Estudo De Resistência À Murcha-De- Fusarium E

UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS ESCOLA DE AGRONOMIA PROGRAMAUNIVERSIDADE DE FEDERAL PÓS-GRADUAÇÃO DE GOIÁS EM GENÉTICA E ESCOLAMELHORAMENTO DE AGRONOMIA DE PLANTAS PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM GENÉTICA E MELHORAMENTO DE PLANTAS

ESTUDO DE RESISTÊNCIA À MURCHA-DE- FUSARIUM E IDENTIFICAÇÃO DE QTLs EM ESTUDO DE RESISTÊNCIAFEIJEIRO À MURCHA-DE-FUSARIUM-COMUM E IDENTIFICAÇÃO DE QTLs EM FEIJEIRO-COMUM

STELLASTELLA CRISTINA CRISTINA DIAS VALDO DIAS VALDO

Orientadora: Orientador(a): Profª. Dra. LeilaProf.(ª) Garcês Leila de Araújo Garcês de Araújo

Goiânia, GO – Brasil

Abril - 2017 Goiânia - GO GoiâniaBrasil – GO Abril – 2017 BRASIL

STELLA CRISTINA DIAS VALDO

ESTUDO DE RESISTÊNCIA À MURCHA-DE-FUSARIUM E IDENTIFICAÇÃO DE QTLS EM FEIJEIRO-COMUM

Tese apresentada ao Programa de Pós- Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas, da Universidade Federal de Goiás, como requisito parcial à obtenção do título de Doutora em Genética e Melhoramento de Plantas.

Orientadora: Profa. Dra. Leila Garcês de Araújo

Coorientadora: Dra. Adriane Wendland

Goiânia, GO – Brasil 2017

À minha mãe com muito amor dedico, por ser a razão do meu sonhar.

AGRADECIMENTOS

À Deus pela vida e salvação por meio da graça. Pela presença constante em todos os meus dias. À minha mãe que sempre foi meu porto seguro, que batalhou a vida toda para que eu pudesse realizar este projeto de vida. À minha irmã que me apoiou nos momentos difíceis. Ao Valdemi, que mesmo depois de sérias intempéries, me apoiou na conclusão deste curso. Ao meu pai Adilson, irmão Petrus e irmã Silvia por me incentivar. Toda minha família, onde busco refúgio e é A base de minha vivência. Ao Programa de Genética e Melhoramento de Plantas e à Universidade Federal de Goiás por proporcionar estrutura e ensinamentos. À FAPEG pelo recurso financeiro por meio da concessão de bolsa. À Embrapa Arroz e Feijão pela estrutura e serviços para que fosse possível a realização deste. Minhas orientadoras Leila Garcês e Adriane Wendland por extrair o melhor de mim e transferir teus conhecimentos durante o mestrado e o doutorado, me guiando pelo caminho do conhecimento científico. À Rosana Vianello por participar ativamente da execução do presente trabalho. Ao professor Alexandre Coelho por contribuir com generosidade. Meus professores do PGMP, João Batista, Lázaro Chaves, Mariana Pires, Sérgio Tadeu Sibov, Patrícia Guimarães, Mara Rúbia e Thannya Nascimento sou grata por compartilhar generosamente o conhecimento ao longo destes anos. Aos colegas do PGMP sempre presentes no cotidiano e ensinando direta ou indiretamente. Aos amigos de doutorado: Elias Emanuel, Odilon Morais, Paulo Henrique, Poliana Carloni, Polianna Dias, Ueric José e Gabriel Feresin. Aos amigos do LGM: Kellen Sousa, Lays Alves, Jacqueline Borba, Priscila e Bruno Leonardo. Aos amigos da Embrapa Arroz e Feijão: Maythsulene, Adélia Cristina, Lorraynne Rosa, Rafaela Luz, João Augusto, Janeo Eustáquio, Wendell Pereira, Eugenio Sperandio, Ariadna, Daniany, Rodrigo Souza, Alan, Nara, Alaerson, Fernanda e Robson. Aos funcionários do Laboratório de Biotecnologia: Paula, Gesimária, Luana, Fernanda e José. Aos funcionários do Laboratório de Fitopatologia: Ronair, Elder, Márcio, Lívia e Mônica. Aos irmãos em Cristo, sou grata por todas as orações. Aos membros da banca por contribuir com o nosso trabalho Dra. Rosana Vianello, Dr. Fábio Gonçalves, Dra. Marta Cristina e Dr. Alexandre Coelho aceitando prontamente nosso convite.

RESUMO GERAL

VALDO, S. C. D. Estudo de resistência à murcha-de-fusarium e idenficaçaõ de QTLs em feijoeiro-comum. 2017. 179 f. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Escola de Agronomia, Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2017. 1

A cultura do feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris) tem importância cultural e econômica no Brasil. O feijoeiro-comum é cultivado em todas as regiões brasileiras e é acometido por várias doenças, como a murcha-de-fusarium, causada pelo fungo habitante de solo Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli. Esta doença causa significativas perdas na cultura e a principal forma de controle é a resistência genética. Desenvolver cultivares resistentes é um dos alvos dos programas de melhoramento, portanto os objetivos deste trabalho foram: i) selecionar linhagens resistentes obtidas de população F5:7 oriunda do cruzamento entre Ouro Branco e CNFP10132 para F. oxysporum f. sp. phaseoli, em condições de campo e de ambiente controlado e ii) identificar marcadores SSR e SNP's ligados a QTLs associados à resistência do feijoeiro-comum à murcha-de-fusarium utilizando 92 linhagens recombinantes endogâmicas (RILs) derivadas do cruzamento Ouro Branco x CNFP10132. No primeiro estudo 140 linhagens, os genitores Ouro Branco e CNFP10132, duas testemunhas BRS Esplendor (resistente) e BRS Supremo (suscetível) foram avaliados. Os ensaios de campo foram conduzidos em área de pivô central onde ocorre infestação natural do patógeno. Os tratamentos foram avaliados em duas safras (safra das águas e de inverno) em delineamento de látice triplo 12x12. Os dois ensaios em ambiente controlado foram conduzidos em delineamento inteiramente causalizado. As plantas foram inoculadas utilizando o método de corte de raiz e imersão destas na suspensão de conídios, que foi ajustada para 1x106 conídeos/mL durante cinco minutos. A avaliação foi feita utilizando uma escala de notas de nove graus que representam a severidade da doença: sendo 1 - ausência de sintomas e 9 - acima 75% da folhagem com sintomas de murcha. Os dados foram submetidos à análise de variância e teste de Scott-Knott para os ambos ambientes. Para os ensaios em ambiente controlado foram estimados área abaixo da curva do progresso da doença (AACPD) e parâmetros genéticos. Foram observadas diferenças significativas para safras e para ensaios de ambiente controlado, indicativo de que o ambiente influencia diretamente na severidade da doença. Foram encontradas diferenças altamente significativas para linhagens em todos os ambientes avaliados, evidenciando a existência de variabilidade genética, o que possibilita seleção de linhagens resistentes à murcha-de-fusarium. Ao considerar as menores médias em campo, ambiente controlado e ACCPD as linhagens Ouro Branco x CNFP 10132.140, Ouro Branco x CNFP 10132.49, Ouro Branco x CNFP 10132.12, Ouro Branco x CNFP 10132.90 e Ouro Branco x CNFP 10132.48 se destacaram e são candidatas para compor o programa de melhoramento. As estimativas de herdabilidade foram altas para todos os ambientes, média de 85,48% para campo e 95,47% para ambiente controlado. Portanto, a seleção para resistência à F. oxysporum f. sp. phaseoli dentre estas linhagens, será bem sucedida. No segundo estudo foi extraído o DNA de 92 linhagens e dos genitores para genotipagem com marcadores

1 Orientadora: Profa. Dra. Leila Garcês de Araújo. EA – UFG. Coorientadora: Dra. Adriane Wendland. EA - UFG.

SSRs e SNPs. Para obtenção da localização destes marcadores as sequências dos primers foram alinhadas no genoma andino do feijoeiro-comum. O método de mapeamento por marcas simples (análise de QTLs por meio da regressão linear) foi utilizado para identificar QTLs associados à resistência à murcha-de-fusarium. Foram considerados marcadores significativos os que apresentaram p-valor<0,05. Noventa e três marcadores foram identificados ligados a 104 QTLs associados à resistência à murcha-de-fusarium. Dentre estes marcadores destaca-se os que foram significativos em mais de um ambiente PV 115, PV 251, BARC-PV-0004089, BARC-PV-0004548, BARC-PV-0003450, BARC- PV-0006051, BARC-PV-0003368, BARC-PV-0005477 e BARC-PV-0004897. Dentre os marcadores, somente o marcador BARC-PV-0003450 foi altamente significativo nos dois ensaios, em ambiente controlado (p<0,001) e na safra de inverno (p<0,01), e explicou até 21,5% da variância fenotípica. Foi feita a anotação gênica considerando a localização de todos os marcadores que foram significativos à p<0,01 e abrangeu 500 kb anterior e posterior à localização. Foram anotados 960 transcritos codificados. Ainda observou-se que o marcador BARC-PV-0003450 está localizado no cromossomo 8 distante 338,54 kb do gene Phvul.008G014700 o qual está associado à proteína putativa RPP13 relacionada com resistência à doenças, identificada em Arabidopsis thaliana. Esta proteína pertence à terceira classe de genes de resistência que engloba o domínio denominado de Repetições Ricas em Leucina (LRR; Leucine Rich Repeats). Este domínio está envolvido no reconhecimento do patógeno pelo hospedeiro durante o processo de infecção. Portanto há a possibilidade de selecionar linhagens resistentes à murcha-de-fusarium e identificar QTLs que possivelmente estão ligados aos marcadores utilizados

Palavras-chave: Phaseolus vulgaris L., marcadores moleculares, linhagens endogâmicas recombinantes, Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli.

GENERAL ABSTRACT

VALDO, S. C. D. Study of fusarium wilt resistance and identification of QTLs in common bean. 2017.179 f. Thesis (PhD in Genetics and Plant Breeding) – Escola de Agronomia, Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2017. 2

The common bean (Phaseolus vulgaris) crop plays an important role in the culture and economy of Brazil. It is cultivated in all Brazilian regions and is affected by several diseases like fusarium wilt which is caused by Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli (soil- born fungus). This disease brings significant losses in common bean culture and genetic resistance is the primary form of control. One of the core goals of breeding programs is the development of resistant cultivars, therefore the objectives of this work are: i) To select F. oxysporum f. sp. phaseoli resistant F5:7 lines resulted from the crossing between Ouro Branco X CNFP10132, under controlled field and environment conditions ii) To identify SSR markers and QTL-linked SNPs associated with the resistance of common bean to fusarium wilt using 92 recombinat inbred lines(RILs) resulted from the crossing between Ouro Branco x CNFP10132. In the first study, 140 lines, the breeders Ouro Branco and CNFP10132, BRS Esplendor (resistant) and BRS Supremo (susceptible) as controls were evaluated. Field trials were conducted in a center pivot area where natural infestation of the pathogen occurs. The treatments were evaluated in summer and winter crop and the experimental design used was 12x12 triple lattice. The two controlled environment trials were conducted in a completely randomized design. The treatments were inoculated by cutting and immersing the roots in a conidial suspension, which was adjusted to 1x106 conidia/ml for five minutes. The evaluation was performed using a scale of nine grades that represent the severity of the disease: 1 – absence of symptoms and 9 – over 75% of foliage with wilt symptoms. Data were submitted to analysis of variance and Scott-Knott test for both environments. The area under the disease progress curve (AUDPC) and genetic parameters were estimated for controlled environment tests. Significant differences were observed for crops and for controlled environment trials, indicating that environment influences directly the severity of the disease. Highly significant differences were found for lines in all environments evaluated, demonstrating the existence of genetic variability, which allows the selection of resistant lines resistant to fusarium wilt. Treatments were classified in different groups according to the Scott-knott test. When considering the lowest averages in field, controlled environment and AUDPC, the strains Ouro Branco x CNFP 10132.140, Ouro Branco x CNFP 10132.49, Ouro Branco x CNFP 10132.12, Ouro Branco x CNFP 10132.90 and Ouro Branco x CNFP 10132.48 were prominent and are candidates to produce a breeding program. Heritability estimates were high for all environments, mean of 85.48% for field and 95.47% for controlled environment. Therefore, selection for resistance to F. oxysporum f. sp. phaseoli of these lines, will be successful. In the second study it was extracted DNA from 92 lines and from genitors for genotyping with SSRs and SNPs. In order to obtain the localization of these markers, sequences of the primers were aligned to the andean genome of the common bean. The method of single marker (analysis of QTLs based on linear regression) was used to identify

1 Orientadora: Profa. Dra. Leila Garcês de Araújo. EA – UFG. Coorientadora: Dra. Adriane Wendland. EA - UFG.

QTLs associated with fusarium wilt resistance. These markers were considered significant when brought up p-value <0.05. Ninety-three markers were linked to 104 QTLs associated with fusarium wilt resistance and among these, were considered significant in more than one environment PV 115, PV 251, BARC-PV-0004089, BARC-PV-0004548, BARC-PV- 0003450, BARC-PV-0006051, BARC-PV-0003368 , BARC-PV-0005477 and BARC-PV- 0004897. However only the BARC-PV-0003450 marker was highly significant in the two environment controled trials (p <0.001) and winter crop (p <0.01) and explained up to 21.5% of the phenotypic variance. Subsequently, the gene annotation was made considering the location of all markers that were significant at p <0.01 comprising 500 kb before and after the localization. 960 coded transcripts were annotated. It was observed in gene annotation that BARC-PV-0003450 marker is located on the chromosome 8, 338.54 kb distant of the gene Phvul.008G014700 which is associated with the putative protein RPP13 related to disease resistance, identified in Arabidopsis thaliana. This protein belongs to the third class of resistance genes that encloses the domain called Leucine-Rich Repeats (LRR). This domain is involved in the recognition of the pathogen by the host during the infection process. Therefore, this marker is suitable for marker- assisted selection aiming the development of cultivars resistant to fusarium wilt.

Key words: Phaseolus vulgaris L., resistance, molecular markers, recombinant inbred lines, Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli.

SUMÁRIO

1 INTRODUÇÃO GERAL...... 11

2 SELEÇÃO DE LINHAGENS DE FEIJOEIRO-COMUM RESISTENTES À Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli...... 13 RESUMO ...... 14 ABSTRACT ...... 15 2.1 INTRODUÇÃO...... 16 2.2 MATERIAL E MÉTODOS ...... 17 2.2.1 Ensaios em campo ...... 18 2.2.2 Ensaios em ambiente controlado...... 19 2.2.2.1 Preparo de inóculo do patógeno...... 19 2.2.2.2 Inoculação e avaliação em ambiente controlado...... 20 2.2.3 Análises estatísticas e genética dos dados fenotípicos...... 20 2.2.3.1 Análise estatística dos dados obtidos em campo...... 20 2.2.3.2 Análise estatística dos dados obtidos em ambiente controlado...... 20 2.2.3.3. Estimativas dos componentes de variância...... 20 2.3 RESULTADOS E DISCUSSÃO...... 21 2.3.1 Ensaios em campo...... 21 2.3.2 Ensaios em ambiente controlado...... 27 2.3.3 Estimativas dos componentes de variância para médias de severidade de murcha-de-fusarium em genótipos de feijoeiro-comum, em condições de campo e ambiente controlado...... 33 2.4 CONCLUSÕES...... 37 2.5 REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS...... 38

3 MAPEAMENTO DE LOCOS LIGADOS À RESISTÊNCIA À MURCHA-DE-FUSARIUM EM FEIJOEIRO-COMUM...... 42 RESUMO...... 54 ABSTRACT...... 43 3.1 INTRODUÇÃO...... 44 3.2 MATERIAL E MÉTODOS...... 46 3.2.1 Material vegetal...... 46 3.2.2 Avaliação de murcha-de-fusarium em campo e ambiente controlado...... 47 3.2.3 Análises estatísticas dos dados fenotípicos...... 48 3.2.4 Genotipagem com marcadores SSRs...... 48 3.2.5 Genotipagem com marcadores SNPs...... 48 3.2.6 Alinhamento dos marcadores no genoma de Phaseolus vulgaris...... 49 3.2.7 Análise de QTL por meio de regressão linear...... 49 3.2.8 Anotação gênica dos SSRs e SNPs significativos...... 50 3.3 RESULTADOS E DISCUSSÃO...... 50 3.3.1 Dados fenotípicos...... 50 3.3.2 Genotipagem...... 53 3.3.3 Distribuição dos marcadores SSRs e SNPs no genoma do feijoeiro- comum...... 53 3.3.4 Análise de QTL...... 55 3.3.5 Anotação Gênica...... 59 3.4 CONCLUSÕES...... 60

3.5 REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS...... 61

4 CONCLUSÕES GERAIS...... 68

5 REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS...... 69

APÊNDICES...... 72

1 INTRODUÇÃO GERAL

O feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris L.) é uma importante fonte de minerais e proteína na dieta de grande parte das classes da população brasileira (Carneiro et al., 2012). O Brasil obteve produção de 2.670.735 toneladas no ano de 2015. É o país com maior consumo de feijão, com média de 17,5 kg/pessoa/ano (Conab, 2017). (Embrapa Arroz e Feijão, 2017). Dentre os mais importantes fatores da queda de produtividade encontram-se as doenças, que podem provocar perdas de até 100% na produção, diminuindo as qualidades fisiológicas, nutricionais e sanitárias do produto colhido, afetando o preço e sua comercialização. As doenças causadas por fungos de solo causam maiores perdas de produtividade, com destaque para a murcha ou amarelecimento de Fusarium (Biazon, 2004). A murcha-de-fusarium é uma doença vascular severa do feijoeiro-comum, relatada em todas as regiões produtoras de feijão do mundo, causando problemas maiores na América Latina, África e noroeste dos Estados Unidos (Pastor-Corrales & Abawi, 1987; Buruchara & Camacho, 2000). Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli penetra nas plantas pelo sistema radicular e coloniza o xilema, provocando desfolhamento prematuro, murcha, descoloração vascular, clorose, nanismo e morte prematura de plantas (Nelson et al., 1983). As perdas variam de acordo com a variedade utilizada, nível de infestação, propriedades de características físico-químicas e biológicas do solo. No Brasil as perdas de produtividade variam de 80% a 100% (Cramer et al., 2003). Como medidas de controle para murhca-de-fusarium recomenda-se realizar rotação de culturas por mais de três anos, utilizar sementes sadias e tratadas com fungicidas, evitar condições de excesso ou falta de água, realizar bom preparo de solo e adicionar matéria orgânica ao solo (Kimati, 2013). Contudo, a principal forma de controle é a utilização de cultivares resistentes. A obtenção destas é dificultada pela existência de raças patogênicas, exigindo a identificação de fontes de resistência para este patógeno. As raças de F. oxysporum f. sp. phaseoli são geograficamente distribuídas entre os continentes. No Brasil, há indicativos da predominância de apenas um patótipo,

denominado patótipo 2 ou brasileiro (Alves-Santos et al., 2002). Porém em estudos realizados no municípios de Santo Antônio de Goiás – GO, foram idenrificadas 13 raças o que indica que a série diferenciadora utilizada atualmente não identifica todas as raças existentes atualmente (Gonçalves, comunicação pessoal). Uma abordagem de muito interesse dos programas de melhoramento são os estudos realizados com objetivo de identificação de caracteres quantitativos, que são controlados por inúmeros locos, os QTLs (Quantitative Trait Loci). Para obtenção das estimativas de localização e efeito dos QTLs são empregados softwares, que por sua vez são alimentados com informações obtidas por marcadores moleculares e dados fenotípicos dos genótipos de interesse. Portanto, com o emprego de marcadores moleculares, a obtenção de mapas genéticos e a utilização de programas computacionais, torna-se possível mapear QTLs que são responsáveis pela expressão de caracteres quantitativos (Sabadin et al., 2008). A identificação de QTLs responsáveis pelo controle de doenças em feijoeiro- comum é amplamente utilizada nos programas de melhoramento de feijoeiro-comum. Para murcha-de-fusarium Fall et al. (2001) identificaram três locos com associação significativa no grupo de ligação 10, responsável por 63,5% da variação fenotípica da severidade da doença. Estes autores também identificaram mais duas marcas adicionais ao realizar análise por marca simples, nos grupos de ligação 3 e 11. Ronquillo-López et al. (2010) avaliaram a reação de RILs ( Recombinant Inbred Line) à murcha-de-fusarium e à podridão de raiz e identificaram marcadores dos grupos de ligação B6 e B8, como também marcas adicionais no grupo de ligação B2, associados aos QTLs em resposta a ambas as doenças. Identificar genótipos resistentes à murcha-de-fusarium é a forma de controle mais eficaz contra esta doença, contudo os trabalhos de avaliação de genótipos de feijoeiro-comum quanto à reação à F. oxyporum f. sp. phaseoli ainda são reduzidos (Pastor Corrales & Abawi, 1987; Balardin et al., 1990; Piza, 1993; Nascimento et al., 1995; Rava et al., 1996; Rocha Júnior et al., 1998; Pereira et al., 2011; Batista et al., 2016). A sequência genômica disponível nos bancos de dados públicos é uma ferramenta importante na identificação de marcadores fortemente ligados a genes de interesse. Identificar marcadores significativos utilizandosequências do genoma do feijoeiro-comum disponíveis nos bancos de dados públicos possibilita que estes marcadores associados à genes de resistência conhecidos, possam ser usados em programas de melhoramento (Burt et al.,

2015).Diante do exposto os objetivos do presente trabalho foram i) selecionar linhagens resistentes obtidas de população F5:7 oriunda do cruzamento entre Ouro Branco e CNFP10132 para F. oxysporum f. sp. phaseoli, em condições de campo e de ambiente controlado e ii) Identificar marcadores SSR e SNPs associados a QTLs associados à resistência à murcha-de-fusarium em linhagens endogâmicas recombinantes (RILs) deste cruzamento.

2 SELEÇÃO DE LINHAGENS DE FEIJOEIRO-COMUM RESISTENTES À Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli

RESUMO

A murcha-de-fusarium do feijoeiro-comum é causada pelo fungo habitante do solo Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli. Este patógeno coloniza os vasos xilemáticos impedindo que água e sais minerais cheguem até à parte aérea da planta causando os sintomas de flacidez, desfolhamento prematuro, murcha e morte das plantas. A resistência genética é a principal forma de controle desta doença, sendo assim a obtenção de genótipos resistentes à doenças é um dos objetivos dos programas de melhoramento. O presente trabalho objetivou selecionar linhagens resistentes obtidas de população F5:7 oriunda do cruzamento entre Ouro Branco x CNFP10132 para F. oxysporum f. sp. phaseoli, em condições de campo e de ambiente controlado. As linhagens, os genitores e as testemunhas BRS Esplendor e BRS Supremo foram avaliadas em diferentes ambientes (campo e ambiente controlado), utilizando escala de notas de nove graus que representam a severidade da doença, sendo 1 - ausência de sintomas e 9 – acima 75% da folhagem com sintomas de murcha. Os ensaios no campo foram conduzidos sob delineamento de lattice triplo 12 x 12 e ocorreram em duas safras distintas, safra de inverno e safra das águas, em área de pivô central infestada naturalmente por F. oxysporum f. sp. phaseoli. Em dois ensaios em ambiente controlado os tratamentos foram inoculados utilizando o método dipping e imersão destas na suspensão de conídios que foi ajustada para 1x106 conídeos/ml durante cinco minutos. As avaliações foram realizadas aos 15, 21 e 28 dias após inoculação. Os dados foram submetidos à análise de variância e as médias comparadas pelo teste de Scott-Knott, estimativas de área abaixo da curva do progresso da doença (AACPD) e parâmetros genéticos. Observou-se diferenças significativas para safras e para ensaios de ambiente controlado, indicativo de que o ambiente influencia diretamente na severidade da doença. Foram encontradas diferenças significativas para linhagens em todos os ambientes avaliados, demonstrando que há variabilidade genética, o que possibilita seleção de linhagens resistentes à murcha-de-fusarium. Os tratamentos foram classificados em diferentes grupos segundo o teste de Scott-knott. Considerando as menores médias no campo, em ambiente controlado e menores AACDP as linhagens Ouro Branco x CNFP 10132.140, Ouro Branco x CNFP 10132.49, Ouro Branco x CNFP 10132.12, Ouro Branco x CNFP 10132.90 e Ouro Branco x CNFP 10132.48 se destacaram sendo portanto indicadas para compor o programa de melhoramento para resistência à murcha-de- fusarium. As estimativas de herdabilidade foram altas com 85,8% para safra de inverno, 85,16 para safra das águas. O ambiente controlado foi de 93,86 e 97,09% no primeiro e segundo ensaios, respectivamente. A seleção para resistência à F. oxysporum f. sp. phaseoli dentre estas linhagens, será bem sucedida.

Palavras-chave: Resistência, Phaseolus vulgaris, murcha-de-fusarium.

ABSTRACT

The fusarium wilt of the common bean is caused by the fungus inhabitant of the soil Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli. This pathogen colonizes the xylem vessels preventing water and minerals from reaching the aerial part of the plant causing premature defoliation, wilt and death of plants. Genetic resistance to fusarium wilt is the main strategy for disease control, thus obtaining genotypes resistant to diseases is one of the objectives of breeding programs. Therefore, this work aims to select resistant lines obtained from population F5:7 resulted from the cross between Ouro Branco X CNFP10132 for F. oxysporum f. sp. phaseoli, under controlled field and environment conditions. The breeders, lines and the controls BRS Esplendor (resistant) and BRS Supremo were evaluated using a scale of nine grades that represent the severity of the disease: 1 – absence of symptoms and 9 – over 75% of foliage with wilt symptoms. Field trials were conducted in center pivot area with a natural infestation of F. oxysporum f. sp. phaseoli. The treatments were evaluated in summer and winter crop and the experimental design used was 12x12 triple lattice. In two controlled environment trials the treatments were inoculated by cutting and immersing the roots in a conidial suspension which was adjusted to 1x106 conidia/ml for five minutes. Evaluations were permormed at 15, 21 and 8 days after inoculation. Data were submitted to analysis of variance, Scott-Knott test and AUDPC as well as genetic parameters were estimated. Significant differences were observed for crops as and for controlled environment trials, indicating that environment directly influences the severity of the disease. Highly significant differences were found for lines in all evaluated environments, demonstrating that there is genetic variability, which allows the selection of resistant lines resistant to Fusarium wilt. Treatments were classified in different groups according to the Scott-knott test. When considering the lowest averages in the field, controlled environment and AUDPC, the lines Ouro Branco x CNFP 10132.140, Ouro Branco x CNFP 10132.49, Ouro Branco x CNFP 10132.12, Ouro Branco x CNFP 10132.90 and Ouro Branco x CNFP 10132.48 were prominent and are suitable for breeding program for resistance to fusarium wilt. Heritability estimates were high showing 85.8% for winter crop and 85.16% for rainy season crop, as for controlled environment the result was 93.86% and 97.09% in the first and second trials respectively. Therefore, selection for resistance to F. oxysporum f. sp. phaseoli of these lineages, will be successful.

Key words: resistance, Phaseolus vulgaris, fusarium wilt.

2.1 INTRODUÇÃO

As doenças do feijoeiro comum são responsáveis por perdas de 100% da produção como também a diminuição das qualidades fisiológicas, nutricionais e sanitárias das sementes, bem como sua comercialização (Sartorato, 2006). Dentre os fungos fitopatogênicos habitantes do solo cita-se Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli causador da murcha ou amarelecimento de Fusarium que se destaca por ser uma doença vascular severa do feijoeiro-comum. Há relatos da ocorrência da murcha-de-fusarium em diferentes regiões geográficas como América Latina, África e noroeste dos Estados Unidos (Pastor- Corrales & Abawi, 1987; Buruchara & Camacho, 2000). Em cultivos realizados em pivô central a doença causa maiores prejuízos na produção da cultura. Perdas de produtividade de 80% a 100% podem ocorrer dependendo da cultivar utilizada, do nível de infestação do patógeno e das características físico-químicas e biológicas do solo na área de cultivo (Kendrick & Snyder, 1942; Ribeiro & Ferraz, 1984, Cramer et al., 2003). O fungo F. oxysporum f. sp. phaseoli penetra nas plantas pelo sistema radicular e coloniza o xilema, provocando desfolhamento prematuro, flacidez, murcha, descoloração vascular, clorose, nanismo e morte prematura de plantas (Nelson et al., 1983). Esse patógeno é disseminado dentro e entre as lavouras por meio do movimento do solo, fragmentos infectados do hospedeiro, água de drenagem ou irrigação e sementes contaminadas (Sartorato & Rava, 1994). O controle de doenças no feijoeiro-comum não pode ser tratado de forma isolada e sim integrada. Conforme Agrios (2005) o manejo integrado tem por objetivos eliminar/reduzir inóculo inicial ou atrasar o aparecimento, diminuir a taxa de desenvolvimento da doença e o período de exposição da cultura ao patógeno. Dentre os métodos de controle estão biológico, químico, físico, cultural e genético. No controle biológico objetiva-se reduzir a quantidade de inóculo ou das atividades da doença provocada pelo patógeno. Este tipo de controle é realizado por meio de um ou mais organismos e não somente pela ação humana (Agrios, 2005). O controle químico atua em menor tempo, e a ação dos produtos utilizados tem por objetivo reduzir a penetração e a infecção do patógeno causador da doença tratada. Em muitos casos é a única medida eficiente e economicamente viável com a finalidade de garantir a produtividade e qualidade da cultura. No controle físico são utilizados agentes físicos para diminuir o

inóculo ou impedir que a doença se desenvolva. Dentre estes estão a temperatura, a radiação, a ventilação e a luz (Kimati, 2013). O controle genético é o mais frequentemente empregado por ser de mais fácil utilização com menor custo para o produtor. Além disso, há doenças que podem ser controladas somente por este método, pode-se citar carvões e ferrugens dos cereais, virose na maioria das culturas e também as murchas vasculares (Camargo & Bergamin Filho, 2013). Para controle da murcha-de-fusarium é recomendada a utilização de cultivares resistentes.A obtenção destas é dificultada pela existência de raças patogênicas, exigindo a identificação de fontes de resistência para as diferentes raças deste patógeno. As raças de F. oxysporum f. sp. phaseoli são geograficamente distribuídas entre os continentes. No Brasil, ocorre com maior frequência a raça 2 (Alves-Santos et al., 2002; Ribeiro & Hagedorn, 1979b; Nascimento et al., 1995), entretanto Gonçalves, et al. (comunicação pessoal) identificaram mais 16 raças oriundas de Goiás, São Paulo, Rio Grande do Sul, Pernambuco e Paraná. Das 16 raças obtidas em Goiás, 13 foram encontradas no município de Santo Antônio de Goiás – GO. Estudos já foram realizados com o objetivo de identificar genótipos resistentes à murcha-de-fusarium no germoplasma de feijoeiro-comum. Nestes estudos os autores avaliaram cultivares e linhagens em diferentes safras e locais. O resultado destes esforços resultou em dezenas de genótipos caracterizados para esta doença (Balardin et al., 1990; Piza, 1993; Nascimento et al., 1995; Rocha Júnior et al., 1998; Buruchara & Camacho, 2000; Sala et al., 2006; Pereira et al., 2011). Diante disso, o presente trabalho teve por objetivo selecionar linhagens resistentes obtidas de população F5:7 oriunda do cruzamento entre Ouro Branco x CNFP10132 para F. oxysporum f. sp. phaseoli, em condições de campo e de ambiente controlado.

2.2 MATERIAL E MÉTODOS

Os genótipos utilizados neste estudo correspondem a 140 linhagens oriundas do cruzamento dos genótipos Ouro Branco e CNFP10132, pertencentes aos pools gênico Andino e Mesoamericano, respectivamente. Estes genótipos foram escolhidos para obtenção da população segregante, por apresentarem respostas contrastantes à murcha-de- curtobacterium e posteriormente avaliados também para murcha-de-fusarium. A cultivar Ouro Branco foi desenvolvida pelo Centro Internacional de Agricultura (CIAT), este

parental apresentou resistência à murcha-de-fusarium em estudos anteiores. Apresentou altas produtividades em monocultivo e em consórcio, nas safras das águas, seca e inverno (Costa et al., 1997). A linhagem CNFP10132 foi desenvolvida pela Embrapa Arroz e Feijão e apresenta alto valor agronômico e grão tipo preto, o qual exibiu suscetibilidade à murcha-de-fusarium em estudo anteriores. Esta população foi obtida em 2009 pelo método Bulk com seleção de plantas individuais em F5, multiplicação em F5:6 e avaliação em F5:7.

2.2.1 Ensaios em campo

Os experimentos foram conduzidos sob condições de pivô central, em área previamente identificada por sua infestação natural com Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli na Embrapa Arroz e Feijão, localizada no município de Santo Antônio de Goiás – Goiás, a 16°28’00” de latitude Sul, 49°17’00’’ de longitude oeste, e 823m de altitude. Foram conduzidos dois ensaios em duas safras, a primeira de inverno (junho a agosto de 2015) e a segunda das águas (janeiro a março de 2016) em látice triplo 12x12. Foi aplicado 250 kg/ha da fórmula 4-30-16, 125 kg/ha de sulfato de amônio e 20 kg/ha de sulfato de zinco, em cobertura. Foram utilizadas uma parcela de três metros com espaçamento de 0,45 m e densidade de semeadura de 45 sementes/m linear, com três repetições. O índice de severidade da doença expresso em porcentagem de folhagem afetada foi determinado aos 71 dias após o plantio. Utilizou-se uma escala de 9 graus desenvolvida por Schoonhoven & Pastor-Corrales (1987), em que: 1 - ausência de sintomas; 2 - até 5% da folhagem com sintomas de murcha; 3 - de 6 a 10% da folhagem com sintomas de murcha; 4 – de 11 a 15% da folhagem com sintomas de murcha; 5 - de 16 a 25% da folhagem com sintomas de murcha; 6 - de 26 a 35% da folhagem com sintomas de murcha; 7 - de 36 a 50% da folhagem com sintomas de murcha; 8 - de 51 a 75% da folhagem com sintomas de murcha; 9 - 75% da folhagem com sintomas de murcha. Linhagens com médias entre 1 a 3 foram consideradas resistentes, de 3,1 a 6 moderadamente resistentes e de 6,1 a 9 suscetíveis (Pastor-Corrales & Abawi, 1987; Salgado & Schwartz, 1993; Paula Junior & Wendland, 2012). As temperaturas foram estimadas pelo departamento de meteorologia da Embrapa Arroz e Feijão.

2.2.2 Ensaios em ambiente controlado

2.2.2.1 Preparo de inóculo do patógeno

Foi utilizado nas inoculações o isolado BRM 28134 de F. oxysporum f. sp. phaseoli, pertencente à raça 2, escolhida por ser a mais frequente no Brasil (Ribeiro & Hagedorn, 1979b). O isolado BRM 28134 foi repicado em placas de Petri contendo BDA por sete dias em câmara de crescimento à 24ºC. Fragmentos de 5mm2 de meio com o isolado crescido foram retirados e transferidos para Erlenmeyers contendo 800 mL de batata dextrose (BD). Os Erlenmeyers foram mantidos em mesa agitadora a 125 rpm a 24ºC durante 96 horas. O conteúdo, contendo o inóculo foi filtrado em tecido e posteriormente foi obtida a suspensão de conídios que foi ajustada para 1x106 conídeos/mL-1 com auxílio da câmara de Neubauer.

2.2.2.2 Inoculação e avaliação em ambiente controlado

Os ensaios foram conduzidos em ambiente controlado com temperatura de 24ºC, irrigação a cada dois dias e fotoperíodo de 12 horas, em delineamento inteiramente casualizado com quatro repetições, utilizando-se três plantas por vaso de 700 mL. As 140 progênies, uma testemunha suscetível (BRS Esplendor), outra resistente (BRS Supremo) e os dois genitores da população, Ouro Branco e CNFP 10132 foram semeados em bandejas contendo substrato comercial Maxfertil® (casca de pinus compostada, vermiculita e adubação de base) e inoculadas aos sete dias após plantio. As inoculações foram realizadas segundo metodologia proposta por (Costa et al. (1989), em que as raízes são cortadas (método dipping) e as plantas são imersas até o caule por cinco minutos no inóculo. Posteriormente as plantas foram transplantadas para vasos contendo substrato comercial. Nas testemunhas as raízes foram cortadas e imersas em água destilada estéril. As plantas foram avaliadas por três vezes, aos 15, 21 e 28 dias utilizando-se a escala de notas que representam o índice de severidade da doença desenvolvido por Schoonhoven & Pastor- Corrales (1987) descrita no item 2.2.1. Todos os genótipos foram submetidas à análise de área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD). O aumento dos sintomas foi calculado em ambos os

ensaios. AAACPD que foi calculada pela expressão de acordo com Campbell & Madden (1990).

2.2.3 Análises estatísticas e genética dos dados fenotípicos

2.2.3.1 Análise estatística dos dados obtidos em campo

Como pressuposto da análise de variância, foi realizado o teste de normalidade de Shapiro-Wilk (Shapiro & Wilk, 1965). Para cada ensaio de campo foram realizadas análises de variância individuais. As médias foram comparadas pelo teste de Scott & Knott (1974) (p ≤ 0,05) utilizando o software R software v2.15.0. Um dos parâmetros para estimar a precisão de um experimento é a acurácia seletiva. Este parâmetro leva em conta não só a proporção da variação residual e do número de repetições, mas também a magnitude entre variações de natureza genética e residual agregadas ao caráter que está sob avaliação (Resende & Duarte, 2007). No presente trabalho, estimou-se acurácia seletiva (AS) com o objetivo de avaliar a precisão dos experimentos realizados em campo e em ambiente controlado. A escala de notas que representa o índice de severidade da doença é arbitrária e a AS é o mais indicado para estimar a precisão neste caso. Nesta estimativa quanto mais próximo de 1, maior o grau de precisão experimental.

2.2.3.2 Análise estatística dos dados obtidos em ambiente controlado

Os dados obtidos em ambiente controlado não seguiram distribuição normal, portanto foi realizada a transformação dos dados pelo método de Box & Cox (1964). Para cada ensaio foram realizadas análises de variância individuais e também a análise de variância conjunta, conforme modelo matemático abaixo. As médias foram comparadas pelo teste de Scott & Knott (1974) (p ≤ 0,05) utilizando o software R software v2.15.0.

2.2.3.3 Estimativas dos componentes de variância

Para as avaliações em campo e de ambiente controlado foram estimados parâmetros genéticos e fenotípicos, variância genética, variância fenotípica, variância

ambiental, coeficiente de variação genético e herdabilidade (Tabela 2.1). Para estimação dos componentes de variância associados aos efeitos aleatórios do modelo definido na Tabela 2.1 foi utilizado o método de quadrados mínimos.

Tabela 2.1 – Estimativas dos parâmetros genéticos e fenotípicos para as médias de severidade de murcha-de-fusarium em linhagens de feijoeiro-comum.

Estimadores Legenda Expressão para as estimativas

2 − í σ g Variância genética entre linhagens

2 Variância fenotípica entre médias de σ F linhagens

2 í σe Variância ambiental

2 Herdabilidade no sentido restrito entre − í hr 100 médias QM - quadrado médio obtido na análise de variância; r - o número de repetições

2.3 RESULTADOS E DISCUSSÃO

2.3.1 Ensaios em campo

As temperaturas médias durante as safras foram distintas, a safra das águas apresentou temperaturas mais altas quando comparadas à safra de inverno (Figura 2.1). As médias das notas que representaram o índice de severidade da doença apresentadas pelas linhagens e genótipos foram mais altas nas safras das águas em relação à safra de inverno, pois a elevada temperatura e alta umidade que ocorreram no campo favoreceram a intensificação da doença conforme também foi observado por Ramalho et al. (2012). Portanto, houve maior pressão de doença na safra das águas. As testemunhas BRS Esplendor e BRS Supremo comportaram-se como resistente e suscetível, respectivamente, para murcha-de-fusarium, como esperado. Entretanto o genótipo Ouro Branco na safra de inverno mostrou-se moderadamente resistente e na safra das águas suscetível. A linhagem CNFP10132 comportou-se resistente na safra de inverno e suscetível na safra das águas.

Os resultados dos genitores nas duas safras mostraram reações diferentes do esperado, provavelmente devido à existência de raças no campo, raças essas que podem ter suplantado a resistência do genitor Ouro Branco.

Figura 2.1 – Temperaturas médias obtidas na Embrapa Arroz e Feijão (Fazenda Capivara - Lat.: 16°28´; Long.: 49°17´; Alt.: 823 m) durante o período das safras de inverno e águas. Eixo x representou o tempo: safra de inverno – 01/06/15 à 31/08/15; safra das águas – 15/12/15 à 15/03/16. Eixo y – temperatura em graus Celsius (Cº). (Fonte: Embrapa Arroz e Feijão - Ms. Silvando Carlos da Silva).

A distribuição dos resíduos apresentou distribuição normal conforme o teste de Shapiro-Wilk (1965), portanto não foi necessário proceder a transformação dos dados em nenhuma das safras avaliadas. Na análise de variância (Tabela 2.2) houve efeito significativo para linhagens e avaliação nas duas safras. Os genótipos apresentaram diferenças significativas somente na safra de inverno. A significância para avaliação demonstra que a média da primeira e da segunda foi diferente entre avaliações. Esta diferença ocorre em função da exposição das plantas ao patógeno. Não houve diferenças significativas nas interações avaliação x genótipo e avaliação x linhagem, isto é, os genótipos e as linhagens se comportaram de modo semelhante quanto ao índice de severidade da doença entre as avaliações, logo não houve mudança significativa no ranqueamento destes de uma avaliação para outra. Portanto, as linhagens com menores

médias na primeira avaliação, continuaram apresentando as menores médias na segunda (Tabela 2.2).

Tabela 2.2 - Resumo da análise de variância da severidade da murcha-de-fusarium em 144 genótipos de feijoeiro-comum - Safras de inverno/2015 e das águas/2016. Inverno/2015 Águas/2016 FV GL QM F GL QM F Repetição 2 1,44 1,55ns 2 60,37 87,06*** Grupo 1 0,32 0,34ns 1 0,51 0,74ns Linhagem 139 6,55 7,04*** 139 4,65 6,70*** Genótipo 3 3,93 4,22** 3 0,28 0,40ns Avaliação 1 129,12 138,77*** 1 27,71 39,96*** Bloco (Repetição) 33 2,82 3,03*** 33 3,66 5,28*** Avaliação x Grupo 1 0,22 0,24ns 1 0,58 0,83ns Avaliação x Linhagem 139 0,45 0,48ns 139 0,58 0,83ns Avaliação x Genótipo 3 0,37 0,40ns 3 0,33 0,48ns Resíduo 541 0,93 541 0,69 Média 3,15 6,89 CV(%) 30,57 12,85 AS 0,925 0,920 GL – graus de liberdade; QM – Quadrado médio, F – teste F (Scenedor); AS – Acurácia seletiva; CV – coeficiente de variação; ns – não significativo; ***;** e * – significativo a 0,1%, 1% e 5% de probabilidade pelo teste F.

Na análise conjunta as linhagens se comportaram diferentemente. Retratando a variabilidade dentro desta população o que possibilita uma seleção eficiente de linhagens resistentes à murcha-de-fusarium. As safras apresentaram diferenças altamente significativas, como também as interações safra x tratamento e avaliação x safra (Tabela 2.3), o que evidenciou o efeito do ambiente sobre o comportamento das linhagens frente ao aumento da severidade da doença. Portanto para obtenção de linhagens resistentes à murcha-de-fusarium é indicado avaliá-las em diferentes safras, para possibilitar a seleção destas em diferentes níveis de severidade de murcha-de-fusarium.

Tabela 2.3 - Resumo da análise de variância conjunta da severidade da murcha-de- fusarium em 144 genótipos de feijoeiro-comum. FV GL QM F Repetição 2 29,8 34,49* Avaliação 1 135,9 157,36* Grupo 1 0,8 0,91ns Tratamento 143 8,3 9,60* Linhagem 140 8,4 9,76* Genótipo 3 1,8 2,08ns Safra 1 6033,1 6984,81* Bloco (Repetição) 57 4,6 5,31* Avaliação x Tratamento 143 0,6 0,72ns Avaliação x Safra 1 18,6 21,56* Safra x Tratamento 143 2,3 2,70* Avaliação x Safra x Tratamento 143 0,4 0,46ns Resíduo 1091 0,9 Média 5,02 CV(%) 18,51 AS 0,95 GL – graus de liberdade; QM – Quadrado médio, F – teste F (Scenedor); AS – Acurácia seletiva; CV – coeficiente de variação; ns – não significativo; * – significativo a 5% de probabilidade pelo teste F.

