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Diversité Écologique Et Fonctionnelle Des Champignons Décomposeurs De Bois : L’Influence Du Substrat De La Communauté À L’Enzyme Yann Mathieu
Diversité écologique et fonctionnelle des champignons décomposeurs de bois : l’influence du substrat de la communauté à l’enzyme Yann Mathieu To cite this version: Yann Mathieu. Diversité écologique et fonctionnelle des champignons décomposeurs de bois : l’influence du substrat de la communauté à l’enzyme. Sciences du Vivant [q-bio]. Université de Lorraine, 2012. Français. tel-02811550 HAL Id: tel-02811550 https://hal.inrae.fr/tel-02811550 Submitted on 6 Jun 2020 HAL is a multi-disciplinary open access L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est archive for the deposit and dissemination of sci- destinée au dépôt et à la diffusion de documents entific research documents, whether they are pub- scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, lished or not. The documents may come from émanant des établissements d’enseignement et de teaching and research institutions in France or recherche français ou étrangers, des laboratoires abroad, or from public or private research centers. publics ou privés. AVERTISSEMENT Ce document est le fruit d'un long travail approuvé par le jury de soutenance et mis à disposition de l'ensemble de la communauté universitaire élargie. Il est soumis à la propriété intellectuelle de l'auteur. Ceci implique une obligation de citation et de référencement lors de l’utilisation de ce document. D'autre part, toute contrefaçon, plagiat, reproduction illicite encourt une poursuite pénale. Contact : [email protected] LIENS Code de la Propriété Intellectuelle. articles L 122. 4 Code de la Propriété Intellectuelle. articles L 335.2- L 335.10 http://www.cfcopies.com/V2/leg/leg_droi.php http://www.culture.gouv.fr/culture/infos-pratiques/droits/protection.htm U.F.R. -
Bumblebees (Bombus Impatiens Cresson) As Vectors Of
Commercial Bumble Bees as Vectors of the Microbial Antagonist Clonostachys rosea for Management of Botrytis Blight in Wild Blueberry (Vaccinium angustifolium) by Kevin William Reeh Submitted in partial fulfilment of the requirements for the degree of Master of Science at Dalhousie University Halifax, Nova Scotia in co-operation with Nova Scotia Agricultural College Truro, Nova Scotia June 2012 © Copyright by Kevin William Reeh, 2012 DALHOUSIE UNIVERSITY NOVA SCOTIA AGRICULTURAL COLLEGE The undersigned hereby certify that they have read and recommend to the Faculty of Graduate Studies for acceptance a thesis entitled “Commercial Bumble Bees as Vectors of the Microbial Antagonist Clonostachys rosea for Management of Botrytis Blight in Wild Blueberry (Vaccinium angustifolium)” by Kevin William Reeh in partial fulfilment of the requirements for the degree of Master of Science. Dated: May 10, 2012 Supervisor: _________________________________ Readers: _________________________________ _________________________________ _________________________________ ii DALHOUSIE UNIVERSITY AND NOVA SCOTIA AGRICULTURAL COLLEGE DATE: May 10, 2012 AUTHOR: Kevin William Reeh TITLE: Commercial Bumble Bees as Vectors of the Microbial Antagonist Clonostachys rosea for Management of Botrytis Blight in Wild Blueberry (Vaccinium angustifolium) DEPARTMENT OR SCHOOL: Department of Environmental Sciences DEGREE: M.Sc. CONVOCATION: October YEAR: 2012 Permission is herewith granted to Dalhousie University to circulate and to have copied for non-commercial purposes, at its discretion, the above title upon the request of individuals or institutions. I understand that my thesis will be electronically available to the public. The author reserves other publication rights, and neither the thesis nor extensive extracts from it may be printed or otherwise reproduced without the author’s written permission. -
A Worldwide List of Endophytic Fungi with Notes on Ecology and Diversity
