protected]

prof. Ing. Martin Flajšhans, Dr.rer. Ing. Petr Císař, Ph.D. agr. člen RR, ÚKS člen RR, VÚRH [email protected] [email protected]

3.2. Pobočka Akademické knihovny JU při FROV JU

Rybářská knihovna ve Vodňanech působí při VÚRH od jeho založení v roce 1921 a od roku 2012 je pobočkou Akademické knihovny Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích. Knihovna spravuje specializovaný fond dokumentů o velikosti cca 20 000 knihovních jednotek z oboru rybářství, hydrobiologie, ichtyologie, akvakultury a příbuzných věd. Řada titulů je v České republice unikátní a hodnotu má i ucelenost kolekcí. Fond monografií doplňují vzácné knižní dary prof. Eugena Balona, prof. Karla Absolona, prof. Vladimíra Sládečka, doc. Petra Obrdlíka a dr. Tomislava Petra.

Mgr. Dana Lučivňáková knihovnice [email protected]

79 03 VÝZKUM A EXCELENCE

3.3. Výzkumné projekty 2018–2019

PROJEKTY PODPOROVANÉ MINISTERSTVEM ŠKOLSTVÍ, MLÁDEŽE A TĚLOVÝCHOVY ČR

z Propagace a popularizace vědecko-výzkumné činnosti České zemědělské univerzity v Praze, Vysoké školy chemicko-technologické v Praze a Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích (2018, odpovědný řešitel Mgr. Miroslav Boček) z Zvýšení absorpční kapacity pro mezinárodní VaV projekty – H2020 Umbrella (2018, odpovědný řešitel Ing. Petr Císař, Ph.D.) z C14-2019 Podpora kapacit pro mezinárodní VaV projekty – H2020 Umbrella II (2019, odpovědný řešitel Ing. Michal Hojdekr, MBA) z LM2018099 Velké výzkumné infrastruktury: CENAKVA – Jihočeské výzkumné centrum akvakultury a biodiverzity hydrocenóz (2019–2022, odpovědný řešitel prof. Ing. Otomar Linhart, DrSc.)

Národní program udržitelnosti

z LO1205 Udržitelnost excelence centra akvakultury a biodiverzity hydrocenóz (CENAKVA 2014–2018, odpovědný řešitel prof. Ing. Otomar Linhart, DrSc.)

Institucionální plán JU

z Systémová podpora rozvoje spolupráce FROV JU/JU s MŠ, ZŠ, SŠ, VOŠ – odborná činnost v oblasti akvakultury (2016–2018, odpovědný řešitel PaedDr. Jiří Koleček) z Rozvoj materiálně technické základny FROV JU (2016–2018, odpovědný řešitel Ing. Vladimír Nedopil) z Rozvoj studia a vzdělávání na FROV JU v oblasti intenzivní akvakultury (2016–2018, odpovědný řešitel doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D.) z Č. 3 Rozvoj programů celoživotního vzdělávání na FROV JU (2019–2020, odpovědný řešitel PaedDr. Jiří Koleček) z Č. 25 Vzdělávání regionu v oblasti rybářství a ochrany vod a propagace studia na JU (2019– 2020, odpovědný řešitel doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D.) z Č. 26 Podpora tvorby cizojazyčných studijních opor magisterského studia v LMS Moodle (2019–2020, odpovědný řešitel doc. Ing. Martin Kocour, Ph.D.) z Č. 35 Letní školy s tvůrčím zapojením studentů FROV JU (2019–2020, odpovědný řešitel doc. Ing. Vladimír Žlábek, Ph.D.)

Operační program Výzkum, vývoj a vzdělávání

z CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_017/0002614 Výzkumná infrastruktura pro vzdělávací účely FROV JU (2017–2022, odpovědný řešitel doc. Ing. Vladimír Žlábek, Ph.D.) z CZ.02.2.69/0.0/0.0/16_018/0002616 Rozvoj výzkumně zaměřených studijních programů FROV JU (2017–2022, odpovědný řešitel doc. Ing. Vladimír Žlábek, Ph.D.) z CZ.02.2.69/0.0/0.0/16_014/0000628 Rozvoj kanceláře transferu technologií na Jihočeské univerzitě (2017–2021, odpovědný řešitel za FROV JU Ing. Michal Hojdekr, MBA) z CZ.02.3.68/0.0/0.0/16_010/0000523 Podpora vzájemného učení pedagogů MŠ (2017– 2019, odpovědný řešitel za FROV JU Mgr. Miroslav Boček) z CZ.02.2.69/0.0/0.0/16_015/0002348 Rozvoj JU–ESF (2017–2022, odpovědný řešitel za FROV JU Ing. Michal Hojdekr, MBA) z CZ.02.2.67/0.0/0.0/17_044/0008542 Rozvoj JU – Studijní prostředí (2017–2019, odpovědný řešitel za FROV JU Ing. Michal Hojdekr, MBA)

80 FROV JU z CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_025/0007370 Reprodukční a genetické postupy pro uchování biodiverzity ryb a akvakulturu (2018–2021, odpovědný řešitel prof. Ing. Martin Flajšhans, Dr.rer.agr.) z CZ.02.2.69/0.0/0.0/16_028/0006192 Rozvoj JU – Kapacity pro VaV (2018–2021, odpovědní řešitelé za FROV JU doc. Ing. Vladimír Žlábek, Ph.D., Ing. Michal Hojdekr, MBA) z CZ.02.2.69/0.0/0.0/16_027/0008364 Rozvoj JU – Mezinárodní mobility (2018–2020, odpo- vědný řešitel za FROV JU doc. Ing. Vladimír Žlábek, Ph.D.) z CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_019/0000869 Udržitelná produkce zdravých ryb v různých akvakul- turních systémech – PROFISH (2019–2023, odpovědný řešitel za FROV MVDr. Veronika Piač- ková, Ph.D.)

PROJEKTY PODPOROVANÉ MINISTERSTVEM ZEMĚDĚLSTVÍ ČR

Národní agentura pro zemědělský výzkum z QJ1510077 Zvýšení a zefektivnění produkce lososovitých ryb v ČR s využitím jejich genetické identifikace (2015–2018, odpovědný řešitel za FROV JU Ing. Vlastimil Stejskal, Ph.D.) z QJ1510119 Efektivní a dlouhodobě udržitelné využívání živin v intenzivní akvakultuře s využitím multitrofických systémů (2015–2018, odpovědný řešitel prof. Ing. Pavel Kozák, Ph.D.) z QJ1530120 Výskyt farmak a dalších polutantů z komunálních odpadních vod v povodí klíčových vodárenských zdrojů ČR (2015–2018, odpovědný řešitel prof. Ing. Tomáš Randák, Ph.D.) z QJ1510117 Optimalizace metod umělé a poloumělé reprodukce ryb (2015–2018, odpovědný řešitel prof. Ing. Jan Kouřil, Ph.D.) z QJ1610324 Studium tradičních a nových zemědělských plodin jako zdrojů antioxidantů a dalších zdraví prospěšných látek a jejich využití při výrobě potravin (2016–2018, odpovědný řešitel za FROV JU doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D.) z QK1710310 Využití nových biotechnologických postupů v podmínkách české akvakultury s cílem dosáhnout efektivní, kvalitní a ekologicky šetrné produkce ryb (2017–2021, odpovědný řešitel doc. Ing. Tomáš Policar, Ph.D.) z QK1710114 Nová virová onemocnění v chovech kapra obecného – diagnostika a prevence (2017–2021, odpovědný řešitel MVDr. Veronika Piačková, Ph.D.) z QK1810221 Využití mikročástic jako nosičů hormonálně aktivních látek v řízené reprodukci ryb (2018–2021, odpovědný řešitel Mgr. Peter Podhorec, Ph.D.) z QK1810296 Využití alternativních komponent a inovativních postupů ve výživě ryb (2018– 2021, odpovědný řešitel Ing. Vlastimil Stejskal, Ph.D.) z QK1810095 Stanovení dusíkových faktorů pro vybrané druhy sladkovodních ryb jako indikátorů obsahu rybí složky v „čerstvých“ rybách a ve výrobcích ze sladkovodních ryb (2018–2022, odpovědný řešitel dr hab. Ing. Josef Velíšek, Ph.D.) z QK1820354 Technická a technologická inovace intenzivních chovů ryb založená na nových znalostech umožňující efektivní a stabilní produkci (2018–2020, odpovědný řešitel doc. Ing. Tomáš Policar, Ph.D.) z QK1920102 Automatizace a objektivizace monitoringu rybožravých predátorů (2019–2021, odpovědný řešitel Ing. Petr Císař, Ph.D.) z QK1910428 Uchovávání genetických zdrojů kapra obecného in vitro a tvorba isogenních linií pomocí transplantace zárodečných buněk (2019–2023, odpovědný řešitel Ing. Vojtěch Kašpar, Ph.D.) z QK1910430 Inovace technologických prvků v chovu kapra obecného za účelem maximálního využití vysokého potenciálu selekčních programů v podmínkách rybničního hospodaření (2019–2023, odpovědný řešitel doc. Ing. Martin Kocour, Ph.D.) z QK1920326 Akvakultura reofilních druhů ryb (2019–2021, odpovědný řešitel Mgr. Peter Podhorec, Ph.D.)

81 03 VÝZKUM A EXCELENCE

z QK1910282 Možnosti zmírnění dopadů extrémních srážko-odtokových jevů v malých povodích s ohledem na požadavky trvale udržitelného zemědělského hospodaření a produkce ryb (2019–2023, odpovědný řešitel za FROV JU dr hab. Ing. Josef Velíšek, Ph.D.)

Operační program Rybářství

z CZ.10.5.109/5.2/4.0/17_009/0000372 Kniha II. – Choroby ryb (2017–2019, odpovědný řešitel MVDr. Veronika Piačková, Ph.D.) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/17_009/0000375 Kniha III. – Vodní toxikologie pro rybáře – aktualizované vydání (2017–2019, odpovědný řešitel dr hab. Ing. Josef Velíšek, Ph.D.) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/17_009/0000376 Konference I. – Ochrana zdraví ryb (2017–2018, odpovědný řešitel MVDr. Veronika Piačková, Ph.D.) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/17_009/0000373 Metodika I. – Potrava sladkovodních ryb (2017– 2019, odpovědný řešitel doc. RNDr. Zdeněk Adámek, CSc.) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/17_009/0000371 Metodika II. – Monitoring farmak (2017–2019, odpovědný řešitel doc. Mgr. Roman Grabic, Ph.D.) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/17_009/0000369 Propagace – Ryby pro lidi (2017–2018, odpovědný řešitel Ing. Jan Kašpar) z CZ.10.2.101/2.1/0.0/17_011/0000457 Inovace rybích výrobků (2018–2019, odpovědný řešitel Ing. Jan Kašpar) z CZ.10.2.101/2.1/0.0/17_011/0000459 Vývoj nových rybích výrobků pro předškolní děti (2018–2019, odpovědný řešitel doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D.) z CZ.10.2.101/2.1/0.0/17_011/0000455 Optimalizace podmínek před zpracováním ryb pro zvýšení jejich welfare a kvality masa (2018–2019, odpovědný řešitel doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D.) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/18_012/0000589 Co s rybou?! (2019–2020, odpovědný řešitel Ing. Jan Kašpar) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/18_012/0000590 Konference III (2018–2019, odpovědný řešitel Ing. Josef Příborský) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/18_012/0000592 Publikace I (2018–2020, odpovědný řešitel Ing. Josef Příborský) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/18_012/0000591 Publikace II (2018–2020, odpovědný řešitel Ing. Josef Příborský) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/18_012/0000593 Publikace III (2018–2020, odpovědný řešitel Ing. Josef Příborský) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/18_012/0000595 Publikace V (2018–2020, odpovědný řešitel Ing. Josef Příborský) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/18_012/0000596 Kniha IV (2018–2020, odpovědný řešitel Ing. Petr Dvořák, Ph.D.) z CZ.10.2.101/2.1/0.0/17_011/0000454 Nové terapeutické postupy eliminující motolice oční v chovu kaprovitých ryb – zejména u amura bílého (2018–2019, odpovědný řešitel MVDr. Eliška Zusková, Ph.D.) z CZ.10.2.101/2.1/0.0/17_011/0000460 Vliv hustoty obsádek sumečka afrického na efektivitu jeho intenzivního chovu v RAS (2018–2019, odpovědný řešitel Ing. Jiří Křišťan, Ph.D.) z CZ.10.2.101/2.1/0.0/17_011/0000458 Energetický audit, vzdálené řízení a produkce kontejnerové farmy s chovem keříčkovce červenolemého (2018–2020, odpovědný řešitel Ing. Vlastimil Stejskal, Ph.D.) z CZ.10.2.101/2.1/0.0/18_013/0000773 Optimalizace provozu RAS dánského typu zajišťující zvýšenou a kvalitní produkci lososovitých ryb (2019–2020, odpovědný řešitel doc. Ing. Tomáš Policar, Ph.D.) z CZ.10.2.101/2.1/0.0/18_013/0000787 Optimalizace managementu rybniční akvakultury – potlačení negativního vlivu střevličky východní (2019–2021, odpovědný řešitel doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D.)

82 FROV JU z CZ.10.2.101/2.1/0.0/18_013/0000789 Optimalizace postupů pro snížení ztrát vnitrobuněčné vody po rozmrazení u rybích výrobků (2019–2021, odpovědný řešitel doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D.) z CZ.10.2.101/2.1/0.0/18_013/0000792 Ověření možnosti zlepšení welfare ryb při výlovu rybníku (2019–2020, odpovědný řešitel Ing. Ján Regenda, Ph.D.) z CZ.10.2.101/2.1/0.0/18_013/0000793 Adaptace a chov okounka pstruhového v podmínkách intenzivní akvakultury využívající RAS (2019–2020, odpovědný řešitel doc. Ing. Tomáš Policar, Ph.D.) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/19_014/0000886 Metodika III (2019–2021, odpovědný řešitel doc. Ing. Tomáš Policar, Ph.D.) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/19_014/0000887 Metodika IV (2019–2021, odpovědný řešitel prof. MVDr. Zdeňka Svobodová, DrSc.) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/19_014/0000889 Metodika V (2019–2021, odpovědný řešitel Ing. Roman Franěk) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/19_014/0000893 Technologie II (2019–2021, odpovědný Ing. Roman Franěk) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/19_014/0000894 Technologie III (2019–2021, odpovědný řešitel Ing. Antonín Kouba, Ph.D.) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/19_014/0000895 Technologie IV (2019–2021, odpovědný řešitel M.Sc. Carlos Yanes-Roca, Ph.D.) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/19_014/0000897 Technologie V (2019–2021, odpovědný řešitel Ing. Vlastimil Stejskal, Ph.D.) z CZ.10.5.109/5.2/4.0/19_014/0000898 Technologie VI (2019–2021, odpovědný řešitel Mgr. Peter Podhorec, Ph.D.)

Ostatní z Národní program uchování a využití genetických zdrojů hospodářských a užitkových zvířat – Udržování genetických zdrojů u ryb (odpovědný řešitel prof. Ing. Martin Flajšhans, Dr.rer.agr.) z MZe – podpůrný program 2.A.e.1a): Udržování a zlepšování genetického potenciálu hospodářských zvířat a rostlin (odpovědný řešitel: prof. Ing. Martin Flajšhans, Dr.rer.agr.)

PROJEKTY PODPOŘENÉ MINISTERSTVEM PRŮMYSLU A OBCHODU ČR

Operační program Podnikání a inovace pro konkurenceschopnost z CZ.01.1.02/0.0/0.0/16_084/0010345 Instalace uzavřených okruhů na sádkách ryb, zadržení vody v krajině a minimalizace produkce škodlivin a opětovné využití živin v rybničním hospodářství (2017–2020, odpovědní řešitelé za FROV JU doc. Ing. Hana Kocour Kroupová, Ph.D.)

PROJEKTY PODPOŘENÉ MINISTERSTVEM KULTURY ČR

Program na podporu aplikovaného výzkumu a experimentálního vývoje národní a kulturní identity (NAKI II) z DG18P02OVV057 Kulturní tradice českého rybářství ve světle jejího využití v cestovním ruchu a krajinotvorbě (2018–2022, odpovědný řešitel za FROV JU doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D.)

PROJEKTY PODPOŘENÉ GRANTOVOU AGENTUROU ČR z 16-09709Y Výskyt a osud syntetických progestinů ve vodním prostředí a jejich vliv na ryby (2016–2018, odpovědný řešitel doc. Ing. Hana Kocour Kroupová Ph.D.)

83 03 VÝZKUM A EXCELENCE

z 16-02407Y Transferrin v semenné plazmě kapra a jeseterů nám může pomoci identifikovat význam některých proteinů při zmrazování rybích spermií (2016–2018, odpovědný řešitel M.Sc. Ping Li, Ph.D.) z 16-06498S Psychoaktivní látky ve vodním prostředí a jejich vliv na exponované organismy (2016–2018, odpovědný řešitel prof. Ing. Tomáš Randák, Ph.D.) z 16-03754S Evoluce kapacitace spermií: průkopnická studie u taxonomicky izolovaných paryb (2016–2018, odpovědný řešitel Ing. Marek Rodina Ph.D.) z 17-19714Y Jaderný transfer u ryb: šance pro obnovení mizejících druhů jeseterů (2017–2019, odpovědný řešitel doc. Ing. Martin Pšenička Ph.D.) z 17-09310S Rybníky jako modely pro studium diversity a dynamiky planktonu hypertrofních mělkých jezer (2017–2019, odpovědný řešitel za FROV JU doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D.) z 17-09807S Jak a proč zvířata opouštějí sex: kauzální role hybridizace v iniciaci asexuality (2017–2019, odpovědný řešitel za FROV JU doc. Ing. Martin Pšenička, Ph.D.) z 17-08937S Chování léčiv v systému půda-voda-rostlina (2017–2019, odpovědný řešitel za FROV JU doc. Mgr. Roman Grabic, Ph.D.) z 18-09323S Duplikace genomu v evoluci jeseterů a dopad na jejich biologii (2018–2020, odpovědný řešitel prof. Ing. Martin Flajšhans, Dr.rer.agr.) z 18-03712S Je nová generace herbicidů bezpečnější alternativou i pro vodní bezobratlé? (2018–2020, odpovědný řešitel dr hab. Ing. Josef Velíšek, Ph.D.) z 18-15802S Transformace farmak v prostředí běžného recipientu vyčištěných komunálních odpadních vod (2018–2020, odpovědný řešitel doc. Ing. Vladimír Žlábek, Ph.D.) z 18-12465Y Výzkum naváděcích mechanismů spermií u sladkovodních ryb (2018–2020, odpovědný řešitel M.Sc. Sergii Boryshpolets, Ph.D.) z 19-11313S Mezidruhové srovnávání RNA lokalizace v rámci vajíček pro objasnění regulace časného vývoje a asymetrického dělení buněk (2019–2021, odpovědný řešitel za FROV JU doc. Ing. Martin Pšenička, Ph.D.) z 19-04431S Teplotou ovlivněné změny v interakcích a ekologických rolích prominentních invazivních raků (2019–2021, odpovědný řešitel Ing. Antonín Kouba, Ph.D.) z 19-11140Y Systém reparace poškození DNA u vyvíjejících se embryí jeseterů (2019–2021, odpovědný řešitel M.Sc. Ievgeniia Gazo, Ph.D.)

PROJEKTY PODPOŘENÉ GRANTOVOU AGENTUROU JIHOČESKÉ UNIVERZITY V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

z 012/2016/Z Výskyt a kritické hodnocení vlivu cizorodých látek na exponované organismy ve vodních ekosystémech a možnosti prevence a eliminace závažných virových onemocnění v chovech ryb (2016–2018, odpovědný řešitel prof. Ing. Tomáš Randák, Ph.D.) z 125/2016/Z Nové metody a biotechnologické přístupy v reprodukci a genetice ryb II. (2016– 2018, odpovědný řešitel Ing. Vojtěch Kašpar, Ph.D.) z 017/2016/Z Porozumění experimentálním výsledkům na základě soudobé teorie informace (2016–2018, odpovědný řešitel prof. RNDr. Dalibor Štys, CSc.) z 060/2016/Z Inovace pro dlouhodobě udržitelný rozvoj akvakultury (2016–2018, odpovědný řešitel doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D.) z 034/2017/Z Nový postup pro produkci izogenních ryb prostřednictvím transplantace zárodečných kmenových buněk (2017–2018, odpovědný řešitel Ing. Roman Franěk) z 095/2017/Z Funkční analýza Δ6-, Δ5- a Δ4- desaturáz u kapra obecného (Cyprinus carpio) (2017–2018, odpovědný řešitel Ing. Zuzana Bláhová) z 079/2017/Z Vyřazení genu dnd pomocí technologie CRISPR / CAS9, její účinky na vývoj zárodečných linií a další funkčně příbuzné geny u ryb (2017–2018, odpovědný řešitel M.Sc. Abdul Rasheed Khanzai Baloch) z 046/2017/Z Efektivní využití energie ekosystému v kaprovitých rybnících (2017–2018, odpovědný řešitel M.Sc. Marcellin Rutegwa)

84 FROV JU z 059/2017/Z Účinky extraktu z echinacey na kapra obecného a koi kapra experimentálně nakažené koi herpesvirem (2017–2018, odpovědný řešitel M.Sc. Mehrak Mohammadi) z 068/2017/Z Přenos jednotlivých somatických buněk vs. vícebuněčný jaderný přenos jako klonovací techniky u nejvíce ohrožených druhů na světě – jeseterů (2017–2018, odpovědný řešitel M.Sc. Fatira Effrosyni) z 056/2017/Z Přispívají syntetické progestiny k (anti-)androgenním aktivitám ve vodním prostředí? (2017–2018, odpovědný řešitel Ing. Pavel Šauer) z 097/2017/Z Vývoj a aplikace metod LDTD/TQMS-HRMS pro stanovení psychoaktivních látek v tkáňových mikrovzorcích (2017–2018, odpovědný řešitel Ing. Adam Bořík) z 085/2017/Z Změna projevů mRNA vzorců související se stárnutím oocytů ryb (2017–2018, odpovědný řešitel M.Sc. Azadeh Mohagheghi Samarin, Ph.D.) z 008/2018/Z Knock-out dnd1 genu pomocí CRISPR/Cas9 u jeseterů a korelace dnd1 s dalšími souvisejícími geny u ryb (2018–2019, odpovědný řešitel M.Sc. Abdul Rasheed Khanzai Baloch, Ph.D.) z 100/2018/Z Teplotní aklimace delečních mutantů delta-6-desaturázy a elongázy kapra obecného (Cyprinus carpio) připravených metodou CRISPR/Cas9 a její možné ovlivnění výživou (2018–2019, odpovědný řešitel Ing. Zuzana Bláhová) z 077/2018/Z Možnosti využití nukleotidového polymorfismu DNA (SNP) u kapra obecného určeného pomocí RAD sekvenování k odhadu růstové schopnosti ryb a jejich odolnosti vůči Koi herpes viróze (2018–2019, odpovědný řešitel M.Sc. Jinfeng Zhao) z 102/2018/Z Interakce, růst a dospívání: porovnání dvou prominentních invazivních druhů raků (2018–2019, odpovědný řešitel M.Sc. Wei Guo) z 013/2018/Z Vliv ovariální tekutiny na oplození u pstruha duhového (2018–2019, odpovědný řešitel M.Sc. Vitaliy Kholodnyy, Ph.D.) z 097/2019/Z Nové metody a biotechnologické postupy v reprodukci a genetice ryb III. (2019– 2021, odpovědný řešitel doc. Ing. Martin Pšenička Ph.D.) z 061/2019/Z Ekofyziologické účinky vybraných environmentálních faktorů na vodní organismy (2019–2021, odpovědný prof. Ing. Tomáš Randák, Ph.D.) z 013/2019/Z Nové technologie monitorování akvakultury s ohledem na dobré životní podmínky vodních organismů (2019–2021, odpovědný řešitel Ing. Petr Císař Ph.D.) z 122/2019/Z Dlouhodobě udržitelná akvakultura (2019–2021, odpovědný řešitel doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D.) z 102/2019/Z Reakce ryb na environmentální koktejl psychoaktivních látek (2019–2020, odpovědný řešitel M.Sc. Eugenia Maria Sancho Santos) z 088/2019/Z Vliv environmentálně významné koncentrace antidepresiva sertralinu na klonální raky mramorované na úrovni chování a biochemie (2019–2020, odpovědný řešitel M.Sc. Md. Shakhawate Hossain) z 080/2019/Z Použití alginátového nátěru ve spojení s esenciálními oleji k úpravě mikrobiálních společenstev a zlepšení kvality kapřích filetů uložených v chladu (2019–2020, odpovědný řešitel M.Sc. Ruoyi Hao) z 071/2019/Z Charakterizace diferenciace zárodečných buněk jesetera prostřednictvím třídění buněk a sekvenování RNA (2019–2020, odpovědný řešitel M.Sc. Xuan Xie) z 098/2019/Z Zesilovací činidla na rybách: účinnost dietních beta-glukanů a probiotik na zvýšení imunity sliznice amura bílého vůči oční infekci (2019–2020, odpovědný řešitel M.Sc. Bernard Erasmus) z 078/2019/Z Vařící se raci? Porovnání norování v podmínkách simulovaného sucha po ovlivnění znečištěním herbicidy (2019–2020, odpovědný řešitel M.Sc. Wei Guo) z 099/2019/Z Vliv PLGA mikročástic na indukci ovulace u candáta obecného (2019–2020, odpovědný řešitel Ing. Jindřiška Matějková)

85 03 VÝZKUM A EXCELENCE

PROJEKTY PODPOŘENÉ TECHNOLOGICKOU AGENTUROU ČR

Program Gama

z TG 03010027 – 01_11 Systém pro včasnou detekci nemocí ryb (2017–2019, odpovědný řešitel Ing. Petr Císař, Ph.D.) z TG03010027-2015V001 Individualizované monitorování chování pro bezpečnostní aplikace i-secure (2018–2019, odpovědný řešitel prof. RNDr. Dalibor Štys, CSc.) z TG03010027-2018V001 Konsolidace software jednoduchého mikroskopu velmi vysokého rozlišení Nano Truth (2018–2019, odpovědný řešitel Ing. Bc. Renata Štysová Rychtáriková, Ph.D.) z TG 03010027 – 02_23 Ověření metody, zařízení a aplikace pro fotografickou komoru a parametrizaci rybích experimentů (2018–2019, Ing. Jan Urban, Ph.D.) z TG03010027 – 01_09 Testování zařízení ke zlepšování kvality vody na odtoku z rybníku a substrátu k hodnocení kvality vody (2017–2019, odpovědný řešitel Ing. Ján Regenda, Ph.D.) z TG 03010027 – 01_10 Ověření a optimalizace metody stabilní produkce diploidních gamet pomocí náhradních rodičů pro účely triploidizace v akvakultuře (2017–2019, doc. Ing. Martin Pšenička, Ph.D.)

PROJEKTY PODPOŘENÉ JIHOČESKÝM KRAJEM

Programové dotace Jihočeského kraje

z 435-04-015/18 Podpora původních populací lipana podhorního a pstruha obecného v rybářském revíru Blanice vodňanská 4B (2018, odpovědný řešitel prof. Ing. Tomáš Randák, Ph.D.) z 458-01-028/18 Příspěvek na pořadatelství mezinárodního workshopu o nových virových chorobách kaprovitých ryb (2018, odpovědný řešitel MVDr. Veronika Piačková, Ph.D.) z 463-03-03/18 Rozvoj technického vzdělávání v Jihočeském kraji v oboru Ochrany vod a Rybářství (2018–2019, odpovědný řešitel Ing. Petr Dvořák, Ph.D.) z 435-03-001/19 Podpora původních populací lipana podhorního a pstruha obecného v rybářském revíru Blanice vodňanská 4B (2019, odpovědný řešitel prof. Ing. Tomáš Randák, Ph.D.) z 463-01-002/19 Ochrana vodních ekosystémů (2019, odpovědný řešitel PaedDr. Jiří Koleček)

MEZINÁRODNÍ VÝZKUMNÉ PROJEKTY

7. rámcový program EU a HORIZON 2020

z 613611 FishBOOST Improving European aquaculture by advancing selective breeding to the next level for the six main finfish species (2014–2019, odpovědný řešitel doc. Ing. Martin Kocour, Ph.D.) z 642893 Marie Curie projekt IMPRESS Inovované strategie produkce pro ohrožené sladkovodní druhy (2015–2018, odpovědný řešitel prof. Ing. Otomar Linhart, DrSc.) z 652831 AQUAEXCEL 2020 Aquaculture infrastructures for excellence in European fish research (2015–2020, odpovědný řešitel prof. Ing. Otomar Linhart, DrSc.)

INTERREG V-A: Rakousko – Česká republika

z KPF-01-031 Česko-rakouská spolupráce pro minimalizaci škod způsobených kormorány (2017–2018, odpovědný řešitel Ing. Petr Císař, Ph.D.) z KPF-01-016 Posilování spolupráce mezi JU a Verein für Fisch- und Gewässerökologie (2018– 2019, odpovědný řešitel PaedDr. Jiří Koleček)

86 FROV JU z KPF-01-017 Posilování spolupráce mezi JU a HLUW Yspertal v oblasti rybářství a ochrany vod (2018–2019, odpovědný řešitel PaedDr. Jiří Koleček) z KPF-01-108 Spolupráce JU a Bundesamt für Wasserwirtschaft – udržitelné využívání rybníků (2018–2019, odpovědný řešitel PaedDr. Jiří Koleček) z KPF-01-111 Přeshraniční spolupráce – matematické modelování multifyzikálních procesů (2018–2019, odpovědný řešitel Ing. Petr Císař, Ph.D.) z KPF-01-134 Spolupráce JU a Verein für Fisch-und Gewässerökologie, invazní, nepůvodní druhy (2019, odpovědný řešitel PaedDr. Jiří Koleček) z ATCZ133 Kompetenzzentrum MechanoBiologie in Regenerativer Medizin - Kompetenzzentrum MechanoBiologie (2017–2019, odpovědný řešitel prof. RNDr. Dalibor Štys, CSc.) z KPF-01-162 Spolupráce mezi JU a HLUW Yspertal – výuka a praxe 2019 (2019, odpovědný řešitel PaedDr. Jiří Koleček)

INTERREG V-A: Česká republika – Svobodný stát Sasko z 100314623 Přeshraniční monitoring biologických invazí jako nástroj pro ochranu sladkovodní biodiverzity (2017–2020, odpovědný řešitel Ing. Miloš Buřič, Ph.D.)

