Fièvre de la Vallée du Rift en Mauritanie

Epidémies, Surveillance et Perspectives

Dr DOUMBIA Baba, CVO Mauritanie Faro, le 13 juin 2013 INTRODUCTION

DEFINITION

 La fièvre de la Vallée du Rift (FVR) est une zoonose virale touchant principalement les animaux mais pouvant aussi contaminer l'homme.

 Elle est également connue sous le nom d’hépatite enzootique du mouton, en raison des lésions caractéristiques d’hépatite observées et de la sensibilité particulière des ovins à cette infection (Provost, 1980 ; Swanepoel & Coetzer, 2004).

 La maladie est transmise par des piqûres de nombreuses espèces de moustiques appartenant aux genres edes, Anopheles, Culex, Eretmapodites et Mansonia. INTRODUCTION (2)

 Les principaux vecteurs en Afrique de l’ouest sont les moustiques des genres :

CULEX AEDES INTRODUCTION (3)

CONDITIONS D’APPARITION

 Les épidémies de FVR sont souvent associées à des facteurs de risque tels que les aménagements hydrauliques (Egypte 1977, Mauritanie 1987)

 Les adaptations et changements biologiques, le trafic et le commerce internationaux, la démographie et les comportements humains (Wilson, 1994) ;

 Les pluies diluviennes qui font suite à une période de sécheresse (Mauritanie, 1998, 2010 et 2012) (Martin, 2001). INTRODUCTION (4)

DISTRIBUTION GEOGRAPHIQUE

Les grandes épidémies: Egypte: 1977/78 Mauritanie: 1987/1998/2010/2012 Kenya: 1998/2006/07 A. Saoudite/Yémen: 2000

Source CDC, 2003

Zone épidémique (Gambie, Sénegal, Mauritanie, Namibie, Afrique du Sud, Mozambique, Zimbabwe, Zambie, Kenya, Soudan, Egypte, Madagascar, Arabie Saoudite, Yémen) Zone enzootique (Botswana, Angola, République Démocratique du Congo, Congo, Gabon, Cameroun, Nigeria, République Centrafricaine, Tchad, Niger, Burkina Faso, Mali, Guinée, Tanzanie, Malawi, Ouganda, Ethiopie, Somalie) HISTORIQUE DE LA FVR EN RIM

• Circulation virale entre 1981 et 1986

• Epidémie en 1987 (+ de 300 décès)

• Reprise de la circulation entre 1993 et 1995

• Epidémie en 1998 (6 décès)

• Epidémie en Adrar et Inchiri en 2010 (13 décès)

• Epidémie en 2012 dans plusieurs wilayas du pays (36 cas FH dont 21 confirmés et 19 décès). EPIDEMIE DE LA FVR EN 1987

• Mise en évidence une importante circulation du virus de la FVR dans le Sud de la Mauritanie entre 1981 et 1986 (Saluzzo et al., 1987) • Durant l'hivernage 1987, une épizootie de FVR a touché la basse et moyenne vallée du fleuve Sénégal entraînant une vague d’avortements chez les ruminants et une mortalité élevée chez les jeunes. Elle a été suivie quelques semaines plus tard, dans cette même région par une épidémie qui a entraîné la mort de plusieurs centaines de personnes. • L’étendue géographique de l’épidémie, par rapport à la ville de , s’étend jusqu’à Keur Masséne à l’ouest (63 km), au nord (90 km), Mbout à l’est (325 km) en passant par Rkiz et Boghé (Jouan et al., 1990). • Cette épidémie est probablement due aux changements hydro-écologiques survenus à la suite de la mise en eau du barrage de Diama sur le fleuve Sénégal en 1987 (Jouan et al., 1990). EPIDEMIE DE LA FVR EN 1998

 Deux foyers de FVR ont été observés en 1993 dans les régions du Gorgol et du Guidimakha en Mauritanie et dans la région de St-Louis au Sénégal (Fontenille et al., 1998).

 Une étude de prévalence de la FVR, conduite en Mauritanie en 1993, conclut à une reprise de la circulation du virus dans les régions du Gorgol, de l’Assaba et du Hodh El Gharbi (Schneegans, 1999).

 En 1998 une deuxième épidémie a frappé Aïoun El Atrouss au Hodh El Gharbi à environ 800 km de la zone des foyers de 1987.

 Six personnes sont décédées à l’hôpital d’Aïoun El Atrouss entre le 15 septembre et le 1 octobre 1998 (Nabet et al., 2001). EPIDEMIE DE LA FVR EN 2010

 Durant l’hivernage 2010 une épidémie de FVR est survenue en Adrar au nord de la Mauritanie, dans une zone où on s’attendait le moins.