Mycosphere 10(1): 798–1079 (2019) www.mycosphere.org ISSN 2077 7019 Article Doi 10.5943/mycosphere/10/1/19 A worldwide list of endophytic fungi with notes on ecology and diversity Rashmi M, Kushveer JS and Sarma VV* Fungal Biotechnology Lab, Department of Biotechnology, School of Life Sciences, Pondicherry University, Kalapet, Pondicherry 605014, Puducherry, India Rashmi M, Kushveer JS, Sarma VV 2019 – A worldwide list of endophytic fungi with notes on ecology and diversity. Mycosphere 10(1), 798–1079, Doi 10.5943/mycosphere/10/1/19 Abstract Endophytic fungi are symptomless internal inhabits of plant tissues. They are implicated in the production of antibiotic and other compounds of therapeutic importance. Ecologically they provide several benefits to plants, including protection from plant pathogens. There have been numerous studies on the biodiversity and ecology of endophytic fungi. Some taxa dominate and occur frequently when compared to others due to adaptations or capabilities to produce different primary and secondary metabolites. It is therefore of interest to examine different fungal species and major taxonomic groups to which these fungi belong for bioactive compound production. In the present paper a list of endophytes based on the available literature is reported. More than 800 genera have been reported worldwide. Dominant genera are Alternaria, Aspergillus, Colletotrichum, Fusarium, Penicillium, and Phoma. Most endophyte studies have been on angiosperms followed by gymnosperms. Among the different substrates, leaf endophytes have been studied and analyzed in more detail when compared to other parts. Most investigations are from Asian countries such as China, India, European countries such as Germany, Spain and the UK in addition to major contributions from Brazil and the USA. -
Diversité Écologique Et Fonctionnelle Des Champignons Décomposeurs Du Bois : L’Influence Du Substrat De La Communauté À L’Enzyme Yann Mathieu
Diversité écologique et fonctionnelle des champignons décomposeurs du bois : l’influence du substrat de la communauté à l’enzyme Yann Mathieu To cite this version: Yann Mathieu. Diversité écologique et fonctionnelle des champignons décomposeurs du bois : l’influence du substrat de la communauté à l’enzyme. Biologie végétale. Université de Lorraine, 2012. Français. NNT : 2012LORR0255. tel-01749638 HAL Id: tel-01749638 https://hal.univ-lorraine.fr/tel-01749638 Submitted on 29 Mar 2018 HAL is a multi-disciplinary open access L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est archive for the deposit and dissemination of sci- destinée au dépôt et à la diffusion de documents entific research documents, whether they are pub- scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, lished or not. The documents may come from émanant des établissements d’enseignement et de teaching and research institutions in France or recherche français ou étrangers, des laboratoires abroad, or from public or private research centers. publics ou privés. AVERTISSEMENT Ce document est le fruit d'un long travail approuvé par le jury de soutenance et mis à disposition de l'ensemble de la communauté universitaire élargie. Il est soumis à la propriété intellectuelle de l'auteur. Ceci implique une obligation de citation et de référencement lors de l’utilisation de ce document. D'autre part, toute contrefaçon, plagiat, reproduction illicite encourt une poursuite pénale. Contact : [email protected] LIENS Code de la Propriété Intellectuelle. articles L 122. 4 Code de la Propriété Intellectuelle. articles L 335.2- L 335.10 http://www.cfcopies.com/V2/leg/leg_droi.php http://www.culture.gouv.fr/culture/infos-pratiques/droits/protection.htm U.F.R. -
XI International Fungal Biology Conference
XI International Fungal Biology Conference Karlsruhe, Germany 29th September – 3rd October 2013 KARLSRUHE INSTITUTE OF TECHNOLOGY KIT – University of the State of Baden-Wuerttemberg and National Research Center of the Helmholtz Association www.kit.edu SCIENTIFIC PROGRAM MONDAY, 30.09.2013 SUNDAY, 29.09.2013 08:30 – 10:30 Poster session talks: Pathogenic fungi 16:00 – 16:15 Welcome Addresses PLENARY SESSION: PLANT FUNGAL 16:15 – 17:00 OPENING LECTURE Raymond J. St. Leger, INTERACTIONS College Park, MD, USA Chairs: Regine Kahmann “How to use a fungus to combat Marburg, Germany malaria” Nick Talbot Exeter, UK PLENARY SESSION: HOST-PATHOGEN 11:00 – 11:30 Martijn Rep INTERACTIONS Amsterdam, The Netherlands Chairs: A. Brakhage “Speculations on