O coeficiente de variação foi satisfatório na safra de inverno e baixo na safra das águas, bem como na análise conjunta. A acurácia seletiva foi muito alta, acima de 0,92 em todas as análises, demonstrando precisão alta dos ensaios. Portanto, as avaliações realizadas no campo possibilitaram um levantamento eficiente de linhagens resistentes, e uma seleção eficaz depende da precisão em que as avaliações são realizadas. Com a realização do teste de Scott & Knott (1974) foi possível constituir grupos em função da variabilidade entre estes grupos de médias com relação à severidade da doença (Apêndice A). Em ambas as safras as linhagens foram classificadas em cinco grupos, todavia na safra de inverno o grupo “a”, com menores médias, foi constituído de mais indivíduos, pois nesta safra a severidade da doença foi menor. Conforme Pastor-Corrales & Abawi (1987) as linhagens com médias abaixo de 3 são consideradas resistentes. Na safra de inverno foi possível obter linhagens resistentes

à murcha-de-fusarium, enquanto que na safra das águas a menor média foi 4,67, e as respectivas linhagens identificadas como moderadamente resistentes, dentro da mesma população. Na safra de inverno, 55% das linhagens apresentaram médias abaixo de 3,0. Contudo, na safra das águas, a severidade da doença foi maior, e foi possível identificar 19,29% de linhagens moderadamente resistentes à murcha-de-fusarium com médias entre 4,67 e 6,0. Costa et al. (2007) também avaliou linhagens de feijoeiro-comum quanto a reação à murcha-de-fusarium e obtiveram 20 linhagens resistentes oriundas de cada um dos cruzamentos FT Tarumã x Xamego, Milionário 1732 x Xamego, Serrano x Xamego, FT Tarumã x Diamante Negrom e Milionário 1732 x Diamante Negro. Rava et al. (1996) avaliaram em casa de vegetação 70 cultivares e 29 linhagens oriundas de diferentes instituições de pesquisa. Dentre as cultivares 8,6% mostraram reação de resistência aos dois isolados utilizados e 10% destas foram resistentes ao isolado Fop 53 e moderadamente resistente a Fop 46. Das linhagens avaliadas 24,1% foram resistentes aos dois isolados e 20,7% foram resistentes ao isolado Fop 53 e moderadamente resistente ao Fop 46. Rocha Júnior et al. (1998) avaliaram 27 cultivares e 142 linhagens oriundas do programa de melhoramento da Universidade Federal de Lavras (UFLA). Das cultivares avaliadas 22,22% mostraram-se resistentes e das linhagens somente 5,63% foram resistentes. Os demais genótipos apresentaram reação moderadamente resistentes ou suscetíveis. Pereira et al. (2011) inocularam 367 linhagens oriundas do Banco de Germoplasma da UFLA com o isolado Fop 01. Dentre estas 36,5% apresentaram resistência ao isolado de F. oxysporum f. sp. phaseoli, Fop 01. As linhagens Ouro Branco x CNFP 10132.140, Ouro Branco x CNFP 10132.49, Ouro Branco x CNFP 10132.90, Ouro Branco x CNFP 10132.48 e Ouro Branco x CNFP 10132.12 se destacaram dentre todas as linhagens avaliadas por apresentar média de severidade menor que as demais em ambas as safras (Apêndice A), pertencendo ao grupo do teste de Scott & Knott (1974) de linhagens resistentes e moderadamente resistentes, na safra das águas e safra de inverno, respectivamente. Em contraste, as linhagens Ouro Branco x CNFP 10132.160, Ouro Branco x CNFP 10132.27, Ouro Branco x CNFP 10132.156 e Ouro Branco x CNFP 10132.41 foram as mais suscetíveis em ambas as safras, apresentaram média de severidade alta (de 5,17 a 9,00). As linhagens Ouro Branco x CNFP 10132.16 e Ouro Branco x CNFP 10132.192 foram resistentes na safra de inverno e suscetíveis na safra das águas,demonstrando o efeito do ambiente na severidade de murcha-de-fusarium, conforme observado por

Ramalho et al. (2012). As linhagens Ouro Branco x CNFP 10132.54, Ouro Branco x CNFP 10132.187 e Ouro Branco x CNFP 10132.45 se comportaram de modo diferente das demais. Na safra das águas em que houve maior severidade da doença, estas três linhagens apresentaram as menores médias e foram consideradas resistentes. Entretanto, na safra de inverno onde houve menor pressão de doença, apresentaram média de severidade maior, portanto foram consideradas moderadamente resistentes. As linhagens que mantiveram-se resistentes e suscetíveis em ambas as safras, são linhagens que provavelmente possuem resistência horizontal, contendo genes de efeito menor, que conferem resistência a várias raças do patógeno. Portanto, independente da raça presente no campo, estas linhagens possivelmente apresentarão níveis consideráveis de resistência. Por outro lado, as linhagens que apresentaram-se resistentes em uma safra e suscetíveis na outra, provavelmente possuem resistência vertical, isto é, que supostamente apresentamresistência efetiva contra algumas raças do patógeno. Este resultado é possivelmente indica a existência de raças diferentes incidindo na área durante as duas safras em que foram feitas as avaliações. Os resultados demonstram que além de fatores ambientais que influenciaram na severidade da doença, as possíveis diferentes raças do patógeno influenciaram na reação das linhagens à doença. Trabalhos anteriores mostraram resultados quanto à existência de mais de uma raça no Brasil (Sala et al., 2006). Em experimentos realizados no mesmo município do presente trabalho, foram encontradas 13 raças do patógeno, e com base nos resultados obtidos, foi proposta a inserção de novas cultivares diferenciadoras para identificação de raças, uma vez que a série atual não discriminou todas as raças encontradas (Gonçalves et al., comunicação pessoal). Os genitores Ouro Branco e CNFP10132 foram escolhidos para obtenção desta população por apresentar reação contrastante em resposta à murcha-de-curtobacterium e murcha-de-fusarium, em evidências e avaliações anteriores, realizadas no Paraná e Distrito Federal (Wendland et al., 2012). Porém, no presente estudo esta resposta variou em função das condições ambientais de cada safra. O genitor CNFP 10132 se mostrou mais resistente que Ouro Branco na safra de inverno. Este comportamento foi observado, provavelmente devido a incidência de raças de F. oxysporum f. sp. phaseoli distintas entre os ensaios anteriores e os realizados no presente estudo, bem como da raça inoculada nos experimentos conduzidos em ambiente controlado. Portanto, para a realização de ensaios com estes genitores contrastantes, deve-se levar em consideração a raça do patógeno a ser avaliada na população segregante. Nos futuros ensaios a serem conduzidos, deve-se

sempre utilizar como controle, o plantio da série diferenciadora de raças de F. oxysporum f. sp. phaseoli, possibilitando a identificar a raça a qual os genótipos estão sendo expostos. Proceder também a coleta de linhagens avaliada para isolamento do patógeno e posterior inoculação em casa de vegetação nas diferenciadoras, para identificação destas raças.

2.3.2 Ensaios em ambiente controlado

Pereira et al. (2008) avaliaram diferentes métodos de inoculação incluindo o utilizado no presente trabalho e concluíram que a metodologia que melhor discrimina as linhagens de feijoeiro-comum quanto à reação ao F. oxysporum f. sp. phaseoli é a imersão de raízes na suspensão de esporos, com ou sem o corte do sistema radicular. Em ambos os ensaios foi constatada significância para grupo, linhagem, avaliação e linhagens x avaliações. Como ocorreu no campo, as linhagens também se comportaram de modo distinto conforme o ambiente, demonstrando variabilidade genética para este caráter (P≤0,01) e possibilitando a seleção de linhagens para o programa de melhoramento visando resistência à murcha-de-fusarium. As avaliações diferiram entre si ao nível 0,1% de significância, demonstrando que a média destas foram distintas, como ocorreu no campo e em ambiente controlado, devendo-se também ao fato da exposição das plantas ao patógeno. Na interação linhagens x avaliações, foram observadas diferenças significativas, o que demonstrou que as três avaliações realizadas dentro do mesmo ensaio discriminou bem as linhagens. Pela significância observada em grupo foi possível demonstrar que as linhagens e genótipos diferiram entre si em ambos os ensaios, sob condição de ambiente controlado (Tabela 2.5).

Tabela 2.5 - Resumo da análise de variância da severidade da murcha-de-fusarium em 144 tratamentos de feijoeiro-comum - Primeiro e Segundo Ensaio. Primeiro Ensaio Segundo Ensaio FV GL QM F GL QM F ** Grupo 1 37,53 19,40*** 1 7.29 7.41 *** Linhagem 136 31,43 16,25*** 136 41 41.69 *** Genótipo 3 2,1 1,09ns 3 42.22 42.93 *** Avaliação 2 365,81 189,09*** 2 437.81 445.18 *** Linhagens x avaliações 274 3,64 1,88*** 274 3.27 3.33 *** Genótipos x avaliações 6 0,38 0,19ns 6 6.08 6.18

Resíduo 840 1,93 846 0.98 Média 2,64 2,99 CV(%) 52,58 33,06 AS 0,96 0,98 GL – graus de liberdade; QM – Quadrado médio, F – teste F (Scenedor); AS – Acurácia seletiva; CV – coeficiente de variação; ns – não significativo; ***;** e * – significativo a 0,1%, 1% e 5% de probabilidade pelo teste F.

Verificou-se que os ensaios apresentaram diferenças significativas, isto é, os tratamentos se comportaram diferentemente entre os ensaios, mesmo em ambiente controlado. Este comportamento pode ter sido ocasionado por variações mínimas de temperatura ou irrigação (Tabela 2.6). Este fato é corroborado pelas interações ensaio x linhagens e ensaios x genótipos que também apresentaram diferenças significativas. Na análise conjunta, tanto genótipo quanto linhagens apresentaram comportamento diferente entre as avaliações. Estas foram realizadas com intervalo de sete dias e foi observada a intensificação dos sintomas (evolução da doença) em todos os tratamentos, o que explica as diferenças encontradas nas interações linhagens x avaliação e genótipos x avaliações (Tabela 2.6). Os coeficientes de variação da análise de variância nos dois ensaios e da análise conjunta foram mais altos do que os observados em outros trabalhos (Cândida, et al., 2009; Pereira et al., 2011). Porém a precisão experimental pode ser estimada por outros métodos como a acurácia seletiva. Este parâmetro avalia as variações de natureza genética e residual que incidem sobre o caráter que está sob avaliação (Resende & Duarte, 2007).

Tanto nas análises individuais quanto na análise conjunta a acurácia seletiva está acima de 0,96, evidenciando precisão experimental, pois nesta estimativa quanto mais próximo de um, mais preciso é o experimento.

Tabela 2.6 - Resumo da análise de variância conjunta da severidade da murcha-de- fusarium em 144 tratamentos de feijoeiro-comum em ambiente controlado. FV GL QM F *** Ensaio 1 79,29 52,63 *** Linhagem 137 58,12 38,57 *** Genótipo 3 27,75 18,42 *** Avaliação 2 799,96 531,02 *** Ensaios x Linhagens 137 14,11 9,37 *** Ensaios x Genótipos 3 16,57 10,99 *** Linhagens x Avaliações 274 5,15 3,42 * Genótipos x Avaliações 6 3,69 2,45

Resíduo 1968 1,51 Média Geral 2,82 CV 43,47 AS 0,98 GL – graus de liberdade; QM – Quadrado médio, F – teste F (Scenedor); AS – Acurácia seletiva; CV – coeficiente de variação; ns – não significativo; ***;** e * – significativo a 0,1%, 1% e 5% de probabilidade pelo teste F.

Os tratamentos (linhagens e genótipos) apresentaram cinco grupos para o primeiro ensaio e seis grupos para o segundo ensaio pelo teste Scott & Knott (1974) (Apêndice B). Nos experimentos realizados em ambiente controlado observou-se maior quantidade de linhagens resistentes do que no campo, e também somente neste ambiente foram observadas linhagens com nota que representa o índice de severidade um. Esta diferença na resposta dos genótipos pode ser explicado pela incidência de diferentes raças que estavam presentes no campo que em ambiente controlado. Em ambiente controlado utilizou-se o isolado BRM 28134 (raça 2). No campo experimental em que os ensaios deste estudo foram realizados, Gonçalves et al. (comunicação pessoal), identificou a

predominância da raça 6 pelo cultivo da série diferenciadora de Fop em 5 locais equidistantes previamente amostrados. As linhagens com médias entre 1 a 3 foram consideradas resistentes, de 3,1 a 6 moderadamente resistentes e de 6,1 a 9 suscetíveis (Pastor-Corrales & Abawi, 1987; Salgado & Schwartz, 1993). Outros autores avaliam diferentes patógenos do feijoeiro- comum com escala de notas que representa o índice de severidade da doença e também classificam os genótipos de modo semelhante ao descrito acima (Sartorato & Thung, 2002; Ragagnin et al., 2003, Wendland et al., 2012). Utilizando este critério, foi obtido 54,86% de linhagens resistentes na safra de inverno, nenhuma na safra das águas; 71,63% no primeiro ensaio em ambiente controlado e 66,66 no segundo ensaio em ambiente controlado (Figura 2.2). Em ambos ensaios realizados em ambiente controlado, as linhagens descritas na tabela acima, apresentaram-se resistentes com média de severidade da doença menor que três. Houve diferença significativa entre as linhagens quando avaliadas em campo e em ambiente controlado para todos os ensaios, representando um potencial para seleção de genótipos resistentes à F. oxysporum f. sp. phaseoli, também constatado anteriormente por Pereira et al. (2011). Neste trabalho os autores, inocularam 367 linhagens com o isolado Fop01 e identificaram 36,5% linhagens resistentes. Sala et al. (2006) também objetivaram avaliar a resistência de genótipos de feijoeiro-comum à murcha-de-fusarium, e observaramque 33% de 104 genótipos apresentaram resistência. As linhagens Ouro Branco x CNFP 10132.140 e Ouro Branco x CNFP 10132.12 foram classificados nos grupos dos genótipos mais resistentes tanto em campo, para ambas as safras, quanto em ambiente controlado, em ambos os ensaios. Em contrapartida, as linhagens Ouro Branco x CNFP 10132.48 e Ouro Branco x CNFP 10132.49 que foram as mais resistentes no campo, em ambiente controlado no entanto, foram classificadas como moderadamente resistentes (Apêndice B), indicando que estas linhagens não possuem o gene que confere resistência à raça 2 utilizada na inoculação sob ambiente controlado. Este fato comprova a variabilidade de raças do patógeno no campo, pois há pelo menos mais uma raça além da raça 2 inoculada e da raça 6 identificada como predominante. Na figura 2.2, os resultados demonstraram que foi possível identificar, o alto potencial de uso de seleção de genótipos com as inoculações de raças, pelo programa de melhoramento genético para resistência a esta doença. Uma metodologia eficiente de

avaliação e classificação de linhagens utilizando uma escala de notas que representa o índice de severidade da doença é aquela que permite discriminar todos os tratamentos avaliados (Pereira et al., 2011). Isto pode ser observado no presente trabalho uma vez que os tratamentos avaliados receberam notas de um a nove, isto é, compreendendo toda a amplitude da escala de notas que representam o índice de severidade da doença utilizada (Figura 2.2). Isto também foi observado por Pereira et al. (2011) e Pereira et al. (2008) que avaliaram linhagens de feijoeiro-comum inoculadas com F. oxysporum f. sp. phaseoli e também observaram a distribuição das notas em toda amplitude da escala.

Notas de Severidade

Figura 2.2 – Distribuição de frequência das notas que representam o índice de severidade da doença de severidade das linhagens de feijoeiro-comum inoculadas com Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli (Inverno e águas – safras de experimento em campo; 1º e 2º ensaio – experimentos em ambiente controlado).

As avaliações para estimar a AACPD foram realizadas aos 15, 21 e 28 dias, retratou a grande diferença de notas que representou o índice de severidade da doença entre as linhagens resistentes e suscetíveis (Apêndice C). Batista et al. (2016) afirmaram que após 21 dias da inoculação, é a época ideal para realizar as avaliações de murcha-de- fusarium e determinar a reação dos genótipos (resistente, moderadamente resistente e suscetível) com base na severidade do patógeno. O presente trabalho compreendeu os dias

anteriores e posteriores (21 dias) usualmente utilizados por outros autores (Pastor-Corrales & Abawi 1987, Cândida et al. 2009, Pereira et al. 2009; Batista et al., 2016), portanto estima satisfatoriamente a severidade da doença. As linhagens Ouro Branco x CNFP 10132.113, Ouro Branco x CNFP 10132.71 e Ouro Branco x CNFP 10132.91 foram as mais resistentes com os menores valores de AACPD em ambos os ensaios (18,00). As linhagens Ouro Branco x CNFP 10132.142, Ouro Branco x CNFP 10132.67, Ouro Branco x CNFP 10132.41 e Ouro Branco x CNFP 10132.45 obtiveram os maiores índices (113.67 – 138,17) (Apêndice C). Contudo, a linhagem Ouro Branco x CNFP 10132.45 esteve entre o grupo das linhagens moderadamente resistentes na safra das águas no campo, isto é, sua resistência possivelmente varia em função da raça do patógeno que incide na planta, uma vez que a linhagem mostrou-se suscetível à raça inoculada sob ambiente controlado. Na Figura 3 é possível visualizar a divisão das médias dos grupos definidos pelo teste de Scott & Knott (1974). No primeiro ensaio observaram-se as linhagens agrupadas em três grupos e no segundo ensaio em sete grupos, explicando a diferença significativa encontrada entre ensaios (Tabela 2.6). Pereira et al. (2008) ao avaliar linhagens de feijoeiro-comum também observaram interação entre ensaio x linhagem. Porém estes autores verificaram que as linhagens resistentes tiveram comportamento semelhante nas avaliações e as linhagens suscetíveis que apresentaram mudanças no comportamento entre as avaliações, o que também pode ser observado no presente trabalho. As linhagens que apresentaram médias baixas na primeira avaliação, assim permaneceram nas demais. As linhagens suscetíveis exibiram mudança de comportamento com sintomas acentuados. Batista et al. (2016) avaliaram 15 híbridos (F1) de feijoeiro- comum e observaram estimativas de AACPD de 6,00 à 45,25. Os genitores, a testemunha BRS Esplendor e 87 linhagens avaliadas no presente trabalho apresentaram AACPD abaixo desta estimativa, portanto estimar AACPD foi eficaz para diferenciar genótipos. Ao grupo “a” pertence as linhagens com menores índices de AACPD, não diferindo estatisticamente entre si. No primeiro ensaio foram observadas 111 linhagens resistentes e no 2ª ensaio 69. Sessenta e três linhagens pertenceram ao grupo “a” (mais resistentes) em ambos os ensaios (Apêndice C). Neste grupo também foi classificada a testemunha resistente BRS Esplendor. Portanto há a possibilidade de seleção de linhagens resistentes dentro do grupo “a” para desenvolvimento de material resistente à murcha-de- fusarium.

Figura 2.3 – Resumo da estimativa da área abaixo da curva do progresso da doença (AACPD) nos dois ensaios de avaliação da severidade de murcha-de-fusarium em genótipos de feijoeiro-comum (Apêndice C).

2.3.3 Estimativas dos componentes de variância para médias de severidade de murcha-de-fusarium em genótipos de feijoeiro-comum, em condições de campo e ambiente controlado

2 A herdabilidade ( hr ) fornece a proporção da variância genética presente na variância fenotípica total (Ramalho et al., 2012), Ao estimá-la a para ambas as safras em campo e ambos os ensaios em ambiente controlado, observaram-se valores elevados

2 (Tabela 2.9). Os altos valores de hr sugere que a seleção para resistência à F. oxysporum f. sp. phaseoli dentre estas linhagens, será bem sucedida. A magnitude da variância genética foi superior à variância ambiental para todos os ambientes, demonstrando que para todos os ambientes, o fenótipo foi mais influenciado pelo genótipo que pelo ambiente.

2 Tabela 2.9 – Estimativas de variância genética de linhagens ( σ g ), variância fenotípica 2 2 2 entre as linhagens ( σ F ) variância ambiental ( σe ) e herdabilidade no sentido restrito ( hr ) para médias de severidade de murcha-de-fusarium em genótipos de feijoeiro-comum. Parâmetros

2 2 2 2 Ambientes σ g σ F σe hr Inverno 1,87 2,18 0,31 85,80 Campo Águas 1,32 1,55 0,23 85,16

Ambiente 1º Ensaio 9,83 10,48 0,64 93,86 controlado* 2º Ensaio 1 1,03 0,03 97,09 *Dados de ambiente controlado transformados pelo método de Box & Cox (1964).

A herdabilidade observada tanto nos dados de campo, em ambas as safras, quanto nos dados de ambiente controlado, em ambos os ensaios (Tabela 2.6) foram altas, o que também foi observado por outros autores (Pereira et. al., 2009, 2011; Cross et al., 2000; Cândida et al., 2009). Conforme Pereira et. al., (2011) estimativas de alta herdabilidade eram esperadas (85%), pois utilizou-se escala de notas para avaliar o índice de severidade da doença. Estes autores relatam que a resistência à murcha-de-fusarium envolve poucos genes de dominância, porém Pereira et al. (2008) não descarta a participação de outros genes de efeito menor na expressão deste caráter. Ribeiro & Hagedorn (1979a) observaram que a resistência aos isolados 2107-A e ATCC18131 é controlada por um alelo dominante, e este está presente nas cultivares Early Gallatin, Tenderete e Pintado. No presente estudo obteve-se estimativas de herdabilidade de 85,80 para safra de inverno e 85,16 para safra das águas no campo enquanto que em ambiente controlado as estimativas foram mais altas com 93,86 no primeiro ensaio e 97,09 para o segundo ensaio. Cross et al. (2000) também encontrou herdabilidade alta (85%) quando avaliou genótipos de feijoeiro-comum inoculados com o isolado pertencente à raça 4. Pereira et al. (2009) obtiveram herdabilidade no sentido restrito entre 34% e 42% nos cruzamentos estudados. Resultados obtidos por Cândida et al. (2009) demonstraram houve variação genética, portanto há a possibilidade de seleção de linhagens para a resistência à murcha-de-fusarium. As estimativas de herdabilidade foram altas tanto para as famílias obtidas do cruzamento de Milionário 1723 x Macanudo (87,45%) e quanto para as oriundas do cruzamento de Macanudo x FT Tarumã (94,4).

Foi possível selecionar linhagens resistentes à F. oxyporum f. sp. phaseoli baseado em experimentos de campo e de ambiente controlado. Como a herdabilidade do caráter estudado é alta, isso indica que as seleções serão bem sucedidas visando resistência à este patógeno (Tabela 2.10). As linhagens Ouro Branco x CNFP 10132.140, Ouro Branco x CNFP 10132.49, Ouro Branco x CNFP 10132.12, Ouro Branco x CNFP 10132.90 e Ouro Branco x CNFP 10132.48 foram as que obtiveram melhores respostas à infestação de F. oxysporum f. sp. phaseoli em campo e em ambiente controlado. Os genótipos utilizados neste estudo também foram avaliados quanto a reação á murcha-de-curtobacterium em ensaios anteriroes. Quanto a reação à Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens a linhagem Ouro Branco x CNFP 10132.90 foi superior as demais, uma vez em dois dos três ensaios realizados, se mostrou moderadamente resistente. Essa linhagem possui grão preto e massa de 100 grãos no valor de 19,72g, superior à testemunha resistente BRS Esplendor que é de 19,34 g. A cultivar BRS Esplendor é resistente à murcha-de-curtobacterium e para murcha-de-fusarium e apresentou médias altas somente na safra das águas, em que a pressão da doença foi maior (Tabela 2.10). A linhagem Ouro Branco x CNFP 10132.140 apresentou menor valor de AACP para murcha-de-fusarium dentre as linhagens mais resistentes (Tabela 2.10). Esta linhagem possui grão branco e massa de 100 grãos de 37,56g, porém ao compará-la com o genitor Ouro Branco, que também possui grão branco, observou-se que a linhagem possui massa de 100 grãos menor que a do genitor (55,17g), devido ao menor tamanho das sementes da linhagem. Nas avaliações para a murcha-de-curtobacterium, esta linhagem foi moderadamente resistente em um dos ensaios de casa de vegetação, enquanto o genitor Ouro Branco é resistente à esta doença.

Tabela 2.10 – Características de genitores, testemunhas e linhagens resistentes à murcha-de-fusarium pertencentes à população de feijoeiro- comum oriundas do cruzamento Ouro Branco x CNFP 10132. 1 Reação à murcha-de-fusarium Reação à murcha-de- AACPD 2 Peso de 100 Campo Ambiente controlado curtobacterium Tratamentos Cor do grão (Média) grãos (g) Safra de Safra das 1º 2º 1º 2º 3º Inverno Águas Ensaio Ensaio Ensaio Ensaio Ensaio Ouro Branco x CNFP Branco 37,56 R MR R R 29,33 MR S S 10132.140 Ouro Branco x CNFP 10132.49 Predominantemente 25,67 R MR R R 30,50 S S S Branco Ouro Branco x CNFP 10132.12 Bege 27,80 R MR R R 31.67 S MR S Ouro Branco x CNFP 10132.90 Preto 19,72 R MR MR R 35,83 S MR MR Ouro Branco x CNFP 10132.48 Carioca 22,79 R MR MR R 50,00 S MR S CNFP 10132 Preto 23,81 R S R R 20,83 S4 BRS Esplendor Preto 19,34 R S R R 25,83 R3 Ouro Branco Branco 55,17 MR S R R 26,17 R4 BRS Supremo Preto 19,92 R S R MR 64,50 R3 1 Reação baseada na classificação de Pastor-Corrales & Abawi, (1987) em que o tratamento com médias entre 1 a 3 foram consideradas resistentes (R), de 3,1 a 6 moderadamente resistentes (MR) e de 6,1 a 9 suscetíveis (S). 2 Fonte: Embrapa Arroz e Feijão - Avaliações realizadas em casa de vegetação em três ensaios diferentes, utilizando isolado BRM 14946. Escala de notas que representam o índice de severidade da doença proposta por Wendland et al. (2008). 3 Reação à murcha-de-curtobacterium obtida por média de notas que representam o índice de severidade da de sete ensaios em cinco locais diferentes (Londrina – PR; Tibagi – PR; Pato Branco – PR; Guarapuava - PR (safras das aguas e seca); Ponta Grossa – PR (safras das aguas e seca) (Wendland et al., 2012). 4 Reação à murcha-de-curtobacterium (Valdo et al., 2016).

2.4 CONCLUSÕES

- Houve influência das condições ambientais (safra das águas e de inverno) na inversão da reação de linhagens para a murcha-de-fusarium; - Foi evidenciada a presença de resistência vertical entre as linhagens avaliadas, devido à mudança da reação de resistência para suscetibilidade em função da raça inoculada e das raças presentes no campo; - Foi observada a presença de resistência horizontal nas linhagens que se apresentaram resistentes em todos os ambientes de avaliação, isto é, resistência a várias raças do patógeno; - Foi possível obter linhagens de feijoeiro-comum oriundas do cruzamento Ouro Branco x CNFP10132 resistentes à murcha-de-fusarium. Das linhagens avaliadas, 54,86% e 71,63% foram resistentes em campo e em ambiente controlado, respectivamente; - A seleção de linhagens resistentes foi eficiente e a herdabilidade do caráter foi alta em todos os ambientes em que as linhagens foram avaliadas; - As linhagens Ouro Branco x CNFP 10132.90 e Ouro Branco x CNFP 10132.140 foram as mais promissoras para seleção e uso no programa de melhoramento do feijoeiro-comum por agregar características morfológicas favoráveis, resistência à murcha-de-fusarium e moderada resistência à murcha-de-curtobacterium.

2.5 REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS

AGRIOS, G. H. Control of plant diseases In: AGRIOS, G. H. (Ed.). Plant pathology. 5. ed. Burlington: Elevier Acadmic Press, 2005. v. 1, cap. 9, p. 319-377

ALVES-SANTOS, F. M.; CORDEIRO-RODRIGUES, L.; SAYAGUÉS; MARTÍN- DOMÍNGUEZ, R.; GARCÍA-BENAVIDES, P.; CRESPO, M. C.; DÍAZ-MÍNGUEZ, J. M.; ESLAVA, A. P. Pathogenicity and race characterization of Fusarium oxysporum f. sp. Phaseoli isolates from Spain and Greece. Plant Pathology, v. 51, p. 605-611, 2002.

BALARDIN, R. S.; PASTOR-CORRALES. M. A.; OTOYA, M. M. Resistência de germoplasmas de feijão (Phaseolus vulgaris) a Fusarium oxysporum f.sp. phaseoli. Fitopatologia Brasileira, Brasília, v. 15, n. 1, p. 102-103, 1990.

BATISTA, R. O.; OLIVEIRA, A. M. C.; SILVA, J. L. O.; NICOLI, A.; CARNEIRO, P. C. S.; CARNEIRO, J. E. S.; PAULO JÚNIOR, J.; QUEIROZ, M. V. Resistance to Fusarium wilt in common bean. Crop Breeding and Applied Biotechnology, Viçosa, v. 16, p. 226- 233, 2016.

BOX, G. E. P.; COX, D. R. An analysis of transformations, Journal of the Royal Statistical Society, Series B, v. 26, p. 211-252, 1964.

BURUCHARA, R. A.; CAMACHO, L. Common bean reaction to Fusarium oxysporum f.sp. phaseoli, the cause of severe vascular wilt in Central Africa. Journal of Phytopathology, v. 148, p. 39-45, 2000.

CAMARGO, L. E. A.; BERGAMIN FILHO, A. Controle genético. In: AMORIM, L.; REZENDE, J. A.M.; BERGAMIN FILHO, A. (Ed.). Manual de Fitopatologia – Princípios e Controle. 4. ed. Viçosa: Agronômica Ceres, 2013. v.1, cap. 15, p. 729-758.

CAMPBELL, C. L.; MADDEN, L. V. Introduction to plant disease epidemiology. 1990. 532 p.

CÂNDIDA, D. V.; COSTA, J. G. C.; RAVA, C. A.; CARNEIRO, M. S. Controle genético da murcha do fusário (Fusarium oxysporum) em feijoeiro comum. Tropical Plant Pathology, Brasília, v. 34, n. 6, p. 379-384, 2009.

CONAB. Companhia Nacional de Abastecimento. 2015. Disponível em: . Acesso em: 10 maio. 2017.

COSTA, A.S.V.; VIEIRA, C.; CRUZ, C.D.; CARDOSO, A.A. Comportamento de cultivares de feijão (Phaseolus vulgaris) em dez ambientes compreendendo cinco sistemas de produção. Revista Ceres, Viçosa, n.256, p. 676-700, 1997.

COSTA, J. G. C.; RAVA, C. A.; PURÍSSIMO, J. D. Obtenção de linhagens de feijoeiro comum resistentes a murcha-de-fusário. Ceres, Viçosa, v. 54, n. 315, p. 447-452, 2007.

CRAMER, R. A.; BYRNE, P. F.; BRICK, M. A.; PANELLA, L.; WICKLIFFE, E.; SCHWARTZ, H. F. Characterization of Fusarium oxysporum isolates from common bean 38

and sugar beet using pathogenicity assays and randon-amplified polymorfhic DNA markers. Journal of Phytopathology, v. 151, p. 352-360, 2003.

CROSS, H.; BRICK, M. A.; SCHWARTZ, H. F.; PANELLA, L. W.; BYRNE, P. F. Inheritance of resistance to Fusarium wilt in two common beans races. Crop Science, Madison, v. 40, p. 954-958, 2000.

FERREIRA, D. F. Sistema para análise de variância para dados balanceados (SISVAR). UFLA: Lavras, 1999.

KENDRICK, J. B.; SNYDER, W. C. Fusarium yellows of bean. Phytopathology, v. 32, p. 1010-1014, 1942.

KIMATI, H.; BERGAMIN FILHO, A. Princípios gerais de controle. In: AMORIM, L.; REZENDE, J. A.M.; BERGAMIN FILHO, A. (Ed.). Manual de Fitopatologia – Princípios e Controle. 4. ed. Viçosa: Agronômica Ceres, 2013. v.1, cap. 14, p. 692-709.

NASCIMENTO, S. R. C.; MARINGONI, A. C.; KUROZAWA, C. Comportamento de variedades e linhagens de feijoeiro ao Fusarium oxysporum f.sp. phaseoli. Fitopatologia Brasileira, Brasília, v. 20, n. 3, p. 458-463, 1995.

NELSON, P. E.; TOUSSON, T. A.; MARASAS, W. F. Fusarium species: an illustrated manual for identification. Pennsylvania/London: The Pennsylvania State University/University Park and London, 1983. 193 p.

PASTOR-CORRALES, M. A.; ABAWI, G. S. Reactions of selected bean germplasms to infection by Fusarium oxysporum f.sp. phaseoli. Plant Disease, v. 71, n. 11, p. 990-993, 1987.

PEREIRA, M. J. Z.; RAMALHO, M. A. R.; ABREU, A. F. B. Estratégias para eficiência da seleção de feijoeiro quanto à resistência à murcha-de-fusário. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 43, n. 6, p. 721-728, 2008.

PEREIRA, M. J. Z.; RAMALHO, M. A. R.; ABREU, A. F. B. Iheritance of resistance to Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli brazilian race 2 in common bean. Scientia Agricola, Piracicaba, v. 66, n. 6, p. 788-792, 2009.

PEREIRA, M. J. Z.; RAMALHO, M. A. R.; ABREU, A. F. B. Reação de linhagens de feijoeiro ao fungo Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli em condições controladas. Ciência Agrotécnica, Lavras, v. 35, n. 5, p. 940 -947, 2011.

PIZA, S. M. T. Patogenicidade de Fusarium oxysporum f.sp. phaseoli e reação de germoplasma de feijoeiro (Phaseolus vulgaris). Summa Phytopathologica, Botucatu, v. 19, n. 3/4, p. 165-167, 1993.

RAGAGNIN, V. A.; ALZATE_MARIN, A. L.; SOUZA, T. O. P.; ARRUDA, K. M. A.; MOREIRA, M. A.; BARROS, E. G. Avaliação da resistência de isolinhas de feijoeiro ao Colletotrichum lindemuthianum, Uromyces appendiculatus e Phaeoisariopsis griseola. Fitopatologia Brasileira, Brasília, v. 28, n. 6, p. 591-596, 2003.

RAMALHO. M. A P.; ABREU, A. F. B.; CARNEIRO, J. E. S.; WENDLAND, A.; PAULA JÚNIOR, T. J.; VIEIRA, R. F.; DEL PELOSO, M. J.; LOBO JUNIOR, M.; PEREIRA, A. C. Murcha-de-fusarium. In: JÚNIOR, T. J. D. P.; WENDLAND, A. (Ed.). Melhoramento genético do feijoeiro-comum e prevenção de doenças. Viçosa: EPAMIG, 2012. p. 127-138.

RAVA, C. A.; SARTORATO, A.; COSTA, J. G. C. Reação de genótipos de feijoeiro comum ao Fusarium oxysporum f.sp. phaseoli em casa de vegetação. Fitopatologia Brasileira, Brasília, v. 21, n. 2, p. 296-300, 1996.

RESENDE, M. D. V.; DUARTE, J. B. Precisão e controle de qualidade em experimentos de avaliação de cultivares. Pesquisa Agropecuária Tropical, Goiânia, v. 37, n. 13, p. 182- 194, 2007.

RIBEIRO, C. A.G.; FERRAZ, S. Resistência varietal do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.) a Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli. Fitopatologia Brasileira, Brasília, v. 9, n 1, p. 37-44, 1984.

RIBEIRO, R. L. D.; HAGEDORN, D. J. Inheritance and nature of resistance in beans to Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli. Phytopathology, Madison, v. 69, p. 859-861, 1979a.

RIBEIRO, R. L. D.; HAGEDORN, D. J. Screening for Resistance to and Pathogenic Specialization of Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli, the Causal Agent of Bean Yellows. Phytopathology, Madison, v. 69, n. 3, p. 272-276, 1979b.

ROCHA JÚNIOR, W. C.; SANTOS, J. B.; MENDESCOSTA, M. C. Reação de cultivares e linhagens de feijão à Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli. Fitopatologia Brasileira, Brasília, v. 23, n. 3, p. 407-409, 1998.

SALA, G. M.; ITO, M. F.; CARBONELL, S. A. M. Reação de genótipos de feijoeiro comum a quatro raças de Fusarium oxysporum f.sp. phaseoli. Summa Phytopathologica, Botucatu, v. 32, n. 3, p. 286-287, 2006.

SALGADO, M. O.; SCHWARTZ, H. F. Physiological specialization end effects of inoculum concentration on Fusarium oxysporum f.sp. phaseoli in common beans. Plant Disease, v. 79, n. 5, p. 492-496, 1993.

SARTORATO, A., Desafios no controle de doenças na cultura do feijoeiro na região Centro-Oeste. In: VI SEMINÁRIO SOBRE PRAGAS, DOENÇAS E PLANTAS DANINHAS DO FEIJOEIRO, 2006, Campinas. Anais... Campinas: Instituto Agronômico. p. 15-17.

SARTORATO A.; RAVA, C. A. Murcha ou amarelecimento de Fusarium. In: SARTORATO, A.; RAVA C. A. (Ed.) Principais doenças do feijoeiro comum e seu controle. Brasília, EMBRAPA-SPI, Brasília, p.175-190, 1994.

SARTORATO, A.; THUNG, M. Determinação da variabilidade patogênica de Phaeoisariopsis griseola e avaliação da mancha angular. In: TALLER INTERNACIONAL

SOBRE LA MANCHA ANGULAR DEL FRIJOL, 1., 2002, Santo Antônio de Goiás, GO. Memórias... Disponível em: . Acesso em: 10 jul. 2017.

SCOTT, A. J.; KNOTT, M. A cluster analysis method for grouping means in the analysis of variance. Biometrics, Arlington, v. 30, n. 3, p. 507-512, 1974.

SHAPIRO, S. S.; WILK, M. B. An Analysis of Variance Test for Normality (Complete Samples). Biometrika, Oxford, v. 52, n. 3/4, p. 591-611, 1965.

SCHOONHOVEN, A.A.S.; PASTOR-CORRALES, M.A. Standard system for the evaluation of bean germplasm. Cali : CIAT, 1987. 54p.

WENDLAND, A.; ALENCAR, N. E.; MELO, L. C.; COSTA, J. G. C. D.; DEL PELOSO, M. J.; PEREIRA, H. S.; FARIA, L. C. D.; CÔRTES, M. V. D. C. B.; BRONDANI, R. P. V. Padrão de sintomas de isolados de Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens em dois genótipos de feijoeiro comum. In: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 33. Embrapa Arroz e Feijão, 2008.

WENDLAND, A.; MODA-CIRINO, V.; DEL PELOSO, M. J.; COSTA, J. G. C. D. OLIVEIRA, M. I. S.; LIMA, S. C. D.; ARAÚJO, L. G. Murcha-de-curtobacterium. In: JÚNIOR, T. J. D. P.; WENDLAND, A. (Ed.). Melhoramento genético do feijoeiro- comum e prevenção de doenças. Viçosa, EPAMIG, Viçosa, p. 111-124, 2012.

3 MAPEAMENTO DE LOCOS LIGADOS À RESISTÊNCIA À MURCHA-DE-FUSARIUM EM FEIJOEIRO-COMUM

RESUMO

Dentre as doenças que acometem o feijoeiro-comum está a murcha-de-fusarium com grande importância econômica, causando perdas de até 80% da cultura. O principal método de controle da doença é a resistência genética. A identificação de QTLs que controlam a resistência à murcha-de-furasium é uma das abordagens utilizadas pelos programas de melhoramento. O objetivo deste trabalho foi identificar marcadores SSR e SNP's ligados a QTLs associados à resistência do feijoeiro-comum à murcha-de-fusarium utilizando 92 linhagens recombinantes endogâmicas (RILs) derivadas do cruzamento Ouro Branco x CNFP10132. As linhagens F5:7 foram avaliadas na safra das águas e de inverno, e em dois ensaios em ambiente controlado para avaliações fenotípicas. As notas que representam a severidade da doença obtidas foram submetidas à análise de variância e teste de Scott- Knott. O material vegetal foi coletado e o DNA de 92 linhagens e dos genitores foi extraído para genotipagem de marcadores SSRs e SNPs. Estes marcadores foram alinhados no genoma andino de feijoeiro-comum visando obter a distribuição destes ao longo do genoma. Para identificação dos QTLs foi empregado o método de mapeamento por marcas simples (análise de QTLs por meio da regressão linear). Foram considerados marcadores significativos os que apresentaram p-valor<0,05. Foram identificados 104 QTLs associados à resistência à murcha-de-fusarium ligados à 93 marcadores distribuídos nos cromossomos 1, 5, 6, 7, 9 e 10. Os marcadores PV 115, PV 251, BARC-PV-0004089, BARC-PV-0004548, BARC-PV-0003450, BARC-PV-0006051, BARC-PV-0003368, BARC-PV-0005477 e BARC-PV-0004897 foram significativos em mais de um ambiente. Para anotação gênica, abrangeu-se 500 kb anterior e posterior à localização dos 24 marcadores que apresentaram significância p<0,01 para identificação de transcritos relatados no genoma do feijoeiro-comum. Um total de 960 transcritos codificados foram anotados. Dentre os 24 marcadores, um se localizou dentro de um gene e os demais próximos a genes, com distâncias que variaram de 0,843 a 499,77 kb. Somente o marcador BARC-PV-0003450 foi altamente significativo nos dois ensaios em ambiente controlado (p<0,001) e na safra de inverno (p<0,01) e explicou até 21,5% da variância fenotípica. Este marcador está localizado no cromossomo 8 a uma distância de 338,54 kb do gene Phvul.008G014700. Este gene está associado à proteína putativa RPP13 que está relacionada com resistência a doenças, identificada em Arabidopsis thaliana. Esta proteína pertence à terceira classe de genes de resistência que englobam domínios Sítio de Ligação de Nucleotídeo (NBS; Nucleotide Binding Site) e Repetições Ricas em Leucina (LRR; Leucine Rich Repeats). Este último domínio está envolvido no reconhecimento do patógeno pelo hospedeiro durante o processo de infecção. Portanto, este marcador é indicado para ser utilizado na Seleção Assistida por Marcadores Moleculares com o objetivo de desenvolvimento de cultivares resistentes à murcha-de-fusarium.

Palavras-chave: Phaseolus vulgaris, resistência genética, QTLs, marcadores moleculares.

ABSTRACT

Among the diseases that affect common bean is fusarium wilt causing losses of up to 80% of crops. Genetic resistance to fusarium wilt is the main strategy for disease control. Identiffication of QTLs that control fusarium wilt resistance in common bean is one of the approaches used by breeding programs. The aim of this study was to identify SSR markers and QTL-linked SNPs associated with the resistance of common bean to fusarium wilt using 92 recombinat inbred lines(RILs)) resulted from the crossing between Ouro Branco x CNFP10132. The F5:7 lines were evaluated in the rainy season crop and winter crop, in field and in two controlled environment trials for phenotypic evaluations. The disease severity index data were submitted to variance analysis and Scott Knott's test. Vegetal material was collected and DNA was extracted from 92 lines and from genitors for genotyping with SSRs and SNPs. These markers were aligned in the andean genome of common bean to obtain the distribution of these along the genome. The method of single marker (analysis of QTLs based on linear regression) was used to identify QTLs associated with fusarium wilt resistance. Significant markers were those with p-value <0.05. There were 104 identified QTLs associated with fusarium wilt resistance linked to 93 markers distributed on chromosomes 1, 5, 6, 7, 9 and 10. Among these, were considered significant in more than one environment PV 115, PV 251, BARC-PV-0004089, BARC-PV-0004548, BARC-PV-0003450, BARC-PV-0006051, BARC-PV-0003368 , BARC-PV-0005477 and BARC-PV-0004897. For gene annotation it encompassed 500 kb before and after the location of the 24 markers that showed significance p <0.01 for the identification of transcripts reported in the genome of the common bean. A total of 960 coded transcripts were annotated. Among the 24 markers, one was located within a gene and the others markers were close to genes, with distances varying from 0.843 to 499.77 kb. However only the BARC-PV-0003450 marker was highly significant in the two environment controled trials (p <0.001) and winter crop (p<0.01) that explained up to 21.5% of the phenotypic variance. This marker is located on the chromosome 8 at 338.54 kb distance from gene Phvul.008G014700 which is associated with the putative protein RPP13 related to disease resistance, identified in Arabidopsis thaliana. This protein belongs to the third class of resistance genes that encompasses the domain called Nucleotide Binding Site (NBS) and Leucine Rich Repeats (LRR) domain that is involved in the recognition of the pathogen by the host during the infection process. Therefore, this marker is suitable for marker-assisted selection aiming the development of cultivars resistant to fusarium wilt.

Key word: Phaseolus vulgaris, genetic resistance, QTLs, molecular markers.

3.1 INTRODUÇÃO

O feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris L.) representa fonte de minerais e proteína na dieta de grande parte da população em países em desenvolvimento principalmente pelas classes sociais menos beneficiadas (Carneiro et al., 2012). O Brasil é o maior produtor de feijoeiro-comum do mundo atingindo anualmente 2.670.735 toneladas (Embrapa Arroz e Feijão, 2017), distribuídas em três safras cultivadas em vários ambientes diferentes. Contudo, a produtividade pode ser afetada pela ocorrência de diferentes patógenos, nas diferentes safras e locais onde é cultivado (Barros & Souza, 2012). Dentre as doenças que acometem cultura do feijoeiro-comum se encontra a murcha-de-fusarium ocasionada pelo fungo Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli. O pivô central permitiu o cultivo sucessivo de feijoeiro-comum, com isso também ocorreu o aumento de doenças, dentre elas a murcha-de-fusarium (Ramalho et al., 2012). Na ocorrência de altas temperaturas associada à alta umidade, esta doença causou perdas de até 80%, pois ocasiona na maioria das vezes a morte das plantas (Cramer et al., 2003). O patógeno impede a passagem de água e sais mineirais para parte aérea das plantas por meio da obstrução dos vasos xilemáticos (Mace et al., 1981; Saettler, 1991), o que ocasiona os sintomas de flacidez, amarelecimento das folhas, murcha e morte das plantas (Wendland et al., et al., 2012). Uma das melhores formas de controle é utilizando cultivares resistentes e a caracterização genética de cultivares resistentes é muito importante para melhoria da cultura (Oblessuc et al., 2012). Para obtenção de cultivares resistentes é necessário conhecer o sistema que controla a característica avaliada e que contribui para a variação genética associada à variável contínua. A denominação QTL (Quantitative Trait Loci – loco de caráter quantitativo) foi sugerida para os locos que contribuem para a variância do caráter quantitativo (Gelderman, 1975). Os caracteres quantitativos são os que possibilitam a classificação de indivíduos em classes distintas, isto é, não é possível uma diferenciação marcante entre os indivíduos estudados. Estes caracteres são controlados por muitos genes, ou seja, poligênicos, fazendo com que o efeito destes genes sobre o caráter seja pequeno (Allard, 1999). De acordo com Cândida et al. (2009) a resistência à murcha-de-fusarium é uma característica oligogênica. Um caráter é denominado poligênico quando locos contribuem para a variação genética associada à uma variável contínua, logo QTL (loco de um caráter

quantitativo) é qualquer loco que contribui para a variância do caráter (Gelderman, 1975; Thoday, 1977). Com a utilização de marcadores moleculares é possível mapear e estimar a magnitude dos efeitos de QTLs. O mapeamento de caracteres quantitativos permite a localização de QTLs responsáveis direta ou indiretamente pela expressão de distintos caracteres de interesse em diversas espécies (Ferreira & Grattapaglia, 1998). Estudos com mancha angular identificaram genes dominantes responsáveis por conferir a resistência a esta doença, são eles Phg - 1, Phg - 2, Phg - 3, Phg - 4, Phg - 5 e Phg - 6 (Carvalho et al., 1998; Gonçalves-Vidigal et al., 2011, Mahuku et al., 2004; Caixeta et al., 2005; Sartorato et al., 2000; Mahuku et al., 2011 Lópes et al., 2003; Mahuku et al., 2009). Oblessuc et al. (2012) identificaram sete QTL’s em cinco diferentes grupos de ligação, dentre estes quatro não tinham ainda sido reportados em mancha angular. Em antracnose os genes de resistência Co-1, Co-2, Co-4, Co-42, Co-5, Co-6 foram identificados em diferentes grupos de ligação e em cultivares distintas (Young & Kelly, 1996 e 1997; Adam Blondon et al., 1994; Alzate-Marin et al. 1999a, 1999b; Young et al., 1998). Foram identificados por vários autores 30 QTLs associados à resistência à Fusarium solani ligados à diferentes tipos de marcadores (Schneider et al., 2001; Chowdhury et al., 2002; Roman-Aviles & Kelly, 2005; Hagerty et al., 2015). Os genes Ur- 3, Ur-4, Ur-5, Ur-6, Ur-7, Ur-9, Ur-11, Ur-12, Ur-13 e Ur-14 condicionam a resistência Uromyces appendiculatus causador da ferrugem em feijoeiro-comum (Augustin et al. 1972; Ballantyne 1978; Stavely 1984; Grafton et al. 1985; Luannfinke et al. 1986; Jung et al. 1998; Liebenberg & Pretorius 2004; Souza et al. 2011). A utilização de marcadores moleculares no melhoramento de plantas se tornou uma ferramenta relevante pois oferece inúmeras alternativas de aplicabilidade como na organização de coleções nucleares, teste de paternidade, identificação de duplicatas, seleção assistida por marcadores moleculares, mapeamento e/ou análise de QTLs, dentre outros (Eichenberg et al., 2000). A análise de QTLs por meio do método de regressão, baseado no modelo linear com efeitos fixos, é empregado para estimar a significância estatística da associação entre um caracter quantitativo (fenótipo) e um loco marcador (Edwards et al., 1987). Identificar locos marcadores ligados a um QTL, possibilita a seleção de indivíduos com base no fenótipo do marcador, sem que precise avaliar o fenótipo da característica. Esta abordagem é conhecida como seleção assistida por marcadores moleculares. Este tipo de seleção reduz custos e tempo com as avaliações das características de interesse (Souza, 2001).

