ΒΙΟΠΟΛΙΣ, 41500 Λάρισα Τηλ. 2410685701-2 Fax. 2410685546 www.med.uth.gr [email protected] Τυποποίηση στελεχών Legionella pneumophila από περιβαλλοντικά δείγματα και συρροές κρουσμάτων με Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry (MALDI- TOF MS) Μαρία Αποστόλου Κυρίτση Ιατρός Μικροβιολόγος-Βιοπαθολόγος MSc στη Μοριακή Ιατρική Υπεβλήθη για την εκπλήρωση μέρους των απαιτήσεων για την απόκτηση του Διδακτορικού διπλώματος Λάρισα, Νοέμβριος 2019 Τυποποίηση στελεχών Legionella pneumophila από περιβαλλοντικά δείγματα και συρροές κρουσμάτων με Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time-of- Σελίδα 1 Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) Institutional Repository - Library & Information Centre - University of Thessaly 08/10/2021 07:30:09 EEST - 170.106.203.34 Στους γονείς μου, Απόστολο και Ευθυμία Στο σύζυγό μου, Θανάση Στα παιδιά μου, Γιάννη και Απόστολο ©2019 Μαρία Κυρίτση Τυποποίηση στελεχών Legionella pneumophila από περιβαλλοντικά δείγματα και συρροές κρουσμάτων με Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time-of- Σελίδα 2 Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) Institutional Repository - Library & Information Centre - University of Thessaly 08/10/2021 07:30:09 EEST - 170.106.203.34 Η διδακτορική διατριβή υλοποιήθηκε στα πλαίσια του Επιχειρησιακού Προγράμματος «Ανάπτυξη ανθρώπινου δυναμικού, εκπαίδευση και δια βίου μάθηση» με τη συγχρηματοδότηση του Ευρωπαϊκού Κοινωνικού Ταμείου (ΕΚΤ) με τίτλο «Υποστήριξη ερευνητών με έμφαση στους νέους ερευνητές» Τυποποίηση στελεχών Legionella pneumophila από περιβαλλοντικά δείγματα και συρροές κρουσμάτων με Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time-of- Σελίδα 3 Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) Institutional Repository - Library & Information Centre - University of Thessaly 08/10/2021 07:30:09 EEST - 170.106.203.34 Η έγκριση της διδακτορικής διατριβής από το Τμήμα Ιατρικής της Σχολής Επιστημών Υγείας του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας δεν υποδηλώνει αποδοχή των απόψεων του συγγραφέα (σύμφωνα με τις διατάξεις του άρθρου 202, παράγραφος 2, του Ν. 5343/1932). Τυποποίηση στελεχών Legionella pneumophila από περιβαλλοντικά δείγματα και συρροές κρουσμάτων με Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time-of- Σελίδα 4 Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) Institutional Repository - Library & Information Centre - University of Thessaly 08/10/2021 07:30:09 EEST - 170.106.203.34 Εγκρίθηκε από τα μέλη της επταμελούς εξεταστικής επιτροπής (1η 18.09.2019 Γενική Συνέλευση Τμήματος Ιατρικής του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας) 1ος Εξεταστής Δρ. Χρήστος Χατζηχριστοδούλου (Επιβλέπων) Καθηγητής, Τμήμα Ιατρικής, Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας 2ος Εξεταστής Δρ. Σπυρίδων Πουρνάρας Καθηγητής, Ιατρική Σχολή, Εθνικό Μετσόβειο Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών 3ος Εξεταστής Δρ. Ανδρέας Τσακάλωφ Αναπληρωτής Καθηγητής, Τμήμα Ιατρικής, Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας 4ος Εξεταστής Δρ. Ευθυμία Πετεινάκη Καθηγήτρια, Τμήμα Ιατρικής, Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας 5ος Εξεταστής Δρ. Ματθαίος Σπελέτας Καθηγητής, Τμήμα Ιατρικής, Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας 6ος Εξεταστής Δρ. Γεώργιος Ραχιώτης Αναπληρωτής Καθηγητής, Τμήμα Ιατρικής, Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας 7ος Εξεταστής Δρ. Κωνσταντίνος