Actividad formadora de canales transm embrana en la superficie de Gordonia jacobaea Mª Guadalupe Jiménez Galisteo ADVERTIMENT . La consulta d’aquesta tesi queda condicionada a l’acceptació de les següents condicions d'ús: La difusió d’aquesta tesi per mitjà del servei TDX ( www.tdx.cat ) i a través del Dipòsit Digital de la UB ( diposit.ub.edu ) ha estat autoritzada pels titulars dels drets de propietat intel·lectual únicament per a usos privats emmarcats en activitats d’investigació i docència. No s’autoritza la seva reproducció amb finalitats de lucre ni la seva difusió i posada a disposici ó des d’un lloc aliè al servei TDX ni al Dipòsit Digital de la UB . No s’autoritza la presentació del seu contingut en un a finestra o marc aliè a TDX o al Dipòsit Digital de la UB (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant al resum de presentació de la tesi com als seus continguts. En la utilització o cita de parts de la tesi és obligat indicar el nom de la persona auto ra. ADVERTENCIA . 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TESIS DOCTORAL Actividad formadora de canales transmembrana en la superficie de Gordonia jacobaea Programa de Doctorado de Biomedicina Autor: Mª Guadalupe Jiménez Galisteo Directores: Miguel Viñas Ciordia y Teresa Vinuesa Aumedes Barcelona, Julio 2015 Unidad de Microbiología DEPARTAMENTO DE PATOLOGÍA Y TERAPÉUTICA EXPERIMENTAL Facultad de Medicina UNIVERSIDAD DE BARCELONA Actividad formadora de canales transmembrana en la superficie de Gordonia jacobaea Programa de Doctorado de Biomedicina Autor: Mª Guadalupe Jiménez Galisteo Directores: Miguel Viñas Ciordia y Teresa Vinuesa Aumedes Barcelona, Julio de 2015 “Aprende como si fueras a vivir toda la vida, y vive como si fueras a morir mañana”. Charles Chaplin "La ciencia se construye a partir de aproximaciones que gradualmente se acercan a la verdad". (Anochecer) Isaac Asimov “Nunca se es demasiado mayor para aprender más de lo que se sabe y llegar a ser capaz de hacer más de lo que ya se puede”. (Los límites de la fundación) Isaac Asimov A mi familia y seres queridos AGRADECIMIENTOS En palabras de Louis Pasteur "La suerte favorece sólo a la mente preparada”. Ante esta afirmación me gustaría añadir que muchas veces la mente no es algo individual, y que un grupo de personas puede trabajar y unir sus mentes para lograr un objetivo. Por ese motivo me gustaría agradecer a todas esas mentes, que durante estos años de trabajo han estado a mi lado, y que con sus ánimos, con sus gestos, con sus consejos, me han ayudado a lograr este objetivo. En primer lugar, agradezco enormemente al profesor Miguel Viñas, director y tutor de esta tesis, y al Profesor Ángel Domínguez de la Universidad de Salamanca, que bien podría figurar como codirector, su dirección, sus ideas, su inestimable apoyo y ayuda, y por supuesto su trabajo de ”becarios” en la anotación del genoma. Ellos me han demostrado que a pesar de ser dos veteranos de mente brillante, muestran el mismo entusiasmo por la ciencia que cuando empezaron, y para mí son un ejemplo a seguir. Sin su ayuda y su apoyo, este proyecto no habría visto la luz. A la Dra. Teresa Vinuesa le agradezco toda su ayuda como codirectora de esta tesis, junto con su confianza, afecto y preocupación tanto a nivel profesional como personal. Al Dr. Tomás G. Villa, a la Dra. Trinidad de Miguel y a la Dra. Patricia Veiga, les agradezco que me presentasen y me permitiesen trabajar con la minúscula Gordonia jacobaea, este microorganismo ha ocupado gran parte de mis pensamientos durante estos años, y si no hubiese sido por ellos, jamás habría tenido el gusto de conocerla. Al Dr. Benz y a Elker Maier de la Universidad de Bremen (Alemania), y a la Dra. Elisa Muñoz de la Universidad de Salamanca, en la distancia su ayuda y apoyo han sido todo un regalo. Infinitas gracias a todos los compañeros con los que he tenido el placer de trabajar en este laboratorio, me gustaría agradecerles su apoyo incondicional y cada minuto que