Contribution À La Caractérisation De La Diversité Génétique De L'abeille Domestique Apis Mellifera En France : Cas Du Lo

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Contribution À La Caractérisation De La Diversité Génétique De L'abeille Domestique Apis Mellifera En France : Cas Du Lo Open Archive TOULOUSE Archive Ouverte (OATAO) OATAO is an open access repository that collects the work of Toulouse researchers and makes it freely available over the web where possible. This is an author-deposited version published in : http://oatao.univ-toulouse.fr/ Eprints ID : 17312 To cite this version : Catays, Guillaume. Contribution à la caractérisation de la diversité génétique de l’abeille domestique Apis mellifera en France : cas du locus csd de détermination du sexe. Thèse d'exercice, Médecine vétérinaire, Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse - ENVT, 2016, 313 p. Any correspondence concerning this service should be sent to the repository administrator: [email protected] ANNEE 2016 THESE : 2016 – TOU 3 – 4075 CONTRIBUTION A LA CARACTÉRISATION DE LA DIVERSITE GÉNÉTIQUE DE L’ABEILLE DOMESTIQUE APIS MELLIFERA EN FRANCE : CAS DU LOCUS CSD DE DETERMINATION DU SEXE _________________ THESE pour obtenir le grade de DOCTEUR VETERINAIRE DIPLOME D’ETAT présentée et soutenue publiquement devant l’Université Paul-Sabatier de Toulouse par CATAYS, Guillaume Né, le 06 septembre 1990 à Rodez (12) ___________ Directeur de thèse : M. Alain DUCOS ___________ JURY PRESIDENT : M. Patrick CALVAS Professeur à l’Université Paul-Sabatier de TOULOUSE ASSESSEURS : M. Alain DUCOS Professeur à l’Ecole Nationale Vétérinaire de TOULOUSE Mme Christelle CAMUS Maître de Conférences à l’Ecole Nationale Vétérinaire de TOULOUSE MEMBRE INVITE : M. Alain VIGNAL Directeur de Recherche, INRA, UMR 1388 GENPHYSE Mme Kamila TABET- AOUL Ingénieure INRA, UMR 1388 GENPHYSE Mme Lydia VILAGINES Dr Vétérinaire, commission apicole de la SNGTV . 1 REMERCIEMENTS À Monsieur le Professeur Patrick CALVAS, Professeur des Universités Praticien hospitalier Génétique médicale - Pôle biologie - CHU de Toulouse - Hôpital Purpan Qui nous fait l’honneur d’accepter de présider notre jury de thèse. Hommages respectueux. À Monsieur le Professeur Alain DUCOS, Professeur de l’Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse Productions Animales – Zootechnie - Génétique Quantitative et des Populations Qui nous fait l’honneur d’accepter la direction de cette thèse. Pour m’avoir pris sous son aile depuis mon entrée dans cette école. Pour avoir su faire en sorte que le thème de cette thèse corresponde à mes attentes ainsi que pour ses corrections rapides, justes et pertinentes. Pour sa pédagogie efficace et élaborée doublée d’une rigueur bienveillante. Pour ses valeurs, ses idées, ses combats et son sens aigu de l’intérêt général humain. Qu’aussi bien l’Homme que le Professeur trouve ici l’assurance de mon immense respect et de ma sincère reconnaissance. À Madame le Docteur Christelle BOUCLAINVILLE-CAMUS, Maître de conférences de l’Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse Biologie cellulaire et moléculaire Qui nous fait l’honneur de prendre part à notre jury de thèse. Très sincères remerciements. À Monsieur le Docteur Alain VIGNAL, Directeur de Recherche à l’Institut National de la Recherche Agronomique UMR 1388 GenPhySE - Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage Pour m’avoir accepté en stage au sein de son équipe. Pour ses précieux conseils, son savoir et son expertise. Pour ses corrections avisées. Qu’il trouve ici le témoignage de ma grande sympathie et de ma gratitude À Madame Kamila TABET-AOUL, Ingénieure à l’Institut National de la Recherche Agronomique UMR 1388 GenPhySE - Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage Pour m’avoir encadré au cours de mes expérimentations Pour m’avoir accueilli dans son bureau Pour ses conseils judicieux Pour sa bonne humeur communicative et son enthousiasme Qu’elle soit assurée de mon amitié et de mon estime et qu’elle reçoive mes remerciements « La connaissance est une navigation dans un océan d'incertitudes à travers des archipels de certitudes. » Les sept savoirs nécessaires à l'éducation du futur Edgar Morin TABLES DES MATIERES LISTE DES ANNEXES ........................................................................................................... 14 LISTE DES FIGURES ............................................................................................................. 15 LISTE DES TABLEAUX ........................................................................................................ 18 LISTE DES PHOTOGRAPHIES ............................................................................................. 19 LISTE DES ABREVIATIONS ................................................................................................ 20 INTRODUCTION .................................................................................................................... 