Hox
Hox
Hox
Hox
Hox
Hox
Hox
Hox13
Hoxb13 Hoxc13
T/Brachyury
Cyp26A1
Cyp26A1
Cyp26A1
Raldh2
Raldh2
Raldh2
Hoxb1-9
Hoxb1-9
Hox
Hox
Brachyury/T
Hox
Hoxb1-9
Hox
Hoxb9
Hox
Hoxc8 Hoxd8
Hoxa13
Hox
Hox
Hox
in vivo
Hox
Hox
Hox Hoxa9, Hoxc9, Hoxd10, Hoxd11, Hoxc11, Hoxa13,
Hoxb13 Hoxc13 Hox
Hox
Hoxa10, Hoxc10, Hoxa11, Hoxc12, Hoxd12 and Hoxd13
Hoxd10 Hoxc11
Hoxc11
Hoxd10
Hoxa13 Hoxc11
Hox
Hox
Hoxa13
Hoxa13
Hoxa13
Hoxa13
Sox2
Hoxa13
Hox
RhoA
Hoxa13 DN-RhoA
.
, Hox
Hox
Hoxa9, Hoxc9, Hoxd10, Hoxd11, Hoxc11, Hoxa13, Hoxb13 Hoxc13
Hoxa10, Hoxc10, Hoxa11, Hoxc12, Hoxd12 Hoxd13
Hox
Hox
Hox
Hox
Hox
Drosophila Hox
Hoxb1-9
Hox
Hoxd10
Hoxc11
Hoxc11 Hoxc11
Hoxc11mutH
Hox Hoxc11
Hoxc11 Hoxd10.
Hoxa13 Hoxc11
Hox
Hox
Hox
Hox
Hox
Pbx1
Pbx1 Pbx1
Pbx1
Pbx1
Pbx1
Pbx1
Hoxb7, Hoxb9
Hoxa9, Hoxc9, Hoxd10, Hoxd11, Hoxc11, Hoxa13, Hoxb13 Hoxc13
Pbx1 Hox Hoxb7 Hoxb9 Pbx1
Hox
Pbx1 Hox
Pbx1
Pbx1 Hox
Hox
Pbx1 Hox
Hox β
Hox
H2B-Venus
Hoxa13 H2B-Venus
β
Axin2, Fgf8 Sp8 Hoxa13
Hox
β
in situ Axin2, Fgf8
T Brachyury
Hoxa13
Axin2, Fgf8
T Brachyury.
Hoxd10, Hoxc11 Hoxa13 βcatLEF
β
β
Hoxa9 Hoxc9 Hoxd10 Hoxd11 Hoxc11, Hoxa13,
Hoxb13 Hoxc13 Hox
Hoxd10 Hoxd11
Hox
β Hoxa9 Hoxa13
Hoxa13
Hoxa13
Hox
Hox Hoxa13
Lrp6 Ctbbn1
Wnt3 Wnt5a
Hox
Fzd2 Hoxa13
Hoxa13
Fzd2
Dact2
Hoxa13
Hoxa13 FGFR1 Fgf8,
Etv1 Cyp26A1 Rasgrp3,
Spred2
Hoxa13
Hoxc11 Hoxa13
Cyp26A1,
Hox
T/Brachyury Hox
T Brachyury
T
T
Hoxa9 Hoxd10 Hoxc11 Hoxa13
T
Hoxa13
T µ µ Hoxa13
T Hoxa13
T Hoxc11 Hoxa13
T Hoxa13
βcatLEF T
Hoxa13 βcatLEF T
Hox T
β
Hox
T
Hoxa13
Hoxa13dn Hox13
Hox13 Hoxa13dn
Hoxa13
Hoxd10 Hoxd10dn)
Hoxc11 Hoxc11dn)
Hoxa13dn
Hoxc11dn Hoxc11dn Hoxd10dn
Hox10-13
Hoxd10dn, Hoxc11dn Hoxa13dn
T Axin2 Fzd2
β
Hox
T/Brachyury
T/Brachyury
T/Brachyury
T/Brachyury .
T/Brachyury
T/Brachyury.
T/Brachyury
T/Brachyury
T/Brachyury .