Zpracovala: Mgr. Michaela Šmídová

3.4. Publikační a vydavatelská činnost

2018

ČLÁNKY ZAHRNUTÉ V DATABÁZI WoS (celkem 121)

Adamek, M., Teitge, F., Jung-Schroers, V., Heling, M., Gela, D., Piačková, V., Kocour, M., Stein- hagen, D., 2018. Flavobacteria as secondary pathogens in carp suffering from koi sleepy disease. Journal of Fish Diseases 41: 1631–1642. (IF 2017 = 2,004; AIS 2017 = 0,418) AftabUddin, S., Roman, W.U., Hasan, C.K., Ahmed, M., Rahman, H., Siddique, M.A.M., 2018. First incidence of loose-shell syndrome disease in the giant tiger shrimp Penaeus mono- don from the brackish water ponds in Bangladesh. Journal of Applied Animal Research 46: 210–217. (IF 2017 = 0,826; AIS 2017 = 0,131) Andreji, J., Dvořák, P., 2018. Levels of selected contaminants in fish muscle from upper Nitra River. Neuroendocrinology Letters 39: 315–320. (IF 2017 = 0,754; AIS 2017 = 0,192) Arslan-Alaton, I., Koba, O., Olmez-Hanci, T., 2018. Removal of an X-Ray contrast chemical from tertiary treated wastewater: Investigation of persulfate-mediated photochemical treatment systems. Catalysis Today 313: 134–141. (IF 2017 = 4,667; AIS 2017 = 0,868) Blabolil, P., Duras, J., Jůza, T., Kočvara, L., Matěna, J., Muška, M., Říha, M., Vejřík, L., Holubová, M., Peterka, J., 2018. Assessment of burbot Lota lota (L. 1758) population sustainability in central European reservoirs. Journal of Fish Biology 92: 1545–1559. (IF 2017 = 1,702; AIS 2017 = 0,529) Bláha, M., Ložek, F., Buřič, M., Kouba, A., Kozák, P., 2018. Native European branchiobdellis on non-native crayfihes: Report from the Czech Republic. Journal of Limnology 77: 164–168. (IF 2017 = 1,277; AIS 2017 = 0,474) Blecha, M., Dzyuba, B., Boryshpolets, S., Horokhovatskyi, Y., Dadras, H., Malinovskyi, O., Sampels, S., Policar, T., 2018. Spermatozoa quality and sperm lipid composition in intensively cultured and wild burbot (Lota lota). Animal Reproduction Science 198: 129–136. (IF 2017 = 1,647; AIS 2017 = 0,421) Blomqvist, J., Pickova, J., KhaliliTilami, S., Sampels, S., Mikkelsen, N., Brandenburg, J., Sadgren, M., Passoth, V., 2018. Oleaginous yeast as a component in fish feed. Scientific Reports 8: 15945. (IF 2017 = 4,122; AIS 2017 = 1,356) Boccaletto, P., Siddique, M.A.M., Cosson, J., 2018. Proteomics: A valuable approach to elu- cidate spermatozoa post – testicular maturation in the endangered Acipenseridae family. Animal Reproduction Science 192: 18–27. (IF 2017 = 1,647; AIS 2017 = 0,421)

87 03 VÝZKUM A EXCELENCE

Bondarenko, V., Blecha, M., Policar, T., 2018. Changes of sperm morphology, volume, density, and motility parameters in northern pike during the spawning period. Fish Physiology and Biochemistry 44: 1591–1597. (IF 2017 = 1,735; AIS 2017 = 0,477) Boryshpolets, S., Kholodnyy, V., Cosson, J., Dzyuba, B., 2018. Fish sperm motility analysis: the central role of the flagellum. Reproduction, Fertility and Development 30: 833–841. (IF 2017 = 2,105; AIS 2017 = 0,568) Boulais, M., Suquet, M., Arsenault-Pernet, E.J., Malo, F., Queau, I., Pignet, P., Ratiskol, D., Le Grand, J., Huber, M., Cosson, J., 2018. pH controls spermatozoa motility in the Pacific oyster (Crassostrea gigas). Biology Open 7: bio031427. (IF 2017 = 2,217; AIS 2017 = 0,937) Burkina, V., Sakalli, S., Pilipenko, N., Žlábek, V., Zamaratskaia, G., 2018. Effect of human pharmaceuticals common to aquatic environments on hepatic CYP1A and CYP3A-like activities in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss): An in vitro study. Chemosphere 205: 380–386. (IF 2017 = 4,427; AIS 2017 = 0,869) Burkina, V., Sakalli, S., Zlabek, V., Zamaratskaia, G., 2018. CYP1A1 activity in rainbow trout is inhibited by the environmental pollutant p-cresol. Environmental Toxicology and Pharmacol- ogy 62: 199–202. (IF 2017 = 2,776; AIS 2017 = 0,533) Burkina, V., Zamaratskaia, G., Sakalli, S., Pham, T.G., Kodes, V., Grabic, R., Velíšek, J., Turek, J., Kolářová, J., Žlábek, V., Randák., T., 2018. Complex effect of pollution on fish in major rivers in the Czech Republic. Ecotoxicology and Environmental Safety 164: 92–99. (IF 2017 = 3,974; AIS 2017 = 0,738) Buřič, M., Grabicová, K., Kubec, J., Kouba, A., Kuklina, I., Kozák, P., Grabic, R., Randák, T., 2018. Environmentally relevant concentrations of tramadol and citalopram alter behaviour of an aquatic invertebrate. Aquatic Toxicology 200: 226–232. (IF 2017 = 3,884; AIS 2017 = 0,803) Císař, P., Saberioon, M., Kozák, P., Pautsina, A., 2018. Fully contactless system for crayfish heartbeat monitoring: Undisturbed crayfish as bio-indicator. Sensors and Actuators B: Chem- ical 255: 29-34. (IF 2017 = 5,667; AIS 2017 = 0,787) Czölderová, M., Behúl, M., Filip, J., Zajíček, P., Grabic, R., Vojs-Staňová, A., Gála, M., Kerekeš, K., Híveš, J., Ryba, J., Rybanská, M., Brandeburová, P., Mackuľak, T., 2018. 3D printed polyvinyl alcohol ferrate(VI) capsules: Effective means for the removal of pharmaceuticals and illicit drugs from wastewater. Chemical Engineering Journal 349: 269–275. (IF 2017 = 6,735; AIS 2017 = 1,084) Červený, D., Grabic, R., Fedorova, G., Grabicová, K., Turek, J., Žlábek, V., Randák, T., 2018. Fate of perfluoroalkyl substances within a small stream food web affected by sewage effluent. Water Research 134: 226–233. (IF 2017 = 7,051; AIS 2017 = 1,500) de Siqueira-Silva, D.H., Saito, T., dos Santos-Silva, A.P., da Silva Costa, R., Pšenička, M., Yasui, G.S., 2018. Biotechnology applied to fish reproduction: tools for conservation. Fish Physiolo- gy and Biochemistry 44: 1469–1485. (IF 2017 = 1,735; AIS 2017 = 0,477) Demoy-Schneider, M., Schmitt, N., Le Pennec, G., Suquet, M., Cosson, J., 2018. Quality assessment of cryopreserved black-lip pearl oyster Pinctada margaritifera spermatozoa. Aquacul- ture 497: 278–286. (IF 2017 = 2,710; AIS 2017 = 0,602) Durinikova, E., Plava, J., Tyciakova, S., Skvara, P., Vojs Staňová, A., Kozovska, Z., Kucerova, L., Matuskova, M., 2018. Cytotoxic response of 5-fluorouracil-resistant cells to gene- and cell- directed enzyme/prodrug treatment. Cancer Gene Therapy 25: 285–299. (IF 2017 = 4,044; AIS 2017 = 0,657) Dvořák, P., Andreji, J., Faltová Leitmanová, I., Petrách, F., Mráz, J., 2018. Accumulation of selected metals pollution in aquatic ecosystems in the Smeda river (Czech Republic). Neuroendo- crinology Letters 39: 380–384. (IF 2017 = 0,754; AIS 2017 = 0,192) Fatira, E., Havelka, M., Labbé, C., Depincé, A., Iegorova, V., Pšenička, M., Saito, T., 2018. Appli- cation of interspecific Somatic Cell Nuclear Transfer (iSCNT) in sturgeons and an unexpect- edly produced gynogenetic sterlet with homozygous quadruple haploid. Scientific Reports 8: 5997. (IF 2017 = 4,122; AIS 2017 = 1,356) Fér, M., Kodešová, R., Golovko, O., Schmidtová, Z., Klement, A., Nikodem. A., Kočárek, M., Grabic, R., 2018. Sorption of atenolol, sulfamethoxazole and carbamazepine onto soil ag- gregates from the illuvial horizonof the Haplic Luvisol on loess. Soil and Water Research 13: 177–183. (IF 2017 = 0,882; AIS 2017 = 0,220) Gebauer, R., Divíšek, J., Buřič, M., Večeřa, M., Kouba, A., Drozd, B., 2018. Distribution of alien animal species richness in the Czech Republic. Ecology and Evolution 8: 4455–4464. (IF 2017 = 2,340; AIS 2017 = 0,927)

88 FROV JU

Gebauer, R., Veselý, L., Kouba, A., Buřič, M., Drozd, B., 2018. Forecasting impact of existing and emerging invasive gobiids under temperature change using comparative functional responses. Aquatic Invasions 13: 289–297. (IF 2017 = 1,976; AIS 2017 = 0,713) Gholizadeh, A., Saberioon, M., Ben-Dor, E., Borůvka, L., 2018. Monitoring of selected soil contaminants using proximal and remote sensing techniques: Background, state-of-the-art and future perspectives. Critical Reviews in Environmental Science and Technology 48: 243–278. (IF 2017 = 7,683; AIS 2017 = 1,519) Gholizadeh, A., Saberioon, M., Carmon, N., Boruvka, L., Ben-Dor, E., 2018. Examining the performance of PARACUDA-II Data-mining engine versus selected techniques to model soil carbon from reflectance spectra. Remote Sensing 10: 1172. (IF 2017 = 3,406; AIS 2017 = 0,872) Gholizadeh, A., Zizala, D., Saberioon, M., Boruvka, L., 2018. Soil organic carbon and texture retrieving and mapping using proximal, airborne and Sentinel-2 spectral imaging. Remote Sensing of Environment 218: 89–103. (IF 2017 = 6,457; AIS 2017 = 1,977) Golovko, O., Šauer, P., Fedorova, G., Kocour Kroupová, H., Grabic, R., 2018. Determination of progestogens in surface and waste water using SPE extraction and LC-APCI/APPI-HRPS. Sci- ence of the Total Environment 621: 1066–1073. (IF 2017 = 4,610; AIS 2017 = 1,032) Grabicová, K., Vojs Staňová, A., Koba Ucun, O., Bořík, A., Randák, T., Grabic, R., 2018. Develop- ment of a robust extraction procedure for the HPLC-ESI-HRPS determination of multi-residual pharmaceuticals in biota samples. Analytica Chimica Acta 1022: 53–60. (IF 2017 = 5,123; AIS 2017 = 0,990) Hematyar, N., Másílko, J., Mráz, J., Sampels, S., 2018. Nutritional quality, oxidation, and sensory parameters in fillets of common carp Cyprinus( carpio L.) influenced by frozen storage (-20 °C). Journal of Food Processing and Preservation 42: e13589. (IF 2017 = 1,309; AIS 2017 = 0,261) Horokhovatskyi, Y., Dietrich, M.A., Lebeda, I., Fedorov, P., Rodina, M., Dzyuba, B., 2018. Cryo- preservation effects on a viable sperm sterlet Acipenser( ruthenus) subpopulation obtained by a Percoll density gradient method. PLoS One 13: e0202514. (IF 2017 = 2,766; AIS 2017 = 1,000) Hossain, M.S., Patoka, J., Kouba, A., Buřič, M., 2018. Clonal crayfish as biological model: a review on marbled crayfish. Biologia 73: 841–855. (IF 2017 = 0,696; AIS 2017 = 0,182) Chupani, L., Niksirat, H., Lünsmannb, V., Haange, S.-B., von Bergen, M., Jehmlich, N., Zusková, E., 2018. Insight into the modulation of intestinal proteome of juvenile common carp (Cypri- nus carpio L.) after dietary exposure to ZnO nanoparticles. Science of the Total Environment 613–614: 62–71. (IF 2017 = 4,610; AIS 017 = 1,032) Chupani, L., Niksirat, H., Velíšek, J., Stará, A., Hradilová, Š., Kolařík, J., Panáček, A., Zusková, E., 2018. Chronic dietary toxicity of zinc oxide nanoparticles in common carp (Cyprinus carpio L.): Tissue accumulation and physiological responses. Ecotoxicology and Environmental Safe- ty 147: 110–116. (IF 2017 = 3,974; AIS 2017 = 0,738) Iegorova, V., Havelka, M., Pšenička, M., Saito, T., 2018. First evidence of viable progeny from three interspecific parents in sturgeon. Fish Physiology and Biochemistry 44: 1541–1550. (IF 2017 = 1,735; AIS 2017 = 0,477) Iegorova, V., Pšenička, M., Lebeda, Y., Rodina, M., Saito, T., 2018. Polyspermy produces viable haploid/diploid mosaics in sturgeon. Biology of Reproduction 99: 695–706. (IF 2017 = 3,184; AIS 2017 = 1,007) Ivanová, L., Macluľak, T., Grabic, R., Golovko, O., Koba, O., Vojs Staňová, A., Szabová, P., Grenčíková, A., Bodík, I., 2018. Pharmaceuticals and illicit drugs – A new threat to the application of sewage sludge in agriculture. Science of the Total Environment 634: 606–615. (IF 2017 = 4,610; AIS 2017 = 1,032) Joshi, K.D., Dasa, S.C.S., Pathaka, R.K., Khana, A., Sarkar, U.K., Roy, K., 2018. Pattern of reproductive biology of the endangered golden mahseer Tor putitora (Hamilton 1822) with special reference to regional climate change implications on breeding phenology from lesser Himalayan region, India. Journal of Applied Animal Research 46: 1289–1295. (IF 2017 = 0,826; AIS 2017 = 0,131) KhaliliTilami, S., Sampels, S., 2018. Nutritional value of fish: lipids, proteins, vitamins, and min- erals. Reviews in Fisheries Science & Aquaculture 26: 243–253. (IF 2017 = 4,750; AIS 2017 = 0,947) Khalili Tilami, S., Sampels, S., Zajíc, T., Krejsa, J., Másílko, J., Mráz, J., 2018. Nutritional value of several commercially important river fish species from the Czech Republic. PeerJ 6: e5729. (IF 2017 = 2,118; AIS 2017 = 0,820)

89 03 VÝZKUM A EXCELENCE

Khendek, A., Chakraborty, A., Roche, J., Ledoré, Y., Personne, A., Policar, T., Żarski, D., Mandiki, R., Kestemont, P., Milla, S., Fontaine, P., 2018. Rearing conditions and life history influence the progress of gametogenesis and reproduction performances in pikeperch males and females. Animal 12: 2335–2346. (IF 2017 = 1,870; AIS 2017 = 0,608) Klement, A., Kodešová, R., Bauerová, M., Golovko, O., Kočárek, M., Fér, M., Koba, O., Nikodem, A., Grabic, R., 2018. Sorption of citalopram, irbesartan and fexofenadine in soils: Estimation of sorption coefficients from soil properties. Chemosphere 195: 615–623. (IF 2017 = 4,427; AIS 2017 = 0,869) Koba, O., Grabicová, K., Červený, D., Turek, J., Kolářová, J., Randák, T., Žlábek, V., Grabic, R., 2018. Transport of pharmaceuticals and their metabolites between water and sediments as a further potential exposure for aquatic organisms. Journal of Hazardous Materials 342: 401–407. (IF 2017 = 6,434; AIS 2017 = 1,182) Kocour Kroupová, H., Valentová, O., Svobodová, Z., Šauer, P., Máchová, J., 2018. Toxic effects of nitrite on freshwater organisms: a review. Reviews in Aquaculture 10: 525–542. (IF 2017 = 7,139; AIS 2017 = 1,552) Kouba, A., Lunda, R., Hlaváč, D., Kuklina, I., Hamáčková, J., Randák, T., Kozák, P., Koubová, A., Buřič, M., 2018. Vermicomposting of sludge from recirculating aquaculture system using Eisenia andrei: Technological feasibility and quality assessment of end-products. Journal of Cleaner Production 117: 655–673. (IF 2017 = 5,651; AIS 2017 = 0,816) Křišťan, J., Zarski, D., Blecha, M., Policar, T., Malinovskyi, O., Samarin, A.M., Palinska-Zarska, K., Nowosad, J., Krejszeff, S., Kucharczyk, D., 2018. Fertilizing ability of gametes at different post-activation times and the sperm-oocyte-ratio in the artificial reproduction of pikeperch Sander lucioperca. Aquaculture Research 49: 1383–1388. (IF 2017 = 1,475; AIS 2017 = 0,352) Kuklina, I., Ložek, F., Císař, P., Kouba, A., Kozák, P., 2018. Crayfish can distinguish between natural and chemical stimuli as assessed by cardiac and locomotor reactions. Environmental Science and Pollution Research 25: 8396–8403. (IF 2017 = 2,800; AIS 2017 = 0,558) Kumar, G., 2018. Mercury concentrations in fresh and canned tuna: A Review. Reviews in Fisher- ies Science & Aquaculture 26: 111–120. (IF 2017 = 4,750; AIS 2017 = 0,947) Kumar, U., Rajaee, A.H., Idris, M.H., Nesarul, M.H., Siddique, M.A.M., Abu Hena, M.K., 2018. Length-weight relationship of Secutor interruptus (Valencennes, 1835) and Opisthopterus tardoore (Cuvier, 1829) from the South China Sea, Sarawak. Journal of Applied Ichthyology 34: 703–705. (IF 2017 = 0,774; AIS 2017 = 0,232) Lebeda, I., Steinbach, Ch., Flajšhans, M., 2018. Flow cytometry for assessing the efficacy of interspecific gynogenesis induction in sturgeon. Journal of Fish Biology 92: 1819–1831. (IF 2017 = 1,702; AIS 2017 = 0,526) Lépesová, K., Kraková, L., Pangallo, D., Medveďová, A., Olejníková, P., Mackuľak, T., Tichý, J., Gr- abic, R., Birošová, L., 2018. Prevalence of antibiotic-resistant coliform bacteria, Entrococcus spp. and Staphylococcus spp. in wastewater sewerage biofilm. Journal of Global Antimicrobial Resistance 14: 145–151. (IF 2017 = 2,022; AIS 2017 = 0,498) Li, P., Xi, M.D., Du, H., Qiao, X.M., Liu, Z.G., Wei, Q.W., 2018. Antioxidant supplementation, effect on post-thaw spermatozoan function in three sturgeon species. Reproduction in Do- mestic Animals 53: 287–295. (IF 2017 = 1,422; AIS 2017 = 0,375) Linhartová, Z., Havelka, M., Pšenička, M., Flajšhans, M., 2018. Interspecific hybridization of sturgeon species affects differently their gonadal development. Czech Journal of Animal Sci- ence 63: 1–10. (IF 2017 = 0,955; AIS 2017 = 0,222) Linhartová, Z., Krejsa, J., Zajíc, T., Másílko, J., Sampels, S., Mráz, J., 2018. Proximate and fatty acid composition of 13 important freshwater fish species in central Europe. Aquaculture In- ternational 26: 695–711. (IF 2017 = 1,283; AIS 2017 = 0,344) Linhartová, Z., Lunda, R., Másílko, J., Dvořák, P., Lundová, K., Stejskal, V., Matoušek, J., Mráz, J., 2018. Impact of photostimulation for delayed maturity on flesh quality of brook trout Salve-( linus fontinalis) stored under refrigerated conditions. Aquaculture Research 49: 3817–3829. (IF 2017 = 1,475; AIS 2017 = 0,352) Lipták, B., Liptáková, P., Veselý, L., Kouba, A., 2018. Length frequency and morphometric analysis of the non-indigenous red-rimmed melania (Melanoides tuberculata) populations in Slo- vakia. Biologia 73: 505–511. (IF 2017 = 0,696; AIS 2017 = 0,182) Lundová, K., Kouřil, J., Sampels, S., Matoušek, J., Stejskal, V., 2018. Growth, survival rate and fatty acid composition of sterlet (Acipenser ruthenus) larvae fed fatty acid-enriched Artemia nauplii. Aquaculture Research 49: 3309–3318. (IF 2017 = 1,475; AIS 2017 = 0,352)

90 FROV JU

Malinovskyi, O., Veselý, L., Blecha, M., Křišťan, J., Policar, T., 2018. The substrate selection and spawning behaviour of pikeperch Sander lucioperca L. broodstock under pond conditions. Aquaculture Research 49: 3541–3547. (IF 2017 = 1,475; AIS 2017 = 0,352) Mohagheghi Samarin, A., Sampels, S., Krzyskow, A., Burkina, V., Křišťan, J., Gela, D., Flajšhans, M., Policar, T., Samarin, A.M., 2018. Egg oxidation status, antioxidant enzyme activities, lipid classes, fatty acid composition profile and embryo survival rates duringin vitro oocyte ageing in tench Tinca tinca (Linnaeus, 1758). Aquaculture Research 49: 2305–2316. (IF 2017 = 1,475; AIS 2017 = 0,352) Mohagheghi Samarin, A., Sampels, S., Policar, T., Rodina, M., Hematyar, N., Mohagheghi Sa- marin, A., 2017. mRNA abundance changes during in vitro oocyte ageing in African catfish Clarias gariepinus (Burchel, 1822). Aquaculture Research 49: 1037–1045. (IF 2017 = 1,475; AIS 2017 = 0,352) Niksirat, H., Steinbach, Ch., 2018. Ultracytochemical visualization of calcium distribution in heart cells and erythrocytes of zebrafishDanio rerio. Micron 111: 19–27. (IF 2017 = 1,728; AIS 2017 = 0,549) Novák, J., Vrana, B., Rusina, T., Okonski, K., Grabic, R., Neale, P.A., Escher, B.I., Macová, M., Ait- Aissa, S., Creusot, N., Allan, I., Hilscherová, K., 2018. Effect-based monitoring of the Danube River using mobile passive sampling. Science of the Total Environment 636: 1608–1619. (IF 2017 = 4,610; AIS 2017 = 1,032) Palaiokostas, C., Kocour, M., Prchal, M., Houston, R.D., 2018. Accuracy of genomic evaluations of juvenile growth rate in common carp (Cyprinus carpio) using genotyping by sequencing. Frontiers in Genetics 9: 82. (IF 2017 = 4,151; AIS 2017 = 2,287) Palaiokostas, Ch., Roblede, D., Veselý, T., Prchal, M., Pokorová, D., Piačková, V., Pojezdal, L., Kocour, M., Houston, R.D., 2018. Mapping and sequencing of a significant quantitative trait locus affecting resistance to koi herpesvirus in common carp. G3 – Genes Genomes Genetics 8: 3507–3513. (IF 2017 = 2,742; AIS 2017 = 1,221) Papáček, Š., Jablonský, J., Petera, K., 2018. Advanced integration of fluid dynamics and photo- synthetic reaction kinetics for microalgae culture systems. BMC Systems Biology 12 (Suppl 5): 93. (IF 2017 = 2,050; AIS 2017 = 0,887) Patoka, J., Magalhães, A.L.B., Kouba, A., Faulkes, Z., Jerikho, R., Vitule, J.R.S., 2018. Invasive aquatic pets: failed policies increase risks of harmful invasions. Biodiversity and Conservation 27: 3037–3046. (IF 2017 = 2,828; AIS 2017 = 0,913) Patoka, J., Wardiatno, Y., Mashar, A., Yonvitner, Wowor, D., Jerikho, R., Takdir, M., Purnamasa- ri, L., Petrtýl, M., Kalous, L., Kouba, A., Bláha, M., 2018. Redclaw crayfish, Cherax quadricarinatus (von Martens, 1868), widespread throughout Indonesia. BioInvasions Records 7: 185–189. (IF 2017 = 1,189; AIS 2017 = 0,544) Pham, T.G., Sakalli, S., Fedorova, G., Khalili Tilami, S., Bakal, T., Najmanová, L., Grabicová, K., Kolářová, J., Sampels, S., Zamaratskaia, G., Grabic, R., Randák, T., Žlábek, V., Burkina, V., 2018. Biomarker response, health indicators, and intestinal microbiome composition in wild brown trout (Salmo trutta m. fario L.) exposed to a sewage treatment plant effluent-dominated stream. Science of the Total Environment 625: 1494–1509. (IF 2017 = 4,610; AIS 2017 = 1,032) Pilipenko, N., Rasmussen, M.K., Doran, O., Zamaratskaia, G., 2018. 7-Hydroxylation of warfarin is strongly inhibited by sesamin, but not by episesamin, caffeic and ferulic acids in human hepatic microsomes. Food and Chemical Toxicology 113: 14–18. (IF 2017 = 3,977; AIS 2017 = 0,722) Pocherniaieva, K., Sidova, M., Havelka, M., Saito, T., Pšenička, M., Sindelka, R., Kašpar, V., 2018. Comparison of oocyte mRNA localization patterns in sterlet Acipenser ruthenus and African clawed frog Xenopus laevis. Journal of Experimental Zoology Part B, Molecular and Developmental Evolution 330: 181–187. (IF 2017 = 2,432; AIS 2017 = 0,770) Policar, T., Bondarenko, V., Bezusyj, O., Stejskal, V., Křišťan, J., Malinovskyi, O., Imentai, A., Ble- cha, M., Pylypenko, Y., 2018. Crayfish in central and southern Ukraine with special focus on populations of indigenous crayfishAstacus pachypus (Rathke, 1837) and their conservation needs. Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems 28: 6–16. (IF 2017 = 2,988; AIS 2017 = 0,753) Pospíchal, A., Pokorová, D., Veselý, T., Piačková, V., 2018. Susceptibility of the topmouth gudgeon (Pseudorasbora parva) to CyHV-3 under no-stress and stress conditions. Veterinarni Medicina 63: 229–239. (IF 2017 = 0,434; AIS 2017 = 0,178)

91 03 VÝZKUM A EXCELENCE

Prchal, M., Bugeon, J., Vandeputte, M., Kause, A., Vergnet, A., Zhao, J., Gela, D., Genestout, L., Bestin, A., Haffray, P., Kocour, M., 2018. Potential for genetic improvement of the main slaughter yields in common carp with in vivo morphological predictors. Frontiers in Genetics 9:283. (IF 2017 = 4,151; AIS 2017 = 2,287) Prchal, M., Kause, A., Vandeputte, M., Gela, D., Allamellou, J.-M., Kumar, G., Bestin, A., Bugeon, J., Zhao, J., Kocour, M., 2018. The genetics of overwintering performance in two-year old common carp and its relation to performance until market size. PLoS One 13: e0191624. (IF 2017 = 2,766; AIS 2017 = 1,000) Prchal, M., Vandeputte, M., Gela, D., Doležal, M., Buchtová, H., Rodina, M., Flajšhans, M., Ko- cour, M., 2018. Estimation of genetic parameters of fatty acids composition in flesh of market size common carp (Cyprinus carpio L.) and their relation to performance traits revealed that selective breeding can indirectly affect flesh quality. Czech Journal of Animal Science 63: 280–291. (IF 2017 = 0,955; AIS 2017 = 0,222) Příborský, J., Velíšek, J., 2018. A review of three commonly used fish anesthetics. Reviews in Fisheries Science & Aquaculture 26: 417–442. (IF 2017 = 4,750; AIS 2017 = 0,947) Pšenička, M., 2018. Rapid de-adhesion of northern pike Esox lucius eggs using sodium hy- pochlorite. Fish Physiology and Biochemistry 44: 1535–1539. (IF 2017 = 1,735; AIS 2017 = 0,477) Putra, M.D., Bláha, M., Wardiatno, Y., Kristanti, M., Yonvitner, Jerikho, R., Kamal, M.M., Mo- jžišová, M., Bystřický, P.K., Kouba, A., Kalous, L., Petrusek, A., Patoka, J., 2018. Procambarus clarkii (Girard, 1852) and crayfish plague as new threats for biodiversity in Indonesia. Aquatic Conservation – Marine and Freshwater Ecosystems 28: 1434–1440. (IF 2017 = 2,988; AIS 2017 = 0,753) Rai, K., Sun, Y., Shaliutina-Kolešová, A., Nian, R., Xian, M., 2018. Proteins: natural polymers for tissue engineering. Journal of Biomaterials and Tissue Engineering 8: 295–308. (IF 2017 = 0,781; AIS 2017 = 0,105) Rodrigues, A.C.M., Bordalo, M.D., Golovko, O., Koba, O., Barata, C., Soares, A.M.V.M., Pestana, J.L.T., 2018. Combined effects of insecticide exposure and predation risk on freshwater detri- tivores. Ecotoxicology 27: 794–802. (IF 2017 = 1,987; AIS 2017 = 0,570) Rodrigues, A., Machado, A., Bordalo, M., Saro, L., Simão, F., Rocha, R., Golovko, O., Žlábek, V., Barata, C., Soares, A., Pestana, J., 2018. Invasive species mediate insecticide effects on community and ecosystem functioning. Environmental Science & Technology 52: 4889−4900. (IF 2017 = 6,653; AIS 2017 = 1,646) Roche, J., Żarski, D., Khendek, A., Ben Ammar, I., Broquard, C., Depp, A., Ledoré, Y., Policar, T., Fontaine, P., Milla, S., 2018. D1, but not D2, dopamine receptor regulates steroid levels during the final stages of pikeperch gametogenesis. Animal 12: 2587–2597. (IF 2017 = 1,870; AIS 2017 = 0,608) Rychtáriková, R., Korbel, J., Macháček, J., Štys, D., 2018. Point divergence gain and multidimen- sional data sequences analysis. Entropy 20: 106. (IF 2017 = 2,305; AIS 2017 = 0,564) Saberioon, M., Císař, P., 2018. Automated within tank fish mass estimation using infrared reflection system. Computers and Electronics in Agriculture 150: 484–492. (IF 2017 = 2,427; AIS 2017 = 0,558) Saberioon, M., Císař, P., Labbé, L., Souček, P., Pelisser, P., Kerneis, T., 2018. Comparative performance analysis of support vector machine, random forest, logistic regression and k-nearest neighbours in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) classification using image-based features. Sensors 18: 1027. (IF 2017 = 2,475; AIS 2017 = 0,554) Saito, T., Güralp, H., Iegorova, V., Rodina, M., Pšenička, M., 2018. Elimination of primordial germ cells in sturgeon embryos by ultraviolet irradiation. Biology of Reproduction 99: 556– 564. (IF 2017 = 3,184; AIS 2017 = 1,007) Sakalli, S., Burkina, V., Pilipenko, N., Zlabek, V., Zamaratskaia, G., 2018. In vitro effects of di- osmin, naringenin, quercetin and indole-3-carbinol on fish hepatic CYP1A1 in the presence of clotrimazole and dexamethasone. Chemosphere 192: 105–112. (IF 2017 = 4,427; AIS 2017 = 0,869) Sakalli, S., Pham, T.G., Burkina, V., Zamaratskaia, G., Rasmussen, M.K., Bakal, T., Khalili Tilami, S., Sampels, S., Kolářová, J., Grabic, R., Turek, J., Randák, T., Žlábek, V., 2018. The effects of sewage treatment plant effluents on hepatic and intestinal biomarkers in common carp (Cyprinus carpio). Science of the Total Environment 635: 1160–1169. (IF 2017 = 4,610; AIS 2017 = 1,032)

92 FROV JU

Saraiva A.S., Sarmento, R.A., Golovko, O., Randák, T., Pestana J.L.T., Soares, A.M.V.M., 2018. Lethal and sub-lethal effects of cyproconazole on freshwater organisms: a case study with Chironomus riparius and Dugesia tigrina. Environmental Science and Pollution Research 25: 12169–12176. (IF 2017 = 2,800; AIS 2017 = 0,558) Sarkar, U.K., Roy, K., Karnatak, G., Nandy, S.K., 2018. Adaptive climate change resilient indigenous fisheries strategies in the floodplain wetlands of West Bengal, India. Journal of Water and Climate Change 9: 449–462. (IF 2017 = 0,809; AIS 2017 = 0,224) Sedlar, K., Koscova, P., Vasylkivska, M., Branska, B., Kolek, J., Kupkova, K., Patakova, P., Provaznik, I., 2018. Transcription profiling of butanol producerClostridium beijerinckii NRRL B-598 using RNA-Seq. BMC Genomics 19: 415. (IF 2017 = 3,730; AIS 2017 = 1,347) Shaliutina-Kolešová, A., Rui, N., Ashtiani, S., Rodina, M., Cosson, J., Linhart, O., 2018. Oxi- dative stress and antioxidant enzyme defence system in seminal plasma of common carp (Cyprinus carpio) and rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) during spawning season. Czech Journal of Animal Science 63: 78–84. (IF 2017 = 0,955; AIS 2017 = 0,222) Stará, A., Kouba, A., Velíšek, J., 2018. Biochemical and histological effects of sub-chronic exposure to atrazine in crayfishCherax destructor. Chemico-Biological Interactions 291: 95–102 (IF 2017 = 3,296; AIS 2017 = 0,660) Stejskal, V., Matoušek, J., Prokešová, M., Podhorec, P., Šebesta, R., Drozd, B., 2018. Combined effect of weaning time and co-feeding duration on growth and survival of peledCoregonus peled (Gmelin) larvae. Aquaculture Nutrition 24:434–441. (IF 2017 = 2,078; AIS 2017 = 0,488) Stejskal, V., Matoušek, J., Šebesta, R., Prokešová, M., Vanina, T., Podhorec, P., 2018. Prevalence of deformities in intensively reared peled Coregonus peled and comparative morphometry with pond-reared fish. Journal of Fish Diseases 41: 375–381. (IF 2017 = 2,004; AIS 2017 = 0,418) Sterniša, M., Dvořák, P., Lunda, R., Linhartová, Z., Smole Možina, S., Mráz, J., 2018. Bleeding of common carp (Cyprinus carpio) improves sensory quality of fillets and slows oxidative and microbiological changes during refrigerated aerobic storage. Food Technology and Biotech- nology 56: 524–532. (IF 2017 = 1,168; AIS 2017 = 0,307) Šauer, P., Bořík, A., Golovko, O., Grabic, R., Vojs Staňová, A., Valentová, O., Stará, A., Šandová, M., Kocour Kroupová, H., 2018. Do progestins contribute to (anti-)androgenic activities in aquatic environments? Environmental Pollution 242: 417–425. (IF 2017 = 4,358; AIS 2017 = 1,118) Šauer, P., Stará, A., Golovko, O., Valentová, O., Bořík, A., Grabic, R., Kocour Kroupová, H., 2018. Two synthetic progestins and natural progesterone are responsible for most of the progestagenic activities in municipal wastewater treatment plant effluents in the Czech and Slovak republics. Water Research 137: 64–71. (IF 2017 = 7,051; AIS 2017 = 1,500) Šebesta, R., Kucharczyk, D., Nowosad, J., Sikora, M., Stejskal, V., 2018. Effect of temperature on growth and survival of maraena whitefishCoregonus maraena (Bloch 1779) larvae in controlled conditions. Aquacutlture Research 49: 3151–3157. (IF 2017 = 1,475; AIS 2017 = 0,352) Thøgersen, R., Petrat-Melin, B., Zamaratskaia, G., Grevsen, K., Young, J.F., Rasmussen, M.K., 2018. In vitro effects of rebaudioside A, stevioside and steviol on porcine cytochrome p450 expression and activity. Food Chemistry 258: 245–253. (IF 2017 = 4,946; AIS 2017 = 0,899) Turek, J., Žlábek, V., Velíšek, J., Lepič, P., Červený, D., Randák, T., 2018. Influence of geographic origin on post-stocking survival and condition of European grayling (Thymallus thymallus) in a small river. Aquatic Living Resources 31: 29. (IF 2017 = 0,525; AIS 2017 = 0,340) van Nuijs, A.L.N., Lai, F.Y., Been, F., Andres-Costa, M.J., Barron, L., Baz-Lomba, J.A., Berset, J.-D., Benaglia, L., Bijlsma, L., Burgard, D., Castiglioni, S., Christophoridis, Ch., Covaci, A., de Voogt, P., Emke, E., Fatta-Kassinos, D., Fick, J., Hernandez, F., Gerber, C., González-Marino, I., Grabic, R., Gunnar, T., Kannan, K., Karolak, S., Kasprzyk-Hordern, B., Kokot, Z., Krizman-Matasic, I., Li, A., Li, X., Löve, A.S.C., Lopez de Alda, M., McCall, A.-K., Meyer, M.R., Oberacher, H., O´Brien, J., Quintana, J.B., Reid, M., Schneider, S., Simoes, S.S., Thomaidis, N.S., Thomas, K., Yargeau, V., Ort, Ch., 2018. Multi-year inter-laboratory exercises for the analysis of illicit drugs and metabolites in wastewater: Development of a quality control system. Trends in Analytical Chemistry 103: 34–43. (IF 2017 = 7,034; AIS 2017 = 1,625) Velíšek, J., Stará, A., 2018. Effect of thiacloprid on early life stages of common carp Cyprinus( carpio). Chemosphere 194: 481–487 (IF 2017 = 4,427; AIS 2017 = 0,869)

