MÁRCIO LORENCINI AVALIAÇÃO GLOBAL DE TRANSCRITOS ASSOCIADOS AO ENVELHECIMENTO DA EPIDERME HUMANA UTILIZANDO MICROARRANJOS DE DNA GLOBAL EVALUATION OF TRANSCRIPTS ASSOCIATED TO HUMAN EPIDERMAL AGING WITH DNA MICROARRAYS CAMPINAS 2014 i ii UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS Instituto de Biologia MÁRCIO LORENCINI AVALIAÇÃO GLOBAL DE TRANSCRITOS ASSOCIADOS AO ENVELHECIMENTO DA EPIDERME HUMANA UTILIZANDO MICROARRANJOS DE DNA GLOBAL EVALUATION OF TRANSCRIPTS ASSOCIATED TO HUMAN EPIDERMAL AGING WITH DNA MICROARRAYS Tese apresentada ao Instituto de Biologia da Universidade Estadual de Campinas como parte dos requisitos exigidos para a obtenção do título de Doutor em Genética e Biologia Molecular, na área de Genética Animal e Evolução. Thesis presented to the Institute of Biology of the University of Campinas in partial fulfillment of the requirements for the degree of Doctor in Genetics and Molecular Biology, in the area of Animal Genetics and Evolution. Orientador/Supervisor: PROF. DR. NILSON IVO TONIN ZANCHIN ESTE EXEMPLAR CORRESPONDE À VERSÃO FINAL DA TESE DEFENDIDA PELO ALUNO MÁRCIO LORENCINI, E ORIENTADA PELO PROF. DR. NILSON IVO TONIN ZANCHIN. ________________________________________ Prof. Dr. Nilson Ivo Tonin Zanchin CAMPINAS 2014 iii iv COMISSÃO JULGADORA 31 de janeiro de 2014 Membros titulares: Prof. Dr. Nilson Ivo Tonin Zanchin (Orientador) __________________________ Assinatura Prof. Dr. José Andrés Yunes __________________________ Assinatura Profa. Dra. Maricilda Palandi de Mello __________________________ Assinatura Profa. Dra. Bettina Malnic __________________________ Assinatura Profa. Dra. Ana Paula Ulian Araújo __________________________ Assinatura Membros suplentes: Profa. Dra. Edi Lúcia Sartorato __________________________ Assinatura Profa. Dra. Cristina Pontes Vicente __________________________ Assinatura Profa. Dra. Daniela Sanchez Bassères __________________________ Assinatura v vi RESUMO Com o aumento do tempo de vida da população humana muitas modalidades médicas, incluindo a dermatologia, deparam-se com uma revolução na forma de garantir saúde e qualidade de vida aos pacientes. Em contato com o ambiente externo, a pele representa um órgão no qual as mudanças com o envelhecimento causam danos funcionais, além de potencial impacto estético e psicossocial. A epiderme, camada mais externa da pele, constitui uma barreira seletiva com destacada capacidade de renovação e manutenção da homeostasia corporal. Entretanto, o entendimento de diversos mecanismos associados à fisiologia e envelhecimento da epiderme permanece como desafio para a comunidade científica. Com base nesse cenário, o objetivo do presente trabalho foi compreender o atual estado da arte no tema de envelhecimento da epiderme e realizar experimentos voltados para lacunas existentes, com foco na integração de aspectos clínicos, fisiológicos, morfológicos, celulares e moleculares. O capítulo de abertura descreve uma avaliação global de transcritos associados ao envelhecimento da epiderme humana, com a técnica de microarranjos de DNA e coleta não invasiva com fitas adesivas. O estudo indica características moleculares específicas do fotoenvelhecimento epidermal, com alterações relevantes e complementares a dados clínicos e morfológicos prévios, como modulação das vias de organização do citoesqueleto de actina e sinalização de cálcio, expressão gênica alterada de proteínas do envelope córneo, e avaliação de um painel segmentado por décadas de vida que sugere aspectos inéditos de regulação homeostática da epiderme, além de genes com modulação contínua ao longo das idades. O segundo capítulo compara o envelhecimento nas regiões folicular e interfolicular da epiderme. Como um sistema biológico de simples obtenção e fácil manuseio, os bulbos dos folículos pilosos representam uma fonte rica de material epidermal distinto, conforme evidencias na ampla modulação gênica diferenciada. O terceiro capítulo inclui uma avaliação in vitro do envelhecimento da epiderme, com queratinócitos de indivíduos de diferentes idades cultivados em monocamada e no modelo de pele equivalente. Os vii resultados evidenciam diferenças na expressão de marcadores moleculares de proliferação e diferenciação entre queratinócitos neonatais e adultos, mas não entre adultos de diferentes idades. Não houve diferença nas populações de células tronco, entretanto, observou-se aumento de células na fase proliferativa do ciclo celular em neonatos, assim como predominância de células na fase estacionária do ciclo celular em adultos mais velhos. Concluindo, os resultados obtidos no presente trabalho contribuem de forma significativa para o avanço do entendimento dos mecanismos moleculares afetados pelo avanço da idade da epiderme, possilitando a busca de novas alternativas no tratamento do envelhecimento cutâneo. viii