the evolution Jena, Germany of host-specific pathogenicity in the Fusarium oxysporum species 17:30 – 18:00 Clarissa Nobile complex” San Francisco, USA “A sticky situation: unraveling how 11:30 – 12:00 Richard O’Connell Candida albicans forms biofilms“ Cologne, Germany “Insights into Colletotrichum 18:00 – 18:30 Robin May hemibiotrophy from genome and Birmingham, UK transcriptome sequencing” „Hijacking of the immune system by a fatal fungal pathogen“ 12:00 – 12:30 Ane Sesma Madrid, Spain 18:30 – 19:00 Markus Künzler “Post-transcriptional regulation of Zürich, Switzerland Magnaporthe oryzae pathogenicity „Fungi as hosts of ‚pathogens‘: genes” Defense mechanisms of multicel- lular fungi against fungivorous nematodes“ PLENARY SESSION: CELL BIOLOGY AND TROPIC GROWTH 19:00 Welcome Reception Chairs: Mertixell -
Characterising Plant Pathogen Communities and Their Environmental Drivers at a National Scale
Lincoln University Digital Thesis Copyright Statement The digital copy of this thesis is protected by the Copyright Act 1994 (New Zealand). This thesis may be consulted by you, provided you comply with the provisions of the Act and the following conditions of use: you will use the copy only for the purposes of research or private study you will recognise the author's right to be identified as the author of the thesis and due acknowledgement will be made to the author where appropriate you will obtain the author's permission before publishing any material from the thesis. Characterising plant pathogen communities and their environmental drivers at a national scale A thesis submitted in partial fulfilment of the requirements for the Degree of Doctor of Philosophy at Lincoln University by Andreas Makiola Lincoln University, New Zealand 2019 General abstract Plant pathogens play a critical role for global food security, conservation of natural ecosystems and future resilience and sustainability of ecosystem services in general. Thus, it is crucial to understand the large-scale processes that shape plant pathogen communities. The recent drop in DNA sequencing costs offers, for the first time, the opportunity to study multiple plant pathogens simultaneously in their naturally occurring environment effectively at large scale. In this thesis, my aims were (1) to employ next-generation sequencing (NGS) based metabarcoding for the detection and identification of plant pathogens at the ecosystem scale in New Zealand, (2) to characterise plant pathogen communities, and (3) to determine the environmental drivers of these communities. First, I investigated the suitability of NGS for the detection, identification and quantification of plant pathogens using rust fungi as a model system. -
Ce Document Est Le Fruit D'un Long Travail Approuvé Par Le Jury De Soutenance Et Mis À Disposition De L'ensemble De La Communauté Universitaire Élargie
AVERTISSEMENT Ce document est le fruit d'un long travail approuvé par le jury de soutenance et mis à disposition de l'ensemble de la communauté universitaire élargie. Il est soumis à la propriété intellectuelle de l'auteur. Ceci implique une obligation de citation et de référencement lors de l’utilisation de ce document. D'autre part, toute contrefaçon, plagiat, reproduction illicite encourt une poursuite pénale. Contact : [email protected] LIENS Code de la Propriété Intellectuelle. articles L 122. 4 Code de la Propriété Intellectuelle. articles L 335.2- L 335.10 http://www.cfcopies.com/V2/leg/leg_droi.php http://www.culture.gouv.fr/culture/infos-pratiques/droits/protection.htm U.F.R. Sciences & Technologies IFR 110 Génomique, Ecophysiologie et Ecologie E.D. Ressources, Procédés, Produits et Fonctionnelle Environnement Unité Mixte de Recherche INRA/UL-1136 Biologie Végétale et Forestière Interactions Arbres-Microorganismes Thèse Présentée pour l'obtention du titre de Docteur de l'Université de Lorraine en Biologie Végétale et Forestière par MATHIEU Yann Diversité écologique et fonctionnelle des champignons décomposeurs du bois : l’influence du substrat de la communauté à l’enzyme. Soutenance publique prévue le 11 Décembre 2012 Membres du jury : Rapporteurs : Eric RECORD, Directeur de Recherche, INRA Jean-François COLLET, Professeur, Université Catholique de Louvain Examinateurs : Gaétan LE FLOCH, Maître de Conférences, Université de Bretagne Occidentale Pierre-Emmanuel COURTY, Research Associate, Université de Bâle Philippe GERARDIN, Professeur, Université de Lorraine Eric GELHAYE, Professeur, Université de Lorraine, Directeur de Thèse Invités : Marc BUEE, Chargé de Recherche, INRA, Co-directeur de Thèse Luc HARVENGT, Responsable Scientifique Biotech, FCBA, Co-directeur de Thèse Mélanie Morel, Maître de Conférences, Université de Lorraine Claude DIDIERJEAN, Maître de Conférences, Université de Lorraine La Science est fille de l’étonnement. -