Hox
β
T/Brachyury
Hox
Hox
Sox2 Brachyury
Hoxa13
Hoxa13
Hoxa13
Hoxb13 Hoxc13
Hox
Hox
vivo
Cyp26A1
raldh2
Hox
Hoxa13 b13 c13
Hoxd
Hoxd
Hoxd
Hoxc13
Cyp26A1
Hoxa13
raldh2
raldh2
Hox
Hox
Hox
Hox
Hoxb1-9
in vivo
Hox
Hox
Hox
Hox10 Hox11
Hox
Pbx1
Pbx1 Pbx2
Pbx1-/-; Pbx2+/- Hox
Wnt3a
T
Hox13
Hox
T
Hoxa13 Hox
Hoxa13
Hox
Hoxa13
Sox2 in situ
Hox
Sox2
Hox
T
Hox
Hox
ex ovo
Hox T…)
Hox
Hox
pCAGGS-Venus pCAGGS-Hoxa13-IRES2-Venus
in situ in situ
Pbx1
Fgf8
Fzd2 Dact2
T cSox
Hox Hoxa2 Hoxa3, b3,
d4 Hoxa10, a11, a13, c4, c5, c6, c8, c9, d8 d9 d10, d11, d12
d13 Hoxb1, b4, b7, b9
Hoxb8 Hoxb5, c10, c11, c12, c13 b13
Hoxa4
Hoxa5 Hoxa6 Hoxa7
Hoxa9 Hoxb2
Hoxb6 Hoxd3
Hox Pbx1 T
Wnt3a Wnt5a, Dact2 Fzd2
Accuprime pfx
lef1
β
Lrp6 ∆ Ctbbn1
Rhoa
Hoxa13, Hoxc11, Hoxd10
Hoxd10 c11 a13 Hoxd10dn, Hoxc11dn Hoxa13dn
T
firefly
T β
siamois
firefly
Pbx1
Pbx1
Pbx1
Pbx1
Pbx1
Pbx1
Pbx1
Pbx1
µ
Hox T
Hox
µ
µ µ
µ µ
µ µ
Hox
Hoxa13mutH
Hoxc11mutH Hoxa13mutH or Hoxd10mutH Hoxc11mutH Hoxa13mutH
Hoxa13dn Hoxc11dn
Hoxa13dn Hoxd10dn, Hoxc11dn Hoxa13dn
Hoxa13
µ
Hoxa13
µ
µ µ
−
−β
µ
in vitro
In Situ
H2B-venus Hoxa13 H2B-venus
Hoxa13
µ
Hoxa13
Hoxa13
Hoxa13
µ µ
µ µ
gapdh
gapdh.
Hoxd10mutH, Hoxc11mutH and Hoxa13mutH
Hoxd10dn, Hoxc11dn Hoxa13dn
µ
µ µ
µ µ
gapdh
gapdh.
µ
µ µ
µ µ
gapdh
gapdh.
Hox in situ
15
4 466 29 129 134 321 51 9 220 239 49 206 129 134 10 427 256
13 98 78 12 127 454 312 12 195 195 18 120 375 442 104 205 420 125
22 23 344 100 24 22 135 134 291 15 108 10 104 134 10
120 122 44 15 193 112 128 , et al. 147 22 15 7 10 10 , et al. 141 5 17
238 301 192 55 121 136 13 , et al. 17
Hox
Hox
Hoxa Hoxb
Hoxc Hoxd
Hox
Hox
Hox
Hox
Hoxa9 Hoxc11, Hoxb13
Hox
Hox
Hoxa13
Hoxa13 α
Hoxa13
Hoxa13
Hoxa13
In situ
Hoxa13 Sox2
Hoxa13+DN-RhoA
Hox
Hoxa13
Hoxa9 Hoxc9 Hoxd10
Hoxd11 Hoxc11, Hoxa13, Hoxb13 Hoxc13
Hox
Hoxc11 Cherry Hoxc11mutH-Cherry Hoxd10-Venus
Hoxc11-Venus
Hoxa1 -Cherry Hoxa13mutH-Cherry Hoxa13-Venus
Hoxc11-Venus
β
Hoxa9 Hoxa13 Hoxa9 Hoxa13
Hoxa13 µ µ
Hoxa13
µ
Hoxa13
µ
Hox
Pbx1 Pbx1
Pbx1
Pbx1
Pbx1 Pbx1 Hoxb7
Hoxb9 Hoxc9 Hoxc11 Hoxa13
Pbx1
β Hox
Hoxa13 T/Brachyruy
Axin2 Fgf8
Hoxd10mutH Hoxd10
Hoxd10+βcatLEF Hoxc11mutH Hoxc11 Hoxc11+βcatLEF Hoxa13mutH
Hoxa13 Hoxa13+βcatLEF. β
Hoxa9
Hoxc9 Hoxd10 Hoxd11 Hoxc11, Hoxa13, Hoxb13 Hoxc13
β
Hoxa13 Hoxa13+dBC Hoxa13+Lrp6∆ Hoxa13
Hoxa13+Wnt3a Hoxa13+Wnt5a Fzd2 Hoxa13 Hoxa13+Fzd2
Dact2
Hox Brachyury
β
T Hoxa13
Hoxa13 Hoxa13
T T Hoxa13
Hoxc11 Hoxa13
βcatLEF, Hoxa13 Hoxa13 βcatLEF
β
Hoxa13mutH, Hoxa13dn, Hoxa13+Hoxa13mutH Hoxa13+Hoxa13dn
Hoxd10mutH Hoxd10dn Hoxd10+Hoxd10mutH Hoxd10+Hoxd10dn
Hoxc11mutH, Hoxc11dn, Hoxc11+Hoxc11mutH Hoxc11+Hoxc11dn
β
Hoxa13mutH
Hoxa13dn Hoxa13mutH Hoxc11mutH Hoxa13dn Hoxc11dn
Hoxa13mutH Hoxc11mutH Hoxd10mutH Hox13dn Hoxc11dn
Hoxd10dn T Axin2 Fzd2
Hoxa13mutH Hoxc11mutH Hoxd10mutH
Hoxa13dn Hoxc11dn Hoxd10dn
Hoxa5 Hoxa13,
Hoxa5Ha13 Hoxa13Ha5 Hoxa13, NHox13HCa5 Hoxa5Ca13
Hoxc11Ha5 Hoxa13Ha5.