93 03 VÝZKUM A EXCELENCE

Velíšek, J., Stará, A., Zusková, E., Kubec, J., Buřič, M., Kouba, A., 2018. Chronic toxicity of metolachlor OA on growth, ontogenetic development, antioxidant biomarkers and histopatholo- gy of early life stages of marbled crayfish. Science of the Total Environment 643: 1456–1463. (IF 2017 = 4,610; AIS 2017 = 1,032) Vrtílek, M., Žák, J., Pšenička, M., Reichard, M., 2018. Extremely rapid maturation of a wild Afri- can annual fish. Current Biology 28: R822–R824. (IF 2017 = 9,251; AIS 2017 = 4,754) Wang, M., Wang, Y., Baloch, A.R., Pan, Y.-Y., Tian, L., Xu, F., Chen, S., Zeng, Q.-Y., 2018. Chuzan virus in yaks, Qinghai-Tibetan Plateau, China. Emerging Infectious Diseases 24: 2371–2373. (IF 2017 = 7,422; AIS 2017 = 2,562) Wang, M., Wang, Y., Baloch, A.R., Pan, Y., Tian, L., Xu, F., Shivaramu, S., Chen, S., Zeng, Q., 2018. Detection and genetic characterization of porcine deltacoronavirus in Tibetan pigs surrounding the Qinghai-Tibet Plateau of China. Transboundary and Emerging Diseases 65: 363–369. (IF 2017 = 3,504; AIS 2017 = 0,822) Wang, M., Wang, Y., Baloch, A.R., Pan, Y., Xu, F., Tian, L., Zeng, Q., 2018. Molecular epidemiol- ogy and characterization of bovine leukemia virus in domestic yaks (Bos grunniens) on the Qinghai-Tibet Plateau, China. Archives of Virology 163: 659–670. (IF 2017 = 2,160; AIS 2017 = 0,558) Xi, M.D., Li, P., Du, H., Qiao, X.M., Liu, Z.G., Wei, Q.W., 2018. Disaccharide combinations and the expression of enolase3 and plasma membrane Ca2+ ATPase isoform in sturgeon sperm cryopreservation. Reproduction in Domestic Animals 53: 472–483. (IF 2017 = 1,422; AIS 2017 = 0,375) Xi, M.D., Li, P., Du, H., Qiao, X.M., Liu, Z.G., Wei, W.Q., 2018. Geranylgeranylacetone induction of HSP90α exerts cryoprotective effect onAcipenser sinensis sperm. Animal Reproduction Science 193: 19–25. (IF 2017 = 1,647; AIS 2017 = 0,421) Xin, M., Shaliutina-Kolešová, A., Sterba, J., Konik, P., Boryshpolets, S., Rodina, M., Li, P., Nian, R., Linhart, O., 2018. Impact of cryopreservation on sterlet, Acipenser ruthenus sperm motility and proteome. Animal Reproduction Science 192: 280–289. (IF 2017 = 1,647; AIS 2017 = 0,421) Xin, M., Sterba, J., Shaliutina-Kolešová, A., Dzyuba, B., Lieskovska, J., Boryshpolets, S., Sid- dique, M.A.M., Kholodnyy, V., Lebeda, I., Linhart, O., 2018. Protective role of antifreeze proteins on sterlet (Acipenser ruthenus) sperm during cryopreservation. Fish Physiology and Biochemistry 44: 1527–1533. (IF 2017 = 1,735; AIS 2017 = 0,477) Xin, M., Tučková, V., Rodina, M., Kholodnyy, V., Dadras, H., Boryshpolets, S., Shaliuti- na-Kolešová, A., Linhart, O., 2018. Effects of antifreeze proteins on cryopreserved sterlet (Acipenser ruthenus) sperm motility variables and fertilization capacity. Animal Reproduc- tion Science 196: 143–149. (IF 2017 = 1,647; AIS 2017 = 0,421) Yanes-Roca, C., Mráz, J., Born-Torrijos, A., Holzer, A.S., Imentai, A., Policar, T., 2018. Introduc- tion of rotifers (Brachionus plicatilis) during pikeperch first feeding. Aquaculture 497: 260– 268. (IF 2017 = 2,710; AIS 2017 = 0,602) Yanes-Roca, C., Toledo-Cuevas, M.E., Sánchez, L.J., Born-Torrijos, A., Rhody, N., Main, K.L., 2018. Digestive enzyme activity during larval development of black snook, Centropomus nigrescens. Journal of the World Aquaculture Society 49: 612–624. (IF 2017 = 1,338; AIS 2017 = 0,271) Yazicioglu, B., Kouba, A., Kozák, P., Niksirat, H., 2018. Post-mating spermatophore storage strategies in two species of crayfish: implications for broodstock management. Animal 13: 554–558. (IF 2017 = 1,870; AIS 2017 = 0,608) Zamaratskaia, G., Thøgersen, R., Čandek-Potokar, M., Krøyer Rasmussen, M., 2018. Co-treatment with indole-3-carbinol and resveratrol modify porcine CYP1A and CYP3A activities and expression. Xenobiotica 48: 232–240. (IF 2017 = 1,857; AIS 2017 = 0,379) Zusková, E., Piačková, V., Máchová, J., Chupani, L., Steinbach, C., Stará, A., Velíšek, J., 2018. Efficacy and toxicity of praziquantel in helminth-infected barbelBarbus ( barbus L.). Journal of Fish Diseases 41: 643–649. (IF 2017 = 2,004; AIS 2017 = 0,418)

ČLÁNKY ZAHRNUTÉ V DATABÁZI SCOPUS (CELKEM 9)

Bárta, A., Souček, P., Bozhynov, V., Urbanová, P., Bekkozhayeova, D., 2018. Trends in online biomonitoring. In: Rojas, I., Ortuño, F. (Eds), Bioinformatics and Biomedical Engineering. IWB- BIO 2018. Lecture Notes in Computer Science 10813, 6th International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, IWBBIO 2018, Granada, Spain, pp. 3–14. (SJR 2017 = 0,295)

94 FROV JU

Bozhynov, V., Souček, P., Bárta, A., Urbanová, P., Bekkozhayeva, D., 2018. Visible aquaphotomics spectrophotometry for aquaculture systems. In: Rojas, I., Ortuño, F. (Eds), Bioinformatics and Biomedical Engineering. IWBBIO 2018. Lecture Notes in Computer Science 10813, 6th International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, IWBBIO 2018, Granada, Spain, pp. 107–117. (SJR 2017 = 0,295) Gholizadeh, A., Zizala, D., Saberioon, M., Boruvka, L., 2018. Soil organic carbon content monitoring and mapping using airborne and Sentinel-2 spectral imaging. In: Themistocleous, K., Papadavid, G., Michaelides, S., Ambrosia, V., Hadjimtsis, D.G. (Eds), Proceedings of SPIE – The International Society for Optical Engineering 10773. 6th International Conference on Remote Sensing and Geoinformation of the Environment, RSCy 2018, Paphos, Cyprus, pp. 1077319- 1–1077319-7. (SJR 2017 = 0,234) Matonoha, C., Papáček, Š., Kindermann, S., 2018. Disc vs. annulus: On the bleaching pattern optimization for FRAP experiments. In: Kozubek, T., Čermák, M., Tichý, P., Blaheta, R., Šístek, J., Lukáš, D, Jaroš, J. (Eds), Lecture Notes in Computer Science 11087. 3rd International Con- ference on High Performance Computing in Science and Engineering, HPCSE 2017, Karolinka, Czech Republic, pp. 160–173. (SJR 2017 = 0,295) Papáček, Š., Matonoha, C., Petera, K., 2018. Modeling and simulation of microalgae growth in a couette-taylor bioreactor. In: Kozubek, T., Čermák, M., Tichý, P., Blaheta, R., Šístek, J., Lukáš, D, Jaroš, J. (Eds), Lecture Notes in Computer Science 11087. 3rd International Conference on High Performance Computing in Science and Engineering, HPCSE 2017, Karolinka, Czech Re- public, pp. 174–187. (SJR 2017 = 0,295) Rychtáriková, R., Urban, J., Štys, D., 2018. Žampa´s systems theory: a comprehensive theory of measurement in dynamic systems. Acta Polytechnica 58: 128–143. (SJR 2017 = 0,206) Urban, J., 2018. Resolution, precision, and entropy as binning problem in mass spectrometry. In: Rojas, I., Ortuño, F. (Eds), Bioinformatics and Biomedical Engineering. IWBBIO 2018. Lec- ture Notes in Computer Science 10813, 6th International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, IWBBIO 2018, Granada, Spain, pp. 118–128. (SJR 2017 = 0,295) Urbanová, P., Cyran, N., Souček, P., Bárta, A., Bozhynov, V., Bekkozhayeva, D., Císař, P., Železný, M., 2018. Unsupervised parametrization of nano-objects in electron microscopy. In: Rojas, I., Ortuño, F. (Eds), Bioinformatics and Biomedical Engineering. IWBBIO 2018. Lecture Notes in Computer Science 10813, 6th International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedi- cal Engineering, IWBBIO 2018, Granada, Spain, pp. 139–149. (SJR 2017 = 0,295) Waghmare, S.G., Sindhumole, P., Shylaja, M.R., Mathew, D., Francies, R.M., Abida, P.S., Sajini, S., 2018. Analysis of simple sequence repeat (SSR) polymorphism between N22 and Uma rice varieties for marker assisted selection. Electronic Journal of Plant Breeding 9: 511–517. (SJR 2017 = 0,146)

OSTATNÍ ČLÁNKY (CELKEM 10)

Barate, P.L., Kumar, R.R., Waghmare, S.G., Pawar, K.R., Tabe, R.H., 2018. Effect of different parameters on agrobacterium mediated transformation in Glycine max. International Journal of Advanced Biological Research 8: 99–105. Bárta, J., Bártová, V., Jarošová, M., Švajner, J., Smetana, P., Diviš, J., Bedrníček, J., Laknerová, I., Linhartová, Z., Kadlec, J., Mráz, J., Pešek, M., Wintrová, R., Vrchotová, N., Tříska, J., 2018. Charakteristika mouky ze salátové řepy (Beta vulgaris var. conditiva) a její antioxidační aktivita. Úroda 66: 397–400. Bártová, V., Diviš, J., Bárta, J., Jarošová, M., Švajner, J., Smetana, P., Bedrníček, J., Laknerová, I., Linhartová, Z., Kadlec, J., Mráz, J., Pešek, M., Wintrová, R., Vrchotová, N., Tříska, J., 2018. Pomocné látky v rostlinné výrobě a jejich vliv na antioxidační aktivitu hlíz bramboru. Úroda 66: 401–404. Flajšhans, M., 2018. Genetické zdroje ryb. Náš chov 12: 8–11. Gál, B., Gábris, V., Csányi, B., Cser, B., Danyik, T., Farkas, A., Farkas, J., Gebauer, R., Répás, E., Szajbert, B., Kouba, A., Patoka, J., Pãrvulescu, L., Weiperth, A., 2018. Present distribution of the invasive red swamp crayfishProcambarus clarkii (Girard, 1852) and its effects on the fish fauna assemblages in some tributaries of the Hungarian section of the River Danube. Pisces Hungarici 12: 71–76. Honzlová, A., Čurdová, H., Schebestová, L., Příborský, J., Svobodová, Z., Velíšek, J., 2018. Stan- ovení dusíkových faktorů jako indikátorů obsahu rybí složky v „čerstvých“ rybách a ve výrob- cích ze sladkovodních ryb. Maso 5: 45–48.

95 03 VÝZKUM A EXCELENCE

Kouba, A., 2018. Raci a sucho – porovnání přežívání a norování původních a nepůvodních druhů. Vodohospodářský bulletin 10: 22–24. Shaliutina Kolešová, A., Shaliutina, O., Ashtiani, S., Yue, S., Mo, X., Rui, N., 2018. Application of natural marine materials: opportunities and challenges. International Journal of Modern Trends in Engineering and Research 5: 210–223 Schwinger, V., Seyfried, R., Kallert, D., Fjelldal, P.G., Baierl, F., Lebeda, I., Speierl, T., Täubert, J.-E., Flajšhans, M., 2018. Späte Laichreife und spontane Triploidie bei Saiblingen – hängt natürliche Aneuploidie mit Fehlentwicklungen und Absterben der Embryos zusammen? Fis- cher & Teichwirt 1: 5–8. Szendőfi, B., Bérces, S., Csányi, B., Gábris, V., Gál, B., Gönye, Zs., Répás, E., Seprős, R., Tóth, B., Kouba, A., Patoka, J., Weiperth A., 2018. Occurrence of exotic fish and crayfish species in Barát and Dera creeks and their adjacent section of the River Danube. Pisces Hungarici 12: 47–51.

KAPITOLY V KNIZE (CELKEM 4)

Ciereszko, A., Pšenička, M., 2018. Siberian sturgeon sperm cryopreservation. In: Williot, P., Non- notte, G., Chebanov, C. (Eds), The Siberian Sturgeon Acipenser( baerii, Brandt, 1869) Volume 2 – Farming. Springer International Publishing AG, Switzerland, pp. 49–58. Dulić, Z., Adámek, Z., Hlaváč, D., Anton-Pardo, M., 2018. Zooplankton ecology in common carp ponds. In: Rahman, M.M., Balcombe, S.R. (Eds). Cyprinus carpio: Biological Features, Ecology and Diseases and Control Measures. Nova Science Publishers, New York, pp. 103–143. Pšenička, M., Ciereszko, A., 2018. Sperm and spermatozoa characteristics in the Siberian sturgeon. In: Williot, P., Nonnotte, G., Vizziano-Cantonnet, V., Chebanov, C. (Eds), The Siberian Sturgeon (Acipenser baerii, Brandt, 1869) Volume 1 – Biology. Springer International Publish- ing AG, Switzerland, pp. 307–326. Roche, K., Adámek, Z., Jurajda, P., 2018. Utilisation of natural food resources by carp in fish ponds. In: Rahman, M.M., Balcombe, S.R. (Eds), Cyprinus carpio: Biological Features, Ecology and Diseases and Control Measures. Nova Science Publishers, New York, pp. 65–101.

DIZERTAČNÍ PRÁCE (CELKEM 9)

Dadras, H., 2018. Temperature dependency of sperm motility in different fish species [Teplotní závislost motility spermatu u různých druhů ryb]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 90 pp. Gebauer, R., 2018. Foraging behavior of non-indigenous gobiid fish species [Potravní chování nepůvodních druhů hlaváčovitých ryb]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 101 pp. Horokhovatskyi, Y., 2018. Applied aspects of fish sperm cryopreservation [Aplikované aspekty kryokonzervace rybích spermií]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 82 pp. Iegorova, V., 2018. Polyspermy produces viable mosaics in sturgeon [Polyspermie u jeseterů dává vzniknout životaschopným mozaikám]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 71 pp. Pham, T.G., 2018. Biological effects of anthropogenic pollutants in recipients of treated sewage water [Biologický vliv antropogenních polutantů přítomných v recipientech komunálních od- padních vod]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 81 pp. Prchal, M., 2018. Estimation of genetic variation of performance traits in common carp to predict potential of selective breeding under pond management conditions [Odhad genetické variance užitkových vlastností kapra obecného s cílem předpovědět potenciál selekčního šlechtění v rybničních podmínkách chovu]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 130 pp. Sakalli, S., 2018. Bioactive compounds in the aquatic environment and their effects on fish – a special focus on piscine cytochrome P450 [Bioaktivní látky ve vodním prostředí a jejich vliv na ryby – zaměření na cytochromy P450 v rybách]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 114 pp. Samarin, A.M., 2018. Alteration of mRNA abundance, oxidation products and antioxidant enzyme activities associated with fish oocyte ageing [Změny v množství mRNA, v aktivitě oxi- dativní produktů a antioxidačních enzymů v závislosti na stárnutí rybích oocytů]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 114 pp. Šebesta, R., 2018. Selected aspects of intensively cultured European whitefish Coregonus( maraena, Bloch) and peled (Coregonus peled, Gmelin) [Vybrané aspekty intenzivního chovu síha marény (Coregonus maraena, Bloch) a peledě (Coregonus peled, Gmelin)]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 139 pp.

96 FROV JU

CERTIFIKOVANÉ METODIKY (CELKEM 5)

Grabic, R., Vrana, B., Fedorova, G., Švecová, H., Urík, J., Červený, D., Golovko, O., Grabicová, K., Šandová, M., Turek, J., Randák, T., 2018. Využití pasivních vzorkovačů POCIS pro monitoring farmak a pesticidů v povrchových vodách. Edice Metodik, FROV JU, Vodňany, č. 167, 50 s. Mráz, J., Lunda, R., Stejskal, V., 2018. Konstrukce recirkulačních akvaponických systémů. Certi- fikovaná metodika, FROV JU, Vodňany, č. 171, 78 s. Mráz, J., Tůmová, V., Gebauer, R., Kalous, L., 2018. Management akvaponických systémů. Certi- fikovaná metodika, FROV JU, Vodňany, č. 172, 107 s. Policar, T., Fuka, T., Blecha, T., 2018. Popis a využití nových technologických komponentů poten- cionálně využívaných v intenzivní akvakultuře. Edice Metodik, FROV JU, Vodňany, č. 170, 42 s. Policar, T., Křišťan, J., Hampl, J., Blecha, M., Kolářová, J., 2018. Provozní manuál sloužící k efe- ktivnímu provozu intenzivní akvakultury využívající RAS. Edice Metodik, FROV JU, Vodňany, č. 169, 45 s.

OVĚŘENÉ TECHNOLOGIE (CELKEM 6)

Kouřil, J., Korentovich, M., 2018. Využití obohacených metanauplií artemie k odkrmu plůdku ryb. Ověřená technologie. FROV JU, Vodňany, č. 175, 49 s. Kouřil, J., Podhorec, P., Policar, T., Stejskal, V., 2018. Hormonální stimulace vybraných druhů ryb k umělému a poloumělému výtěru. Edice Metodik, FROV JU, Vodňany, č. 176, 73 s. Linhartová, Z., Siglová, K., Lunda, R., Dvořák, P., Mráz, J., Bárta, J., Bártová, V., Kadlec, J., Sam- ková, E., Bedrníček, J., Pešek, M., Laknerová, I., Smetana, P., 2018. Vliv čtyř přírodních aditiv na prodloužení skladovatelnosti chlazených kapřích (Cyprinus carpio) paštik. Ověřená technologie. FROV JU, Vodňany, 18 s. Lunda, R., Stejskal, V., Prokešová, M., Mráz, J., 2018. Využití biofloc technologie v intenzivní akvakultuře. Edice Metodik, FROV JU, Vodňany, č. 173, 40 s. Stejskal, V., Gebauer, R., Matoušek, J., Šebesta, R., Prokešová, M., Mráz, J., Kouřil, J., 2018. Technologie a technické prvky recirkulačních akvakulturních systémů pro chov ryb. Edice Metodik, FROV JU, Vodňany, č. 174, 89 s. Turek, J., Stejskal, V., Lepič, P., Červený, D., Randák, T., Kozák, P., 2018. Využití hmyzu jako krmiva pro ryby. Edice Metodik, FROV JU, Vodňany, č. 168, 26 s.

FUNKČNÍ VZOREK (CELKEM 1)

Bedrníček, J., Smetana, P., Mráz, J., Kadlec, J., Samková, E., Vácha, F., Jirotková, D., Laknerová, I., Karda, K., 2018. Fortifikovaný výrobek se zvýšeným obsahem zdravotně prospěšných látek. Funkční vzorek.

UŽITNÉ VZORY (CELKEM 2)

Auský, J., Smetana, P., Kadlec, J., Bártová, V., Samková, E., Bárta, J., Pešek, M., Mráz, J., Jirot- ková, D., Bedrníček, J., Laknerová, I., Nodes, R., Karda, K., 2018. Antioxidační složka pro obohacení zejména pekařských nebo masných nebo mléčných výrobků a pekařský, masný a mléčný výrobek obohacený touto složkou. Užitný vzor č. 32058. Úřad průmyslového vlast- nictví ČR, Praha. Bedrníček, J., Smetana, P., Kadlec, J., Mráz, J., Samková, E., Vácha, F., Jirotková, D., Laknerová, I., Karda, K., 2018. Masný výrobek s obsahem biologicky aktivní složky. Užitný vzor č. 32395. Úřad průmyslového vlastnictví ČR, Praha.

PATENTY (CELKEM 5)

Císař, P., Saberioon, M., Souček, P., 2018. Způsob bezkontaktní detekce zdravotního stavu ryb a zařízení k provádění tohoto způsobu. Patent č. 307309. Úřad průmyslového vlastnictví ČR, Praha. Regenda, J., 2018. Zařízení ke zlepšování kvality vody na odtoku z hráze rybníku. Patent č. 307619. Úřad průmyslového vlastnicí ČR, Praha. Regenda, J., 2018. Zařízení ke zlepšování kvality vody na odtoku z rybníku. Patent č. 307618. Úřad průmyslového vlastnicí ČR, Praha.

97 03 VÝZKUM A EXCELENCE

Regenda, J., 2018. Zařízení k čištění odpadní vody. Patent č. 307519. Úřad průmyslového vlast- nicí ČR, Praha. Saito, T., Pšenička, M., 2018. Způsob značení zárodečných buněk, zejména primordiálních gonocytů chrupavčitých ryb. Patent č. 307467. Úřad průmyslového vlastnicí ČR, Praha.

SOFTWARE (CELKEM 3)

Císař, P., Saberioon, M., 2018. Software pro lokalizaci ryb. Saberioon, M., Souček, P., Brom, J., 2018. RemoteGuard software. Saberioon, M., Souček, P., Brom, J., 2018. RemoteChanges software.

VÝSLEDKY PROMÍTNUTÉ DO SCHVÁLENÝCH STRATEGICKÝCH A KONCEPČNÍCH DOKUMENTŮ (CELKEM 1)

Randák, T., Švecová, H., Grabic, R., 2018. Výskyt farmak a chemikálií pro osobní potřebu (PPCP) v povodí 3 klíčových zdrojů pitné vody v ČR a v pitné vodě pocházející z těchto zdrojů. Výsledek promítnutý do schválených strat. a konce. dokumentů.

KONFERENCE A WORKSHOPY (CELKEM 9)

Koleček, J., 2018. Aktuální témata chovu kaprů. Workshop, Heidenreichstein, 25. 4. 2018. Koleček, J., 2018. Practical Worksop on Fishery and Biodiversity of Hydrocenoses for Profes- sional Teachers. Workshop, Vodňany, 11.–21. 3. 2018. Koleček, J., 2018. Project week – workshop for Höhere Lehranstalt für Umwelt und Wirtschaft Yspertal – Fishery and Protection of Waters. Workshop, Vodňany, 13.–19. 5. 2018. Kouřil, J., 2018. Chov keříčkovce červenolemého. Workshop. České Budějovice, 6. 12. 2018. Kouřil, J., 2018. Novinky v řízené poloumělé a umělé reprodukci ryb. Workshop. České Budějo- vice, 6. 12. 2018. Kouřil, J., 2018. Využití obohacené živé potravy ke krmení plůdku ryb. Workshop. České Budě- jovice, 6. 12. 2018. Piačková, V., 2018. Nová virová onemocnění v akvakultuře. Konference, Vodňany, 23.–25. 10. 2018. Piačková, V., 2018. Ochrana zdraví ryb. Konference, Vodňany, 26.–27. 3. 2018. Saberioon, M., Císař, P., Labbé, L., 2018. In vivo fish diet discrimination using selected hyperspectral image classification methods. In: 9th Workshop on Hyperspectral Image and Signal Processing: Evolution in Remote Sensing (WHISPERS), Amsterdam, Nizozemí, 23–26. 9. 2018.

OSTATNÍ VÝSLEDKY (CELKEM 5)

Bedrníček, J., Jirotková, D., Smetana, P., Kadlec, J., Bárta, J., Bártová, V., Kolek, J., Mráz, J., Laknerová, I., Pešek, M., 2018. Sledování kvalitativních ukazatelů loveckého salámu během skladování. In: Pyte, R., Nedomová, Š., Jůzl, M., Ondrušíková, S. (Eds), Ingrovy Dny: XLIV. Kon- ference o jakosti potravin a potravinových surovin, Brno, s. 82–88. Bedrníček, J., Samková, E., Smetana, P., Kadlec, J., Bárta, J., Bártová, V., Kolek, J., Mráz, J., Laknerová, I., Pešek, M., 2018. Odpadní produkty cibule kuchyňské jako zdroj antiooxidantů v masných výrobcích. In: Golian, J., Belej, L., Čapla, J. (Eds), Bezpečnosť a kontrola potravín, (Piešťany, 23.3.2018), Nitra, Slovensko, s. 128–131. Dvořáková Líšková, Z., Škodová Parmová, D., Dvořák, P., Klufová, R., 2018. Globalization and economic conditions of brownfields regeneration in the Visegrad group countries. Globaliza- tion and its Socio-Economic Consequences, pp. 1065–10171. Dvořáková Líšková, Z., Škodová Parmová, D., Pártlová, P., Dvořák, P., 2018. Brownfieldy a inve- stori v Českej republike. Geografické informácie, s. 115–123. Vácha, F., Flanšhans, M., Dvořák, P., Kala, R., Vácha, A., Smetana, P., Rutkayová, J., 2018. Ry- bářský slovník.

98 FROV JU

2019

ČLÁNKY ZAHRNUTÉ V DATABÁZI WoS (CELKEM 147)

Abdolahpur, M.F., Chupani, L., Vijver, M.G., Vancová, M., Peijnenburg, W.J.G.M., 2019. Analyti- cal approaches for characterizing and quantifying engineered nanoparticles in biological ma- trices from an (eco)toxicological perspective: old challenges, new methods and techniques. Science of the Total Environment 660: 1283–1293. (IF 2018 = 5,589; AIS 2018 = 1,061) Abdolahpur, M.F., Chupani, L., Zusková, E., Peters, R., Vancová, M., Vijver, M.G., Porcal, P., Peij- nenburg, W.J.G.M., 2019. Method for extraction and quantification of metal-based nanoparticles in biological media: number-based biodistribution and bioconcentration. Environmen- tal Science and Technology 53: 946–953. (IF 2018 = 7,149; AIS 2018 = 1,677) Adamek, M., Matras, M., Dawson, A., Piačková, V., Gela, D., Kocour, M., Adamek, J., Kaminski, R., Rakus, K., Bergmann, S.M., Stachnik, M., Reichert, M., Steinhagen, D., 2019. Type I inter- feron responses of common carp strains with different levels of resistance to koi herpesvirus disease during infection with CyHV-3 or SVCV. Fish & Shellfish Immunology 87: 809–819. (IF 2018 = 3,298; AIS 2018 = 0,498) Adámek, Z., Mössmer, M., Hauber, M., 2019. Current principles and issues affecting organic carp (Cyprinus carpio) pond farming. Aquaculture 512: 734261. (IF 2018 = 3,022; AIS 2018 = 0,643) Alavi, S.M.H., Cosson, J., 2019. Reproductive biology in male aquatic animals: From stem cells to sperm – foreward. Theriogenology 138: 152–153. (IF 2018 = 2,299; AIS 2018 = 0,495) Alavi, S.M.H., Cosson, J., Bondarenko, O., Linhart, O., 2019. Sperm motility in fishes: (III) diversity of regulatory signals from membrane to the axoneme. Theriogenology 136: 143–165. (IF 2018 = 2,299; AIS 2018 = 0,495) Almeida, A.R., Jesus, F., Henriques, J.F., Andrade, T.S., Barreto, Â., Koba, O., Giang, P.T., Soares, A.M.V.M., Oliveira, M., Domingues, I., 2019. The role of humic acids on gemfibrozil toxicity to zebrafish embryos. Chemosphere 220: 556–564. (IF 2018 = 5,108; AIS 2018 = 0,869) Almeida, A.R., Tacao, M., Machado, A.L., Golovko, O., Žlábek, V., Domingues, I., Henriques, I., 2019. Long-term effects of oxytetracycline exposure in zebrafish: A multi-level perspective. Chemosphere 222: 333–344. (IF 2018 = 5,108; AIS 2018 = 0,869) Bakal, T., Janata, J., Sabova, L., Grabic, R., Žlábek, V., Najmanova, L., 2019. Suitability and se- tup of next-generation sequencing-based method for taxonomic characterization of aquatic microbial biofilm. Folia Microbiologica 64: 9–17. (IF 2018 = 1,448; AIS 2018 = 0,357) Bedrníček, J., Laknerová, I., Linhartová, Z., Kadlec, J., Samková, E., Bárta, J., Bártová, V., Mráz, J., Pešek, M., Winterová, R., Vrchotová, N., Tříska, J., Smetana, P., 2019. Onion waste as a rich source of antioxidants for meat products. Czech Journal of Food Science 37: 268–275. (IF 2018 = 0,846; AIS 2018 = 0,220) Bengtsson-Palme, J., Milakovic, M., Švecová, H., Ganjto, M., Jonsson, V., Grabic, R., Udikovic- -Kolic, N., 2019. Industrial wastewater treatment plant enriches antibiotic resistance genes and alters the structure of microbial communities. Water Research 162: 437–445. (IF 2018 = 7,913; AIS 2018 = 1,548) Bláha, M., Grabicová, K., Shaliutina, O., Kubec, J., Randák, T., Žlábek, V., Buřič, M., Veselý, L., 2019. Foraging behaviour of top predators mediated by pollution of psychoactive pharmaceuticals and effects on ecosystem stability. Science of the Total Environment 662: 655–661. (IF 2018 = 5,589; AIS 2018 = 1,061) Blecha, M., Malinovskyi, O., Veselý, L., Křišťan, J., Policar, T., 2019. Swim bladder inflation fai- lure in pikeperch (Sander lucioperca) larvae in pond culture. Aquaculture International 27: 983–989. (IF 2018 = 1,455; AIS 2018 = 0,339) Bondarenko, V., Cosson, J., 2019. Structure and beating behavior of the sperm motility appa- ratus in aquatic animals. Theriogenology 135: 152–163. (IF 2018 = 2,999; AIS 2018 = 0,495) Boulais, M., Demoy-Schneider, M., Alavi, S.M.H., Cosson, J., 2019. Spermatozoa motility in bi- valves: Signaling, flagellar beating behavior, and energetics. Theriogenology 136: 15–27. (IF 2018 = 2,299; AIS 2018 = 0,495) Browne, R.K., Silla, A.J., Upton, R., Della-Togna, G., Mercec-Greaves, R., Shishova, N.V., Ute- shev, V.K., Troano, B., Pérez, O.D., Mansour, N., Kaurova, S.A., Gakhova, E.N., Cosson, J., Dzyuba, B., Kramarova, L.I., McGinnity, D., Gonzalez, M., Clulow, J., Clulow, S., 2019. Sperm collection and storage for the sustainable management of amphibian biodiversity. Therioge- nology 133: 187–200. (IF 2018 = 2,299; AIS 2018 = 0,495)

