Université de la Nouvelle-Calédonie École doctorale du Pacifique ED469 Doctorat Science _Physiologie et biologie des organismes-population-interaction Spécialité : Ecologie et physiologie végétales appliquées Institut Agronomique néo-Calédonien (IAC) Thèse présentée par Yawiya ITITIATY Etude sur la dispersion/germination en lien avec la dynamique des écosystèmes restaurés: le cas du plateau de Goro en Nouvelle-Calédonie Thèse dirigée par Bruno FOGLIANI, et Fabrice BRESCIA (co-encadrant) Thèse soutenue publiquement le 2 mai 2019 Jury composé de : Françoise Corbineau, Professeur, Université de Pierre et Marie Curie 1 Rapporteur Thierry Dutoit, Directeur de recherche au CNRS Rapporteur Eric Vidal, Directeur de recherche, IRD Examinateur Valérie Burtet-Sarramégna, Maître de conférences, UNC Examinateur Stéphane Mc Coy, Responsable du service préservation de Vale NC Examinateur Bruno Fogliani, Chercheur HDR et directeur adjoint de l’IAC Directeur de thèse Fabrice Brescia, Chercheur, IAC Co-encadrant Remerciements I koloini, la thèse est enfin terminée. Merci à tous ceux qui ont participé de près ou de loin à cette belle expérience. Avant tout, j’aimerais remercier Françoise Corbineau et Thierry Dutoit qui ont accepté d’être rapporteurs de cette thèse. Merci également à Eric Vidal, Valérie Burtet-Saramégna et Stephane Mc Coy d’avoir accepté d’examiner ce travail. Au Gouvernement de la Nouvelle-Calédonie, à la fondation Vale NC et à l’Institut Agronomique néo-Calédonien, merci pour leur soutien financier. J’aimerais ensuite remercier Bruno Fogliani mon directeur de thèse et Fabrice Brescia mon encadrant pour leur confiance, leur soutien, leurs conseils et leur encadrement durant ces années de thèse. Merci de m’avoir donné les moyens de concrétiser ce projet. Merci également pour votre accompagnement dans la rédaction de ce manuscrit de thèse. Je n’ai pas les mots pour exprimer ma gratitude à part un simple « Olé boarii » merci beaucoup! La prochaine pensée va ensuite à mama (grand frère) Charly Zongo. Merci de m’avoir encouragé fortement à suivre la même voie que toi et de m’avoir lancé dans cette aventure qui fut une belle expérience. Ce n’est sans quelques larmes de reconnaissance que je rédige ces remerciements. Ces années de travail ont été une superbe aventure grâce à toute l’équipe Ecorce (à temps plein ou de passage) : Bruno, Marie (notre grande dame), Charly, Casi, Romain, Guigui, Louis Charles, Marie Dubreuil, Sylvie, Peter, Lho, Simon, Gigi, Marie De Gail et sans oublier la fille de Pouebo (Jo), Cedric, Eugénie et Malik. Merci à tous pour vos encouragements, le partage de connaissances (scientifiques et de culture générale), pour les sourires, les fous rires et surtout les moments de partage autour d’une bonne salade tahitienne et d’un gâteau au chocolat. Merci beaucoup la bande! Merci à L’ho, Peter et Simon pour les longues discussions et leurs conseils en statistiques; et merci à Peter et Marie pour les Illustrations. Merci à Casi pour son aide sur le terrain et pour l’identification d’espèces adultes ou des plantules. Merci à Jean Paul, René et Alexandre pour les quelques virées de terrain qui furent mémorables et pour m’avoir aidé dans le rempotage des plants. Merci aux stagiaires: Pierre, Océane, Marie, Esmeralda, Jo et Brandon. Qu’ils aient effectué une semaine, un mois, trois mois ou six mois avec moi, leur contribution fut d’une grande aide dans l’aboutissement de ce projet. Merci également de m’avoir permis de partager avec vous les connaissances acquises tout au long de ce parcours. Merci à toute l’équipe de la Pépinière de Vale NC pour leur accueil chaleureux (le café et les biscuits), pour leur enthousiasme, leur encouragement et leur joie de vivre. A Stéphane Mc Coy (notre papa de la pépinière) merci beaucoup pour le partage de connaissances (l’accès à la liste des taxons de la flore de la zone), pour m’avoir donné l’accès à l’herbier et à la photothèque de Vale NC et pour m’avoir aidé dans la détermination des espèces inconnues lors de l’inventaire. Merci à Jacqueline pour sa disponibilité, son accueil chaleureux et son sourire à l’herbier de Nouméa. Merci à Ruth Bone du Kew Botanical Garden, d’avoir soumis nos données au modèle de Wyse & Dickie (2017) et à toute l’équipe du Millenium Seed Bank pour l’invitation et la prise en charge des deux semaines de formation passées avec eux. Merci à Clément Paita et à Clothilde Tindao pour avoir veillé sur moi durant mes années de travail à Paita. Merci à grand mère Wamè et à mes grands-pères : Itopupu, Sinaw Coti et Kwidjo grâce à qui je me permets de travailler à Goro librement comme si j’y étais comme chez moi. Merci aux esprits de la terre du plateau de Goro de nous avoir permis de fouler leur terre et d’avoir veillé sur nous. Je tenais également à remercie moumwa (grande sœur) Sya d’avoir partagé sa passion pour les plantes et son charisme avec moi. Merci à moumwa Bwa d’être toujours là pour m’écouter, m’encourager et me remettre sur les rails quand je divague. Merci à l’association Gnâ gnii (fleur du Soleil) au bureau, aux membres et surtout aux enfants, pour l’aide et le soutien durant ces années. A mes trésors : Sinaw, les 2 Katché, Jean Marie, Kynaël, Tchako, Kwiè, Cetré, Tchoti, Kendrick, Jayanna, Eugenie, Djakou, Jemima, Saito, Tonya, Maybel, Wanakami et Wadangari pour leur innocence et leur joie de vivre qui me donnent le courage d’avancer. A mes frères, sœurs, cousins, cousines, bien trop nombreux pour être cités, pour leur présence et leurs petits mots d’encouragement tout au long de cette aventure. A ma grand-mère Viviane pour ses encouragements et pour toutes ses prières du matin. Merci à mon petit frère Amédée pour être venu à chaque fois réparer ma vieille Xsara et faire qu’elle puisse tenir jusqu’au bout de la thèse. Enfin à ma mère, Sarah sans qui rien de tout ce parcours ne serait possible, merci pour ta confiance, et surtout merci de m’avoir donné des racines (par ton amour) et des ailes (en m’apprenant à rêver). Merci de m’avoir écouté, encouragé, soutenu, tout au long du chemin. Merci d’être mon modèle de force et de courage chaque jour. A ma mère et à mes trésors…. AVERTISSEMENT Le contenu de cette thèse est bilingue. L’introduction générale, les chapitres 1, 3 et 4 ainsi que la synthèse et les recommandations sont rédigés en français. Le chapitre 2 présente un article scientifique rédigé en anglais. FOREWORD The content of this thesis is bilingual. The main introduction, the chapters 1, 3 and 4 and the chapter synthesis and recommendations are written in French. The chapter 2 presents one scientific article written in English and the abstract in French. TABLE DES MATIERES Introduction générale .........................................................................................................................1 Chapitre 1: Synthèse des connaissances sur le concept de restauration écologique et déclinaison en Nouvelle-Calédonie.............................................................................................................................7 1. Restaurer les milieux dégradés ....................................................................................................8 1.1. Problématique de la restauration des milieux dégradés ........................................................8 1.2. La restauration écologique ...................................................................................................9 1.2.1. Définition.......................................................................................................................9 1.2.2. Restauration passive .................................................................................................... 10 1.2.3. Restauration active ...................................................................................................... 11 v La plantation .............................................................................................................. 11 v L'ensemencement ...................................................................................................... 11 v L'utilisation du topsoil ................................................................................................ 12 1.3. Dispositif de restauration d'un milieu dégradé par l'activité minière ................................... 14 2. Restaurer les continuités écologiques pour favoriser la restauration des milieux dégradés ........ 18 2.1. Problématique de fragmentation des milieux: la disparition des connectivités ................... 18 2.2. Restaurer les continuités écologiques ................................................................................. 20 2.3. La dispersion des fruits/graines au sein des connectivités ................................................... 22 2.3.1. Les différents modes de dispersion des fruits/graines .................................................. 23 v L'anémochorie ........................................................................................................... 23 v La zoochorie .............................................................................................................. 23 v Hydrochorie, Autochorie et Barochorie: ..................................................................... 25 2.3.2. Les intérêts biologiques de la dispersion ...................................................................... 25 2.4. Maitrise de la tolérance à la dessiccation des graines et leur germination pour la restauration des milieux dégradés ...........................................................................................