Hox
Hox
Hox
Pbx1
Hox
5 Hox
Hox
Hox T/Brachyury
Hox Pbx1
Hoxa13
Standard Standard Average Gene Average (Control) Dev dev Fold Change (Hoxa13) (control) (Hoxa13)
Sp8 949.9 279.2 483.8 21.4 0.51
Fzd2 139.7 10.7 78.5 8.6 0.56
Axin2 857.8 42.5 677.0 99.1 0.79
Dact2 415.8 134.4 989.8 270.1 2.38
Cyp26a1 625.1 258 102.9 13 0.16
Fgf8 1523.9 159.3 591.2 65 0.39
Etv1 296.6 113.2 155.1 23.8 0.52
Fgfr1 145.9 5.8 80 0.6 0.55
Rasgrp3 1441.3 671.8 362.8 218.8 0.25
gene size of the gene reference primers sequence 5'-->3' name amplicon F: GCTGAGAACGGGAAACTTGTG Gapdh NM_204305.1 62bp R: GGGTCACGCTCCTGGAAGA F: CGAGGAGATCACAGCTTTAAAAATT T NM_204940.1 75bp R: TCATTTCTTTCCTTTGCGTCAA F: GCGCAAACGATAGTGAGATATCC Axin2 NM_204491.1 76bp R: CCATCTACACTGCTGTCTGTCATTG F: CATGGCGCACCCCTACGAGTC Sp8 NM_001198666.1 131bp R: CGTTGGGGGCACGTCGATCCA F: CCCTGCCCGCTGCACTTCAC Fzd2 NM_204222.1 190bp R: CCGCTCACACCGTGGTCTCG F: AGGAGCCCGAGGGTGGCTACA Cyp26a1 NM_001001129.1 138bp R: TGGCAGTGGTTTCATGACCTCCAA F: CGCTCTTCAGCTACGTGTTCATGC Fgf8 NM_001012767.1 108bp R: TGGTAGGTGCGCACGAGCC F: ATGGACCACAGATTTCGCCGCC Etv1 NM_204917.1 145bp R: TTGGACGTCCTTCCCTCGGCA F: CACGCTGCCCGACCAAGCTC Fgfr1 NM_205510.1 168bp R: GTGATGCGCGTGCGGTTGTT Rasgrp3 NM_001006401.1 111bp
Hox
Hoxd10-Cherry Hoxc11-Venus
Hoxc11 Cherry Hoxa13-Venus
Hoxa13
Hoxc11 Hoxd10
Hox
In situ
Hoxa13 Axin2 Fgf8 T Fzd2
Dact2
Dact2 Hoxa13
Hox
Hoxd10 Hoxd11
Hox
Hoxb1 Hoxa5 Hoxc11 Hoxa13.
β
T Hoxa13 Hoxa13+T.
Hoxa13
H2B-Venus
Hoxa9 Hoxc11 Hoxa13
H2B-Venus
Hoxa9-ires2-H2B-Venus Hoxc11-ires2-H2B-Venus
Hoxa13-ires2-H2B-Venus
Hoxa9, c11 and a13
Pbx1
pBIC Pbx1pBIC
Pbx1
β T
Hoxa13
Hoxa13mutH-ires2-H2B-Venus
Hoxa13-ires2-H2B-Venus T Hoxa13-ires2-H2B-Venus
βcatLEF Hoxa13-ires2-H2B-Venus
β
Hoxd10
Hoxd10mutH-ires2-H2B-
Venus Hoxd10-ires2-H2B-Venus βcatLEF Hoxd10-
ires2-H2B-Venus
β
Hoxc11
Hoxc11mutH-ires2-H2B-
Venus Hoxc11-ires2-H2B-Venus βcatLEF Hoxc11-
ires2-H2B-Venus