99 03 VÝZKUM A EXCELENCE

Burkina, V., Rasmussen, K.M., Oliinychenko, Y., Zamaratskaia, G., 2019. Porcine cytochrome 2A19 and 2E1. Basic & Clinical Pharmacology & Toxicology 124: 32–39. (IF 2018 = 2,452; AIS 2018 = 0,629) Burkina, V., Žlábek, V., Rasmussen, M.K., Zamaratskaia, G., 2019. End-product inhibition of skatole-metabolising enzymes CYP1A, CYP2A19 and CYP2E1 in porcine and piscine hepatic microsomes. Toxicology Letters 303: 67–71. (IF 2018 = 3,499; AIS 2018 = 0,761) Caldeira, C., Hernández-Ibánez, S., Valverde, A., Martin, P., Herranz-Jusdado, J.G., Gallego, V., Asturiano, J.F., Dzyuba, B., Pšenička, M., Soler, C., 2019. Standardization of sperm motility analysis by using CASA-Mot for Atlantic salmon (Salmo salar), European eel (Anguilla anguilla) and Siberian sturgeon (Acipenser baerii). Aquaculture 502: 233–231. (IF 2018 = 3,022; AIS 2018 = 0,643) Campos, D., Silva, A.R.R., Loureiro, S., Grabicová, K., Vojs Staňová, A., Soares, A.M.V.M., Pest- ana, J.L.T., 2019. Two-generational effects of Benzophenone-3 on the aquatic midgeChiro- nomus riparius. Science of the Total Environment 669: 983–990. (IF 2018 = 5,589; AIS 2018 = 1,061) Cartwright, A., Gebauer, R., Vanina, T., Stejskal, V., Drozd, B., 2019. Shelter competition between mature non-indigenous western tubenose goby (Proterorhinus semilunaris) and invasive round goby (Neogobius melanostomus) for plants and rocks. Biological Invasions 21: 2723–2734. (IF 2018 = 2,897; AIS 2018 = 0,809) Chupani, L., Barta, J., Zusková, E., 2019. Effects of food-borne ZnO nanoparticles on intestinal microbiota of common carp (Cyprinus carpio L.). Environmental Science and Pollution Rese- arch 26: 25869–25873. (IF 2018 = 2,914; AIS 2018 = 0,539) Correia, D., Almeida, A.R., Santos, J., Machado, A.L., Koba Ucun, O., Žlábek, V., Oliveira, M., Domingues, I., 2019. Behavioral effects in adult zebrafish after developmental exposure to carbaryl. Chemosphere 235: 1022–1029. (IF 2018 = 5,108; AIS 2018 = 0,869) Cosson, J., Linhart, O., Alavi, S.M.H., 2019. Obituary: remembering professor roland billard. Theriogenology 133: 159–160. (IF 2018 = 2,299; AIS 2018 = 0,495) Dadras, H., Boryshpolets, S., Golpour, A., Policar, T., Blecha, M., Dzyuba, B., 2019. Effects of temperature on sperm motility of burbot Lota lota: spontaneous activation and calcium dependency. Journal of Fish Biology 95: 1137–1144. (IF 2018 = 2,038; AIS 2018 = 0,555) Dadras, H., Dzyuba, V., Golpour, A., Xin, M., Dzyuba, B., 2019. In vitro antioxidant enzyme activity and sperm motility at different temperatures in sterletAcipenser ruthenus and rainbow trout Oncorhynchus mykiss. Fish Physiology and Biochemistry 45: 1791–1800. (IF 2018 = 1,729; AIS 2018 = 0,415) Dadras, H., Golpour, A., Dzyuba, B., Křišťan, J., Policar, T., 2019. Ultrastructural feature of sper- matogenic cells and spermatozoon in cultured burbot Lota lota. Tissue and Cell 61: 1–7. (IF 2018 = 1,438; AIS 2018 = 0,318) Douda, K., Zhao, S., Vodáková, B., Horký, P., Grabicová, K., Božková, K., Grabic, R., Slavík, O., Randák, T., 2019. Host-parasite interaction as a toxicity test endpoint using asymmetrical exposures. Aquatic Toxicology 211: 173–180. (IF 2018 = 3,794; AIS 2018 = 0,767) Dzyuba, B., Legendre, M., Baroiller, J.F., Cosson, J., 2019. Sperm motility of the Nile tilapia (Oreochromis niloticus): Effects of temperature on the swimming characteristics. Animal Reproduction Science 202: 65–72. (IF 2018 = 1,817; AIS 2018 = 0,442) Dzyuba, V., Ninhaus-Silveira, A., Kahanec, M., Veríssimo-Silveira, R., Rodina, M., Holt, W.V., Dzyuba, B., 2019. Sperm motility in ocellate river stingrays: evidence for post-testicular sperm maturation and capacitation in Chondrichthyes. Journal of Zoology 307: 9–16. (IF 2018 = 1,676; AIS 2018 = 0,693) Dzyuba, V., Sampels, S., Ninhaus-Silveira, A., Kahanec, M., Veríssimo-Silveira, R., Rodina, M., Cosson, J., Boryshpolets, S., Selinger, M., Sterba, J., Dzyuba, B., 2019. Sperm motility and lipid composition in internally fertilizing ocellate river stingray Potamotrygon motoro. Therio- genology 130: 26–35. (IF 2018 = 2,299; AIS 2018 = 0,495) Dzyuba, V., Shelton, W.L., Kholodnyy, V., Boryshpolets, S., Cosson, J., Dzyuba, B., 2019. Fish sperm biology in relation to urogenital system structure. Theriogenology 132: 153–163. (IF 2018 = 2,299; AIS 2018 = 0,495) Engel, K.M., Sampels, S., Dzyuba, B., Podhorec, P., Policar, T., Dannenberger, D., Schiller, J., 2019. Swimming at different temperatures: The lipid composition of sperm from three freshwater fish species determined by mass spectrometry and nuclear magnetic resonance spectroscopy. Chemistry and Physics of Lipids 221: 65–72. (IF 2018 = 2,536; AIS 2018 = 0,757)

100 FROV JU

Fatira, E., Havelka, M., Labbé, C., Depincé, A., Pšenička, M., Saito, T., 2019. A newly developed cloning technique in sturgeons; an important step towards recovering endangered species. Scientific Reports 9: 10453. (IF 2018 = 4,011; AIS 2018 = 1,286) Fořt, M., Hossain, S.Md., Kouba, A., Buřič, M., Kozák, P., 2019. Agonistic interactions and domi- nance establishment in three crayfish species non-native to Europe. Limnologica 74: 73–79. (IF 2018 = 2,051; AIS 2018 = 0,522) Francová, K., Šumberová, K., Janauer, G.A., Adámek, Z., 2019. Effects of fish farming on macro- phytes in temperate carp ponds. Aquaculture International 27: 413–436. (IF 2018 = 1,455; AIS 2018 = 0,339) Francová, K., Šumberová, K., Kučerová, A., Čtvrtlíková, M., Šorf, M., Borovec, J., Drozd, B., Janauer, G.A., Vrba, J., 2019. Macrophyte assemblages in fishponds under different fish farming management. Aquatic Botany 159: 103131. (IF 2018 = 2,143; AIS 2018 = 0,502) Franěk, R., Marinović, Z., Lujić, J., Urbányi, B., Fučíková, M., Kašpar, V., Pšenička, M., Horváth, Á., 2019. Cryopreservation and transplantation of common carp spermatogonia. PLoS ONE 14: e0205481. (IF 2018 = 2,776; AIS 2018 = 0,978) Franěk, R., Tichopád, T., Fučíková, M., Steinbach, C., Pšenička, M., 2019. Production and use of triploid zebrafish for surrogate reproduction. Theriogenology 140: 33–43. (IF 2018 = 2,999; AIS 2018 = 0,495) Franěk, R., Tichopád, T., Steinbach, C., Xie, X., Lujić, J., Marinović, Z., Horváth, Á., Kašpar, V., Pšenička, M., 2019. Preservation of female genetic resources of common carp through oo- gonial stem cell manipulation. Cryobiology 87: 78–85. (IF 2018 = 2,141; AIS 2018 = 0,528) Gebauer, R., Veselý, L., Vanina, T., Buřič, M., Kouba, A., Drozd, B., 2019. Prediction of ecological impact of two alien gobiids in habitat structures of differing complexity. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences 76: 1954–1961. (IF 2018 = 2,567; AIS 2018 = 0,879) Gomes, I.D.L., Gazo, E., Nabi, D., Besnardeau, L., Hebras, C., McDougall, A., Dumollard, R., 2019. Bisphenols disrupt differentiation of the pigmented cells during larval brain formation in the ascidian. Aquatic Toxicology 216: 105314. (IF 2018 = 3,794; AIS 2018 = 0,767) Gomes, I.D.L., Gazo, I., Besnardeau, L., Hebras, C., McDougall, A., Dumollard, R., 2019. Poten- tial roles of nuclear receptors in mediating neurodevelopmental toxicity of known endocrine-disrupting chemicals in ascidian embryos. Molecular Reproduction and Development 86: 1333–1347. (IF 2018 = 2,124; AIS 2018 = 0,898) Guo, W., Kubec, J., Veselý, L., Hossain, S.Md., Buřič, M., McClain, R., Kouba, A., 2019. High air humidity is sufficient for successful egg incubation and early post-embryonic development in the marbled crayfish Procambarus( virginalis). Freshwater Biology 64: 1603–1612. (IF 2018 = 3,404; AIS 2018 = 1,016) Hashemi, S.A.R., Stará, A., Faggio, C., 2019. Biological characteristics, growth parameters and mortality rate of Carassius auratus in the Shadegan Wetland (Iran). International Journal of Environmental Research 13: 457–464. (IF 2018 = 1,488; AIS 2018 = 0,214) Haubrock, P.J., Balzani, P., Azzini, M., Inghilesi, A.F., Veselý, L., Guo, W., Tricarico, E., 2019. Shared histories of co-evolution may affect trophic interactions in a freshwater community dominated by alien species. Frontiers in Ecology and Evolution 7: 355. (IF 2018 = 2,868; AIS 2018 not counted) Haubrock, P.J., Balzani, P., Criado, A., Inghilesi, A.F., Tricarico, E., Monteoliva, A.P., 2019. Pre- dicting the effects of reintroducing a native predator (European eel,Anguilla anguilla) into a freshwater community dominated by alien species using a multidisciplinary approach. Man- agement of Biological Invasions 10: 171–191. (IF 2018 = 1,515; AIS 2018 not counted) Haubrock, P.J., Inghilesi, A.F., Mazza, G., Bendoni, M., Solari, L., Tricarico, E., 2019. Burrowing activity of Procambarus clarkii on levees: analysing behaviour and burrow structure. Wet- lands Ecology and Management 27: 497–511. (IF 2018 = 2,250; AIS 2018 = 0,545) Haubrock, P.J., Kubec, J., Veselý, L., Buřič, M., Tricarico, E., Kouba, A., 2019. Water temperature as a hindrance, but not limiting factor for the survival of warm water invasive crayfish intro- duced in cold periods. Journal of Great Lakes Research 45: 788–794. (IF 2018 = 2,175; AIS 2018 = 0,586) Hematyar, N., Rustad, T., Sampels, S., Dalsgaard, T.K., 2019. Relationship between lipid and protein oxidation in fish. Aquaculture Research 50: 1393–1403. (IF 2018 = 1,502; AIS 2018 = 0,338) Hossain, Md.S., Kubec, J., Kouba, A., Kozák, P., Buřič, M., 2019. Still waters run deep: marbled crayfish dominates over red swamp crayfish in agonistic interactions. Aquatic Ecology 53: 97–107. (IF 2018 = 2,505; AIS 2018 = 0,616)

101 03 VÝZKUM A EXCELENCE

Hossain, S.M., Kubec, J., Grabicová, K., Grabic, R., Randák, T., Guo, W., Kouba, A., Buřič, M., 2019. Environmentally relevant concentrations of methamphetamine and sertraline modify the behavior and life history traits of an aquatic invertebrate. Aquatic Toxicology 213: 105222. (IF 2018 = 3,794; AIS 2018 = 0,767) Hossain, S.Md., Kouba, A., Buřič, M., 2019. Morphometry, size at maturity, and fecundity of marbled crayfish Procambarus( virginalis). Zoologischer Anzeiger 281: 68–75. (IF 2018 = 1,601; AIS 2018 = 0,484) Imentai, A., Yanes-Roca, C., Malinovskyi, O., Policar, T., 2019. Effect ofBrachionus plicatilis density on pikeperch (Sander lucioperca L.) larva performance at first feeding. Journal of Applied Ichthyology 35: 1292–1294. (IF 2018 = 0,877; AIS 2018 = 0,193) Imentai, A., Yanes-Roca, C., Steinbach, Ch., Policar, T., 2019. Optimized application of rotifers Brachionus plicatilis for rearing pikeperch Sander lucioperca L. larvae. Aquaculture Interna- tional 27: 1137–1149. (IF 2018 = 1,455; AIS 2018 = 0,339) Jůza, T., Duras, J., Blabolil, P., Sajdlová, Z., Hess, J., Chocholoušková, Z., Kubečka, J., 2019. Re- covery of the Velky Bolevecky pond (Plzen, Czech Republic) via biomanipulation – Key study for management. Ecological Engineering 136: 167–176. (IF 2018 = 3,406; AIS 2018 = 0,653) Karanovic, T., Bláha, M., 2019. Taming extreme morphological variability through coupling of molecular phylogeny and quantitative phenotype analysis as a new avenue for taxonomy. Scientific Reports 9: 2429. (IF 2018 = 4,011; AIS 2018 = 1,286) Khanzai Baloch, A.R., Franěk, R., Tichopád, T., Fučíková, M., Rodina, M., Pšenička, M., 2019. Dnd1 knockout in sturgeons by CRISPR/Cas9 generates germ cell free host for surrogate production. Animals 9: 174. (IF 2018 = 1,832; AIS 2018 not counted) Khanzai Baloch, A.R., Fučíková, M., Rodina, M., Metscher, B., Tichopád, T., Shah, A.M., Franěk, R., Pšenička, M., 2019. Delivery of Iron oxide nanoparticles into primordial germ cells in sturgeon. Biomolecules 9: 333. (IF 2018 = 4,694; AIS 2018 not counted) Kindermann, S., Papáček, Š., 2019. Optimization of the shape (and topology) of the initial conditions for diffusion parameter identification. Computers and Mathematics Applications 77: 3102–3116. (IF 2018 = 2,811; AIS 2018 = 0,787) Kodešová, R., Klement, A., Golovko, O., Fér, M., Kočárek, M., Nikodem, A., Grabic, R., 2019. Soil influences on uptake and transfer of pharmaceuticals from sewage sludge amended soils to spinach. Journal of Environmental Management 250:109407. (IF 2018 = 4,865; AIS 2018 = 0,868) Kodešová, R., Klement, A., Golovko, O., Fér, M., Nikodem, A., Kočárek, M., Grabic, R., 2019. Root uptake of atenolol, sulfamethoxazole and carbamazepine, and their transformation in three soils and four plants. Environmental Science and Pollution Research 26: 9876–9891. (IF 2018 = 2,914; AIS 2018 = 0,539) Kolešová, A., Dietrich, M., Xian, M., Nian, R., 2019. Seminal plasma transferrin effects on cryopreserved common carp Cyprinus carpio sperm and comparison with bovine serum al- bumin and antifreeze proteins. Animal Reproduction Science 204: 125–130. (IF 2018 = 1,817; AIS 2018 = 0,442) Kolešová, A., Xian, M., Nian, R., 2019. Antioxidant defence system in protein fractions of common carp (Cyprinus carpio) seminal plasma. Czech Journal of Animal Science 64: 265–271. (IF 2018 = 1,008; AIS 2018 = 0,222) Koliada, I., Balk, H., Tušer, M., Ptáček, L., Kubečka, J., 2019. Limitations of target detection in horizontal acoustic surveys of extremely shallow water bodies. Fisheries Research 218: 94–104. (IF 2018 = 2,343; AIS 2018 = 0,648) Korytář, T., Wiegertjes, G.F., Zusková, E., Tomanová, A., Lisnerová, M., Patra, S., Sieranski, V., Šíma, R., Born-Torrijos, A., Wentzel, A.S., Blasco-Monleon, S., Yanes-Roca, C., Policar, T., Hol- zer, A.S., 2019. The kinetics of cellular and humoral immune responses of common carp to presporogonic development of the myxozoan Sphaerospora molnari. Parasites & Vectors 12: 208. (IF 2018 = 3,031; AIS 2018 = 0,959) Křišťan, J., Blecha, M., Policar, T., 2019. Survival and growth rates of juvenile grass carp Cteno- pharyngodon idella overwintered in ponds and recirculating aquaculture systems including a comparison of production economics. Turkish Journal of Fisheries and Aquatic Sciences 19: 261–266. (IF 2018 = 0,738; AIS 2018 = 0,194) Kubec, J., Hossain, Md.S., Grabicová, K., Randák, T., Kouba, A., Grabic, R., Roje, S., Buřič, M., 2019. Oxazepam alters the behavior of crayfish at diluted concentrations, venlafaxine does not. Water 11: 196. (IF 2018 = 2,524; AIS 2018 = 0,441) Kubec, J., Kouba, A., Buřič, M., 2019. Communication, behaviour, and decision making in crayfish: A review. Zoologischer Anzeiger 278: 28–37. (IF 2018 = 1,601; AIS 2018 = 0,484)

102 FROV JU

Kubec, J., Kouba, A., Kozák, P., Buřič, M., 2019. Females bet on the known: crayfish females recognize and prefer males from familiar population, males are not picky. Hydrobiologia 842: 31–38. (IF 2018 = 2,325; AIS 2018 = 0,631) Kuklina, I., Ložek, F., Císař, P., Pautsina, A., Buřič, M., Kozák, P., 2019. Continuous noninvasive measuring of crayfish cardiac and behavioral activities. Journal of Visualized Experiments 144: e58555. (IF 2018 = 1,108; AIS 2018 = 0,558) Kumar, G., Langa, J., Montes, I., Conklin, D., Kocour, M., Kohlmann, K., Estonba, A., 2019. A novel transcriptome-derived SNPs array for tench (Tinca tinca L.). PLoS One14: e0213992. (IF 2018 = 2,776; AIS 2018 = 0,978) Li, P., Du, H., Qiao, X.M., Liu, Z.G., Zhou, Q., Wei, Q.W., 2019. Protein profile of Dabry’s sturgeon (Acipenser dabryanus) spermatozoa and relationship to sperm quality. Animal Reproduction Science 201: 1–11. (IF 2018 = 1,817; AIS 2018 = 0,442) Li, P., Guo, W., Qiao, X.M., Liu, Z.G., Shen, L., Wei, Q.W., 2019. Morphology and ultrastructure of Dabry’s sturgeon (Acipenser dabryanus) spermatozoa using scanning and transmission electron microscopy. Journal of Applied Ichthyology 35: 192–201. (IF 2018 = 0,877; AIS 2018 = 0,193) Lidová, J., Buřič, M., Kouba, A., Velíšek, J., 2019. Acute toxicity of two pyrethroid insectici- des for five non-indigenous crayfish species in Europe. Veterinarni Medicina 64: 125–133. (IF 2018 = 0,636; AIS 2018 = 0,191) Linhartová, Z., Lunda, R., Dvořák, P., Bárta, J., Bártová, V., Kadlec, J., Samková, E., Bedrníček J., Pešek, M., Laknerová, I., Smole Možina, S., Smetana, P., Mráz, J., 2019. Influence of rosemary extract (Rosmarinus officinalis) Inolens to extend the shelf life of vacuum-packed rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) fillets stored under refrigerated conditions. Aquaculture Inter- national 27: 833–847. (IF 2018 = 1,455; AIS 2018 = 0,339) Lipták, B., Veselý, L., Ercoli, F., Bláha, M., Buřič, M., Ruokonen, T.J., Kouba, A., 2019. Trophic role of marbled crayfish in a lentic freshwater ecosystem. Aquatic Invasions 14: 299–309. (IF 2018 = 1,705; AIS 2018 = 0,655) Liu, W., Fan, X., Wang, X., Bao, Z., Sun, Y., Rai, K., Kolešová, A., Su, J., Xian, M., Nian, R., 2019. Salt-enhanced permeabilization for monoclonal antibody precipitation and purification in a tubular reactor with a depth filtration membrane with advanced chromatin extraction. Bio- chemical Engineering Journal 151: 107332. (IF 2018 = 3,371; AIS 2018 = 0,607) Lonhus, K., Štys, D., Saberioon, M., Rychtáriková, R., 2019. Segmentation of laterally symmet- ric overlapping objects: Application to images of collective animal behavior. Symmetry 11: 866. (IF 2018 = 2,143; AIS 2018 = 0,801) Ložek, F., Kuklina, I., Grabicová, K., Kubec, J., Buřič, M., Grabic, R., Randák, T., Císař, P., Kozák, P., 2019. Behaviour and cardiac response to stress in signal crayfish exposed to environmental concentrations of tramadol. Aquatic Toxicology 213: 105217. (IF 2018 = 3,794; AIS 2018 = 0,767) Lunda, R., Roy, K., Másílko, J., Mráz, J., 2019. Understanding nutrient throughput of operational RAS farm effluents to support semi-commercial aquaponics: Easy upgrade possible beyond controversies. Journal of Environmental Management 245: 255–263. (IF 2018 = 4,865; AIS 2018 = 0,868) Lundová, K., Matoušek, J., Prokešová, M., Šebesta, R., Policar, T., Stejskal, V., 2019. The effect of timing of extended photoperiod on growth and maturity of brook trout (Salvelinus fontinalis). Aquaculture Research 50: 1697–1704. (IF 2018 = 1,502; AIS 2018 = 0,338) Lundová, K., Matoušek, J., Prokešová, M., Vanina, T., Šebesta, R., Urban, J., Stejskal, V., 2019. The effects of a prolonged photoperiod and light source on growth, sexual maturation, fin condition, and vulnerability to fungal disease in brook trout Salvelinus fontinalis. Aquacultu- re Research 50: 256–267. (IF 2018 = 1,502; AIS 2018 = 0,338) Mackuľak, T., Brandeburová, P., Grenčíková, A., Bodík, I., Vojs Staňová, A., Golovko, O., Koba, O., Mackuľaková, M., Špalková, V., Gál, M., Grabic, R., 2019. Music festivals and drugs: Was- tewater analysis. Science of the Total Environment 659: 326–334. (IF 2018 = 5,589; AIS 2018 = 1,061) Mackuľak, T., Grabic, R., Špalková, V., Belišová, N., Škulcová, A., Slavík, O., Horký, P., Gál, M., Filip, J., Híveš, J., Vojs, M., Vojs Staňová, A., Medveďová, A., Marton, M., Birošová, L., 2019. Hospital wastewaters treatment: Fenton reaction vs. BDDE vs. ferrate(VI). Environmental Sci- ence and Pollution Research 26: 31812–31821. (IF 2018 = 2,914; AIS 2018 = 0,539) Mackuľak, T., Škulcová, A., Belišová, N., Horáková, I., Žabka, D., Semerád, M., Vojs Staňová, A., Brandeburová, P., 2019. Liečivá a drogy – environmentálny problém? Chemické Listy 113: 654–661. (IF 2018 = 0,311; AIS 2008 = 0,031)

103 03 VÝZKUM A EXCELENCE

Magdanz, V., Boryshpolets, S., Ridzewski, C., Eckel, B., Reinhardt, K., 2019. The motility-based swim-up technique separates bull sperm based on differences in metabolic rates and tail length. PLoS One 14: e0223576. (IF 2018 = 2,776; AIS 2018 = 0,978) Malinovskyi, O., Kolářová, J., Blecha, M., Stará, A., Velíšek, J., Křišťan, J., Policar, T., 2019. Be- havior and physiological status of pond-cultured pikeperch (Sander lucioperca) broodstock effected by sexual interactions throughout semi-artificial reproduction. Aquaculture Interna- tional 27: 1093–1107. (IF 2018 = 1,455; AIS 2018 = 0,339) Mareš, J., Strunecký, O., Bučinská, L., Wiedermannová, J., 2019. evolutionary patterns of thy- lakoid architecture in cyanobacteria. Frontiers in Microbiology 10: 277. (IF 2018 = 4,259; AIS 2018 = 1,254) Marton, M., Michniak, P., Behul, M., Rehacek, V., Vojs Stanova, A., Redhammer, R., Vojs, M., 2019. Bismuth modified boron doped diamond electrode for simultaneous determination of Zn, Cd and Pb ions by square wave anodic stripping voltammetry: Influence of boron concen- tration and surface morphology. Vacuum 167: 182–188. (IF 2018 = 2,515; AIS 2018 = 0,335) Matějková, J., Podhorec, P., 2019. Sustained drug delivery system in fish and the potential for use of PLGA microparticles: a review. Veterinarni Medicina 64: 287–293. (IF 2018 = 0,636; AIS 2018 = 0,191) McCallum, E.S., Červený, D., Fick, J., Brodin, T., 2019. Slow-release implants for manipulating contaminant exposures in aquatic wildlife: A new tool for field ecotoxicology. Environmental Science and Technology 53: 8282–8290. (IF 2018 = 7,149; AIS 2018 = 1,677) Mohagheghi Samarin, A., Mohagheghi Samarin, A., Knutsdatter Østbye, T.K., Ruyter, B., Sam- pels, S., Burkina, V., Blecha, M., Gela, D., Policar, T., 2019. Alteration of mRNA abundance, oxidation products and antioxidant enzyme activities during oocyte ageing in common carp Cyprinus carpio. PLoSOne 14: e0212694. (IF 2018 = 2,776; AIS 2018 = 0,978) Mrugała, A., Buřič, M., Petrusek, A., Kouba, A., 2019. May atyid shrimps act as potential vectors of crayfish plague? NeoBiota 51:65–80. (IF 2018 = 2,488; AIS 2018 not counted) Nag, S.K., Nandy, S.K., Roy, K., Sarkar, U.K., Das, B.K., 2019. Carbon balance of a sewage-fed aquaculture wetland. Wetlands Ecology and Management 27: 311–322. (IF 2018 = 2,250; AIS 2018 = 0,545) Novak, A., Císař, P., Bruneau, M., Lotton, P., Simon, L., 2019. Localization of sound-producing fish in a water-filled tank. Journal of Acoustical Society of America 146: 4842–4850. (IF 2018 = 1,819; AIS 2018 = 0,483) Oberle, M., Másílko, J., Wedekind, H., 2019. Observation of parasitic behaviour of an invasive neozootic fish species, the topmouth gudgeon,Pseudorasbora parva (Actinopterygii: Cypri- niformes: Cyprinidae), on other cyprinid fishes. Acta Ichthyologica et Piscatoria 49: 171–176. (IF 2018 = 0,667; AIS 2018 = 0,232) Palaiokostas, C., Veselý, T., Kocour, M., Prchal, M., Pokorová, D., Piačková, V., Pojezdal, L., Houston, R.D., 2019. Optimizing genomic prediction of host resistence to koi herpesvirus disease in carp. Frontiers in Genetics 10: 543. (IF 2018 = 3,517; AIS 2018 not counted) Pan, Y., Wang, M., Baloch, A.R., Zhang, Q., Wang, J., Ma, R., Xu, G., Kashif, J., Wang, L., Fan, J., Cui, Y., Yu, S., 2019. FGF10 enhances yak oocyte fertilization competence and subsequent blastocyst quality and regulates the levels of CD9, CD81, DNMT1, and DNMT3B. Journal of Cellular Physiology 234: 17677–17689. (IF 2018 = 4,522; AIS 2018 = 0,978) Pan, Y., Wang, Y., Wang, M., Zhang, Q., Baloch, A.R., Zhou, J., Ma, J., Kashif, J., Xu, G., Wang, L., Fan, J., Cui, Y., Yu, S., 2019. First detection and genetic characterization of ungulate tetraparvovirus 2 and ungulate tetraparvovirus 4 in special livestock on the Qinghai-Tibet Plateau in China. Virology Journal 16: 56. (IF 2018 = 2,464; AIS 2018 = 0,698) Pfauserová, N., Slavík, O., Horký, P., Kolářová, J., Randák, T., 2019. Migration of non-native predator asp (Leuciscus aspius) from a Reservoir poses a potential threat to native species in tributaries. Water 11: 1306. (IF 2018 = 2,524; AIS 2018 = 0,441) Pham, T.G., Burkina, V., Sakalli, S., Schmidt-Posthaus, H., Rasmussen, M.K., Randák, T., Grabic, R., Grabicová, K., Fedorova, G.., Koba, O., Golovko, O., Turek, J., Červený, D., Kolářová, J., Žlá- bek, V., 2019. Effects of multi-component mixtures from sewage treatment plant effluent on common carp (Cyprinus carpio) under fully realistic condition. Environmental Management 63: 466–484. (IF 2018 = 2,376; AIS 2018 = 0,640) Pocherniaieva, K., Güralp, H., Saito, T., Pšenička, M., Tichopád, T., Janko, K., Kašpar, V., 2019. The timing and characterization of maternal to zygote transition and mid-blastula transition in sterlet Acipenser Ruthenus and A. ruthenus x Acipenser gueldenstaedtii hybrid. Turkish Journal of Fisheries and Aquatic Sciences 19: 77–84. (IF 2018 = 0,738; AIS 2018 = 0,194)

104 FROV JU

Policar, T., Malinovskyi, O., Křišťan, J., Stejskal, V., Samarin, A.M., 2019. Post-spawning bath treatments to reduce morbidity and mortality of pond-cultured pikeperch (Sander lucioperca L.) broodstock. Aquaculture International 27: 1065–1078. (IF 2018 = 1,455; AIS 2018 = 0,339) Policar, T., Schaefer, F.J., Panana, E., Meyer, S., Teerlinck, S., Toner, D., Zarski, D., 2019. Recent progress in European percid fish culture production technology – tackling bottlenecks. Aqua- culture International 27: 1151–1174. (IF 2018 = 1,455; AIS 2018 = 0,339) Raabová, L., Kovacik, L., Elster, J., Strunecký, O., 2019. Review of the genus Phormidesmis (Cyanobacteria) based on environmental, morphological, and molecular data with descripti- on of a new genus Leptodesmis. Phytotaxa 395: 1–16. (IF 2018 = 1,168; AIS 2018 = 0,249) Rajesware, J.J., Hatef, A., Golshan, M., Alavi, S.M.H., Unniappan, S., 2019. Metabolic stress leads to divergent changes in the ghrelinergic system in goldfish Carassius( auratus) go- nads. Comparative Biochemistry and Physiology Part A: Molecular and Integrative Physiology 235: 112–120. (IF 2018 = 2,142; AIS 2018 = 0,566) Rashid, I., Hossain, Md.S., Salam, M.A., Rafiquzzaman, S.M., 2019. Evaluation of seminal plasma composition and spermatozoa quality parameters of silver barb, Barbonymus goniono- tus Bleeker, 1850. Fish Physiology and Biochemistry 45: 105–114. (IF 2018 = 1,729; AIS 2018 = 0,415) Rodrigues, S., Antunes, S.C., Correia, A.T., Golovko, O., Zlabek, V., Nunes, B., 2019. Assessment of toxic effects of the antibiotic erythromycin on the marine fish gilthead seabreamSparus ( aurata L.) by a multi-biomarker approach. Chemosphere 216: 234-247. (IF 2018 = 5,108; AIS 2018 = 0,869) Rutegwa, M., Gebauer, R., Veselý, L., Regenda, J., Strunecký, O., Hejzlar, J., Drozd, B., 2019. Diffusive methane emissions from temperate semi-intensive carp ponds. Aquaculture Envi- ronment Interactions 11: 19–30. (IF 2018 = 2,380; AIS 2018 = 0,759) Rutegwa, M., Potužák, J., Hejzlar, J., Drozd, B., 2019. Carbon metabolism and nutrient balance in a hypereutrophic semi-intensive fishpond. Knowledge and Management of Aquatic Ecosys- tems 420: 49. (IF 2018 = 1,265; AIS 2018 = 0,299) Saberioon, M., Císař, P., Labbé, L., Souček, P., Pelissier, P., 2019. Spectral imaging application to discriminate different diets of live rainbow trout Oncorhynchus( mykiss). Computers and Electronics in Agriculture 165: 104949. (IF 2018 = 3,171; AIS 2018 = 0,582) Samarin, A.M., Samarin, A.M., Blecha, M., Křišťan, J., Policar, T., 2019. In vitro storage of pikeperch (Sander lucioperca) eggs. Aquaculture International 27: 1037–1044. (IF 2018 = 1,455; AIS 2018 = 0,339) Samarin, A.M., Samarin, A.M., Østbye, T.-K.K., Ruyter, B., Sampels, S., Burkina, V., Blecha, M., Policar, T., 2019. The possible involvement of oxidative stress in the oocyte ageing process in goldfish Carassius auratus (Linnaeus, 1758). Scientific Reports 9: 10469. (IF 2018 = 4,011; AIS 2018 = 1,286) Samarin, A.M., Samarin, A.M., Policar, T., 2019. Cellular and molecular changes associated with fish oocyte ageing. Reviews in Aquaculture 11: 619–630. (IF 2018 = 7,190; AIS 2018 = 1,787) Sarkar, U.K., Naskar, M., Srivastava, P.K., Roy, K., Sarkar, S.D., Gupta, S., Bose, A.K., Nandy, S.K., Verma, V.K., Sudgeesan, D., Karnatak, G., 2019. Climato-environmental influence on breeding phenology of native catfishes in River Ganga and modeling species response to climatic variability for their conservation. International Journal of Biometeorology 63: 991–1004. (IF 2018 = 2,377; AIS 2018 = 0,566) Sarkar, U.K., Roy, K., Naskar, M., Srivastava, P.K., Bose, A.K., Verma, V.K., Gupta, S., Nandy, S.K., Sarkar, S.D., Karnatak, G., Sudgeesan, D., Das, B.K., 2019. Minnows may be more repro- ductively resilient to climatic variability than anticipated: Synthesis from a reproductive vulnerability assessment of Gangetic pool barbs (Puntius sophore). Ecological Indicators 105: 727–736. (IF 2018 = 4,490; AIS 2018 = 0,899) Šebesta, R., Stejskal, V., Matoušek, J., Lundová, K., 2019. The effect of light intensity and tank wall colour on survival and growth of peled Coregonus peled Gmelin 1788 Larvae. Turkish Journal of Fisheries and Aquatic Sciences 19: 541–549. (IF 2018 = 0,738; AIS 2018 = 0,194) Sehonova, P., Tokanova, N., Hodkovicova, N., Kocour Kroupová, H., Tumová, J., Blahova, J., Marsalek, P., Plhalova, L., Doubkova, V., Dobsikova, R., Chloupek, P., Dolezalova, P., Faldyna, M., Svobodová, Z., Faggio, C., 2019. Oxidative stress induced by fluoroquinolone enrofloxa- cin in zebrafish Danio( rerio) can be ameliorated after a prolonged exposure. Environmental Toxicology and Pharmacology 67: 87–93. (IF 2018 = 3,061; AIS 2018 = 0,545)