Cependant cette épidémie a suivi le tableau classique habituel à savoir :

o Une pluviométrie sans précédant au niveau des zones affectées

o Une pullulation inhabituelle de moustiques

o Des vagues d’avortement chez les animaux

o Une contamination de l’Homme EPIDEMIE DE LA FVR EN 2010 (2)

Le 15/12 : dernier cas humain connu

Octobre Novembre Décembre

25 31 21 26 Repartition des cas de Fievre de la Vallˇe du Rift de la semaine 43 ˆ la semaine 52/ 2010 par districts au niveau des rˇgions de l'Adrar et de l'Ichiri en Mauritanie 25

20 2

2 15 Akjoujt Ajoueft Chinguitti Atar †D Nombre de 14 † berger 10 12

1

2 susp. 5 6 3 0 3 cliniques 6 2 4 † 2 3 3 2 2 1 1 1 0 dont 1 † 0 S43 S44 S45 S46 S47 S48 S49 S50 S51 S52 fillettes Semaine epidemiologique 2010 EPIDEMIE DE LA FVR EN 2010 (3)

Facteurs d’émergence: Un environnement modifié…

… et favorable aux populations de moustiques EPIDEMIE DE LA FVR EN 2010 (4)

 En Adrar et l'Inchiri, les analyses effectuées sur les échantillons prélevés ont confirmé la présence de la fièvre de la Vallée du Rift (FVR) chez des patients et des animaux.

 La situation de l’épidémie chez les humains se résume officiellement à 68 cas (21 à Atar, 2 à Chinguitty, 41 à et 4 à Akjoujt) avec 13 décès, soit un taux de létalité de 19%.

 D’autre part, sur les 546 prélèvements effectués sur les animaux, 123 sont positifs, soit 22,5 %.

 Le dromadaire, une espèce affectée EPIDEMIE DE LA FVR EN 2010 (5)

Techniques utilisées : Résultats :  Test VNT (recherche d’anticorps anti FVR)  Test VNT : 67 sérums positifs pour  Test d’Isolement virus sur cellules vero E6 117 sérums testés, soit un  Test RT-PCR en pool de 4 sérums (recherche de pourcentage de 57,3 génome du virus FVR) avec les séquences amorces ciblant gène NS1 RVF1- F 5’-TGT CAC ACT GCT Conclusions : Confirmation du CTC AGT GCC et RVF2-R5’-GGA GCT TGC CTG diagnostic de la fièvre de la vallée du AAT CAG TTC- (Taille fragment: 363pb) Rift par détection de génome et d’anticorps spécifiques des sérums de dromadaires et de petits ruminants de Adrar (Akjoujt) et de Nouakchott (Nouadibou). EPIDEMIE DE LA FVR EN 2010 (6)

N°ISRA Echantillon Espèce Résultats RT PCR Résultats Isolement

4 Sang Dromadaire Négatif Négatif

7 Sang Dromadaire POSITIF POSITIF

SN Sérum Dromadaire POSITIF POSITIF EPIDEMIE DE LA FVR EN 2010 (7) Tableau N°2: Résultats des sérums de chèvres et de dromadaires de la région d’Inchiri et d’Adrar, Mauritanie.

N° Echantillon Espèce Résultats Résultats RT PCR Isolement 1 Sérum Chèvre Négatif Négatif 2 Sérum Chèvre Négatif Négatif 3 Sérum Chèvre Négatif Négatif 4 Sérum Chèvre Négatif Négatif 5 Sérum Chèvre Négatif Négatif 6 Sérum Chèvre Négatif Négatif 7 Sérum Chèvre Négatif Négatif 8 Sérum Chèvre Négatif Négatif 9 Sérum Chèvre Négatif POSITIF 10 Sérum Chèvre Négatif Négatif 11 Sérum Chèvre Négatif Négatif 12 Sérum Chèvre Négatif Négatif 13 Sérum Chèvre Négatif Négatif 14 Sérum Chèvre Négatif Négatif 15 Sérum Chèvre Négatif Négatif 16 Sérum Chèvre Négatif POSITIF 17 Sérum Chèvre Négatif Négatif 18 Sérum Chèvre Négatif Négatif 19 Sérum Chèvre Négatif Négatif 20 Sérum Chèvre Négatif Négatif 21 Sérum Dromadaire POSITIF Négatif 22 Sérum Dromadaire POSITIF Négatif 23 Sérum Dromadaire Négatif Négatif 24 Sérum Dromadaire POSITIF POSITIF 25 Sérum Dromadaire Négatif Négatif 26 Sérum Dromadaire Négatif Négatif 27 Sérum Dromadaire Négatif Négatif 28 Sérum Dromadaire POSITIF Négatif 29 Sérum Dromadaire Négatif Négatif 30 Sérum Dromadaire POSITIF POSITIF 31 Sérum Dromadaire Négatif Négatif 32 Sérum Chèvre Négatif Négatif