ABSTRACT With the increase in lifetime of the human population many medical disciplines, including dermatology, are facing a revolution in the approaches to ensure healthcare and quality of life for patients. In contact with the external environment, the skin is an organ in which the changes of aging cause functional damage, in addition to potential aesthetic and psychosocial impact. Epidermis, the outermost skin layer, is a selective barrier with outstanding capacity for renewal and maintenance of the body homeostasis. However, the understanding of several mechanisms associated with skin physiology and aging remains a challenge for the scientific community. Considering this scenario, the objective of this work was to evaluate the state of the art knowledge on epidermal aging and to conduct experimental approaches to cover gaps that still exist on that theme, focusing on the integration of clinical, physiological, morphological, cellular and molecular aspects of epidermis aging. The opening chapter describes a study based on global transcriptional evaluation associated with aging of the human epidermis, using DNA microarrays and noninvasive tape stripping. This study reveals molecular characteristics specific of epidermal photoaging, with relevant findings complementary to previous clinical and morphological data, such as modulation of the actin cytoskeleton and calcium signaling pathways; altered gene expression of proteins of the cornified envelope; and evaluation of a segmented panel structured by decades of life, which suggests new aspects of homeostatic regulation in the epidermis and unvails genes with continuous modulation throughout different ages. The second chapter compares the gene expression patterns of the follicular and interfollicular regions of epidermis undergoing aging. As a biological system easily sampled and handled, the bulbs of plucked hair follicles represent a rich source of distinct epidermal material, as evidenced by the wide differential gene modulation that was detected. The third chapter includes an experimental in vitro evaluation of skin aging using keratinocytes isolated from individuals of different ages and cultured in monolayer and in skin equivalent models. Differences in the expression of proliferation and differentiation molecular markers between neonatal and adult ix keratinocytes were observed. No differences were found regarding the stem cell populations, however, neonates showed an increased percentage of cells in the proliferative phase of cell cycle, while older adults presented a predominance of cells in the stationary phase of cell cycle. The results herein presented provide novel insights on the molecular mechanisms affected by epidermal aging, enabling the search of new alternatives in the treatment of aging skin. x SUMÁRIO RESUMO ……………...……………………………………………….…………… vii ABSTRACT ………………………………………………………………………… ix AGRADECIMENTOS ……………………………………………………………… xv 1. INTRODUÇÃO ………………………………………………………………….. 1 1.1. Conceituação do envelhecimento humano …………...………… 1 1.2. Envelhecimento populacional ………………….…...……………. 2 1.3. Dermatologia e o envelhecimento cutâneo................................. 4 1.4. Funções, estrutura e tipos de pele ............................................. 5 1.5. Mudanças cutâneas com o envelhecimento .............................. 11 1.6. Mudanças funcionais e moleculares da epiderme com o envelhecimento .......................................................................... 13 1.7. Evolução contínua em biologia molecular impacta na dermatologia .............................................................................. 16 1.8. Justificativa e estrutura do trabalho ........................................... 17 2. OBJETIVOS .............................................................................................. 21 2.1. Objetivo geral ............................................................................. 21 2.2. Objetivos específicos ................................................................. 21 3. EXPERIMENTOS E RESULTADOS ......................................................... 23 3.1. Capítulo I (Artigo experimental I) ............................................... 23 3.2. Capítulo II (Artigo experimental II) ............................................. 89 3.3. Capítulo III (Artigo experimental III) ........................................... 123 4. DISCUSSÃO GERAL ................................................................................ 145 5. CONCLUSÕES ......................................................................................... 151 6. REFERÊNCIAS ......................................................................................... 153 7. ANEXOS ..................................................................................................