105 03 VÝZKUM A EXCELENCE

Shah, B.R., Xu, W., Mráz, J., 2019. Cytochrome P450 1B1: role in health and disease and effect of nutrition on its expression. RSC Advances 9: 21050–21062. (IF 2018 = 3,049; AIS 2018 = 0,546) Shivaramu, S., Santo, C.E., Kašpar, V., Bierbach, D., Gessner, J., Rodina, M., Gela, D., Flajšhans, M., Wuertz, S., 2019. Critical swimming speed of sterlet (Acipenser ruthenus): Does in- traspecific hybridization affect swimming performance? Journal of Applied Ichthyology 35: 217–225. (IF 2018 = 0,877; AIS 2018 = 0,193) Shivaramu, S., Thi Vuong, D., Havelka, M., Šachlová, H., Lebeda, I., Kašpar, V., Flajšhans, M., 2019. Influence of interspecific hybridization on fitness-related traits in Siberian sturgeon and Russian sturgeon. Czech Journal of Animal Science 64: 78–88. (IF 2018 = 1,008; AIS 2018 = 0,222) Song, X., Rahimnejad, S., Zhou, W., Cal, L., Lu, K., 2019. Molecular characterization of peroxi- some proliferator-activated receptor-gamma coactivator-1 alpha (PGC1 alpha) and its role in mitochondrial biogenesis in blunt snout bream (Megalobrama amblycephala). Frontiers in Physiology 10: 1957. (IF 2018 = 3,201; AIS 2018 = 1,023) Stará, A., Bellinvia, R., Velíšek, J., Strouhová, A., Kouba, A., Faggio, C., 2019. Acute exposure of common yabby (Cherax destructor) to the neonicotinoid pesticide. Science of the Total Environment 665: 718–723. (IF 2018 = 5,589; AIS 2018 = 1,061) Stará, A., Kubec, J., Zusková, E., Buřič, M., Faggio, C., Kouba, A., Velíšek, J., 2019. Effects of S-metolachlor and its degradation product metolachlor OA on marbled crayfish Procamba-( rus virginalis). Chemosphere 224: 616–625. (IF 2018 = 5,108; AIS 2018 = 0,869) Steinbach, C., Císař, P., Šauer, P., Klicnarová, J., Schmidt-Posthaus, H., Golovko, O., Kocour Kroupová, H., 2019. Synthetic progestin etonogestrel negatively affects mating behavior and reproduction in Endler‘s guppies (Poecilia wingei). Science of the Total Environment 663: 206–215. (IF 2018 = 5,589; AIS 2018 = 1,061) Stejskal, V., Matoušek, J., Podhorec, P., Prokešová, M., Zajíc, T., Mráz, J., 2019. the effect of culture system on proximate composition and amino and fatty acid profiles of peledCoregonus peled fillets. Journal of Aquatic Food Product Technology 28: 933–943. (IF 2018 = 0,707; AIS 2018 = 0,131) Stellati, L., Borgianni, N., Bissattini, A.M., Buono, V., Haubrock, P.J., Balzani, P., Tricarico, E., Inghilesi, A.F., Tancioni, L., Martinoli, M., Luiselli, L., Vignoli, L., 2019. Living with aliens: Su- boptimal ecological condition in semiaquatic snakes inhabiting a hot spot of allodiversity. Acta Oecologica 100: 103466. (IF 2018 = 1,478; AIS 2018 = 0,487) Strunecký, O., Kopejtka, K., Goecke, F., Tomasch, J., Lukavský, J., Neori, A., Kahl, S., Pieper, D.H., Pilarski, P., Kaftan, D., Koblížek, M., 2019. High diversity of thermophilic cyanobacteria in Rupite hot spring identified by microscopy, cultivation, single-cell PCR and amplicon sequencing. Extremophliles 23: 35–48. (IF 2018 = 2,046; AIS 2018 = 0,576) Štys, D., Štysová Rychtáriková, R., Zhyrova, A., Štys, K.M., Jizba, P., 2019. Noisy hodgepodge machine and the observed mesoscopic behavior in the non-stirred Belousov/Zhabotinsky reaction. The European Physical Journal – Special Topics 227: 2361–2374. (IF 2018 = 1,660; AIS 2018 = 0,571) Tebbens, J.D., Matonoha, C., Matthios, A., Papáček, Š., 2019. On parameter estimation in and in vitro compartmental model for drug-induced enzyme production in pharmacotherapy. Applications of Mathematics 64: 253–277. (IF 2018 = 0,537; AIS 2018 = 0,331) Toomey, L., Bláha, M., Mauduit, E., Vanina, T., Baratcabal, M., Ledoré, Y., Vesala, S., Fontaine, P, Pasquet, A., Lecocq, T., 2019. When behavioural geographic differentiation matters: inter-populational comparison of aggressiveness and group structure in the European perch. Aquaculture International 27: 1177–1191. (IF 2018 = 1,455; AIS 2018 = 0,339) Toušová, Z., Vrana, B., Smutná, M., Novák, J., Klučárová, V., Grabic, R., Slobodník, J., Giesy, J.P., Hilscherová, K., 2019. Analytical and bioanalytical assessments of organic micropollutants in the Bosna River using a combination of passive sampling, bioassays and multi-residue analysis. Science of the Total Environment 650: 1599–1612. (IF 2018 = 5,589; AIS 2018 = 1,061) Tumová, J., Šauer, P., Golovko, O., Koba Ucun, O., Grabic, R., Máchová, J., Kocour Kroupová, H., 2019. Effect of polycyclic musk compounds on aquatic organisms: A critical literature review supplemented by own data. Science of the Total Environment 651: 2235–2246. (IF 2018 = 5,589; AIS 2018 = 1,061) Uzunmehmetoğlu, O.Y., Buřič, M., Erol, K.G., Özkök, R., Çınar, Ş., Kozák, P., 2019. Habitat se- paration of the crab potamon potamios and the crayfishPontastacus leptodactylus in Lake Eğirdir, Turkey. Limnologica 78: 125692. (IF 2018 = 2,051; AIS 2018 = 0,522)

106 FROV JU

Vanina, T., Gebauer, R., Toomey, L., Stejskal, V., Drozd, B., Bláha, M., Kouřil, J., Lecocq, T., 2019. Seeking for the inner potential: comparison of larval growth rate between seven populations of Perca fluviatilis. Aquaculture International 27: 1055–1064. (IF 2018 = 1,455; AIS 2018 = 0,339) Vanina, T., Gebauer, R., Toomey, L., Stejskal, V., Rutegwa, M., Kouřil, J., Bláha, M., Lecocq, T., 2019. Genetic and aquaculture performance differentiation among wild allopatric populations of European perch (Percidae, Perca fluviatilis). Aquaculture 503: 139–145. (IF 2018 = 3,022; AIS 2018 = 0,643) Velíšek, J., Stará, A., Zusková, E., Kubec, J., Buřič, M., Kouba, A., 2019. Effects of s-metolachlor on early life stages of marbled crayfish. Pesticide Biochemistry and Physiology 153: 87–94. (IF 2018 = 2,870; AIS 2018 = 0,730) Veselý, L., Boukal, D.S., Buřič, M., Kuklina, I., Fořt, M., Yazicioglu, B., Prchal, M., Kozák, P., Kouba, A., Sentis, A., 2019. Temperature and prey density jointly influence trophic and non- -trophic interactions in multiple predator communities. Freshwater Biology 64: 1984–1993. (IF 2018 = 3,404; AIS 2018 = 1,016) Weiperth, A., Gábris, V., Danyik, T., Farkas, A., Kuříková, P., Kouba, A., Patoka, J., 2019. Oc- currence of non-native red cherry shrimp in European temperate waterbodies: a case study from Hungary. Knowledge and Management of Aquatic Ecosystems 420: 9. (IF 2018 = 1,265; AIS 2018 = 0,299) Weiperth, A., Gáll, B., Kuříková, P., Langrová, I., Kouba, A., Patoka, J., 2019. Risk assessment of pet-traded decapod crustaceans in Hungary with evidence of Cherax quadricarinatus (von Martens, 1868) in the wild. North-Western Journal of Zoology 14: 42–47. (IF 2018 = 0,843; AIS 2018 = 0,244) Xie, X., Li, P., Pšenička, M., Ye, H., Steinbach, C., Li, C., Wei, Q., 2019. Optimization of in vitro culture conditions of sturgeon germ cells for purpose of surrogate production. Animals 9: 106. (IF 2018 = 1,832; AIS 2018 not counted) Xin, M., Vechtová, P., Kolešová, A., Fussy, Z., Loginov, D., Dzyuba, B., Linhart, O., Boryshpo- lets, S., Rodina, M., Li, P., Loginova, Y., Štěrba, J., 2019. Transferrin identification in sterlet (Acipenser ruthenus) reproductive system. Animals 9: 753. (IF 2018 = 1,832; AIS 2018 not counted) Xu, W., Lu, H., Jin, W., Ge, P., Shah, B.R., Zhu, D., Jing., J., 2019. Encapsulation and release behavior of curcumin based on nanoemulsions-filled alginate hydrogel beads. International Journal of Biological Macromolecules 134: 210–215. (IF 2018 = 4,784; AIS 2018 = 0,667) Xu, W., Xue, X., Huang, L., Liu, H., Shah, B.R., Wang, Y., Li, Y., Liu, X., 2019. Biomimetic minera- lization of calcium carbonate/poly (sodium p-styrenesulfonate) for lysozyme immobilization. Materials Research Express 6: 025101. (IF 2018 = 1,449; AIS 2018 = 0,236) Xu, W., Zhu, D., Li, Z., Luo, D., Hang, L., Jing, J., Shah, R.B., 2019. Controlled release of lysozy-

me based core/shells structured alginate beads with CaCO3 microparticles using Pickering emulsion template and in situ gelation. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces 183: 110410. (IF 2018 = 3,973; AIS 2018 = 0,687) Zhang, C.-N., Rahimnejad, S., Lu, K.-L., Zhou, W.-H., Zhang, J.-L., 2019. Molecular characterization of p38 MAPK from blunt snout bream (Megalobrama amblycephala) and its expression after ammonia stress, and lipopolysaccharide and bacterial challenge. Fish & Shellfish Immu- nology 84: 848–856. (IF 2018 = 3,298; AIS 2018 = 0,498)

ČLÁNKY ZAHRNUTÉ V DATABÁZI SCOPUS (CELKEM 6)

Bekkozhayeva, D., Saberioon, M., Císař, P., 2019. Image based individual identification of Su- matra barb (Puntigrus tetrazona). In: Rojas, I., Valenzuela, O., Rojas, F., Ortuño, F. (Eds), Bioinformatics and Biomedical Engineering. Lecture Notes in Computer Science 11465, 7th International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, IWBBIO 2019, Granada, Spain, 116–119. (SJR 2018 = 0,283) Bozhynov, V., Souček, P., Bárta, A., Urbanová, P., Bekkozhayeva, D., 2019. Dependency model for visible aquaphotomics. In: Rojas, I., Valenzuela, O., Rojas, F., Ortuño, F. (Eds), Bioinforma- tics and Biomedical Engineering. Lecture Notes in Computer Science 11465, 7th Internatio- nal Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, IWBBIO 2019, Granada, Spain, 105–115. (SJR 2018 = 0,283) Ethin, R., Hossain, S.Md., Roy, A., Rutegwa, M., 2019. Stock identification of minor carp, Cirrhi- nus reba, Hamilton 1822 through landmark-based morphometric and meristic variations. Fis- heries and Aquatic Sciences 22: 12. (SJR 2018 = 0,261)

107 03 VÝZKUM A EXCELENCE

Urban, J., 2019. Probability in HPLC-MS metabolomics. In: Rojas, I., Valenzuela, O., Rojas, F., Or- tuño, F. (Eds), Bioinformatics and Biomedical Engineering. Lecture Notes in Computer Scien- ce 11465, 7th International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, IWBBIO 2019, Granada, Spain, 132–141. (SJR 2018 = 0,283) Urban, J., Rycháriková, R., Macháček, P., Štys, D., Urbanová, P., Císař, P., 2019. Optimization of the computational burden of the point information gain. Acta Polytechnica 59: 593–600. (SJR 2018 = 0,200) Urbanová, P., Bozhynov, V., Bekkozhayeva, D., Císař, P., Železný, M., 2019. Pipeline for electron microscopy images processing. In: Rojas, I., Valenzuela, O., Rojas, F., Ortuño, F. (Eds), Bioinfor- matics and Biomedical Engineering. Lecture Notes in Computer Science 11465, 7th Internatio- nal Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, IWBBIO 2019, Granada, Spain, 142–153. (SJR 2018 = 0,283)

OSTATNÍ ČLÁNKY (CELKEM 4)

Kolářová, J., Policar, T., Nepejchalová, L., 2019. Aspekty bezpečného používání léčivých a dal- ších látek používaných v intenzivních chovech ryb využívajících technologii RASs (recirkulační akvakulturní systémy). Veterinářství 69: 418–420. Kolářová, J., Policar, T., 2019. Zdravotní problematika ryb chovaných v recirkulačních akvakultur- ních systémech (RAS) v ČR – přehled. Veterinářství 69: 412–417. Malečková, D., Štysová Rychtáriková, R., Urban, J., 2019. Obraz, informace, entropie. ProInflow 11:30–39. Prchal, M., Kocour, M., 2019. Genetika a šlechtění ryb: Možnosti zvyšování užitkovosti kapra selekcí. Rybářství 123: 56–59.

KNIHA (CELKEM 1)

Palíková, M., Piačková, V., Navrátil, S., Zusková, E., Papežíková, I., Kolářová, J., Pojezdal, Ľ., Dy- ková, I., Scholz, T., Gelnar, M., Svobodová, Z., Řehulková, E., Mareš, J., Modrá, H., Blažek, R., Veselý, T., 2019. Nemoci a chorobné stavy ryb. Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Fakulta rybářství a ochrany vod, Vodňany, 462 s.

KAPITOLA V KNIZE (CELKEM 2)

Keesman, K.J., Körner, O., Wagner, K., Urban, J., Karimanzirea, D., Rauschenbach, T., Goddek, S., 2019. Aquaponics systems modelling. In: Goddek, S., Joyce, A., Kotzen, B., Burnell, G.M. (Eds), Aquaponics Food Production Systems. Springer, Cham, Switzerland, pp. 267–299. Wuertz, S., Güralp, H., Pšenička, M., Chebanov, M., 2019. Sex determination in sturgeon. In: Wang, H.P., Piferrer, F., Chen, S.L., Shen, Z.G. (Eds), Sex Control in Aquaculture. John Wiley & Sons Ltd., Chichester, UK, pp. 645–668.

DIZERTAČNÍ PRÁCE (CELKEM 13)

Baloch, A.R., 2019. Utilization of CRISPR/Cas9 and novel germ cells labelling technique for surrogate production in sturgeons [Použití CRISPR/Cas9 a nové techniky značení zárodeč- ných buněk pro náhradní reprodukci u jeseterů]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 79 pp. Franěk, R., 2019. Germ cell manipulations as a tool to manage and produce isogenic lines in fish [Manipulace se zárodečnými buňkami jako nástroj pro management a produkci izogenních linií ryb]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 164 pp. KhaliliTilami, S., 2019. Factors influencing nutritional value of fish [Faktory ovlivňující výživovou hodnotu ryb]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 116 pp. Koutnik, D., 2019. The effect of triazine based pesticides and their metabolites on no-target aquatic organisms [Vliv triazinových pesticidů a jejich metabolite na necílové vodní organizmy]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 123 pp. Kubec, J., 2019. Decision making in crayfish: behavioural and reproductive issues [Rozhodovací proces u raků: problematika chování a reprodukce]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 97 pp. Lipták, B., 2019. Non-indigenous crayfish species in Slovakia [Nepůvodní druhy raků na Sloven- sku]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 98 pp.

108 FROV JU

Malinovskyi, O., 2019. Broodstock management of pikeperch (Sander lucioperca) and it’s effect on eggs and larval production [Management generačních ryb candáta obecného San-( der lucioperca) a jeho vliv na produkci jiker a larev]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 91 pp. Nima, H., 2019. Protein and lipid oxidation in fish: pathways, kinetics and products [Oxidace proteinů a lipidů u ryb: dráhy, kinetika a produkty]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 112 pp. Pospíchal, A., 2019. Susceptibility of cyprinid and non-cyprinid fish species to CyHV-3 [Vníma- vost kaprovitých a nekaprovitých druhů ryb k CyHV-3]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 83 pp. Šauer, P., 2019. Environmental pollutants progestins: occurrence, hormonal activities and effects on fish [Environmentální polutanty progestiny: výskyt, hormonální aktivity a účinky na ryby]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 114 pp. Shivaramu, S., 2019. Hybridization of sturgeons [Hybridizace jeseterů]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 106 pp. Vanina, T., 2019. Growth, genetic and morphological characteristics of different perch Perca( fluviatilis) populations in intensive aquaculture [Růst, genetické a morfologické charakteris- tiky různých populací okouna říčního (Perca fluviatilis) v intenzivní akvakultuře]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 91 pp. Xin, M.M., 2019. The role of some proteins in freezing fish sperm [Úloha některých proteinů při zmrazování spermatu ryb]. Ph.D. thesis, FROV JU, Vodňany, 87 pp.

CERTIFIKOVANÉ METODIKY (CELKEM 5)

Franěk, R., Kašpar, V., Pšenička, M., 2019. Zmrazování zárodečných buněk kapra obecného (Cyprinus carpio) a jejich využití k transplantaci do náhradních rodičů pro účely reprodukce. Certifikovaná metodika. Edice Metodik, FROV JU, Vodňany, č. 178, 27 s. Kolářová, J., Nepejchalová, L., Policar, T., 2019. Řešení zdravotní problematiky v intenzivních chovech ryb využívajících RAS (recirkulační akvakulturní systém). Edice Metodik, FROV JU, Vodňany, č. 180, 44 s. Manko, P., Adámek, Z., 2019. Metodické postupy při studiu potravy sladkovodních ryb. Edice Metodik, FROV JU, Vodňany, č. 177, 134 s. Piačková, V., Zusková, E., Kocour Kroupová, H., Máchová, J., Veselý, T., Matějíčková, K., Pojez- dal, Ľ., Papežíková, I., Syrová, E., Palíková, M., 2019. Diagnostika jarních úhynů kaprů. Edice Metodik, FROV JU, Vodňany, č. 181, 49 s. Policar, T., Křišťan, J., Dadras, H.A., Flajšhans, M., 2019. Produkce a využití triploidů u okouno- vitých ryb. Edice Metodik, FROV JU, Vodňany, č. 179, 25 s.

OVĚŘENÁ TECHNOLOGIE (CELKEM 1)

Franěk, R., Pšenička, M., 2019. Metody stabilní produkce diploidních gamet pomocí náhradních rodičů pro účely triploidizace v akvakultuře. Edice Metodik, FROV JU, Vodňany, č. 182, 30 s.

UŽITNÉ VZORY (CELKEM 2)

Křišťan, J., Policar, T., Dadras, H.A., 2019. Sada pro krátkodobé uchování a aktivaci spermatu candáta obecného. Užitný vzor č. 33417. Úřad průmyslového vlastnictví ČR, Praha. Urban, J., Bekkozhayeva, D., Bozhynov, V., Bárta, A., Urbanová, P., Souček, P., 2019. Zařízení pro standardizované fotografování živých objektů, zejména ryb. Užitný vzor č. 32990. Úřad průmyslového vlastnictví ČR, Praha.

SOFTWARE (CELKEM 6)

Lonhus, K., 2019. HuTrack – unsupervised miner of human trajectory from unannotated video. Software. Lonhus, K., 2019. HuFit – Fits the model to the data, using human-aided annotation (example .xlsx Excel file included) and .h5 tracklets from HuTrack software. Software. Lonhus, K., 2019. HuEs – Estimation of desired parameters in new data sequences. Software. Štysová, R., Štys, D., 2019. Řídící software mikroskopu NanoTruth. Software. Urban, J., Urbanová, P., Souček, P., 2019. de Wise Init. Software. Urban, J., Urbanová, P., 2019. de Wise Analyst. Software.

109 03 VÝZKUM A EXCELENCE

KONFERENCE A WORKSHOPY (CELKEM 3)

Papáček, Š., Petera, K., Masaló, I., Oca, J., 2019. On the optimization of recirculated aquaculture systems. In: Rodrigues, H.C., Herskovits, J., Mota Soares, C.M., Araújo, A.L., Guedes, J.M., Folgado, J.O., Moleiro, F., Madeira, J.F.A. (Eds), EngOpt 2018 Proceedings of the 6th Internatio- nal Conference on Engineering Optimization, Lisbon, Portugal, pp. 1229–1240. Valentová, O., Velíšek, J., 2019. XIX. konference „Toxicita a biodegradabilita odpadů a látek významných ve vodním prostředí“. Vodňany, 21.–23. 8. 2019. Velíšek, J.,, 2019. Sledování kvality masa sladkovodních ryb a výrobků z nich, Lnáře, 18.–19. 9. 2019.

Zpracovala: Pavlína Nováková

3.5. Citační indexy (SCI) dle Web of Science

Počet citací vč. Celkový počet Zdroj: Web of Science autocitací v roce citací bez Pracovník 2018 2019 autocitací Laboratoř etologie ryb a raků Ing. Miloš Buřič, Ph.D. 87 162 466 prof. Ing. Pavel Kozák, Ph.D. 188 215 1 243 Ing. Antonín Kouba, Ph.D. 226 380 964 doc. RNDr. Zdeněk Adámek, CSc. 74 125 589 M.Sc. Hamid Niksirat Hashjin, Ph.D. 73 150 424 Ing. Martin Bláha, Ph.D. 74 112 300 M.Sc. Iryna Kuklina, Ph.D. 26 48 136 Ing. Lukáš Veselý, Ph.D. 20 49 86 Mgr. Boris Lipták, Ph.D. 9 11 34 Mgr. Martin Fořt, Ph.D. 6 13 27 Ing. Jan Kubec, Ph.D. 3 35 26 M.Sc. Shakhawate Hossain 0 21 12 M.Sc. Sara Roje 1 4 7 M.Sc. Wei Guo 4 1 6 Ing. Filip Ložek 0 4 3 Laboratoř intenzivní akvakultury doc. Ing. Tomáš Policar, Ph.D. 156 210 730 M.Sc. Samad Rahimnejad, Ph.D. 82 160 316 Ing. Křišťan Jiří, Ph.D. 61 83 187 M.Sc. Azin Mohagheghi Samarin, Ph.D 48 62 111 Ing. Miroslav Blecha, Ph.D. 51 82 110 M.Sc. Carlos Yanes-Roca, Ph.D. 11 14 76 M.Sc. Hadiseh Dadras Asyabar, Ph.D. 25 35 60 M.Sc. Oleksandr Malinovskyi, Ph.D. 8 26 21 M.Sc. Aiman Imentai 5 7 17 M.Sc. Azadeh Mohagheghi Samarin, Ph.D. 5 11 13 M.Sc. Nima Hematyar, Ph.D. 2 5 6 Laboratoř fyziologie reprodukce M.Sc. Sergii Boryshpolets, Ph.D. 103 105 454 Jacky Cosson, Ph.D., Dr.h.c. 501 605 4 590 prof. Ing. Otomar Linhart, DrSc. 398 418 3 602 Ing. Marek Rodina, Ph.D. 310 365 1 336 M.Sc. Ping Li, Ph.D. 154 113 1 015 doc. M.Sc. Borys Dzyuba , Ph.D. 156 220 694 M.Sc. Hermes Augusto Buarque Gadelha, Ph.D. 77 116 455 M.Sc. Viktoriya Dzyuba , Ph.D. 27 70 147 M.Sc. Mohammad Abdul Momin Siddique, Ph.D. 38 37 93 M.Sc. Olga Bondarenko, Ph.D. 16 36 75 M.Sc. Volodymyr Bondarenko, Ph.D. 16 17 66 M.Sc. MiaoMiao Xin, Ph.D. 11 13 35

110 FROV JU

M.Sc. Vitaliy Kholodnyy, Ph.D. 5 13 29 M.Sc. Yevhen Horokhovatskyi, Ph.D. 6 12 17 Mgr. Vladimíra Tučková 2 7 12 M.Sc. Yu Cheng 1 3 5 Laboratoř molekulární, buněčné a kvantitativní genetiky prof. Ing. Martin Flajšhans, Dr.rer.agr. 144 157 1 381 doc. Ing. Martin Kocour, Ph.D. 88 83 792 Ing. Vojtěch Kašpar, Ph.D. 34 61 293 M.Sc. Ievgenia Gazo, Ph.D. 62 94 273 M.Sc. Anna Kolešová, Ph.D. 59 67 241 M.Sc. Ievgen Lebeda, Ph.D. 17 26 50 M.Sc. Olena Shaliutina 16 15 47 Girish Kumar, Ph.D. 15 12 34 Mgr. Eva Prášková, Ph.D. 5 9 22 Ing. Martin Prchal, Ph.D. 8 19 20 M.Sc. Sahana Shivaramu, Ph.D. 0 7 7 M.Sc. Jinfeng Zhao 4 4 7 Laboratoř zárodečných buněk doc. Ing. Martin Pšenička, Ph.D. 122 211 770 Ing. Zuzana Bláhová 12 2 89 M.Sc. Abdul Rasheen Khanzai Baloch, Ph.D. 17 35 65 M.Sc. Hilal Güralp, Ph.D. 2 13 18 M.Sc. Viktoriia Iegorova, Ph.D. 0 9 9 Mgr. Tomáš Tichopád 0 1 4 M.Sc. Xuan Xie 0 3 3 M.Sc. Fatira Effrosyni 0 3 2 Ing. Roman Franěk, Ph.D. 0 4 0 Laboratoř environmentální chemie a biochemie prof. Ing. Tomáš Randák, Ph.D. 325 316 1 948 doc. Mgr. Roman Grabic, Ph.D. 609 704 3 350 doc. Ing. Vladimír Žlábek, Ph.D. 234 235 1 507 MVDr. Jitka Kolářová 123 108 898 M.Sc. Ganna Fedorova, Ph.D. 188 203 767 M.Sc. Oksana Golovko, Ph.D. 154 236 525 Ing. Jan Turek, Ph.D. 66 75 325 Ing. Kateřina Grabicová, Ph.D. 89 119 307 RNDr. Andrea Vojs Staňová, Ph.D. 21 53 209 M.Sc. Viktoriia Burkina, Ph.D. 62 63 190 Ing. Daniel Červený, Ph.D. 44 60 144 M.Sc. Pavlo Fedorov, Ph.D. 14 39 64 M.Sc. Sidika Sakalli, Ph.D. 11 10 19 Ing. Adam Bořík 1 14 16 M.Sc. Pham Thain Giang 0 6 5 Ing. Helena Švecová, Ph.D. 0 1 4 Ing. Marie Šandová 0 0 1 Laboratoř vodní toxikologie a ichtyopatologie dr hab. Ing. Josef Velíšek, Ph.D. 362 319 1 934 prof. MVDr. Zdeňka Svobodová, DrSc. 495 513 3 138 Ing. Jana Máchová, Ph.D 182 149 1 374 doc. Ing. Hana Kocour Kroupová, Ph.D 117 116 791 MVDr. Veronika Piačková, Ph.D. 86 80 735 Ing. Alžběta Stará, Ph.D. 152 187 571 MVDr. Eliška Zusková, Ph.D. 104 132 543 Dipl. Biol. Christoph Steinbach, Ph.D. 25 30 120 M.Sc. Latifeh Chupani, Ph.D. 20 56 100 Ing. Olga Valentová 8 20 65 Ing. Josef Příborský 14 35 65 Ing. Dalibor Koutnik, Ph.D. 24 9 56

111 03 VÝZKUM A EXCELENCE

Ing. Pavel Šauer, Ph.D. 3 28 26 Ing. Jaroslava Lidová 4 6 10 Experimentální rybochovné pracoviště a pokusnictví Ing. Pavel Lepič 12 18 109 Ing. Jitka Hamáčková 344 40 502 Ing. Andrea Lepičová 5 3 94 Genetické rybářské centrum Ing. Gela David, Ph.D. 156 157 1 401 Bc. Martin Kahanec, DiS. 0 2 1 Laboratoř aplikované hydrobiologie RNDr. Bořek Drozd, Ph.D. 15 23 75 Mgr. Otakar Strunecký, Ph.D. 69 81 480 Ing. David Hlaváč, Ph.D. 11 29 59 Ing. Adéla Stupková, Ph.D. 9 15 49 Ing. Jan Potužák, Ph.D. 10 22 43 RNDr. Jindřich Duras, Ph.D. 3 12 41 Ing. Pavel Hartman, CSc. 4 18 38 Ing. Pavel Franta 4 12 25 Ing. Ján Regenda, Ph.D. 2 8 10 M.Sc. Marcellin Rutegwa 0 3 2 Ing. Kateřina Francová 0 1 1 Laboratoř řízené reprodukce a intenzivního chovu ryb Ing. Vlastimil Stejskal, Ph.D. 55 75 259 prof. Ing. Jan Kouřil, Ph.D. 43 47 410 Mgr. Tomáš Korytář, Ph.D. 74 98 387 Mgr. Peter Podhorec, Ph.D. 20 24 111 Ing. Jan Matoušek 12 19 74 Ing. Markéta Prokešová, Ph.D. 8 10 59 Ing. Roman Šebesta, Ph.D. 1 7 18 M.Sc. Tatyana Gebauer (Vanina), Ph.D. 1 6 6 Ing. Jindřiška Knowles (Matějková) 0 1 3 M.Sc. Katsiaryna Lundová (Novikava) 0 1 1 Laboratoř výživy doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D. 56 42 171 RNDr. Aleš Tomčala, Ph.D. 82 100 615 M.Sc. Bakht Ramin Shah, Ph.D. 117 145 419 M.Sc. Jinfeng Pan, Ph.D. 30 46 147 Mgr. Zuzana Linhartová, Ph.D. 25 37 126 RNDr. Jan Kolek, Ph.D. 28 48 65 Ing. Petr Dvořák, Ph.D. 19 4 59 M.Sc. Hui Jia 10 8 36 Ing. Roman Lunda 2 6 11 M.Sc. Koushik Roy 5 18 8 Ing. Radek Gebauer, Ph.D. 0 5 5 Laboratoř komplexních systémů Prof. RNDr. Dalibor Štys, CSc. 72 42 697 Ing. Štěpán Papáček Ph.D. 26 18 115 Mgr. Jiří Jablonský, Ph.D. 13 15 75 Ing. Bc. Renata Štysová Rychtáriková, Ph.D. 11 1 16 M.Sc. Kirill Lonhus 0 2 2 M.Sc. Daria Malakhova 3 2 0 Laboratoř zpracování signálu a obrazu Ing. Jan Urban, Ph.D. 22 14 118 Mgr. Mohammadmehdi Saberioon, Ph.D. 110 127 323 Ing. Petr Císař, Ph.D. 43 39 134 Ing. Aliaksandr Pautsina, Ph.D 22 17 47 M.Sc. Oleksandr Mashchenko 12 8 26

Zpracovala: Zuzana Dvořáková

112 FROV JU

3.6. Excelentní výzkum

Nejvýznamnější výstupy v období 2018–2019

Tato studie členů z Laboratoře environmentální chemie a biochemie přinesla nové poznatky o výskytu a osudu emergentních polutantů, konkrétně per- a polyfluoroalkylovaných sloučenin (PFAS), v reálném vodním ekosystému ovlivněném výtokem z čistírny odpadních vod (ČOV). PFAS jsou plošně používány např. jako složky ochranných vrstev oděvů či kuchyňského nádobí (např. teflon, Gore-Tex), jež se dostávají i do komunálních odpadních vod. Během procesu jejich čištění však nejsou zcela odstraňovány a kontaminují vodní prostředí. V rámci této studie byla použita unikátní metodika terénního experimentu a nově vyvinuté efektivní analytické LC-HRMS metody pro detekci PFAS ve vodě, biotě (bentosu a rybách) a v pasivních vzorkovačích POCIS. V průběhu času tak byl popsán výskyt a osud čtrnácti sloučenin ze skupiny PFAS v prostředí malého toku ovlivněného výtokem „vyčištěné“ vody z ČOV. Pokročilou analýzou byla zjištěna pří- tomnost 12 sledovaných látek v různých složkách vodního prostředí včetně potravního řetězce. Jedná se tak o důležitý poznatek využitelný v oblasti ochrany životního prostředí.

