Recherche de gènes candidats responsables du Syndrome d’Aicardi : Complémentarité des approches expérimentales et bioinformatiques Saliha Yilmaz To cite this version: Saliha Yilmaz. Recherche de gènes candidats responsables du Syndrome d’Aicardi : Complémentarité des approches expérimentales et bioinformatiques. Génétique. Université Henri Poincaré - Nancy 1, 2007. Français. NNT : 2007NAN10149. tel-01748514 HAL Id: tel-01748514 https://hal.univ-lorraine.fr/tel-01748514 Submitted on 29 Mar 2018 HAL is a multi-disciplinary open access L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est archive for the deposit and dissemination of sci- destinée au dépôt et à la diffusion de documents entific research documents, whether they are pub- scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, lished or not. 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Contact : [email protected] LIENS Code de la Propriété Intellectuelle. articles L 122. 4 Code de la Propriété Intellectuelle. articles L 335.2- L 335.10 http://www.cfcopies.com/V2/leg/leg_droi.php http://www.culture.gouv.fr/culture/infos-pratiques/droits/protection.htm FACULTE DES SCIENCES & TECHNIQUES U.F.R Sciences & Techniques biologiques Ecole Doctorale Biologie, Santé et Environnement (BioSE) Thèse présentée pour l’obtention du titre de Docteur de l’Université Henri Poincaré, Nancy‐I Spécialité Génomique par Saliha YILMAZ Recherche de gènes candidats responsables du Syndrome d'Aicardi : Complémentarité des approches expérimentales et bioinformatiques Soutenue publiquement le 7 Novembre2007 Directeur de thèse : Professeur Philippe JONVEAUX Membres du jury : Rapporteurs : Professeur Yves MOREAU Professeur Joris Robert VERMEESCH Examinateurs : Docteur Marie‐Dominique DEVIGNES Docteur John Louis McGREGOR Docteur Roberto INCITTI Professeur Bruno LEHEUP Professeur Philippe JONVEAUX Invité d’honneur : Professeur Jean AICARDI Laboratoire de Génétique Médicale, CHU Nancy‐Brabois, Rue du Morvan, 54511 Vandoeuvre‐lès‐Nancy A Annick Perroux, ma tata… Sans toi ce travail n’existerait pas Quel bonheur de t’avoir connue A la jolie Anne­Lorène… … à toutes les filles Aicardi de part le monde et aux familles qui ont participé à ce projet… Remerciements Je remercie tout particulièrement mon Directeur de thèse, le Professeur Philippe Jonveaux. Merci de m’avoir accueillie dans votre laboratoire, de m’avoir accordé votre confiance et de m’avoir permis de confirmer mon goût (devenue passion) pour la génétique humaine. Mes remerciements vont également à Christophe Philippe. Tu as été présent à chaque fois que j’ai eu besoin de toi, merci pour ta générosité et ton altruisme. Je remercie également Marie‐José Grégoire. Merci de m’avoir fait profiter de votre esprit cartésien. Clarté et simplicité … Toute ma profonde gratitude pour Monsieur Jean Aicardi. Merci Monsieur de me faire l’honneur de votre présence dans mon jury. Yves Moreau et Joris Robert Vermeesch m’ont fait l’honneur d’être les rapporteurs de cette thèse, et je les en remercie, de même que pour leur participation au Jury. Bien sur, je remercierai les deux représentantes de l’équipe orpailleur Marie‐Dominique Devignes et Malika Smaïl‐Tabbone. Merci à vous, très sincèrement je n’ai cessé d’apprendre et j’ai encore soif… Je tiens à remercier Roberto Incitti pour les conseils stimulants et les suggestions enrichissantes que j’ai reçus de sa part. Je remercie également Bruno Leheup d’avoir accepté de participer au Jury de soutenance. Votre savoir m’a toujours impressionnée. Je tiens à dire un grand Merci à John Louis McGregor. Merci de m’avoir si naturellement et si gentiment accueillie dans votre équipe à Londres. Je suis impatiente à l’idée de commencer un tel projet avec vous et Sophie. Une nouvelle aventure dans une nouvelle vie et une ville où, quoi qu’on en dise, il ne pleut pas* * autant qu’à Nancy. J’en profite pour remercier Flo, Marion, Sophie, Chris, Kira et Thibault pour tous les bons moments que nous avons partagés ensemble durant mes séjours à Londres. Un grand merci à Karène pour sa gentillesse et sa disponibilité. Merci à Hervé et Cédric. Et bien sur à Stéphane, un vrai cadeau en tant que premier stagiaire… Et puis, il y a tout ce monde autour de moi, dont beaucoup de personnes d’exception. Des personnes que je connaissais ou que j’ai rencontrées et qui ont fait que ces années ont été aussi riches et agréables. Mes amis de toujours, Eléonore et Manu, Valérie et Gaby. Je suis à la traîne mais j’ai presque fini… Marie Jo, merci pour ton amitié et ta sincérité. Ilham. Je ne désespère pas de te voir un jour chez moi…idem, tu vas me dire… Micheline. Toi heureusement que tu es là…et pour beaucoup de monde j’en suis sur. Aline et son petit bout de chou…qui va bientôt nous rejoindre. Merci à Khaled, Cindy, Üstün, Nizar, Adrien, Lazslo…avec qui j’ai partagé cette dernière année de thèse si agréable. Je souhaite remercier toutes les personnes, qui d’une façon ou une autre m’ont épaulée : soit au sein du laboratoire de génétique que celui du Loria … grâce à leur gentillesse, leur disponibilité et leur compétence, ils m’ont enrichie pour mener à bien ce fabuleux projet. Merci à mes parents de m’avoir toujours poussé à réaliser ce que je souhaitais faire. D’avoir été là, toujours à mes cotés. Merci à mes frères Okan et Ozcan. Promis, à l’avenir je serai moins stressée et plus disponible. Merci à ma sœur Sevgi. Tu tombes toujours à pic … merci Et merci à mon porte bonheur. Quelle patience tu as… 4°¨• §•≥ ° © ≤•≥ Table des matières Liste des figures...................................................................................................................................................7 Liste des tableaux ...............................................................................................................................................9 Abréviations.......................................................................................................................................................11 Préambule...........................................................................................................................................................16 Introduction 1. Retard mental ..........................................................................................................................................19 1.1. Définition...........................................................................................................................................19 1.2. Prévalence des RM.........................................................................................................................20 1.3. Etiologie des RM.............................................................................................................................20 2. Retards mentaux liés au chromosome X......................................................................................23 2.1. Prévalence des RMLX...................................................................................................................23 2.2. Nosologie ...........................................................................................................................................24 2.3. Etiologie .............................................................................................................................................25 2.4. Physiopathologie des RMLX......................................................................................................30 2.4.1. RMLX et synapse ...................................................................................................................30 2.4.2. RMLX, régulation de la transcription et remodelage de la chromatine.........33 2.4.3. RMLX et possibilités thérapeutiques............................................................................34 3. Le Syndrome d’Aicardi.........................................................................................................................34 3.1. Historique..........................................................................................................................................34 3.2. Spectre clinique ..............................................................................................................................35 3.2.1. Les anomalies neurologiques ..........................................................................................35 3.2.2. Les anomalies oculaires .....................................................................................................36 3.2.3. Les anomalies extra neurologiques...............................................................................37 3.2.4. Pronostic et histoire naturelle.........................................................................................38 3.2.5. Proposition de critères pour le diagnostic clinique du syndrome d’Aicardi..... ................................................................................................................................................