Παπαγιαννίτσης Επίκουρος Καθηγητής, Τμήμα Ιατρικής, Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας Τυποποίηση στελεχών Legionella pneumophila από περιβαλλοντικά δείγματα και συρροές κρουσμάτων με Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time-of- Σελίδα 5 Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) Institutional Repository - Library & Information Centre - University of Thessaly 08/10/2021 07:30:09 EEST - 170.106.203.34 ΕΥΧΑΡΙΣΤΙΕΣ Αισθάνομαι την ανάγκη να εκφράσω τις ευχαριστίες μου σε όλους όσοι συνέβαλαν στην πραγματοποίηση της παρούσας διδακτορικής διατριβής. Ευχαριστώ θερμά το Διευθυντή του Εργαστηρίου Υγιεινής & Επιδημιολογίας του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας, και επιβλέποντα της διατριβής, καθηγητή κ. Χρήστο Χατζηχριστοδούλου για την πολύτιμη βοήθειά του, τη συνεχή επιστημονική καθοδήγηση και τη συμπαράσταση μέχρι το τέλος του πονήματος. Θα ήθελα να εκφράσω τη βαθιά ευγνωμοσύνη μου στο πρόσωπό του όχι μόνο για την ευκαιρία που μου έδωσε να εκπονήσω την παρούσα διατριβή, αλλά και για τη συνολική του συμβολή στην εκπαίδευσή μου στο πεδίο της Δημόσιας Υγείας και Επιδημιολογίας, από τη λήξη της ειδικότητάς μου μέχρι και σήμερα. Ιδιαίτερες ευχαριστίες στα μέλη της τριμελούς συμβουλευτικής επιτροπής: στον καθηγητή Κλινικής Μικροβιολογίας κ. Σπυρίδωνα Πουρνάρα για τη βοήθεια και την αμέριστη συμπαράστασή του, καθώς και στον αναπληρωτή καθηγητή Κλινικής Χημείας κ. Ανδρέα Τσακάλωφ που με την άριστη επιστημονική του κατάρτιση στον τομέα της φασματομετρίας μαζών συνέβαλε στην επιτυχή ολοκλήρωση της μελέτης. Ευχαριστώ θερμά τα μέλη της επταμελούς εξεταστικής επιτροπής καθηγήτρια κα Ευθυμία Πετεινάκη, καθηγητή κ. Ματθαίο Σπελέτα, αναπληρωτή καθηγητή κ. Γεώργιο Ραχιώτη και επίκουρο καθηγητή κ. Κωνσταντίνο Παπαγιαννίτση για τις σημαντικές υποδείξεις τους, οι οποίες βελτίωσαν την τελική εικόνα του πονήματος. Θα ήταν παράλειψή μου να μην ευχαριστήσω την Δρ. Ιουλιάννα Κρίστο, Βιοχημικό, για την πολύτιμη βοήθειά της και την άψογη συνεργασία καθ’ όλη τη διάρκεια της διατριβής καθώς και την κα Φωτεινή Κολοκυθοπούλου, Βιολόγο, για την έμπρακτη βοήθειά της. Κλείνοντας, ευχαριστώ θερμά όλο το προσωπικό του Εργαστηρίου Υγιεινής & Επιδημιολογίας του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας για την βοήθεια, ανοχή και στήριξή τους όλο το διάστημα της εκπόνησης της διδακτορικής διατριβής. Μαρία Κυρίτση Τυποποίηση στελεχών Legionella pneumophila από περιβαλλοντικά δείγματα και συρροές κρουσμάτων με Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time-of- Σελίδα 6 Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) Institutional Repository - Library & Information Centre - University of Thessaly 08/10/2021 07:30:09 EEST - 170.106.203.34 ΣΥΝΤΟΜΟ ΒΙΟΓΡΑΦΙΚΟ ΣΗΜΕΙΩΜΑ Μαρία Αποστόλου Κυρίτση, Βιοπαθολόγος, M.D., M. Sc. E-mail: [email protected] και [email protected] ΠΑΡΟΥΣΑ ΘΕΣΗ ΕΡΓΑΣΙΑΣ Τεχνική Υπεύθυνη του Μικροβιολογικού Τμήματος και του Τμήματος Μοριακής Επιδημιολογίας του Εργαστηρίου Υγιεινής & Επιδημιολογίας του Τμήματος Ιατρικής, του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας. Τεχνική Υπεύθυνη του Μικροβιολογικού Τμήματος και του Τμήματος Μοριακής Επιδημιολογίας του Περιφερειακού Εργαστηρίου Δημόσιας Υγείας (ΠΕΔΥ) Θεσσαλίας. ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΑ ΕΝΔΙΑΦΕΡΟΝΤΑ Τυποποίηση μικροοργανισμών με φασματομετρία μαζών. Πρωτεομική Μικροβίωμα (περιβαλλοντικών και κλινικών δειγμάτων) ΣΠΟΥΔΕΣ-ΕΚΠΑΙΔΕΥΣΗ 1997-2003: Τμήμα Ιατρικής, Σχολή Επιστημών Υγείας, Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας: Πτυχίο Ιατρικής 2005-2007: Τμήμα Ιατρικής, Σχολή Επιστημών Υγείας, Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας: Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα Σπουδών «Κλινικές Εφαρμογές της Μοριακής Ιατρικής» 2006-2011: Πανεπιστημιακό Γενικό Νοσοκομείο Λάρισας, Εργαστήριο Μικροβιολογίας & Βιοπαθολογίας: Ειδικότητα Ιατρικής Βιοπαθολογίας 2011: Απόκτηση ειδικότητας Ιατρικής Βιοπαθολογίας 2016: Τμήμα Ιατρικής, Σχολή Επιστημών Υγείας, Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας, Εργαστήριο Υγιεινής & Επιδημιολογίας: Υποψήφια διδάκτορας με θέμα: «Τυποποίηση στελεχών Legionella pneumophila από περιβαλλοντικά δείγματα και συρροές κρουσμάτων με Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS)», Επιβλέπων: Χρήστος Χατζηχριστοδούλου, καθηγητής Υγιεινής & Επιδημιολογίας Τυποποίηση στελεχών Legionella pneumophila από περιβαλλοντικά δείγματα και συρροές κρουσμάτων με Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time-of- Σελίδα 7 Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) Institutional Repository - Library & Information Centre - University of Thessaly 08/10/2021 07:30:09 EEST - 170.106.203.34 ΕΠΑΓΓΕΛΜΑΤΙΚΗ ΕΜΠΕΙΡΙΑ 2011-2016: Μικροβιολόγος στο Μικροβιολογικό Τμήμα του Εργαστηρίου Υγιεινής & Επιδημιολογίας του Τμήματος Ιατρικής, του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας. Μικροβιολόγος στο Μικροβιολογικό Τμήμα του Περιφερειακού Εργαστηρίου Δημόσιας Υγείας (ΠΕΔΥ) Θεσσαλίας. 2014-σήμερα: Τεχνική Υπεύθυνη του Τμήματος Μοριακής Επιδημιολογίας του Εργαστηρίου Υγιεινής & Επιδημιολογίας του Τμήματος Ιατρικής, του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας. Τεχνική Υπεύθυνη του Τμήματος Μοριακής Επιδημιολογίας του Περιφερειακού Εργαστηρίου Δημόσιας Υγείας (ΠΕΔΥ) Θεσσαλίας. 2016-σήμερα: Τεχνική Υπεύθυνη του Μικροβιολογικού Τμήματος του Εργαστηρίου Υγιεινής & Επιδημιολογίας του Τμήματος Ιατρικής, του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας. Τεχνική Υπεύθυνη του Μικροβιολογικού Τμήματος του Περιφερειακού Εργαστηρίου Δημόσιας Υγείας (ΠΕΔΥ) Θεσσαλίας. ΜΕΛΟΣ ΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΩΝ ΕΤΑΙΡΕΙΩΝ Μέλος της Ελληνικής Μικροβιολογικής Εταιρείας (από το 2006) Μέλος της Ευρωπαϊκής Εταιρείας Κλινικής Μικροβιολογίας και Λοιμωδών Νοσημάτων (European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases- ESCMID) (από το 2008) Μέλος της SHIPSAN Association (από το 2018) Μέλος της Εταιρείας Δημόσιας Υγείας και Περιβαλλοντικής Υγιεινής (ΕΔΥΠΥ) Μέλος της ESCMID ομάδας μελέτης για τις λοιμώξεις από Legionella (ESCMID Study Group for Legionella Infections-ESGLI) (από το Μάρτιο του 2019) ΔΗΜΟΣΙΕΥΣΕΙΣ ΣΕ ΔΙΕΘΝΗ ΠΕΡΙΟΔΙΚΑ: 12 ΑΝΑΚΟΙΝΩΣΕΙΣ ΣΕ ΕΛΛΗΝΙΚΑ ΣΥΝΕΔΡΙΑ: 9 ΑΝΑΚΟΙΝΩΣΕΙΣ ΣΕ ΔΙΕΘΝΗ ΣΥΝΕΔΡΙΑ: 3 ΠΡΟΣΚΕΚΛΗΜΕΝΗ ΟΜΙΛΗΤΡΙΑ ΣΕ ΕΛΛΗΝΙΚΑ ΣΥΝΕΔΡΙΑ/ΗΜΕΡΙΔΕΣ: 4 Τυποποίηση στελεχών Legionella pneumophila από περιβαλλοντικά δείγματα και συρροές κρουσμάτων με Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time-of- Σελίδα 8 Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) Institutional Repository - Library & Information Centre - University of Thessaly 08/10/2021 07:30:09 EEST - 170.106.203.34 ΧΟΡΗΓΙΕΣ-ΥΠΟΤΡΟΦΙΕΣ Ειδικό Πρόγραμμα Ελέγχου για τον Ιό του Δυτικού Νείλου και την Ελονοσία, Ενίσχυση της Επιτήρησης στην Ελληνική Επικράτεια (01/01/2012-31/12/2013). Υπουργείο Υγείας & Κοινωνικής Αλληλεγγύης, Συγχρηματοδότηση