Raci patří do skupiny živočichů, kteří jsou využíváni jako bioindikátory čisté vody. Jsou velmi citliví na změny svého životního prostředí a rychle na ně reagují. Díky tomu mají raci velký po- tenciál při detekci znečišťujících látek ve vodě. I drobnější změna kvality vody se projeví na jejich srdeční aktivitě. Vědci vyvinuli několik počítačových systémů, které využívají mechanizmu spočívajícího v detekci a analýze srdečního tepu raků. Jejich hlavním problémem jsou ale dráty nebo optická vlákna, které je nutné k přenosu signálu ze snímače využívat. Snímač je umístěn na zádech raka, odkud je signál přenášen do počítače. Tyto sensory a jejich připojení ale zne- možňují umístit více raků do jednoho akvária a omezují i jejich přirozený pohyb, čímž jejich vy- povídací schopnosti omezují. Vědci na Fakultě rybářství a ochrany vod tento problém vyřešili. Díky spolupráci členů Laboratoře etologie ryb a raků a Laboratoře zpracování signálu a obrazu vytvořili originální systém sledování srdečního tepu, který je založen na zcela neinvazivním, bezdotykovém hardwaru. Systém dokáže stanovit frekvenci srdečního tepu kombinací infračer- veného osvětlovače a citlivé kamery. Není třeba žádný sensor, a proto je možné monitorovat více raků v jednom akváriu současně. Tento systém je navíc levnější a představuje efektivnější ekvivalent dřívějších metod.

V komunálních odpadních vodách, které byly v minulosti považovány za poměrně snadno čistitelné, se ve stále větší míře objevují znečišťující látky. Významnou skupinu těchto látek představují progestiny (či progestageny), které jsou obsaženy například v hormonální antikoncepci. Jedná se o látky, které čistírnami odpadních vod mnohdy procházejí bez výraznějších změn a díky tomu dále přecházejí do povrchových vod. Z toho důvodu se vědci z Fakulty rybář- ství a ochrany vod JU zaměřili na mapování výskytu syntetických progestinů ve vodním prostředí a s tím souvisejících hormonálních (progestagenních) aktivit na vybraných lokalitách v České re-

113 03 VÝZKUM A EXCELENCE

publice. Ve svém výzkumu se zaměřili na „rizikové“ lokality, ke kterým patří odtoky z čistíren ko- munálních odpadních vod a dále místa pod zaústěním vyčištěných odpadních vod, kde dochází k jejich naředění. Souběžně s monitoringem výskytu těchto látek byly prováděny laboratorní pokusy, při kterých byla sledována i jejich hormonální aktivita. Díky tomuto výzkumu již dnes víme, že koncentrace sledovaných hormonů na odtoku z českých čistíren odpadních vod zatím nedosahují tak vysokých hodnot, jaké byly zaznamenány v jiných evropských či asijských stá- tech. Vzhledem k neustále narůstající spotřebě hormonálních preparátů a k jejich rozšiřujícímu se spektru je však potřeba i nadále věnovat této problematice náležitou pozornost. Výsledky dosavadního bádání rovněž naznačily, které látky z široké skupiny progestinů lze v našich pod- mínkách označit jako nejvíce rizikové, a tudíž by jim bylo vhodné dát nejvyšší prioritu v dalším výzkumu. Tyto byly na odtocích z čistíren odpadních vod detekovány nejčastěji a zároveň vyka- zují relativně velkou hormonální (progestagenní) aktivitu.

Iegorova, V., Pšenička, M., Lebeda, Y., Rodina, M., Saito, T., 2018. Polyspermy produces viable haploid/diploid mosaics in sturgeon. Biology of Reproduction 99: 695–706.

Většina druhů jeseterů je dnes kriticky ohrožena a obnova jejich populací je závislá na člově- ku a umělé reprodukci. Ta je však náročná mj. kvůli pozdnímu dospívání generačních ryb. Poro- zumění jejich reprodukční biologii je proto velmi důležité. Viktroiia Iegorova a kolektiv z Fakulty rybářství a ochrany vod JU popsali způsob oplození u jeseterů, který je unikátní v celé živočišné říši. Během oplozování byly pozorovány dva mechanizmy. Prvním je fyziologická polyspermie (proniknutí více spermií) a druhým karyogamie (fúze prvojader spermie a vajíčka) s dodatečnou plazmogamií (fúze cytoplazmy vajíčka a další spermie). Studie demonstrovala, že během oplo- zení vajíčka dochází vlivem vyššího počtu mikropilárních otvorů k proniknutí více spermií (až 10) do cytoplazmy vajíčka. Tyto spermie mají tendenci degradovat v čase a obvykle jen prvojádro jedné spermie fúzuje s jádrem vajíčka. Nicméně některé spermie, které nefúzovaly s prvojádrem vajíčka a unikly degradačním mechanizmům, se mohou dále účastnit vývoje a dát vzniknout tzv. polyspermní mozaice. Tyto polyspermní mozaiky se vyznačují vyšším počtem blastomer ve sta- diu 2–4 buněk a mozaikovou haploidní/diplodní úrovní. Během naší práce bylo potvrzeno, že diploidní buňky obsahují genetickou informaci matky i otce, zatímco haploidní buňky vykazovaly jen otcovský genotyp. Tyto mozaiky se překvapivě vyvíjely normálně a přežívaly jako kontrolní ryby. Získané poznatky nám mohou umožnit aplikaci nových biotechnologických postupů, jako je produkce klonálních gamet.

Ruku v ruce se změnou klimatu vzrůstá frekvence, doba trvání a intenzita extrémů počasí, jako jsou například období extrémního sucha. Tyto situace jsou přirozeně kritické pro vodní organizmy, neboť přímo souvisí s prostředím, které obývají. Raci v tomto období ocení své úkryty a nory, jež jim umožňují zachovat kontakt s hladinou vody či alespoň setrvání v prostředí s vyšší vzdušnou vlhkostí. Některé druhy raků, u nás nepůvodních, se i za takových okolností dokáží rozmnožovat. Není však známo, zda je k reprodukci nezbytně nutný kontakt s vodou, nebo zda je dostačující pobyt v prostředí s vysokou vzdušnou vlhkostí, jíž lze v norách při jejich uzavření dosáhnout. Členové Laboratoře ryb a raků za tímto účelem provedli sérii experimentů využívajících umě- lé nory s vysokou vzdušnou vlhkostí a invazivní raky mramorované jako modelový organizmus. Reprodukující se samice držené ve vodě posloužily jako kontrolní skupina. Samice s vajíčky pře- nesené do nor s vysokou vlhkostí své potomky úspěšně odlíhnuly. V dalším experimentu byly samice s vajíčky přeneseny opět do nor s vysokou vzdušnou vlhkostí a po prodělaném líhnutí byl dokumentovaný i navazující postembryonální vývoj ráčat. Vylíhlá ráčata byla schopna se i za těchto podmínek úspěšně svléknout do druhého vývojového stadia, další vývoj však nebyl

114 FROV JU zaznamenán. Tato ráčata však zůstala v průměru životaschopná po dobu dvaceti dnů (toto stadium běžně trvá jen jednotky dnů), a pokud byla přenesena do vodního prostředí, jejich další vývoj (svlékání do třetího vývojového stadia, osamostatnění se a započetí příjmu potravy) probíhal normálně. Získané výsledky demonstrují schopnost raka mramorovaného prodělat značnou část emb- ryonálního a postembryonálního vývoje pouze v podmínkách vysoké vzdušné vlhkosti, což není u původních evropských druhů raků dosažitelné. Tyto výsledky zdůrazňují význam adaptací vod- ních organizmů vůči vysychání, stejně jako schopnosti raka mramorovaného jako invazivního partenogeneticky se rozmnožujícího druhu.

Nemoci a chorobné stavy ryb

Kniha Nemoci a chorobné stavy ryb je svým pojetím první knihou svého druhu napsanou českými autory v českém jazyce. Vznikla z dlouhodobé potřeby aktuálního studijního materiálu pro studenty Veterinární a farmaceutické univerzity Brno i studentů oborů zaměřených na chov ryb. Autorský kolektiv tvoří patnáct odborníků z několika českých univerzit a institucí Akademie věd ČR (tři z FROV JU) a výsledkem jejich práce pod vedením doc. MVDr. Miroslavy Palíkové, Ph.D., je dílo, které bude na dlouho základním materiálem pro získávání vědomostí v oblasti nemocí ryb. V jednotlivých kapitolách jsou zapracovány nejnovější vědecké i praktické poznatky o virových, bakteriálních, parazitárních, mykotických a neinfekčních chorobách ryb, včetně aktuálního přehledu možností léčby v chovech ryb, velkou měrou využitelné i v rybářské praxi. Kniha respektuje nové taxonomické řazení organizmů, čímž se výrazně liší od starších publikací podobného zaměření. Autorský kolektiv uvažuje o vydání knihy v anglickém jazyce. Při předsta- vení knihy některým významným členům European Association of Fish Pathologists byl tento záměr velmi příznivě kvitován.

115 03 VÝZKUM A EXCELENCE

Ocenění fakulty, centra, zaměstnanců a studentů

Ocenění práce Otomara Linharta

Profesor Otomar Linhart je předním odborníkem v oblasti reprodukce a šlechtění ryb. V letech 2005–2009 zastával pozici ředitele Výzkumného ústavu rybářského a hydrobiologického ve Vodňanech (VÚRH) a inicioval vznik Fakulty rybářství a ochrany vod, kde působil od jejího za- ložení (září 2009) až do roku 2017 v pozici děkana. Zasloužil se jako ředitel o vznik centra výzku- mu CENAKVA (2010–2019) a po vybudování fakulty na její transformaci ve velkou výzkumnou infrastrukturou s otevřeným přístupem. Vedle bohaté publikační a projektové činnosti vždy dbal o vytváření dobrých vztahů na národní i mezinárodní úrovni. Tím se zasloužil o rozvoj oboru, fakulty, univerzity, kraje a regionu. Nejen díky těmto zásluhám mu byla udělena ocenění osobnosti roku v jihočeském kraji (2013) a na Strakonicku (2018). V letech 2018–2019 pak získal pamětní medaili Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích, pamětní medaili VÚRH a na Univerzitě sva- tého Štěpána v maďarském Gödöllő mu byl udělen titul professor honoris causa.

Udělení čestného doktorátu JU

Ve středu 31. října 2018 byl na českobudějovické radnici udělen čestný titul doctor honoris causa Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích paní prof. Janě Pickové, Ph.D. Prof. Jana Pickova je mezinárodně známá vědkyně zabývající se významem lipidů pro bio- logické procesy, zejména výzkumem aspektů složení tuků v potravě, úlohou mastných kyselin a jejich metabolickými transformacemi, vlivem složení lipidů na reprodukci ryb, složením, degra- dací a stabilitou rybího tuku a v neposlední řadě vlivem složení unikátních rybích tuků na die- tetickou kvalitu konzumovaných ryb. Jana Pickova je více než dvacet let aktivní spolupracovnicí Výzkumného ústavu rybářského a hydrobiologického, později Fakulty rybářství a ochrany vod JU. Tato plodná spolupráce je zjevná na poli projektovém, publikačním, ale i vzájemné výměny stu- dentů. Značnou měrou tak pomohla rozvoji centra CENAKVA a vzniku dnešní Laboratoře výživy, čímž přispěla k rozvoji fakulty.

116 FROV JU

Časopis Týden

Již téměř tradičně se v rámci průzkumu časopisu Týden („Kam jít studovat na vysokou školu”) umístila Fakulta rybářství a ochrany vod JU na prvním místě v kategorii zemědělských, lesnických a veterinárních věd. Věříme, že se nám tohoto prestižního ocenění podaří dosahovat i nadále.

Casting sport

V sezóně 2018/2019 se studentka naší fakulty Kateřina Marková v rybářském sportu ne- ztratila. Na mistrovství České republiky v Kroměříži Kateřina vybojovala 1. místo v celkovém pětiboji i sedmiboji žen. Svou suverenitu potvrdila i na mezinárodním mistrovství Vídně a o ně- kolik týdnů déle i na mezinárodním mistrovství Švýcarska, kde znovu vybojovala nejvyšší příčku. Vyvrcholením celé sezóny bylo mistrovství světa ve Švédsku (Ronneby), kde Kateřina vybojovala hned 5 zlatých, 2 stříbrné a 2 bronzové medaile. Stala se tak mistryní světa v celkovém pětiboji a sedmiboji žen a zároveň v disciplíně č. 5 (hod zátěží 7,5 g do výseče) překonala a stanovila nový světový rekord ve vzdálenosti 78,64 m, který přehodila o necelé 3 metry. Na jaře 2019 se vítězstvím třech kvalifikačních závodů Kateřina nominovala na mistrovství světa. Obhájila titul mistryně Vídně a svou kvalitu potvrdila i na mezinárodním mistrovství České republiky, kde vybojovala několik zlatých medailí. Na samotném mistrovství světa vybojovala tituly mistryně světa v disciplínách: Moucha skish, zátěž arenberk, multi skish a v neposlední řadě obhájila titul a stala se mistryní světa v celkovém pětiboji a sedmiboji žen pro rok 2019.

Věda pro zemi

Naše studentka Bc. Alžběta Strouhová se zúčastnila celostátní soutěže Věda pro zemi, or- ganizované Národním zemědělským muzeum. V kategorii bakalářská práce obsadila se svou prací nazvanou „Neonikotinoidy ve vodních ekosystémech a jejich vliv na necílové organismy“ (vedoucí Ing. Alžběta Stará, Ph.D.) sdílené 1.–3. místo.

117 04 PEDAGOGICKÁ ČINNOST

4. PEDAGOGICKÁ ČINNOST

Studijní pracoviště

Proděkan pro pedagogickou činnost řídí Studijní pracoviště fakulty a metodicky koordinuje ostatní činnosti na fakultě spojené se studiem, dále dbá o rozvoj studijní činnosti na fakultě. Pracoviště spravuje studijní agendu od bakalářského, magisterského až po doktorský stupeň studia, připravuje přijímací řízení ke studiu, organizuje státní závěrečné zkoušky a akademické obřady, eviduje studijní programy, plány, vyučující a učebny v IS/STAG. Dále pracoviště spravuje absolventský klub a zprostředkovává pracovní nabídky pro zvýšení uplatnitelnosti absolventů fakulty na trhu práce.

doc. Ing. Martin Kocour, Ph.D. Ing. Jitka Plecerová proděkan pro pedagogickou čin- studijní referentka pro Bc. + nost Mgr. studium [email protected] (od 5/2018 do 5/2019) [email protected]

Ing. Martina Vorlová Lucie Kačerová vedoucí studijního pracoviště referentka pro Ph.D. studium a za- [email protected] hraniční činnost [email protected]

Mgr. Kateřina Bártová studijní referentka pro Bc. + Mgr. studium (do 11/2019) [email protected]

Fakulta rybářství a ochrany vod zajišťuje všechny stupně studia (bakalářský, navazující magi- sterský, doktorský) jak v prezenční, tak i kombinované formě. Výuka bakalářského a navazujícího magisterského studia je realizována především na Ústavu akvakultury a ochrany vod v Českých Budějovicích v kampusu Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích (Budova ZR) a blízkém oko- lí (budova na Husově třídě). Nejvyšší počet studentů doktorského studia působí v laboratořích Výzkumného ústavu rybářského a hydrobiologického ve Vodňanech.

118 FROV JU

Vývoj celkového počtu studentů na FROV JU od roku 2009 (XX/YY = měsíc/rok; hodnoty v říjnu daného roku ukazují stav na počátku výuky v příslušném akademickém roce, hodnoty v červnu daného roku ukazují naopak stav na konci výuky příslušného akademického roku).

BAKALÁŘSKÉ STUDIUM

Akreditované studijní programy a obory Studijní program Číslo Studijní obor Kód oboru Forma studia Stand. Jazyk Akreditace (SP) SP doba výuky do studia Zootechnika B4103 Rybářství 4103R003 prezenční, 3 roky český 31. 12. 2024 kombinovaná Ekologie a ochra- B1601 Ochrana vod 1601R004 prezenční 3 roky český 31. 12. 2024 na prostředí

Profil a cíle studia

V oboru Rybářství lze získat odborné znalosti v oblasti biologicko-ekologických vazeb vod- ních organizmů, moderních technologií v rybníkářství i v chovu ryb ve specializovaných zaříze- ních a vodním hospodářství. Studenti se rovněž seznamují s problematikou právních ustanovení v rybářství, s legislativou ochrany vod, vodního prostředí a nakládání s vodami. Absolventi jsou kvalifikováni k činnostem souvisejícími s chovem ryb, výkonem rybářského ale i mysliveckého práva a zároveň jsou připraveni k odborné práci v oblastech souvisejících s ochranou životního prostředí, vodohospodářstvím a kvalitou vod na úrovni nižšího a středního managementu. Vý- uka v oboru Rybářství je nabízena v prezenční i kombinované formě studia. Obor Ochrana vod je zaměřen více na chemické procesy ve vodním prostředí, fyzikální vlastnosti vody, ekologii, legislativní ochranu a užívání vod v rámci EU, koloběh vody v krajině, čištění odpadních vod, vodárenství, vodohospodářství a vodní stavby. Výuka v oboru je nabízena pouze v prezenční formě. Cílem studia oboru Ochrana vod je připravit odborníky, kteří jsou zárukou naplňování, dodržování a vylepšování legislativy týkající se ochrany vod a životního prostředí na úrovni nižšího a středního managementu. U obou oborů je kladen důraz na jazykovou přípravu studenta, absolvent by měl být schopen bez problémů komunikovat ústně i písemně v anglickém jazyce.

119 04 PEDAGOGICKÁ ČINNOST

Počty studentů přijatých do prvních ročníků Akademický Studijní pro- Studijní Forma studia Počet došlých Počet Počet studentů rok gram (kód obor přihlášek přijatých zapsaných do prv- programu) ke studiu uchazečů ního ročníku 2018/2019 Zootechnika Rybářství prezenční 47 47 28 (B4103) 2018/2019 Zootechnika Rybářství kombino- 26 25 20 (B4103) vaná 2018/2019 Ekologie Ochrana prezenční 43 40 15 a ochrana vod prostředí (B1601) Celkem 116 112 63 2019/2020 Zootechnika Rybářství prezenční 45 44 20 (B4103) 2019/2020 Zootechnika Rybářství prezenční 21 18 16 (B4103) 2019/2020 Ekologie Ochrana kombino- 63 56 27 a ochrana vod vaná prostředí (B1601) Celkem 129 118 63

Student 2. ročníku bakalářského studia během pasování do cechu rybářského.

120 FROV JU

Počty studentů ve vyšších ročnících (údaje ke dni 31. 10. daného akademického roku) Akademický Studijní program Studijní obor Forma studia 2. ročník 3. ročník 4. a vyšší Celkem rok (kód programu) ročník 2018/2019 Zootechnika Rybářství prezenční 8 8 1 17 (B4103) Zootechnika Rybářství kombinovaná 3 1 1 5 (B4103) Ekologie a ochra- Ochrana vod prezenční 8 5 1 14 na prostředí (B1601) Celkem 19 14 3 36 2019/2020 Zootechnika Rybářství prezenční 14 7 1 22 (B4103) Zootechnika Rybářství kombinovaná 6 1 – 7 (B4103) Ekologie a ochra- Ochrana vod prezenční 6 8 2 16 na prostředí (B1601) Celkem 26 16 3 39

Absolventi bakalářského studia, kteří obhájili závěrečnou kvalifikační práci v letech 2018 a 2019 Rok Student Téma bakalářské práce Vedoucí práce Výsledek SZZ absolv. 2018 Lenka Kajgrová Makrozoobentos zarostlého a volného doc. RNDr. Zdeněk absolvovala bahnitého litorálu kaprových rybníků Adámek, CSc. s vyznamená- ním 2018 Ondřej Bartoš Použití obohacených nauplií artémie pro prof. Ing. Jan absolvoval odkrm larev ryb Kouřil, Ph.D 2018 Tomáš Doležal Rybí společenstvo vybraných toků Jizer- Ing. Petr Dvořák, absolvoval ských hor Ph.D. 2018 Pavel Duda Využití hormonálních přípravků při výtěru Ing. Pavel Lepič, absolvoval podoustve říční (Vimba vimba) Ph.D. 2018 Jiří Jakš Hejnové chování jako odezva na změny Ing. Jan Urban, absolvoval prostředí, přehledová studie Ph.D. 2018 Marek Kodras Možnosti využití hmyzí moučky v krmivech Ing. Pavel Lepič, absolvoval pro candáta obecného (Sander lucioper- Ph.D. ca) 2018 Tomáš Kolařík Hodnocení efektivity reintrodukce lipana Ing. Jan Turek, absolvoval podhorního (Thymallus thymallus L.) Ph.D. do vybraných lokalit jihočeských toků 2018 Petr Kovář Potravní chování hlaváčovitých ryb v závis- Ing. Radek Ge- absolvoval losti na komplexitě prostředí bauer, Ph.D. 2018 Miloslav Krejčí Kompetice o úkryt mezi hlavačkou mra- RNDr. Bořek absolvoval morovanou a hlaváčem černoústým Drozd, Ph.D. 2018 Tadeáš Přibyl Testování háďátka octového (Turbatrix Ing. Roman Šebes- absolvoval aceti) a substrátů pro eliminaci olejových ta, Ph.D. látek z povrchové blanky pro raná stádia okouna říčního (Perca fluviatilis) 2018 Alžběta Neonikotinoidy ve vodních ekosystémech Ing. Alžběta Stará, absolvovala Strouhová a jejich vliv na necílové organismy Ph.D. 2018 Ondřej Tunys Vliv přírodních extraktů na senzorické Mgr. Zuzana Lin- absolvoval vlastnosti a prodloužení skladovatelnosti hartová, Ph.D. masa pstruha duhového (Oncorhynchus mykiss)

121 04 PEDAGOGICKÁ ČINNOST

2018 Jan Volský Vliv krmení raného plůdku jesetera malého M.Sc. Katsiaryna absolvoval (Acipenser ruthenus) obohacenými Lundová naupliemi žábronožky (r. Artemia) na jeho růst a přežití 2019 Oldřich Pecha Využití přípravků umožňujících kontrolo- Mgr. Peter Podho- absolvoval vané uvolňování hormonální látky v umělé rec, Ph.D. s vyznamená- reprodukci ryb ním 2019 Jan Rytíř Odhad ekologického vlivu hlaváče čer- RNDr. Bořek absolvoval noústého (Neogobius melanostomus) Drozd, Ph.D. s vyznamená- na makrozoobentos dolního Labe pomocí ním funkční odpovědi potravního chování: vliv velikosti predátora 2019 Jan Janík Hematologické vyšetření ryb po antipara- MVDr. Eliška Zus- absolvoval zitární léčbě ková, Ph.D. 2019 Martin Kareš Splňují ryby chované v biologickém ryb- doc. Ing. Vladimír absolvoval níku napájeném vodou z ČOV požadavky Žlábek, Ph.D. na hygienickou kvalitu masa? 2019 Josef Mareš Stravitelnost krmiv pro kapra doc. Ing. Jan Mráz, absolvoval Ph.D. 2019 Josef Mareš Chování vodních organismů a kontamina- Ing. Miloš Buřič, absolvoval ce vodních toků? Nechtěná léčba deprese Ph.D. a nespavosti u raků 2019 Jan Materna Vliv herbicidu s-metolachloru na raná dr hab. Ing. Josef absolvoval vývojová stádia raka mramorovaného Velíšek, Ph.D. 2019 Taisiya Advances in fish sperm cryopreservation: doc. M.Sc. Borys absolvovala Stechkina taxonomical consideration Dzyuba, Ph.D. 2019 Martin Dynamika fytoplanktonu kaprových Mgr. Otakar Stru- absolvoval Svoboda rybníků necký, Ph.D. 2019 Jan Toman Rak mexický (Cambarellus patzcuaren- Ing. Antonín Kou- absolvoval sis) – přehledová studie ba, Ph.D. 2019 Ondřej Critical swimming speed in intensively Ing. Vlastimil absolvoval Tomášek cultured European perch (Perca fluviatilis Stejskal, Ph.D. L.): Influence of fish size, production system and repeated testing

Absolventi bakalářského studia po slavnostní promoci v roce 2018 s děkanem fakulty prof. Ing. Pa- vlem Kozákem, Ph.D.

122 FROV JU

Odměny za výborné studijní výsledky

Za výborné studijní výsledky mohli studenti a studentky prezenční formy studia získat pro- spěchové nebo prémiové stipendium.

Prospěchové stipendium

Prospěchové stipendium bylo přiznáno studentům, kteří si v předchozím akademickém roce zapsali předměty v celkovém objemu alespoň 60 kreditů a dosáhli váženého studijního průměru nejvýše 1,60. Podmínky pro výplatu stipendií upravovaly Stipendijní řád JU, Rozhodnutí děkana č. 12/2017, Opatření děkana č. 30/2018 a č. 14/2019.

Tabulka udělených prospěchových stipendií dle příjemců Akademický Student(ka) Výše přiznaného stipendia/měsíc (v Kč) Celková částka (v Kč) rok Vendula Bryllová 800,- 7 200,- Václav Kučera 800,- 7 200,- Aneta Mondeková 800,- 7 200,- 2018/2019 Jan Materna 1 200,- 10 800,- Oldřich Pecha 1 200,- 10 800,- Jan Rytíř 1 200,- 10 800,- Pavel Švejda 1 600,- 14 400,- Celkem – 68 400,- Vendula Bryllová 2 000,- 18 000,- Jana Krulová 1 000,- 9 000,- 2019/2020 Václav Kučera 1 500,- 13 500,- Andrea Martanová 1 000,- 9 000,- Aneta Mondeková 1 500,- 13 500,- Celkem – 63 000,- Celkem za oba roky – 131 400,-

Prémiové stipendium

Prémiová stipendia byla přiznávána za vynikající studijní výsledky z celého studia a za ba- kalářské práce, které byly komisemi Státních závěrečných zkoušek hodnoceny jako dostatečně inovativní a/nebo přispívající k prohloubení znalostí.

Tabulka udělených prémiových stipendií za výsledky v akademickém roce 2017/2018 dle jednotlivých kategorií Prémiová stipendia v akademickém roce 2017/2018 Výše Počet studentů Celkem vypla- stipendia s přiznaným ceno (v Kč) stipendiem (v Kč) a) za bakalářskou práci s vynikajícími výzkumnými, 1 000,- 2 2 000,- vývojovými, inovačními nebo jinými tvůrčími vý- sledky přispívajícími k prohloubení znalostí b) studentům bakalářského studia za výsledky bodo- – – – vě uznatelné v RIVu pro účely hodnocení výzkumu a vývoje c) studentům bakalářského studia za vynikající vý- 10 000,- 1 10 000,- sledky během celého studia – cena děkana Celkem 12 000,-

123 04 PEDAGOGICKÁ ČINNOST

Tabulka udělených prémiových stipendií za výsledky v akademickém roce 2017/2018 dle příjemců Student(ka) Prémiová stipendia dle druhu – viz tabulka výše Celková výše (v Kč) a) c) Lenka Kajgrová 10 000,- 10 000,- Petr Kovář 1 000,- 1 000,- Alžběta Strouhová 1 000,- 1 000,- Celkem 2 000,- 10 000,- 12 000,-

Tabulka udělených prémiových stipendií za výsledky v akademickém roce 2018/2019 dle jednotlivých kategorií Prémiová stipendia v akademickém roce 2018/2019 Výše Počet studentů Celkem vypla- stipendia s přiznaným ceno (v Kč) stipendiem (v Kč) a) za bakalářskou práci s vynikajícími výzkumnými, vývojovými, inovačními nebo jinými tvůrčími výsledky přispívajícími k prohloubení znalostí, 1 000,- 3 3 000,- tedy za práci, která bude hodnocena státnicovou komisí známkou „výborně“ c) studentům bakalářského studia za vynikající vý- 10 000,- 1 18 000,- sledky během celého studia – cena děkana 8 000,- 1 Celkem 21 000,-

Tabulka udělených prémiových stipendií za výsledky v akademickém roce 2018/2019 dle příjemců Student(ka) Prémiová stipendia dle druhu – viz tabulka výše Celková výše (v Kč) a) c) Josef Mareš 1 000,- 1 000,- Jan Materna 1 000,- 1 000,- Oldřich Pecha 10 000,- 10 000,- Jan Rytíř 8 000,- 8 000,- Ondřej Tomášek 1 000,- 1 000,- Celkem 3 000,- 18 000,- 21 000,-

Specifická mimořádná stipendia

Od akademického roku 2012/2013 fakulta zavedla dva typy mimořádných stipendií – Mimo- řádné stipendium pro nadané studenty a Mimořádné stipendium pro sportovce. V roce 2018 fakulta zavedla další typ stipendia, a to Mimořádné stipendium na podporu bakalářských stu- dentů s dobrými studijními předpoklady.

Mimořádné stipendium pro nadané studenty

Stipendium má podporovat a přilákat do studentských řad fakulty schopné a pracovité studenty a motivovat takové studenty k užší spolupráci s fakultou.

„Nadaný, schopný a pracovitý student netrpí na naší fakultě existenční nouzí.“

Na stipendium mají nárok studenti, kteří si v předchozím akademickém roce na FROV JU zapsali předměty v celkovém objemu alespoň 60 kreditů, dosáhli váženého studijního průměru nejvýše 1,5 a vedle toho aktivně pracovali v laboratořích FROV JU, zapojovali se do propagace

124 FROV JU fakulty, pomáhali při realizaci výuky na fakultě, dosáhli výrazného sportovního úspěchu nebo realizovali zahraniční pobyt. Výše stipendia je odstupňována podle prospěchu a rozsahu aktivit studentů. Pro akademický rok 2018/2019 byly podmínky pro přidělení stipendia uprave- ny Opatřením děkana č. 4/2018, pro akademický rok 2019/2020 to bylo Opatřením děkana č. 2/2019. V akademickém roce 2018/2019 toto stipendium nezískal žádný ze studentů baka- lářského studia, v akademickém roce 2019/2020 jej získal 1 student.

