UNIVERSIDADE FEDERAL DE SANTA CATARINA CENTRO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA CELULAR, EMBRIOLOGIA E GENÉTICA CURSO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS Jéssica Imperico Maciel REVISÃO BIBLIOGRÁFICA DE ESPÉCIES DE PEIXES IDENTIFICADAS COM O AUXÍLIO DO GENE COI NAS AMÉRICAS Florianópolis 2021 Jéssica Imperico Maciel REVISÃO BIBLIOGRÁFICA DE ESPÉCIES DE PEIXES IDENTIFICADAS COM O AUXÍLIO DO GENE COI NAS AMÉRICAS Trabalho Conclusão do Curso de Graduação em Ciências Biológicas do Centro de Ciências Biológicas da Universidade Federal de Santa Catarina como requisito para a obtenção do título de Bacharel em Ciências Biológicas. Orientador: Prof. Drª. Andrea Rita Marrero. Florianópolis 2021 Jéssica Imperico Maciel REVISÃO BIBLIOGRÁFICA DE ESPÉCIES DE PEIXES IDENTIFICADAS COM O AUXÍLIO DO GENE COI NAS AMÉRICAS Este Trabalho Conclusão de Curso foi julgado adequado para obtenção do Título de “Bacharel em Ciências Biológicas” e aprovado em sua forma final pelo Curso Ciências Biológicas. Local, 15 de Abril de 2021. Prof. Dr. Carlos Roberto Zanetti Coordenador do Curso Banca Examinadora: Prof.(a) Dr.(a) Andrea Rita Marrero Orientadora Universidade Federal de Santa Catarina Prof. Dr. Carlos José de Carvalho Pinto Avaliador Universidade Federal de Santa Catarina Prof. Dr. Renato Hajenius Aché de Freitas Avaliador Universidade Federal de Santa Catarina Este trabalho é dedicado à minha mãe, às minhas dindas e aos meus amigos. AGRADECIMENTOS Gostaria de agradecer à minha família, especialmente, à minha mãe e minhas dindas por todo o apoio, amparo e por sempre me incentivarem a seguir estudando biologia. À minha orientadora, Drª Andrea Rita Marrero, por ter me acolhido no laboratório e acreditado em mim. Por ser essa grande pesquisadora como também pessoa que em tantos momentos esteve ao meu lado me motivando e encorajando. Obrigada por tanto apoio, pelos valiosos ensinamentos, pelas risadas e lágrimas compartilhadas e por toda essa caminhada juntas que me fizeram crescer como ser humano. Aos membros da banca examinadora, que gentilmente aceitaram participar e contribuir com este trabalho. Aos meus amigos da vida Ana Luiza Hemb, Carolina Dias, Lucas Aparecido, Carolina Biasi, Aline Linhares Bilck, Ana Paola Fernandes, Márcia Pancieira, Henrique Almeida, Carlos Alberto Filho e Mayara da Ventura Barbosa por terem aguentado todas as minhas lamentações e por diversas vezes me escutado sempre me acolhendo e incentivando a completar mais essa etapa. Obrigada por terem sido meu alicerce neste momento. Aos amigos que a biologia me proporcionou Larissa Daminelli, Sabrina Gonçalves, Deonir Batista, Marina Amorin, Luisa Ribeiro, David Leiroza, Ana Cristina Lima, Mariana Lima, Paula Grassi, Wilker Cavalcante, Luiza Machado, Gabriela Pinto e Karina Vieira por terem me apoiado durante esses longos anos, dividindo os momentos de desespero, compartilhando risadas e transformando este momento da graduação em lembranças inesquecíveis. À Universidade Federal de Santa Catarina e a todos os funcionários e colaboradores que me propiciaram a oportunidade de me formar no curso de Ciências Biológicas, e a toda a comunidade acadêmica, em especial aos meus mestres por todos os ensinamentos adquiridos durantes estes anos. RESUMO O DNA barcode tem sido utilizado com sucesso na identificação de várias espécies, com um alto nível de precisão. Visto que os sistemas taxonômicos convencionais baseados em morfologia se mostram defasados, vagarosos e imprecisos na correta classificação dos seres vivos. Dado que estudos de identificação de espécies, relações filogenéticas e análises de produtos alimentares, não conseguem basear-se somente nas características externas para a correta análise dos indivíduos, faz-se necessário a utilização de métodos analíticos mais sensíveis. Neste contexto, marcadores moleculares vêm sendo utilizados para uma identificação mais precisa das espécies analisadas, desde estudos de levantamento de fauna até comercialização e fraude na comercialização de espécies. O DNA barcoding é uma das técnicas moleculares amplamente difundidas e nela a região do gene mitocondrial COI é o fragmento responsável pela delimitação e identificação das espécies. Desta forma, através de um levantamento sistemático na bibliografia, este trabalho tem como objetivo quantificar os artigos que usam a COI como marcador molecular de espécies de peixes identificadas nas Américas. Foi realizado um levantamento no banco de dados online PubMed, usando o operador AND, com 19 combinações de palavras-chave em inglês. Após uma seleção feita com base no título e abstract foram selecionados 413 artigos, destes 109 foram selecionados após sua leitura integral e por apresentar a COI como identificador de espécies de peixes nas Américas, onde 58 foram realizados