Académie Universitaire Wallonie – Europe Université de Liège – Faculté de Médecine Vétérinaire Département des Maladies Infectieuses et Parasitaires Service d’Épidémiologie et Analyse de Risques Appliquées aux Sciences Vétérinaires Institut de Médecine Tropicale d’Anvers Unité de Biostadistique et d’Epidémiologie Département de Sciences Biomédicales Centro Internacional de Zoonosis Universidad Central del Ecuador ETUDE ÉPIDÉMIOLOGIQUE DE LA BRUCELLOSE BOVINE ET SON IMPACT EN SANTÉ PUBLIQUE DANS LE NORD-OUEST DE L’EQUATEUR EPIDEMIOLOGICAL STUDY OF BOVINE BRUCELLOSIS AND ITS IMPACT IN PUBLIC HEALTH IN THE NORTHWEST OF ECUADOR Jorge RON-ROMÁN Thèse présentée en vue de l’obtention du Grade de Docteur en Sciences Vétérinaires Année académique 2016-2017 Source des illustrations de la couverture : Jorge Ron-Román et Alexandra Angulo-Cruz Académie Universitaire Wallonie – Europe Université de Liège – Faculté de Médecine Vétérinaire Département des Maladies Infectieuses et Parasitaires Service d’Épidémiologie et Analyse de Risques Appliquées aux Sciences Vétérinaires Institut de Médecine Tropicale d’Anvers Unité de Biostadistique et d’Epidémiologie Département de Sciences Biomédicales Centro Internacional de Zoonosis Universidad Central del Ecuador ETUDE ÉPIDÉMIOLOGIQUE DE LA BRUCELLOSE BOVINE ET SON IMPACT EN SANTÉ PUBLIQUE DANS LE NORD-OUEST DE L’EQUATEUR EPIDEMIOLOGICAL STUDY OF BOVINE BRUCELLOSIS AND ITS IMPACT IN PUBLIC HEALTH IN THE NORTHWEST OF ECUADOR Promoteur: Prof. Dr. Claude SAEGERMAN Unité de recherche en Epidémiologie et Analyse de Risque Appliquées aux Sciences Vétérinaires (UREAR-ULg), Fundamental and Applied Research for Animal and Health (FARAH) Center, Département des Maladies Infectieuses et Parasitaires Faculté de Médecine Vétérinaire – Université de Liège Co-promoteur: Prof. Dr. ir. Dirk BERKVENS Unité de Biostatistique et d’Epidémiologie Département de Sciences Biomédicales Institut de Médecine Tropicale d’Anvers Jorge RON-ROMÁN Thèse présenté en vue de l’obtention du Grade de Docteur en Sciences Vétérinaires Année académique 2016-2017 Dédicace ¡Amen! La louange, la gloire, la sagesse, l'action de grâces, l'honneur, la puissance, et la force, soient à notre Dieu, aux siècles des siècles. !Amen! Apocalypse 7:12 (La Sainte Bible, Louis Segond, 1910) Au peuple équatorien: mon plus grand investisseur et sponsor. À ma épouse et filles: María-Augusta, Emilia et María-Inés. À mes parents et frères: Jorge, Victoria, Carlitos, Carmita y Rebequita Dedicatoria [Texte] ¡Amén! La bendición, la gloria, la sabiduría, la acción de gracias, la honra, el poder y la fortaleza sean a nuestro Dios por los siglos de los siglos. ¡Amén! Apocalipsis 7:12 (Santa Biblia, Reina & Valera, 1960) Al pueblo ecuatoriano: mi mayor inversionista y patrocinador. A mi esposa e hijas: María-Augusta, Emilia et María-Inés. A mis padres y hermanas: Jorge, Victoria, Carlos, Carmita y Rebeca RÉSUMÉ Version française INTRODUCTION La brucellose, aussi connue en tant que fièvre de Malte ou fièvre ondulante chez l'homme, et comme maladie de Bang ou avortement contagieux chez les bovins, est une infection hautement contagieuse causée par des bactéries du genre Brucella. Malgré les nombreux efforts déployés pour contrôler et éradiquer cette maladie, elle est toujours considérée comme l'une des zoonoses les plus répandues dans le monde. La prévalence est élevée dans les pays ou les régions où les conditions sanitaires sont mauvaises, où les systèmes d'exploitation des animaux sont traditionnels, et lorsqu’aucun système adéquat de surveillance épidémiologique de la maladie n’est mis en place. Son importance est liée à l’impact désastreux en matière de santé publique, ainsi qu’aux pertes économiques qu’elle peut générer. En santé publique, les pertes économiques sont associées au coût des diagnostics clinique et de laboratoire, aux frais thérapeutiques et aux compensations versées aux patients; en effet, cette affection est reconnue comme maladie professionnelle dans de nombreuses régions du monde. Chez les bovins, l'avortement, la stérilité, la chute de production laitière, les retards dans les programmes d’amélioration génétique et la naissance de veaux faibles sont les causes les plus courantes de pertes économiques. Les restrictions en termes d’échanges commerciaux internationaux des animaux et de produits alimentaires dérivés de ceux-ci ont également un impact économique majeur. L'homme et les animaux s’infectent, soit par contact direct avec des animaux ou du matériel infecté (fœtus, membranes fœtales ou sécrétions vaginales), soit après consommation de produits laitiers non pasteurisés. L'une des options les plus fréquemment utilisées pour contrôler la brucellose bovine repose sur la vaccination du bétail avec une souche atténuée de B. abortus