EPIDEMIE DE LA FVR EN 2010 (8)

 Isolement du virus puis séquençage chez le dromadaire (pour la 1ère fois) : le typage par séquençage complet des segments S et M des virus FVR au CIRAD à partir des souches isolées au LNERV-ISRA à partir de sérums de caprins et de camélidés échantillonnés en Mauritanie par les services vétérinaires.

 En effet, aucun lien proche avec les souches isolées en 1987. Aucune séquence complète de souches FVR de l’épisode 2002-2003 n’est accessible, seule une portion du gène NSs (601 bp) est accessible, d’où la représentation de ce second arbre incluant les souches Mauritanie (Figure 6). Les souches isolées en 2003 font partie du clade Est africain avec les souches kenyannes et malgaches, les souches Mauritanie de 2011 se trouvent dans un clade isolé. CONDITIONS D’EMERGENCE: EFFET DE LA PLUVIOMETRIE

Total of precipitation (in mm) in Atar, Adrar region, from 1950 to Oct. 2010 Source: CLIMPAG / FAOClimNet and meteorological service of the Ministry of Rural Development, CONDITIONS D’EMERGENCE: EFFET DE LA PLUVIOMETRIE (2)

moyenne annuelle

400 350 300 250

200 moyenne annuelle 150 100 50 0 EPIDEMIE DE LA FVR EN 2012

 L’alerte a été donnée par le Ministère de la Santé suite à la confirmation de la FVR par le laboratoire d’un cas suspect de fièvres hémorragiques à , le 16 septembre.

 Une première enquête épidémiologique réalisée du 27 septembre au 04 octobre dans les sites de Ouad Naga (Trarza), Ouneija (Brakna), Tourgueyline (Tagant) et (Assaba) n’a pas pu mettre en évidence un lien étroit entre les cas humains et l’Animal.

 Au cours de cette enquête l’analyse de 97 prélèvement de sang réalisés à Lehlewa (27), Ouneija (20), Tourgueyline (31) et Kiffa (18) a permis de révéler un seul animal (bovin) positif en IgM

 Il a été ensuite recommandé d’urgence une enquête au niveau national. EPIDEMIE DE LA FVR EN 2012 (2)

 L’enquête nationale a été élaborée suivant trois axes :

 axe Tagant-Assaba-Hodh EL Gharbi et Hodh Charghi  axe des régions de la vallée du fleuve Sénégal  axe des régions du Nord

 Cette enquête a permis de détecter des foyers de FVR chez l’animal dans les régions du Tagant, Hodh Chargui, Hodh EL Gharbi,Brakna et Gorgol.

 Les espèces les plus touchées sont les petits ruminants et les dromadaires. EPIDEMIE DE LA FVR EN 2012 (3)

Région Nombre de prélèvements Avortements Ig M positifs

Tagant 205 33 48

Brakna 151 11 9

Hodh Charghi 176 35 26

Hodh El Gharbi 144 59 53

Assaba 93 20 46

Trarza 286 11 3

Gorgol 162 50 6

Adrar 118 0 1

Inchiri 107 0 0

Guidimakha 127 0 0

Tiris Zemmour 79 0 1

Nouakchott 215 2 9 Total 1.863 221 202 EPIDEMIE DE LA FVR EN 2012 (4) Espèce Avortements Ig M Ig G PR 200 164 242 Camelins 19 27 224 Bovins 7 12 54

300

250

200 Avortements 150 IgM IgG 100

50

0 PR Camelins Bovins EPIDEMIE DE LA FVR EN 2012 (5) EPIDEMIE DE LA FVR EN 2012 (6)

RELATION ENTRE CAS HUMAINS ET CAS ANIMAUX

Région Nombre de prélèvements Avortements IgM positifs Cas conf Décés Tagant 205 33 48 6 8 Brakna 151 11 9 1 2

Hodh Charghi 176 35 26 2 2

Hodh El Gharbi 144 59 53 4 4

Assaba 93 20 46 2 1 Trarza 286 11 3 3 2 Gorgol 162 50 6 0 0 Adrar 118 0 1 0 0 Inchiri 107 0 0 0 0 Guidimakha 127 0 0 0 0 Tiris Zemmour 79 0 1 0 0 Nouakchott 215 2 9 0 0 Total 1863 221 202 18 19 EPIDEMIE DE LA FVR EN 2012 (7)