Houve um aumento no desenvolvimento e utilização de marcadores moleculares para o feijoeiro-comum. Dentre os objetivos estão os estudos com resistência à doenças (Barros & Souza, 2012). Diante disto este trabalho objetiva identificar marcadores SSR e SNP's ligados a QTLs associados à resistência do feijoeiro-comum à murcha-de-fusarium utilizando 92 linhagens recombinantes endogâmicas (RILs) derivadas do cruzamento Ouro Branco x CNFP10132, com o proprósito de contribuir com o programa de melhoramento de feijoeiro-comum da Embrapa Arroz e Feijão por meio dos resultados obtidos neste estudo.

3.2 MATERIAL E MÉTODOS

3.2.1 Material Vegetal

A cultivar Ouro Branco foi desenvolvida pelo Centro Internacional de Agricultura (CIAT) é resistente à murcha-de-fusarium, apresenta altas produtividades em monocultivo e em consórcio, como também em diferentes safras do feijoeiro-comum (Costa et al., 1997) pertencente ao pool gênico Andino. A linhagem CNFP10132 foi desenvolvida pela Embrapa Arroz e feijão e apresenta alto valor agronômico, grão tipo preto e é suscetível à murcha-de-fusarium, pertencente ao pool gênico Mesomaericano. As testemunhas (BRS Esplendor e BRS Supremo) e os genitores foram semeados e conduzidos em casa de vegetação e 10 dias após o plantio as folhas foram colhidas para extração de DNA no Laboratório de Biotecnologia da Embrapa Arroz e Feijão, tal como todas as atividades relacionadas à genotipagem e análises dos dados gerados por meio destes procedimentos. O protocolo utilizado para extração de DNA destas amostras foi de CTAB proposto por Ferreira & Grattapaglia (1998). Para quantificação do DNA extraído utilizou- se duas metodologias eletroforese horizontal em gel de agarose 1% e NanoDrop espectrofotômetro (NanoDrop 2000c UV-Vis Spectrophotometer). Posteriormente realizou-se a diluição do DNA extraído e a concentração foi ajustada para 5ng/µl para genotipagem com SSR e 50 ng/µl para genotipagem com SNPs, e armazenada em freezer -20ºC.

3.2.2 Avaliação de murcha-de-fusarium em campo e ambiente controlado

Foram realizados experimentos em campo, em que os genótipos foram submetidos à infestação natural de F. oxysporum f. sp. phaseoli em pivô central. Neste ambiente foram realizados duas avaliações na safra das águas e na safra de inverno sob delineamento de látice triplo. Em ambiente controlado, os genótipos foram inoculados com o isolado BRM 28134, classificado como raça 2, a qual é a raça mais frequente no território brasileiro. Nos dois ensaios neste ambiente, os ensaios foram conduzidos em delineamento inteiramente casualizado com quatro repetições, utilizando-se três plantas por vaso de 700 mL. As 140 progênies, uma testemunha suscetível (BRS Esplendor), outra resistente (BRS Supremo) e os dois genitores da população, Ouro Branco e CNFP 10132 foram semeados em bandejas contendo substrato comercial Maxfertil® (casca de pinus compostada, vermiculita e adubação de base) e inoculadas aos sete dias após plantio. As inoculações foram realizadas segundo metodologia proposta por Pastor-Corrales & Abawi (1987), em que as raízes são cortadas e as plantas são imersas até o caule por cinco minutos no inóculo. Posteriormente as plantas foram transplantadas para vasos contendo substrato comercial. Nas testemunhas as raízes foram cortadas e imersas em água destilada estéril. As avaliações realizadas em campo e em ambiente controlado foram baseadas no índice de severidade da doença que foi expresso em porcentagem de folhagem afetada foi determinado aos 71 dias após o plantio em campo e aos 15, 21 e 28 dias em embiente cnotrolado. Utilizou-se uma escala de 9 graus desenvolvida por Schoonhoven & Pastor- Corrales (1987), em que, 1 - ausência de sintomas; 2 - até 5% da folhagem com sintomas de murcha; 3 - de 6 a 10% da folhagem com sintomas de murcha; 4 – de 11 a 15% da folhagem com sintomas de murcha; 5 - de 16 a 25% da folhagem com sintomas de murcha; 6 - de 26 a 35% da folhagem com sintomas de murcha; 7 - de 36 a 50% da folhagem com sintomas de murcha; 8 - de 51 a 75% da folhagem com sintomas de murcha; 9 - 75% da folhagem com sintomas de murcha. Linhagens com médias entre 1 a 3 foram consideradas resistentes, de 3,1 a 6 moderadamente resistentes e de 6,1 a 9 suscetíveis (Pastor-Corrales & Abawi, 1987; Salgado & Schwartz, 1993).

3.2.3 Análises estatísticas dos dados fenotípicos

Como pressuposto da análise de variância, foi realizado o teste de normalidade de Shapiro-Wilk (Shapiro & Wilk, 1965). Os dados de campo e ambiente controlado submetidos à análises de variância individuais e conjunta, conforme modelo matemático abaixo e as médias foram comparadas pelo teste de Scott & Knott (1974) (p ≤ 0,05), utilizando o programa R software v2.15.0.

3.2.4 Genotipagem com marcadores SSRs

A genotipagem foi realizada com 110 locos SSRs nas progênies oriundas do cruzamento Ouro Branco x CNFP10132, nas testemunhas e nos genitores. As amplificações foram realizadas com kit comercial Master Mix (Promega®) em termociclador GeneAmp PCR System, modelo 9700 (Applied Biossystems). Os produtos de amplificação foram submetidos à desnaturação por 5 minutos a 95ºC e os fragmentos foram submetidos à eletroforese capilar conduzida na plataforma ABI 3100 Genetic Analyzer (Applied Biosystems) utilizando o filtro “D” como padrão para a detecção automatizada das fluoresceínas. Os dados foram coletados por meio do programa Foundation Data Collection 2.0 (Applied Biosystems) e analisados com o GeneMapper 3.5 (Applied Biosystems).

3.2.5 Genotipagem com marcadores SNPs

Os genitores Ouro Branco x CNFP10132 e 92 progênies que não apresentaram transmissão preferencial de alelos para um destes foram genotipados com conjunto de 384 SNPs. A genotipagem foi realizada em plataforma BeadXpress (Illumina) via Golden Gate/Vera Code®. Para genotipagem dos SNPs foi utilizado o programa GenomeStudio (Illumina, EUA) utilizando os algoritmos Genecall para a chamada dos SNPs e GenTrain para o agrupamento dos SNPs.

3.2.6 Alinhamento dos marcadores no genoma de Phaseolus vulgaris

Utilizou-se a ferramenta BLASTN para alinhamento da sequência dos marcadores SSRs e SNPs no genoma de P. vulgaris, cultivar andina (G19833) (Schmutz et al., 2014), na versão Phaseolus vulgaris v2.1 disponível no Phytozome v12.0 [https://www.phytozome. com/commonbean.php], para visualização da distribuição dos marcadores SSRs e SNPs no genoma do feijoeiro-comum. Para cada marcador analisado somente o hit com menor e-value foi utilizado para desenvolver o gráfico, em que foi possível revelar a posição no genoma de P. vulgaris em que as regiões flanqueadas foram alinhadas. Obteve-se uma figura de distribuição dos marcadores no genoma do feijoeiro- comum utilizando o programa R software v2.15.0.

3.2.7 Análise de QTL por meio de regressão linear

Para realização da análise de QTL foi empregado o programa QTL Cartographer v.2.5 (Wang et al., 2012), método de mapeamento por marcas simples, seguindo o modelo de análise de associação por meio de regressão linear.. Neste tipo de análise, foi atribuído escores para os genótipos dos marcadores e posteriormente realizou-se a análise de regressão simples do valor fenotípico das notas das avaliações de murcha-de-fusarium (variável dependente) em função dos escores dos genótipos dos marcadores (variável independente). Quando é identificado um efeito significativo da regressão, é indicativo da existência da associação entre o marcador e a característica avaliada. Esta associação ocorre quando há ligação genética entre o QTL e o marcador. O valor do coeficiente de determinação (R2) da regressão é a proporção da variação fenotípica da característica explicada pelo marcador (Schuster & Cruz, 2013). Os dados fenotípicos utilizados foram oriundos da avaliação em duas safras distintas no campo (safra das águas e safra de inverno) e dois ensaios em épocas diferentes em ambiente controlado, na Embrapa Arroz e Feijão, em 2015, Santo Antônio de Goiás, GO. Para as análises de QTL, nas avaliações de campo, foram utilizadas as médias ajustadas obtidas a partir da análise de variância e nas análises de ambiente controlado, utilizou-se a média da terceira avaliação, pois esta discriminou melhor as linhagens.

3.2.8 Anotação gênica dos SSRs e SNPs significativos

Para a anotação dos genes, foram consideradas somente as regiões com de - log10 (P) inferiores a 2 (P<0,01). Portanto, foi realizado alinhamento das regiões anteriores e posteriores da localização dos marcadores por meio da ferramenta BioMart da plataforma Phytozome v12.0 [https://www.phytozome.com/commonbean.php]. Müller et al. (2015) detectou elevado desequilíbrio de ligação em feijoeiro- comum ao utilizar marcadores SNPs (84,92%), portanto para possibilitar a detecção de marcadores ligados aos QTLs associados à murcha-de-fusarium estendeu-se a região da localização do marcador 500Kb para ambos os lados e os genes presentes nesse intervalo foram anotados. Foi escolhido estender 500Kb devido ao elevado desequilíbrio de ligação observado em feijoeiro-comum.

3.3 RESULTADOS E DISCUSSÃO 3.3.1 Dados fenotípicos

As temperaturas médias na safra das águas foram superiores em relação a safra de inverno. As médias das notas que representam o índice de severidade da doença apresentadas pelos tratamentos mais altas nas safras das águas em quando comparadas à safra de inverno, uma vez que elevadas temperaturas e alta umidade que ocorreram no campo favoreceram a intensificação da doença conforme também foi observado por Ramalho et al. (2012). As médias dos tratamentos em ambiente controlado também diferiram das médias observadas em campo, visto que, foi possível observar maior quantidade de genótipos resistentes, demonstrando que o fator ambiental influencia na resposta dos tratamentos frente à presença do patógeno. A possível presença de diferentes raças nas safras das águas e inverno podem ter ocasionado respostas distintas nos genótipos avaliados, uma vez que a área de pivô é infestada naturalmente e as plantas foram semeadas em diferentes posições nas safras estudadas. Foram detectados efeitos altamente significativos para linhagens (P≤0,01) para avaliação à murcha-de-fusarium nos ensaios de campo e ambiente controlado (Tabelas 3.1 e 3.2). Isto é indicativo de presença de variação genética e possibilidade de sucesso com a seleção de linhagens resistentes a esta doença, que também foi constatado por Pereira et al. (2011). Neste trabalho os autores, inocularam 367 linhagens com o isolado Fop01 e

identificadas 36,5% de linhagens. Sala et al. (2006) avaliaram 104 genótipos e identificaram que 33% deles foram resistentes. As safras apresentaram diferenças altamente significativas, como também as interações safra x tratamento e avaliação x safra (Tabela 3.1). Nos ensaios realizados em ambiente controlado também ocorreram diferenças significativas. Isto evidencia que ocorre efeito de ambiente (campo e ambiente controlado) (Tabela 3.2) sobre o comportamento das linhagens frente ao aumento da severidade da doença, como também é indicativo de presença de diferentes raças nas safras em que as linhagens foram avaliadas e em ambiente controlado, onde foi utilizado a raça 2, a mais frequente no território brasileiro (Alves- Santos et al., 2002; Ribeiro & Hagedorn, 1979; Nascimento et al., 1995).

Tabela 3.1 - Resumo da análise de variância conjunta (safra de inverno e safra das águas) da severidade de murcha-de-fusarium em 144 genótipos de feijoeiro-comum em avaliação em campo (ambiente de infestação natural). FV GL QM F Repetição 2 29,8 34,49 Avaliação 1 135,9 157,36* Grupo 1 0,8 0,91ns Tratamento 143 8,3 9,60* Linhagem 140 8,4 9,76* Genótipo 3 1,8 2,08ns Safra 1 6033,1 6984,81* Bloco (Repetição) 57 4,6 5,31* Avaliação x Tratamento 143 0,6 0,72ns Avaliação x Safra 1 18,6 21,56* Safra x Tratamento 143 2,3 2,70* Avaliação x Safra x Tratamento 143 0,4 0,46ns Resíduo 1091 0,9 Média 5,02 CV(%) 18,51 AS 0,95 GL – graus de liberdade; QM – Quadrado médio, F – teste F (Scenedor); AS – Acurácia seletiva; CV – coeficiente de variação; ns – não significativo; * – significativo a 5% de probabilidade pelo teste F.

Tabela 3.2 - Resumo da análise de variância conjunta da severidade de murcha-de- fusarium em 144 tratamentos de feijoeiro-comum em ambiente controlado FV GL QM F ** Ensaio 1 79,29 52,63 ** Linhagem 137 58,12 38,57 ** Genótipo 3 27,75 18,42 ** Avaliação 2 799,96 531,02 ** Ensaio x Linhagem 137 14,11 9,37 ** Ensaio x Genótipo 3 16,57 10,99 ** Linhagem x Avaliação 274 5,15 3,42 * Genótipo x Avaliação 6 3,69 2,45

Resíduo 1968 1,51 Média Geral 2,82 CV 43,47 AS 0,98 GL – graus de liberdade; QM – Quadrado médio, F – teste F (Scenedor); AS – Acurácia seletiva; CV – coeficiente de variação; ns – não significativo; ** e * – significativo a 1% e 5% de probabilidade pelo teste F.

Foi possível identificar linhagens resistentes tanto em campo, ambas as safras, e em ambiente controlado em ambos os ensaios. Ouro Branco x CNFP 10132.140 e Ouro Branco x CNFP 10132.12 foram classificados nos grupos dos genótipos mais resistentes em todas as condições de avaliação pelo teste de Scott-Knott (Tabelas 2.4 e 2.7). Em contrapartida, as linhagens Ouro Branco x CNFP 10132.48 e Ouro Branco x CNFP 10132.49 estavam nos grupos das mais resistentes no campo, em ambiente controlado foram classificadas no grupo das moderadamente resistentes, indicando que estas linhagens não possuem o gene que confere resistência à raça utilizada nos ensaios em ambiente controlado. Este fato comprova que no campo possuem mais raças além da raça 2.

3.3.2 Genotipagem

Foram genotipados 494 marcadores, em que 384 SNPs e 110 SSRs em 92 linhagens oriundas do cruzamento Ouro Branco x CNFP 10132. Dentre os 384 SNPs testados, 265 (69%) amplificaram produtos específicos, 90 foram monomóficos, 19 (5%) não amplificaram, 9 (2%) foram alelos nulos e um não foi utilizado por não alinhar com o genoma andino (G19833) (Schmutz et al. 2014). Foi realizada a retirada dos SSRs em os genitores não apresentaram alelos, foram heterozigotos e genitores com alelos monomórficos. Foram obtidos 42 marcadores, entre estes 11 não alinharam no genoma andino utilizado no presente trabalho. Foram identificados 296 marcadores (SNPs e SSRs) distribuídos nos 11 cromossomos de P. vulgaris. O aproveitamento de 69% da genotipagem dos SNPs demonstrou que foi possível identificar uma grande quantidade de SNPs polimórficos entre os genitores do mapeamento. Este resultado também foi obtido por trabalhos realizados anteriormente que afirmam que a presença de SNPs distribuídos ao longo do genoma do feijão é alta (Gaitán- Solís et al., 2002; Souza et al., 2012, Mota, 2013)

3.3.3 Distribuição dos marcadores SSRs e SNPs no genoma do feijoeiro-comum

O alinhamento das sequências dos iniciadores de 296 marcadores, sendo 31 SSRs e 265 SNPs, no genoma de P. vulgaris, cultivar andina é representado na Figura 3.1. Os marcadores foram distribuídos nos 11 cromossomos, sendo que o cromossomo 5 apresentou o maior número de hits de SSRs (5 SSRs) e o cromossomo 8 apresentou o maior número de SNPs (34 SNPs). A cobertura genômica foi considerável, com 14 marcadores no cromossomo 4 a 38 no cromossomo 8. Os cromossomos 3, 8 e 11 foram os mais representativos com 39, 38 e 35 marcadores respectivamente. O cromossomo 4 apresentou a menor número de marcadores, com 14 (Tabela 3.3). Nove SNPs (BARC-PV- 0003023, BARC-PV-0004006, BARC-PV-0004020, BARC-PV-0003094, BARC-PV- 0003840, BARC-PV-0004276, BARC-PV-0004576, BARC-PV-0003566, BARC-PV- 0004026) apresentaram E-value = 0, ou seja, alinharam-se com mais de 99% de identidade com o genoma de P. vulgaris, dentre estes marcadores o comprimento de alinhamento foi maior que 350 pb.

Posição Física (Mb)

Figura 3.1 – Distribuição dos marcadores SSRs e SNPs ao longo de 11 cromossomos de P. vulgaris representado com intervalos de 1 megabase (Mb). Eixo y - número (quantidade) de marcadores; eixo x - posição física do marcador ao longo do cromossomo; count – número de marcadores na posição da barra.

O número médio de marcadores por cromossomo foi de aproximadamente 27, estima-se densidade média de um SNP a cada 1.736,4 kb. O cromossomo três foi o mais denso com média de um marcador a cada 1.370,2 kb, já o cromossomo quatro apresentou menor densidade com um marcador a cada 3.432,027 kb (Tabela 3.3). A densidade de marcadores identificada ao longo do genoma varia de acordo com a quantidade de marcadores utilizado nos trabalho, o que pode ter influenciado na densidade observada. Müller et al. (2015) observou a ocorrência de um SSR a cada 8,36 kb. Este resultado

corrobora com densidades já descritas por outras Fabaceas como a soja, com a ocorrência de um SSR a cada 6,82 kb (Saini et al., 2008); feijão guandu, que apresentou densidade de 5,65 kb/SSR (Bohra et al., 2011) e densidade observada para grão de bico de 4,85 kb/SSR (Thudi et al., 2011).

Tabela 3.3 – Distribuição de 296 marcadores (SSRs e SNPs) ao longo dos 11 cromossomos de Phaseolus vulgaris. Cromossomo Número de marcadores Tamanho do cromossomo (pb)* Densidade(kb) 1 33 51433939 1558,604 2 27 49670989 1839,666 3 39 53438756 1370,225 4 14 48048378 3432,027 5 29 40923498 1411,155 6 17 31236378 1837,434 7 18 40041001 2224,500 8 38 63048260 1659,165 9 23 38250102 1663,048 10 22 44302882 2013,767 11 36 53580169 1488,338 Total 296 513974352 1736400 * Dados obtidos na plataforma Phytozome v12.0 [https://www.phytozome.com/commonbean.php].

3.3.4 Análise de QTL

Para as análises de QTLs para todos os ambientes utilizou-se de análise de associação por meio de regressão linear (mapeamento por marca simples) (Apêndice E). A análise de QTLs foi realizado separadamente para cada local (campo e ambiente controlado) e ensaios (safras e ensaios). Os valores de threshold obtidos pelas análises resultaram de –log10 próximos a 2 e 1,30103 que correspondem a p-valores de 0,01 e 0,05, respectivamente (Figura 3.2). No total 104 QTLs foram identificados e estão distribuídos nos cromossomos 1, 2, 5, 6, 7, 8, 9, 10 e 11, sendo que os cromossomos 1 e 8 foram os que mais apresentaram marcas significativas.

Na análise de QTL em ambiente controlado observa-se poucos QTLs identificados, quando comparados com os que foram detectados em experimentos realizados no campo (Figura 3.2 e Apêndice D). No primeiro ensaio em ambiente controlado foram identificados 3 QTLs e no segundo ensaio 4. Este ocorrido evidencia a possível presença de diferentes raças no campo, pois em ambiente controlado foi utilizado somente a raça 2. Plantas expostas a raças diferentes apresentam reações distintas e isto afeta diretamente a análise de QTL. O marcador BARC-PV-0003450 (cromossomo 8) (Apêndice D) foi altamente significativo na safra de inverno e apresentou significância p<0,001 em ambos os ensaios em ambiente controlado, demonstrando que este QTL associado à este loco sofre baixa influência ambiental ou um QTL mais estável para resistência à murcha-de-fusarium.

Figura 3.2 – Gráfico Manhattan Plot dos valores de significância das associações nas análises de QTLs (Mapeamento por marcas simples) dos experimentos de campo (A - safra das águas; B - safra de inverno) e ambiente controlado (C – primeiro ensaio; D- segundo ensaio). O limiar de significância para todos os marcadores p< 0,05 é indicado pela linha vermelha e p<0.01 pela linha azul. O eixo x representa o genoma na ordem física e o eixo y mostra -log10 p-valores para todos os marcadores.

Dentre as marcas significativas, 12 estão localizados associados a marcadores SSR e os demais a SNPs. Dos QTLs identificados 47 foram na safra de inverno, 48 na safra das águas, três no primeiro ensaio de avaliação em ambiente controlado e quatro no

segundo ensaio deste mesmo ambiente (Figura 3.2 e Apêndice D). Para mancha bacteriana comum, Liu et al. (2008) identificaram um QTL no cromossomo 1 numa região definida por oito marcadores moleculares que explicam 25 a 52% da variação fenotípica. Passos (2016) identificou 10 QTLs ligados à resistência de crestamento bacteriano comum em uma população de RILs nos cromossomos Pv01, Pv02, Pv07, Pv09 e PV11. No presente trabalho os marcadores PV115, PV251, BARC-PV-0003368, BARC-PV-0004897, BARC-PV-0005477, BARC-PV-0006051 e BARC-PV-0003131 apresentaram associação significativa para ambas as safras avaliadas em campo. Os locos BARC-PV-0004089 e BARC-PV-0004548 apresentaram associação significativa na safra de inverno e o segundo ensaio de ambiente controlado. Somente o loco BARC-PV- 0003450 apresentou associação significativa na safra de inverno (p-valor<0,05), primeiro e segundo ensaios em ambiente controlado (p-valor<0,0001). Este marcador localiza-se no cromossomo 8 (Figura 3.2A, C e D) e responde por 10,31% da variação fenotípica no campo e até 21,58% em ambiente controlado (Apêndice D). Shi et al. (2012) identificaram dois genes de efeito maiores nas regiões de 2 marcadores (BC420 e SU91) nos cromossomos 6 e 8, respectivamente para mancha bacteriana comum. Navarro et at., (2007), utilizando marcadores RAPD e analisando os dados por mapeamento por intervalo composto, identificaram quatro QTLs associados à mancha bacteriana marrom, nos grupos de ligação B1, B3, B6 e B11. Hagerty et al. (2015), identificaram dois QTLs nos cromossomos Pv 03 e Pv 07, associados à resistência à Fusarium solani e estes eram responsáveis por 9 a 22% da variação genética. Fall et al. (2001) identificaram 3 locos com associação significativa no grupo de ligação LG-10 para murcha-de-fusarium em feijoeiro-comum, que era responsável por 63,5% da variação fenotípica da severidade da doença, utilizando mapeamento por intervalo composto. Estes autores identificaram mais duas marcas adicionais ao realizar análise por marca simples, nos grupos de ligação 3 e 11, porém somente a marca do grupo de ligação 10 tinha associação forte. Ronquillo-López et al. (2010) avaliaram a reação de RILs à murcha-de-fusarium e à podridão de raiz e objetivaram identificar os mesmo QTLs previamente identificados na resistência à Aphanomyces euteiches, também nestas doenças. Marcadores dos grupos de ligação B6 e B8, como também marcas adicionais no grupo de ligação B2, foram identificados associados aos QTLs em resposta à ambas as doenças.

Analisando os ambientes avaliados foi possível detectar 93 marcadores significativos. Destes marcadores 9 foram identificados em mais de um ambiente e 84 em somente um dos ambientes avaliados. Portanto os QTLs identificados neste estudo (Apêndice D) poderão ser utilizados como subsídio para trabalhos com melhoramento. É possível realizar seleção de linhagens resistentes à F. oxysporum f. sp. phaseoli, uma vez que há variabilidade na reação à doença em todos os ambientes em que as linhagens foram avaliadas.

A presença de interação de genótipos por ambientes é um fator que influencia na detecção de QTLs. Esta interação reduz a associação entre os valores fenotípicos e genotípicos, acarretando a diferentes níveis de significância do efeito do QTL em diferentes ambientes (Vieira et al., 2006). Nas análises fenotípicas observou-se que a média das plantas na safra das águas em resposta à murcha-de-fusarium aumentou, em relação à safra de inverno. Alguns autores (Ribeiro & Hagedorn, 1979; Cramer et al., 2003; Ramalho et al., 2012) já relataram que temperaturas e umidade elevadas, como comumente ocorre na safra das águas, fazem com que as perdas da produção alcancem 80%, isto se deve ao fato de que a severidade da doença ser maior. O que explica a não coincidência de marcadores para ambos os ensaios de experimento em campo. Os fatores ambientais influenciaram o desempenho das plantas, em que estas apresentaram resposta diferenciada a ambientes (safras) distintos, mesmo sendo a mesma localização geográfica. A interação genótipo com ambiente reduz a associação entre os valores fenotípicos e genotípicos e leva a diferentes níveis de significância do efeito do QTL em ambientes diferentes (Groh et al., 2001). Além disso, tais resultados poderão ser utilizados como conhecimento básico para o desenvolvimento de pesquisas futuras, que terão por objetivo validar tais marcas por meio de ensaios em diferentes ambientes e períodos de plantio e também realizar análises genômicas mais robustas das possíveis regiões envolvidas na característica de resistência, a fim de encontrar genes envolvidos e a interação entre eles, para compreender melhor a relação patógeno-hospedeiro e utilizá-losna seleção assistida por marcadores moleculares.

3.3.5 Anotação Gênica

Observando os 296 marcadores utilizados, 93 foram significativos (p<0,05; p<0,01 e p<0,001), contudo para anotação gênica foi considerado somente os marcadores que apresentaram significância de p<0,01. Vinte e quatro marcadores foram altamente significativos e três destes apresentaram significância em mais de um ambiente (Apêndice D). Após identificar os marcadores associados à resistência à murcha-de-fusarium por meio da regressão linear, foram utilizadas as posições dos marcadores, com abrangência de 500 kb anterior e posterior à estes com o objetivo de encontrar transcritos relatados no genoma do feijoeiro-comum disponíveis no banco de dados do Phytozome v12.0 na versão Phaseolus vulgaris v2.1. Foi possível detectar 1460 transcritos já identificados no genoma do feijoeiro- comum. Dentre estes se encontraram os transcritos que apresentaram, como produto, proteínas expressas cuja função e processo biológicos ainda não foram determinados. Portanto foi realizada uma filtragem considerando somente os transcritos que as proteínas codificadas por estes já foram descritas. Um total de 960 transcritos codificados foram anotados (Apêndice B). A anotação gênica possibilitou a identificação de marcadores próximos a genes responsáveis por transcritos já identificados. Dos 24 marcadores significativos a p<0,01, o marcador BARC-PV-0003450 se localizou dentro do gene Phvul.008G018700 e os demais marcadores estão localizados próximos aos genes. As distâncias entre os marcadores e os genes identificados variaram de 0,843 a 499,77 Kb. O marcador BARC-PV-0003450 foi altamente significativo em ambiente controlado (p<0,001) e na safra de inverno (p<0,01), explicando 10,3% da variação fenotípica na safra de inverno, 21,5 e 20,2% nos dois ensaios em ambiente controlado. Este marcador encontra-se à uma distância de 338,54 kb do gene Phvul.008G014700 (Apêndice B). Este gene está associado à proteína putativa RPP13 que está relacionada com resistência à doenças. Os genes de resistência são agrupados em quatro classes de acordo com a natureza dos produtos produzidos (Hammond-Kosak e Jones, 1997; Liu et al., 2004). A proteína RPP13 está classificada na primeira subclasse da terceira classe dos genes de resistência. Esta subclasse é caracterizada por possuir o domínio Cauda Espiralada (CC; Coiled-coil) na região amino-terminal, responsável pelo reconhecimento das moléculas elicitoras. Nesta classe estão os genes Rps2, RPP8, RPP13 e Rpm1 de Arabidopsis thaliana; Pib, Pi-ta e Xa1 de arroz; Prf, I2, Mi e Sw5 de tomate e Hero de

batata (McDowell et al., 1998; Bittner-Eddy et al., 2000; Liu et al., 2004). A terceira classe dos genes de resistência é caracterizada por englobar as proteínas que sintetizam os domínios Sítio de Ligação de Nucleotídeo (NBS; Nucleotide Binding Site) e Repetições Ricas em Leucina (LRR; Leucine Rich Repeats) (Tarr & Alexander, 2009; Wan et al., 2010). O domínio LRR está envolvido no reconhecimento do patógeno pelo hospedeiro durante o processo de infecção (Sun & Wang, 2011). Burt et al.(2015) também identificaram genes de resistência à antracnose no cromossomo 8. Estes autores relataram marcadores próximos à genes pertencentes ao complexo LRR que conferem resistência à antracnose. Os marcadores SSRs BM175 e PV115 estão próximos aos genes que estão associados à β-1-3 glucanase. O marcador BM175 está a 439687 pb do gene Phvul.001G128500 e a 350460 pb do gene Phvul.001G128550. O marcador PV115 está a 1328158pb de distância do gene Phvul.005G130900. Burt et al. (2015) também identificou esta proteína ao realizar a anotação de genes e afirma que os genes anotados para esta proteína estão envolvidos na resistência à antracnose. Portanto, no presente estudo estes genes podem ter sido efetivos ao conferir resistência contra a invasão fúngica. Portanto, o presente estudo relatou marcadores de feijoeiro-comum próximo à um gene associado a uma proteína que está relacionada com resistência adoenças. Uma vez que este gene pode estar relacionado com a resistência à murcha-de-fusarium, o presente trabalho contribuiu com este relato inédito, para o melhoramento de feijoeiro-comum, visando o desenvolvimento de cultivares resistentes a esta doença.

3.4 CONCLUSÕES

- As análises fenotípicas possibilitaram a identificação de linhagens resistentes à murcha- de-fusarium; - A metodologia de análise de QTLs por meio da regressão linear mostrou-se eficiente na identificação de QTLs associados à resistência à murcha-de-fusarium na população oriunda do cruzamento Ouro Branco x CNFP10132; - Os marcadores utilizados no presente trabalho tiveram distribuição homogênea no genoma do feijoeiro-comum, posicionados em todos os cromossomos;

- Um grande número de QTLs foram identificados, confirmando o padrão de herança poligênica de resistência para esta doença; - O marcador BARC-PV-0003450 apresentou altamente significativo para safra de inverno e nos dois ensaios em ambiente controlado. Este marcador está próximo ao gene que está associado à proteína putativa RPP13 que está relacionada com resistência de plantas à doenças; - Os marcadores BM175 e PV115 se localizaram próximo a genes associados à produção de β-1-3 glucanase, um dos mecanismos de defesa à fungos fitopatogênicos; - O presente estudo detectou QTL de maior efeito na variância fenotípica sob condições ambiente controlado.

3.5 REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS

ADAM-BLONDON, A. F.; SÉVIGNAE, M.; BANNEROT, H.; DRON, M. SCAR, RAPD and RFLP markers linked to a dominant gene (Are) conferring resistance to anthracnose in common bean. Theoretical and Applied Genetics, v. 88, n. 6/7, p. 865-870, 1994.

ALLARD, R. W. Principles of plant breeding. 2 ed. New York: John Wiley & Sons, 1999. 254. p.

ALZATE-MARIN, A. L.; ARRUDA, M. C. C.; MENARIM, H.; CHAGAS, J. M.; BARROS, E. G.; MOREIRA, M. A. Identification of RAPD markers linked to resistance genes to anthracnose in common bean cultivars AB136, TO and G2333. Annual Report of the Bean Improvement Cooperative, v. 42, n., p.13-14, 1999a.

ALZATE-MARIN, A. L.; MENARIM, H.; CARVALHO, G. A.; PAULA JÚNIOR, T. J.; BARROS, E. G.; MOREIRA, M. A. Improved selection with newly identified RAPD markers linked to resistance gene to four pathotypes of Colletotrichum lindemuthianum in common bean. Phytopathology, Madison, v. 89, n., p. 281-285, 1999b.

AUGUSTIN, E.; COYNE, D. P.; SCHUSTER, M. L. Inheritance of resistance in Phaseolus vulgaris to Uromyces phaseoli typica Brazilian rust race B11 and of plant habit. J. Am. Soc. Hortic. Sci., v. 97, n. 4, p. 526–529, 1972.

BALLANTYNE, B. The Genetic Bases of Resistance to Rust, Caused by Uromyces Appendiculatus in Bean (Phaseolus Vulgaris). Sydney: University of Sydney, 1978, 262 p.

BARROS, E. G.; SOUZA, T. L. P. O. Biotecnologia aplicada à cultura do feijoeiro. In: CANÇADO, G. M. A.; SOARES, B. D. F. (Eds.). Biotecnologia aplicada à Agropecuária. Belo Horizonte: Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais. 2012, 664p.

BOHRA, A.; DUBEY, A.; SAXENA, R. K. L. Analysis of BAC-end sequences (BESs) and development of BES-SSR markers for genetic mapping and hybrid purity assessment in pigeonpea (Cajanus spp.). BMC Plant Biol, London, v. 11, n. 56, p. 1-15, 2011.

BURT, A. J.; WILLIAM, H. M.; PERRY, G.; KHANAL, R.; PAULS, K. P.; JAMES, D. K.; NAVABI, A. Candidate Gene Identification with SNP Marker-Based Fine Mapping of Anthracnose Resistance Gene Co-4 in Common Bean. Plos One, v. 10, n. 10, p. 1-19, 2015.

CAIXETA,E.T.; BORÉM, A.; ALZATE-MARIN, A. L.; FAGUNDES, S. D. A.; SILVA, M. G. D. M. E.; BARROS, E. G. Allelic relationships for genes that confer resistance to angular leaf spot in common bean. Euphytica, v. 145, n. 3, p. 237–245, 2005.

CARNEIRO, J. E. S.; ABREU, A. F. B.; RAMALHO, M. A. P.; DE PAULA JÚNIOR, T. J.; DEL PELOSO, M. J.; MELO, L. C.; PEREIRA, H. S.; PEREIRA FILHO, I. A.; MARTINS, M.; VIEIRA, R. F.; MARTINS, F. A. D.; COELHO, M. A. O; CARNEIRO, P. C. S.; MOREIRA, J. A. A.; SANTOS, J. B.; FARIA, L. C.; COSTA, J. G. C.; HUDSON TEIXEIRA, H. BRSMG Madrepérola: common bean cultivar with late-darkening Carioca grain. Crop Breeding Applied Biotechnology, Viçoa, v. 12, n. 4, p. 281-284, 2012.

CARVALHO, G. A.; PAULA, T. J.; ALZATE-MARIN, A. L.; NIETSCHE, S.; BARROS, E. G.; MOREIRA, M. A. Inheritance of resistance to angular leaf spot of common bean in AND 277 to race 63–23 of Phaeoisariopsis griseola and identification of a RAPD marker linked to the resistance gene. Fitopatologia Brasileira, Brasília, v. 23, n. 4, p. 482–485, 1998.

CHOWDHURY, M. A.; YU, K.; PARK, S. J. Molecular mapping of root rot resistance in common beans. Annu. Rep. Bean Improv. Coop., East Lansing, v. 45, n. 45, p. 96–97, 2002.

CRAMER, R.A.; BYRNE, P.F.; BRICK, M.A.; PANELLA, L.; WICKLIFFE, E.; SCHWARTZ, H.F. Characterization of Fusarium oxysporum isolates from common bean and sugar beet using pathogenicity assays and randon-amplified polymorfhic DNA markers. J. Phytopathol. v. 151, n. 6, p. 352-360, 2003.

EDWARDS, M. D.; STUBER, C. W.; WENDEL, J. F.. Molecular-marker-facilitated investigations of quantitative-trait loci in maize. I. Numbers, genomic distribution, and types of genes action. Genetics, v. 116, n. 1, p. 113-125, 1987.

EMBRAPA ARROZ E FEIJÃO. Dados conjunturais da produção de feijão comum (Phaseolus vulgaris L.) e caupi (Vigna unguiculata (L.) Walp) no Brasil (1985 a 2015): área, produção e rendimento. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2016. Disponível em: . Acesso em: 25 jan. 2017.

EICHENBERG, K.; GUGERLI, F.; SCHNELLER, J. J. Morphological and molecular diversity of swiss common bean cultivars (Phaseolus vulgaris L. Fabaceae) and their origin. Botanica Helvetica, Basel, v.110, n.1, p.61-67, 2000.

FALL, A. L.; BYRNE, P. F.; JUNG, G.; COYNE, D. P.; CRICK. M. A.; SCHWARTZ, H. F. Detection and mapping of a major locus for fusarium wilt resistance in common bean. Crop Science, Madison, v. 41, n.5, p. 1494-1498, 2001.

FERREIRA, M. E.; GRATTAPAGLIA, D. Introdução ao uso de marcadores moleculares em análise genética. 3. ed. Brasília, DF: Embrapa-Cenargen, 1998. 220 p.

GAITÁN-SOLÍS, E.; DUQUE, M. C.; EDWARDS, K. J.; TOHME, J. Microsatellite repeats in common bean (Phaseolus vulgaris): Isolation, characterization and cross-species amplification in Phaseolus ssp. Crop Science, Madison, v. 42, n. 6, p.1228–1236, 2002.

GELDERMAN, H. Investigations on inheritance of quantitative characters in animals by gene markers. I. Method. Theoretical and Applied Genetics, v. 46, n. 319 p. 319-330, 1975.

GONÇALVES-VIDIGAL, M. C.; CRUZ, A. S.; GARCIA, A.; KAMI, J.; VIDIGAL FILHO, P. S.; SOUSA, L. L.; MCCLEAN, P.; GEPTS, P.; PASTOR-CORRALES, M. A. Linkage mapping of the Phg-1 and Co-14 genes for resistance to angular leaf spot and anthracnose in the common bean cultivar AND 277. Theoretical and Applied Genetics, v. 122, n. 5, p. 893–903, 2011.

GRAFTON, K. F.; WEISER, G. C.; LITTLEFIELD, L. J.; STAVELY, J. R. Inheritance of resistance to two races of leaf rust in dry edible bean. Crop Science, Madison, v. 25, n.3, p. 537–539, 1985.

GROH, S.; KIANIAN, S. F.; PHILLIPS, R. L.; RINES, H. W.; STUTHMAN, D. D.; Liu, S., K. Yu, and S.J. Park. Development of STS markersand QTL validation for common bacterial blight resistance incommon bean. Plant Breed, v. 127, n. 1, p. 62–66, 2008.

HAGERTY, C. H.; CUESTA-MARCOS, A.; CREGAN, P. B.; SONG, Q.; MCCLEAN, P.; NOFFSINGER, S.; MYERS, J. R. Mapping and Root Rot Resistance and Root Architecture Quantitative Trait Loci in Common Bean. Crop Science, Madison, v. 55, n. 5, p. 1969-1977, 2015.

HAMMOND-KOSACK, K. E.; JONES, J. D. G. Plant disease resistance genes. Annu Rev Plant physiol Plant Mol Biol, Palo Alto, v. 48, n., p. 575-607, 1997.

JUNG, G.; COYNE, D. P.; BOKOSI, J.; STEADMAN, J. R. NIENHUIS, J. Mapping genes for specific and adult plant resistance to rust and abaxial leaf pubescence and their genetic relationships using randomLy amplified polymorphic DNA (RAPD) markers in common bean. J. Am. Soc. Hortic. Sci., v. 123, n. 5, p. 859–863, 1998.

LIEBENBERG, M. M.; PRETORIUS, Z. A. Inheritance of resistance to Uromyces appendiculatus in the South African dry bean cultivar Kranskop. S. Afr. J. Plant Soil, Pretoria, v. 21, n.4, p. 245–250, 2004.

LIU, B.; ZHANG, S.; ZHU, X.; YANG. Q.; WU, S.; MEI, M.; MAULEON, R.; LEACH, J.; MEW, T.; LEUNG, H. Candidate defense genes as predictors of quantitative blast resistance in rice. Molecular Plant-Microbe Interactions, Ames, v. 17, n. 10, p. 1146- 115, 2004.

LÓPEZ, C. E.; ACOSTA, I. F.; JARA, C.; PEDRAZA, F.; GAITÁN-SOLÍS, E.; GALLEGO, G.; BEEBE, S.; TOHME, J. Identifying resistance gene analogs associated with resistances to different pathogens in common bean. Phytopathology, Madison, v. 93, n. 1, p. 88–95, 2003.

LUANNFINKE, M. L.; COYNE, D. P.; STEADMAN, J. R. The inheritance and association of resistance to rust, common bacterial blight, plant habit and foliar abnormalities in Phaseolus vulgaris. L. Euphytica, v.35, n., p. 969–982, 1986.

MACE, M. E.; BELL, A. A.; BECKMAN, C. H. Fungal wilt diseases of plants. New York: Academic Press, 1981. 654 p.

MAHUKU, G.; MONTOYA, C.; HENRIQUEZ, M. A.; JARA, C.; TERAN, H.; BEEBE, S. Inheritance and characterization of angular leaf spot resistance gene present in common bean accession G10474 and identification of an AFLP marker linked to the resistance gene. Crop Science, Madison, v. 44, n. 5, p. 1817–1824, 2004.

MAHUKU, G. S.; IGLESIAS, A. M.; JARA, C. Genetics of angular leaf spot resistance in the Andean common bean accession G5686 and identification of markers linked to the resistance genes. Euphytica, v. 167, n. 3, p. 381–396, 2009.

MAHUKU, G. S.; HENRIQUEZ, M. A.; MONTOYA, C.; JARA, C.; TERAN, H.; BEEBE. S. Inheritance and development of molecular markers linked to angular leaf spot resistance genes in the common bean accession G10909. Molecular Breeding, v. 28, n. 1, p. 57–71, 2011.

MARGARIDO, G. R. A.; SOUZA, A. P.; GARCIA, A. A. F. OneMap: software for genetic mapping in outcrossing species. Hereditas, v. 144, n. 3, p. 78-79, 2007.

MOTA, A. P. S. Relatório de estágio curricular realizado na embrapa arroz e feijão, goiânia, go de 29 de outubro de 2012 a 28 de fevereiro de 2013. 2013. 36 f. Monografia (Graduação em Agronomia) - Escola de Agronomia, Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2013.

MÜLLER, B. S. F.; PAPPAS JR, G. J.; VALDISSER, P. A. M. R.; COELHO, G. R. C.; MENEZES, I. P. P.; ABREU, A. G.; BORBA. T. C. O.; SAKAMOTO, T.; BRONDANI, C.; BARROS, E. G.; VIANELLO, R. P. An Operational SNP Panel Integrated to SSR Marker for the Assessment of Genetic Diversity and Population Structure of the Common Bean. Plant Mol Biol Rep, v. 33, n. 6, p. 169-1711, 2015.

NAVARRO, F. P.; SKROCH, G. J.; NIENHUIS, D J. Quantitative trait loci associated with bacterial brown spot in Phaseolusvulgaris L. Crop Science, Madison, v. 47, p. 1344– 1353, 2007.

OBLESSUC, P. R.; BARONI, R. M.; GARCIA, A. A. F.; CHIORATTO, A. F.; CARBONELL, S. A. M.; CAMARGO, L. E. A.; BENCHIMOL, L. L. Mapping of angular leaf spot resistance QTL in common bean (Phaseolus vulgaris L.) under different environments. BMC Genetics, London, v. 13, n. 50, p. 1-9, 2012.

OLIVEIRA, M. I. S.; LIMA, S. C. D. V.; ARAÚJO, L. G. D. Murcha-de-curtobacterium. In: JÚNIOR, T. J. D. P.; WENDLAND, A. (Ed.). Melhoramento genético do feijoeiro- comum e prevenção de doenças. Viçosa: EPAMIG, 2012. p. 111-124.

PASSOS, A.L. P. Mapeamento de locos de resistência ao crestamento bacteriano comum do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.). 2016. 78 f. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Escola de Agronomia, Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2016.

PASTOR-CORRALES, M. A.; ABAWI, G. S. Reactions of selected bean germplasms to infection by Fusarium oxysporum f.sp. phaseoli. Plant Disease, Ames, v. 71, n. 11, p. 990- 993, 1987.

RAMALHO, M. A. P.; ABREU, A. F. B.; CARNEIRO, J. E. S.; WENDLAND, A., PAULA JÚNIOR, T. J. P.; VIEIRA, R. F.; DEL PELOSO, M. J, LOBO JUNIOR, M.; PEREIRA, A. C. Murcha-de-fusarium. In: JÚNIOR, T. J. D. P.; WENDLAND, A. (Ed.). Melhoramento genético do feijoeiro-comum e prevenção de doenças. Viçosa: EPAMIG, 2012. p. 127-138.

ROMAN-AVILES, B.; KELLY, J. D. Identification of quantitative trait loci conditioning resistance to Fusarium root rot in common bean. Crop Science, Madison, v. 45, n. 5, p. 1881–1890, 2005.

RONQUILLO-LÓPEZ, M. G. ; GRAU, C. R.; NIENHUIS, J. Variation in Reaction to Fusarium spp. Identified in a Common Bean (Phaseolus vulgaris L.) Population Developed for Field-Based Resistance to Root Rot and Wilt. Crop Science, Madison, vol. 50, n. 6, p. 2303-2309, 2010.

SAETTLER, A. W. Diseases caused by bacteria. In: SCHWARTZ, H. F.; STEADMAN, J. R.; HALL, R.; FORSTER, R. L. (Ed.). Compendium of bean diseases. 2 ed. St. Paul: APS Press, 1991. 109 p.

SAINI, N.; SHULTZ, J.; LIGHTFOOT, D. A. Re-annotation of the physical map of Glycine max for polyploid-like regions by BAC end sequence driven whole genome shotgun read assembly. BMC Genomics, London, v. 9, n. 323, p.323, 2008.

SALGADO, M. O.; SCHWARTZ, H. F. Physiological specialization end effects of inoculum concentration on Fusarium oxysporum f.sp. phaseoli in common beans. Plant Disease, Ames, v. 79, n. 5, p. 492-496, 1993.

SARTORATO, A.; NIETSCHE, S.; BARROS, E. G.; MOREIRA, M. A. RAPD and SCAR markers linked to resistance gene to angular leaf spot in common beans. Fitopatologia Brasileira, Brasília, v. 25, n. 4, p. 637–642, 2000.

SHAPIRO, S. S.; WILK, M. B. An Analysis of Variance Test for Normality (Complete Samples). Biometrika, Oxford, v. 52, n. 3/4, p. 591-611, 1965.

SCHMUTZ, J.; MCCLEAN, P. E.; MAMIDI, S. A reference genome for common bean and genome-wide analysis of dual domestications. Nature Genetics, New York, v. 46, n. 7, p.707-713, 2014.

SCHNEIDER, K. A.; GRAFTON, K. F.; KELLY, J. D. QTL analysis of resistance to Fusarium root rot in bean. Crop Science, Madison, v. 41, n. 2, p. 535, 2001.

SCHOONHOVEN, A.A.S.; PASTOR-CORRALES, M.A. Standard system for the evaluation of bean germplasm. Cali : CIAT, 1987. 54p.

SCHUSTER, I.; CRUZ, C.D. Análise de QTLs – Mapeamento por marcas simples. In: SCHUSTER, I.; CRUZ, C.D. (Ed.). Estatística genômica aplicada a populações derivadas de cruzamentos controlados. 2. ed. rev. Viçosa: UFV, 2013. Cap. 8, p.323- 428.

SHI, C.; YU, K.; XIE, W.; PERRY, G.; NAVABI, A.; PAULS, K. P.; MIKLAS, P. N.; FOURIE, D. Development of candidate gene markers associated to common bacterial blight resistance in common bean. Theoretical and Applied Genetics, v. 25, n. 7, p. 1525- 1537, 2012.