hemos podido compartir. En su compañía el trabajo ha sido ligero, enriquecedor y hasta divertido. Especialmente me gustaría agradecer a Lidia “pequeña” y a Ester por ser mis compañeras eternas, con vosotras he pasado algunos de los momentos más difíciles de mi vida y también algunos de los más gratificantes, y siempre, siempre, habéis estado ahí para apoyarme y regalarme vuestra ayuda. Desde el primer día en que os conocí, hace ya mucho, mucho tiempo, habéis sido una fuente de alegría y bienestar para mí. Sois estupendas. A Álex, Blanca, Rocío, Eulalia, Héctor, con vosotros la ciencia es otra cosa, muchas gracias por estar ahí y haberme ayudado con vuestro ánimo y apoyo. Por supuesto, gracias a Eva, quien siempre ha estado dispuesta a echarme una mano. También quiero recordar y agradecer a aquellos que, aunque ya no están en nuestro laboratorio, han formado parte de la historia de esta tesis. Lidia “grande” y César, que me recibieron cuando entré en este intrigante mundo de la microbiología, a Jana, Cate, Indira, Iraida, Erica y Marina, aunque compartimos poco tiempo juntas, ha sido un placer coincidir con vosotras. Y por supuesto, a Toni, Carolina y Elena. A Rosaura, Isabel G. e Isabel E., muchas gracias por vuestra colaboración, ayuda y paciencia. Siempre que he recurrido a vosotras he sentido vuestro apoyo y cariño. No puedo olvidarme de mi familia, que han compartido conmigo este viaje como copilotos eficaces. Gracias a mis padres, Juan Manuel y Lupe, sus gestos y enseñanzas vitales me han hecho como soy colocando la primera piedra de mi ser. A mi hermano Carlos (Juancar), ¿qué puedo decir?, siempre has estado ahí hermanito y tu cariño y privilegiado cerebro ha sido uno de mis mejores apoyos. A Juan, mi otra mitad, gracias por tu amor y tu apoyo incondicional, gracias por haberme insuflado la energía y la motivación para no hundirme ante los baches del camino y luchar por lograr mis objetivos en la vida. Tú siendo como eres, me has dado el empujón que necesitaba. Sé que me dejo a muchas personas que han estado ahí y que de distintas formas me han ayudado con una frase reflexiva o con unas palabras amables, a Mariona, Tareixa, Sonia, Joseta, Isabel, Cristina, Laura, Anna, José, Encarna... cada una de ellas, a su modo, han puesto su pequeño granito de arena. Muchas gracias. Y por último quiero recordar a quienes ya no están: mi tito Epi, mi tito Paco, mi “muma” Antonia, y a todos los seres queridos, que se que se habrían sentido muy orgullosos de este trabajo. ……. Índic e ÍNDICE Índice Índice SÍMBOLOS Y ABREVIATURAS ................................................................... VII 1. INTRODUCCIÓN ....................................................................................... 1 1.1. Género Gordonia ....................................................................................... 1 1.1.1. Generalidades ........................................................................................ 1 1.1.2. Descripción. Propiedades morfológicas y quimiotaxonómicas ...... 2 1.1.3. Hábitat .................................................................................................... 3 1.1.4. Taxonomía.............................................................................................. 4 1.1.4.1. Taxonomía genética del género Gordonia ........................................ 6 1.1.5. Interés industrial del género Gordonia ................................................ 8 1.1.5.1 Propiedades anabólicas ...................................................................... 8 1.1.5.1.1 Biosurfactantes ................................................................................. 8 1.1.5.1.2. Carotenoides .................................................................................... 9 1.1.5.1.3. Acido 1 y 2 imidazol amino ........................................................... 10 1.1.5.1.4. Gordonano ......................................................................................