350 300 250 Nombre de prélèvements Avortements 200 IgM positifs 150 Cas conf 100 Décés 50 0

Trarza Adrar Inchiri Tagant Brakna Assaba Gorgol H.Gharbi Guidimakha Nouakchott Hodh Chargui Tiris zemmour EPIDEMIE DE LA FVR EN 2012 (8)  En santé humaine •Réunion technique présidée par le Ministre en présence du Représentant de l’OMS ; •Réunion de la Cellule de Veille conjointe •Mission d’évaluation conjointe MDR et MS •la lutte anti vectorielle en collaboration avec le MDR •Diffusion des directives sur détection, la prise en charge et prévention de la FVR •Envoi des messages à tous les Walis pour le renforcement de la situation épidémiologique •Emission de sensibilisation et d’ information du public dans les médias (TV, Radio) •Dispositions en cours pour le renforcement du plateau technique de l’ INRSP , des banques de sang , laboratoires régionaux et stocks de médicaments. •Acquisition en cours de 100.000 moustiquaires imprégnées. EPIDEMIE DE LA FVR EN 2012 (9)

 En santé animale : Les principales mesures prises ont consisté, entre autres, à :

. Détection et détermination de l'amplitude de la maladie chez les animaux à travers une surveillance active et passive, et le suivi des suspicions et des rumeurs;

. Mission d’investigation du 28 septembre au 04 octobre 2012 au niveau des foyers humains à Ouad Naga, Maghta Lahjaar, Letfetar et Kiffa ;

. Acquisition de nouveaux kits Elisa IgM et IgG.

. Renforcement de l’inspection des viandes, le renforcement du personnel et des mesures d’hygiène des viandes, distribution du matériel de protection, examen systématique des animaux à l’abattoir et consignes pour mettre en quarantaine tout animal suspect; EPIDEMIE DE LA FVR EN 2012 (10)

. Utilisation de produits répulsifs chez les animaux pour limiter la transmission de la maladie au sein du cheptel (six équipes opèrent actuellement dans les wilayas qui ont connu une circulation virale).

. Enquête épidémiologique sur l’ensemble du territoire dont l’objectif est de détecter la circulation virale et collecter les données relatives à la maladie.

.Surveillance des élevages laitiers et les marchés à bétail ;

. Lutte anti vectorielle en collaboration avec la Santé;

. Information et sensibilisation de l’opinion publique (émissions radio et télévisées, posters et guide de surveillance de la maladie) ;

. Soumission de requêtes aux partenaires techniques. EPIDEMIE DE LA FVR EN 2012 (11)

Ces résultats montrent :

 l’étendue de l’épidémie contrairement à celle de 2010, limitée à la région de l’Adrar.

 Un taux de létalité relativement élevé quoi que expliqué en partie par la faible prise en charge des malades nécessitant des transfusions .

 Une absence, pour le moment de la maladie animale dans des zones très « sensibles » comme le Trarza et le Guidimakha.

 Un lien étroit avec la pluviométrie et la pression des moustiques. EPIDEMIE DE LA FVR EN 2012 (12)

 Les conditions climatiques étaient favorables à une telle émergence avec l’importance de la pluviométrie enregistrée cette année et consécutive à une année de sécheresse.

 L’émergence de la maladie en 2012, soit moins de deux ans après l’épidémie de l’Adrar, explique soit que cette dernière était associée à une activité du virus dans le sud non décelée, soit qu’on est en face de deux situations indépendantes, l’une au nord et l’autre dans le reste du pays.

 l’absence de données entomologiques reste un facteur limitant pour mieux comprendre le maintien du virus et l’épidémiologie de la maladie. PERSPECTIVES

 Particularité de la FVR chez le dromadaire  Mécanisme de Maintien du virus  Mécanismes d’émergence de la maladie

Et surtout :  Gestion de toutes les alertes avec des données et des prélèvements adéquats  Amélioration du système des Troupeaux sentinelles  Enquêtes entomologiques  Analyses virologiques et histologiques  Vaccination  Approfondir les investigations sur les prélèvements déjà réalisées (PCR, Isolement, séquençage) pour mieux caractériser la souche 2012 et voir le lien probable avec celle de 2010. (Tagant), octobre 2012 Nbeika (Tagant), octobre 2012 (Hodh Charghi), octobre 2012 Oualata (Hodh Charghi), octobre 2012 (Hodh El Gharbi), octobre 2012