SCOTT, A. J.; KNOTT, M. A cluster analysis method for grouping means in the analysis of variance. Biometrics, v. 30, n. 3, p. 507-512, 1974.

SOUZA, T. L. P. O.; DESSAUNE, S. N.; SANGLARD, D. A.; MOREIRA, M. A. BARROS, E. G. Characterization of the rust resistance gene present in the common bean cultivar Ouro Negro, the main rust resistance source used in Brazil. Plant Pathology, v. 60, n. 5, p. 839–845, 2011.

SOUZA, A.P. Biologia molecular aplicada ao melhoramento. In: Nass, L.L.; Valois, A. C.C.; Melo, I.S.; Valadares-Inglis, M.C. Recursos Genéticos e melhoramento. Sinop: Fundação MT, p.939-965, 2001.

SOUZA, T. L. P. O.; BARROS, E. G.; BELLATO, C. M.; HWANG, E. Y.; CREGAN, P. B.; PASTOR-CORRALES, M. A. Single nucleotide polymorphism discovery in common bean. Mol Breeding, v. 30, n. 1, p. 419–428, 2012.

STAVELY, J. R. Pathogenic specialization in Uromyces phaseoli in the United States and rust resistance in beans. Plant Disease, Ames, v. 68, n. 2, p. 95–99, 1984.

SUN, X. WANG, G. L. Genome-Wide Identification, Characterization and Phylogenetic Analysis of the Rice LRR-Kinases. PLoS ONE, Califórnia, v. 6, n.3, 2011.

TARR, D. E. K.; ALEXANDER, H. M. TIR-NBS-LRR genes are rare in monocots: evidence from diverse monocot orders. BMC Res Notes, London, v. 2, n. 197, p. 1-10, 2009.

THODAY, J. M. Effects of specific genes. In: POLLAK, E.; KEMPTHORNE, O.; BAILEY, T. B. (Ed.). In: INTERNATIONAL QUANTITATIVE GENETICS CONFERENCE, 1., 1976, Ames. Proceedings... Ames: Iowa State University, p. 141-159, 1977.

THUDI, M.; BOHRA, A.; NAYAK, S. N. Novel SSR markers from BAC-end sequences, DArT arrays and a comprehensive genetic map with 1,291 marker loci for chickpea (Cicer arietinum L.). PLoS ONE, Califórnia, v. 6, n. 11, p. e27275, 2011.

VIEIRA, E. A.; NODARI, R. O.; CARVALHO, F. I. F. DE.; FIALHO, J. DE. Mapeamento genético de caracteres quantitativos e sua interação com o ambiente. Brasília: Documentos/ Embrapa Cerrados, 2006. 28 p.

WANG, S.; BASTEN, C. J.; ZENG, Z.-B. Windows QTL Cartographer 2.5. Department of Statistics, North Carolina State University, Raleigh, NC. ( http://statgen.ncsu.edu/qtlcart /WQTLCart.htm), 2012.

WAN, H.; ZHAO, Z.; MALIK, A. A.; QIAN, C.; CHEN, J. Identification and characterization of potential NBS-encoding resistance genes and induction kinetics of a putative candidate gene associated with downy mildew resistance in Cucumis. BMC Plant Biology, London, v. 10 n. 186, p. 186-198, 2010.

YOUNG, R. A.; KELLY, J. D. RAPD markers flanking the Are gene for anthracnose resistance in common bean. Journal of American Society of Horticultural Science, v. 121, n. 1, p. 37-41, 1996.

YOUNG, R.A. & KELLY, J.D. RAPD markers linked to three major anthracnose resistance genes in common bean. Crop Science, Madison, v. 37, n. 3, p. 940-946, 1997.

YOUNG, R.A.; MELOTTO, M.; NODARI, R. O.; KELLY, J. D. Marker assisted dissection of the oligogenic anthracnose resistance in common bean cultivar, G2333. Theoretical and Applied Genetics, v. 96, n. 1, p.87-94, 1998.

4 CONCLUSÕES GERAIS

- A metodologia de análise de QTLs por meio da regressão linear mostrou-se eficiente na identificação de QTLs associados à resistência à murcha-de-fusarium na população oriunda do cruzamento Ouro Branco x CNFP10132; - Os marcadores utilizados no presente trabalho tiveram distribuição homogênea no genoma do feijoeiro-comum, posicionados em todos os cromossomos; - Um grande número de QTLs foram identificados, confirmando o padrão de herança poligênica de resistência para esta doença; - O marcador BARC-PV-0003450 apresentou altamente significativo para safra de inverno e nos dois ensaios em ambiente controlado. Este marcador está próximo ao gene que está associado à proteína putativa RPP13 que está relacionada com resistência de plantas à doenças. Portanto, este marcador é indicado para ser utilizado na Seleção Assistida por Marcadores Moleculares; - O presente estudo apresentou uma importante contribuição para o melhoramento de feijoeiro-comum visando resistência à murcha-de-fusarium, uma vez que detectou QTL de maior efeito na variância fenotípica sob condições ambiente controlado.

5 REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS

BIAZON, V. L.; MARINGONI, A.C.; GRASSI FILHO, H. Influência de cálcio e de nitrogênio nos teores de macronutrients foliares e na suscetibilidade do feijoeiro Iapar ao crestamento bacteriano comum. Summa Phytopathologica, v. 30, n. 3, p. 320-323, 2004.

BURUCHARA, R. A.; CAMACHO, L. Common bean reaction to Fusarium oxysporum f.sp. phaseoli, the cause of severe vascular wilt in Central Africa. Journal of Phytopathology, v. 148, p. 39-45, 2000.

PASTOR-CORRALES, M. A.; ABAWI, G. S. Reactions of selected bean germplasms to infection by Fusarium oxysporum f.sp. phaseoli. Plant Disease, v. 71, n. 11, p. 990-993, 1987.

PIZA, S. M. T. Patogenicidade de Fusarium oxysporum f.sp. phaseoli e reação de germoplasma de feijoeiro (Phaseolus vulgaris). Summa Phytopathologica, Botucatu, v. 19, n. 3/4, p. 165-167, 1993.

SABADIN, K. P.; SOUZA JÚNIOR, C. L.; SOUZA, A. P. GARCIA, A. A. F. QTL mapping for yield components in a tropical maize population using microsatellite markers. Hereditas, v.145, n. 4, p. 194-203, 2008.

APÊNDICES Apêndice A - Médias de severidade de genótipos de feijoeiro-comum infestados por Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli em condições de campo. Inverno Águas Média de Média de Linhagens Severidade Linhagens Severidade Ouro Branco x CNFP 10132.49 1,5 a* Ouro Branco x CNFP 10132.49 4,67 a Ouro Branco x CNFP 10132.12 1,67 a Ouro Branco x CNFP 10132.63 4,67 a Ouro Branco x CNFP 10132.48 1,67 a Ouro Branco x CNFP 10132.48 5,17 a Ouro Branco x CNFP 10132.74 1,67 a Ouro Branco x CNFP 10132.90 5,17 a Ouro Branco x CNFP 10132.90 1,67 a Ouro Branco x CNFP 10132.55 5,33 a Ouro Branco x CNFP 10132.84 1,83 a Ouro Branco x CNFP 10132.61 5,33 a Ouro Branco x CNFP 10132.140 1,83 a Ouro Branco x CNFP 10132.12 5,5 a Ouro Branco x CNFP 10132.196 1,83 a Ouro Branco x CNFP 10132.2 5,67 a Ouro Branco x CNFP 10132.23 2 a Ouro Branco x CNFP 10132.45 5,67 a Ouro Branco x CNFP 10132.28 2 a Ouro Branco x CNFP 10132.54 5,67 a Ouro Branco x CNFP 10132.40 2 a Ouro Branco x CNFP 10132.109 5,67 a Ouro Branco x CNFP 10132.52 2 a Ouro Branco x CNFP 10132.121 5,67 a Ouro Branco x CNFP 10132.77 2 a Ouro Branco x CNFP 10132.139 5,67 a Ouro Branco x CNFP 10132.79 2 a Ouro Branco x CNFP 10132.140 5,67 a Ouro Branco x CNFP 10132.118 2 a Ouro Branco x CNFP 10132.40 5,83 a Ouro Branco x CNFP 10132.144 2 a Ouro Branco x CNFP 10132.50 5,83 a Ouro Branco x CNFP 10132.147 2 a Ouro Branco x CNFP 10132.74 5,83 a Ouro Branco x CNFP 10132.149 2 a Ouro Branco x CNFP 10132.187 5,83 a BRS Esplendor 2 a Ouro Branco x CNFP 10132.189 5,83 a Ouro Branco x CNFP 10132.29 2,17 a Ouro Branco x CNFP 10132.47 6 a Ouro Branco x CNFP 10132.30 2,17 a Ouro Branco x CNFP 10132.51 6 a Ouro Branco x CNFP 10132.58 2,17 a Ouro Branco x CNFP 10132.52 6 a Ouro Branco x CNFP 10132.80 2,17 a Ouro Branco x CNFP 10132.80 6 a Ouro Branco x CNFP 10132.104 2,17 a Ouro Branco x CNFP 10132.104 6 a Ouro Branco x CNFP 10132.121 2,17 a Ouro Branco x CNFP 10132.106 6 a Ouro Branco x CNFP 10132.139 2,17 a Ouro Branco x CNFP 10132.111 6 a Ouro Branco x CNFP 10132.189 2,17 a Ouro Branco x CNFP 10132.125 6 a Ouro Branco x CNFP 10132.16 2,33 a Ouro Branco x CNFP 10132.20 6,17 b Ouro Branco x CNFP 10132.22 2,33 a Ouro Branco x CNFP 10132.29 6,17 b Ouro Branco x CNFP 10132.61 2,33 a Ouro Branco x CNFP 10132.58 6,17 b Ouro Branco x CNFP 10132.63 2,33 a Ouro Branco x CNFP 10132.92 6,17 b Ouro Branco x CNFP 10132.111 2,33 a Ouro Branco x CNFP 10132.142 6,17 b Ouro Branco x CNFP 10132.125 2,33 a Ouro Branco x CNFP 10132.182 6,17 b Ouro Branco x CNFP 10132.127 2,33 a Ouro Branco x CNFP 10132.191 6,17 b Ouro Branco x CNFP 10132.133 2,33 a Ouro Branco x CNFP 10132.3 6,33 b Ouro Branco x CNFP 10132.4 2,5 a Ouro Branco x CNFP 10132.35 6,33 b

Apêndice A - Continuação...

Inverno Águas Média de Média de Linhagens Severidade Linhagens Severidade Ouro Branco x CNFP 10132.7 2,5 a Ouro Branco x CNFP 10132.94 6,33 b Ouro Branco x CNFP 10132.25 2,5 a Ouro Branco x CNFP 10132.113 6,33 b Ouro Branco x CNFP 10132.43 2,5 a Ouro Branco x CNFP 10132.114 6,33 b Ouro Branco x CNFP 10132.55 2,5 a Ouro Branco x CNFP 10132.147 6,33 b Ouro Branco x CNFP 10132.112 2,5 a Ouro Branco x CNFP 10132.159 6,33 b Ouro Branco x CNFP 10132.113 2,5 a Ouro Branco x CNFP 10132.186 6,33 b Ouro Branco x CNFP 10132.122 2,5 a Ouro Branco x CNFP 10132.84 6,4 b Ouro Branco x CNFP 10132.154 2,5 a Ouro Branco x CNFP 10132.14 6,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.20 2,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.28 6,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.45 2,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.34 6,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.72 2,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.68 6,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.75 2,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.79 6,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.106 2,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.95 6,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.117 2,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.112 6,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.158 2,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.116 6,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.182 2,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.118 6,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.184 2,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.120 6,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.187 2,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.129 6,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.2 2,83 b Ouro Branco x CNFP 10132.149 6,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.3 2,83 b Ouro Branco x CNFP 10132.154 6,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.11 2,83 b Ouro Branco x CNFP 10132.196 6,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.24 2,83 b BRS 7762 Supremo 6,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.26 2,83 b Ouro Branco x CNFP 10132.7 6,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.31 2,83 b Ouro Branco x CNFP 10132.30 6,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.33 2,83 b Ouro Branco x CNFP 10132.31 6,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.50 2,83 b Ouro Branco x CNFP 10132.42 6,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.62 2,83 b Ouro Branco x CNFP 10132.59 6,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.93 2,83 b Ouro Branco x CNFP 10132.62 6,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.102 2,83 b Ouro Branco x CNFP 10132.122 6,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.114 2,83 b Ouro Branco x CNFP 10132.133 6,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.120 2,83 b Ouro Branco x CNFP 10132.197 6,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.162 2,83 b CNFP 10132 6,67 b Ouro Branco x CNFP 10132.197 2,83 b Ouro Branco x CNFP 10132.43 6,83 b CNFP 10132 2,83 b Ouro Branco x CNFP 10132.102 6,83 b Ouro Branco x CNFP 10132.36 3 b Ouro Branco x CNFP 10132.141 6,83 b Ouro Branco x CNFP 10132.56 3 b BRS Esplendor 6,83 b

Apêndice A – Continuação...

Inverno Águas Média de Média de Linhagens Severidade Linhagens Severidade Ouro Branco x CNFP 10132.91 3 b Ouro Branco x CNFP 10132.11 7 c Ouro Branco x CNFP 10132.95 3 b Ouro Branco x CNFP 10132.57 7 c Ouro Branco x CNFP 10132.98 3 b Ouro Branco x CNFP 10132.66 7 c Ouro Branco x CNFP 10132.109 3 b Ouro Branco x CNFP 10132.124 7 c Ouro Branco x CNFP 10132.165 3 b Ouro Branco x CNFP 10132.134 7 c Ouro Branco x CNFP 10132.174 3 b Ouro Branco x CNFP 10132.135 7 c Ouro Branco x CNFP 10132.179 3 b Ouro Branco x CNFP 10132.177 7 c Ouro Branco x CNFP 10132.35 3,17 b Ouro Branco 7 c Ouro Branco x CNFP 10132.47 3,17 b Ouro Branco x CNFP 10132.24 7,17 c Ouro Branco x CNFP 10132.66 3,17 b Ouro Branco x CNFP 10132.33 7,17 c Ouro Branco x CNFP 10132.129 3,17 b Ouro Branco x CNFP 10132.67 7,17 c Ouro Branco x CNFP 10132.155 3,17 b Ouro Branco x CNFP 10132.70 7,17 c Ouro Branco x CNFP 10132.188 3,17 b Ouro Branco x CNFP 10132.88 7,17 c Ouro Branco x CNFP 10132.190 3,17 b Ouro Branco x CNFP 10132.117 7,17 c Ouro Branco x CNFP 10132.195 3,17 b Ouro Branco x CNFP 10132.146 7,17 c Ouro Branco x CNFP 10132.5 3,33 b Ouro Branco x CNFP 10132.188 7,17 c Ouro Branco x CNFP 10132.6 3,33 b Ouro Branco x CNFP 10132.193 7,17 c Ouro Branco x CNFP 10132.70 3,33 b Ouro Branco x CNFP 10132.23 7,33 c Ouro Branco x CNFP 10132.94 3,33 b Ouro Branco x CNFP 10132.36 7,33 c Ouro Branco x CNFP 10132.135 3,33 b Ouro Branco x CNFP 10132.44 7,33 c Ouro Branco x CNFP 10132.142 3,33 b Ouro Branco x CNFP 10132.56 7,33 c Ouro Branco x CNFP 10132.159 3,33 b Ouro Branco x CNFP 10132.72 7,33 c Ouro Branco x CNFP 10132.163 3,33 b Ouro Branco x CNFP 10132.89 7,33 c Ouro Branco x CNFP 10132.191 3,33 b Ouro Branco x CNFP 10132.123 7,33 c Ouro Branco x CNFP 10132.198 3,33 b Ouro Branco x CNFP 10132.165 7,33 c Ouro Branco x CNFP 10132.42 3,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.166 7,33 c Ouro Branco x CNFP 10132.51 3,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.22 7,5 c Ouro Branco x CNFP 10132.71 3,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.25 7,5 c Ouro Branco x CNFP 10132.134 3,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.26 7,5 c Ouro Branco x CNFP 10132.141 3,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.75 7,5 c Ouro Branco x CNFP 10132.148 3,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.77 7,5 c Ouro Branco 3,5 b Ouro Branco x CNFP 10132.91 7,5 c Ouro Branco x CNFP 10132.14 3,67 c Ouro Branco x CNFP 10132.93 7,5 c Ouro Branco x CNFP 10132.18 3,67 c Ouro Branco x CNFP 10132.127 7,5 c Ouro Branco x CNFP 10132.164 3,67 c Ouro Branco x CNFP 10132.161 7,5 c Ouro Branco x CNFP 10132.178 3,67 c Ouro Branco x CNFP 10132.164 7,5 c Ouro Branco x CNFP 10132.192 3,67 c Ouro Branco x CNFP 10132.179 7,5 c Ouro Branco x CNFP 10132.200 3,67 c Ouro Branco x CNFP 10132.184 7,5 c

Apêndice A – Continuação...

Inverno Águas Média de Média de Linhagens Severidade Linhagens Severidade Ouro Branco x CNFP 10132.44 3,83 c Ouro Branco x CNFP 10132.105 7,6 c Ouro Branco x CNFP 10132.68 3,83 c Ouro Branco x CNFP 10132.1 7,67 c Ouro Branco x CNFP 10132.96 3,83 c Ouro Branco x CNFP 10132.6 7,67 c Ouro Branco x CNFP 10132.116 3,83 c Ouro Branco x CNFP 10132.18 7,67 c Ouro Branco x CNFP 10132.123 3,83 c Ouro Branco x CNFP 10132.65 7,67 c Ouro Branco x CNFP 10132.146 3,83 c Ouro Branco x CNFP 10132.96 7,67 c Ouro Branco x CNFP 10132.193 3,83 c Ouro Branco x CNFP 10132.144 7,67 c Ouro Branco x CNFP 10132.194 3,83 c Ouro Branco x CNFP 10132.148 7,67 c BRS 7762 Supremo 3,83 c Ouro Branco x CNFP 10132.162 7,67 c Ouro Branco x CNFP 10132.21 4 c Ouro Branco x CNFP 10132.174 7,67 c Ouro Branco x CNFP 10132.54 4 c Ouro Branco x CNFP 10132.178 7,67 c Ouro Branco x CNFP 10132.57 4 c Ouro Branco x CNFP 10132.195 7,67 c Ouro Branco x CNFP 10132.59 4 c Ouro Branco x CNFP 10132.4 7,83 d Ouro Branco x CNFP 10132.166 4 c Ouro Branco x CNFP 10132.5 7,83 d Ouro Branco x CNFP 10132.175 4 c Ouro Branco x CNFP 10132.15 7,83 d Ouro Branco x CNFP 10132.88 4,17 c Ouro Branco x CNFP 10132.71 7,83 d Ouro Branco x CNFP 10132.124 4,17 c Ouro Branco x CNFP 10132.175 7,83 d Ouro Branco x CNFP 10132.161 4,17 c Ouro Branco x CNFP 10132.190 7,83 d Ouro Branco x CNFP 10132.34 4,33 c Ouro Branco x CNFP 10132.194 7,83 d Ouro Branco x CNFP 10132.67 4,33 c Ouro Branco x CNFP 10132.198 7,83 d Ouro Branco x CNFP 10132.92 4,33 c Ouro Branco x CNFP 10132.155 8 d Ouro Branco x CNFP 10132.105 4,5 c Ouro Branco x CNFP 10132.158 8 d Ouro Branco x CNFP 10132.177 4,5 c Ouro Branco x CNFP 10132.163 8 d Ouro Branco x CNFP 10132.65 4,67 c Ouro Branco x CNFP 10132.169 8 d Ouro Branco x CNFP 10132.9 4,83 c Ouro Branco x CNFP 10132.200 8 d Ouro Branco x CNFP 10132.15 4,83 c Ouro Branco x CNFP 10132.9 8,17 d Ouro Branco x CNFP 10132.156 5,17 d Ouro Branco x CNFP 10132.98 8,17 d Ouro Branco x CNFP 10132.41 5,67 d Ouro Branco x CNFP 10132.192 8,33 e Ouro Branco x CNFP 10132.160 5,83 d Ouro Branco x CNFP 10132.16 8,5 e Ouro Branco x CNFP 10132.1 6 d Ouro Branco x CNFP 10132.41 8,5 e Ouro Branco x CNFP 10132.27 6 d Ouro Branco x CNFP 10132.21 8,83 e Ouro Branco x CNFP 10132.186 6,17 d Ouro Branco x CNFP 10132.27 8,83 e Ouro Branco x CNFP 10132.89 6,83 e Ouro Branco x CNFP 10132.156 8,83 e Ouro Branco x CNFP 10132.169 7 e Ouro Branco x CNFP 10132.160 9 e *Médias seguidas por mesma letra não diferem estatisticamente pelo teste de Scott & Knott (1974) (p<0,05).

Apêndice B - Médias de severidade de genótipos de feijoeiro-comum inoculados por Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli em condições de ambiente controlado em dois ensaios. Primeiro Ensaio Segundo Ensaio Linhagens Médias de Linhagens Médias de Severidade Severidade Ouro Branco x CNFP 10132.23 1.00 a* Ouro Branco x CNFP 10132.4 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.40 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.36 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.43 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.50 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.71 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.51 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.77 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.62 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.79 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.63 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.91 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.66 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.113 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.71 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.121 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.75 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.133 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.90 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.134 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.91 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.135 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.93 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.146 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.102 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.148 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.112 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.165 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.113 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.174 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.117 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.190 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.118 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.192 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.154 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.196 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.179 1.00 a CNFP 10132.200 1.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.28 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.16 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.79 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.28 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.84 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.29 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.133 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.30 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.144 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.31 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.147 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.50 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.149 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.51 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.200 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.62 1.11 a Ouro Branco 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.98 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.43 1.22 a Ouro Branco x CNFP 10132.198 1.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.80 1.22 a Ouro Branco x CNFP 10132.5 1.22 a Ouro Branco x CNFP 10132.146 1.22 a Ouro Branco x CNFP 10132.20 1.22 a Ouro Branco x CNFP 10132.174 1.22 a Ouro Branco x CNFP 10132.21 1.22 a Ouro Branco x CNFP 10132.190 1.22 a Ouro Branco x CNFP 10132.22 1.22 a Ouro Branco x CNFP 10132.22 1.33 a Ouro Branco x CNFP 10132.26 1.22 a Ouro Branco x CNFP 10132.23 1.33 a Ouro Branco x CNFP 10132.34 1.22 a Ouro Branco x CNFP 10132.25 1.33 a

Apêndice B – Continuação...

Primeiro Ensaio Segundo Ensaio Linhagens Médias de Linhagens Médias de Severidade Severidade Ouro Branco x CNFP 10132.44 1.22 a Ouro Branco x CNFP 10132.127 1.33 a Ouro Branco x CNFP 10132.56 1.22 a Ouro Branco x CNFP 10132.148 1.33 a Ouro Branco x CNFP 10132.147 1.22 a Ouro Branco x CNFP 10132.12 1.44 a Ouro Branco x CNFP 10132.200 1.22 a Ouro Branco x CNFP 10132.21 1.44 a Ouro Branco x CNFP 10132.24 1.33 a Ouro Branco x CNFP 10132.42 1.44 a Ouro Branco x CNFP 10132.25 1.33 a Ouro Branco x CNFP 10132.56 1.44 a Ouro Branco x CNFP 10132.84 1.33 a Ouro Branco x CNFP 10132.29 1.56 a Ouro Branco x CNFP 10132.112 1.33 a Ouro Branco x CNFP 10132.122 1.56 a Ouro Branco x CNFP 10132.149 1.33 a Ouro Branco x CNFP 10132.134 1.56 a Ouro Branco x CNFP 10132.166 1.33 a Ouro Branco x CNFP 10132.135 1.56 a Ouro Branco x CNFP 10132.194 1.33 a Ouro Branco x CNFP 10132.164 1.56 a Ouro Branco x CNFP 10132.36 1.44 a CNFP 10132 1.56 a Ouro Branco x CNFP 10132.63 1.44 a Ouro Branco x CNFP 10132.26 1.67 a Ouro Branco x CNFP 10132.104 1.44 a Ouro Branco x CNFP 10132.58 1.67 a Ouro Branco x CNFP 10132.118 1.44 a Ouro Branco x CNFP 10132.74 1.67 a Ouro Branco x CNFP 10132.179 1.44 a Ouro Branco x CNFP 10132.121 1.67 a Ouro Branco x CNFP 10132.7 1.56 a Ouro Branco x CNFP 10132.24 1.78 a Ouro Branco x CNFP 10132.80 1.56 a Ouro Branco x CNFP 10132.31 1.78 a BRS Esplendor 1.56 a Ouro Branco x CNFP 10132.104 1.78 a Ouro Branco x CNFP 10132.49 1.67 a BRS Esplendor 1.78 a Ouro Branco x CNFP 10132.140 1.67 a Ouro Branco x CNFP 10132.30 1.89 a Ouro Branco x CNFP 10132.162 1.67 a Ouro Branco x CNFP 10132.34 1.89 a Ouro Branco x CNFP 10132.164 1.67 a Ouro Branco x CNFP 10132.40 1.89 a Ouro Branco x CNFP 10132.186 1.67 a Ouro Branco x CNFP 10132.88 1.89 a Ouro Branco x CNFP 10132.117 1.78 a Ouro Branco x CNFP 10132.140 1.89 a Ouro Branco x CNFP 10132.144 1.78 a Ouro Branco x CNFP 10132.158 1.89 a Ouro Branco x CNFP 10132.197 1.78 a Ouro Branco x CNFP 10132.165 1.89 a Ouro Branco x CNFP 10132.2 1.89 a Ouro Branco x CNFP 10132.198 1.89 a Ouro Branco x CNFP 10132.75 1.89 a Ouro Branco x CNFP 10132.44 2.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.88 1.89 a Ouro Branco x CNFP 10132.49 2.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.105 1.89 a Ouro Branco x CNFP 10132.59 2.00 a Ouro Branco x CNFP 10132.122 1.89 a Ouro Branco x CNFP 10132.20 2.11 a Ouro Branco 1.89 a Ouro Branco x CNFP 10132.61 2.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.52 2.00 b Ouro Branco x CNFP 10132.94 2.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.61 2.00 b Ouro Branco x CNFP 10132.187 2.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.175 2.00 b Ouro Branco x CNFP 10132.196 2.11 a Ouro Branco x CNFP 10132.193 2.00 b Ouro Branco x CNFP 10132.68 2.22 b Ouro Branco x CNFP 10132.35 2.11 b Ouro Branco x CNFP 10132.177 2.22 b

Apêndice B – Continuação...

Primeiro Ensaio Segundo Ensaio Linhagens Médias de Linhagens Médias de Severidade Severidade Ouro Branco x CNFP 10132.68 2.11 b Ouro Branco x CNFP 10132.77 2.33 b Ouro Branco x CNFP 10132.72 2.11 b Ouro Branco x CNFP 10132.192 2.33 b Ouro Branco x CNFP 10132.125 2.11 b Ouro Branco x CNFP 10132.193 2.33 b Ouro Branco x CNFP 10132.163 2.11 b Ouro Branco x CNFP 10132.11 2.44 b Ouro Branco x CNFP 10132.177 2.11 b Ouro Branco x CNFP 10132.33 2.44 b Ouro Branco x CNFP 10132.189 2.11 b Ouro Branco x CNFP 10132.48 2.44 b BRS 7762 Supremo 2.11 b Ouro Branco x CNFP 10132.129 2.44 b Ouro Branco x CNFP 10132.182 2.22 b Ouro Branco x CNFP 10132.189 2.44 b Ouro Branco x CNFP 10132.15 2.33 b Ouro Branco x CNFP 10132.57 2.56 b Ouro Branco x CNFP 10132.47 2.33 b Ouro Branco x CNFP 10132.125 2.56 b Ouro Branco x CNFP 10132.120 2.33 b Ouro Branco x CNFP 10132.163 2.56 b Ouro Branco x CNFP 10132.129 2.33 b Ouro Branco x CNFP 10132.35 2.67 b Ouro Branco x CNFP 10132.160 2.33 b Ouro Branco x CNFP 10132.98 2.67 b Ouro Branco x CNFP 10132.12 2.44 b Ouro Branco x CNFP 10132.175 2.67 b Ouro Branco x CNFP 10132.54 2.44 b Ouro Branco x CNFP 10132.178 2.67 b Ouro Branco x CNFP 10132.4 2.56 b Ouro Branco x CNFP 10132.47 2.78 b Ouro Branco x CNFP 10132.14 2.56 b Ouro Branco x CNFP 10132.72 2.78 b Ouro Branco x CNFP 10132.94 2.56 b Ouro Branco x CNFP 10132.55 2.89 b Ouro Branco x CNFP 10132.161 2.56 b Ouro Branco x CNFP 10132.16 3.00 b Ouro Branco x CNFP 10132.169 2.56 b Ouro Branco x CNFP 10132.197 3.00 b Ouro Branco x CNFP 10132.106 2.78 b Ouro Branco x CNFP 10132.120 3.11 b Ouro Branco x CNFP 10132.127 2.78 b Ouro Branco x CNFP 10132.169 3.11 b Ouro Branco x CNFP 10132.66 2.89 b Ouro Branco x CNFP 10132.194 3.11 b Ouro Branco x CNFP 10132.58 3.00 b Ouro Branco x CNFP 10132.105 3.22 c Ouro Branco x CNFP 10132.95 3.00 b Ouro Branco x CNFP 10132.123 3.44 c Ouro Branco x CNFP 10132.154 3.00 b Ouro Branco x CNFP 10132.7 3.56 c Ouro Branco x CNFP 10132.158 3.00 b Ouro Branco x CNFP 10132.3 3.67 c Ouro Branco x CNFP 10132.90 3.22 b Ouro Branco x CNFP 10132.52 3.67 c Ouro Branco x CNFP 10132.124 3.22 b Ouro Branco x CNFP 10132.70 3.78 c Ouro Branco x CNFP 10132.139 3.44 b Ouro Branco x CNFP 10132.2 3.89 c Ouro Branco x CNFP 10132.48 3.56 b Ouro Branco x CNFP 10132.124 3.89 c Ouro Branco x CNFP 10132.74 3.56 b Ouro Branco x CNFP 10132.162 4.00 c Ouro Branco x CNFP 10132.141 3.56 b Ouro Branco x CNFP 10132.95 4.11 c Ouro Branco x CNFP 10132.93 3.67 c Ouro Branco x CNFP 10132.195 4.44 d Ouro Branco x CNFP 10132.159 3.67 c Ouro Branco x CNFP 10132.65 4.67 d Ouro Branco x CNFP 10132.42 3.78 c Ouro Branco x CNFP 10132.6 4.89 d Ouro Branco x CNFP 10132.187 3.78 c Ouro Branco x CNFP 10132.139 4.89 d Ouro Branco x CNFP 10132.188 3.78 c Ouro Branco x CNFP 10132.1 5.11 d

Apêndice B – Continuação...

Primeiro Ensaio Segundo Ensaio Linhagens Médias de Linhagens Médias de Severidade Severidade Ouro Branco x CNFP 10132.11 3.89 c Ouro Branco x CNFP 10132.41 5.11 d Ouro Branco x CNFP 10132.195 4.00 c Ouro Branco x CNFP 10132.106 5.11 d Ouro Branco x CNFP 10132.3 4.22 c Ouro Branco x CNFP 10132.14 5.22 d Ouro Branco x CNFP 10132.57 4.22 c Ouro Branco x CNFP 10132.184 5.22 d Ouro Branco x CNFP 10132.70 4.33 c Ouro Branco x CNFP 10132.166 5.56 d Ouro Branco x CNFP 10132.184 4.56 c BRS 7762 Supremo 5.78 d Ouro Branco x CNFP 10132.55 4.67 c Ouro Branco x CNFP 10132.186 5.89 d Ouro Branco x CNFP 10132.59 4.67 c Ouro Branco x CNFP 10132.89 6.11 d Ouro Branco x CNFP 10132.92 4.67 c Ouro Branco x CNFP 10132.18 6.22 e Ouro Branco x CNFP 10132.102 4.89 c Ouro Branco x CNFP 10132.27 6.33 e Ouro Branco x CNFP 10132.123 4.89 c Ouro Branco x CNFP 10132.67 6.33 e Ouro Branco x CNFP 10132.96 5.11 c Ouro Branco x CNFP 10132.5 6.44 e Ouro Branco x CNFP 10132.178 5.22 c Ouro Branco x CNFP 10132.141 6.78 e Ouro Branco x CNFP 10132.1 5.67 d Ouro Branco x CNFP 10132.159 6.78 e Ouro Branco x CNFP 10132.9 5.78 d Ouro Branco x CNFP 10132.188 6.78 e Ouro Branco x CNFP 10132.191 5.78 d Ouro Branco x CNFP 10132.9 6.89 e Ouro Branco x CNFP 10132.114 6.00 d Ouro Branco x CNFP 10132.54 6.89 e Ouro Branco x CNFP 10132.111 6.22 d Ouro Branco x CNFP 10132.15 7.00 e Ouro Branco x CNFP 10132.109 6.44 d Ouro Branco x CNFP 10132.96 7.00 e Ouro Branco x CNFP 10132.27 6.56 d Ouro Branco x CNFP 10132.142 7.00 e Ouro Branco x CNFP 10132.18 6.67 d Ouro Branco x CNFP 10132.109 7.11 e Ouro Branco x CNFP 10132.33 6.67 d Ouro Branco x CNFP 10132.111 7.11 e Ouro Branco x CNFP 10132.142 6.67 d Ouro Branco x CNFP 10132.191 7.11 e Ouro Branco x CNFP 10132.89 6.78 d Ouro Branco x CNFP 10132.161 7.33 e Ouro Branco x CNFP 10132.45 7.44 e Ouro Branco x CNFP 10132.92 7.56 f Ouro Branco x CNFP 10132.67 7.44 e Ouro Branco x CNFP 10132.114 7.67 f Ouro Branco x CNFP 10132.65 7.78 e Ouro Branco x CNFP 10132.182 7.78 f Ouro Branco x CNFP 10132.41 8.11 e Ouro Branco x CNFP 10132.45 8.67 f Ouro Branco x CNFP 10132.6 8.44 e Ouro Branco x CNFP 10132.160 8.78 f *Médias seguidas por mesma letra não diferem estatisticamente pelo teste de Scott & Knott (1974) (p<0,05).

Apêndice C - Área abaixo da curva do progresso da doença (AACDP) de genótipos de feijoeiro-comum à Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli (Ensaios 1 e 2). Genótipo Ensaio 1 - AACPD Ensaio 2 - AACPD Média Ouro Branco x CNFP 10132.113 18.00 a* 18.00 a 18.00 Ouro Branco x CNFP 10132.71 18.00 a 18.00 a 18.00 Ouro Branco x CNFP 10132.91 18.00 a 18.00 a 18.00 Ouro Branco x CNFP 10132.50 19.00 a 18.00 a 18.50 Ouro Branco x CNFP 10132.51 19.00 a 18.00 a 18.50 Ouro Branco x CNFP 10132.62 19.00 a 18.00 a 18.50 Ouro Branco x CNFP 10132.79 18.00 a 19.00 a 18.50 Ouro Branco x CNFP 10132.146 18.00 a 20.00 a 19.00 Ouro Branco x CNFP 10132.28 19.00 a 19.00 a 19.00 Ouro Branco x CNFP 10132.43 18.00 a 20.00 a 19.00 Ouro Branco x CNFP 10132.133 18.00 a 20.33 a 19.17 Ouro Branco x CNFP 10132.190 18.00 a 20.33 a 19.17 Ouro Branco x CNFP 10132.147 20.00 a 19.00 a 19.50 Ouro Branco x CNFP 10132.23 18.00 a 21.00 a 19.50 Ouro Branco x CNFP 10132.174 18.00 a 21.33 a 19.67 Ouro Branco x CNFP 10132.200 20.33 a 19.00 a 19.67 Ouro Branco x CNFP 10132.148 18.00 a 22.33 a 20.17 Ouro Branco x CNFP 10132.179 22.67 a 18.00 a 20.33 Ouro Branco x CNFP 10132.149 22.33 a 19.00 a 20.67 Ouro Branco x CNFP 10132.84 22.33 a 19.00 a 20.67 CNFP 10132 18.00 a 23.67 a 20.83 Ouro Branco x CNFP 10132.118 23.67 a 18.00 a 20.83 Ouro Branco x CNFP 10132.36 23.67 a 18.00 a 20.83 Ouro Branco x CNFP 10132.22 20.00 a 22.33 a 21.17 Ouro Branco x CNFP 10132.63 24.67 a 18.00 a 21.33 Ouro Branco x CNFP 10132.112 25.00 a 18.00 a 21.50 Ouro Branco x CNFP 10132.135 18.00 a 25.00 a 21.50 Ouro Branco x CNFP 10132.134 18.00 a 25.67 a 21.83 Ouro Branco x CNFP 10132.25 21.33 a 22.67 a 22.00 Ouro Branco x CNFP 10132.21 20.00 a 24.67 a 22.33 Ouro Branco x CNFP 10132.29 19.00 a 25.67 a 22.33 Ouro Branco x CNFP 10132.80 24.67 a 20.00 a 22.33 Ouro Branco x CNFP 10132.121 18.00 a 27.33 a 22.67 Ouro Branco x CNFP 10132.40 18.00 a 28.33 a 23.17 Ouro Branco x CNFP 10132.56 21.33 a 25.00 a 23.17 Ouro Branco x CNFP 10132.26 20.00 a 27.00 a 23.50 Ouro Branco x CNFP 10132.196 18.00 a 29.33 a 23.67 Ouro Branco x CNFP 10132.31 19.00 a 28.33 a 23.67 Ouro Branco x CNFP 10132.117 29.67 a 18.00 a 23.83

Apêndice C – Continuação...

Genótipo Ensaio 1 - AACPD Ensaio 2 - AACPD Média Ouro Branco x CNFP 10132.24 21.00 a 27.00 a 24.00 Ouro Branco x CNFP 10132.144 29.33 a 19.00 a 24.17 Ouro Branco x CNFP 10132.198 19.00 a 29.33 a 24.17 Ouro Branco x CNFP 10132.30 19.00 a 29.33 a 24.17 Ouro Branco x CNFP 10132.75 30.67 a 18.00 a 24.33 Ouro Branco x CNFP 10132.165 18.00 a 31.67 a 24.83 Ouro Branco x CNFP 10132.34 21.33 a 29.67 a 25.50 BRS Esplendor 25.67 a 26.00 a 25.83 Ouro Branco x CNFP 10132.104 22.67 a 29.33 a 26.00 Ouro Branco 32.00 a 20.33 a 26.17 Ouro Branco x CNFP 10132.44 20.00 a 33.00 a 26.50 Ouro Branco x CNFP 10132.164 28.00 a 25.67 a 26.83 Ouro Branco x CNFP 10132.77 18.00 a 36.33 b 27.17 Ouro Branco x CNFP 10132.122 29.33 a 26.00 a 27.67 Ouro Branco x CNFP 10132.192 18.00 a 37.67 b 27.83 Ouro Branco x CNFP 10132.20 21.33 a 35.33 b 28.33 Ouro Branco x CNFP 10132.93 40.00 a 18.00 a 29.00 Ouro Branco x CNFP 10132.140 27.00 a 31.67 a 29.33 Ouro Branco x CNFP 10132.98 19.00 a 40.00 b 29.50 Ouro Branco x CNFP 10132.49 27.00 a 34.00 a 30.50 Ouro Branco x CNFP 10132.4 43.33 a 18.00 a 30.67 Ouro Branco x CNFP 10132.16 19.00 a 43.33 b 31.17 Ouro Branco x CNFP 10132.88 30.67 a 31.67 a 31.17 Ouro Branco x CNFP 10132.12 40.00 a 23.33 a 31.67 Ouro Branco x CNFP 10132.61 28.33 a 35.33 b 31.83 Ouro Branco x CNFP 10132.66 50.67 a 18.00 a 34.33 Ouro Branco x CNFP 10132.154 51.67 a 18.00 a 34.83 Ouro Branco x CNFP 10132.127 46.00 a 23.67 a 34.83 Ouro Branco x CNFP 10132.194 21.33 a 50.33 c 35.83 Ouro Branco x CNFP 10132.68 34.33 a 37.33 b 35.83 Ouro Branco x CNFP 10132.193 34.00 a 37.67 b 35.83 Ouro Branco x CNFP 10132.90 53.67 a 18.00 a 35.83 Ouro Branco x CNFP 10132.163 32.67 a 40.00 b 36.33 Ouro Branco x CNFP 10132.189 33.00 a 39.67 b 36.33 Ouro Branco x CNFP 10132.177 34.00 a 39.00 b 36.50 Ouro Branco x CNFP 10132.58 45.67 a 27.33 a 36.50 Ouro Branco x CNFP 10132.94 41.00 a 34.00 a 37.50 Ouro Branco x CNFP 10132.125 34.00 a 42.33 b 38.17 Ouro Branco x CNFP 10132.175 33.00 a 43.33 b 38.17

Apêndice C – Continuação...

Genótipo Ensaio 1 - AACPD Ensaio 2 - AACPD Média Ouro Branco x CNFP 10132.35 33.00 a 45.67 b 39.33 Ouro Branco x CNFP 10132.158 48.00 a 31.67 a 39.83 Ouro Branco x CNFP 10132.72 34.33 a 46.00 b 40.17 Ouro Branco x CNFP 10132.129 37.33 a 43.33 b 40.33 Ouro Branco x CNFP 10132.197 29.33 a 51.67 c 40.50 Ouro Branco x CNFP 10132.47 41.33 a 41.33 b 41.33 Ouro Branco x CNFP 10132.105 29.67 a 54.00 c 41.83 Ouro Branco x CNFP 10132.74 56.33 a 28.00 a 42.17 Ouro Branco x CNFP 10132.7 26.00 a 59.67 c 42.83 Ouro Branco x CNFP 10132.42 64.67 b 23.67 a 44.17 Ouro Branco x CNFP 10132.120 40.00 a 50.33 c 45.17 Ouro Branco x CNFP 10132.162 27.00 a 63.33 c 45.17 Ouro Branco x CNFP 10132.52 29.67 a 61.00 c 45.33 Ouro Branco x CNFP 10132.169 41.00 a 52.67 c 46.83 Ouro Branco x CNFP 10132.2 30.67 a 64.33 c 47.50 Ouro Branco x CNFP 10132.95 29.33 a 69.00 d 49.17 Ouro Branco x CNFP 10132.187 65.67 b 33.00 a 49.33 Ouro Branco x CNFP 10132.48 60.00 a 40.00 b 50.00 Ouro Branco x CNFP 10132.102 83.33 b 18.00 a 50.67 Ouro Branco x CNFP 10132.11 63.33 b 43.33 b 53.33 Ouro Branco x CNFP 10132.59 75.00 b 35.33 b 55.17 Ouro Branco x CNFP 10132.57 69.00 b 42.33 b 55.67 Ouro Branco x CNFP 10132.166 22.67 a 89.00 d 55.83 Ouro Branco x CNFP 10132.124 50.33 a 63.33 c 56.83 Ouro Branco x CNFP 10132.186 26.00 a 93.67 e 59.83 Ouro Branco x CNFP 10132.178 78.67 b 43.33 b 61.00 Ouro Branco x CNFP 10132.5 20.00 a 104.33 e 62.17 Ouro Branco x CNFP 10132.106 44.33 a 82.00 d 63.17 Ouro Branco x CNFP 10132.55 77.33 b 49.33 c 63.33 Ouro Branco x CNFP 10132.139 52.67 a 75.00 d 63.83 Ouro Branco x CNFP 10132.14 43.33 a 85.33 d 64.33 Ouro Branco x CNFP 10132.3 70.00 b 58.67 c 64.33 BRS 7762 Supremo 35.33 a 93.67 e 64.50 Ouro Branco x CNFP 10132.70 70.33 b 60.00 c 65.17 Ouro Branco x CNFP 10132.123 74.67 b 56.33 c 65.50 Ouro Branco x CNFP 10132.195 61.00 a 76.00 d 68.50 Ouro Branco x CNFP 10132.33 112.33 c 36.33 b 74.33 Ouro Branco x CNFP 10132.54 38.67 a 113.67 f 76.17 Ouro Branco x CNFP 10132.15 37.67 a 116.00 f 76.83

Apêndice C – Continuação...

Genótipo Ensaio 1 - AACPD Ensaio 2 - AACPD Média Ouro Branco x CNFP 10132.184 74.67 b 86.67 d 80.67 Ouro Branco x CNFP 10132.161 38.67 a 125.33 f 82.00 Ouro Branco x CNFP 10132.159 57.33 a 111.33 f 84.33 Ouro Branco x CNFP 10132.1 92.33 b 77.33 d 84.83 Ouro Branco x CNFP 10132.141 58.67 a 111.33 f 85.00 Ouro Branco x CNFP 10132.182 35.00 a 137.00 g 86.00 Ouro Branco x CNFP 10132.188 59.67 a 114.67 f 87.17 Ouro Branco x CNFP 10132.160 36.67 a 153.33 g 95.00 Ouro Branco x CNFP 10132.92 67.00 b 127.67 f 97.33 Ouro Branco x CNFP 10132.96 80.67 b 116.00 f 98.33 Ouro Branco x CNFP 10132.65 132.33 c 72.67 d 102.50 Ouro Branco x CNFP 10132.9 91.33 b 113.67 f 102.50 Ouro Branco x CNFP 10132.27 106.67 c 102.00 e 104.33 Ouro Branco x CNFP 10132.18 109.00 c 102.00 E 105.50 Ouro Branco x CNFP 10132.191 91.33 b 120.67 f 106.00 Ouro Branco x CNFP 10132.111 99.67 c 118.33 f 109.00 Ouro Branco x CNFP 10132.89 116.00 c 103.00 e 109.50 Ouro Branco x CNFP 10132.6 146.33 c 75.00 d 110.67 Ouro Branco x CNFP 10132.109 104.33 c 118.33 f 111.33 Ouro Branco x CNFP 10132.114 95.00 b 130.00 f 112.50 Ouro Branco x CNFP 10132.142 109.00 c 118.33 f 113.67 Ouro Branco x CNFP 10132.67 125.33 c 102.00 e 113.67 Ouro Branco x CNFP 10132.41 141.67 c 85.67 d 113.67 Ouro Branco x CNFP 10132.45 125.33 c 151.00 g 138.17 CV(%) 47.69 27.76 *Médias seguidas por mesma letra não diferem estatisticamente pelo teste de Scott & Knott (1974) (p<0,05).