Tabulka udělených mimořádných stipendií pro nadané studenty dle pří- jemců Akademický rok Student Výše přiznaného stipendia/měsíc (v Kč) Celková částka (v Kč) 2019/2020 Václav Kučera 14 000,- 112 000,- Celkem 112 000,-

Mimořádné stipendium pro sportovce

Stipendium bylo vypláceno za vynikající sportovní výkony a/nebo na podporu sportovních aktivit v souladu s Rozhodnutím děkana č. 7/2013. Vynikajícím sportovním výkonem se rozumí výborné umístění v národních, mezinárodních nebo univerzitních soutěžích (mistrovstvích). Sti- pendium na podporu sportovních aktivit může být studentům vypláceno za účelem usnadnění účasti na významných sportovních akcích, podpory tréninku či sportovních výkonů. V akademic- kém roce 2018/2019 získala stipendium jedna studentka a v akademickém roce 2019/2020 jeden student.

Tabulka udělených mimořádných stipendií pro sportovce v akademickém roce 2018/2019 a 2019/2020 dle příjemců Student Za vynikající sportov- Na podporu sportovních aktivit Celková částka (Kč) ní výkon Kateřina Marková 15 000,- 16 000,- 31 000,- Zdeněk Polívka – 6 000, 6 000,

Vítězná studentka Kateřina Marková na světovém poháru v Casting sportu.

125 04 PEDAGOGICKÁ ČINNOST

Mimořádné stipendium na podporu bakalářských studentů s dobrými studijními předpoklady

Tento nový typ mimořádného stipendia byl cílen na studenty, kteří zatím nemají nárok na stipendia, jež jsou zaměřena na nadané studenty a studenty s dobrými studijními výsled- ky na vysoké škole ve vyšších ročnících studia. Naší snahou bylo motivovat studenty s dobrý- mi studijními předpoklady k zápisu na naši fakultu a ke snížení studijní neúspěšnosti v prvním semestru studia. Stipendium bylo rozděleno na dvě kategorie. V první kategorii bylo přizná- váno stipendium poprvé zapsaným studentům na FROV JU, kteří měli dobré studijní výsledky na střední škole, v druhé všem studentům, kteří získají alespoň 20 kreditů z povinných a po- vinně volitelných předmětů v prvním semestru studia. Výše stipendií a podmínky pro přidělení stipendií v jednotlivých kategoriích byla upravena Opatřeními děkana č. 21/2018 a č. 1/2019.

Tabulka udělených mimořádných stipendií pro studenty 1. ročníku dle prospěchu ze SŠ podle příjemců Akademický rok Student(ka) Výše přiznaného stipendia (Kč) Jan Blafka 5 000,- Vojtěch Sloup 5 000,- Daniel Štefan 5 000,- Pavel Koukolík 8 000,- 2018/2019 Jana Krulová 8 000,- Alexandr Nádaský 10 000,- Jiří Paroulek 10 000,- Jan Pastejřík 10 000,- Celkem 61 000,- Ondřej Lorenc 5 000,- Jan Slabý 5 000,- Lucie Žaloudková 5 000,- Monika Dušánková 8 000,- 2019/2020 Jakub Kocour 8 000,- Jakub Meisner 8 000,- Eliška Pejcharová 8 000,- Anna Hovorková 10 000,- Natalie Tomasová 10 000,- Celkem 67 000,- Celkem za oba roky 128 000,-

Tabulka udělených mimořádných stipendií pro studenty 1. ročníku za zís- kání 20 kreditů z povinných a povinně volitelných předmětů v ZS podle příjemců Akademický rok Student(ka) Výše přiznaného stipendia (Kč) Jaroslav David 8 000,- Jan Fábrik 8 000,- Jiří Kadlec 8 000,- Pavel Koukolík 8 000,- Jana Krulová 8 000,- 2018/2019 Alexandr Nádaský 8 000,- Jiří Paroulek 8 000,- Jan Pastejřík 8 000,- Vendula Puhanová 8 000,- Martin Řehořek 8 000,- Daniel Štefan 8 000,- Celkem 88 000,-

126 FROV JU

NAVAZUJÍCÍ MAGISTERSKÉ STUDIUM Akreditované studijní programy a obory Studijní pro- Číslo Studijní obor Forma studia Stand. doba Jazyk výuky Akreditace do gram (SP) SP studia Zemědělská N4106 Rybářství prezenční, 2 roky český 31. 12. 2024 specializace a ochrana vod kombinovaná Agricultural N4106 Fishery and prezenční, 2 roky anglický 31. 12. 2024 Specialization Protection of kombinovaná waters Zootechnika N4103 Rybářství prezenční, 2 roky český 31. 5. 2020* kombinovaná * pouze na dostudování stávajících studentů

Profil a cíle studia

Obor Rybářství a ochrana vod je ucelený a ve své podstatě kombinovaný obor, který se vedle znalostí z biologické, ekologické a technologické stránky rybářství zaměřuje i na problematiku vodního hospodářství a ochranu vodního prostředí. Problematika rybářství a ochrany vod se v tomto studijním oboru vzájemně propojuje a odvíjí se od legislativních požadavků i novodo- bých trendů a potřeb. Absolventi tohoto oboru jsou připraveni k odborné práci ve vrcholovém managementu v rybářských firmách a svazech, v institucích zaměřených na ochranu životního prostředí, v oblasti vodohospodářství i ve specializovaných laboratořích zaměřených zejména na hodnocení kvality vody. Dále jsou kvalifikovaní k výkonu rybářského práva a k výkonu funkce rybářského hospodáře. Cílem navazujícího magisterského studia je připravit kvalifikované odborníky v oblastech rybářství, chovu ryb a ochrany vodního prostředí, kteří budou schopni využít získané znalosti a dovednosti při řízení vyšších organizačních jednotek, např. velkých pracovních týmů v rybář- ství, vodohospodářství, veřejné a státní správě na úrovni vrcholového managementu.

Počty studentů přijatých do prvních ročníků Akademic- Studijní program Studijní obor Forma Došlých Přijatých Zapsaných do ký rok (kód programu) studia přihlášek uchazečů 1. ročníku Zemědělská spe- Rybářství prezenční 14 13 11 cializace (N4106) a ochrana vod Zemědělská spe- Rybářství kombino- 10 9 8 cializace (N4106) a ochrana vod vaná

2018/2019 Agricultural Fishery and prezenční Specialization Protection of 2 0 0 (N4106) Waters Agricultural Fishery and kombino- Specialization Protection of vaná 0 0 0 (N4106) Waters Celkem 26 22 19 Zemědělská spe- Rybářství prezenční 15 14 11 cializace (N4106) a ochrana vod Zemědělská spe- Rybářství kombino- 8 7 5 cializace (N4106) a ochrana vod vaná

2019/2020 Agricultural Fishery and prezenční Specialization Protection of 4 0 0 (N4106) Waters Agricultural Fishery and kombino- Specialization Protection of vaná 5 4 1 (N4106) Waters Celkem 32 25 17

127 04 PEDAGOGICKÁ ČINNOST

Počty studentů ve vyšších ročnících (údaje ke dni 31. 10. daného akademického roku) Akademický Studijní Studijní Forma studia 2. ročník 3. a vyšší Celkem rok program (kód obor ročník programu) Zemědělská Rybářství prezenční specializace a ochrana 9 2 11 (N4106) vod Zemědělská Rybářství kombinovaná specializace a ochrana 4 2 6 (N4106) vod 2018/2019 Agricultural Fishery and prezenční Specialization Protection – – – (N4106) of Waters Agricultural Fishery and kombinovaná Specialization Protection – 1 1 (N4106) of Waters Celkem 13 5 18 Zemědělská Rybářství prezenční specializace 10 6 16 (N4106) Zemědělská Rybářství kombinovaná specializace 3 0 3 (N4106) 2019/2020 Agricultural Rybářství prezenční Specialization a ochrana 0 0 0 (N4106) vod Agricultural Rybářství kombinovaná Specialization a ochrana 0 0 0 (N4106) vod Celkem 13 6 19

Absolventi 2letého navazujícího magisterského studia, kteří obhájili zá- věrečnou kvalifikační práci v letech 2018 a 2019 Rok Student Téma diplomové práce Vedoucí práce Výsledek SZZ absolv. 2018 Bc. Martin Možnosti fixace vzorků pro měření obsahu prof. Ing. Martin absolvoval Hubálek DNA u ryb průtokovou cytometrií Flajšhans, Dr.rer. s vyznamená- agr. ním 2018 Bc. Martin Indukce triploidie u candáta obecného Ing. Miroslav absolvoval Růžek (Sander lucioperca) Blecha, Ph.D. s vyznamená- ním 2018 Bc. Jakub Čejka Vliv teplotních a hyperoxických podmínek Ing. Vlastimil absolvoval na růst, příjem krmiva a fyziologii hybrida Stejskal, Ph.D. sivena arktického (Salvelinus alpinus Linnaeus, 1758) a sivena amerického (Sal- velinus fontinalis Mitchill, 1815) 2018 Bc. Martin Fojt Vyhodnocení plodnosti raka signálního Ing. Miloš Buřič, absolvoval včetně post-ovulačního stavu vaječníků Ph.D. 2018 Bc. Michaela Kryoprezervace a transplantace spermato- doc. Ing. Martin absolvovala Fučíková gonií kapra obecného Pšenička, Ph.D. 2018 Bc. Petr Adaptace a intenzivní chov okounka doc. Ing. Tomáš absolvoval Hanzlík pstruhového (Micropterus salmoides) Policar, Ph.D. v porovnání s intenzivním chovem candáta obecného (Sander lucioperca)

128 FROV JU

2018 Bc. Markéta Hodnocení subchronického působení Ing. Alžběta Stará, absolvovala Hlávková atrazinu na raka (Cherax destructor) Ph.D. 2018 Bc. Ondřej Využití samokrmítkových systémů pro Ing. Vlastimil absolvoval Homola okounovité ryby Stejskal, Ph.D. 2018 Ing. Jaroslav Provozní ověření monosexních obsádek prof. Ing. Jan absolvoval Jelínek v chovu tržního keříčkovce jihoafického Kouřil, Ph.D. (Clarias gariepinus) 2018 Bc. Marek Let Sledování kontaminace Bezdrevského doc. Mgr. Roman absolvoval potoka polychlorovanými bifenyly Grabic, Ph.D. 2018 Bc. Viktoriia Vliv hygienicky ošetřené vody na srdeční prof. Ing. Pavel absolvovala Malinovska frekvenci raka a jejich následnou mortalitu Kozák, Ph.D. 2018 Bc. Václav Potenciál krmných směsí a obilovin jako Ing. Ján Regenda, absolvoval Melka nástroj pro udržení dobré produkce tržní- Ph.D, ho kapra ve vztahu ke kvalitě vody 2018 Bc. Jakub Optimalizace intenzivního chovu larev can- doc. Ing. Tomáš absolvoval Morava dáta obecného (Sander lucioperca L.) Policar, Ph.D. 2018 Bc. Tomáš Odběr spermatu pomocí katetru a jeho doc. Ing. Tomáš absolvoval Plaňanský využití při výtěru štiky obecné (Esox Policar, Ph.D. lucius L.) 2018 Bc. Jakub Starý Provozní ověření vlivu krmení raného prof. Ing. Jan absolvoval plůdku jeseterovitých ryb obohacenými Kouřil, Ph.D. naupliemi žábronožky na jejich přežití a rychlost růstu 2018 Bc. Kateřina Interakce nepůvodních druhů korýšů Ing. Miloš Buřič, absolvovala Švagrová ve vodách ČR: Lovec nebo kořist? Ph.D. 2018 Bc. Jakub Vlček Využití ozónu v intenzivním chovu vybra- doc. Ing. Tomáš absolvoval ných druhů ryb Policar, Ph.D. 2019 Bc. Dominik Intenzivní chov okounka pstruhového doc. Ing. Tomáš absolvoval Boňko (Micropterus salmoides) v RAS s různým Policar, Ph.D. s vyznamená- světelným režimem ním 2019 Bc. Andreas Vliv teploty na udržení schopnosti oploze- prof. Ing. Jan absolvoval Andoniu ní a líhnivosti při přechovávání neoploze- Kouřil, Ph.D. ných jiker u lína obecného (Tinca tinca) 2019 Bc. Jan Chá- Studium základních mechanismů peri- Mgr. Tomáš Kory- absolvoval bera toneálního zánětu u candáta obecného tář, Ph.D. (Sander lucioperca) 2019 Bc. Milan Man Porovnání raka mramorovaného a raka Ing. Antonín Kou- absolvoval pruhovaného: přímá interakce a kompeti- ba, Ph.D. ce o zdroje 2019 Bc. Martin Společenstvo bentických organismů Ing. Miloš Buřič, absolvoval Musil na dolním toku Ohře, Labe a jejich příto- Ph.D. cích 2019 Bc. Michal Vliv syntetického progestinu etono- doc. Ing. Hana absolvoval Pech gestrelu na sekundární pohlavní znaky Kocour Kroupová, a histologii gonád živorodky Wingeovy Ph.D. (Poecilia wingei) 2019 Bc. Eliška Diverzita makrozoobentosu v Evropsky Ing. Martin Bláha, absolvovala Peřinová významné lokalitě výskytu raka kamenáče Ph.D. (Austropotamobius torrentium) 2019 Bc. Pavel Válek Vertikální distribuce zoobentosu v rybníce doc. RNDr. Zdeněk absolvoval v reakci na biomasu obsádky kapra Adámek, CSc.

129 04 PEDAGOGICKÁ ČINNOST

Odměny za výborné studijní výsledky

Za výborné studijní výsledky mohli studenti a studentky prezenční formy studia získat pro- spěchové nebo prémiové stipendium. Podmínky pro výplatu stipendií upravovaly Stipendijní řád JU, Rozhodnutí děkana č. 12/2017, Opatření děkana č. 30/2018 a č. 14/2019.

Prospěchové stipendium

Prospěchové stipendium bylo přiznáno studentům, kteří si v předchozím akademickém roce zapsali předměty v celkovém objemu alespoň 60 kreditů a dosáhli váženého studijního průmě- ru nejvýše 1,60. Limit 60 kreditů se v akademickém roce 2018/2019 nevztahoval na studenty, kteří po řádném ukončení studia v bakalářském studijním programu pokračovali ve studiu v magisterském studijním programu navazujícím na bakalářský studijní program. Podmínky pro výplatu stipendií upravovaly Stipendijní řád JU, Rozhodnutí děkana č. 12/2017, Opatření děkana č. 30/2018 a č. 14/2019.

Tabulka udělených prospěchových stipendií dle příjemců Akademický Student(ka) Výše přiznaného stipendia/měsíc (v Kč) Celková částka (v Kč) rok Bc. Dominik Boňko 1 200,- 10 800,- Bc. Michal Pech 800,- 7 200,- 2018/2019 Bc. Vít Profant 800,- 7 200,- Bc. Martin Vágner 800,- 7 200,- Celkem – 32 400,- Bc. Jiří Jakš 1 000,- 9 000,- Bc. Jan Rytíř 1 500,- 13 500,- 2019/2020 Bc. Lenka Kajgrová 2 000,- 18 000,- Bc. Marek Kodras 2 000,- 18 000,- Celkem – 58 500,- Celkem za oba roky – 90 900,-

Prémiové stipendium

Prémiová stipendia byla přiznávána za vynikající studijní výsledky z celého studia a za di- plomové práce, které byly komisemi Státních závěrečných zkoušek hodnoceny jako dostatečně inovativní a/nebo přispívající k prohloubení znalostí.

Tabulka udělených prémiových stipendií za výsledky v akademickém roce 2017/2018 dle jednotlivých kategorií Prémiová stipendia v akademickém roce 2017/2018 Výše Počet studentů Celkem vypla- stipendia s přiznaným ceno (v Kč) stipendiem (v Kč) a) za diplomovou práci s vynikajícími výzkumnými, 3 000,- 2 6 000,- vývojovými, inovačními nebo jinými tvůrčími vý- sledky přispívajícími k prohloubení znalostí c) studentům navazujícího magisterského studia za 15 000,- 1 15 000,- vynikající výsledky během celého studia – cena děkana a cena rektora Celkem 21 000,-

130 FROV JU

Tabulka udělených prémiových stipendií za výsledky v akademickém roce 2017/2018 dle příjemců Student(ka) Prémiová stipendia dle druhu – viz tabulka výše Celková výše (v Kč) b) c) Bc. Michaela Fučíková 3 000,- 3 000,- Bc. Martin Hubálek 3 000,- 15 000,- 18 000,- Celkem 6 000,- 21 000,-

Tabulka udělených prémiových stipendií za výsledky v akademickém roce 2018/2019 dle jednotlivých kategorií Prémiová stipendia v akademickém roce 2017/2018 Výše Počet studentů Celkem vypla- stipendia s přiznaným ceno (v Kč) stipendiem (v Kč) a) za diplomovou práci s vynikajícími výzkumnými, 3 000,- 2 6 000,- vývojovými, inovačními nebo jinými tvůrčími vý- sledky přispívajícími k prohloubení znalostí c) studentům navazujícího magisterského studia za 12 000,- 1 12 000,- vynikající výsledky během celého studia – cena děkana a cena rektora Celkem 18 000,-

Tabulka udělených prémiových stipendií za výsledky v akademickém roce 2017/2018 dle příjemců Student(ka) Prémiová stipendia dle druhu – viz tabulka výše Celková výše (v Kč) a) c) Bc. Dominik Boňko 3 000,- 12 000,- 15 000,- Bc. Michal Pech 3 000,- 3 000,- Celkem 6 000,- 18 000,-

Absolventi magisterského studia po slavnostní promoci.

131 04 PEDAGOGICKÁ ČINNOST

Specifická mimořádná stipendia

Od akademického roku 2012/2013 fakulta zavedla dva typy mimořádných stipendií – Mimo- řádné stipendium pro nadané studenty a Mimořádné stipendium pro sportovce.

Mimořádné stipendium pro nadané studenty

Podrobnosti k mimořádnému stipendiu pro nadané studenty jsou uvedeny u bakalářského studia.

Tabulka udělených mimořádných stipendií pro nadané studenty dle pří- jemců Akademický Student(ka) Výše přiznaného stipendia/měsíc (v Kč) Celková částka (v Kč) rok Bc. Dominik Boňko 10 000,- 84 000,- 2018/2019 Bc. Lenka Kajgrová 7 000,- 56 000,- Bc. Vít Profant 7 000,- 56 000,- Celkem – 196 000,- Bc. Lenka Kajgrová 14 000,- 112 000,- 2019/2020 Bc. Oldřich Pecha 14 000,- 112 000,- Celkem – 224 000,- Celkem za oba roky – 420 000,-

Studenti navazujícího magisterského studia ocenění mimořádnými stipendii pro nadané studenty se členy komise děkana pro udělování těchto stipendií.

132 FROV JU

DOKTORSKÉ STUDIUM

Profil a cíle studia

Doktorské studium oboru Rybářství představuje zajímavou možnost pokračovat v získávání vědeckých poznatků v oblasti rybářství, chovu ryb a ochrany vod dle individuálního studijního plánu. Doktorandi si prohlubují znalosti a dovednosti získané v magisterském studiu s prová- zaností detailní odborné specializace zpravidla v kontextu s aktuálními vědecko-výzkumnými problémy. Cílem je připravit studenty na budoucí vědeckou, výzkumnou či pedagogickou dráhu ve vysokoškolských či výzkumných institucích. Studium lze absolvovat v prezenční nebo kombi- nované formě v českém a anglickém jazyce.

Akreditované studijní programy a obory Studijní pro- Číslo Studijní obor Kód SO Forma studia Stand. Jazyk Akreditace gram (SP) SP (kód oboru) (KKOV) doba výuky do studia Zootechnika P4103 Rybářství 4103V003 prezenční, 4 roky český 31. 12. 2024 kombinovaná Zootechnics P4103 Fishery 4103V003 prezenční, 4 roky anglický 31. 12. 2024 kombinovaná

Počty studentů doktorského studia přijatých do prvních ročníků Akademický Studijní Studijní obor Forma studia Počet došlých Počet Počet studentů rok program (kód přihlášek přijatých zapsaných programu) ke studiu uchazečů do 1. ročníku Zootechnika Rybářství prezenční 4 3 3 (P4103) Zootechnika Rybářství kombinovaná 1 1 1 2018/2019 (P4103) Zootechnics Fishery prezenční 16 11 8 (P4103) Celkem 21 15 11 Zootechnika Rybářství prezenční 1 1 1 (B4103) Zootechnika Rybářství kombinovaná 1 1 0 2012/2020 (B4103) Zootechnics Fishery prezenční 15 10 5 (B4103) Celkem 17 12 6

133 04 PEDAGOGICKÁ ČINNOST

Počty studentů doktorského studia ve vyšších ročnících (údaje k 31. 12. daného akademického roku) Akademický Studijní program Studijní Forma 2. 3. 4. 5. 6. Celkem rok (kód programu) obor studia ročník ročník ročník ročník ročník Zootechnika Rybářství prezenční 2 9 9 0 0 (B4103) Zootechnika Rybářství kombino- 0 0 2 2 3 24 2018/2019 (B4103) vaná Zootechnics Fishery prezenční 9 0 2 0 0 (B4103) Celkem 11 9 13 2 3 8 Zootechnika Rybářství prezenční 4 2 10 2 1 19 (B4103) Zootechnika Rybářství kombino- 1 0 0 2 5 8 2019/2020 (B4103) vaná Zootechnics Fishery prezenční 9 8 0 0 0 17 (B4103) Celkem 14 10 10 4 6 44

Národnostní struktura studentů studujících či působících na FROV JU k 31. 12. 2019.

134 FROV JU

Absolventi doktorského studia v letech 2018 a 2019 Rok Doktorand Název dizertační práce Školitel absol. 2018 Ing. Radek Gebauer Foraging behavior of non-indigenous gobiid RNDr. Bořek Drozd, Ph.D. fish species 2018 M.Sc. Hadiseh Dadras Temperature dependency of sperm motility doc. M.Sc. Borys Dzyuba, Asyabar in different fish species Ph.D. 2018 Ing. Martin Prchal Estimation of genetic variation of perfor- doc. Ing. Martin Kocour, mance traits in common carp to predict Ph.D. potential of selective breeding under pond management conditions 2018 M.Sc. Yevhen Applied aspects of fish sperm cryopreser- doc. M.Sc. Borys Dzyuba, Horokhovatskyi vation Ph.D. 2018 M.Sc. Azadeh Alteration of mRNA abundance, oxidation doc. Ing. Tomáš Policar, Mohagheghi Samarin products and antioxidant enzyme activities Ph.D. associated with fish oocyte ageing 2018 M.Sc. Thai Giang Biological effects of anthropogenic po- doc. Ing. Vladimír Žlábek, Pham llutants present in recipients of treated Ph.D. sewage water 2018 M.Sc. Sidika Sakalli Bioactive compunds in the aquatic envi- doc. Ing. Vladimír Žlábek, ronment and their effects on fish. Special Ph.D. focus on piscine cytochrome P450 2018 Ing. Roman Šebesta Selected aspects of intensively cultured Ing. Vlastimil Stejskal, Ph.D. European whitefish Coregonus( maraena, Bloch) and peled (Coregonus peled, Gmelin) 2018 M.Sc. Viktoriia Polyspermy produces viable mosaics in M.Sc. Taiju Saito, Ph.D. Iegorova sturgeon 2019 M.Sc. Sarvenaz Factors influencing nutritional value of fish doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D. Khalili Tilami 2019 Ing. Dalibor Koutnik The effect of triazine based pesticides and dr hab. Ing. Josef Velíšek, their metabolities on no-target aquatic Ph.D. organisms 2019 Ing. Pavel Šauer Environmental pollutants progestins: doc. Ing. Hana Kocour occurrence, hormonal activities and effects Kroupová, Ph.D. on fish 2019 Ing. Roman Franěk Germ stem cell manipilations as a tool to doc. Ing. Martin Pšenička, manage and produce isogenic lines in fish Ph.D. 2019 M.Sc. Tatyana Growth, genetics and morphological charac- prof. Ing. Jan Kouřil, Ph.D. Gebauer teristics of different perch Perca( fluviatilis) populations in intensive aquaculture 2019 M.Sc. Nima Hematyar Protein and lipid oxidation in fish: pathways, doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D. kinetics and products 2019 M.Sc. Sahana Hybridization of sturgeons prof. Ing. Martin Flajšhans, Shivaramu Dr.rer.agr. 2019 Ing. Jan Kubec Decision making in crayfish: behavioural and Ing. Miloš Buřič, Ph.D. reproductive issues 2019 M.Sc. Abdul Rasheed Utilization of CRISPR/Cas9 and novel germ doc. Ing. Martin Pšenička, Khanzai Baloch cells labelling technique for surrogate produ- Ph.D. ction in sturgeons 2019 Mgr. Boris Lipták Non-indigenous crayfish species in Slovakia Ing. Antonín Kouba, Ph.D. 2019 Mgr. Aleš Pospíchal Susceptibility of cyprinid and non-cyprinid MVDr. Veronika Piačková, fish species to CyHV-3 Ph.D. 2019 M.Sc. MiaoMiao Xin The role of some proteins in freezing fish prof. Ing. Otomar Linhart, sperm DrSc. 2019 M.Sc. Oleksandr Broodstock management of pikeperch (San- doc. Ing. Tomáš Policar, Malinovskyi der lucioperca L.) and it´s effect on eggs and Ph.D. larval production

135 04 PEDAGOGICKÁ ČINNOST

Promoce studentů doktorského studia v roce 2018. Foto zleva: prof. Ing. Pavel Kozák, Ph.D. – děkan FROV JU, Ing. Martin Prchal, Ph. D. – čerstvý absolvent.

136 FROV JU

Témata probíhajících dizertačních prací studentů DSP Rybářství Školitel Doktorand Název dizertační práce Ing. Martin Bláha, Ph.D. Ing. Marek Let Communities of macroinvertebrates in aquatic ecosystems affected by human activities M.Sc. Sergii Borsyhpolets, M.Sc. Vitaliy Kholodnyy Study of sperm/egg interaction in fish: Ph.D. Influence of environment on fertilization process M.Sc. Fabio F. R. Herrera Osmoregulation in fish spermatozoa: involvement in motility activation and impact on short-term storage outcomes Ing. Miloš Buřič, Ph.D. M.Sc. Shakhawate Hossain The marbled crayfish: parthenogenetic invasive species as an applicable biological model M.Sc. Sara Roje Cocktail of invaders in European inland waters – ecologival characteristic, interactions and consequences RNDr. Bořek Drozd, Ph.D. Ing. Pavel Franta Foraging efficiency and capacity of non-native gobiids under various biotic and abiotic conditions M.Sc. Marcellin Rutegwa Pond ecosystem dynamics in terms of production ecology Ing. Martin Šindler Revitalization of the sterlet (Acipenser ruthenus) population in the Slovakian part of Danube M.Sc. VIktoryia Dzyuba, M.Sc. Deepali Rahi Enzymatic activities involved in energy supply Ph.D. of fish sperm motility doc. M.Sc. Borys Dzyuba, M.Sc. Anatolli Sotnikov Fish sperm cryopreservation: the quality Ph.D. versus quantity prof. Ing. Martin Flajšhans, MUDr. Eva Šálková Comparative haematology of polyploid Dr.rer.agr. sturgeons Ing. Martin Hubálek Polyploidization capacity of sturgeons and its influence on fitness doc. Mgr. Roman Grabic, Ing. Adam Bořík Tracing of PPCPs from sources to recipients Ph.D. Ing. Petra Nováková High resolution mass spectrometry for investigation of new pollutants in water/soil M.Sc. Ievgeniia Gazo, Ph.D. M.Sc. Olena Shaliutina The effect of xenobiotics on fish spermatozoa M.Sc. Astrid S. Holzer, M.Sc. Pudhuvai Baveesh Proteases and their inhibitors as mediators of Ph.D. host-parasite interplay in a cnidarioan parasite-fish host system Mgr. Jiří Jablonský, Ph.D. M.Sc. Anushree Bachhar Role of isoenzymes in metabolic regulation of cyanobacteria Ing. Vojtěch Kašpar, Ph.D. M.Sc. Kseniia Pocherniaieva The foundation of maternal factors in sturgeon: from oocyte to embryo Ing. Antonín Kouba, Ph.D. M.Sc. Wei Guo Burrowing behaviour in crayfish Ing. Martin Musil Interactions between invasive crayfish and predators doc. Ing. Martin Kocour, M.Sc. Jinfeng Zhao Using of molecular data for selective breeding Ph.D. in common carp prof. Ing. Pavel Kozák, Ing. Filip Ložek Characterization of crayfish cardiac physiolo- Ph.D. gy: behavioural activation and beta-adrenergic pharmacology Ing. Martin Fořt Competitive abilities as a factor of invasive potential in crayfish Ing. Viktoriia Malinovska Monitoring of crayfish reaction to the different stimuli: are the crayfish good bioindicators? doc. Ing. Hana Kocour Mgr. Jitka Tumová Newly emerging endocrine discruptors in Kroupová, Ph.D. aquatic enviroment and their effect on fish

137 04 PEDAGOGICKÁ ČINNOST

prof. RNDr. Jan Kubečka, M.Sc. Ievgen Koliada Fish detection near the water surface by CSc. scientific echosounders prof. Ing. Otomar Linhart, M.Sc. Yu Cheng Sperm quality affects the fertilization in DrSc. freshwater fishes Ing. Jan Mráz, Ph.D. Ing. Roman Lunda Alternative feeds and technologies in fish culture M.Sc. Koushik Roy Carp nutrition in pond aquaculture and effects on water quality M.Sc. Ruoyi Hao Freshness and shelf-life of fish product M.Sc. Azeez Ewumi Folo- Integrates pest management and nutrient runso availability in aquaponics M.Sc. Hui Jia Processing and quality of fish products M.Sc. Azin Mohagheghi M.Sc. Swapnil Gorakh Cellular and molecular study of fish oocyte Samarin, Ph.D. Waghmare ageing M.Sc. Hamid Niksirat M.Sc. Kifayatullah Cellular and molecular aspects of the limb Hashjin regeneration in crayfish MVDr. Veronika Piačková, M.Sc. Ali Asghar Baloch Susceptibility of common carp strains reared Ph.D. in CR to the disease caused by CEV (Carp Edema Virus) doc. Ing. Tomáš Policar, M.Sc. Aiman Imentai Pikeperch aquaculture (Sander lucioperca L.) Ph.D. with focus on production monosex population Mgr. Peter Podhorec, Ph.D. Ing. Jindřiška Matějková The influence of different hormonal treatments and a route of administration on the reproduction of commercially important fish species doc. Ing. Martin Pšenička, M.Sc. Mujahid Ali Shah Comparative study on egg cleavage pattern in Ph.D. Xenopus (Amphibian), sturgeon (Chondroste- an) and zebrafish (Teleostean) M.Sc. Xuan Xie In vitro culture of sturgeon germ stem cells Mgr. Tomáš Tichopád The effect of polyploidization and hybridization on reproductive physiology in fish Ing. Zuzana Bláhová Regulation of biosynthesis of LC-PUFA in fish prof. Ing. Tomáš Randák, M.Sc. Maria Eugenia Sancho Psychoactive compounds in aquatic envi- Ph.D. Santos ronment and their effects on fish M.Sc. Mladen Avramovič Perspectives of reintroduction of European grayling (Thymallus Thymallus) into open waters M.Sc. Taiju Saito, Ph.D. M.Sc. Effrosyni Fatira Nuclear transplantation in sturgeon eggs Ing. Vlastimil Stejskal, Ing. Jan Matoušek Technological aspects of intensive culture of Ph.D. whitefish Coregonus( peled) M.Sc. Katsiaryna Lundová Technology for efficient prevention of early maturation in brook trout (Salvelinus fontinalis Mitchill) M.Sc. Tran Quang Hung Insect meal as feed source in nutrition of percids, eurasian perch (Perca fluviatilis) and pikeperch (Sander lucioperca) M.Sc. Mahyar Zare Biologically active compounds in nutrition of percids Mgr. Otakar Strunecký, M.Sc. Anna Pavlovna The taxonomical and physiological diversity of Ph.D. Ivanova cyanobacteria from water environment Ing. Jan Urban, Ph.D. M.Sc. Dinara Bekkozhayeva Fish biometric using machine vision M.Sc. Hassan Nazari Changes in fish behaviour under stress conditions

138 FROV JU

dr hab. Ing. Josef Velíšek, Ing. Josef Příborský The effect of pyrethroids on aquatic organisms Ph.D. Ing. Jaroslava Lidová Biodiversity of carp pond ecosystems and environment quality with respect to prof. RNDr. Jaroslav Vrba, Ing. Kateřina Francová farming technologies and intensity Ph.D. MVDr. Eliška Zusková, M.Sc. Bernard Erasmus Antiparasitic treatment possibilities in aqua- Ph.D. culture doc. Ing. Vladimír Žlábek, M.Sc. Tuyen Van Nguyen Environmental transformation of pharma- Ph.D. ceuticals in the common recipient of treated sewage water

ABSOLVENTI

Od doby vzniku FROV JU v roce v 2009 do 31. 12. 2019 prošlo úspešně studiem 389 absol- ventů, jak je vidět níže v tabulce. Stupeň Obor Forma studia Počet absolventů Prům. počet ab- studia solventů za rok Bakalářský Ochrana vod prezenční 24 183 18 Rybářství prezenční 135 kombinovaná 24 Navazující Rybářství prezenční 82 126 13 magisterský kombinovaná 9 Rybářství a ochrana prezenční 21 vod kombinovaná 11 Aquaculture prezenční 1 Fishery and Protec- prezenční 2 tion of Waters Magisterský Rybářství prezenční 3 3 – Doktorský Rybářství prezenční 60 75 8 kombinovaná 13 Fishery prezenční 2 Celkem 389 39

Absolventi FROV JU, kteří byli v průběhu let 2018 a 2019 evidováni na úřadu práce (ÚP).