23 PARTIE I : BIOLOGIE DE L’ABEILLE ................................................................................ 25 CHAPITRE 1 : L’ABEILLE AU SEIN DU REGNE ANIMAL ......................................... 27 A. Classification et taxonomie ...................................................................................... 27 a. Histoire de la classification ................................................................................ 27 b. L’ordre des Hyménoptères ................................................................................. 30 c. La famille des Apidae ......................................................................................... 31 d. Le genre Apis ...................................................................................................... 32 B. Occurrences historiques ........................................................................................... 35 a. De l’origine des abeilles ..................................................................................... 35 i. Des fossiles datant du Crétacé ........................................................................ 35 ii. L’ancêtre des abeilles ..................................................................................... 36 iii. La coévolution avec les Angiospermes .......................................................... 37 b. Représentations, symbolisme et littérature ......................................................... 38 i. L’abeille de la Préhistoire à l’Antiquité .......................................................... 38 ii. Auteurs célèbres de l’Antiquité au Moyen Âge ............................................. 40 iii. Des avancées majeures permises par le microscope ...................................... 41 C. Rôles de l’abeille dans nos écosystèmes .................................................................. 44 a. Le service de pollinisation .................................................................................. 44 i. Mécanisme de la pollinisation ........................................................................ 44 ii. Economie de la pollinisation .......................................................................... 45 iii. De l’intérêt de la biodiversité ......................................................................... 48 b. Autres services de l’abeille et des pollinisateurs ................................................ 49 i. L’abeille, sentinelle de l’environnement ......................................................... 49 ii. L’abeille dans la lutte contre le réchauffement climatique ............................. 49 iii. Abeilles, plantes et animaux sauvages ........................................................... 50 7 D. Le déclin des abeilles ............................................................................................... 51 a. Les abeilles domestiques .................................................................................... 51 i. Un phénomène mondial .................................................................................. 51 ii. Mortalité des ruchers en Europe ..................................................................... 53 iii. Des motifs d’espoir ? ...................................................................................... 55 b. Quid des abeilles sauvages ? .............................................................................. 56 E. Revue des menaces actuelles pour l’abeille ............................................................. 57 a. Maladies et parasites .......................................................................................... 57 i. La loque américaine (Paenibacillus larvae) .................................................... 57 ii. La loque européenne (Melissococcus plutonius) ............................................ 59 iii. Le varroa (Varroa destructor) ......................................................................... 60 b. Le frelon asiatique .............................................................................................. 63 c. Effets des pesticides ........................................................................................... 65 d. Les monocultures ............................................................................................... 68 CHAPITRE 2 : MORPHO-ANATOMIE DE L’ABEILLE ................................................. 69 A. Anatomie générale d’une abeille ouvrière ............................................................... 69 a. Caractères généraux ........................................................................................... 69 b. La tête ................................................................................................................. 70 i. Organes sensitifs : les yeux ............................................................................. 71 ii. Organes sensitifs :
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