Apêndice D – Marcadores SSRs e SNPs de Phaseolus vulgaris significativos (p<0,05 e p<0,01) detectados na safra da águas, safra de inverno e nos dois ensaios em ambiente controlado à reação à Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli Primeiro Localização Águas Inverno Segundo Ensaio Marcador Crom. Ensaio (pb) 2 2 2 2 pr(F) R pr(F) R pr(F) R pr(F) R BARC-PV- 1 656652 0,029* 0,054 0,055 0,034 0,603 0,002 0,266 0,011 0003886 BARC-PV- 1 3558527 0,203 0,014 0,033* 0,043 0,992 0 0,332 0,010 0003474 BARC-PV- 1 7552138 0,726 0,011 0,044* 0,090 0,817 0 0,732 0,001 0003399 BARC-PV- 1 11784824 0,726 0 0,044* 0,040 0,817 0,003 0,732 0,010 0005875 BARC-PV- 1 12808111 0,726 0,008 0,044* 0,064 0,817 0 0,732 0,003 0005480 BARC-PV- 1 13286208 0,726 0,003 0,044* 0,053 0,817 0,001 0,732 0,006 0004130 BARC-PV- 1 14652950 0,726 0 0,044* 0,023 0,817 0,002 0,732 0,010 0003821 BARC-PV- 1 19020179 0,726 0 0,044* 0,060 0,817 0,001 0,732 0 0003741 BARC-PV- 1 22330041 0,726 0,002 0,044* 0,050 0,817 0,003 0,732 0,008 0004667 BARC-PV- 1 22930356 0,726 0,001 0,044* 0,032 0,817 0,004 0,732 0,010 0003933 BARC-PV- 1 23251005 0,726 0,005 0,044* 0,065 0,817 0,001 0,732 0,005 0005778 BARC-PV- 1 23913702 0,726 0,001 0,044* 0,029 0,817 0,001 0,732 0,008 0005524 BARC-PV- 1 25805731 0,726 0,001 0,044* 0,044 0,817 0 0,732 0,004 0004536 BARC-PV- 1 26109366 0,726 0,005 0,044* 0,065 0,817 0,001 0,732 0,005 0004233 BARC-PV- 1 28107998 0,726 0,005 0,044* 0,065 0,817 0,001 0,732 0,005 0005874 PV115 1 36134344 0,022* 0,042 0,005** 0,061 0,504 0,005 0,057 0,039 BARC-PV- 1 43127402 0,081 0,041 0,016* 0,062 0,346 0,011 0,231 0,017 0003651 PV251 1 50673414 0,015* 0,079 0,001** 0,120 0,781 0 0,189 0,009 BARC-PV- 2 23133780 0,035* 0,048 0,211 0,017 0,991 0 0,544 0,004 0006196 BARC-PV- 2 36426514 0,024* 0,054 0,396 0,019 0,137 0,015 0,240 0,008 0003999 BARC-PV- 2 37322043 0,024* 0,057 0,396 0,016 0,137 0,019 0,240 0,009 0003812 BARC-PV- 2 40633880 0,061 0,041 0,534 0,009 0,020* 0,047 0,051 0,025 0004274 BM164 2 46039840 0,043* 0,065 0,406 0,010 0,054 0,030 0,116 0,017 BARC-PV- 2 46388961 0,061 0,032 0,534 0 0,020* 0,047 0,051 0,023 0004238 PV83 5 2696703 0,873 0,016 0,046* 0,021 0,936 0,000 0,195 0,016 BARC-PV- 5 10149272 0,150 0,019 0,003** 0,074 0,193 0,019 0,055 0,045 0004636 BARC-PV- 5 10195827 0,083 0,025 0,001** 0,099 0,244 0,020 0,107 0,029 0003048

Apêndice D – Continuação...

Primeiro Localização Águas Inverno Segundo Ensaio Marcador Crom. Ensaio (pb) 2 2 2 2 pr(F) R pr(F) R pr(F) R pr(F) R BARC-PV- 5 19722620 0,809 0 0,049* 0,056 0,545 0,003 0,962 0 0005202 BARC-PV- 5 21407272 0,586 0,002 0,008** 0,099 0,951 0 0,486 0,001 0005461 BARC-PV- 5 21545353 0,809 0 0,049* 0,042 0,545 0,004 0,962 0 0003756 BARC-PV- 5 26851655 0,724 0 0,003** 0,036 0,890 0 0,546 0,004 0003282 BARC-PV- 5 33432130 0,588 0,003 0,002** 0,095 0,563 0,003 0,107 0,028 0004532 BARC-PV- 5 33913514 0,670 0,003 0,003** 0,093 0,579 0,002 0,163 0,022 0004007 BARC-PV- 5 35147141 0,724 0,001 0,003** 0,092 0,432 0,006 0,075 0,034 0005249 BM175 5 37077612 0,715 0,001 0,002** 0,116 0,593 0 0,102 0,028 BARC-PV- 5 40394094 0,011* 0,057 0,841 0 0,403 0,006 0,523 0,003 0003680 BARC-PV- 6 1070965 0,083 0,025 0,001** 0,095 0,244 0,013 0,107 0,028 0003706 BARC-PV- 6 1754501 0,150 0,030 0,003** 0,087 0,193 0,019 0,055 0,019 0004934 BARC-PV- 6 1808250 0,083 0,025 0,001** 0,095 0,244 0,013 0,107 0,028 0003383 BARC-PV- 6 8633260 0,083 0,005 0,001** 0,102 0,244 0,020 0,107 0,029 0004895 BARC-PV- 6 14090279 0,023* 0,051 0,391 0,005 0,059 0 0,077 0 0004797 PV163 6 19569797 0,465 0,008 0,001** 0,078 0,129 0,009 0,092 0,013 BARC-PV- 6 20389287 0,264 0,012 0,035* 0,047 0,655 0,004 0,628 0,004 0005885 BARC-PV- 6 25992042 0,477 0,001 0,013* 0,028 0,174 0,005 0,285 0,002 0003800 BARC-PV- 6 26264167 0,476 0,003 0,014* 0,052 0,119 0,010 0,372 0,003 0004791 BARC-PV- 6 27358722 0,840 0,000 0,372 0,014 0,393 0,001 0,048* 0,020 0005909 BARC-PV- 6 29302076 0,277 0,011 0,031* 0,062 0,346 0,011 0,044* 0,050 0004089 0,009* BM183 7 173639 0,035 0,199 0,016 0,900 0 0,622 0,004 * BARC-PV- 8 266043 0,937 0 0,015* 0,037 0,254 0,016 0,040* 0,051 0004548 BARC-PV- 4,84E- 1,17E- 8 1544569 0,618 0 0,002** 0,103 0,215 0,202 0003450 06*** 05**** BM165 8 7945005 0,120 0,035 0,048* 0,042 0,297 0,019 0,261 0,019 0,012 BM151 8 10298072 0,031* 0,066 0,1945 0,01 0,334 0,012 0,241 2 BARC-PV- 0,007* 8 12970064 0,076 0,999 0 0,595 0,004 0,670 0,001 0004385 * BARC-PV- 8 13120700 0,063 0,055 0,841 0,001 0,239 0,004 0,379 0,010 0004953

Apêndice D – Continuação...

Primeiro Localização Águas Inverno Segundo Ensaio Marcador Crom. Ensaio (pb) 2 2 2 2 pr(F) R pr(F) R pr(F) R pr(F) R BARC-PV- 0,007* 8 13605914 0,070 0,999 0 0,595 0,004 0,670 0,006 0006098 * BARC-PV- 8 14814473 0,013* 0,063 0,890 0 0,595 0,001 0,670 0,002 0003657 BARC-PV- 0,007* 8 16124872 0,066 0,999 0 0,595 0,003 0,670 0,004 0004651 * 0,003* BM211 8 16203767 0,085 0,953 0 0,469 0,004 0,550 0,001 * BARC-PV- 8 18641864 0,011* 0,073 0,920 0 0,33 0,018 0,530 0,011 0002954 BARC-PV- 8 18756140 0,018* 0,063 0,323 0,023 0,128 0,034 0,158 0,026 0003703 BARC-PV- 8 21536057 0,013* 0,058 0,890 0 0,598 0,004 0,950 0,001 0004605 BARC-PV- 8 21536359 0,013* 0,053 0,890 0 0,598 0,002 0,950 0 0003468 BARC-PV- 8 21898767 0,013* 0,056 0,890 0 0,598 0,003 0,950 0 0004998 BARC-PV- 8 23506426 0,015* 0,056 0,927 0 0,606 0,003 0,981 0 0006238 BARC-PV- 8 24896572 0,027* 0,052 0,997 0 1 0,011 1 0,006 0004112 BARC-PV- 8 26068747 0,013* 0,066 0,890 0 0,598 0,003 0,950 0 0005569 BARC-PV- 8 26980949 0,028* 0,052 0,977 0 0,467 0,005 0,491 0,005 0004144 BARC-PV- 8 26982153 0,013* 0,066 0,890 0 0,598 0,003 0,950 0 0003026 BARC-PV- 8 28442397 0,028* 0,048 0,977 0 0,467 0,003 0,491 0,001 0004878 BARC-PV- 8 31020586 0,013* 0,053 0,890 0 0,598 0,002 0,950 0 0003019 BARC-PV- 8 32335767 0,015* 0,057 0,927 0 0,606 0,002 0,981 0 0003541 BARC-PV- 8 32398214 0,013* 0,066 0,890 0 0,598 0,003 0,950 0 0005704 BARC-PV- 8 34988065 0,013* 0,055 0,890 0 0,598 0,005 0,950 0,001 0004129 BARC-PV- 8 37101742 0,013* 0,048 0,890 0 0,606 0,005 0,980 0,003 0003223 BARC-PV- 8 38658788 0,015* 0,062 0,927 0 0,606 0,003 0,981 0 0003574 BARC-PV- 8 44672449 0,047* 0,045 0,670 0,013 0,855 0 0,741 0 0005017 BARC-PV- 8 49207104 0,013* 0,039 0,890 0,008 0,697 0,001 0,980 0 0003042 BARC-PV- 8 55924317 0,035* 0,048 0,259 0,014 0,434 0,006 0,797 0 0004489 BARC-PV- 8 57579572 0,021* 0,052 0,548 0,006 0,919 0 0,797 0 0003331 BARC-PV- 8 61614202 0,041* 0,057 0,764 0 0,128 0,028 0,110 0,028 0004057

Apêndice D – Continuação...

Primeiro Localização Águas Inverno Segundo Ensaio Marcador Crom. Ensaio (pb) 2 2 2 2 pr(F) R pr(F) R pr(F) R pr(F) R BARC-PV- 9 996704 0,035* 0,047 0,525 0,003 0,423 0,010 0,559 0,007 0004829 BARC-PV- 9 2386714 0,022* 0,056 0,031* 0,041 0,750 0 0,343 0,014 0006051 BARC-PV- 9 3311917 0,022* 0,056 0,031* 0,041 0,750 0 0,343 0,014 0003368 BARC-PV- 9 3478743 0,022* 0,056 0,031* 0,042 0,750 0 0,343 0,005 0005477 BARC-PV- 9 5350398 0,015* 0,058 0,014* 0,060 0,801 0,001 0,450 0,002 0004897 BARC-PV- 9 18263708 0,132 0,013 0,006** 0,043 0,772 0 0,509 0,001 0004115 BARC-PV- 9 18790559 0,132 0,010 0,006** 0,047 0,772 0 0,509 0,003 0004725 BARC-PV- 0,007* 10 27226871 0,063 0,999 0 0,597 0,005 0,948 0,001 0004798 * BARC-PV- 11 27464746 0,023* 0,052 0,391 0,028 0,965 0 0,494 0,005 0004506 BARC-PV- 11 29032746 0,023* 0,038 0,391 0,009 1 0,001 1 0 0003777 BARC-PV- 11 29355078 0,726 0 0,044* 0,040 0,817 0,002 0,732 0,010 0003503 BARC-PV- 11 31982258 0,032* 0,060 0,049* 0,028 1 0,002 1 0,001 0003131 BARC-PV- 11 35446494 0,023* 0,035 0,391 0,019 0,059 0 0,077 0,006 0004483 Crom.: cromossomo; Safra das águas e safra de inverno: ensaios realizados no campo; Primeiro e Segundo ensaios: ensaios realizados em ambiente controlado.

Apêndice E- Resultado da análise de mapeamento de marcas simples da reação à mucha- de-fusarium de linhagens F5:7 oriundas do cruzamento Ouro Branco x CNFP10132 indicando a probabilidade, os níveis de significância e a % de variação (R2) explicada pelos marcadores. Safra de Inverno Safra das Águas Primeira Época Segunda Época Marcadores Cromossomo p(F) R2 p(F) R2 p(F) R2 p(F) R2 BARC-PV-0003023 Chr01 0,0817 0,0308 0,5476 0,002 0,7815 0,0164 0,4223 0,0198 BARC-PV-0003399 Chr01 0,0445* 0,0904 0,7264 0,0111 0,8172 0,0001 0,7320 0,0019 BARC-PV-0003454 Chr01 0,0817 0,0412 0,5476 0,0063 0,7815 0,0157 0,4223 0,0226 BARC-PV-0003474 Chr01 0,0330* 0,0434 0,2038 0,0149 0,9921 0,0002 0,3328 0,0103 BARC-PV-0003651 Chr01 0,0161* 0,0628 0,0811 0,0413 0,3463 0,0115 0,2317 0,0175 BARC-PV-0003741 Chr01 0,0445* 0,0609 0,7264 0,0002 0,8172 0,001 0,7320 0,0001 BARC-PV-0003821 Chr01 0,0445* 0,0239 0,7264 0 0,8172 0,0024 0,7320 0,0107 BARC-PV-0003886 Chr01 0,0552 0,0341 0,0295* 0,0548 0,6032 0,0021 0,2669 0,0112 BARC-PV-0003933 Chr01 0,0445* 0,0324 0,7264 0,0012 0,8172 0,004 0,7320 0,0103 BARC-PV-0004006 Chr01 0,0817 0,0276 0,5476 0,0041 0,7815 0,0127 0,4223 0,0241 BARC-PV-0004130 Chr01 0,0445* 0,0534 0,7264 0,0031 0,8172 0,0013 0,7320 0,0069 BARC-PV-0004183 Chr01 0,0759 0,0615 0,5611 0,0141 0,7815 0,013 0,4223 0,0143 BARC-PV-0004206 Chr01 0,0759 0,0472 0,5611 0,0109 0,6615 0,015 0,3772 0,0225 BARC-PV-0004233 Chr01 0,0445* 0,0656 0,7264 0,0059 0,8172 0,0017 0,7320 0,0055 BARC-PV-0004309 Chr01 0,3227 0,0109 0,2253 0,0163 0,8254 0,0005 0,7537 0,0011 BARC-PV-0004423 Chr01 0,1244 0,0212 0,1382 0,0235 0,9547 0,0052 0,8634 0,0041 BARC-PV-0004536 Chr01 0,0445* 0,0445 0,7264 0,0017 0,8172 0,0006 0,7320 0,0041 BARC-PV-0004667 Chr01 0,0445* 0,0505 0,7264 0,0021 0,8172 0,0032 0,7320 0,0087 BARC-PV-0004670 Chr01 0,1309 0,0056 0,0941 0,0184 0,8143 0,0006 0,4691 0,0069 BARC-PV-0004813 Chr01 0,0759 0,0554 0,5611 0,0123 0,7815 0,0118 0,4223 0,0171 BARC-PV-0004818 Chr01 0,2790 0,005 0,2119 0,0127 0,5078 0,0026 0,4206 0,0069 BARC-PV-0004823 Chr01 0,1244 0,0098 0,1382 0,0133 0,9547 0,0039 0,8634 0,0052 BARC-PV-0005480 Chr01 0,0445* 0,0641 0,7264 0,0084 0,8172 0 0,7320 0,003 BARC-PV-0005524 Chr01 0,0445* 0,0299 0,7264 0,0017 0,8172 0,0013 0,7320 0,0082 BARC-PV-0005645 Chr01 0,0974 0,0171 0,7584 0,0039 0,3513 0,0024 0,6453 0,0003 BARC-PV-0005778 Chr01 0,0445* 0,0656 0,7264 0,0059 0,8172 0,0017 0,7320 0,0055 BARC-PV-0005784 Chr01 0,0773 0,0548 0,7865 0,0006 0,6581 0,0024 0,6979 0,0012 BARC-PV-0005874 Chr01 0,0445* 0,0656 0,7264 0,0059 0,8172 0,0017 0,7320 0,0055 BARC-PV-0005875 Chr01 0,0445* 0,0409 0,7264 0,0007 0,8172 0,0037 0,7320 0,0106 BARC-PV-0005895 Chr01 0,0759 0,0624 0,5611 0,0137 0,7815 0,0093 0,4223 0,0142 PV107 Chr01 0,1448 0,0193 0,3239 0,0113 0,6713 0,0007 0,9571 0 PV115 Chr01 0,0058** 0,0618 0,0220* 0,0428 0,5042 0,0057 0,0580 0,0397 PV251 Chr01 0,0016** 0,1208 0,0152* 0,0796 0,7817 0,0006 0,1894 0,0091 BARC-PV-0003025 Chr02 0,4029 0,0131 0,1421 0,035 0,7781 0,0001 0,7196 0,0053 BARC-PV-0003123 Chr02 0,3110 0,0214 0,2505 0,0311 0,9514 0,0128 0,3491 0,0015 BARC-PV-0003585 Chr02 0,3533 0,0179 0,2431 0,022 0,8469 0,0046 0,8268 0

Apêndice E – Continuação...

Safra de Inverno Safra das Águas Primeira Época Segunda Época Marcadores Cromossomo p(F) R2 p(F) R2 p(F) R2 p(F) R2 BARC-PV-0003658 Chr02 0,9390 0 0,3651 0,0137 0,2835 0,0087 0,7995 0 BARC-PV-0003812 Chr02 0,3965 0,0162 0,0248* 0,0572 0,1374 0,019 0,2407 0,0098 BARC-PV-0003881 Chr02 0,4029 0,0189 0,1421 0,0412 0,7781 0 0,7196 0,0028 BARC-PV-0003999 Chr02 0,3965 0,0193 0,0248* 0,054 0,1374 0,0155 0,2407 0,0083 BARC-PV-0004134 Chr02 0,4029 0,0108 0,1421 0,0356 0,7781 0,0015 0,7196 0,0027 BARC-PV-0004238 Chr02 0,5345 0,006 0,0620 0,0321 0,0208* 0,0476 0,0518 0,0233 BARC-PV-0004243 Chr02 0,3642 0,0094 0,1568 0,0216 0,8808 0 0,8301 0,0008 BARC-PV-0004274 Chr02 0,5345 0,0092 0,0620 0,0414 0,0208* 0,0473 0,0518 0,0258 BARC-PV-0004709 Chr02 0,4029 0,0139 0,1421 0,0351 0,7781 0,0006 0,7196 0,0061 BARC-PV-0004803 Chr02 0,4029 0,0189 0,1421 0,0412 0,7781 0 0,7196 0,0028 BARC-PV-0004815 Chr02 0,8689 0,0001 0,4214 0,0058 0,3481 0,0132 0,8638 0,0015 BARC-PV-0004996 Chr02 0,4029 0,0189 0,1421 0,0412 0,8147 0 0,7585 0,0028 BARC-PV-0005065 Chr02 0,3319 0,0132 0,2409 0,0159 0,7262 0,0026 0,6906 0,0008 BARC-PV-0005188 Chr02 0,3797 0,0139 0,1461 0,0351 0,7781 0,0006 0,7196 0,0061 BARC-PV-0005450 Chr02 0,4029 0,0131 0,1421 0,035 0,7781 0,0001 0,7196 0,0053 BARC-PV-0005556 Chr02 0,4029 0,0087 0,1421 0,0046 0,7781 0,01 0,7196 0,001 BARC-PV-0005710 Chr02 0,4029 0,0184 0,1421 0,044 0,7781 0,0001 0,7196 0,0043 BARC-PV-0005888 Chr02 0,4029 0,0139 0,1421 0,0351 0,7781 0,0006 0,7196 0,0061 BARC-PV-0006196 Chr02 0,2115 0,0173 0,0352* 0,0483 0,9913 0 0,5450 0,0041 BM164 Chr02 0,4064 0,0101 0,0431* 0,0656 0,0541 0,0306 0,1170 0,0172 GATs91 Chr02 0,8442 0,0014 0,5902 0,015 0,1381 0,0091 0,3663 0,0018 PV11 Chr02 1,0000 0,0145 1,0000 0,0005 1,0000 0,0453 1,0000 0,0049 PV243 Chr02 0,8442 0,0001 0,5902 0,0037 0,1381 0,0277 0,3663 0,0116 PV272 Chr02 0,8442 0,0248 0,5902 0,0291 0,1381 0,0403 0,3663 0,0336 BARC-PV-0003037 Chr03 0,2947 0,0071 0,4242 0,0103 0,3129 0,0074 0,6119 0,0021 BARC-PV-0003092 Chr03 0,2947 0,0122 0,4242 0,0071 0,3129 0,0113 0,6119 0,0029 BARC-PV-0003097 Chr03 0,2947 0,0122 0,4242 0,0071 0,3129 0,0113 0,6119 0,0029 BARC-PV-0003118 Chr03 0,2848 0,0145 0,5283 0,0029 0,4092 0,0065 0,7104 0,0017 BARC-PV-0003167 Chr03 0,3929 0,0095 0,4002 0,0058 0,4857 0,0065 0,6339 0,0024 BARC-PV-0003186 Chr03 0,8514 0,0007 0,2696 0,0167 0,8837 0,0001 0,9752 0,0004 BARC-PV-0003262 Chr03 0,7376 0,0032 0,6346 0,0014 0,9053 0,0037 0,6273 0,0145 BARC-PV-0003269 Chr03 0,2773 0,0309 0,4840 0,0001 0,3072 0,0059 0,5582 0,0027 BARC-PV-0003353 Chr03 0,3263 0,0107 0,8018 0,0007 0,6042 0,003 0,9744 0 BARC-PV-0003419 Chr03 0,2947 0,0102 0,4242 0,0076 0,3129 0,0095 0,6119 0,0025 BARC-PV-0003508 Chr03 0,3243 0,0108 0,5544 0,0039 0,4857 0,0054 0,6339 0,0025 BARC-PV-0003600 Chr03 0,2947 0,0122 0,4242 0,0071 0,3129 0,0113 0,6119 0,0029 BARC-PV-0003892 Chr03 0,2773 0,0132 0,4840 0,0039 0,3072 0,0021 0,5582 0,0006 BARC-PV-0003924 Chr03 0,2773 0,0096 0,4840 0,0058 0,3072 0,0005 0,5582 0,0003

Apêndice E – Continuação...

Safra de Inverno Safra das Águas Primeira Época Segunda Época Marcadores Cromossomo p(F) R2 p(F) R2 p(F) R2 p(F) R2 BARC-PV-0003993 Chr03 0,2773 0,0136 0,4840 0,0051 0,3072 0,0033 0,5582 0,0012 BARC-PV-0004027 Chr03 0,3389 0,0081 0,4094 0,0079 0,3129 0,0076 0,6119 0,0022 BARC-PV-0004260 Chr03 0,2947 0,0117 0,4242 0,0055 0,3129 0,0083 0,6119 0,0028 BARC-PV-0004281 Chr03 0,3553 0,0119 0,4704 0,004 0,3129 0,0047 0,6119 0,0013 BARC-PV-0004466 Chr03 0,2773 0,0132 0,4840 0,0039 0,3072 0,0021 0,5582 0,0006 BARC-PV-0004496 Chr03 0,3263 0,0123 0,8018 0,0002 0,6042 0,0023 0,9744 0 BARC-PV-0004800 Chr03 0,3243 0,0108 0,5544 0,0039 0,4857 0,0054 0,6339 0,0025 BARC-PV-0004951 Chr03 0,1700 0,0099 0,6115 0,0098 0,3129 0,0042 0,6119 0,0013 BARC-PV-0004981 Chr03 0,3741 0,0095 0,4322 0,0058 0,4857 0,0065 0,6339 0,0024 BARC-PV-0004989 Chr03 0,2773 0,0096 0,4840 0,0058 0,3072 0,0005 0,5582 0,0003 BARC-PV-0005055 Chr03 0,2773 0,0094 0,4840 0,0077 0,3072 0,0023 0,5582 0,0012 BARC-PV-0005097 Chr03 0,2747 0,0039 0,1314 0,0119 1,0000 0 1,0000 0,0012 BARC-PV-0005100 Chr03 0,2773 0,0079 0,4840 0,0104 0,3072 0,003 0,5582 0,0011 BARC-PV-0005192 Chr03 0,6852 0,001 0,6309 0,0022 0,7910 0,0004 0,9598 0,0001 BARC-PV-0005304 Chr03 0,7376 0,0029 0,6346 0,0023 0,9053 0,001 0,6273 0,0065 BARC-PV-0005490 Chr03 0,3929 0,0148 0,4002 0,0009 0,3129 0,0086 0,6119 0,0004 BARC-PV-0005555 Chr03 1,0000 0,0152 1,0000 0,0046 1,0000 0,0006 1,0000 0,0063 BARC-PV-0005722 Chr03 0,2773 0,008 0,4840 0,0082 0,3072 0,0009 0,5582 0,0002 BARC-PV-0005758 Chr03 0,5315 0,0108 0,9811 0,0039 0,1465 0,0054 0,0616 0,0025 BARC-PV-0006218 Chr03 0,3386 0,0117 0,5118 0,0055 0,3129 0,0083 0,6119 0,0028 BARC-PV-0006276 Chr03 0,3929 0,0095 0,4002 0,0058 0,4857 0,0065 0,6339 0,0024 BARC-PV-0006304 Chr03 0,2773 0,0106 0,4840 0,0063 0,3072 0,003 0,5582 0,0002 BM181 Chr03 0,2253 0,0038 0,8688 0,0002 0,4709 0,009 0,7558 0,0024 BM189 Chr03 0,4280 0,0017 0,9819 0,0002 0,7708 0,0032 0,4145 0,0001 PV87 Chr03 0,1845 0,0319 0,1700 0,0119 0,6153 0,0087 0,6306 0,0074 BARC-PV-0003403 Chr04 1,0000 0,0051 1,0000 0,0125 0,0595 0,014 0,0777 0,0003 BARC-PV-0003493 Chr04 0,2827 0,0117 0,1976 0,0149 0,3851 0,0087 0,7587 0,002 BARC-PV-0003586 Chr04 0,4680 0,0052 0,6199 0,0016 0,8198 0,0013 0,8150 0,0005 BARC-PV-0003814 Chr04 0,6674 0,008 0,0862 0,0435 0,9346 0,0004 0,9650 0,0004 BARC-PV-0004020 Chr04 0,6674 0,0124 0,0862 0,0503 0,9347 0,0017 0,9208 0,0004 BARC-PV-0004292 Chr04 0,7274 0,0119 0,7816 0,0004 0,4325 0,0028 0,6331 0,0029 BARC-PV-0004473 Chr04 0,4336 0,0047 0,1919 0,024 0,8867 0,0003 0,4698 0,0063 BARC-PV-0004634 Chr04 0,8675 0,0003 0,5764 0,0051 0,9013 0,0001 0,9971 0,0002 BARC-PV-0004881 Chr04 0,5820 0,0049 0,7274 0,0009 0,8954 0,0002 0,7141 0,0018 BARC-PV-0005500 Chr04 0,4508 0,0091 0,2760 0,0079 0,2586 0,0253 0,5018 0,0071 BARC-PV-0005606 Chr04 0,7421 0,0018 0,8628 0,003 0,9493 0,0002 0,9348 0,0021 BARC-PV-0005667 Chr04 0,7427 0,001 0,8621 0,0032 0,9493 0,0002 0,9348 0,0014 BM149 Chr04 0,8046 0,0042 0,7893 0,0014 0,9679 0 0,9023 0

Apêndice E – Continuação...

Safra de Inverno Safra das Águas Primeira Época Segunda Época Marcadores Cromossomo p(F) R2 p(F) R2 p(F) R2 p(F) R2 BM171 Chr04 0,6639 0,0022 0,7374 0,0057 0,2796 0,0079 0,3438 0,0027 BARC-PV-0002964 Chr05 0,0683 0,061 0,9074 0,0002 0,8908 0,0009 0,5463 0,0081 BARC-PV-0003048 Chr05 0,0018** 0,099 0,0838 0,0252 0,2448 0,0204 0,1077 0,0298 BARC-PV-0003215 Chr05 0,0683 0,0527 0,9074 0 0,8908 0,0001 0,5463 0,0051 BARC-PV-0003259 Chr05 0,6674 0,008 0,0862 0,0375 0,9715 0,0002 0,9973 0,0002 BARC-PV-0003282 Chr05 0,0031** 0,0365 0,7247 0,0002 0,8908 0,0002 0,5463 0,0041 BARC-PV-0003562 Chr05 0,2970 0,0178 0,0593 0,047 0,7164 0,0022 0,5191 0,0014 BARC-PV-0003623 Chr05 0,8184 0 0,3786 0,0094 0,6398 0,0058 0,3740 0,0132 BARC-PV-0003629 Chr05 0,0683 0,0484 0,9074 0 0,8908 0,0001 0,5463 0,0062 BARC-PV-0003680 Chr05 0,8416 0,0004 0,0115* 0,0571 0,4031 0,006 0,5234 0,0035 BARC-PV-0003756 Chr05 0,0493* 0,0422 0,8100 0,0006 0,5454 0,0041 0,9626 0 BARC-PV-0003839 Chr05 0,3110 0,0448 0,2505 0 0,9514 0,0015 0,3491 0,0052 BARC-PV-0003968 Chr05 0,0683 0,0365 0,9074 0,0002 0,8908 0,0002 0,5463 0,0041 BARC-PV-0004007 Chr05 0,0039** 0,0934 0,6706 0,0034 0,5797 0,0027 0,1637 0,0221 BARC-PV-0004019 Chr05 0,7816 0,0665 0,8445 0,0006 0,4182 0,005 0,8334 0,0005 BARC-PV-0004351 Chr05 0,0683 0,0417 0,9074 0,0002 0,8908 0 0,5463 0,005 BARC-PV-0004532 Chr05 0,0027** 0,0956 0,5888 0,0033 0,5638 0,0037 0,1077 0,0285 BARC-PV-0004636 Chr05 0,0038** 0,0745 0,1503 0,0199 0,1939 0,0194 0,0552 0,0457 BARC-PV-0004776 Chr05 0,2147 0,0159 0,5369 0,0061 0,8055 0,0005 0,4413 0,0062 BARC-PV-0005047 Chr05 0,0509 0,0376 0,9246 0,0013 0,6917 0,0081 0,6684 0,0002 BARC-PV-0005091 Chr05 0,5414 0,0663 0,7218 0,0011 1,0000 0,0031 1,0000 0,0143 BARC-PV-0005202 Chr05 0,0493* 0,0567 0,8100 0,0008 0,5454 0,0036 0,9626 0,0001 BARC-PV-0005249 Chr05 0,0031** 0,0926 0,7247 0,0014 0,4324 0,0069 0,0752 0,0348 BARC-PV-0005264 Chr05 0,0683 0,0677 0,9074 0,0003 0,8908 0,0001 0,5463 0,0079 BARC-PV-0005461 Chr05 0,0084** 0,0991 0,5870 0,0022 0,9515 0,0008 0,4870 0,0012 BARC-PV-0005470 Chr05 0,7816 0,0627 0,8445 0 0,9857 0,0032 0,9257 0,0008 BARC-PV-0006129 Chr05 0,6674 0,0063 0,0862 0,0449 0,8980 0,0007 0,9327 0,0012 BM155 Chr05 0,7117 0,0014 0,4515 0,0036 0,6124 0,0014 0,4467 0,0017 BM175 Chr05 0,0020** 0,1169 0,7157 0,0013 0,5935 0,0004 0,1024 0,0289 PV83 Chr05 0,0462* 0,0211 0,8740 0,0161 0,9365 0,0002 0,1953 0,0168 BARC-PV-0003369 Chr06 0,2332 0,0232 0,8077 0,0008 0,6560 0 0,1622 0,0115 BARC-PV-0003383 Chr06 0,0018** 0,0953 0,0838 0,0255 0,2448 0,0133 0,1077 0,028 BARC-PV-0003706 Chr06 0,0018** 0,0953 0,0838 0,0255 0,2448 0,0133 0,1077 0,028 BARC-PV-0003800 Chr06 0,0137* 0,0281 0,4777 0,0017 0,1745 0,005 0,2850 0,0024 BARC-PV-0004089 Chr06 0,0312* 0,0628 0,2772 0,0118 0,3465 0,0116 0,0449* 0,0504 BARC-PV-0004147 Chr06 0,4356 0,0093 0,1107 0,0362 0,9658 0,0036 0,4942 0,0022 BARC-PV-0004678 Chr06 0,2332 0,0252 0,8077 0,0013 0,6560 0,0003 0,1622 0,0133 BARC-PV-0004791 Chr06 0,0142* 0,0523 0,4762 0,0038 0,1197 0,0105 0,3721 0,0034 BARC-PV-0004797 Chr06 0,3912 0,0057 0,0233* 0,0519 0,0595 0,0003 0,0777 0,0004

Apêndice E – Continuação...

Safra de Inverno Safra das Águas Primeira Época Segunda Época Marcadores Cromossomo p(F) R2 p(F) R2 p(F) R2 p(F) R2 BARC-PV-0004895 Chr06 0,0018** 0,1023 0,0838 0,005 0,2448 0,0203 0,1077 0,0296 BARC-PV-0004934 Chr06 0,0038** 0,0878 0,1503 0,0302 0,1939 0,0192 0,0552 0,0195 BARC-PV-0005885 Chr06 0,0356* 0,0475 0,2642 0,0124 0,6555 0,004 0,6288 0,0042 BARC-PV-0005909 Chr06 0,3721 0,0146 0,8403 0,0001 0,3933 0,0013 0,0485* 0,0202 BARC-PV-0005992 Chr06 0,1271 0,0043 0,3873 0,0043 0,2879 0,0138 0,1763 0,0143 BARC-PV-0006205 Chr06 0,0707 0,0523 0,9070 0,002 0,2788 0,023 0,3922 0,011 PV163 Chr06 0,0013** 0,0788 0,4652 0,0086 0,1293 0,0098 0,0929 0,0133 PV5 Chr06 0,8392 0,0009 0,2619 0,0197 0,7763 0,0012 0,5920 0,0015 BARC-PV-0002897 Chr07 0,7610 0,0089 0,0878 0,0448 0,4005 0,0045 0,3234 0,0055 BARC-PV-0002932 Chr07 0,5503 0,0139 0,0811 0,046 0,9906 0 0,9695 0 BARC-PV-0003045 Chr07 0,3054 0,0231 0,0865 0,0529 0,7984 0,0024 0,7923 0,0022 BARC-PV-0003094 Chr07 0,3054 0,0139 0,0865 0,046 0,8975 0 0,8857 0 BARC-PV-0003122 Chr07 0,5073 0,0118 0,0551 0,0427 0,2244 0,0092 0,5093 0,0027 BARC-PV-0003224 Chr07 0,5017 0,0015 0,4188 0,026 0,8223 0,0003 0,5128 0,0047 BARC-PV-0003413 Chr07 0,3054 0,0076 0,0865 0,043 0,8292 0 0,8213 0,0019 BARC-PV-0003501 Chr07 0,3054 0,0066 0,0865 0,0101 0,8980 0,0065 0,9327 0,0019 BARC-PV-0003596 Chr07 0,5953 0,0046 0,0930 0,0388 0,7207 0,0006 0,8785 0 BARC-PV-0003682 Chr07 0,5953 0,0046 0,0930 0,0449 0,7207 0,0001 0,8785 0,0003 BARC-PV-0003822 Chr07 0,6674 0,0076 0,0862 0,039 0,9531 0,0012 0,9368 0,0002 BARC-PV-0003840 Chr07 0,4785 0,0108 0,0798 0,0484 0,7984 0 0,7923 0,0003 BARC-PV-0003950 Chr07 0,6194 0,0044 0,0837 0,0305 0,7984 0,0003 0,7923 0,0002 BARC-PV-0004417 Chr07 0,5953 0,0026 0,0930 0,0269 0,7207 0 0,8785 0,0006 BARC-PV-0005288 Chr07 0,6674 0,005 0,0862 0,0303 0,7984 0,0009 0,7923 0 BARC-PV-0005575 Chr07 0,6674 0,0058 0,0862 0,0298 0,8980 0,0015 0,9327 0,0001 BARC-PV-0005944 Chr07 0,6674 0,0063 0,0862 0,0449 0,8980 0,0007 0,9327 0,0012 BM183 Chr07 0,1993 0,016 0,0094** 0,0356 0,9004 0 0,6222 0,0047 BARC-PV-0002954 Chr08 0,9203 0 0,0114* 0,0731 0,3360 0,0186 0,5300 0,0115 BARC-PV-0003019 Chr08 0,8910 0,0001 0,0131* 0,0533 0,5990 0,0026 0,9507 0,0002 BARC-PV-0003026 Chr08 0,8910 0,0002 0,0131* 0,0664 0,5990 0,0031 0,9507 0 BARC-PV-0003042 Chr08 0,8910 0,0087 0,0131* 0,0398 0,6978 0,0015 0,9801 0,0001 BARC-PV-0003223 Chr08 0,8910 0,0003 0,0131* 0,0482 0,6061 0,0054 0,9809 0,0031 BARC-PV-0003241 Chr08 0,2339 0,0134 0,1136 0,032 0,6978 0,0017 0,9801 0 BARC-PV-0003264 Chr08 0,2339 0,0222 0,1136 0,0173 0,6978 0,0049 0,9801 0,0004 BARC-PV-0003331 Chr08 0,5482 0,0065 0,0215* 0,0523 0,9195 0,0001 0,7974 0,0001 BARC-PV-0003450 Chr08 0,0025** 0,1031 0,6185 0,0003 0,0000**** 0,2158 0,0000**** 0,2022 BARC-PV-0003468 Chr08 0,8910 0,0001 0,0131* 0,0533 0,5990 0,0026 0,9507 0,0002 BARC-PV-0003541 Chr08 0,9274 0 0,0156* 0,057 0,6062 0,0025 0,9811 0,0001 BARC-PV-0003574 Chr08 0,9274 0,0001 0,0156* 0,0626 0,6062 0,0031 0,9811 0,0001 BARC-PV-0003657 Chr08 0,8910 0,0002 0,0131* 0,0637 0,5957 0,0019 0,6708 0,0024

Apêndice E – Continuação...

Safra de Inverno Safra das Águas Primeira Época Segunda Época Marcadores Cromossomo p(F) R2 p(F) R2 p(F) R2 p(F) R2 BARC-PV-0003703 Chr08 0,3238 0,0231 0,0189* 0,0636 0,1285 0,0346 0,1584 0,0267 BARC-PV-0004057 Chr08 0,7644 0,0005 0,0411* 0,0572 0,1283 0,0285 0,1108 0,0289 BARC-PV-0004112 Chr08 0,9971 0 0,0272* 0,0524 1,0000 0,0112 1,0000 0,0065 BARC-PV-0004129 Chr08 0,8910 0 0,0131* 0,0559 0,5990 0,0053 0,9507 0,0015 BARC-PV-0004144 Chr08 0,9771 0 0,0287* 0,052 0,4677 0,0059 0,4914 0,0053 BARC-PV-0004250 Chr08 0,2339 0,0182 0,1136 0,0287 0,6978 0,0018 0,9801 0,0002 BARC-PV-0004385 Chr08 0,9995 0 0,0072** 0,0767 0,5957 0,004 0,6708 0,0016 BARC-PV-0004489 Chr08 0,2592 0,0141 0,0358* 0,048 0,4341 0,0068 0,7977 0,0007 BARC-PV-0004548 Chr08 0,0158* 0,0379 0,9379 0 0,2542 0,0163 0,0407* 0,0515 BARC-PV-0004605 Chr08 0,8910 0 0,0131* 0,0589 0,5990 0,0043 0,9507 0,001 BARC-PV-0004651 Chr08 0,9995 0,0005 0,0072** 0,0669 0,5957 0,0035 0,6708 0,004 BARC-PV-0004686 Chr08 0,8419 0 0,0637 0,0773 0,5957 0,0031 0,6708 0,002 BARC-PV-0004878 Chr08 0,9771 0 0,0287* 0,0488 0,4677 0,0037 0,4914 0,0019 BARC-PV-0004953 Chr08 0,8419 0,0015 0,0637 0,0554 0,2398 0,0043 0,3798 0,0103 BARC-PV-0004998 Chr08 0,8910 0 0,0131* 0,0567 0,5990 0,0034 0,9507 0,0006 BARC-PV-0005017 Chr08 0,6700 0,0135 0,0472* 0,0454 0,8554 0 0,7414 0,0002 BARC-PV-0005569 Chr08 0,8910 0,0002 0,0131* 0,0664 0,5990 0,0031 0,9507 0 BARC-PV-0005704 Chr08 0,8910 0,0002 0,0131* 0,0664 0,5990 0,0031 0,9507 0 BARC-PV-0005865 Chr08 0,2747 0,0105 0,1314 0,0287 1,0000 0,0016 1,0000 0,0004 BARC-PV-0006098 Chr08 0,9995 0,0002 0,0072** 0,0705 0,5957 0,0047 0,6708 0,0067 BARC-PV-0006238 Chr08 0,9274 0 0,0156* 0,0568 0,6062 0,0033 0,9811 0,0009 BM151 Chr08 0,1945 0,01 0,0315* 0,0669 0,3343 0,0124 0,2419 0,0122 BM165 Chr08 0,0487* 0,0422 0,1208 0,035 0,2979 0,0199 0,2615 0,0197 BM210 Chr08 0,6674 0,001 0,0862 0,0078 0,7984 0,0324 0,7923 0,0007 BM211 Chr08 0,9534 0,0001 0,0031** 0,0857 0,4696 0,0045 0,5506 0,0018 BARC-PV-0003052 Chr09 1,0000 0 1,0000 0 1,0000 0 1,0000 0 BARC-PV-0003067 Chr09 0,1157 0,0133 0,4953 0,005 0,8762 0,0036 0,4765 0,0022 BARC-PV-0003237 Chr09 0,4857 0,0026 0,1841 0,0161 0,9783 0,0017 0,5406 0,0012 BARC-PV-0003337 Chr09 0,6103 0,0043 0,5495 0,0024 0,8124 0,0003 0,9920 0,0001 BARC-PV-0003368 Chr09 0,0313* 0,0413 0,0222* 0,0561 0,7509 0,0005 0,3434 0,0145 BARC-PV-0003496 Chr09 0,6249 0,0038 0,5185 0,006 0,5959 0,0028 0,7956 0,0005 BARC-PV-0003734 Chr09 0,6328 0,0022 0,4002 0,0085 0,4238 0,0076 0,3662 0,0106 BARC-PV-0004115 Chr09 0,0060** 0,0434 0,1328 0,0135 0,7728 0,0002 0,5092 0,0013 BARC-PV-0004230 Chr09 0,6113 0,003 0,9867 0,0004 0,8566 0,0009 0,6460 0,002 BARC-PV-0004270 Chr09 0,3185 0,0144 0,0787 0,0368 0,9783 0,0003 0,5406 0,0064 BARC-PV-0004276 Chr09 1,0000 0,0147 1,0000 0,0593 1,0000 0,0008 1,0000 0 BARC-PV-0004427 Chr09 0,5416 0,0048 0,7220 0,0074 0,7536 0,0006 0,5057 0,0002 BARC-PV-0004725 Chr09 0,0060** 0,0474 0,1328 0,0102 0,7728 0,0002 0,5092 0,0034 BARC-PV-0004829 Chr09 0,5259 0,003 0,0359* 0,0471 0,4237 0,0103 0,5598 0,0075

Apêndice E – Continuação...

Safra de Inverno Safra das Águas Primeira Época Segunda Época Marcadores Cromossomo p(F) R2 p(F) R2 p(F) R2 p(F) R2 BARC-PV-0004897 Chr09 0,0147* 0,0607 0,0150* 0,0584 0,8010 0,0018 0,4502 0,0028 BARC-PV-0005477 Chr09 0,0313* 0,0429 0,0222* 0,0563 0,7509 0,0004 0,3434 0,0054 BARC-PV-0005527 Chr09 0,3185 0,019 0,0787 0,0469 0,7509 0,001 0,3434 0,011 BARC-PV-0005924 Chr09 0,3201 0,0117 0,1739 0,0219 0,7914 0,0014 0,4590 0,0083 BARC-PV-0006051 Chr09 0,0313* 0,0413 0,0222* 0,0561 0,7509 0,0005 0,3434 0,0145 BARC-PV-0006295 Chr09 0,2875 0,0148 0,4673 0,0078 0,5527 0,0038 0,8513 0 BM114 Chr09 0,1515 0,0111 0,7152 0,0003 0,8727 0,0054 0,6285 0,0001 BM202 Chr09 0,1144 0,031 0,6550 0,0049 0,9461 0,0032 0,5356 0,0147 PV131 Chr09 0,9924 0 0,0549 0,0416 0,9173 0,0001 0,7617 0,001 BARC-PV-0003208 Chr10 0,0974 0,026 0,7584 0 0,3513 0,0066 0,6453 0,0042 BARC-PV-0003550 Chr10 0,0974 0,0446 0,7584 0,0028 0,3513 0,0127 0,6453 0,006 BARC-PV-0004095 Chr10 0,0974 0,0535 0,7584 0,0035 0,3513 0,0101 0,6453 0,0086 BARC-PV-0004265 Chr10 0,3617 0,0126 0,0983 0,0415 0,7164 0,0011 0,5191 0,002 BARC-PV-0004354 Chr10 0,0974 0,0413 0,7584 0,0012 0,3513 0,0049 0,6453 0,0017 BARC-PV-0004374 Chr10 0,0974 0,0257 0,7584 0,0006 0,3513 0,0036 0,6453 0,0003 BARC-PV-0004576 Chr10 0,0974 0,0314 0,7584 0,0011 0,3513 0,0058 0,6453 0,0032 BARC-PV-0004798 Chr10 0,9995 0,0002 0,0072** 0,0638 0,5972 0,005 0,9481 0,0017 BARC-PV-0004857 Chr10 0,0974 0,0535 0,7584 0,0035 0,3513 0,0101 0,6453 0,0086 BARC-PV-0005019 Chr10 0,0974 0,0535 0,7584 0,0035 0,3513 0,0101 0,6453 0,0086 BARC-PV-0005299 Chr10 0,0974 0,026 0,7584 0 0,3513 0,0066 0,6453 0,0042 BARC-PV-0005437 Chr10 0,0974 0,0408 0,7584 0 0,9666 0,0055 0,8603 0,0088 BARC-PV-0005749 Chr10 0,1489 0,0093 0,0506 0,0301 0,8314 0,0015 0,7235 0,0046 BARC-PV-0005801 Chr10 0,0974 0,0122 0,7584 0,019 0,3513 0,0065 0,6453 0,0049 BARC-PV-0005886 Chr10 0,6674 0,0008 0,0862 0,0244 0,8980 0,0015 0,9327 0,0007 BARC-PV-0005942 Chr10 0,0974 0,0535 0,7584 0,0035 0,9678 0,0101 0,8610 0,0086 BARC-PV-0006061 Chr10 0,5315 0,0058 0,9811 0,002 0,1465 0,0259 0,0616 0,0299 BARC-PV-0006107 Chr10 0,2012 0,0158 0,9993 0,0002 0,9666 0 0,8603 0,0004 BARC-PV-0006116 Chr10 0,0974 0,0257 0,7584 0,0006 0,3513 0,0036 0,6453 0,0003 BM157 Chr10 0,0770 0,0366 0,3478 0,0258 0,5640 0,0005 0,5399 0,0001 PV12 Chr10 0,6334 0,0181 0,8750 0,0005 0,2407 0,0003 0,3388 0 PV13 Chr10 0,6152 0,0097 0,7189 0,0046 0,3478 0,0257 0,3416 0,0116 BARC-PV-0003020 Chr11 0,2970 0,015 0,0593 0,0393 0,4741 0,0055 0,8368 0,0005 BARC-PV-0003108 Chr11 0,3738 0,0094 0,0995 0,0355 0,7164 0,0024 0,5191 0,0011 BARC-PV-0003131 Chr11 0,0491* 0,0289 0,0326* 0,0609 1,0000 0,0023 1,0000 0,0011 BARC-PV-0003140 Chr11 0,3617 0,0029 0,0983 0,0295 0,7164 0,0103 0,5191 0,0005 BARC-PV-0003194 Chr11 0,3617 0,0114 0,0983 0,032 0,6565 0,0008 0,6174 0,0032 BARC-PV-0003294 Chr11 0,4356 0,0166 0,1107 0,042 0,8314 0,0002 0,7235 0,0032 BARC-PV-0003388 Chr11 0,3115 0,0023 0,2478 0,0043 0,9511 0,004 0,3490 0,003 BARC-PV-0003439 Chr11 0,3617 0,0093 0,0983 0,0301 0,7164 0,0015 0,5191 0,0046

Apêndice E – Continuação...

