Sem´aforoEpidemiol´ogicode Quer´etaro al 24 de mayo de 2021. Eduardo Javier Mendieta Lugo Supervisi´on: Ruth Corona Moreno, Mario Santana Cibrian y Jorge X. Velasco Hern´andez Nodo Multidisciplinario de Matem´aticasAplicadas Instituto de Matem´aticasUNAM Juriquilla. Responsable de la publicaci´on:Jorge X. Velasco Hern´andez 24 de mayo de 2021 ADVERTENCIA: Este documento resume resultados t´ecnicospreliminares para efectos de infor- maci´on´unicamente que no han sido certificados por la revisi´onde pares y, en seguimiento de los est´andaresacad´emicosinternacionales, no pueden usarse para guiar decisiones cl´ınicasni de salud. Asi mismo, estos resultados no deben ser reportados en los medios como informaci´onconfirmada. 1. Introducci´on En este reporte se reproduce el c´alculodel sem´aforoepidemiol´ogicodefinido por la Secretar´ıa de Salud. Estos c´alculosest´anbasados en los datos abiertos federales y una aproximaci´ona la metodolog´ıausada por la DGE. Se usan los 10 indicadores establecidos por la Subsecretar´ıade Prevenci´ony Promoci´onde la Salud, presentados en el documento “Estimaci´onde riesgo epid´emico COVID-19 para el periodo del 31 de agosto al 13 de septiembre para Quer´etaro". 2. Sem´aforo A la fecha de elaboraci´onde este reporte (24 de mayo de 2021), el sem´aforodel estado de Quer´etaroestar´aen color AMARILLO del lunes 31 de mayo de 2021 al 13 de junio de 2021. Los resultados de este c´alculose encuentran en la Tabla 1. 2.1 Aclaraciones sobre el c´alculo: Indicador Trend Valor Score N´umeroreproductivo efectivo Rt (*) " 0.72 2 Tasa de incidencia de casos estimados activos por 100 mil habitantes (*) # 10.52 0 Tasa de mortalidad por 100 mil habitantes # 1.13 0 Tasa de casos hospitalizados por 100 mil habitantes (*) # 2.15 1 Porcentaje de camas generales ocupadas Red IRAG # 6.25 % 0 Porcentaje de camas con ventilador ocupadas Red IRAG # 8.95 % 0 Porcentaje semanal de positividad al virus SARS-CoV-2 # 22.81 % 2 Tendencia de casos hospitalizados por 100 mil habitantes (*) " -0.014 2 Tendencia de casos de s´ındromeCOVID-19 por 100 mil habitantes (*) " -0.123 1 Tendencia de la mortalidad por 100 mil habitantes (*) # -0.007 1 Sem´aforo # 9 (AMARILLO) Cuadro 1: Indicadores del sem´aforoepidemiol´ogicopara el estado de Quer´etarode acuerdo a nuestra aproximaci´ona la nueva metodolog´ıa.Este sem´aforo entrar´ıaen vigor el 31 de mayo de 2021. Los indicadores con (*) son s´oloaproximaciones a los valores que posiblemente reportar´ala federaci´on. La columna Trend muestra si el indicador subi´o(flecha roja), baj´o(flecha verde) o se mantuvo (-) respecto al valor de la semana pasada. 2.1. Aclaraciones sobre el c´alculo: 1. Para calcular las tasas de incidencia, mortalidad, casos hospitalizados, porcentaje de posi- tividad y tendencias, se us´ola base de datos abierta que publica diariamente la Secretar´ıa de Salud [4], con datos actualizados el 24 de mayo de 2021. Estos c´alculosya consideran los cambios en la definici´onde caso positivo que se introdujo el 5 de octubre de 2020. En el caso de la tendencia de casos hospitalizados, tendencia de casos de s´ındromeCOVID y la tendencia de muertes se eliminan los registros de los ´ultimos 7, 14 y 3 d´ıas,respectivamente, para tomar en cuenta el subreportaje. Estos valores son diferentes a los se~naladosen [2]. 2. N´umeroreproductivo efectivo Rt. En este sem´aforo se calcula el Rt usando la metodolog´ıa del software Epiestim [1] que se basa en los casos reportados. Esta metodolog´ıaes la misma utilizada por el gobierno federal para el c´alculode este indicador. En el Reporte NoMMA- Q4-2021, se calcula el Rt con base en los casos infectados estimados totales y se comparan las estimaciones con los del software Epiestim. 3. Para el c´alculode Rt en este documento, se tom´oel promedio de las estimaciones de Rt del 16 de febrero de 2021 al 10 de mayo de 2021 para el estado de Quer´etaro,ya que la estimaci´onde Rt es suavizada aplicando media m´ovilde 7 d´ıas(MA(7)), siguiendo la metodolog´ıapresentada en [5]. Se consideran estas fechas ya que la base de datos federal, actualizada el 24 de mayo de 2021, se recort´ohasta el 10 de mayo para evitar sesgos debido a los posibles retrasos en la actualizaci´onde informaci´on. 4. Porcentajes de camas ocupadas: corresponden a los reportados el 23 de mayo dentro del Sistema de informaci´onde la red IRAQ (www.gits.igg.unam.mx/red-irag-dashboard/reviewHome). 5. Tasa de incidencia de casos estimados activos por 100 mil habitantes: no se conoce con detalle si este indicador incluye un porcentaje de los casos sospechosos de COVID-19; en este ejercicio se ha a~nadido la proporci´onde sospechosos determinada por la tasa de positividad. 