Etude de la diversité de Pectobacterium spp et des effets induits par les lipopolysaccharides chez les plantes Mohamed Kettani Halabi To cite this version: Mohamed Kettani Halabi. Etude de la diversité de Pectobacterium spp et des effets induits par les lipopolysaccharides chez les plantes. Sciences agricoles. Université Paris Sud - Paris XI; Univer- sité Hassan II (Mohammedia, Maroc). Faculté des sciences et techniques, 2012. Français. NNT : 2012PA112230. tel-01070631 HAL Id: tel-01070631 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01070631 Submitted on 2 Oct 2014 HAL is a multi-disciplinary open access L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est archive for the deposit and dissemination of sci- destinée au dépôt et à la diffusion de documents entific research documents, whether they are pub- scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, lished or not. The documents may come from émanant des établissements d’enseignement et de teaching and research institutions in France or recherche français ou étrangers, des laboratoires abroad, or from public or private research centers. publics ou privés. UNIVERSITE PARIS-SUD – UFR des Sciences ECOLE DOCTORALE SCIENCES DU VEGETAL ED 145 UNIVERSITE HASSAN II MOHAMMEDIA - CASABLANCA Thèse de Doctorat Pour obtenir le grade de DOCTEUR EN SCIENCES DE L’UNIVERSITE PARIS-SUD et DOCTEUR DE L’UNIVERSITE HASSAN II MOHAMMEDIA – CASABLANCA Présentée par : M. Mohamed KETTANI HALABI Spécialité : Biologie Sujet de la thèse : Etude de la diversité de Pectobacterium spp et des effets induits par les lipopolysaccharides chez les plantes Thèse présentée et soutenue à Mohammedia le 22 septembre 2012 devant le jury composé de : Michel DRON Professeur d’Enseignement Supérieur Président Directeur de l'IBP – Paris, France Mouncef BENCHEKROUN Professeur d’Enseignement Supérieur Rapporteur Directeur du CED -FST Settat, Maroc Christian MAZARS Directeur de Recherche Rapporteur Université Paul Sabatier -CNRS- Toulouse- France Rajaa Ait MHAND Professeur Habilité Examinateur Université Hassan II Mohammedia, Maroc François BOUTEAU Maître de Conférences Directeur de thèse Université Paris-Diderot 7, Paris, France Moulay Mustapha ENNAJI Professeur d’Enseignement Supérieur Directeur de thèse Université Hassan II Mohammedia, Maroc Etablissements : Faculté des Sciences et Technique Mohammedia Faculté des Sciences d’Orsay CEDocs : Sciences, Techniques, Ingénierie et Développement Durable Sciences du Végétal ED 145 Noms des laboratoires : Laboratoire de Virologie et Hygiène & Microbiologie (LVHM) Laboratoire d’Electrophysiologie des Membranes (LEM) … Thèse de Doctorat Ès Sciences Productions scientifiques PRODUCTIONS SCIENTIFIQUES A. Articles Scientifiques (08) A.1. Articles Scientifiques Internationaux (04) Kettani-Halabi, M.*, Terta, M.*, Ibenyassine, K., Tran, D., Meimoun, P., M'Hand, R.A., El- Maarouf-Bouteau, H., Val, F., Ennaji, M.M., and Bouteau, F. 2010. Arabidopsis thaliana Cells: A Model to Evaluate the Virulence of Pectobacterium carotovorum. Molecular Plant-Microbe Interactions 23:139-143. (* Co-auteur) Baz M., Tran D., Kettani-Halabi M., Samri S.E., Jamjari A., Biligui B., Meimoun P., El- Maarouf-Bouteau H., Garmier M., Saindrenan P., Ennaji M.M., Barakate M., and Bouteau F. 2012. Calcium and ROS mediated defense responses in BY2 tobacco cells by non-pathogenic Streptomyces sp. Journal of Applied Microbiology 112:782-792. Kettani-Halabi M., Tran D, Dauphin A, Errakhi R, Val F, Ennaji MM, Bouteau F. Early common and differential responses of Arabidopsis thaliana cells to lipopolysaccharides from pathogenic and non-pathogenic bacteria (Submitted in Journal of Experimental Botany). Kettani-Halabi M, Terta M, Amdan M, Elfahim M, Bouteau F, Ennaji MM. Sequence analysis of a pmrA gene as a tool to identify Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum in relation to potato diseases (Submitted in BMC Microbiology). A.2 Articles Scientifiques Nationaux (04) Kettani-Halabi M, Amdan M, Terta M, Tran D, Yekkour A, Val F, Ennaji MM, Bouteau F. 2012 Les lipopolysaccharides, biostimulants pour la protection de la pomme de terre contre Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum. Moroccan journal of plant protection 4:131- 140. Terta M., Spirada U., Faouzi A., Melloul, M., El Fafime El., Amdan M., Kettani-Halabi M., Ait M’hand R., Achbani El., Barakate M., Bouteau F., Ennaji MM. 2012. Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis associée à la pourriture molle de la pomme de terre : une première mise en évidence au Maroc. Moroccan journal of plant protection 4:107-118. Amdan M., Ennaji MM., Terta M., Kettani-Halabi M., Faqihi H., Barakat M., Ait Mhand R. L’agressivité de Pectobacterium carotovorum, agent responsable de la pourriture molle de la pomme de terre. Moroccan journal of plant protection 4:97-106. Amdan M., Terta M., Kettani-Halabi M., Achbani El., Ennaji MM. 2012. Pathogénicité de Pectobacterium sp. Agent responsable de la pourriture molle de la pomme de terre. Dans Ennemis de la culture de pomme de terre au Maroc. Edition Dr El Hassan Achbani. Septembre 2011 pp 39-49. M. KETTANI HALABI iii Thèse de Doctorat Ès Sciences Productions scientifiques B. Communications Orales (04) Kettani-Halabi M, Tran D, Amdan M, Terta M, Val F, Ennaji MM, Bouteau F. Implication des Lipopolysaccharides (LPS) dans la stimulation de la défense chez Arabidopsis thaliana. 4ème Journée Scientifique Nationale de l’Environnement et de la Santé « Impact de l’Environnement sur la Santé Public » le 02 Juin 2011 à la FSTM, Maroc ; Kettani-Halabi M, Tran D, Terta M, Amdan M, Val F, Ennaji MM, Bouteau F. Rôle des Lipopolysaccharides (LPS) dans l’induction des mécanismes de défense chez Arabidopsis thaliana, nouvelle approche pour lutter contre le Pectobacterium spp. Congrès International « La Recherche, la Biotechnologie et le Consommateur au service de l’Environnement et de l’Industrie Agroalimentaire" le 19 et 20 Mai 2011 à la Faculté des Sciences de Kénitra, Maroc ; Kettani-Halabi M, Terta M, Ibenyassine K, Tran D, Meimoun P, M’hand RA, El-Maarouf- Bouteau H, Val F, Ennaji MM, Bouteau F. Arabidopsis thaliana cells: a model to evaluate the virulence of Pectobacterium carotovorum. Congrès International MICROBIOD-2009 « Biotechnologie microbienne au service du développement » tenu le 02-05 Novembre 2009 à Marrakech – Maroc ; Ennaji MM, Ait M Hand R, Achabni E, Terta M, Kettani-Halabi M, Baz M, El karkouri A, El Hassouni M, Maaroufi H, Val F, Bouteau F, Barakate M. Caractérisation de la biodiversité de la bactérie macérgéne Erwinia sp. au Maroc. Congrès International MICROBIOD-2009 « Biotechnologie microbienne au service du développement » tenu le 02-05 Novembre 2009 à Marrakech – Maroc. C. Communications Affichées (07) Kettani-Halabi M, Tran D, Terta M, M’hand RA, Val F, Ennaji MM, Bouteau F. Use of Arabidopsis thaliana cells to analyse the pathogenicity of Pectobacterium carotovorum. Congrès de la Société Française de Phytopathologie 2012 du 05 et 8 juin 2012, Paris – France. Yekkour A, Tran D, Kettani-Halabi M, Mathieu F, Briand J, Errakhi R, Lebrihi A, Sabaou N, Bouteau F. effect of Fusarium mycotoxin deoxynivalenol on Nicotiana tabacum cells: signaling events leading to PCD. Congrès de la Société Française de Phytopathologie 2012 du 05 et 8 juin 2012, Paris – France. Kettani-Halabi M, Tran D, Val F, Ennaji MM, Bouteau F. Cell signaling induced by bacterial LPS in Arabidopsis thaliana. The First International Meeting on Ion Channel Signaling Mechanisms: from basic science to clinical application. October 31-November 4, 2011 Marrakesh, Morocco. Kettani-Halabi M, Terta M, Amdan M, M’hand RA, Barakate M, Achbani E, Val F, Bouteau F, Ennaji MM. Virulence et Diversité Génétique du Pouvoir Pathogène des Souches de Pectobacterium carotovorum Isolées des Pommes de Terre Marocaines. Congrès International « La Recherche, la Biotechnologie et le Consommateur au service de l’Environnement et de l’Industrie Agroalimentaire » du 19 et 20 mai 2011 de la Faculté des Sciences de Kénitra, Maroc. Kettani-Halabi M, Tran D, Terta M, Amdan M, Val F, Ennaji MM, Bouteau F. Mechanisms involved in cell signaling in response to various LPS in Arabidopsis thaliana. Congrès International « La Recherche, la Biotechnologie et le Consommateur au service de M. KETTANI HALABI iv Thèse de Doctorat Ès Sciences Productions scientifiques l’Environnement et de l’Industrie Agroalimentaire » du 19 et 20 mai 2011 de la Faculté des Sciences de Kénitra, Maroc. Kettani-Halabi M, Terta M, Amdan M, M’hand RA, Barakate M, Achbani E, Val F, Bouteau F, Ennaji MM. Pectobacterium carotovorum de la Pomme de Terre Marocaine: Nouvelle Nomenclature pour Erwinia carotovora subsp. carotovora, Symptomatologie, Sources et Facteurs de Contamination. 1er Journée de l’Eau sous le thème « Eau et Santé » tenu le 27 Mai 2010 Casablanca, Hôtel Riad Salam, Maroc ; Amdan M, Terta M, Kettani-halabi M, Ait M’hand R, Ennaji MM. Biodiversité de la bactérie Erwinia sp. responsable de la pourriture molle de la pomme de terre au Maroc. 1er Journée de l’Eau sous le thème « Eau et Santé » tenu le 27 Mai 2010 Casablanca, Hôtel Riad Salam, Maroc. D. Publication à Gene Bank (NCBI) de 30 séquences du gène pmrA du Pectobacterium Kettani-Halabi M, Terta M, Amdan M, Melloul M, El Alaoui A, El Fahime E.M, Bouteau F and Ennaji M.M. 2012. Sequence analysis of the gene encoding polymyxin resistance (PmrA) from different strains of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum. PopSet: 383549958 M. KETTANI HALABI v Thèse de Doctorat Ès Sciences Productions scientifiques M. KETTANI HALABI vi Thèse de Doctorat Ès Sciences Formations