Safra de Inverno Safra das Águas Primeira Época Segunda Época Marcadores Cromossomo p(F) R2 p(F) R2 p(F) R2 p(F) R2 BARC-PV-0003503 Chr11 0,0445* 0,0405 0,7264 0,0009 0,8172 0,0024 0,7320 0,0105 BARC-PV-0003566 Chr11 0,3170 0,0171 0,0710 0,0406 0,6760 0,0011 0,5832 0,0038 BARC-PV-0003777 Chr11 0,3912 0,0099 0,0233* 0,0388 1,0000 0,0016 1,0000 0 BARC-PV-0003889 Chr11 0,3617 0,0111 0,0983 0,0358 0,7164 0,0022 0,5191 0,0028 BARC-PV-0003923 Chr11 0,2970 0,0248 0,0593 0,0471 0,4741 0,0006 0,8368 0,0026 BARC-PV-0003967 Chr11 0,2970 0,0116 0,0593 0,0335 0,4741 0,0028 0,8368 0,0029 BARC-PV-0004026 Chr11 0,3617 0,0029 0,0983 0,0295 0,7164 0,0103 0,5191 0,0005 BARC-PV-0004184 Chr11 0,3617 0,0071 0,0983 0,0268 0,7164 0,0015 0,5191 0,0051 BARC-PV-0004303 Chr11 0,6322 0,004 0,0576 0,0354 0,1788 0,0123 0,8847 0 BARC-PV-0004339 Chr11 0,6263 0,0016 0,0858 0,0291 0,5921 0,0032 0,7509 0,0009 BARC-PV-0004483 Chr11 0,3912 0,0195 0,0233* 0,0351 0,0595 0,0001 0,0777 0,0067 BARC-PV-0004506 Chr11 0,3912 0,028 0,0233* 0,0528 0,9658 0 0,4942 0,0052 BARC-PV-0004677 Chr11 0,7551 0,0011 0,3250 0,0108 0,8990 0,0002 0,8205 0,0006 BARC-PV-0004876 Chr11 0,2970 0,0156 0,0593 0,0418 0,1480 0,0042 0,0617 0,0008 BARC-PV-0004938 Chr11 0,3617 0,0171 0,0983 0,0406 0,6377 0,0011 0,6529 0,0038 BARC-PV-0005054 Chr11 0,4079 0,0096 0,1472 0,0273 0,6752 0,0017 0,2971 0,0122 BARC-PV-0005180 Chr11 0,6674 0,0044 0,0862 0,0305 0,8615 0,0003 0,8517 0,0002 BARC-PV-0005262 Chr11 0,3617 0,0071 0,0983 0,0268 0,7164 0,0015 0,5191 0,0051 BARC-PV-0005268 Chr11 0,3625 0,0029 0,0983 0,0295 0,7164 0,0103 0,5191 0,0005 BARC-PV-0005330 Chr11 0,8419 0,008 0,0637 0,0033 0,1788 0,0124 0,8847 0,0003 BARC-PV-0005546 Chr11 0,5127 0,0057 0,0977 0,0359 0,8453 0 0,9334 0,0004 BARC-PV-0005610 Chr11 0,3617 0,0093 0,0983 0,0301 0,7164 0,0015 0,5191 0,0046 BARC-PV-0005729 Chr11 0,8419 0,0199 0,0637 0,029 0,1788 0,0001 0,8847 0,0045 BARC-PV-0005764 Chr11 0,3170 0,0158 0,0710 0,0438 0,7164 0,0011 0,5191 0,0043 BARC-PV-0005793 Chr11 0,6534 0,0022 0,3790 0,0095 0,0774 0,0429 0,0432* 0,0396 BARC-PV-0006352 Chr11 0,2811 0,0129 0,0525 0,0411 0,6022 0,003 0,7268 0,0014 BM205 Chr11 0,7816 0 0,8445 0,002 0,9857 0,0079 0,9257 0,0001 PV113 Chr11 0,4682 0,0058 0,4030 0,0075 0,3013 0,01 0,5320 0,0056

Apêndice B - Anotação gênica dos marcadores significativos detectados nos ambientes de avaliação de severidade da murcha-de-fusarium (safra das águas, safra de inverno e dos ensaios em ambiente controlado).

Gene Marcador Nome do Gene Nome do Gene Descrição Crom. Start Distância* Transcrito End (bp) (bp)

PV115 Phvul.001G128500 Phvul.001G128500.1 PTHR32227:SF49 - BETA-1,3-GLUCANASE 1-RELATED 1 35694657 35696430 439687

PV115 Phvul.001G128550 Phvul.001G128550.1 PTHR32227:SF49 - BETA-1,3-GLUCANASE 1-RELATED 1 35783884 35785469 350460

PTHR22942:SF41 - DNA REPAIR PROTEIN RECA PV115 Phvul.001G128600 Phvul.001G128600.1 1 35796741 35802432 337603 HOMOLOG 2, MITOCHONDRIAL

PTHR12668//PTHR12668:SF18 - TRANSMEMBRANE PV115 Phvul.001G128700 Phvul.001G128700.1 1 35803251 35808294 331093 PROTEIN 14, 15 // SUBFAMILY NOT NAMED

PV115 Phvul.001G128800 Phvul.001G128800.2 PTHR13878:SF53 - CYTOKININ DEHYDROGENASE 6 1 35997847 36000547 136497

PTHR24078//PTHR24078:SF187 - DNAJ HOMOLOG PV115 Phvul.001G129000 Phvul.001G129000.1 1 36013297 36022002 121047 SUBFAMILY C MEMBER // SUBFAMILY NOT NAMED

PV115 Phvul.001G129100 Phvul.001G129100.1 PTHR18952:SF118 - ALPHA CARBONIC ANHYDRASE 6 1 36046292 36049499 88052

PV115 Phvul.001G129200 Phvul.001G129200.1 K11665 - DNA helicase INO80 [EC:3.6.4.12] (INO80, INOC1) 1 36051015 36061940 83329

PTHR11728:SF17 - 6-PHOSPHOGLUCONATE PV115 Phvul.001G129300 Phvul.001G129300.1 1 36072135 36076667 62209 DEHYDROGENASE-LIKE PROTEIN

PV115 Phvul.001G129400 Phvul.001G129400.1 PF07498 - Rho termination factor, N-terminal domain (Rho_N) 1 36085376 36091595 48968

PTHR11132//PTHR11132:SF116 - SOLUTE CARRIER PV115 Phvul.001G129500 Phvul.001G129500.1 1 36102202 36107736 32142 FAMILY 35 // SUBFAMILY NOT NAMED

PF00122//PF00689//PF12710 - E1-E2 ATPase (E1-E2_ATPase) // PV115 Phvul.001G129600 Phvul.001G129600.2 Cation transporting ATPase, C-terminus (Cation_ATPase_C) // 1 36109266 36113810 25078 haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD)

K03124 - transcription initiation factor TFIIB (TFIIB, GTF2B, PV115 Phvul.001G130000 Phvul.001G130000.1 1 36135232 36138844 888 SUA7, tfb)

PV115 Phvul.001G130100 Phvul.001G130100.1 K11792 - DET1- and DDB1-associated protein 1 (DDA1) 1 36153377 36156699 19033

PTHR20961//PTHR20961:SF12 - GLYCOSYLTRANSFERASE PV115 Phvul.001G130200 Phvul.001G130200.1 1 36170150 36172622 35806 // SUBFAMILY NOT NAMED

PV115 Phvul.001G130300 Phvul.001G130300.1 K10406 - kinesin family member C2/C3 (KIFC2_3) 1 36174422 36182206 40078

PV115 Phvul.001G130400 Phvul.001G130400.1 K03350 - anaphase-promoting complex subunit 3 (APC3, CDC27) 1 36202474 36204672 68130

PTHR11089:SF29 - P-LOOP CONTAINING NUCLEOSIDE PV115 Phvul.001G130500 Phvul.001G130500.1 1 36209025 36215229 74681 TRIPHOSPHATE HYDROLASES SUPERFAMILY PROTEIN

PTHR19241//PTHR19241:SF247 - ATP-BINDING CASSETTE PV115 Phvul.001G130700 Phvul.001G130700.2 1 36235622 36241937 101278 TRANSPORTER // SUBFAMILY NOT NAMED

PF00069//PF07645//PF13947 - Protein kinase domain (Pkinase) // PV115 Phvul.001G130800 Phvul.001G130800.1 Calcium-binding EGF domain (EGF_CA) // Wall-associated 1 36268095 36270851 133751 receptor kinase galacturonan-binding (GUB_WAK_bind)

PTHR19241//PTHR19241:SF247 - ATP-BINDING CASSETTE PV115 Phvul.001G130900 Phvul.001G130900.2 1 36300537 36313532 166193 TRANSPORTER // SUBFAMILY NOT NAMED

(M=30) K09419 - heat shock transcription factor, other eukaryote PV115 Phvul.001G131000 Phvul.001G131000.1 1 36356216 36358683 221872 (HSFF)

K05643 - ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 3 PV115 Phvul.001G131150 Phvul.001G131150.1 1 36373855 36438524 239511 (ABCA3)

PV115 Phvul.001G131300 Phvul.001G131300.1 K09285 - AP2-like factor, ANT lineage (OVM, ANT) 1 36479120 36482848 344776

PTHR16557:SF4 - 2-OXOGLUTARATE-DEPENDENT PV115 Phvul.001G131400 Phvul.001G131400.1 1 36501694 36504190 367350 DIOXYGENASE FAMILY PROTEIN-RELATED

2.7.6.3 - 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine PV115 Phvul.001G131450 Phvul.001G131450.1 diphosphokinase / 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin 1 36509895 36518753 375551 pyrophosphokinase

(M=46) PF01535//PF13041//PF13812 - PPR repeat (PPR) // PPR PV115 Phvul.001G131500 Phvul.001G131500.1 1 36520072 36527684 385728 repeat family (PPR_2) // Pentatricopeptide repeat domain (PPR_3)

PV115 Phvul.001G131600 Phvul.001G131600.1 PTHR34960:SF1 - EMB 1 36571897 36573930 437553 PV115 Phvul.001G131700 Phvul.001G131700.1 PTHR11977:SF46 - VILLIN-2-RELATED 1 36584910 36596394 450566 KOG4382 - Uncharacterized conserved protein, contains DTW PV115 Phvul.001G131900 Phvul.001G131900.1 1 36625810 36628952 491466 domain

PTHR10788:SF19 - TREHALOSE-PHOSPHATE PV251 Phvul.001G251300 Phvul.001G251300.1 1 50183860 50186673 489554 PHOSPHATASE E-RELATED

PV251 Phvul.001G251400 Phvul.001G251400.2 1.13.11.40 - Arachidonate 8-lipoxygenase / 8-lipoxygenase 1 50198216 50199284 475198

PTHR22904:SF358 - CC-TETRATRICOPEPTIDE REPEAT PV251 Phvul.001G251500 Phvul.001G251500.1 1 50199883 50203620 473531 PROTEIN PV251 Phvul.001G251600 Phvul.001G251600.1 (M=39) PF05678 - VQ motif (VQ) 1 50209078 50211945 464336

PTHR11384//PTHR11384:SF30 - ATP-BINDING CASSETTE, PV251 Phvul.001G251800 Phvul.001G251800.1 1 50227699 50243382 445715 SUB-FAMILY D MEMBER // SUBFAMILY NOT NAMED

1.14.11.33 - DNA oxidative demethylase / Alkylated DNA repair PV251 Phvul.001G252000 Phvul.001G252000.1 1 50248861 50252227 424553 protein

PTHR23354//PTHR23354:SF76 - NUCLEOLAR PROTEIN PV251 Phvul.001G252100 Phvul.001G252100.1 7/ESTROGEN RECEPTOR COACTIVATOR-RELATED // 1 50253203 50257128 420211 SUBFAMILY NOT NAMED

6.3.5.4 - Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing) / PV251 Phvul.001G252200 Phvul.001G252200.1 1 50257375 50262047 416039 Glutamine-dependent asparagine synthetase

K11842 - ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12/46 PV251 Phvul.001G252400 Phvul.001G252400.2 1 50275645 50280015 397769 [EC:3.4.19.12] (USP12_46)

PTHR10593//PTHR10593:SF41 - SERINE/THREONINE- PV251 Phvul.001G252500 Phvul.001G252500.1 1 50284496 50285967 388918 PROTEIN KINASE RIO // SUBFAMILY NOT NAMED

(M=51) 2.7.10.1//2.7.11.1 - Receptor protein-tyrosine kinase / PV251 Phvul.001G252800 Phvul.001G252800.1 Receptor protein tyrosine kinase // Non-specific serine/threonine 1 50296385 50303522 377029 protein kinase / Threonine-specific protein kinase

PV251 Phvul.001G252900 Phvul.001G252900.1 PTHR24078:SF315 - MOLECULAR CHAPERONE DNAJ 1 50307424 50312535 365990

PV251 Phvul.001G253000 Phvul.001G253000.1 K14772 - U3 small nucleolar RNA-associated protein 20 (UTP20) 1 50313950 50333161 359464

PTHR33109:SF3 - EPIDERMAL PATTERNING FACTOR- PV251 Phvul.001G253101 Phvul.001G253101.1 1 50336314 50337106 337100 LIKE PROTEIN 1

PV251 Phvul.001G253300 Phvul.001G253300.1 (M=22) K07904 - Ras-related protein Rab-11A (RAB11A) 1 50350188 50354056 323226

K15334 - multisite-specific tRNA:(cytosine-C5)- PV251 Phvul.001G253400 Phvul.001G253400.1 1 50354729 50361866 318685 methyltransferase [EC:2.1.1.202] (NCL1, TRM4)

PV251 Phvul.001G253500 Phvul.001G253500.1 PTHR12736:SF14 - LANC-LIKE PROTEIN GCL1 1 50363238 50368257 310176

PV251 Phvul.001G253700 Phvul.001G253700.1 K11253 - histone H3 (H3) 1 50375673 50377399 297741 PV251 Phvul.001G253800 Phvul.001G253800.2 K11253 - histone H3 (H3) 1 50378165 50379892 295249

PV251 Phvul.001G254000 Phvul.001G254000.1 (M=50) K09338 - homeobox-leucine zipper protein (HD-ZIP) 1 50408041 50410160 265373

PTHR18934:SF140 - HELICASE , IBR AND ZINC FINGER PV251 Phvul.001G254100 Phvul.001G254100.1 1 50419088 50425942 254326 PROTEIN DOMAIN-CONTAINING PROTEIN

PTHR14155//PTHR14155:SF87 - RING FINGER DOMAIN- PV251 Phvul.001G254300 Phvul.001G254300.1 1 50430004 50430958 243410 CONTAINING // SUBFAMILY NOT NAMED

100

PV251 Phvul.001G254400 Phvul.001G254400.1 PTHR10551:SF9 - PROTEIN SINGED 1 50434138 50439304 239276

PV251 Phvul.001G254500 Phvul.001G254500.1 PF04759 - Protein of unknown function, DUF617 (DUF617) 1 50441045 50441731 232369

(M=40) KOG1493 - Anaphase-promoting complex (APC), PV251 Phvul.001G254600 Phvul.001G254600.1 1 50447844 50448416 225570 subunit 11

PTHR22951//PTHR22951:SF18 - CLATHRIN ASSEMBLY PV251 Phvul.001G254650 Phvul.001G254650.1 1 50457754 50459936 215660 PROTEIN // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR22951//PTHR22951:SF18 - CLATHRIN ASSEMBLY PV251 Phvul.001G254700 Phvul.001G254700.1 1 50459299 50459952 214115 PROTEIN // SUBFAMILY NOT NAMED

2.4.1.144 - Beta-1,4-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N- PV251 Phvul.001G254800 Phvul.001G254800.1 1 50461858 50464100 211556 acetylglucosaminyltransferase / acetylglucosaminyltransferase III

PV251 Phvul.001G255100 Phvul.001G255100.1 (M=36) PF05553 - Cotton fibre expressed protein (DUF761) 1 50469815 50470364 203599

PV251 Phvul.001G255200 Phvul.001G255200.1 K16285 - RING/U-box domain-containing protein (XERICO) 1 50473987 50475046 199427

PV251 Phvul.001G255300 Phvul.001G255300.1 PF05212 - Protein of unknown function (DUF707) (DUF707) 1 50477799 50482760 195615

PTHR12735:SF11 - SUFE-LIKE PROTEIN 2, PV251 Phvul.001G255400 Phvul.001G255400.1 1 50489729 50490292 183685 CHLOROPLASTIC

PV251 Phvul.001G255500 Phvul.001G255500.1 PTHR11452:SF14 - ALPHA-GALACTOSIDASE A 1 50493914 50499798 179500

PTHR31933:SF1 - GENOMIC DNA, CHROMOSOME 3, BAC PV251 Phvul.001G255600 Phvul.001G255600.1 1 50501181 50506664 172233 CLONE:F20C19 PV251 Phvul.001G255700 Phvul.001G255700.1 K13150 - coilin (COIL, CLN80) 1 50509723 50517280 163691

101

PTHR10159//PTHR10159:SF359 - DUAL SPECIFICITY PV251 Phvul.001G255800 Phvul.001G255800.1 1 50516516 50519922 156898 PROTEIN PHOSPHATASE // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR10857:SF34 - COPINE (CALCIUM-DEPENDENT PV251 Phvul.001G255900 Phvul.001G255900.1 1 50524833 50530075 148581 PHOSPHOLIPID-BINDING PROTEIN) FAMILY PROTEIN

PV251 Phvul.001G256000 Phvul.001G256000.1 K18723 - nucleoporin GLE1 (GLE1) 1 50530440 50537553 142974 PV251 Phvul.001G256100 Phvul.001G256100.1 PTHR33232:SF1 - F12A21.8 1 50539605 50543384 133809 (M=24) K05658 - ATP-binding cassette, subfamily B PV251 Phvul.001G256200 Phvul.001G256200.1 1 50542843 50548919 130571 (MDR/TAP), member 1 (ABCB1) PV251 Phvul.001G256300 Phvul.001G256300.1 PTHR24012:SF415 - F12A21.10-RELATED 1 50554368 50557400 119046

PTHR10314//PTHR10314:SF70 - SER/THR DEHYDRATASE, PV251 Phvul.001G256400 Phvul.001G256400.1 1 50563222 50567084 110192 TRP SYNTHASE // SUBFAMILY NOT NAMED

PV251 Phvul.001G256500 Phvul.001G256500.1 K14856 - protein SDA1 (SDA1, SDAD1) 1 50567651 50572423 105763 PTHR10972:SF67 - OXYSTEROL-BINDING PROTEIN- PV251 Phvul.001G256600 Phvul.001G256600.1 1 50573390 50580574 100024 RELATED PROTEIN 1D

PV251 Phvul.001G256700 Phvul.001G256700.1 K09497 - T-complex protein 1 subunit epsilon (CCT5) 1 50584333 50588802 89081

PV251 Phvul.001G256800 Phvul.001G256800.1 PTHR31683:SF26 - PECTATE LYASE 5-RELATED 1 50589495 50592622 83919

PV251 Phvul.001G256900 Phvul.001G256900.2 PTHR31683:SF26 - PECTATE LYASE 5-RELATED 1 50597366 50599541 76048

PTHR12428:SF18 - ALBINO3-LIKE PROTEIN 1, PV251 Phvul.001G257000 Phvul.001G257000.1 1 50607165 50612738 66249 CHLOROPLASTIC PV251 Phvul.001G257100 Phvul.001G257100.1 K02723 - photosystem II PsbY protein (psbY) 1 50615288 50616052 58126

102

PTHR13164:SF7 - COP1-INTERACTING PROTEIN 4- PV251 Phvul.001G257200 Phvul.001G257200.1 1 50616916 50623039 56498 RELATED

K10251 - 17beta-estradiol 17-dehydrogenase / very-long-chain 3- PV251 Phvul.001G257300 Phvul.001G257300.1 1 50624277 50627367 49137 oxoacyl-CoA reductase (HSD17B12, KAR, IFA38)

K10251 - 17beta-estradiol 17-dehydrogenase / very-long-chain 3- PV251 Phvul.001G257400 Phvul.001G257400.1 1 50629515 50632187 43899 oxoacyl-CoA reductase (HSD17B12, KAR, IFA38)

PV251 Phvul.001G257500 Phvul.001G257500.1 PTHR10845 - REGULATOR OF G PROTEIN SIGNALING 1 50634941 50641381 38473

PF05627 - Cleavage site for pathogenic type III effector PV251 Phvul.001G257600 Phvul.001G257600.1 1 50642741 50644003 30673 avirulence factor Avr (AvrRpt-cleavage) PV251 Phvul.001G257700 Phvul.001G257700.1 PTHR13140:SF312 - MYOSIN-1-RELATED 1 50646290 50654100 27124 PV251 Phvul.001G257800 Phvul.001G257800.1 PTHR15315:SF35 - F21J9.10 1 50657021 50659053 16393

PTHR15315//PTHR15315:SF22 - RING FINGER PROTEIN 41, PV251 Phvul.001G257900 Phvul.001G257900.2 1 50665923 50668506 7491 151 // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR26402//PTHR26402:SF608 - RESPONSE REGULATOR PV251 Phvul.001G258000 Phvul.001G258000.2 OF TWO-COMPONENT SYSTEM // SUBFAMILY NOT 1 50674267 50677657 853 NAMED

PTHR31358:SF12 - TPX2 (TARGETING PROTEIN FOR PV251 Phvul.001G258100 Phvul.001G258100.1 1 50678363 50682597 4949 XKLP2) PROTEIN FAMILY

PTHR11527//PTHR11527:SF137 - SMALL HEAT-SHOCK PV251 Phvul.001G258200 Phvul.001G258200.2 1 50686636 50688648 13222 PROTEIN HSP20 FAMILY // SUBFAMILY NOT NAMED

103

PTHR11804//PTHR11804:SF42 - PROTEASE M3 THIMET PV251 Phvul.001G258300 Phvul.001G258300.1 1 50690747 50693381 17333 OLIGOPEPTIDASE-RELATED // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR10257:SF26 - SERINE/THREONINE PROTEIN PV251 Phvul.001G258400 Phvul.001G258400.1 PHOSPHATASE 2A 55 KDA REGULATORY SUBUNIT B' 1 50695690 50701038 22276 DELTA ISOFORM

PV251 Phvul.001G258500 Phvul.001G258500.1 3.4.24.15 - Thimet oligopeptidase / Soluble metalloendopeptidase 1 50707851 50717994 34437

PTHR10032:SF222 - TRIHELIX TRANSCRIPTION FACTOR PV251 Phvul.001G258700 Phvul.001G258700.1 1 50722964 50727180 49550 GT-1-RELATED

K02537 - mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD2 PV251 Phvul.001G258800 Phvul.001G258800.1 1 50729194 50731346 55780 (MAD2)

PF06522 - NADH-ubiquinone reductase complex 1 MLRQ PV251 Phvul.001G258900 Phvul.001G258900.1 1 50732332 50734128 58918 subunit (B12D)

PTHR10836:SF59 - GLYCERALDEHYDE-3-PHOSPHATE PV251 Phvul.001G259000 Phvul.001G259000.1 1 50743595 50746614 70181 DEHYDROGENASE GAPC1, CYTOSOLIC

PTHR24198//PTHR24198:SF77 - ANKYRIN REPEAT AND PV251 Phvul.001G259100 Phvul.001G259100.1 PROTEIN KINASE DOMAIN-CONTAINING PROTEIN // 1 50753455 50756553 80041 SUBFAMILY NOT NAMED

PF01490//PF03222 - Transmembrane amino acid transporter PV251 Phvul.001G259200 Phvul.001G259200.1 protein (Aa_trans) // Tryptophan/tyrosine permease family 1 50757691 50762301 84277 (Trp_Tyr_perm)

104

PV251 Phvul.001G259300 Phvul.001G259300.1 K02321 - DNA polymerase alpha subunit B (POLA2) 1 50763584 50769575 90170

PV251 Phvul.001G259400 Phvul.001G259400.1 K00059 - 3-oxoacyl- (fabG) 1 50771062 50774775 97648

PV251 Phvul.001G259500 Phvul.001G259500.1 KOG3212 - Uncharacterized conserved protein related to IojAP 1 50776066 50779555 102652

PV251 Phvul.001G259600 Phvul.001G259600.1 PTHR31949:SF3 - PROTEIN, PUTATIVE-RELATED 1 50787122 50793965 113708

PV251 Phvul.001G259700 Phvul.001G259700.1 K09775 - hypothetical protein (K09775) 1 50794915 50799277 121501

PV251 Phvul.001G259800 Phvul.001G259800.2 PTHR13789:SF90 - FAD-BINDING MONOOXYGENASE 1 50800181 50807124 126767

PV251 Phvul.001G259900 Phvul.001G259900.1 PF12056 - Protein of unknown function (DUF3537) (DUF3537) 1 50808932 50812104 135518

PV251 Phvul.001G260000 Phvul.001G260000.1 K01427 - urease (URE) 1 50812525 50819689 139111

KOG0502//KOG0508//KOG4214//KOG4412 - Integral membrane ankyrin-repeat protein Kidins220 (protein kinase D substrate) // PV251 Phvul.001G260100 Phvul.001G260100.1 1 50821628 50826707 148214 Ankyrin repeat protein // Myotrophin and similar proteins // 26S proteasome regulatory complex, subunit PSMD10

PTHR12419//PTHR12419:SF24 - OTU DOMAIN PV251 Phvul.001G260200 Phvul.001G260200.1 1 50832574 50835622 159160 CONTAINING PROTEIN // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR22849:SF8 - U-BOX DOMAIN-CONTAINING PROTEIN PV251 Phvul.001G260300 Phvul.001G260300.1 1 50838135 50843093 164721 45-RELATED PV251 Phvul.001G260400 Phvul.001G260400.1 KOG3808 - Uncharacterized conserved protein 1 50847436 50850120 174022

PV251 Phvul.001G260500 Phvul.001G260500.1 K14308 - nuclear pore complex protein Nup54 (NUP54, NUP57) 1 50850386 50853825 176972

105

PF00646//PF01344 - F-box domain (F-box) // Kelch motif PV251 Phvul.001G260600 Phvul.001G260600.1 1 50856102 50858271 182688 (Kelch_1)

PV251 Phvul.001G260800 Phvul.001G260800.1 K06949 - ribosome biogenesis GTPase [EC:3.6.1.-] (rsgA, engC) 1 50864321 50867591 190907

PV251 Phvul.001G260900 Phvul.001G260900.1 K12946 - signal peptidase complex subunit 1 (SPCS1) 1 50868792 50870742 195378

PV251 Phvul.001G261000 Phvul.001G261000.1 K02880 - large subunit ribosomal protein L17e (RP-L17e, RPL17) 1 50872503 50874426 199089

PTHR12771:SF19 - ELMO/CED-12 DOMAIN-CONTAINING PV251 Phvul.001G261100 Phvul.001G261100.1 1 50876320 50880498 202906 PROTEIN-RELATED

PTHR19321:SF3 - 65-KDA MICROTUBULE-ASSOCIATED PV251 Phvul.001G261200 Phvul.001G261200.1 1 50885737 50890681 212323 PROTEIN 8

PTHR10252:SF25 - DNA POLYMERASE EPSILON SUBUNIT PV251 Phvul.001G261300 Phvul.001G261300.1 1 50890931 50891702 217517 4

PTHR32409:SF3 - MITOCHONDRIAL IMPORT RECEPTOR PV251 Phvul.001G261400 Phvul.001G261400.1 1 50892606 50896565 219192 SUBUNIT TOM20-1-RELATED

1.14.13.21 - Flavonoid 3'-monooxygenase / Flavonoid 3'- PV251 Phvul.001G261500 Phvul.001G261500.1 1 50901610 50903533 228196 hydroxylase

PTHR12210:SF13 - CTD SMALL PHOSPHATASE-LIKE PV251 Phvul.001G261600 Phvul.001G261600.2 1 50905207 50909563 231793 PROTEIN 2

PV251 Phvul.001G261800 Phvul.001G261800.2 PF05755 - Rubber elongation factor protein (REF) (REF) 1 50916436 50918648 243022

PTHR12298//PTHR12298:SF7 - PCDC2 PROGRAMMED CELL PV251 Phvul.001G261900 Phvul.001G261900.1 1 50920914 50922557 247500 DEATH PROTEIN 2 -RELATED // SUBFAMILY NOT NAMED

106

PTHR34687:SF1 - CHAPERONE PROTEIN DNAJ-LIKE PV251 Phvul.001G262000 Phvul.001G262000.1 1 50944564 50944857 271150 PROTEIN

1.14.11.33//4.2.99.18 - DNA oxidative demethylase / Alkylated PV251 Phvul.001G262100 Phvul.001G262100.1 DNA repair protein // DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / 1 50947598 50950235 274184 Phage-T4 UV endonuclease

PV251 Phvul.001G262200 Phvul.001G262200.1 PF04359 - Protein of unknown function (DUF493) (DUF493) 1 50950375 50954250 276961

PV251 Phvul.001G262300 Phvul.001G262300.1 PF04669 - Polysaccharide biosynthesis (Polysacc_synt_4) 1 50955930 50956778 282516

PTHR33044:SF7 - NON-SPECIFIC LIPID TRANSFER PV251 Phvul.001G262400 Phvul.001G262400.1 1 50960829 50963919 287415 PROTEIN GPI-ANCHORED 1

PTHR23111//PTHR23111:SF35 - ZINC FINGER PROTEIN // PV251 Phvul.001G262500 Phvul.001G262500.1 1 50966513 50970055 293099 SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR31251:SF1 - SQUAMOSA PROMOTER-BINDING-LIKE PV251 Phvul.001G262600 Phvul.001G262600.1 1 50971750 50975439 298336 PROTEIN 10-RELATED

PV251 Phvul.001G262700 Phvul.001G262700.1 PTHR32133:SF111 - F-BOX ONLY PROTEIN 6 1 50985049 50989628 311635

PV251 Phvul.001G262800 Phvul.001G262800.1 PTHR12612 - NUCLEAR TRANSPORT FACTOR 2 1 50990522 50992098 317108

PTHR23335:SF1 - CALMODULIN-BINDING PV251 Phvul.001G263000 Phvul.001G263000.2 1 50995370 51005205 321956 TRANSCRIPTION ACTIVATOR 4

PV251 Phvul.001G263100 Phvul.001G263100.1 PF11820 - Protein of unknown function (DUF3339) (DUF3339) 1 51011295 51011504 337881

107

PV251 Phvul.001G263200 Phvul.001G263200.1 PF11820 - Protein of unknown function (DUF3339) (DUF3339) 1 51013315 51013524 339901

PTHR11945//PTHR11945:SF196 - MADS BOX PROTEIN // PV251 Phvul.001G263400 Phvul.001G263400.1 1 51019194 51024353 345780 SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR22950//PTHR22950:SF219 - AMINO ACID PV251 Phvul.001G263500 Phvul.001G263500.1 1 51031383 51034520 357969 TRANSPORTER // SUBFAMILY NOT NAMED

5.2.1.12 - Zeta-carotene isomerase / 15-cis-zeta-carotene PV251 Phvul.001G263600 Phvul.001G263600.1 1 51036285 51039214 362871 isomerase

PTHR10980:SF18 - IMMUNOGLOBULIN E-SET PV251 Phvul.001G263700 Phvul.001G263700.1 1 51040498 51042273 367084 SUPERFAMILY PROTEIN PV251 Phvul.001G263800 Phvul.001G263800.1 PF01823 - MAC/Perforin domain (MACPF) 1 51047027 51052879 373613

PV251 Phvul.001G263900 Phvul.001G263900.1 PF06884 - Protein of unknown function (DUF1264) (DUF1264) 1 51056916 51058300 383502

PTHR23270//PTHR23270:SF9 - PROGRAMMED CELL PV251 Phvul.001G264000 Phvul.001G264000.1 DEATH PROTEIN 11 PRE-RRNA PROCESSING PROTEIN 1 51058320 51063316 384906 RRP5 // SUBFAMILY NOT NAMED

PF04408//PF07717 - Helicase associated domain (HA2) (HA2) // PV251 Phvul.001G264066 Phvul.001G264066.1 Oligonucleotide/oligosaccharide-binding (OB)-fold 1 51063832 51065212 390418 (OB_NTP_bind)

PTHR18934//PTHR18934:SF120 - ATP-DEPENDENT RNA PV251 Phvul.001G264132 Phvul.001G264132.1 1 51065293 51066724 391879 HELICASE // SUBFAMILY NOT NAMED

108

PV251 Phvul.001G264200 Phvul.001G264200.1 K02293 - 15-cis-phytoene desaturase (PDS, crtP) 1 51068350 51075131 394936

PV251 Phvul.001G264300 Phvul.001G264300.1 PTHR11390:SF20 - DNA TOPOISOMERASE 3-BETA-1 1 51076268 51086046 402854

PV251 Phvul.001G264400 Phvul.001G264400.1 K13899 - cystatin-C (CST3) 1 51087611 51088003 414197 PTHR24115:SF413 - KINESIN-LIKE PROTEIN KIN12A- PV251 Phvul.001G264500 Phvul.001G264500.1 1 51092081 51098813 418667 RELATED

PV251 Phvul.001G264600 Phvul.001G264600.2 PTHR35744:SF2 - C2H2 TYPE ZINC FINGER PROTEIN 1 51100229 51102999 426815

PV251 Phvul.001G264700 Phvul.001G264700.1 K14006 - protein transport protein SEC23 (SEC23) 1 51104327 51110532 430913

PV251 Phvul.001G265100 Phvul.001G265100.1 PF08268 - F-box associated domain (FBA_3) 1 51126248 51127402 452834 PV251 Phvul.001G265200 Phvul.001G265200.1 PF13041 - PPR repeat family (PPR_2) 1 51129477 51131641 456063

PTHR31062:SF34 - XYLOGLUCAN PV251 Phvul.001G265300 Phvul.001G265300.1 ENDOTRANSGLUCOSYLASE/HYDROLASE PROTEIN 15- 1 51135478 51137319 462064 RELATED

PV251 Phvul.001G265400 Phvul.001G265400.2 2.4.1.271 - Crocetin glucosyltransferase / UGT75L6 1 51139332 51141183 465918

PTHR27001:SF172 - GENOMIC DNA, CHROMOSOME 3, P1 PV251 Phvul.001G265500 Phvul.001G265500.1 1 51145201 51148970 471787 CLONE: MYM9

PV251 Phvul.001G265600 Phvul.001G265600.1 1.1.1.3//2.7.2.4 - Aspartate kinase / Aspartokinase 1 51151028 51157908 477614

BARC-PV-0004636 Phvul.005G063900 Phvul.005G063900.1 1.14.13.173 - 11-oxo-beta-amyrin 30-oxidase / CYP72A154 5 9738627 9748559 410645

BARC-PV-0004636 Phvul.005G064100 Phvul.005G064100.1 1.14.13.173 - 11-oxo-beta-amyrin 30-oxidase / CYP72A154 5 9888783 9891474 260489

109

2.5.1.30 - Heptaprenyl diphosphate synthase / Trans- BARC-PV-0004636 Phvul.005G064200 Phvul.005G064200.1 5 9967961 9972448 181311 hexaprenyltranstransferase

2.1.1.14 - 5-methyltetrahydropteroyltriglutamate--homocysteine BARC-PV-0004636 Phvul.005G048200 Phvul.005G048200.2 S-methyltransferase / Tetrahydropteroylglutamate-homocysteine 5 10113412 10127067 35860 transmethylase

PTHR11802:SF66 - SERINE CARBOXYPEPTIDASE-LIKE 36- BARC-PV-0004636 Phvul.005G054680 Phvul.005G054680.1 5 10240537 10245190 91265 RELATED

BARC-PV-0004636 Phvul.005G057920 Phvul.005G057920.1 K01094 - phosphatidylglycerophosphatase GEP4 (GEP4) 5 10337013 10339896 187741

BARC-PV-0004636 Phvul.005G061160 Phvul.005G061160.1 PTHR32444:SF13 - COMITIN 5 10433743 10435268 284471

BARC-PV-0003048 Phvul.005G063900 Phvul.005G063900.1 1.14.13.173 - 11-oxo-beta-amyrin 30-oxidase / CYP72A154 5 9738627 9748559 457200

BARC-PV-0003048 Phvul.005G064100 Phvul.005G064100.1 1.14.13.173 - 11-oxo-beta-amyrin 30-oxidase / CYP72A154 5 9888783 9891474 307044

2.5.1.30 - Heptaprenyl diphosphate synthase / Trans- BARC-PV-0003048 Phvul.005G064200 Phvul.005G064200.1 5 9967961 9972448 227866 hexaprenyltranstransferase

2.1.1.14 - 5-methyltetrahydropteroyltriglutamate--homocysteine BARC-PV-0003048 Phvul.005G048200 Phvul.005G048200.2 S-methyltransferase / Tetrahydropteroylglutamate-homocysteine 5 10113412 10127067 82415 transmethylase

PTHR11802:SF66 - SERINE CARBOXYPEPTIDASE-LIKE 36- BARC-PV-0003048 Phvul.005G054680 Phvul.005G054680.1 5 10240537 10245190 44710 RELATED

BARC-PV-0003048 Phvul.005G057920 Phvul.005G057920.1 K01094 - phosphatidylglycerophosphatase GEP4 (GEP4) 5 10337013 10339896 141186

BARC-PV-0003048 Phvul.005G061160 Phvul.005G061160.1 PTHR32444:SF13 - COMITIN 5 10433743 10435268 237916

110

PTHR31044:SF19 - CARBOHYDRATE-BINDING X8 BARC-PV-0003048 Phvul.005G064400 Phvul.005G064400.1 5 10659108 10660591 463281 DOMAIN-CONTAINING PROTEIN-RELATED

PTHR28039:SF6 - ALTERED INHERITANCE OF BARC-PV-0003048 Phvul.005G064500 Phvul.005G064500.1 MITOCHONDRIA PROTEIN 18, MITOCHONDRIAL- 5 10674162 10682616 478335 RELATED

PTHR28039:SF6 - ALTERED INHERITANCE OF BARC-PV-0003048 Phvul.005G064600 Phvul.005G064600.1 MITOCHONDRIA PROTEIN 18, MITOCHONDRIAL- 5 10688723 10693182 492896 RELATED

BARC-PV-0005461 Phvul.005G072900 Phvul.005G072900.1 3.1.3.77 - Acireductone synthase / E-1 enolase-phosphatase 5 21004251 21011898 403021

BARC-PV-0005461 Phvul.005G073000 Phvul.005G073000.1 PF05678 - VQ motif (VQ) 5 21017685 21018529 389587

BARC-PV-0005461 Phvul.005G082300 Phvul.005G082300.3 K04498 - E1A/CREB-binding protein (EP300, CREBBP, KAT3) 5 21283169 21303803 124103

K15377 - solute carrier family 44 (choline transporter-like BARC-PV-0005461 Phvul.005G082401 Phvul.005G082401.1 5 21342477 21364270 64795 protein), member 2/4/5 (SLC44A2_4_5)

BARC-PV-0005461 Phvul.005G082500 Phvul.005G082500.1 PTHR31942:SF15 - MLO-LIKE PROTEIN 11-RELATED 5 21388807 21405271 18465

BARC-PV-0005461 Phvul.005G082600 Phvul.005G082600.1 K14537 - nuclear GTP-binding protein (NUG2, GNL2) 5 21460357 21465168 53085

BARC-PV-0005461 Phvul.005G082701 Phvul.005G082701.1 PTHR11089:SF9 - NUCLEOLAR GTP-BINDING PROTEIN 2 5 21464015 21471609 56743

PTHR10353//PTHR10353:SF42 - GLYCOSYL HYDROLASE // BARC-PV-0005461 Phvul.005G082800 Phvul.005G082800.2 5 21493012 21497153 85740 SUBFAMILY NOT NAMED

111

PTHR10353//PTHR10353:SF42 - GLYCOSYL HYDROLASE // BARC-PV-0005461 Phvul.005G082900 Phvul.005G082900.1 5 21529999 21533766 122727 SUBFAMILY NOT NAMED

(M=35) PF00560//PF13855 - Leucine Rich Repeat (LRR_1) // BARC-PV-0005461 Phvul.005G083000 Phvul.005G083000.1 5 21577149 21585584 169877 Leucine rich repeat (LRR_8)

BARC-PV-0005461 Phvul.005G083100 Phvul.005G083100.1 K15203 - general transcription factor 3C polypeptide 6 (GTF3C6) 5 21587921 21591063 180649

PTHR22870:SF209 - GENOMIC DNA, CHROMOSOME 3, P1 BARC-PV-0005461 Phvul.005G083200 Phvul.005G083200.1 5 21626730 21640365 219458 CLONE: MJK13

PTHR13780:SF39 - CBS DOMAIN-CONTAINING PROTEIN- BARC-PV-0005461 Phvul.005G083300 Phvul.005G083300.1 5 21641980 21644533 234708 RELATED

PTHR11772//PTHR11772:SF14 - ASPARAGINE BARC-PV-0005461 Phvul.005G083400 Phvul.005G083400.1 5 21776573 21784081 369301 SYNTHETASE // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR12736//PTHR12736:SF13 - LANC-LIKE PROTEIN // BARC-PV-0005461 Phvul.005G083500 Phvul.005G083500.1 5 21786635 21789646 379363 SUBFAMILY NOT NAMED

BARC-PV-0005461 Phvul.005G083600 Phvul.005G083600.1 K02870 - large subunit ribosomal protein L12e (RP-L12e, RPL12) 5 21796781 21797276 389509

1.3.1.33 - Protochlorophyllide reductase / Protochlorophyllide BARC-PV-0005461 Phvul.005G083700 Phvul.005G083700.1 5 21802347 21804987 395075 oxidoreductase

BARC-PV-0005461 Phvul.005G083800 Phvul.005G083800.1 PTHR14221:SF0 - WD REPEAT-CONTAINING PROTEIN 44 5 21834616 21840298 427344

PTHR23050//PTHR23050:SF170 - CALCIUM BINDING BARC-PV-0003282 Phvul.005G087900 Phvul.005G087900.1 5 26534768 26535112 316887 PROTEIN // SUBFAMILY NOT NAMED

112

BARC-PV-0003282 Phvul.005G087800 Phvul.005G087800.1 PTHR33388:SF2 - NOZZLE/SPOROCYTELESS 5 26804050 26805342 47605

K15429 - tRNA (guanine37-N1)-methyltransferase [EC:2.1.1.228] BARC-PV-0003282 Phvul.005G087700 Phvul.005G087700.1 5 26809585 26823569 42070 (TRM5, TRMT5)

PTHR10177//PTHR10177:SF240 - CYCLINE // SUBFAMILY BARC-PV-0003282 Phvul.005G087500 Phvul.005G087500.1 5 26885251 26888185 33596 NOT NAMED

PTHR10641//PTHR10641:SF567 - MYB-LIKE DNA-BINDING BARC-PV-0003282 Phvul.005G087400 Phvul.005G087400.1 5 26963532 26965392 111877 PROTEIN MYB // SUBFAMILY NOT NAMED

BARC-PV-0003282 Phvul.005G087300 Phvul.005G087300.1 PF12609 - Wound-induced protein (DUF3774) 5 27050104 27050781 198449 BARC-PV-0003282 Phvul.005G087318 Phvul.005G087318.1 PF12609 - Wound-induced protein (DUF3774) 5 27064942 27065457 213287

PTHR23155:SF442 - PH DOMAIN LEUCINE-RICH REPEAT- BARC-PV-0003282 Phvul.005G087100 Phvul.005G087100.1 5 27066056 27069037 214401 CONTAINING PROTEIN PHOSPHATASE 2

BARC-PV-0004532 Phvul.005G108200 Phvul.005G108200.1 PF12609 - Wound-induced protein (DUF3774) 5 32932356 32932628 499774 BARC-PV-0004532 Phvul.005G108300 Phvul.005G108300.1 PF12609 - Wound-induced protein (DUF3774) 5 32935347 32936174 496783 BARC-PV-0004532 Phvul.005G108400 Phvul.005G108400.1 PF12609 - Wound-induced protein (DUF3774) 5 32937969 32938262 494161 BARC-PV-0004532 Phvul.005G108500 Phvul.005G108500.1 PF12609 - Wound-induced protein (DUF3774) 5 32944555 32945295 487575 PTHR34793:SF1 - PROTEIN THYLAKOID FORMATION 1, BARC-PV-0004532 Phvul.005G108600 Phvul.005G108600.1 5 32996378 32999236 435752 CHLOROPLASTIC

PTHR11255:SF29 - DIACYLGLYCEROL KINASE 5- BARC-PV-0004532 Phvul.005G108700 Phvul.005G108700.1 5 32999982 33005713 432148 RELATED

PTHR31625:SF2 - COUMAROYL-COA:ANTHOCYANIDIN 3- BARC-PV-0004532 Phvul.005G108750 Phvul.005G108750.1 O-GLUCOSIDE-6''-O-COUMAROYLTRANSFERASE 1- 5 33031346 33032767 400784 RELATED

113

PTHR31625:SF2 - COUMAROYL-COA:ANTHOCYANIDIN 3- BARC-PV-0004532 Phvul.005G108800 Phvul.005G108800.1 O-GLUCOSIDE-6''-O-COUMAROYLTRANSFERASE 1- 5 33061744 33063234 370386 RELATED

BARC-PV-0004532 Phvul.005G108900 Phvul.005G108900.1 PF02458 - Transferase family (Transferase) 5 33087470 33089142 344660 BARC-PV-0004532 Phvul.005G109000 Phvul.005G109000.1 PF02458 - Transferase family (Transferase) 5 33096500 33098013 335630

PTHR10641//PTHR10641:SF567 - MYB-LIKE DNA-BINDING BARC-PV-0004532 Phvul.005G109100 Phvul.005G109100.1 5 33128767 33130082 303363 PROTEIN MYB // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR10332:SF30 - EQUILIBRATIVE NUCLEOTIDE BARC-PV-0004532 Phvul.005G109300 Phvul.005G109300.1 5 33175265 33179719 256865 TRANSPORTER 2

1.10.9.1 - Plastoquinol--plastocyanin reductase / Cytochrome b6f BARC-PV-0004532 Phvul.005G109400 Phvul.005G109400.1 5 33186816 33189883 245314 complex BARC-PV-0004532 Phvul.005G109600 Phvul.005G109600.1 K18812 - cyclin D6, plant (CYCD6) 5 33252292 33254387 179838

PTHR10641//PTHR10641:SF584 - MYB-LIKE DNA-BINDING BARC-PV-0004532 Phvul.005G109700 Phvul.005G109700.1 5 33293888 33295341 138242 PROTEIN MYB // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR10641//PTHR10641:SF541 - MYB-LIKE DNA-BINDING BARC-PV-0004532 Phvul.005G109800 Phvul.005G109800.1 5 33435997 33439187 3867 PROTEIN MYB // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR10641//PTHR10641:SF541 - MYB-LIKE DNA-BINDING BARC-PV-0004532 Phvul.005G109900 Phvul.005G109900.1 5 33562188 33566361 130058 PROTEIN MYB // SUBFAMILY NOT NAMED