em território brasileiro. Dentre os 109 artigos selecionados apenas 14 são referentes a fraudes alimentares, onde novamente o país apontado com maior número de investigações foi o Brasil. Das espécies analisadas em casos de fraudes, 55 mostravam-se com algum risco na Red List e 51 apresentaram dados insuficientes. Estes resultados mostram a necessidade de investimento em pesquisas com marcadores moleculares para maior precisão na identificação de espécies, gerando dados que são importantes para a conservação e quantificação da biodiversidade. Palavras-chave: DNA barcode. Fraude. Espécies ameaçadas. ABSTRACT The DNA barcode has been used with success in the identification of several species, with a high level of precision. Since conventional taxonomic systems based on morphology are outdated, slow and imprecise in the correct classification of living beings. Given that studies of species identification, phylogenetic relationships and analysis of food products, are not able to rely only on external characteristics for the correct analysis of individuals, it is necessary to use more sensitive analytical methods.In this context, molecular markers have been used for a more accurate identification of the analyzed species, from studies of fauna surveys to commercialization and fraud in the food industry. DNA barcoding is one of the widespread molecular techniques, in which the region of the mitochondrial gene COI is the fragment responsible for the delimitation and identification of species. Through a systematic survey in the bibliography, this work aims to quantify the articles that use COI as a molecular marker of fish species identified in the Americas. The search was performed in the PubMed online database, using the AND operator, with 19 combinations of keywords in English. After a selection made based on the title and abstract, 413 articles were selected, of these 109 were selected after their full reading and for presenting the IOC as an identifier of fish species in the Americas, where 58 were carried out in Brazilian territory. Among the 109 articles selected, only 14 refer to food fraud, where again the country pointed out with the greatest number of investigations was Brazil. Of the species analyzed in fraud cases, 55 showed some risk in the Red List and 51 presented insufficient data.Showing the need for investment in research with molecular markers for greater precision in the identification of species, generating data that are important for the conservation and quantification of biodiversity. Keywords: DNA barcode. Fraud. Endangered species. LISTA DE FIGURAS Figura 1 – Quantidade de artigos encontrados por país. ........................................................ 22 Figura 2 – Quantidade de artigos encontrados por ano. ........................................................ 22 LISTA DE QUADROS Quadro 1 – Artigos que utilizam a COI para investigação de fraudes alimentares. ................ 23 Quadro 2 – Espécies identificadas em casos de fraudes alimentares e seu grau de ameaça segundo a IUCN. ................................................................................................................. 26 LISTA DE TABELAS Tabela 1 – Combinação de palavras-chave utilizadas nas buscas pela literatura. ................... 19 Tabela 2 – Resultado das buscas por palavras-chaves no banco de dados PubMed. .............. 21 LISTA DE ABREVIATURAS E SIGLAS COI Citocromo oxidase subunidade I DNA Ácido Desoxirribonucleico (do inglês deoxyribonucleic acid) EX Extintas (do inglês extinct) IUCN International Union for Conservation of Nature LC Menos Preocupante (do inglês Least Concern) ONU Organização das Nações Unidas PB Pares de base RAPD13 Random Amplified Polymorphic DNA RFLP Restriction Fragment Lentgh Polymorphism SUMÁRIO 1 INTRODUÇÃO ............................................................................................... 13 1.1 OBJETIVOS ...................................................................................................... 18 1.1.1 Objetivo Geral ................................................................................................. 18 1.1.2 Objetivos Específicos ....................................................................................... 18 2 MATERIAL E MÉTODOS ............................................................................. 19 2.1 COLETA DE DADOS ....................................................................................... 19 3 RESULTADOS ................................................................................................ 21 4 DISCUSSÃO .................................................................................................... 29 5 CONSIDERAÇÕES FINAIS ........................................................................... 32