Buck 19 (B19). Malheureusement, la stratégie de vaccination ne peut éradiquer à elle seule la maladie. En effet, il est indispensable d'identifier les animaux infectés et de les éliminer de manière adéquate. De gros problèmes se posent suite à la vaccination car ce type de vaccin présente l'inconvénient d’engendrer la production d’anticorps qui interfèrent avec les tests diagnostiques tels que l’agglutination, l’ELISA et le test cutané. Cette caractéristique complique la confirmation d’un diagnostic, interfère avec la ii compréhension réelle du problème et avec les moyens permettant d’identifier des options de gestion adaptées aux particularités d'une région ou d'un pays. La présence de la brucellose dans le cheptel bovin équatorien a été mise en évidence par Salvestroni en 1926. Néanmoins, malgré les efforts consacrés à la recherche sur la brucellose animale en Equateur, le manque de techniques diagnostiques standardisées (présentant une sensibilité et une spécificité élevées), l'insuffisance d'interprétation des résultats et le faible nombre d'isolements et caractérisations de Brucella spp. n’ont pas permis de réellement cerner l’ampleur du problème. Ce travail visait à générer des informations fiables sur la situation épidémiologique réelle de la brucellose bovine et son impact en santé publique dans le nord-ouest de l'Equateur, et à investiguer les potentiels facteurs de risque d’infection. En effet, ces informations revêtent une importance primordiale pour les organismes officiels en charge de la surveillance de cette zoonose. Quatre objectifs spécifiques ont été définis et sont précisés ci-dessous. Ce manuscrit est divisé en deux sections principales: d’une part, l’introduction, sous la forme d’une revue de littérature sur Brucella spp. et la brucellose, et d’autre part, la section expérimentale, dans laquelle sont présentées les études réalisées en Equateur chez l’homme et plusieurs espèces animales (travaux de terrain et de laboratoire). L’introduction résume les informations générales sur l'agent infectieux, l'épidémiologie de la maladie et la réponse immunitaire de l'hôte, ainsi que sur les différentes méthodes de diagnostic direct et indirect. De plus, les systèmes d'élevage pratiqués en Equateur sont décrits afin de mieux cerner le contexte épidémiologique (Objectif 1). La section expérimentale présente les résultats d’études réalisées chez les espèces animales afin de caractériser l'agent causal, de déterminer la prévalence réelle de l'infection, et d'estimer les paramètres de sensibilité et spécificité des tests diagnostiques utilisés (Objectif 2). Par ailleurs, l’importance zoonotique de la brucellose en Equateur a été investiguée (Objectif 3). iii Dans un premier temps, les résultats de l'étude réalisée chez les bovins dans le nord- ouest de l'Equateur, ainsi que les résultats de l'étude de la brucellose chez les chèvres dans deux régions d’Equateur sont développés. Concernant l’aspect santé publique, les études visaient (i) à déterminer la prévalence réelle de la maladie et les facteurs de risque et à caractériser l'agent causal, (ii) à évaluer la sensibilité et la spécificité des tests diagnostiques utilisés, et (iii) à présenter un rapport de cas d’orchite avec son suivi clinique et sérologique. Le travail se clôture par la présentation des lignes directrices servant de base à l'élaboration d'une stratégie de surveillance épidémiologique des brucelloses bovine et humaine, adaptée aux conditions du nord-ouest de l'Equateur (Objectif 4). RESULTATS 1. Une révision de la bibliographie locale a démontré que la brucellose a toujours été une préoccupation en Equateur Sans aucun doute, la compréhension d'un problème constitue la base de la formulation, non seulement, des solutions correctes mais aussi et surtout viables. En ce sens, et dans le cadre de ce travail visant à mieux comprendre, et de manière correcte, la situation épidémiologique de cette zoonose chez l'homme et ses différents hôtes, une revue complète de la littérature s’avérait nécessaire comme point de départ. La brucellose a toujours été un centre d’intérêt en Equateur, car suite aux premières notifications chez les bovins par Salvestroni en 1926 et chez l’homme par Valenzuela en 1934, de nombreuses études ont été réalisées, principalement chez les espèces animales réservoirs. Le rôle du vétérinaire de terrain vis-à-vis de cette zoonose a d’ailleurs été mis en avant. La situation réelle de la brucellose humaine en Equateur, telle que rapportée au niveau international, est erronée. En effet, selon les rapports officiels, soit la maladie ne serait pas présente, soit il n’existerait aucune information fiable sur la situation, soit elle serait contrôlée. Cela s’explique par le peu d’études menées chez l’homme. La plupart de ces iv dernières