114

PF00069//PF00954//PF01453//PF08276 - Protein kinase domain BARC-PV-0004532 Phvul.005G110300 Phvul.005G110300.1 (Pkinase) // S-locus glycoprotein domain (S_locus_glycop) // D- 5 33687319 33690007 255189 mannose binding lectin (B_lectin) // PAN-like domain (PAN_2)

PF00069//PF00954//PF01453//PF08276 - Protein kinase domain BARC-PV-0004532 Phvul.005G110400 Phvul.005G110400.1 (Pkinase) // S-locus glycoprotein domain (S_locus_glycop) // D- 5 33692518 33695244 260388 mannose binding lectin (B_lectin) // PAN-like domain (PAN_2)

BARC-PV-0004532 Phvul.005G110500 Phvul.005G110500.1 (M=40) PF00582 - Universal stress protein family (Usp) 5 33710648 33715364 278518

BARC-PV-0004532 Phvul.005G110600 Phvul.005G110600.1 PTHR31717:SF7 - B-BOX DOMAIN PROTEIN 26-RELATED 5 33740901 33742341 308771

PF00954//PF01453//PF07714//PF13947 - S-locus glycoprotein domain (S_locus_glycop) // D-mannose binding lectin (B_lectin) BARC-PV-0004532 Phvul.005G110900 Phvul.005G110900.2 5 33761428 33773501 329298 // Protein tyrosine kinase (Pkinase_Tyr) // Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding (GUB_WAK_bind)

PTHR23050//PTHR23050:SF170 - CALCIUM BINDING BARC-PV-0004532 Phvul.005G110950 Phvul.005G110950.1 5 33790784 33791445 358654 PROTEIN // SUBFAMILY NOT NAMED

BARC-PV-0004532 Phvul.005G111000 Phvul.005G111000.1 K14487 - auxin responsive GH3 gene family (GH3) 5 33847850 33851755 415720

115

PTHR31241:SF2 - DEHYDRATION-RESPONSIVE ELEMENT- BARC-PV-0004532 Phvul.005G111200 Phvul.005G111200.1 5 33873675 33875366 441545 BINDING PROTEIN 2A-RELATED

PTHR31062:SF11 - XYLOGLUCAN BARC-PV-0004532 Phvul.005G111300 Phvul.005G111300.1 5 33899244 33901384 467114 ENDOTRANSGLUCOSYLASE/HYDROLASE PROTEIN 9

PTHR10641//PTHR10641:SF541 - MYB-LIKE DNA-BINDING BARC-PV-0004007 Phvul.005G109800 Phvul.005G109800.1 5 33435997 33439187 477517 PROTEIN MYB // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR10641//PTHR10641:SF541 - MYB-LIKE DNA-BINDING BARC-PV-0004007 Phvul.005G109900 Phvul.005G109900.1 5 33562188 33566361 351326 PROTEIN MYB // SUBFAMILY NOT NAMED

PF00069//PF00954//PF01453//PF08276 - Protein kinase domain BARC-PV-0004007 Phvul.005G110300 Phvul.005G110300.1 (Pkinase) // S-locus glycoprotein domain (S_locus_glycop) // D- 5 33687319 33690007 226195 mannose binding lectin (B_lectin) // PAN-like domain (PAN_2)

PF00069//PF00954//PF01453//PF08276 - Protein kinase domain BARC-PV-0004007 Phvul.005G110400 Phvul.005G110400.1 (Pkinase) // S-locus glycoprotein domain (S_locus_glycop) // D- 5 33692518 33695244 220996 mannose binding lectin (B_lectin) // PAN-like domain (PAN_2)

BARC-PV-0004007 Phvul.005G110500 Phvul.005G110500.1 (M=40) PF00582 - Universal stress protein family (Usp) 5 33710648 33715364 202866

BARC-PV-0004007 Phvul.005G110600 Phvul.005G110600.1 PTHR31717:SF7 - B-BOX DOMAIN PROTEIN 26-RELATED 5 33740901 33742341 172613

116

PF00954//PF01453//PF07714//PF13947 - S-locus glycoprotein domain (S_locus_glycop) // D-mannose binding lectin (B_lectin) BARC-PV-0004007 Phvul.005G110900 Phvul.005G110900.2 5 33761428 33773501 152086 // Protein tyrosine kinase (Pkinase_Tyr) // Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding (GUB_WAK_bind)

PTHR23050//PTHR23050:SF170 - CALCIUM BINDING BARC-PV-0004007 Phvul.005G110950 Phvul.005G110950.1 5 33790784 33791445 122730 PROTEIN // SUBFAMILY NOT NAMED

BARC-PV-0004007 Phvul.005G111000 Phvul.005G111000.1 K14487 - auxin responsive GH3 gene family (GH3) 5 33847850 33851755 65664

PTHR31241:SF2 - DEHYDRATION-RESPONSIVE ELEMENT- BARC-PV-0004007 Phvul.005G111200 Phvul.005G111200.1 5 33873675 33875366 39839 BINDING PROTEIN 2A-RELATED

PTHR31062:SF11 - XYLOGLUCAN BARC-PV-0004007 Phvul.005G111300 Phvul.005G111300.1 5 33899244 33901384 14270 ENDOTRANSGLUCOSYLASE/HYDROLASE PROTEIN 9

3.1.7.11 - Geranyl diphosphate diphosphatase / Geranyl BARC-PV-0004007 Phvul.005G111400 Phvul.005G111400.1 5 33932641 33937198 19127 pyrophosphate pyrophosphatase

3.1.7.11 - Geranyl diphosphate diphosphatase / Geranyl BARC-PV-0004007 Phvul.005G111500 Phvul.005G111500.1 5 33956254 33961525 42740 pyrophosphate pyrophosphatase

3.1.7.11 - Geranyl diphosphate diphosphatase / Geranyl BARC-PV-0004007 Phvul.005G111600 Phvul.005G111600.1 5 33970718 33971913 57204 pyrophosphate pyrophosphatase

BARC-PV-0004007 Phvul.005G111650 Phvul.005G111650.1 PF03732 - Retrotransposon gag protein (Retrotrans_gag) 5 34057521 34058063 144007

3.1.7.11 - Geranyl diphosphate diphosphatase / Geranyl BARC-PV-0004007 Phvul.005G111700 Phvul.005G111700.1 5 34082772 34085867 169258 pyrophosphate pyrophosphatase

117

BARC-PV-0004007 Phvul.005G111800 Phvul.005G111800.1 (M=55) PF03514 - GRAS domain family (GRAS) 5 34130105 34132037 216591

PTHR10997//PTHR10997:SF35 - IMPORTIN-7, 8, 11 // BARC-PV-0004007 Phvul.005G111900 Phvul.005G111900.1 5 34151689 34151989 238175 SUBFAMILY NOT NAMED

BARC-PV-0004007 Phvul.005G112000 Phvul.005G112000.1 PTHR22884:SF343 - PROTEIN MET-1, ISOFORM A 5 34171603 34186980 258089

PTHR12565//PTHR12565:SF160 - STEROL REGULATORY BARC-PV-0004007 Phvul.005G112100 Phvul.005G112100.1 5 34189814 34190674 276300 ELEMENT-BINDING PROTEIN // SUBFAMILY NOT NAMED

BARC-PV-0004007 Phvul.005G112300 Phvul.005G112300.1 PF06749 - Protein of unknown function (DUF1218) (DUF1218) 5 34225848 34226758 312334

BARC-PV-0004007 Phvul.005G112400 Phvul.005G112400.2 PTHR31352:SF5 - BETA-AMYLASE 5-RELATED 5 34229053 34233977 315539

PTHR23042//PTHR23042:SF56 - CIRCADIAN PROTEIN BARC-PV-0004007 Phvul.005G112500 Phvul.005G112500.1 5 34241374 34243480 327860 CLOCK/ARNT/BMAL/PAS // SUBFAMILY NOT NAMED

BARC-PV-0004007 Phvul.005G112600 Phvul.005G112600.1 (M=53) PF02298 - Plastocyanin-like domain (Cu_bind_like) 5 34243714 34245184 330200

(M=85) PF01657 - Salt stress response/antifungal (Stress- BARC-PV-0004007 Phvul.005G112700 Phvul.005G112700.1 5 34246172 34248650 332658 antifung)

(M=85) PF01657 - Salt stress response/antifungal (Stress- BARC-PV-0004007 Phvul.005G112800 Phvul.005G112800.1 5 34264189 34265057 350675 antifung)

PTHR10811//PTHR10811:SF19 - FRINGE-RELATED // BARC-PV-0004007 Phvul.005G112900 Phvul.005G112900.1 5 34279825 34281355 366311 SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR10811//PTHR10811:SF19 - FRINGE-RELATED // BARC-PV-0004007 Phvul.005G113000 Phvul.005G113000.1 5 34286982 34289002 373468 SUBFAMILY NOT NAMED

118

PTHR10811//PTHR10811:SF19 - FRINGE-RELATED // BARC-PV-0004007 Phvul.005G113100 Phvul.005G113100.2 5 34305456 34307096 391942 SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR31717:SF11 - B-BOX TYPE ZINC FINGER- BARC-PV-0004007 Phvul.005G113200 Phvul.005G113200.2 5 34319919 34320517 406405 CONTAINING PROTEIN

PTHR31717:SF13 - CCT MOTIF FAMILY PROTEIN- BARC-PV-0004007 Phvul.005G113300 Phvul.005G113300.1 5 34321527 34325544 408013 RELATED

PTHR10783:SF46 - EXS (ERD1/XPR1/SYG1) DOMAIN BARC-PV-0004007 Phvul.005G113400 Phvul.005G113400.1 5 34326401 34334549 412887 PROTEIN-RELATED

BARC-PV-0004007 Phvul.005G113500 Phvul.005G113500.1 PTHR15615:SF20 - CYCLIN FAMILY PROTEIN-RELATED 5 34334796 34336630 421282

BARC-PV-0004007 Phvul.005G113600 Phvul.005G113600.1 PTHR34126:SF1 - PEROXISOME BIOGENESIS PROTEIN 22 5 34339221 34343962 425707

PTHR12197:SF75 - HISTONE-LYSINE N- BARC-PV-0004007 Phvul.005G113700 Phvul.005G113700.1 5 34348635 34354632 435121 METHYLTRANSFERASE ATXR2

BARC-PV-0004007 Phvul.005G113800 Phvul.005G113800.1 PTHR31235:SF39 - PEROXIDASE 3-RELATED 5 34355270 34357322 441756

PTHR10666:SF140 - UBIQUITIN-LIKE DOMAIN- BARC-PV-0004007 Phvul.005G113900 Phvul.005G113900.1 5 34373313 34374062 459799 CONTAINING PROTEIN

BARC-PV-0004007 Phvul.005G114000 Phvul.005G114000.1 PTHR10388:SF20 - APO PROTEIN 4, MITOCHONDRIAL 5 34381013 34383805 467499

PTHR10641//PTHR10641:SF657 - MYB-LIKE DNA-BINDING BARC-PV-0004007 Phvul.005G114100 Phvul.005G114100.1 5 34396246 34397648 482732 PROTEIN MYB // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR19957//PTHR19957:SF131 - SYNTAXIN // SUBFAMILY BARC-PV-0004007 Phvul.005G114200 Phvul.005G114200.1 5 34404604 34408374 491090 NOT NAMED

PTHR11214:SF5 - BETA-1,3-GALACTOSYLTRANSFERASE BARC-PV-0005249 Phvul.005G115300 Phvul.005G115300.1 5 34653417 34657726 493724 2-RELATED

119

PTHR11695//PTHR11695:SF598 - ALCOHOL BARC-PV-0005249 Phvul.005G115400 Phvul.005G115400.1 5 34708235 34713941 438906 DEHYDROGENASE RELATED // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR10641//PTHR10641:SF571 - MYB-LIKE DNA-BINDING BARC-PV-0005249 Phvul.005G115500 Phvul.005G115500.1 5 34728589 34732366 418552 PROTEIN MYB // SUBFAMILY NOT NAMED

4.2.1.51//4.2.1.91 - Arogenate dehydratase / BARC-PV-0005249 Phvul.005G115600 Phvul.005G115600.1 5 34784371 34790188 362770 Carboxycyclohexadienyl dehydratase

BARC-PV-0005249 Phvul.005G115700 Phvul.005G115700.1 K15083 - DNA repair protein RAD16 (RAD16) 5 34817574 34824526 329567

BARC-PV-0005249 Phvul.005G115800 Phvul.005G115800.1 PTHR12701:SF18 - 4D656-RELATED 5 34826025 34828290 321116

PTHR24361:SF380 - MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN BARC-PV-0005249 Phvul.005G115900 Phvul.005G115900.1 5 34830436 34831635 316705 KINASE KINASE KINASE 17-RELATED

BARC-PV-0005249 Phvul.005G116000 Phvul.005G116000.1 (M=91) PF03106 - WRKY DNA -binding domain (WRKY) 5 34849823 34852957 297318

BARC-PV-0005249 Phvul.005G116100 Phvul.005G116100.1 K01061 - carboxymethylenebutenolidase (E3.1.1.45) 5 34877924 34881291 269217

PTHR13301:SF53 - CELLULOSE SYNTHASE-LIKE PROTEIN BARC-PV-0005249 Phvul.005G116200 Phvul.005G116200.1 5 34899296 34903096 247845 B1-RELATED

PTHR13301:SF53 - CELLULOSE SYNTHASE-LIKE PROTEIN BARC-PV-0005249 Phvul.005G116300 Phvul.005G116300.1 5 34928989 34932748 218152 B1-RELATED

PTHR13301:SF53 - CELLULOSE SYNTHASE-LIKE PROTEIN BARC-PV-0005249 Phvul.005G116400 Phvul.005G116400.1 5 34957178 34960719 189963 B1-RELATED

PTHR13301:SF53 - CELLULOSE SYNTHASE-LIKE PROTEIN BARC-PV-0005249 Phvul.005G116450 Phvul.005G116450.1 5 34978614 34982473 168527 B1-RELATED

120

PTHR13301:SF53 - CELLULOSE SYNTHASE-LIKE PROTEIN BARC-PV-0005249 Phvul.005G116501 Phvul.005G116501.1 5 35008350 35016525 138791 B1-RELATED

PTHR13301:SF53 - CELLULOSE SYNTHASE-LIKE PROTEIN BARC-PV-0005249 Phvul.005G116551 Phvul.005G116551.1 5 35029075 35034296 118066 B1-RELATED

BARC-PV-0005249 Phvul.005G116600 Phvul.005G116600.1 PF06364 - Protein of unknown function (DUF1068) (DUF1068) 5 35043973 35046282 103168

PTHR13301:SF53 - CELLULOSE SYNTHASE-LIKE PROTEIN BARC-PV-0005249 Phvul.005G116700 Phvul.005G116700.1 5 35052364 35056486 94777 B1-RELATED BARC-PV-0005249 Phvul.005G116800 Phvul.005G116800.1 K10528 - hydroperoxide lyase (HPL) 5 35056674 35062448 90467

BARC-PV-0005249 Phvul.005G116900 Phvul.005G116900.1 K06676 - condensin complex subunit 2 (BRRN1, BRN1, CAPH) 5 35082965 35086912 64176

BARC-PV-0005249 Phvul.005G117000 Phvul.005G117000.1 K09775 - hypothetical protein (K09775) 5 35092901 35096157 54240 K14566 - U3 small nucleolar RNA-associated protein 24 (UTP24, BARC-PV-0005249 Phvul.005G117100 Phvul.005G117100.1 5 35097287 35101401 49854 FCF1)

BARC-PV-0005249 Phvul.005G117200 Phvul.005G117200.1 PTHR24115:SF388 - KINESIN FAMILY MEMBER C1 5 35105075 35115678 42066

BARC-PV-0005249 Phvul.005G117300 Phvul.005G117300.1 PTHR33264:SF5 - EXPRESSED PROTEIN-RELATED 5 35126404 35128802 20737

PTHR22763//PTHR22763:SF47 - RING ZINC FINGER BARC-PV-0005249 Phvul.005G117400 Phvul.005G117400.1 5 35138026 35142321 9115 PROTEIN // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR32499:SF3 - FASCICLIN-LIKE ARABINOGALACTAN BARC-PV-0005249 Phvul.005G117500 Phvul.005G117500.1 5 35151153 35154731 4012 PROTEIN 15-RELATED

BARC-PV-0005249 Phvul.005G117600 Phvul.005G117600.1 PTHR31675:SF2 - AXIAL REGULATOR YABBY 2-RELATED 5 35174317 35183295 27176

121

K11835 - ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4/11/15 BARC-PV-0005249 Phvul.005G117700 Phvul.005G117700.1 5 35188603 35203364 41462 [EC:3.4.19.12] (USP4_11_15, UBP12)

PTHR11306//PTHR11306:SF13 - NIEMANN PICK TYPE C2 BARC-PV-0005249 Phvul.005G117800 Phvul.005G117800.1 5 35216535 35219354 69394 PROTEIN NPC2-RELATED // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR13301:SF53 - CELLULOSE SYNTHASE-LIKE PROTEIN BARC-PV-0005249 Phvul.005G117833 Phvul.005G117833.1 5 35238315 35243275 91174 B1-RELATED

PTHR11306//PTHR11306:SF13 - NIEMANN PICK TYPE C2 BARC-PV-0005249 Phvul.005G117866 Phvul.005G117866.1 5 35296932 35299686 149791 PROTEIN NPC2-RELATED // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR23155//PTHR23155:SF497 - LEUCINE-RICH REPEAT- BARC-PV-0005249 Phvul.005G117900 Phvul.005G117900.1 5 35309250 35314337 162109 CONTAINING PROTEIN // SUBFAMILY NOT NAMED

BARC-PV-0005249 Phvul.005G118000 Phvul.005G118000.1 PTHR27001:SF20 - PROTEIN KINASE FAMILY PROTEIN 5 35323981 35327519 176840

BARC-PV-0005249 Phvul.005G118100 Phvul.005G118100.1 K09503 - DnaJ homolog subfamily A member 2 (DNAJA2) 5 35332271 35334582 185130

BARC-PV-0005249 Phvul.005G118200 Phvul.005G118200.1 PTHR32295:SF12 - PROTEIN IQ-DOMAIN 15-RELATED 5 35339862 35346347 192721

PTHR31042:SF4 - CORE-2/I-BRANCHING BETA-1,6-N- BARC-PV-0005249 Phvul.005G118301 Phvul.005G118301.1 ACETYLGLUCOSAMINYLTRANSFERASE FAMILY 5 35348164 35351017 201023 PROTEIN

PTHR12815:SF10 - OUTER MEMBRANE OMP85 FAMILY BARC-PV-0005249 Phvul.005G118400 Phvul.005G118400.1 5 35355446 35359715 208305 PROTEIN

(M=197) PF01535//PF13041 - PPR repeat (PPR) // PPR repeat BARC-PV-0005249 Phvul.005G118500 Phvul.005G118500.1 5 35367873 35369270 220732 family (PPR_2)

122

BARC-PV-0005249 Phvul.005G118600 Phvul.005G118600.1 K15442 - tRNA-specific adenosine deaminase 3 (TAD3, ADAT3) 5 35370407 35375350 223266

PTHR11668//PTHR11668:SF243 - SERINE/THREONINE BARC-PV-0005249 Phvul.005G118700 Phvul.005G118700.1 5 35384702 35396156 237561 PROTEIN PHOSPHATASE // SUBFAMILY NOT NAMED

BARC-PV-0005249 Phvul.005G118800 Phvul.005G118800.1 K09528 - DnaJ homolog subfamily C member 8 (DNAJC8) 5 35396333 35401331 249192

PTHR33155:SF3 - PROTEIN FAF-LIKE, CHLOROPLASTIC- BARC-PV-0005249 Phvul.005G118900 Phvul.005G118900.1 5 35405002 35406887 257861 RELATED

(M=197) PF01535//PF13041 - PPR repeat (PPR) // PPR repeat BARC-PV-0005249 Phvul.005G119000 Phvul.005G119000.1 5 35425827 35434184 278686 family (PPR_2)

PTHR22849//PTHR22849:SF11 - WDSAM1 PROTEIN // BARC-PV-0005249 Phvul.005G119100 Phvul.005G119100.1 5 35436213 35437697 289072 SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR22849:SF0 - WD REPEAT, SAM AND U-BOX DOMAIN- BARC-PV-0005249 Phvul.005G119200 Phvul.005G119200.1 5 35452778 35454167 305637 CONTAINING PROTEIN 1

PTHR11850:SF111 - BEL1-LIKE HOMEODOMAIN PROTEIN BARC-PV-0005249 Phvul.005G119300 Phvul.005G119300.3 5 35459558 35465739 312417 1-RELATED

BARC-PV-0005249 Phvul.005G119400 Phvul.005G119400.1 PTHR13902:SF66 - TRANSCRIPTION FACTOR LHW 5 35551491 35558761 404350

PTHR31086:SF22 - ALUMINUM-ACTIVATED MALATE BARC-PV-0005249 Phvul.005G119700 Phvul.005G119700.1 5 35599261 35601840 452120 TRANSPORTER 1-RELATED

BARC-PV-0005249 Phvul.005G119800 Phvul.005G119800.1 (M=93) PF12796 - Ankyrin repeats (3 copies) (Ank_2) 5 35620553 35622851 473412

123

BARC-PV-0005249 Phvul.005G119900 Phvul.005G119900.1 (M=69) PF13962 - Domain of unknown function (PGG) 5 35628949 35631030 481808

PTHR10993:SF11 - PLASTIDIAL LIPOYLTRANSFERASE 2- BARC-PV-0005249 Phvul.005G120000 Phvul.005G120000.1 5 35638823 35642253 491682 RELATED

PTHR22880:SF167 - DNA BINDING AND ZINC-FINGER BM175 Phvul.005G128100 Phvul.005G128100.1 5 36582131 36589711 495481 DOMAIN-CONTAINING PROTEIN-RELATED

BM175 Phvul.005G128200 Phvul.005G128200.2 K11824 - AP-2 complex subunit alpha (AP2A) 5 36590098 36605212 487514

BM175 Phvul.005G128300 Phvul.005G128300.1 PF11891 - Domain of unknown function (DUF3411) (DUF3411) 5 36609647 36613025 467965

BM175 Phvul.005G128400 Phvul.005G128400.1 (M=37) PF03000 - NPH3 family (NPH3) 5 36614170 36618193 463442 BM175 Phvul.005G128500 Phvul.005G128500.1 K12449 - UDP-apiose/xylose synthase (AXS) 5 36629720 36632528 447892

PTHR22835//PTHR22835:SF191 - ZINC FINGER FYVE BM175 Phvul.005G128600 Phvul.005G128600.1 DOMAIN CONTAINING PROTEIN // SUBFAMILY NOT 5 36639448 36641252 438164 NAMED

BM175 Phvul.005G128700 Phvul.005G128700.1 PTHR23424 - SERUM AMYLOID A 5 36641718 36647312 435894

PTHR13890:SF0 - MAGNESIUM TRANSPORTER MRS2 BM175 Phvul.005G128800 Phvul.005G128800.1 5 36648914 36658521 428698 HOMOLOG, MITOCHONDRIAL

K08832 - serine/threonine-protein kinase SRPK3 [EC:2.7.11.1] BM175 Phvul.005G128900 Phvul.005G128900.1 5 36667107 36672339 410505 (SRPK3, STK23)

PTHR13683:SF348 - ASPARTYL PROTEASE FAMILY BM175 Phvul.005G129000 Phvul.005G129000.1 5 36683870 36688293 393742 PROTEIN

PTHR11010:SF47 - PROLYLCARBOXYPEPTIDASE-LIKE BM175 Phvul.005G129100 Phvul.005G129100.1 5 36693585 36697385 384027 PROTEIN-RELATED

124

BM175 Phvul.005G129200 Phvul.005G129200.1 KOG2183 - Prolylcarboxypeptidase (angiotensinase C) 5 36710212 36715236 367400

3.4.16.2 - Lysosomal Pro-Xaa carboxypeptidase / Prolyl BM175 Phvul.005G129300 Phvul.005G129300.2 5 36753464 36754473 324148 carboxypeptidase

BM175 Phvul.005G129400 Phvul.005G129400.1 K01285 - lysosomal Pro-X carboxypeptidase (PRCP) 5 36758877 36759876 318735

BM175 Phvul.005G129500 Phvul.005G129500.2 KOG2183 - Prolylcarboxypeptidase (angiotensinase C) 5 36766161 36770962 311451

PTHR10891//PTHR10891:SF629 - EF-HAND CALCIUM- BM175 Phvul.005G129600 Phvul.005G129600.1 BINDING DOMAIN CONTAINING PROTEIN // SUBFAMILY 5 36779628 36780542 297984 NOT NAMED

PTHR10044:SF106 - RING/U-BOX DOMAIN-CONTAINING BM175 Phvul.005G129700 Phvul.005G129700.2 5 36800353 36805815 277259 PROTEIN

PTHR24098:SF5 - ACYL-COA N-ACYLTRANSFERASE BM175 Phvul.005G129800 Phvul.005G129800.1 WITH RING/FYVE/PHD-TYPE ZINC FINGER DOMAIN- 5 36827870 36836112 249742 CONTAINING PROTEIN

BM175 Phvul.005G129900 Phvul.005G129900.1 PTHR13774 - PHENAZINE BIOSYNTHESIS PROTEIN 5 36838347 36840660 239265

BM175 Phvul.005G130000 Phvul.005G130000.1 K09646 - serine carboxypeptidase 1 [EC:3.4.16.-] (SCPEP1) 5 36842636 36847758 234976

PTHR10593//PTHR10593:SF41 - SERINE/THREONINE- BM175 Phvul.005G130100 Phvul.005G130100.1 5 36850624 36851868 226988 PROTEIN KINASE RIO // SUBFAMILY NOT NAMED

BM175 Phvul.005G130300 Phvul.005G130300.1 (M=42) PF13912 - C2H2-type zinc finger (zf-C2H2_6) 5 36860953 36862148 216659

125

BM175 Phvul.005G130400 Phvul.005G130400.1 K18734 - protein SMG8 (SMG8) 5 36878733 36885972 198879

PTHR31945:SF17 - TRANSCRIPTION FACTOR FER-LIKE BM175 Phvul.005G130500 Phvul.005G130500.1 5 36885578 36888552 192034 IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR

BM175 Phvul.005G130600 Phvul.005G130600.1 PF06136 - Domain of unknown function (DUF966) (DUF966) 5 36897236 36901504 180376

BM175 Phvul.005G130700 Phvul.005G130700.1 PF07795 - Protein of unknown function (DUF1635) (DUF1635) 5 36914273 36916414 163339

PTHR11062:SF46 - GLUCURONOXYLAN BM175 Phvul.005G130800 Phvul.005G130800.1 5 36936994 36939601 140618 GLUCURONOSYLTRANSFERASE F8H-RELATED

3.2.1.151 - Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase / BM175 Phvul.005G130900 Phvul.005G130900.1 5 36944794 36947158 132818 Xyloglucanendohydrolase

PTHR11214:SF5 - BETA-1,3-GALACTOSYLTRANSFERASE BM175 Phvul.005G130950 Phvul.005G130950.1 5 36958096 36960747 119516 2-RELATED

K16298 - serine carboxypeptidase-like clade IV [EC:3.4.16.-] BM175 Phvul.005G131000 Phvul.005G131000.1 5 36964870 36968809 112742 (SCPL-IV)

PTHR23273//PTHR23273:SF11 - REPLICATION FACTOR A 1, BM175 Phvul.005G131100 Phvul.005G131100.1 5 36968465 36969437 109147 RFA1 // SUBFAMILY NOT NAMED

BM175 Phvul.005G131200 Phvul.005G131200.1 PTHR10030:SF27 - ALPHA-L-FUCOSIDASE 1 5 36969687 36972671 107925

PTHR10641//PTHR10641:SF630 - MYB-LIKE DNA-BINDING BM175 Phvul.005G131300 Phvul.005G131300.1 5 36994620 36996554 82992 PROTEIN MYB // SUBFAMILY NOT NAMED

BM175 Phvul.005G131400 Phvul.005G131400.1 PTHR24096:SF236 - PROTEIN ACS-9 5 37003428 37007556 74184

126

PTHR22814:SF100 - HEAVY METAL BM175 Phvul.005G131500 Phvul.005G131500.1 TRANSPORT/DETOXIFICATION DOMAIN-CONTAINING 5 37041480 37043699 36132 PROTEIN-RELATED

BM175 Phvul.005G131600 Phvul.005G131600.1 K06185 - ATP-binding cassette, subfamily F, member 2 (ABCF2) 5 37044268 37048709 33344

(M=38) PF00076//PF14111 - RNA recognition motif. (a.k.a. BM175 Phvul.005G131700 Phvul.005G131700.1 RRM, RBD, or RNP domain) (RRM_1) // Domain of unknown 5 37054985 37057213 22627 function (DUF4283) (DUF4283)

BM175 Phvul.005G131801 Phvul.005G131801.1 PTHR31374:SF16 - AUXIN-RESPONSIVE FAMILY PROTEIN 5 37060588 37061236 17024

BM175 Phvul.005G131900 Phvul.005G131900.1 K00902 - dolichol kinase (E2.7.1.108) 5 37076676 37084433 936 PTHR19241:SF200 - ABC TRANSPORTER G FAMILY BM175 Phvul.005G132000 Phvul.005G132000.1 5 37085490 37092207 7878 MEMBER 3

K02575 - MFS transporter, NNP family, nitrate/nitrite transporter BM175 Phvul.005G132200 Phvul.005G132200.1 5 37116512 37118592 38900 (NRT, narK, nrtP, nasA)

BM175 Phvul.005G132400 Phvul.005G132400.1 K03857 - phosphatidylinositol glycan, class A (PIGA, GPI3) 5 37174966 37181328 97354

BM175 Phvul.005G132500 Phvul.005G132500.1 PTHR31072:SF1 - TRANSCRIPTION FACTOR TCP8 5 37181776 37183023 104164

BM175 Phvul.005G132600 Phvul.005G132600.1 PTHR27001:SF194 - PROTEIN KINASE FAMILY PROTEIN 5 37185352 37186650 107740

PTHR11850//PTHR11850:SF125 - HOMEOBOX PROTEIN BM175 Phvul.005G132700 Phvul.005G132700.1 5 37216525 37223084 138913 TRANSCRIPTION FACTORS // SUBFAMILY NOT NAMED

4.1.1.31 - Phosphoenolpyruvate carboxylase / Phosphoenolpyruvic BM175 Phvul.005G132900 Phvul.005G132900.1 5 37230371 37237390 152759 carboxylase

127

BM175 Phvul.005G133000 Phvul.005G133000.1 PTHR18952:SF111 - ALPHA CARBONIC ANHYDRASE 3 5 37246275 37248852 168663

BM175 Phvul.005G133101 Phvul.005G133101.1 4.2.3.27 - Isoprene synthase / ISPS 5 37258997 37265401 181385 BM175 Phvul.005G133200 Phvul.005G133200.1 4.2.3.27 - Isoprene synthase / ISPS 5 37284815 37288104 207203 BM175 Phvul.005G133300 Phvul.005G133300.1 4.2.3.27 - Isoprene synthase / ISPS 5 37298611 37301274 220999

BM175 Phvul.005G133400 Phvul.005G133400.1 PTHR18952:SF111 - ALPHA CARBONIC ANHYDRASE 3 5 37333120 37337058 255508

PTHR35116:SF2 - ATP-DEPENDENT HELICASE-LIKE BM175 Phvul.005G133500 Phvul.005G133500.2 5 37345401 37363045 267789 PROTEIN

PTHR10579:SF61 - C3H4 TYPE ZINC FINGER PROTEIN- BM175 Phvul.005G133650 Phvul.005G133650.1 5 37374178 37378447 296566 RELATED

PTHR27001:SF78 - RECEPTOR-LIKE SERINE/THREONINE- BM175 Phvul.005G133700 Phvul.005G133700.1 5 37382160 37387077 304548 PROTEIN KINASE NCRK

BM175 Phvul.005G133800 Phvul.005G133800.1 PF12734 - Cysteine-rich TM module stress tolerance (CYSTM) 5 37387673 37388421 310061

PTHR10217:SF538 - CYCLIC NUCLEOTIDE-GATED ION BM175 Phvul.005G133900 Phvul.005G133900.1 5 37389975 37393672 312363 CHANNEL 15-RELATED

PTHR31223:SF23 - CYTOKININ RIBOSIDE 5'- BM175 Phvul.005G134000 Phvul.005G134000.1 5 37404868 37408708 327256 MONOPHOSPHATE PHOSPHORIBOHYDROLASE LOG1

BM175 Phvul.005G134100 Phvul.005G134100.1 PTHR31210:SF13 - STORAGE PROTEIN-RELATED 5 37411238 37418648 333626

PTHR11132//PTHR11132:SF115 - SOLUTE CARRIER BM175 Phvul.005G134200 Phvul.005G134200.1 5 37424343 37427581 346731 FAMILY 35 // SUBFAMILY NOT NAMED

128

PTHR12136:SF41 - PLECKSTRIN HOMOLOGY (PH) AND BM175 Phvul.005G134300 Phvul.005G134300.1 5 37445720 37456061 368108 LIPID-BINDING START DOMAIN-CONTAINING PROTEIN

PTHR10071:SF184 - GATA TRANSCRIPTION FACTOR 10- BM175 Phvul.005G134400 Phvul.005G134400.1 5 37465249 37469908 387637 RELATED

PTHR31384:SF27 - AUXIN RESPONSE FACTOR 10- BM175 Phvul.005G134500 Phvul.005G134500.1 5 37478132 37481450 400520 RELATED

K15501 - serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory BM175 Phvul.005G134600 Phvul.005G134600.1 5 37493349 37503175 415737 subunit 3 (PPP6R3, SAPS3)

PTHR10910//PTHR10910:SF94 - EUKARYOTE SPECIFIC BM175 Phvul.005G134700 Phvul.005G134700.1 5 37523092 37525817 445480 DSRNA BINDING PROTEIN // SUBFAMILY NOT NAMED

BM175 Phvul.005G134800 Phvul.005G134800.2 PTHR13027 - SAND PROTEIN-RELATED 5 37539380 37545185 461768 BM175 Phvul.005G134900 Phvul.005G134900.1 PTHR33083:SF9 - EMB 5 37552692 37553675 475080 2.6.1.11 - Acetylornithine transaminase / Succinylornithine BARC-PV-0003706 Phvul.006G002000 Phvul.006G002000.1 6 618863 623711 452102 aminotransferase

PTHR23084:SF156 - RADIAL SPOKE HEAD 10 HOMOLOG BARC-PV-0003706 Phvul.006G002100 Phvul.006G002100.1 6 650667 656203 420298 B2 BARC-PV-0003706 Phvul.006G002200 Phvul.006G002200.1 PTHR10281:SF4 - NEUFERRICIN 6 691708 695411 379257

BARC-PV-0003706 Phvul.006G002300 Phvul.006G002300.2 K12153 - phenylalanine N-monooxygenase (CYP79A2) 6 696767 698504 374198

(M=41) PF03479 - Domain of unknown function (DUF296) BARC-PV-0003706 Phvul.006G007300 Phvul.006G007300.1 6 782345 782962 288620 (DUF296)

(M=41) PF03479 - Domain of unknown function (DUF296) BARC-PV-0003706 Phvul.006G007200 Phvul.006G007200.1 6 1056594 1057256 14371 (DUF296)

BARC-PV-0003706 Phvul.006G008480 Phvul.006G008480.1 K11838 - ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7 (USP7, UBP15) 6 1278193 1310573 207228

129

PTHR23002//PTHR23002:SF69 - ZINC FINGER CCHC BARC-PV-0003706 Phvul.006G006900 Phvul.006G006900.1 DOMAIN CONTAINING PROTEIN // SUBFAMILY NOT 6 1403531 1407166 332566 NAMED

PTHR27002:SF29 - CYSTEINE-RICH RECEPTOR-LIKE BARC-PV-0003706 Phvul.006G006800 Phvul.006G006800.3 6 1501100 1503815 430135 PROTEIN KINASE 41

BARC-PV-0003706 Phvul.006G006700 Phvul.006G006700.1 K13429 - chitin elicitor receptor kinase 1 (CERK1) 6 1518408 1527438 447443

BARC-PV-0004934 Phvul.006G008480 Phvul.006G008480.1 K11838 - ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7 (USP7, UBP15) 6 1278193 1310573 476308

PTHR23002//PTHR23002:SF69 - ZINC FINGER CCHC BARC-PV-0004934 Phvul.006G006900 Phvul.006G006900.1 DOMAIN CONTAINING PROTEIN // SUBFAMILY NOT 6 1403531 1407166 350970 NAMED

PTHR27002:SF29 - CYSTEINE-RICH RECEPTOR-LIKE BARC-PV-0004934 Phvul.006G006800 Phvul.006G006800.3 6 1501100 1503815 253401 PROTEIN KINASE 41

BARC-PV-0004934 Phvul.006G006700 Phvul.006G006700.1 K13429 - chitin elicitor receptor kinase 1 (CERK1) 6 1518408 1527438 236093

PTHR36705:SF2 - CLAVATA3/ESR (CLE)-RELATED BARC-PV-0004934 Phvul.006G006600 Phvul.006G006600.1 6 1676279 1676738 78222 PROTEIN 20

1.14.19.2 - Stearoyl-[acyl-carrier-protein] 9-desaturase / Stearyl- BARC-PV-0004934 Phvul.006G006500 Phvul.006G006500.1 6 1708563 1709394 45938 ACP desaturase BARC-PV-0004934 Phvul.006G006400 Phvul.006G006400.2 KOG4702 - Uncharacterized conserved protein 6 1722928 1724724 31573

BARC-PV-0004934 Phvul.006G006300 Phvul.006G006300.1 PTHR36399:SF1 - NAD(P)H DEHYDROGENASE 18 6 1872593 1875520 118092

2.1.1.126 - [Myelin basic protein]-arginine N-methyltransferase / BARC-PV-0004934 Phvul.006G006200 Phvul.006G006200.1 6 1914480 1920552 159979 Protein-arginine N-methyltransferase

130

K17781 - mitochondrial import inner membrane translocase BARC-PV-0004934 Phvul.006G006100 Phvul.006G006100.1 6 1982418 1983643 227917 subunit TIM13 (TIM13)

PTHR11661:SF7 - 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11, BARC-PV-0004934 Phvul.006G007380 Phvul.006G007380.1 6 2029226 2031173 274725 CHLOROPLASTIC-RELATED

BARC-PV-0004934 Phvul.006G008660 Phvul.006G008660.1 PTHR21229:SF22 - DBJ 6 2041341 2043092 286840

BARC-PV-0004934 Phvul.006G009940 Phvul.006G009940.1 PF13225 - Domain of unknown function (DUF4033) (DUF4033) 6 2091297 2093826 336796

BARC-PV-0004934 Phvul.006G011220 Phvul.006G011220.1 PTHR11514:SF40 - TRANSCRIPTION FACTOR BHLH14 6 2126956 2128170 372455

BARC-PV-0004934 Phvul.006G012501 Phvul.006G012501.1 K01761 - methionine-gamma-lyase (E4.4.1.11) 6 2222475 2224220 467974

PTHR23002//PTHR23002:SF69 - ZINC FINGER CCHC BARC-PV-0003383 Phvul.006G006900 Phvul.006G006900.1 DOMAIN CONTAINING PROTEIN // SUBFAMILY NOT 6 1403531 1407166 404719 NAMED

PTHR27002:SF29 - CYSTEINE-RICH RECEPTOR-LIKE BARC-PV-0003383 Phvul.006G006800 Phvul.006G006800.3 6 1501100 1503815 307150 PROTEIN KINASE 41

BARC-PV-0003383 Phvul.006G006700 Phvul.006G006700.1 K13429 - chitin elicitor receptor kinase 1 (CERK1) 6 1518408 1527438 289842

PTHR36705:SF2 - CLAVATA3/ESR (CLE)-RELATED BARC-PV-0003383 Phvul.006G006600 Phvul.006G006600.1 6 1676279 1676738 131971 PROTEIN 20

1.14.19.2 - Stearoyl-[acyl-carrier-protein] 9-desaturase / Stearyl- BARC-PV-0003383 Phvul.006G006500 Phvul.006G006500.1 6 1708563 1709394 99687 ACP desaturase BARC-PV-0003383 Phvul.006G006400 Phvul.006G006400.2 KOG4702 - Uncharacterized conserved protein 6 1722928 1724724 85322

BARC-PV-0003383 Phvul.006G006300 Phvul.006G006300.1 PTHR36399:SF1 - NAD(P)H DEHYDROGENASE 18 6 1872593 1875520 64343

131

2.1.1.126 - [Myelin basic protein]-arginine N-methyltransferase / BARC-PV-0003383 Phvul.006G006200 Phvul.006G006200.1 6 1914480 1920552 106230 Protein-arginine N-methyltransferase

K17781 - mitochondrial import inner membrane translocase BARC-PV-0003383 Phvul.006G006100 Phvul.006G006100.1 6 1982418 1983643 174168 subunit TIM13 (TIM13)

PTHR11661:SF7 - 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11, BARC-PV-0003383 Phvul.006G007380 Phvul.006G007380.1 6 2029226 2031173 220976 CHLOROPLASTIC-RELATED

BARC-PV-0003383 Phvul.006G008660 Phvul.006G008660.1 PTHR21229:SF22 - DBJ 6 2041341 2043092 233091

BARC-PV-0003383 Phvul.006G009940 Phvul.006G009940.1 PF13225 - Domain of unknown function (DUF4033) (DUF4033) 6 2091297 2093826 283047

BARC-PV-0003383 Phvul.006G011220 Phvul.006G011220.1 PTHR11514:SF40 - TRANSCRIPTION FACTOR BHLH14 6 2126956 2128170 318706

BARC-PV-0003383 Phvul.006G012501 Phvul.006G012501.1 K01761 - methionine-gamma-lyase (E4.4.1.11) 6 2222475 2224220 414225

BARC-PV-0003383 Phvul.006G013781 Phvul.006G013781.1 3.4.19.1 - Acylaminoacyl-peptidase / N-acylpeptide hydrolase 6 2297940 2300460 489690

PTHR11782//PTHR11782:SF51 - ADENOSINE/GUANOSINE BARC-PV-0004895 Phvul.006G017211 Phvul.006G017211.1 6 8151663 8188827 481597 DIPHOSPHATASE // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR11926:SF233 - UDP-GLYCOSYLTRANSFERASE 85A1- BARC-PV-0004895 Phvul.006G017400 Phvul.006G017400.1 6 8197094 8201997 436166 RELATED

BARC-PV-0004895 Phvul.006G020300 Phvul.006G020300.2 PTHR13520:SF0 - RAD50-INTERACTING PROTEIN 1 6 8359831 8364678 273429

BARC-PV-0004895 Phvul.006G020200 Phvul.006G020200.1 PTHR10641:SF540 - MYB TRANSCRIPTION FACTOR 6 8414030 8419780 219230

132

BARC-PV-0004895 Phvul.006G020500 Phvul.006G020500.1 PTHR24056:SF227 - CYCLIN-DEPENDENT KINASE C-2 6 8559380 8568891 73880

(M=48) K04733 - interleukin-1 receptor-associated kinase 4 BARC-PV-0004895 Phvul.006G020700 Phvul.006G020700.1 6 8607103 8610369 26157 (IRAK4)

PTHR11260:SF186 - GLUTATHIONE S-TRANSFERASE F11- BARC-PV-0004895 Phvul.006G020800 Phvul.006G020800.2 6 8626154 8627742 7106 RELATED

PTHR24343:SF189 - CBL-INTERACTING BARC-PV-0004895 Phvul.006G020900 Phvul.006G020900.4 6 8642329 8648848 9069 SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 3

PTHR34675:SF1 - PROTEIN BARC-PV-0004895 Phvul.006G021000 Phvul.006G021000.1 6 8654928 8660223 21668 TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL 2, CHLOROPLASTIC

BARC-PV-0004895 Phvul.006G021100 Phvul.006G021100.1 K18466 - vacuolar protein sorting-associated protein 26 (VPS26) 6 8688450 8689891 55190

BARC-PV-0004895 Phvul.006G021200 Phvul.006G021200.1 PTHR22891:SF20 - PROTEIN ARGONAUTE 4-RELATED 6 8724726 8733728 91466

PTHR24193:SF83 - ANKYRIN REPEAT-CONTAINING BARC-PV-0004895 Phvul.006G021300 Phvul.006G021300.1 6 8735255 8739295 101995 PROTEIN

BARC-PV-0004895 Phvul.006G021500 Phvul.006G021500.1 PF14577 - Sieve element occlusion C-terminus (SEO_C) 6 8764459 8768953 131199

BARC-PV-0004895 Phvul.006G021400 Phvul.006G021400.1 PF14577 - Sieve element occlusion C-terminus (SEO_C) 6 8842260 8851563 209000

K02935 - large subunit ribosomal protein L7/L12 (RP-L7, BARC-PV-0004895 Phvul.006G021600 Phvul.006G021600.1 6 8888589 8889839 255329 MRPL12, rplL)

K16296 - serine carboxypeptidase-like clade I [EC:3.4.16.-] BARC-PV-0004895 Phvul.006G021700 Phvul.006G021700.1 6 8922713 8938375 289453 (SCPL-I)

BARC-PV-0004895 Phvul.006G021800 Phvul.006G021800.1 PTHR23050:SF153 - CALMODULIN-1-RELATED 6 8987252 8989496 353992

133

PTHR22952//PTHR22952:SF174 - CAMP-RESPONSE BARC-PV-0004895 Phvul.006G021900 Phvul.006G021900.1 ELEMENT BINDING PROTEIN-RELATED // SUBFAMILY 6 9026893 9033757 393633 NOT NAMED

(M=47) PF12776 - Myb/SANT-like DNA-binding domain BARC-PV-0004895 Phvul.006G022100 Phvul.006G022100.1 6 9090877 9093352 457617 (Myb_DNA-bind_3)

PTHR12549 - JMJC DOMAIN-CONTAINING HISTONE BARC-PV-0004895 Phvul.006G022150 Phvul.006G022150.1 6 9096653 9099279 463393 DEMETHYLATION PROTEIN

(M=24) PF03188 - Eukaryotic cytochrome b561 BARC-PV-0004895 Phvul.006G022300 Phvul.006G022300.1 6 9110996 9114412 477736 (Cytochrom_B561)

PV163 Phvul.006G079000 Phvul.006G079000.1 PTHR31956:SF9 - NON-SPECIFIC PHOSPHOLIPASE C1 6 19074322 19075789 495475

PTHR24298:SF1 - CYTOCHROME P450, FAMILY 79, PV163 Phvul.006G079100 Phvul.006G079100.1 6 19092672 19094730 477125 SUBFAMILY C, POLYPEPTIDE 1-RELATED

PV163 Phvul.006G079200 Phvul.006G079200.2 K12153 - phenylalanine N-monooxygenase (CYP79A2) 6 19104464 19107947 465333

PTHR23336:SF10 - B3 DOMAIN-CONTAINING PV163 Phvul.006G079300 Phvul.006G079300.1 6 19125293 19132662 444504 TRANSCRIPTION REPRESSOR VAL1-RELATED

PV163 Phvul.006G079500 Phvul.006G079500.1 6.2.1.8 - Oxalate--CoA ligase / Oxalyl-CoA synthetase 6 19157062 19160060 412735

PTHR11260//PTHR11260:SF16 - GLUTATHIONE S- PV163 Phvul.006G079600 Phvul.006G079600.1 TRANSFERASE, GST, SUPERFAMILY, GST DOMAIN 6 19161658 19162870 408139 CONTAINING // SUBFAMILY NOT NAMED