Botryotina and Botrytis Species
BOTRYOTINIA AND BOTRYTIS SPECIES taxonomy physiology and pathogenicity Monograph No. 15 1977 Agriculture Canada BOTRYOTINIA AND BOTRYTIS SPECIES: taxonomy, physiology, and pathogenicity A guide to the literature W. R. Jarvis Research Station Harrow, Ontario N0R 1G0 Research Branch Canada Department of Agriculture Monograph No. 15 1977 Copies of this publication may be obtained from INFORMATION DIVISION CANADA DEPARTMENT OF AGRICULTURE OTTAWA K1A 0C7 'MINISTER OF SUPPLY AND SERVICES CANADA 1977 2M-38745-7.77 Cat. No.: A54-3/15 ISBN No.: D-662-00794-8 Hignell Printing Limited Contract No.: 0KT7-1078 CONTENTS PART 1 Introduction 9 PART 2 Taxonomy 11 Taxonomic review 11 Sclerotiniaceae 11 Botryotinia 12 Botryotinia and Botrytis 13 Botrytis 14 The basis for classification 16 Numerical taxonomy 17 Biochemical differentiation 18 Variability 18 Sexual reproduction 18 PART 3 Form and Function 20 Anatomy and morphology 20 Mycelium 20 Conidiophores and conidia 20 Microconidia 21 Chlamydospores 22 Oidia 22 Haustoria 22 Appressoria 23 Organs of attachment 23 Sclerotia 23 Apothecia 25 Ultrastructure 25 Cytology 27 Variants 29 Adaptation to fungicides 31 Growth 33 Effects of temperature 33 Effects of relative humidity 34 Effects of light 35 Phototropism 38 Effects of pH 39 Effects of age and nutrition 39 Staling 41 Effects of volatile metabolites 42 Effects of atmospheric gases and pollutants 42 Autotropism 44 Rheotropism 44 Sporulation inhibitors 45 Storage 45 3 Metabolism 46 Selective media 46 Carbohydrates 46 Nitrogen 48 Amino acids and proteins 49 -
Pilzgattungen Europas - Liste 7: Notizbuchartige Auflistung Der Hypho-, Blasto- Und Agonomyceten
Pilzgattungen Europas - Liste 7: Notizbuchartige Auflistung der Hypho-, Blasto- und Agonomyceten Bernhard Oertel INRES Universität Bonn Auf dem Hügel 6 D-53121 Bonn E-mail: [email protected] 24.06.2011 Wichtige Vorbemerkungen: Viele Beschreibungen, Mikrofotos und Zeichnungen von Hyphomyceten finden sich bei den einzelnen Hyphomyceten-Arten in der Mycobank im Internet. Besonders auch die Darstellungen aus Matsushima (1971, 1975 und 1980-2001) sind in die Mycobank übernommen worden, so dass ein Aufzählen im Detail hier entfallen kann. Die in der Rubrik "Bestimm. d. Gatt." erwähnten Bücher bieten darüberhinaus - außer der Erwähnung der Gattung im Bestimmungsschlüssel - auch weitere Informationen. Diese Bücher sind in den Rubriken "Lit." und "Abb." z.T. nicht noch ein zweites Mal aufgeführt worden. Daseinsberechtigung der Gattungsnamen Durch die fortschreitende Zuordnung der imperfekten Pilze zu den Gattungen der sexuellen Pilze mit Hilfe der Beweiskraft von molekularen Analysen geht auch parallel immer mehr das Bedürfnis verloren, den imperfekten Formen eigene Formgattungsnamen zuzuschreiben. Einerseits ist es aber zum Verständnis der älteren Literatur notwendig, die Bedeutung solcher Gattungsnamen nachschlagen zu können und andererseits ist es als eine Verarmung der mykologischen Wissenschaften anzusehen, wenn die alten Formgattungsnamen nicht wenigstens als Bezeichnungen von Pilzstadien weiterleben dürfen. Viele Arten sind nach wie vor nicht an das System der sexuellen Pilze anzuschließen und verbleiben daher weiterhin in dieser hier behandelten Gruppe der imperfekten Pilze. Rostpilze in Form von asexuellen Stadien Einige Deutermyceten mit Rostpilz-Phylogenie (imperfekte Roste) haben ein Hyphomyceten-artiges Aussehen. Diese Formen werden aber zur Zeit provisorisch in der Coelomyceten-Datei untergebracht. Hier in dieser Datei finden sich nur die Hefeformen aus dieser Verwandtschaft.