2.1 Aclaraciones sobre el c´alculo: 6. Tendencia de mortalidad por 100 mil habitantes: se aplica un suavizamiento mediante splines a los datos reportados de mortalidad, considerando que se tiene un retraso de 5 d´ıas en el registro de defunciones. Figura 3. 7. Porcentaje semanal de positividad al virus SARS-CoV-2: debido a la nueva clasifica- ci´onde casos positivos, negativos y sospechosos, implementada en la base de datos [4] a partir del 5 de octubre, se introdujo una modificaci´onen el c´alculodel porcentaje de positividad. Ahora se considera que el total de muestras positivas diarias est´adado por el n´umerode pruebas de laboratorio realizadas, cuya “Clasificaci´onfinal” corresponda a la confirmaci´on por asociaci´oncl´ınicaepidemiol´ogica,por confirmaci´ondel comit´ede dictaminaci´ono por confirmaci´onde laboratorio. Por otro lado, el total de pruebas diarias realizadas est´adado por el total de individuos reportados en la base de datos para los cuales se tiene un resul- tado. Los casos sospechosos no son tomados en cuenta para este c´alculo.De esta manera el porcentaje semanal de positividad es el cociente del total de pruebas positivas entre el total de pruebas realizadas durante la pen´ultimasemana epidemiol´ogica. 8. Nota t´ecnica:en las aproximaciones de las Figuras 1, 2 y 3 no se aplica ning´unsuavizamiento a los datos. Figura 1: Hospitalizaciones COVID-19 diarias en el estado de Quer´etarohasta el 24 de mayo de 2021, por fecha de ingreso al sistema, seg´unla base de datos publicada el 24 de mayo de 2021 por la Secretar´ıade Salud. Tendencia calculada con un retraso de 7 d´ıas. 2.1 Aclaraciones sobre el c´alculo: Figura 2: Casos diarios confirmados y sospechosos de COVID-19 en el estado de Quer´etarohasta el 24 de mayo de 2021, por fecha de inicio de s´ıntomas, seg´unla base de datos publicada el 24 de mayo de 2021 por la Secretar´ıade Salud; mostrando un ajuste de tendencia considerando un retraso de 14 d´ıasen el registro. 2.1 Aclaraciones sobre el c´alculo: Figura 3: Muertes diarias por cada 100mil habitantes debido a COVID19 en el estado de Quer´etaro hasta el 24 de mayo de 2021, por fecha de defunci´on,seg´unla base de datos publicada el 24 de mayo de 2021 por la Secretar´ıade Salud. La curva de tendencia color roja considera 3 d´ıasde retraso en el registro de fallecimientos. Figura 4: Porcentaje de positividad en el estado de Quer´etaropor semana epidemiol´ogicadesde la semana del 1 de noviembre hasta la semana del 9 de mayo, para evitar sesgos en los datos. 3. Estimaci´onde Rt Para las estimaciones de n´umerosreproductivos se utiliza la metodolog´ıade [1] y [5], usando EpiEstim [3]. La estimaci´onse hace suponiendo un intervalo serial de 4.5 d´ıas, una desviaci´on est´andarde 1 d´ıay se suaviza con una media m´ovilde 7 d´ıas.Los datos son descargados de [4] y para cada localidad se extrae la base de datos de incidencia por inicio de s´ıntomas. En este reporte se muestran los ajustes usando la base de datos actualizada el 24 de mayo de 2021 y recortada hasta el 10 de mayo. Las gr´aficasde Rt presentadas en esta secci´onmuestran las estimaciones desde el 1 de junio, fecha en el que comenz´ola reactivaci´onecon´omicaen el pa´ıs. 3.1 Estado de Quer´etaro 3.1. Estado de Quer´etaro Incidencia y número reproductivo instantáneo en QUERÉTARO = 4.5 y = 1 Rt al 2021-05-10: 0.726 1.4 600 1.3 500 1.2 400 1.1 Rt 300 1.0 Incidencia 0.9 200 0.8 100 0.7 0 Rt al 2021-05-03: 0.693 1.4 600 1.3 500 1.2 400 1.1 1.0 Rt 300 Incidencia 0.9 200 0.8 100 0.7 0 0.6 2020-07 2020-09 2020-11 2021-01 2021-03 2021-05 Figura 5: Estimaciones de Rt (con datos obtenidos en [4]) suavizados con una media m´ovilde 7 d´ıas. La primera gr´aficapresenta el Rt correspondiente a esta semana; la segunda gr´aficapresenta el Rt de la semana pasada, para efectos comparativos. Para la primera gr´afica,se usan datos reportados el 24 de mayo de 2021 y recortados hasta el 10 de mayo de 2021. Segunda gr´afica,se usan datos del 17 de mayo de 2021 recortados al 3 de mayo. 3.2 CADEREYTA DE MONTES 3.2. CADEREYTA DE MONTES Incidencia y número reproductivo instantáneo en CADEREYTA DE MONTES = 4.5 y = 1 Rt al 2021-05-10: 1.360 16 12 14 10 12 8 10 8 Rt 6 Incidencia 6 4 4 2 2 0 0 Rt al 2021-05-03: 0.627 16 12 14 10 12 8 10 8 Rt 6 Incidencia 6 4 4 2 2 0 0 2020-07 2020-09 2020-11 2021-01 2021-03 2021-05 Figura 6: Estimaciones de Rt (con datos obtenidos en [4]) suavizados con una media m´ovilde 7 d´ıas.