Období Počet absolevntů FROV JU evidovaných na ÚP Celkem Z toho žen k 30. 4. 2018 1 1 k 30. 9. 2018 1 0 k 30. 4. 2019 0 0 k 30. 9. 2019 3 0

V roce 2015 byl na FROV JU založen klub absolventů. Snahou FROV JU je udržovat s absol- venty, kteří trvale opustili brány naší fakulty, bližší kontakt a nadále s nimi v rámci možností spolupracovat.

139 04 PEDAGOGICKÁ ČINNOST

Absolventi registrovaní v klubu absolventů mohou získat:

• možnost účastnit se vybraných akcí pořádaných fakultou; • možnost navázat kontakt s kolegy/němi, které ztratili z dohledu; • možnost navázat profesní spolupráci s pracovišti FROV JU v oblasti vědecké, výzkumné či vzdělávací; • 10% slevu na ubytování, pronájem školicích prostorů a služeb na Mezinárodním envi- ronmentálním vzdělávacím poradenském a informačním středisku ochrany vod (MEVPIS) ve Vodňanech a na produkty z našeho e-shopu (s výjimkou ryb); • možnost býti adresně informováni o kurzech celoživotního vzdělávání či dalších vzděláva- cích či odborných akcích pořádaných fakultou či konaných v prostorách naší fakulty; • možnost požádat o drobné rady naše na slovo vzaté odborníky.

Výhody pro registrované v Klubu absolventů budou postupně rozšiřovány. Každý absolvent se může do klubu registrovat prostřednictvím našich webových stránek.

Zpracovali: Ing. Martina Vorlová, Mgr. Kateřina Bártová, Lucie Kačerová, doc. Ing. Martin Kocour, Ph.D.

140 FROV JU

5. CELOŽIVOTNÍ VZDĚLÁVÁNÍ NA PRACOVIŠTI MEVPIS VODŇANY

Součástí děkanátu fakulty je od roku 2014 pracoviště s názvem Mezinárodní environmentál- ní vzdělávací, poradenské a informační středisko ochrany vod Vodňany (MEVPIS Vodňany), které koordinuje a zabezpečuje převážnou většinu celoživotního vzdělávání na fakultě. Díky našim aktivitám jsme měli v letech 2018–2019 možnost přivítat na MEVPIS Vodňany, resp. FROV JU, téměř 21 000 osob.

Pracoviště MEVPIS organizuje konference, semináře, přednášky, letní školy (více na str. 68), kurzy a workshopy nejen pro fakultu, ale i pro širokou veřejnost, firmy, státní správu a školské instituce. Významnou měrou se pracoviště podílí na vzdělávacích aktivitách fakulty v oblasti rybářství a ochrany vod. V letech 2018 a 2019 zaměstnanci MEVPIS pokračovali ve výborně na- staveném trendu vzdělávacích akcí pro žáky mateřských, základních i středních škol. Půldenní, celodenní, dvoudenní a týdenní vzdělávací akce plně využívají zázemí střediska s obsazením konferenčních i ubytovacích prostor. Již tradičně pokračujeme ve spolupráci s rakouskou vyšší odbornou školou s environmetálním zaměřením HLUW Yspertal, pro jejíž studenty každoročně chystáme týdenní bohatý teoretický, praktický i kulturní program. Nadále trvá spolupráce s Pe- dagogickou fakultou JU, se kterou organizujeme řadu jednodenních či vícedenních seminářů určených zejména pro učitele a učitelky mateřských a základních škol. Úspěšné pokračování má i Univerzita 3. věku a programy Dětské či Juniorské univerzity, o které je veliký zájem. Většina vzdělávacích programů pro různé cílové skupiny je doplněna o exkurze na pracoviště Fakulty rybářství a ochrany vod JU s odborným výkladem našich pracovníků.

Vedle těchto skutečností pracovníci MEVPIS zpracovávali administrativní agendu části vě- deckých projektů fakulty, zabezpečují výuku češtiny (pro cizince) a němčiny pro studenty fakulty a vydavatelskou činnost.

Mezinárodní environmentální vzdělávací, poradenské a informační středis- ko ochrany vod Vodňany (MEVPIS)

Klára Nachlingerová Mgr. Markéta Flajšhansová vedoucí pracoviště lektorka (český a německý jazyk), [email protected] akademická pracovnice [email protected]

Ing. Petra Plachtová Michaela Dirnová zástupce vedoucí pracoviště, koordinátorka akcí MEVPIS koordinátorka vzdělávacích aktivit (od 3/2018) MEVPIS, akademická pracovnice [email protected] [email protected]

Bc. Dana Brožová Ing. Blanka Nováková koordinátorka akcí MEVPIS koordinátorka akcí MEVPIS [email protected] (1–3/2018)

Mgr. Miroslav Boček Eva Šimoníková fakultní kreativní manažer uklízečka, pokojská (od 10/2019) [email protected] [email protected]

141 05 CELOŽIVOTNÍ VZDĚLÁVÁNÍ NA PRACOVIŠTI MEVPIS VODŇANY

Obecně by se akce organizované pracovištěm MEVPIS ve Vodňanech daly rozdělit do těchto skupin:

1) Vědecká setkání (konference, workshopy, semináře atd.)

Konference, workshopy a semináře zaměřené na nejrůznější témata pořádá středisko MEVPIS Vodňany jak pro odbornou, tak pro laickou veřejnost ať už samostatně nebo ve spo- lupráci s dalšími subjekty. Mezi nejvýznamnější akce tohoto typu patřily letech 2018–2019 konference Biotechnologie, Nová virová onemocnění v akvakultuře sladkovodních ryb, Ochrana zdraví ryb, Konference Přírodovědecké fakulty JU ČB, Rybářské konference RS ČR, XIX. Toxiko- logická konference s mezinárodní účastí, Zasedání Asociace univerzit třetího věku, Projektové týdny pro Vyšší odbornou školu HLUW Yspertal (Rakousko) či Mezinárodní workshopy: Biomark workshop, 1st Practical Workshop on Fishery and Biodiversity of Hydrocenoses for Proffesional Teachers, Biorigin seminář, FAO workshop – training in pond aquaculture. V období 2018–2019 se uskutečnila řada přednášek či odborných seminářů zahraničních i tuzemských odborníků na témata z oblasti rybářství, vědy a výzkumu a ochrany životního prostředí. Středisko MEVPIS po- kračuje ve spolupráci při pořádání konference Bezpečná společnost, která se v prostorách usku- tečnila v roce 2018 již potřetí. Nemalou část tvoří také celoroční kurzy zaměřené na vzdělávání pedagogů MŠ a ZŠ ve spolupráci s Pedagogickou fakultou a Teologickou fakultou JU ČB. Jedná se především o dvoudenní kurzy zaměřené na vzdělávání pedagogikou Franze Ketta a dále řada dvoudenních kurzů zaměřených na osobnostně sociální rozvoj pedagogů.

Odborný seminář Ochrana zdraví ryb pořádaný na středisku MEVPIS Vodňany ve dnech 26.–27. 3. 2018.

142 FROV JU

2) Výroční zasedání

Mezi nejvýznamnější akce tohoto typu lze zařadit zasedání Šlechtitelské rady pro chov ryb RS ČR, Plenární zasedání RS ČR, Oborové rady FROV JU, Vědecké rady FROV JU. Rovněž se v rámci aktivit MEVPIS podařilo udržet dlouhodobou perspektivní spolupráci se společností České drá- hy, a. s., která u nás pravidelně pořádá téměř dvoutýdenní turnusy zasedání.

3) Vzdělávací programy pro MŠ, ZŠ a SŠ, gymnázia

V rámci vzdělávacích programů se žáci a studenti hravou a interaktivní formou dozvídají zajímavá fakta o přírodě, rybářství, rybníkářství a ochraně životního prostředí. Jednotlivé teore- tické poznatky jsou proloženy pohybovými a výtvarnými aktivitami a rovněž možností bližšího kontaktu s rybami a raky. Vzdělávací programy jsou často doprovázeny exkurzemi na pracoviště VÚRH FROV JU, pří- padně venkovními aktivitami s plněním úkolů na stezce Voda je věda nebo Cesta úhoře. Na- vštívily nás mateřské, základní, střední školy a gymnázia převážně z Jihočeského a Středočes- kého kraje. Vzdělávací programy pořádáme i pro speciální cílové skupiny např. pro nadané žáky, centrum ARPIDA, rodinná centra, pro děti se sluchovým postiženým, pro dětské domovy a pro rodiny s dětmi s domácím vzděláváním. Další specifickou skupinu, pro něž pořádáme vzdělávací programy vč. odborných exkurzí, tvoří senioři.

Účastníci dětské univerzity zachyceni při plnění úkolů.

4) Akce a kurzy pro veřejnost, včetně komerčních akcí, další akce

V letech 2018–2019 jsme nadále pokračovali v pořádání nejrůznějších akcí pro veřejnost. Více o těchto akcích naleznete na str. 145–146. Pracoviště MEVPIS Vodňany v průběhu roku otevírá pro veřejnost kurzy anglického a němec- kého jazyka pro děti i dospělé. Další aktivitou střediska je zajištění zázemí pro taneční kurzy pro

143 05 CELOŽIVOTNÍ VZDĚLÁVÁNÍ NA PRACOVIŠTI MEVPIS VODŇANY

dospělé a kurzy jógy. Novinkou bylo v uplynulých dvou letech pořádání oslav Mezinárodního dne jógy ve formě jógových cvičení doplněných přednáškami o aktivním odpočinku a zdravém život- ním stylu. Novinkou je také pořádání kurzů zaměřujících se na přípravu, zpracování a základy rybí gastronomie v kostce. Mezi komerční akce by se daly zařadit různé semináře, konference či kurzy na klíč, např. kurzy tzv. měkkých dovedností (soft skills). Velké oblíbenosti se těší tradičně vzdělávací programy či vícedenní kurzy v rámci Dětské a Juniorské univerzity, kam řadíme i vzdělávání v rámci Letních příměstských táborů FROV JU a programy pro posílení znalosti cizího jazyka – English Summer campy, při nichž se děti setkají nejen s českými lektory, ale i s rodilými mluvčími. Neopomenu- telnou součástí těchto programů jsou i letní příměstské tábory zaměřené na kreativitu a tvoření z běžně dostupných materiálů bez tvorby nadbytečného odpadu tzv. zero waste. Dále pronajímáme prostory pro soukromé akce různého druhu například oslavy narozenin, svatby atp. Zpracovala: Klára Nachlingerová

144 FROV JU

6. ZE ŽIVOTA FAKULTY

Naší snahou je, aby Fakulta rybářství a ochrany vod JU vstoupila do povědomí veřejnosti města Vodňany a jeho okolí nejen jako čistě vědecké a intelektuální zařízení, ale také jako „instituce“, která má co nabídnout v oblasti kultury a osvěty. Občanům města a okolí se snažíme uspořádat nejen zajímavé kulturní a zábavné akce, ale i jednoduchou a srozumitelnou formou představit témata, kterými se zabýváme a která jsou aktuální pro celou společnost. Mezi nej- významnější akce tohoto typu řadíme FROVfest, tradiční Dny otevřených dveří během Vodňan- ských rybářských dnů, fakultní FROVples, Den vody a Jazzové pikniky. Cílem všech těchto aktivit je vytvořit příjemná a přátelská setkání fakultních zaměstnanců a studentů s širokou veřejností z Vodňan a okolí. Tradiční rockově multižánrový FROVfest je pořádán již od roku 2013 na „oslavu“ začátku akademického roku. Festival si postupně získal dobré jméno a je stále více žádaný jak ze strany vystupujících kapel, tak i samotných návštěvníků. Účinkují zde české i zahraniční kapely, kromě profesionálních hudebníků dostávají prostor i začínající, regionální a místní skupiny. Pro ty, kteří neholdují „tvrdší“ rockové muzice, připravujeme od roku 2017 ve spolupráci s budyňským spol- kem PNUtí z.s. hudební pikniky. Krásné venkovní prostředí kolem pavilonu MEVPIS se k pořádní takových „večírků“ samo nabízí. Každoročně u nás vítáme Petru Ernyei & jazz quartet, návštěvou nás poctila také českokrumlovská rock&rollová kapela Element a Výborný trio.

Fanoušci hudební kapely Pipes and Pites, jež účinkovala na 7. ročníku festivalu FROVfest.

Každoročně se připojujeme k oslavě Světového dne vody, který připadá na 22. března. Ro- dinám s dětmi pro tento den připravujeme zábavní program na odpoledne a pro dospělé ve- černí odbornou přednášku. Děti se hravou formou dozvídají mnoho zajímavostí o problematice sucha, jak šetřit s vodou a jak je, nejen pro nás, voda důležitá. Dále proběhlo promítání filmu „Plastic Ocean“ s debatou o znečištění životního prostředí plastovými odpady.

145 06 ZE ŽIVOTA FAKULTY

Dne 2. 2. 2019 se uskutečnil 1. reprezentační ples Fakulty rybářství a ochrany vod JU, tzv. FROVples. Akce se zúčastnilo 458 lidí. O doprovodný program se postarali účastníci taneční soutěže StarDance Daniela Šinkorová a Michal Padevět. Ples vyvrcholil losováním tomboly, jejíž hlavním lákadlem byl zájezd do Paříže.

Daniela Šinkorová a Michal Padevět zatančili na 1. reprezentačním plesu FROV JU.

Děkan fakulty prof. Ing. Pavel Kozák, Ph.D., při losování tomboly.

146 SEZNAM ZAMĚSTNANCŮ

Seznam zaměstnan- Datum započe- Seznam zaměstnan- Datum započe- ců fakulty v období tí/ukončení pra- Pozice ců fakulty v období tí/ukončení pra- Pozice 2018–2019 covního poměru 2018–2019 covního poměru doc. RNDr. Zdeněk Adámek, akademický pracovník RNDr. Bořek Drozd, Ph.D. akademický pracovník CSc. referentka ekonomic- Ing. Milan Aldorf, DiS. technik Jaroslava Dubová, Bbus. od 1. 4. 2019 kého oddělení M.Sc. Dubbala Prshanthi od 26. 1. 2018 Mgr. Hana Ash lektorka doktorandka Divya Vani do 5. 11. 2018

M.Sc. Mladen Avramovič od 1. 10. 2019 doktorand Ing. Petr Dvořák, Ph.D. akademický pracovník

M.Sc. Ali Asghar Baloch od 10. 9. 2018 doktorand Zuzana Dvořáková redaktorka

doc. M.Sc. Borys Dzyuba, M.Sc. Anushree Bachhar od 1. 5. 2019 doktorand akademický pracovník Ph.D.

Antonín Bárta do 31. 3. 2019 technik M.Sc. Viktoriya Dzyuba, Ph.D. vědecká pracovnice

Mgr. Kateřina Bártová do 11. 10. 2019 studijní referentka M.Sc. Bernard Erasmus od 14. 6. 2018 doktorand

M.Sc. Dinara Bekhoznayeva doktorandka Josef Ertl, DiS. od 9. 12. 2019 technik

Šárka Beranová technička M.Sc. Effrosyni Fatira do 31. 7. 2018 doktorandka

odborná referentka Ing. Eva Bílá M.Sc. Pavlo Fedorov, Ph.D. do 31. 12. 2018 vědecký pracovník ekonomiky akademická pra- Ing. Martin Bláha, Ph.D. akademický pracovník M.Sc. Gana Fedorova, Ph.D. covnice prof. Ing. Martin Flajšhans, Ing. Zuzana Bláhová doktorandka akademický pracovník Dr.rer.agr.

Ing. Miroslav Blecha, Ph.D. do 31. 10. 2018 akademický pracovník Mgr. Markéta Flajšhansová lektorka

Mgr. Miroslav Boček kreativní manažer M.Sc. Ewumi Azeez Folorunso od 3. 6. 2019 doktorand

M.Sc. Olga Bondarenko, Ph.D. vědecká pracovnice Pavel Fořt do 31. 3. 2019 technik

M.Sc. Volodymyr Bondarenko, do 31. 12. 2019 odborný pracovník Ing. Jaroslav Frajman od 1. 7. 2019 technik Ph.D.

Luboš Borovka do 31. 12. 2018 technik Ing. Kateřina Francová do 30. 9. 2019 doktorandka

M.Sc Serhii Boryshpolets, akademický pracovník Ing. Roman Franěk, Ph.D. vědecký pracovník Ph.D.

Ing. Adam Bořík doktorand Ing. Pavel Franta od 12. 2. 2018 doktorand

M.Sc. Vladysla Bozhynov doktorand Bc. Michaela Fučíková technička

koordinátorka akcí zástupce vedoucího Bc. Dana Brožová Bc. Pavlína Gápová od 1. 3. 2019 MEVPIS prodejny ryb M.Sc. Buargue Gadelha od 4. 7. 2018 vědecký pracovník M.Sc. Ievgeniia Gazo, Ph.D. vědecká pracovnice Hermes Augusto, Ph.D.

M.Sc. Viktoriia Burkina, Ph.D. vědecká pracovnice Ing. Radek Gebauer, Ph.D. vědecký pracovník

M.Sc. Tatyana Gebauer, Ph.D. Ing. Miloš Buřič, Ph.D. akademický pracovník vědecká pracovnice (roz. Vanina) akademický pra- Ing. Petr Císař, Ph.D. covník, ředitel ÚKS, Ing. David Gela, Ph.D. akademický pracovník proděkan M.Sc. Ali Ghaznavi od 1. 3. 2019 doktorand Jacky Cosson, Ph.D., Dr.h.c. do 31. 12. 2018 akademický pracovník

M.Sc. Oksana Golovko, Ph.D. vědecká pracovnice Ing. Daniel Červený, Ph.D. vědecký pracovník

M.Sc. Hadiseh Asyabar doc. Mgr. Roman Grabic, Ph.D. akademický pracovník vědecká pracovnice Dadras, Ph.D. Ing. Bc. Kateřina Grabicová, akademická pra- koordinátorka akcí Michaela Dirnová od 26. 3. 2018 Ph.D. covnice MEVPIS M.Sc. Guo Wei doktorand Bc. Petr Dobrovolný, DiS. od 3. 9. 2018 provozní asistent

Bc. Jan Dofek od 8. 1. 2018 technik M.Sc. Hilal Güralp, Ph.D. vědecká pracovnice

147 07 SEZNAM ZAMĚSTNANCŮ

Seznam zaměstnan- Datum započe- Seznam zaměstnan- Datum započe- ců fakulty v období tí/ukončení pra- Pozice ců fakulty v období tí/ukončení pra- Pozice 2018–2019 covního poměru 2018–2019 covního poměru asistentka ekonom. Ing. Jiří Hájíček technik Šárka Kocmichová, DiS. pracoviště akademický pracov- Ing. Jitka Hamáčková výzkumná pracovnice doc. Ing. Martin Kocour, Ph.D. ník, proděkan odborný prac. doc. Ing. Hana Kocour Krou- akademická pra- Ing. Jan Hampl do 30. 4. 2018 biologický pová, Ph.D. covnice

M.Sc. Hao Ruoyi od 28. 5. 2018 doktorand MVDr. Jitka Kolářová výzkumná pracovnice

Bc. Vojtěch Havlis do 7. 4. 2019 projektový manažer PaedDr. Jiří Koleček projektový manažer

Ing. Kristýna Havrdová (roz. technička RNDr. Jan Kolek do 31. 8. 2018 vědecký pracovník Siglová)

M.Sc. Nima Hematyar, Ph.D. vědecký pracovník M.Sc. Anna Kolešová, Ph.D. vědecká pracovnice

M.Sc. Herrera Rodríguez od 1. 2. 2018 od 2. 5. 2018 doktorand M.Sc. Reihaneh Kooshkestani doktorandka Francisco Fabio do 26. 4. 2018 od 1. 8. 2018 asistentka ředitele pro Ing. Michal Hojdekr, MBA tajemník Ing. Jana Kopecká do 31. 7. 2019 provoz M.Sc. Yevhen Horokhovatskyi, do 20. 9. 2018 doktorand Mgr. Tomáš Korytář, Ph.D. vědecký pracovník Ph.D. asistentka pro Mgr. Ing. Jana Horová ekonomickou činnost, Vladimír Kotal do 15. 1. 2019 technik personalistka akademický pracov- M.Sc. Md. Shakhawate Ing. Antonín Kouba, Ph.D. doktorand ník, proděkan Hossain prof. Ing. Jan Kouřil, Ph.D. akademický pracovník Ing. Martin Hubálek od 1. 10. 2018 doktorand akademický pracov- prof. Ing. Pavel Kozák, Ph.D. M.Sc. Yu Cheng od 25. 10. 2018 doktorand ník, děkan Miroslava Krtková do 16. 8. 2019 technička M.Sc. Chupani Latifeh, Ph.D. vědecká pracovnice Ing. Jiří Křišťan, Ph.D. vědecký pracovník M.Sc. Viktoriia Iegorova, Ph.D. do 12. 12. 2018 doktorandka Ing. Michal Kříž do 31. 1. 2018 asistent ředitele VÚRH M.Sc. Aiman Imentai doktorandka

do 30. 4. 2019, Ing. Jan Kubec, Ph.D. vědecký pracovník M.Sc. Anna Pavlovna Ivanova doktorandka od 2.10.2019 M.Sc. Iryna Kuklina, Ph.D. vědecká pracovnice Mgr. Jiří Jablonský, Ph.D. vědecký pracovník Kamil Kuneš do 31. 5. 2018 technik M.Sc. Hui Jia od 21. 11. 2019 doktorandka Filip Kupka, DiS. od 1. 3. 2018 technik Irena Jindrová od 1. 7. 2019 uklízečka Daniel Kvapil od 3. 9. 2018 technik Lucie Kačerová studijní referentka Jana Langová, DiS. referentka práce a mzdy Bc. Martin Kahanec, DiS. technik M.Sc. Ievgen Lebeda, Ph.D. vědecký pracovník Jiří Kasl technik Ing. Pavel Lepič, Ph.D. akademický pracovník Ing. Jan Kašpar vedoucí pracoviště

Ing. Vojtěch Kašpar, Ph.D. akademický pracovník Ing. Andrea Lepičová odborná pracovnice

do 30. 9. 2018 M.Sc. Sarvenaz Tilami Khalili, Ing. Marek Let od 1. 10. 2018 doktorand od 12. 4. 2019 doktorandka Ph.D. do 31. 7. 2019 Ing. Eduard Levý technik M.Sc. Kifayatullah od 2. 10. 2019 doktorand akademická pra- M.Sc. Ping. Li, Ph.D. do 31. 12. 2018 covnice M.Sc. Vitaliy Kholodnyy, Ph.D. vědecký pracovník M.Sc. Zhihua Li, Ph.D. do 31. 12. 2018 akademický pracovník M.Sc. Abdul Rasheen Baloch do 30. 9. 2019 doktorand akademický pracov- Khanzai, Ph.D. prof. Ing. Otomar Linhart, ník, děkan, ředitel DrSc. Ing. Jindřiška Knowles do 31. 12. 2019 doktorandka CENAKVA akademická pra- Mgr. Zuzana Linhartová, Ph.D. Ing. Ivana Kobernová referentka ekonomiky covnice

148 FROV JU

M.Sc. Kirill Lonhus doktorand M.Sc. Jinfeng Pan, Ph.D. od 21. 11. 2019 vědecký pracovník

Ing. Filip Ložek doktorand Ing. Štěpán Papáček, Ph.D. vědecký pracovník

M.Sc. Aliaksandr Pautsina, do 31. 12. 2018, Michal Macho, DiS. IT pracovník vědecký pracovník Ph.D. od 1. 7. 2019

Ing. Zdeňka Machová od 11. 6. 2018 technička Marie Pečená technička

Ing. Jana Máchová, Ph.D. vědecká pracovnice M.Sc. Giang Thai Pham, Ph.D. do 20. 9. 2018 doktorand

Ing. Viktoriia Malinovska od 4. 7. 2018 doktorandka Mgr. Monika Peka Kolafová lektorka

M.Sc. Oleksandr Malinovskyi, vědecký pracovník Tomáš Pešta technik Ph.D. MVDr. Veronika Piačková, akademická pracovni- Bc. Monika Malkusová, DiS. projektová manažerka Ph.D. ce, proděkanka

Petra Martínková technička Bc. Eliška Plachtová projektová manažerka

Ing. Jana Martynková od 3. 9. 2018 laborantka Ing. Petra Plachtová projektová manažerka

M.Sc. Oleksandr Mashchenko od 1. 6. 2019 doktorand M.Sc. Ganna Platonova doktorandka

Ing. Jan Matoušek doktorand Ing. Jitka Plecerová studijní referentka

Ing. Markéta Mlčáková asistentka ředitele Ing. Vítězslav Plička technik

M.Sc. Azadeh Samarin Moha- vědecká pracovnice Mgr. Peter Podhorec, Ph.D. akademický pracovník gheghi, Ph.D. M.Sc. Azin Samarin Mohaghe- vědecká pracovnice doc. Ing. Tomáš Policar, Ph.D. akademický pracovník ghi, Ph.D.

M.Sc. Mehrak Mohammadi do 8. 4. 2019 doktorandka Mgr. Eva Prášková, Ph.D. technička

M.Sc. Oleksandr Movchan od 24. 5. 2018 doktorand Ing. Martin Prchal, Ph.D. vědecký pracovník

akademický pracov- doc. Ing. Jan Mráz, Ph.D. Bc. Mario Prečanica od 5. 11. 2018 technik ník, ředitel ÚAOV

Ing. Martin Musil od 1. 10. 2019 doktorand Ing. Markéta Prokešová, Ph.D. od 1. 11. 2018 technička

Klára Nachlingerová vedoucí MEVPIS Bc. Vít Profant od 7. 10. 2019 odborný asistent

M.Sc. Hassan Nazari od 27. 11. 2018 doktorand Ilona Prokopová technička

odborný referent Ing. Václav Nebeský, Ph.D. Ing. Mirka Průšová personalistka vnějších vztahů vedoucí pracoviště Ing. Vladimír Nedopil Ing. Josef Příborský technik správy doc. Ing. Martin Pšenička, B.Sc. Tram Nguyen Thi od 2. 12. 2019 technička akademický pracovník Ph.D. M.Sc. Hamid Hashjin Niksirad, od 26. 1. 2018 vědecký pracovník M.Sc. Baveesh Pudhuvai doktorand Ph.D. do 31. 10. 2018 od 16. 4. 2018 Bc. Jan Novák technik RNDr. Pavel Punčochář, CSC. akademický pracovník do 31. 8. 2019 od 8. 1. 2018 koordinátorka akcí Ing. Blanka Nováková M.Sc. Deepali Rahi od 17. 1. 2018 doktorandka do 2. 3. 2018 MEVPIS asistentka ředitele Pavlína Nováková M.Sc. Samad Rahimnejad od 18. 7. 2019 vědecký pracovník VÚRH

Ing. Petra Nováková doktorandka prof. Ing. Tomáš Randák, Ph.D. akademický pracovník

M.Sc. Katsiaryna Novikava do 31. 5. 2018 doktorandka Ing. Ján Regenda, Ph.D. akademický pracovník

Ing. Samanta Pajerová asistentka tajemníka Ing. Marek Rodina, Ph.D. akademický pracovník

Ing. Ondřej Palíšek technik M.Sc. Sara Roje doktorandka

149 07 SEZNAM ZAMĚSTNANCŮ

M.Sc. Marcellin Rutegwa doktorand Pavlína Tláskalová technička

M.Sc. Koushik Roy od 13. 2. 2018 doktorand RNDr. Aleš Tomčala, Ph.D. od 1. 4. 2019 vědecký pracovník

Petr Řezníček technik M.Sc. Hung Guang Tran od 3. 9. 2018 doktorand Mohammadmehdi Saberioon, vědecký pracovník Ing. Svatava Trnavská od 3. 9. 2018 asistentka ředitele Ph.D. M.Sc. Sidika Sakalli, Ph.D. do 31. 12. 2019 vědecká pracovnice Mgr. Vladimíra Tučková odborná pracovnice

Ivana Samková technička Ing. Jan Turek, Ph.D. akademický pracovník

M.Sc. Eugenia Sancho Santos doktorandka Ing. Jan Urban, Ph.D. akademický pracovník

M.Sc. Olena Shaliutina do 30. 4. 2019 doktorandka Mgr. Pavla Urbanová doktorandka akademická pra- M.Sc. Ali Mujahid Shah od 21. 1. 2019 doktorand Ing. Olga Valentová covnice M.Sc. Bakht Ramin Shah, Ph.D. od 6. 8. 2018 vědecký pracovník M.Sc. Tuyen Van Nguyen od 6. 11. 2019 doktorand

M.Sc. Ali Mujahid Shah od 21. 1. 2019 doktorand Elek Varga od 3. 4. 2018 technik M.Sc. Sahana Shivaramu, referentka ekonomiky vědecká pracovnice Bc. Zuzana Vavrušková Ph.D. – pokladní Ing. Pavel Souček technik Milada Vazačová asistentka děkana dr hab. Ing. Josef Velíšek, M.Sc. Anatolii Sotnikov od 2. 10. 2019 doktorand akademický pracovník Ph.D. akademická pra- Ing. Alžběta Stará, Ph.D. Jana Veselá uklízečka covnice Dipl. Biol. Christoph Antonius vědecký pracovník Ing. Lukáš Veselý, Ph.D. vědecký pracovník Steinbach, Ph.D. Ing. Vlastimil Stejskal, Ph.D. akademický pracovník Ing. Andrea Vlačihová projektová manažerka

Mgr. Otakar Strunecký, Ph.D. akademický pracovník Ing. Martin Vlček projektový manažer

Ing. Adéla Stupková technička Bc. Josef Vobr technik

Pavel Svoboda technik Lukáš Vojík technik prof. MVDr. Zdeňka Svobo- RNDr. Andrea Vojs Staňová, vědecká pracovnice vědecká pracovnice dová, DrSc. Ph.D. vedoucí ekonomické- Ing. Július Szabó technik Ing. Jaromíra Vondrášková ho pracoviště Ing. Pavel Šablatura technik Ing. Martin Vorlová studijní referentka M.Sc. Swapnil Gorakh Ing. Marie Šandová technička od 17. 1. 2018 doktorand Waghmare Ing. Pavel Šauer, Ph.D. vědecký pracovník Erik Werner od 1. 9. 2019 technik

Ing. Roman Šebesta, Ph.D. do 12. 12. 2018 doktorand M.Sc. Xuan Xie doktorand

Eva Šimoníková uklízečka M.Sc. Miaomiao Xin, Ph.D. vědecká pracovnice

Mgr. Michaela Šmídová od 19. 2. 2018 projektová manažerka M.Sc. Carlos Yanes-Roca, Ph.D. vědecký pracovník od 21. 5. 2018 asistentka ředitele pro prof. RNDr. Dalibor Štys, CSc. akademický pracovník Ing. Kateřina Zánová do 26. 6. 2018 provoz Ing. Renata Štysová Rychtári- akademická pra- M.Sc. Mahyar Zare od 27. 11. 2018 doktorand ková, Ph.D. covnice Bc. Nikola Šulcová (roz. od 15. 1. 2018 asistentka tajemníka M.Sc. Jinfeng Zhao doktorandka Jelínková) Ing. Helena Švecová, Ph.D. vědecká pracovnice Magdalena Zíková, DiS. od 29. 1. 2019 referentka ekonomiky

Lenka Tesařová od 8. 10. 2018 projektová manažerka M.Sc. Anna Zhyrova do 28. 2. 2018 doktorandka asistentka ředitele akademická pra- Petra Tesařová MVDr. Eliška Zusková, Ph.D. ÚKS covnice doc. Ing. Vladimír Žlábek, Mgr. Tomáš Tichopád doktorand akademický pracovník Ph.D.

150 NOČNÍ KRÉM KAVIÁROVÁ KOSMETIKA

VYSOK OBSAH 0,5%

STURGEON FRIENDLY CAVIAR Vyrobeno v

[email protected] nebo na www.SFCAVIAR.eu

Analytická instrumentace, spotřební materiál a laboratorní vybavení merger processing information diagram