134

1.14.13.11 - Trans-cinnamate 4-monooxygenase / Cinnamic acid PV163 Phvul.006G079700 Phvul.006G079700.1 6 19165727 19168571 404070 4-monooxygenase

PTHR24031:SF306 - DEAD-BOX ATP-DEPENDENT RNA PV163 Phvul.006G079800 Phvul.006G079800.1 6 19172419 19180893 397378 HELICASE 11

PTHR32258:SF4 - KINASE INTERACTING (KIP1-LIKE) PV163 Phvul.006G079900 Phvul.006G079900.1 6 19181585 19183594 388212 FAMILY PROTEIN

PTHR31194//PTHR31194:SF6 - SHN SHINE , DNA BINDING / PV163 Phvul.006G080000 Phvul.006G080000.2 6 19194544 19195813 375253 TRANSCRIPTION FACTOR // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR31234:SF7 - LATE EMBRYOGENESIS ABUNDANT PV163 Phvul.006G080100 Phvul.006G080100.1 6 19206917 19208711 362880 HYDROXYPROLINE-RICH GLYCOPROTEIN

(M=43) PF00069//PF00560//PF08263//PF13855 - Protein kinase domain (Pkinase) // Leucine Rich Repeat (LRR_1) // Leucine rich PV163 Phvul.006G080200 Phvul.006G080200.1 6 19209581 19212129 360216 repeat N-terminal domain (LRRNT_2) // Leucine rich repeat (LRR_8)

PV163 Phvul.006G080300 Phvul.006G080300.1 3.6.4.8 - Proteasome ATPase / RP triple-A protein 6 19230640 19235350 339157

PV163 Phvul.006G080400 Phvul.006G080400.1 PTHR32370:SF17 - ROOT PHOTOTROPISM PROTEIN 2 6 19239188 19241698 330609

PTHR27003:SF36 - LEUCINE-RICH REPEAT PROTEIN PV163 Phvul.006G080500 Phvul.006G080500.1 6 19262757 19276195 307040 KINASE-LIKE PROTEIN

PV163 Phvul.006G080600 Phvul.006G080600.1 K02866 - large subunit ribosomal protein L10e (RP-L10e, RPL10) 6 19277786 19279963 292011

135

PTHR11562:SF45 - METAL TOLERANCE PROTEIN C3- PV163 Phvul.006G080700 Phvul.006G080700.1 6 19279972 19283798 289825 RELATED

PTHR24343:SF101 - SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE PV163 Phvul.006G080800 Phvul.006G080800.2 6 19292614 19295424 277183 SRK2A-RELATED

PTHR11208//PTHR11208:SF42 - RNA-BINDING PROTEIN PV163 Phvul.006G080900 Phvul.006G080900.2 6 19310087 19314273 259710 RELATED // SUBFAMILY NOT NAMED

PV163 Phvul.006G081000 Phvul.006G081000.1 PF06697 - Protein of unknown function (DUF1191) (DUF1191) 6 19323546 19324493 246251

PV163 Phvul.006G081200 Phvul.006G081200.1 K11723 - bromodomain-containing protein 7/9 (BRD7_9) 6 19343726 19352735 226071

PTHR22881//PTHR22881:SF17 - BROMODOMAIN PV163 Phvul.006G081400 Phvul.006G081400.1 6 19360008 19364255 209789 CONTAINING PROTEIN // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR22881//PTHR22881:SF17 - BROMODOMAIN PV163 Phvul.006G081500 Phvul.006G081500.1 6 19375921 19380340 193876 CONTAINING PROTEIN // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR35515:SF1 - NADH DEHYDROGENASE-LIKE PV163 Phvul.006G081700 Phvul.006G081700.1 6 19408873 19411137 160924 COMPLEX N

PTHR24282//PTHR24282:SF11 - CYTOCHROME P450 PV163 Phvul.006G081800 Phvul.006G081800.1 6 19419840 19422560 149957 FAMILY MEMBER // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR24282//PTHR24282:SF11 - CYTOCHROME P450 PV163 Phvul.006G081900 Phvul.006G081900.1 6 19444974 19447713 124823 FAMILY MEMBER // SUBFAMILY NOT NAMED

136

PTHR24282//PTHR24282:SF11 - CYTOCHROME P450 PV163 Phvul.006G082000 Phvul.006G082000.1 6 19450029 19450370 119768 FAMILY MEMBER // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR10994//PTHR10994:SF82 - RETICULON // SUBFAMILY PV163 Phvul.006G082100 Phvul.006G082100.1 6 19451298 19453073 118499 NOT NAMED

PV163 Phvul.006G082200 Phvul.006G082200.1 PF10674 - Protein of unknown function (DUF2488) (Ycf54) 6 19453968 19456117 115829

K02879 - large subunit ribosomal protein L17 (RP-L17, MRPL17, PV163 Phvul.006G082300 Phvul.006G082300.1 6 19458176 19460134 111621 rplQ)

3.6.1.29 - Bis(5'-adenosyl)-triphosphatase / PV163 Phvul.006G082500 Phvul.006G082500.2 6 19464563 19466742 105234 Dinucleosidetriphosphatase

PV163 Phvul.006G082600 Phvul.006G082600.1 K03654 - ATP-dependent DNA helicase RecQ (recQ) 6 19468852 19478776 100945

PV163 Phvul.006G082700 Phvul.006G082700.1 KOG2966 - Uncharacterized conserved protein 6 19479223 19482190 90574 PTHR13439//PTHR13439:SF13 - CT120 PROTEIN // PV163 Phvul.006G082800 Phvul.006G082800.1 6 19485922 19493637 83875 SUBFAMILY NOT NAMED

PV163 Phvul.006G083000 Phvul.006G083000.1 PTHR13683:SF250 - ASPARTYL PROTEASE-LIKE PROTEIN 6 19499459 19501042 70338

PTHR10209:SF226 - 2-OXOGLUTARATE (2OG) AND FE(II)- PV163 Phvul.006G083200 Phvul.006G083200.1 6 19530201 19536008 39596 DEPENDENT OXYGENASE SUPERFAMILY PROTEIN

PV163 Phvul.006G083300 Phvul.006G083300.4 PTHR22904:SF373 - PROTEIN TIC 40, CHLOROPLASTIC 6 19539454 19548311 30343

PTHR22911//PTHR22911:SF60 - ACYL-MALONYL PV163 Phvul.006G083500 Phvul.006G083500.1 CONDENSING ENZYME-RELATED // SUBFAMILY NOT 6 19552165 19556149 17632 NAMED

137

PTHR31852:SF1 - LATE EMBRYOGENESIS ABUNDANT PV163 Phvul.006G083600 Phvul.006G083600.1 (LEA) HYDROXYPROLINE-RICH GLYCOPROTEIN- 6 19558388 19559380 11409 RELATED

PV163 Phvul.006G083700 Phvul.006G083700.1 PF11955 - Plant organelle RNA recognition domain (PORR) 6 19560947 19562750 8850

PV163 Phvul.006G083800 Phvul.006G083800.1 PTHR31645:SF1 - GB 6 19564418 19569734 5379

PV163 Phvul.006G083900 Phvul.006G083900.1 PF07466 - Protein of unknown function (DUF1517) (DUF1517) 6 19572259 19576119 2462

PV163 Phvul.006G084200 Phvul.006G084200.1 PTHR31384:SF2 - AUXIN RESPONSE FACTOR 8 6 19583710 19591273 13913

PV163 Phvul.006G084300 Phvul.006G084300.1 PF05757 - Oxygen evolving enhancer protein 3 (PsbQ) (PsbQ) 6 19591669 19593427 21872

(M=40) PF01657//PF07714 - Salt stress response/antifungal PV163 Phvul.006G084400 Phvul.006G084400.1 6 19600415 19606813 30618 (Stress-antifung) // Protein tyrosine kinase (Pkinase_Tyr)

(M=40) PF01657//PF07714 - Salt stress response/antifungal PV163 Phvul.006G084500 Phvul.006G084500.1 6 19611041 19614260 41244 (Stress-antifung) // Protein tyrosine kinase (Pkinase_Tyr)

PF00069//PF01657 - Protein kinase domain (Pkinase) // Salt stress PV163 Phvul.006G084600 Phvul.006G084600.1 6 19616221 19619605 46424 response/antifungal (Stress-antifung)

PF00069//PF01657 - Protein kinase domain (Pkinase) // Salt stress PV163 Phvul.006G084700 Phvul.006G084700.1 6 19624833 19629355 55036 response/antifungal (Stress-antifung)

PF00069//PF01657 - Protein kinase domain (Pkinase) // Salt stress PV163 Phvul.006G084800 Phvul.006G084800.1 6 19632191 19636198 62394 response/antifungal (Stress-antifung)

138

(M=40) PF01657//PF07714 - Salt stress response/antifungal PV163 Phvul.006G084900 Phvul.006G084900.3 6 19642947 19647587 73150 (Stress-antifung) // Protein tyrosine kinase (Pkinase_Tyr)

PV163 Phvul.006G085000 Phvul.006G085000.1 K18881 - D-lactate dehydratase (DJ1D) 6 19648148 19652450 78351

PV163 Phvul.006G085100 Phvul.006G085100.1 K12864 - beta-catenin-like protein 1 (CTNNBL1) 6 19653016 19657410 83219

PTHR10887:SF358 - P-LOOP CONTAINING NUCLEOSIDE PV163 Phvul.006G085200 Phvul.006G085200.1 6 19657924 19663224 88127 TRIPHOSPHATE HYDROLASES SUPERFAMILY PROTEIN

PTHR10887:SF358 - P-LOOP CONTAINING NUCLEOSIDE PV163 Phvul.006G085300 Phvul.006G085300.1 6 19664847 19671971 95050 TRIPHOSPHATE HYDROLASES SUPERFAMILY PROTEIN

PV163 Phvul.006G085400 Phvul.006G085400.1 K18172 - COX assembly mitochondrial protein 2 (CMC2) 6 19673203 19674921 103406

PTHR14445:SF39 - SWIB/MDM2, PLUS-3 AND GYF PV163 Phvul.006G085500 Phvul.006G085500.1 6 19676128 19680040 106331 DOMAIN-CONTAINING PROTEIN-RELATED

PF02201//PF03126 - SWIB/MDM2 domain (SWIB) // Plus-3 PV163 Phvul.006G085511 Phvul.006G085511.1 6 19690094 19699252 120297 domain (Plus-3)

PTHR11615//PTHR11615:SF151 - NITRATE, FROMATE, PV163 Phvul.006G085522 Phvul.006G085522.1 6 19703977 19706319 134180 IRON DEHYDROGENASE // SUBFAMILY NOT NAMED

139

PF02201//PF03004//PF03126 - SWIB/MDM2 domain (SWIB) // PV163 Phvul.006G085533 Phvul.006G085533.1 Plant transposase (Ptta/En/Spm family) (Transposase_24) // Plus-3 6 19705017 19717194 135220 domain (Plus-3)

PTHR11615//PTHR11615:SF151 - NITRATE, FROMATE, PV163 Phvul.006G085600 Phvul.006G085600.2 6 19718261 19721451 148464 IRON DEHYDROGENASE // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR14445:SF36 - PERQ AMINO ACID-RICH WITH GYF PV163 Phvul.006G085700 Phvul.006G085700.1 6 19728474 19732517 158677 DOMAIN-CONTAINING PROTEIN CG11148

1.5.3.16//1.5.3.17 - Spermine oxidase / SMO // Non-specific PV163 Phvul.006G085900 Phvul.006G085900.1 6 19761544 19766764 191747 polyamine oxidase / Polyamine oxidase

PTHR24073:SF570 - RAS-RELATED PROTEIN RABF2A- PV163 Phvul.006G086000 Phvul.006G086000.1 6 19771878 19777596 202081 RELATED

(M=29) PF00501//PF13193 - AMP-binding enzyme (AMP- PV163 Phvul.006G086100 Phvul.006G086100.1 binding) // AMP-binding enzyme C-terminal domain (AMP- 6 19784748 19787292 214951 binding_C)

PV163 Phvul.006G086400 Phvul.006G086400.2 PTHR13980 - CDC68 RELATED 6 19835513 19840823 265716 PV163 Phvul.006G086500 Phvul.006G086500.3 PTHR13980 - CDC68 RELATED 6 19845745 19850469 275948

PTHR24198:SF94 - ANKYRIN REPEAT DOMAIN- PV163 Phvul.006G086600 Phvul.006G086600.1 6 19854770 19859573 284973 CONTAINING PROTEIN EMB506, CHLOROPLASTIC

PV163 Phvul.006G086700 Phvul.006G086700.1 PTHR12802:SF60 - PROTEIN REVEILLE 1-RELATED 6 19863356 19866716 293559

PV163 Phvul.006G086800 Phvul.006G086800.1 PTHR31867:SF3 - EXPANSIN-A13 6 19868295 19869443 298498 PV163 Phvul.006G086811 Phvul.006G086811.1 PTHR22870:SF177 - F12P19.9 PROTEIN 6 19885040 19889712 315243

140

PV163 Phvul.006G086822 Phvul.006G086822.1 PTHR22870:SF177 - F12P19.9 PROTEIN 6 19889888 19892111 320091 PV163 Phvul.006G087000 Phvul.006G087000.1 PTHR31989:SF6 - F12P19.8 PROTEIN 6 19906631 19911082 336834

PTHR14445:SF39 - SWIB/MDM2, PLUS-3 AND GYF PV163 Phvul.006G087011 Phvul.006G087011.1 6 19915850 19916248 346053 DOMAIN-CONTAINING PROTEIN-RELATED

(M=197) PF01535//PF13041 - PPR repeat (PPR) // PPR repeat PV163 Phvul.006G087100 Phvul.006G087100.1 6 19918058 19919806 348261 family (PPR_2)

PV163 Phvul.006G087300 Phvul.006G087300.1 PTHR12526:SF379 - SUCROSE SYNTHASE 5 6 19938272 19942981 368475

PTHR11260:SF186 - GLUTATHIONE S-TRANSFERASE F11- PV163 Phvul.006G087500 Phvul.006G087500.1 6 19947357 19949404 377560 RELATED

PTHR11999//PTHR11999:SF92 - GROUP II PYRIDOXAL-5- PV163 Phvul.006G087600 Phvul.006G087600.1 PHOSPHATE DECARBOXYLASE // SUBFAMILY NOT 6 19960673 19967369 390876 NAMED

PTHR27007:SF47 - L-TYPE LECTIN-DOMAIN CONTAINING PV163 Phvul.006G087700 Phvul.006G087700.1 6 19974245 19976281 404448 RECEPTOR KINASE VIII.1-RELATED

PF00646//PF14299 - F-box domain (F-box) // Phloem protein 2 PV163 Phvul.006G087800 Phvul.006G087800.1 6 19982244 19984992 412447 (PP2) PV163 Phvul.006G087900 Phvul.006G087900.1 PTHR24006:SF442 - PROTEIN GADR-4 6 19987196 19992660 417399

PTHR31707:SF34 - PECTINESTERASE/PECTINESTERASE PV163 Phvul.006G088000 Phvul.006G088000.1 6 19994299 19996305 424502 INHIBITOR 22-RELATED

PV163 Phvul.006G088100 Phvul.006G088100.1 (M=52) K01051 - pectinesterase (E3.1.1.11) 6 20002972 20005754 433175 PV163 Phvul.006G088200 Phvul.006G088200.1 (M=52) K01051 - pectinesterase (E3.1.1.11) 6 20008973 20011322 439176

141

PV163 Phvul.006G088300 Phvul.006G088300.1 PTHR35760:SF1 - SI:CH211-22I13.2 PROTEIN 6 20014741 20017256 444944

PTHR10992:SF907 - ALPHA/BETA-HYDROLASES PV163 Phvul.006G088400 Phvul.006G088400.1 6 20022046 20024244 452249 SUPERFAMILY PROTEIN

PTHR10992:SF907 - ALPHA/BETA-HYDROLASES PV163 Phvul.006G088500 Phvul.006G088500.1 6 20029131 20031048 459334 SUPERFAMILY PROTEIN

PTHR10992:SF907 - ALPHA/BETA-HYDROLASES PV163 Phvul.006G088600 Phvul.006G088600.1 6 20043205 20044667 473408 SUPERFAMILY PROTEIN

PTHR10992:SF907 - ALPHA/BETA-HYDROLASES PV163 Phvul.006G088700 Phvul.006G088700.1 6 20050321 20051693 480524 SUPERFAMILY PROTEIN

PV163 Phvul.006G088800 Phvul.006G088800.1 K02883 - large subunit ribosomal protein L18e (RP-L18e, RPL18) 6 20053409 20055713 483612

PTHR11668:SF262 - SERINE/THREONINE-PROTEIN PV163 Phvul.006G088900 Phvul.006G088900.3 6 20056908 20059828 487111 PHOSPHATASE PP1 ISOZYME 8-RELATED

PTHR33565:SF1 - DORMANCY/AUXIN ASSOCIATED PV163 Phvul.006G089000 Phvul.006G089000.2 6 20061636 20063194 491839 PROTEIN

PTHR13832:SF286 - PROTEIN PHOSPHATASE 2C 33- BM183 Phvul.007G001500 Phvul.007G001500.2 7 79293 83024 94346 RELATED

K10884 - ATP-dependent DNA helicase 2 subunit 1 (XRCC6, BM183 Phvul.007G001600 Phvul.007G001600.1 7 84706 96382 88933 KU70, G22P1)

PTHR10997//PTHR10997:SF35 - IMPORTIN-7, 8, 11 // BM183 Phvul.007G001700 Phvul.007G001700.1 7 97646 106496 75993 SUBFAMILY NOT NAMED

BM183 Phvul.007G001800 Phvul.007G001800.1 (M=66) PF14368 - Probable lipid transfer (LTP_2) 7 109767 110152 63872

PTHR12174:SF36 - SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 3- BM183 Phvul.007G001900 Phvul.007G001900.1 7 111224 119553 62415 RELATED

142

BM183 Phvul.007G002000 Phvul.007G002000.1 PTHR10869:SF42 - PROLYL-4 HYDROXYLASE 7 120389 125304 53250

PF14617 - U3-containing 90S pre-ribosomal complex subunit BM183 Phvul.007G002100 Phvul.007G002100.1 7 125720 127699 47919 (CMS1)

PTHR16223:SF10 - TRANSCRIPTION FACTOR BHLH128- BM183 Phvul.007G002200 Phvul.007G002200.1 7 129180 133613 44459 RELATED BM183 Phvul.007G002300 Phvul.007G002300.2 PTHR21493:SF140 - PROTEIN F28H7.3 7 133494 140785 40145

PF01190//PF04554 - Pollen proteins Ole e I like (Pollen_Ole_e_I) BM183 Phvul.007G002400 Phvul.007G002400.2 7 156129 161139 17510 // Extensin-like region (Extensin_2)

BM183 Phvul.007G002500 Phvul.007G002500.1 PTHR12276:SF45 - CLATHRIN INTERACTOR 1 7 165555 171844 8084

PTHR14233//PTHR14233:SF16 - DUF914-RELATED // BM183 Phvul.007G002600 Phvul.007G002600.1 7 172000 176893 1639 SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR10288//PTHR10288:SF154 - KH DOMAIN CONTAINING BM183 Phvul.007G002700 Phvul.007G002700.1 7 179795 184789 6156 RNA BINDING PROTEIN // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR11654//PTHR11654:SF146 - OLIGOPEPTIDE BM183 Phvul.007G002800 Phvul.007G002800.1 7 188187 191636 14548 TRANSPORTER-RELATED // SUBFAMILY NOT NAMED

BM183 Phvul.007G002900 Phvul.007G002900.1 K09287 - RAV-like factor (RAV) 7 194753 195715 21114 BM183 Phvul.007G003000 Phvul.007G003000.1 PTHR16140:SF0 - PROTEIN H21P03.2 7 197000 199446 23361

PTHR24298:SF160 - CYTOCHROME P450, FAMILY 76, BM183 Phvul.007G003100 Phvul.007G003100.1 7 199528 201468 25889 SUBFAMILY G, POLYPEPTIDE 1

BM183 Phvul.007G003200 Phvul.007G003200.1 K07018 - uncharacterized protein (K07018) 7 204983 206935 31344

143

PTHR33432:SF3 - EMSY N TERMINUS AND PLANT TUDOR- BM183 Phvul.007G003300 Phvul.007G003300.2 7 206288 211586 32649 LIKE DOMAIN-CONTAINING PROTEIN

BM183 Phvul.007G003400 Phvul.007G003400.1 KOG2542 - Uncharacterized conserved protein (YdiU family) 7 213286 218016 39647

K13199 - plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein BM183 Phvul.007G003500 Phvul.007G003500.1 7 219422 223034 45783 (SERBP1)

BM183 Phvul.007G003600 Phvul.007G003600.1 PTHR22952:SF206 - TRANSCRIPTION FACTOR TGA2 7 227319 234734 53680

BM183 Phvul.007G003700 Phvul.007G003700.1 PTHR24064:SF113 - INOSITOL TRANSPORTER 1 7 235558 239687 61919

BM183 Phvul.007G003800 Phvul.007G003800.2 PF07939 - Protein of unknown function (DUF1685) (DUF1685) 7 258923 261022 85284

PTHR10231:SF25 - UDP-SUGAR TRANSPORTER PROTEIN BM183 Phvul.007G003900 Phvul.007G003900.4 7 263557 269436 89918 SLC35A4-RELATED

K13130 - survival of motor neuron protein-interacting protein 1 BM183 Phvul.007G004100 Phvul.007G004100.1 7 280052 283195 106413 (SIP1, GEMIN2)

PTHR27001:SF115 - PTI1-LIKE TYROSINE-PROTEIN BM183 Phvul.007G004200 Phvul.007G004200.3 7 284764 289247 111125 KINASE 1-RELATED

BM183 Phvul.007G004300 Phvul.007G004300.1 K02734 - 20S proteasome subunit beta 4 (PSMB2) 7 292760 294276 119121

PTHR21433 - TRANSMEMBRANE PROTEIN INDUCED BY BM183 Phvul.007G004400 Phvul.007G004400.1 7 297284 303562 123645 TUMOR NECROSIS FACTOR ALPHA

144

PTHR10277//PTHR10277:SF42 - HOMOCITRATE BM183 Phvul.007G004600 Phvul.007G004600.2 7 306333 324656 132694 SYNTHASE-RELATED // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR12687:SF4 - NUCLEOLAR COMPLEX PROTEIN 2 BM183 Phvul.007G004700 Phvul.007G004700.1 7 325938 331700 152299 HOMOLOG

BM183 Phvul.007G004900 Phvul.007G004900.1 PTHR12741:SF12 - CALLOSE SYNTHASE 9 7 350102 385155 176463

BM183 Phvul.007G005100 Phvul.007G005100.1 K11000 - callose synthase [EC:2.4.1.-] Glc b1-3 Glc (CALS) 7 387730 404378 214091

BM183 Phvul.007G005400 Phvul.007G005400.1 PF04755 - PAP_fibrillin (PAP_fibrillin) 7 414240 417740 240601 PTHR22957:SF269 - RABGAP/TBC DOMAIN-CONTAINING BM183 Phvul.007G005500 Phvul.007G005500.1 7 418304 427185 244665 PROTEIN

2.7.8.5 - CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3- BM183 Phvul.007G005600 Phvul.007G005600.1 7 431285 434376 257646 phosphatidyltransferase / Phosphatidylglycerophosphate synthase

PTHR13832:SF358 - PROTEIN PHOSPHATASE 2C 38- BM183 Phvul.007G005700 Phvul.007G005700.2 7 437612 440433 263973 RELATED

BM183 Phvul.007G005800 Phvul.007G005800.1 K16546 - FGFR1 oncogene partner (FGFR10P) 7 443336 445733 269697

BM183 Phvul.007G005900 Phvul.007G005900.2 3.3.2.6 - Leukotriene-A(4) hydrolase / LTA-4 hydrolase 7 446774 450636 273135

BM183 Phvul.007G006000 Phvul.007G006000.1 PTHR13711:SF213 - PROTEIN HMG-20 7 450945 455264 277306 PTHR13711:SF202 - HIGH MOBILITY GROUP B PROTEIN BM183 Phvul.007G006100 Phvul.007G006100.1 7 459081 460486 285442 10-RELATED

BM183 Phvul.007G006200 Phvul.007G006200.1 PTHR15852:SF22 - PROTEIN SSU-2, ISOFORM B 7 462361 465223 288722

145

BM183 Phvul.007G006301 Phvul.007G006301.1 PTHR24006:SF435 - F-BOX/LRR-REPEAT PROTEIN 4 7 465040 467264 291401

6.3.4.3 - Formate--tetrahydrofolate ligase / Tetrahydrofolic BM183 Phvul.007G006400 Phvul.007G006400.1 7 469795 474509 296156 formylase

BM183 Phvul.007G006500 Phvul.007G006500.1 (M=64) PF14416 - PMR5 N terminal Domain (PMR5N) 7 476896 480180 303257

2.2.1.1//2.2.1.2 - Transketolase / Glycoaldehyde transferase // BM183 Phvul.007G006600 Phvul.007G006600.1 7 481606 486094 307967 Transaldolase / Glycerone transferase

BM183 Phvul.007G006700 Phvul.007G006700.1 K02257 - protoheme IX farnesyltransferase (COX10) 7 487412 492449 313773

BM183 Phvul.007G007100 Phvul.007G007100.1 PTHR23088:SF27 - NITRILASE HOMOLOG 1 7 512875 516186 339236

PTHR18937//PTHR18937:SF221 - STRUCTURAL BM183 Phvul.007G007200 Phvul.007G007200.2 MAINTENANCE OF CHROMOSOMES SMC FAMILY 7 517041 520669 343402 MEMBER // SUBFAMILY NOT NAMED

BM183 Phvul.007G007300 Phvul.007G007300.1 K14399 - polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase (CLP1, HERB) 7 525738 529830 352099

BM183 Phvul.007G007400 Phvul.007G007400.1 K18624 - macrophage erythroblast attacher (MAEA, EMP) 7 538867 543155 365228

K19199 - histone-lysine N-methyltransferase SETD3 BM183 Phvul.007G007800 Phvul.007G007800.1 7 556992 563486 383353 [EC:2.1.1.43] (SETD3)

PTHR11178:SF1 - NFU1 IRON-SULFUR CLUSTER BM183 Phvul.007G008000 Phvul.007G008000.1 7 574037 577744 400398 SCAFFOLD HOMOLOG, MITOCHONDRIAL

146

PTHR12436:SF4 - LEUKOCYTE RECEPTOR CLUSTER BM183 Phvul.007G008100 Phvul.007G008100.2 7 581082 591150 407443 MEMBER 8

PTHR19241:SF180 - ABC TRANSPORTER G FAMILY BM183 Phvul.007G008200 Phvul.007G008200.1 7 592430 594703 418791 MEMBER 1-RELATED

K12843 - U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP3 (PRPF3, BM183 Phvul.007G008300 Phvul.007G008300.1 7 601126 604961 427487 PRP3) BM183 Phvul.007G008400 Phvul.007G008400.1 1.11.1.7 - Peroxidase / Lactoperoxidase 7 607208 609910 433569 BM183 Phvul.007G008500 Phvul.007G008500.1 K01859 - chalcone isomerase (E5.5.1.6) 7 612607 614403 438968 BM183 Phvul.007G008600 Phvul.007G008600.1 K01859 - chalcone isomerase (E5.5.1.6) 7 616509 618799 442870

PTHR33312:SF2 - MEMBRANE-ASSOCIATED KINASE BM183 Phvul.007G008800 Phvul.007G008800.1 7 637987 639284 464348 REGULATOR 3-RELATED

KOG0502//KOG0508//KOG0512//KOG4412 - Integral membrane ankyrin-repeat protein Kidins220 (protein kinase D substrate) // BM183 Phvul.007G008900 Phvul.007G008900.2 Ankyrin repeat protein // Fetal globin-inducing factor (contains 7 643030 647444 469391 ankyrin repeats) // 26S proteasome regulatory complex, subunit PSMD10

PTHR13832:SF311 - PROTEIN PHOSPHATASE 2C 11- BM183 Phvul.007G009000 Phvul.007G009000.1 7 649915 654480 476276 RELATED

PTHR31561:SF24 - 3-KETOACYL-COA SYNTHASE 12- BM183 Phvul.007G009100 Phvul.007G009100.1 7 657680 659317 484041 RELATED

PTHR31561:SF24 - 3-KETOACYL-COA SYNTHASE 12- BM183 Phvul.007G009200 Phvul.007G009200.1 7 661883 663334 488244 RELATED

K11713 - geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta BARC-PV-0003450 Phvul.008G012800 Phvul.008G012800.1 8 1055008 1060276 489561 [EC:2.5.1.59] (PGTB1)

147

PTHR19375:SF232 - MEDIATOR OF RNA POLYMERASE II BARC-PV-0003450 Phvul.008G013000 Phvul.008G013000.1 8 1067635 1070630 476934 TRANSCRIPTION SUBUNIT 37E-RELATED

BARC-PV-0003450 Phvul.008G013100 Phvul.008G013100.1 PTHR31096:SF4 - ACT DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 8 1079744 1083901 464825

PTHR11941//PTHR11941:SF84 - ENOYL-COA HYDRATASE- BARC-PV-0003450 Phvul.008G013200 Phvul.008G013200.1 8 1084327 1085244 460242 RELATED // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR10795:SF387 - SUBTILISIN-LIKE SERINE PROTEASE- BARC-PV-0003450 Phvul.008G013300 Phvul.008G013300.1 8 1090400 1093853 454169 RELATED

BARC-PV-0003450 Phvul.008G013400 Phvul.008G013400.1 PTHR18896:SF65 - PHOSPHOLIPASE D BETA 1-RELATED 8 1096710 1104972 447859

BARC-PV-0003450 Phvul.008G013600 Phvul.008G013600.1 PTHR19965:SF33 - THO COMPLEX SUBUNIT 4D 8 1128102 1130707 416467

BARC-PV-0003450 Phvul.008G013732 Phvul.008G013732.1 PF10650 - Putative zinc-finger domain (zf-C3H1) 8 1139806 1144926 404763

BARC-PV-0003450 Phvul.008G013800 Phvul.008G013800.1 K10880 - DNA-repair protein XRCC3 (XRCC3) 8 1147470 1148324 397099

(M=29) PF01535//PF12854//PF13041 - PPR repeat (PPR) // PPR BARC-PV-0003450 Phvul.008G013900 Phvul.008G013900.1 8 1148549 1151194 396020 repeat (PPR_1) // PPR repeat family (PPR_2)

PTHR24326:SF275 - WUSCHEL-RELATED HOMEOBOX 10- BARC-PV-0003450 Phvul.008G014000 Phvul.008G014000.2 8 1149383 1155907 395186 RELATED

(M=79) PF01535//PF13041//PF14432 - PPR repeat (PPR) // PPR BARC-PV-0003450 Phvul.008G014200 Phvul.008G014200.3 repeat family (PPR_2) // DYW family of nucleic acid deaminases 8 1156556 1161160 388013 (DYW_deaminase)

148

BARC-PV-0003450 Phvul.008G014300 Phvul.008G014300.1 K07901 - Ras-related protein Rab-8A (RAB8A, MEL) 8 1166904 1171323 377665

1.2.4.2 - Oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring) / BARC-PV-0003450 Phvul.008G014400 Phvul.008G014400.1 8 1173793 1180769 370776 Oxoglutarate dehydrogenase (lipoamide)

BARC-PV-0003450 Phvul.008G014500 Phvul.008G014500.2 PF16135 - TPL-binding domain in jasmonate signalling (Jas) 8 1181812 1187781 362757

BARC-PV-0003450 Phvul.008G014600 Phvul.008G014600.1 (M=42) PF13912 - C2H2-type zinc finger (zf-C2H2_6) 8 1194584 1195216 349985

PTHR23155:SF402 - DISEASE RESISTANCE PROTEIN BARC-PV-0003450 Phvul.008G014700 Phvul.008G014700.1 8 1206027 1209066 338542 RPP13-RELATED BARC-PV-0003450 Phvul.008G014800 Phvul.008G014800.1 (M=135) PF00646 - F-box domain (F-box) 8 1215210 1217379 329359 BARC-PV-0003450 Phvul.008G014900 Phvul.008G014900.1 PTHR19139:SF151 - AQUAPORIN TIP1-3 8 1221172 1223225 323397 PTHR24222:SF21 - ABC TRANSPORTER B FAMILY BARC-PV-0003450 Phvul.008G015000 Phvul.008G015000.1 8 1226038 1235647 318531 MEMBER 20-RELATED

BARC-PV-0003450 Phvul.008G015100 Phvul.008G015100.1 PTHR31407:SF4 - PSBP-LIKE PROTEIN 1, CHLOROPLASTIC 8 1238503 1240945 306066

K02893 - large subunit ribosomal protein L23Ae (RP-L23Ae, BARC-PV-0003450 Phvul.008G015200 Phvul.008G015200.1 8 1243920 1245570 300649 RPL23A)

PTHR10159:SF339 - PROTEIN-TYROSINE-PHOSPHATASE BARC-PV-0003450 Phvul.008G015300 Phvul.008G015300.1 8 1247378 1252381 297191 MKP1

3.2.1.52 - Beta-N-acetylhexosaminidase / N-acetyl-beta- BARC-PV-0003450 Phvul.008G015400 Phvul.008G015400.1 8 1263928 1271986 280641 glucosaminidase

BARC-PV-0003450 Phvul.008G015500 Phvul.008G015500.1 PTHR11562:SF33 - METAL TOLERANCE PROTEIN 11 8 1278190 1282357 266379

BARC-PV-0003450 Phvul.008G015600 Phvul.008G015600.1 K18059 - sulfate transporter 4 (SULTR4) 8 1285389 1293670 259180

149

BARC-PV-0003450 Phvul.008G015700 Phvul.008G015700.1 KOG1085 - Predicted methyltransferase (contains a SET domain) 8 1294505 1296926 250064

PTHR11732//PTHR11732:SF220 - ALDO/KETO REDUCTASE BARC-PV-0003450 Phvul.008G015800 Phvul.008G015800.1 8 1299787 1301970 244782 // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR31871:SF10 - GENOMIC DNA, CHROMOSOME 3, TAC BARC-PV-0003450 Phvul.008G015900 Phvul.008G015900.1 8 1306625 1308335 237944 CLONE:K5K13

PTHR21726:SF49 - PHOSPHATIDYLINOSITOL N- BARC-PV-0003450 Phvul.008G016000 Phvul.008G016000.1 ACETYGLUCOSAMINLYTRANSFERASE SUBUNIT P-LIKE 8 1313459 1318021 231110 PROTEIN

BARC-PV-0003450 Phvul.008G016100 Phvul.008G016100.1 K11087 - small nuclear ribonucleoprotein D1 (SNRPD1, SMD1) 8 1322012 1324508 222557

BARC-PV-0003450 Phvul.008G016200 Phvul.008G016200.1 3.6.1.25//3.6.1.3 - Adenosinetriphosphatase / Triphosphatase 8 1324940 1325694 219629

BARC-PV-0003450 Phvul.008G016400 Phvul.008G016400.1 PTHR10168:SF62 - GLUTAREDOXIN-C7-RELATED 8 1331043 1331444 213526

PF00612//PF02179 - IQ calmodulin-binding motif (IQ) // BAG BARC-PV-0003450 Phvul.008G016500 Phvul.008G016500.1 8 1347505 1348737 197064 domain (BAG)

PF00612//PF02179 - IQ calmodulin-binding motif (IQ) // BAG BARC-PV-0003450 Phvul.008G016600 Phvul.008G016600.1 8 1349472 1350745 195097 domain (BAG)

PTHR21240 - 2-AMINO-3-CARBOXYLMUCONATE-6- BARC-PV-0003450 Phvul.008G016700 Phvul.008G016700.2 8 1351786 1356282 192783 SEMIALDEHYDE DECARBOXYLASE

2.7.7.59 - [Protein-PII] uridylyltransferase / Uridylyl removing BARC-PV-0003450 Phvul.008G016800 Phvul.008G016800.1 8 1357987 1360998 186582 enzyme

150

PTHR23429:SF3 - GLUCOSE-6-PHOSPHATE 1- BARC-PV-0003450 Phvul.008G016900 Phvul.008G016900.1 8 1372056 1376747 172513 DEHYDROGENASE 2, CHLOROPLASTIC-RELATED

4.1.2.27 - Sphinganine-1-phosphate aldolase / Sphingosine-1- BARC-PV-0003450 Phvul.008G017200 Phvul.008G017200.1 8 1395042 1401360 149527 phosphate lyase

BARC-PV-0003450 Phvul.008G017300 Phvul.008G017300.1 K03247 - translation initiation factor 3 subunit H (EIF3H) 8 1408655 1413017 135914

(M=43) PF00069//PF00560//PF08263//PF13855 - Protein kinase domain (Pkinase) // Leucine Rich Repeat (LRR_1) // Leucine rich BARC-PV-0003450 Phvul.008G017400 Phvul.008G017400.1 8 1413654 1417468 130915 repeat N-terminal domain (LRRNT_2) // Leucine rich repeat (LRR_8)

PTHR22847//PTHR22847:SF453 - WD40 REPEAT PROTEIN // BARC-PV-0003450 Phvul.008G017500 Phvul.008G017500.1 8 1426655 1431910 117914 SUBFAMILY NOT NAMED

BARC-PV-0003450 Phvul.008G017600 Phvul.008G017600.1 K15363 - fanconi-associated nuclease 1 (FAN1, MTMR15) 8 1434404 1442525 110165

BARC-PV-0003450 Phvul.008G017700 Phvul.008G017700.1 PF07889 - Protein of unknown function (DUF1664) (DUF1664) 8 1444099 1450591 100470

PTHR11732//PTHR11732:SF226 - ALDO/KETO REDUCTASE BARC-PV-0003450 Phvul.008G017800 Phvul.008G017800.1 8 1454172 1458779 90397 // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR11062:SF64 - EXOSTOSIN FAMILY PROTEIN- BARC-PV-0003450 Phvul.008G017900 Phvul.008G017900.1 8 1459659 1461236 84910 RELATED

PTHR23177:SF23 - CRIB DOMAIN-CONTAINING PROTEIN BARC-PV-0003450 Phvul.008G018000 Phvul.008G018000.1 8 1465183 1466976 79386 RIC4

151

BARC-PV-0003450 Phvul.008G018100 Phvul.008G018100.1 PTHR22595:SF42 - CHITINASE-LIKE PROTEIN 1 8 1469522 1473069 75047

PTHR13832:SF286 - PROTEIN PHOSPHATASE 2C 33- BARC-PV-0003450 Phvul.008G018200 Phvul.008G018200.1 8 1479125 1484192 65444 RELATED

PTHR13683:SF288 - ASPARTYL PROTEASE FAMILY BARC-PV-0003450 Phvul.008G018300 Phvul.008G018300.1 8 1485268 1496348 59301 PROTEIN-RELATED

PTHR10997//PTHR10997:SF35 - IMPORTIN-7, 8, 11 // BARC-PV-0003450 Phvul.008G018400 Phvul.008G018400.1 8 1499222 1514872 45347 SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR13793:SF100 - HISTONE-LYSINE N- BARC-PV-0003450 Phvul.008G018500 Phvul.008G018500.1 8 1524258 1536772 20311 METHYLTRANSFERASE ATX1-RELATED BARC-PV-0003450 Phvul.008G018600 Phvul.008G018600.1 PTHR10627 - SCP160 8 1539682 1540017 4887

BARC-PV-0003450 Phvul.008G018700 Phvul.008G018700.2 PTHR21495:SF51 - DIRIGENT PROTEIN 24-RELATED 8 1542262 1545363 2307

BARC-PV-0003450 Phvul.008G018800 Phvul.008G018800.1 PTHR10825:SF23 - RING FINGER PROTEIN 8 1559444 1568450 14875

BARC-PV-0003450 Phvul.008G018900 Phvul.008G018900.1 PTHR10627 - SCP160 8 1571654 1572846 27085

PTHR23081:SF2 - RNA POLYMERASE II C-TERMINAL BARC-PV-0003450 Phvul.008G019000 Phvul.008G019000.1 8 1577839 1584350 33270 DOMAIN PHOSPHATASE-LIKE 3

PTHR11802:SF82 - SERINE CARBOXYPEPTIDASE-LIKE 45- BARC-PV-0003450 Phvul.008G019100 Phvul.008G019100.1 8 1591632 1595139 47063 RELATED

(M=51) 2.7.10.1//2.7.11.1 - Receptor protein-tyrosine kinase / BARC-PV-0003450 Phvul.008G019200 Phvul.008G019200.1 Receptor protein tyrosine kinase // Non-specific serine/threonine 8 1596934 1599857 52365 protein kinase / Threonine-specific protein kinase

152

K12489 - Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain- BARC-PV-0003450 Phvul.008G019300 Phvul.008G019300.1 8 1601585 1611052 57016 containing protein (ACAP)

BARC-PV-0003450 Phvul.008G019400 Phvul.008G019400.1 PTHR21654:SF10 - GT-2-RELATED PROTEIN 8 1614718 1618764 70149

KOG4660 - Protein Mei2, essential for commitment to meiosis, BARC-PV-0003450 Phvul.008G019500 Phvul.008G019500.1 8 1626867 1635158 82298 and related proteins BARC-PV-0003450 Phvul.008G019600 Phvul.008G019600.1 (M=180) PF00847 - AP2 domain (AP2) 8 1642756 1647509 98187

PTHR23091//PTHR23091:SF261 - N-TERMINAL BARC-PV-0003450 Phvul.008G019700 Phvul.008G019700.1 8 1651102 1654150 106533 ACETYLTRANSFERASE // SUBFAMILY NOT NAMED

BARC-PV-0003450 Phvul.008G019800 Phvul.008G019800.1 K02908 - large subunit ribosomal protein L30e (RP-L30e, RPL30) 8 1656536 1658177 111967

K03020 - DNA-directed RNA polymerases I and III subunit BARC-PV-0003450 Phvul.008G020000 Phvul.008G020000.1 8 1661885 1664243 117316 RPAC2 (RPC19, POLR1D) BARC-PV-0003450 Phvul.008G020200 Phvul.008G020200.1 K10525 - allene oxide cyclase (AOC) 8 1679258 1681287 134689 BARC-PV-0003450 Phvul.008G020301 Phvul.008G020301.1 PTHR33102:SF6 - DVL1-RELATED 8 1688528 1689180 143959

BARC-PV-0003450 Phvul.008G020400 Phvul.008G020400.1 PTHR31072:SF18 - TRANSCRIPTION FACTOR TCP1 8 1702820 1704885 158251

K03680 - translation initiation factor eIF-2B subunit delta BARC-PV-0003450 Phvul.008G020500 Phvul.008G020500.1 8 1715225 1721101 170656 (EIF2B4)

BARC-PV-0003450 Phvul.008G020600 Phvul.008G020600.1 PTHR31908:SF3 - PROTEIN LITTLE NUCLEI1 8 1727505 1734392 182936

PTHR23155//PTHR23155:SF497 - LEUCINE-RICH REPEAT- BARC-PV-0003450 Phvul.008G020700 Phvul.008G020700.1 8 1735768 1747788 191199 CONTAINING PROTEIN // SUBFAMILY NOT NAMED

153

PTHR23155//PTHR23155:SF497 - LEUCINE-RICH REPEAT- BARC-PV-0003450 Phvul.008G020750 Phvul.008G020750.1 8 1743459 1745204 198890 CONTAINING PROTEIN // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR11654//PTHR11654:SF146 - OLIGOPEPTIDE BARC-PV-0003450 Phvul.008G020800 Phvul.008G020800.1 8 1751096 1753598 206527 TRANSPORTER-RELATED // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR23155//PTHR23155:SF497 - LEUCINE-RICH REPEAT- BARC-PV-0003450 Phvul.008G020850 Phvul.008G020850.1 8 1755309 1755635 210740 CONTAINING PROTEIN // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR23155//PTHR23155:SF497 - LEUCINE-RICH REPEAT- BARC-PV-0003450 Phvul.008G020900 Phvul.008G020900.2 8 1755656 1757267 211087 CONTAINING PROTEIN // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR27001:SF132 - PROLINE-RICH RECEPTOR-LIKE BARC-PV-0003450 Phvul.008G021001 Phvul.008G021001.1 8 1759069 1764686 214500 PROTEIN KINASE PERK8

BARC-PV-0003450 Phvul.008G021100 Phvul.008G021100.1 (M=64) PF14416 - PMR5 N terminal Domain (PMR5N) 8 1769720 1771906 225151

BARC-PV-0003450 Phvul.008G021200 Phvul.008G021200.1 (M=64) PF14416 - PMR5 N terminal Domain (PMR5N) 8 1777460 1782534 232891

BARC-PV-0003450 Phvul.008G021500 Phvul.008G021500.2 K03350 - anaphase-promoting complex subunit 3 (APC3, CDC27) 8 1804913 1814875 260344

5.4.2.12 - Phosphoglycerate mutase (2,3-diphosphoglycerate- BARC-PV-0003450 Phvul.008G021600 Phvul.008G021600.1 8 1816790 1821446 272221 independent) / Phosphoglyceromutase

K03025 - DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6 BARC-PV-0003450 Phvul.008G021700 Phvul.008G021700.1 8 1822247 1824819 277678 (RPC6, POLR3F)

154

PTHR34191:SF2 - STRESS-INDUCED PROTEIN KIN1- BARC-PV-0003450 Phvul.008G021800 Phvul.008G021800.1 8 1825994 1826797 281425 RELATED

PTHR14083 - YIP1 INTERACTING FACTOR HOMOLOG BARC-PV-0003450 Phvul.008G021900 Phvul.008G021900.1 8 1828675 1831950 284106 YIF1 PROTEIN BARC-PV-0003450 Phvul.008G022000 Phvul.008G022000.1 K00318 - proline dehydrogenase (PRODH) 8 1835499 1838504 290930 4.1.1.50 - Adenosylmethionine decarboxylase / S-adenosyl-L- BARC-PV-0003450 Phvul.008G022100 Phvul.008G022100.1 8 1843295 1845851 298726 methionine decarboxylase

PTHR35727:SF1 - CONSERVED PEPTIDE UPSTREAM OPEN BARC-PV-0003450 Phvul.008G022200 Phvul.008G022200.1 8 1844179 1844412 299610 READING FRAME 10-RELATED

PTHR34191:SF2 - STRESS-INDUCED PROTEIN KIN1- BARC-PV-0003450 Phvul.008G022300 Phvul.008G022300.1 8 1847041 1848202 302472 RELATED

PTHR34191:SF2 - STRESS-INDUCED PROTEIN KIN1- BARC-PV-0003450 Phvul.008G022400 Phvul.008G022400.1 8 1851015 1852080 306446 RELATED BARC-PV-0003450 Phvul.008G022500 Phvul.008G022500.1 (M=31) PF08659 - KR domain (KR) 8 1852539 1853747 307970 BARC-PV-0003450 Phvul.008G022600 Phvul.008G022600.1 (M=425) PF01535 - PPR repeat (PPR) 8 1854380 1856627 309811

BARC-PV-0003450 Phvul.008G022700 Phvul.008G022700.1 PTHR27001:SF217 - PROTEIN NSP-INTERACTING KINASE 1 8 1868922 1873520 324353

PTHR31319:SF10 - ZINC FINGER PROTEIN CONSTANS- BARC-PV-0003450 Phvul.008G022800 Phvul.008G022800.1 8 1883852 1886538 339283 RELATED

BARC-PV-0003450 Phvul.008G022900 Phvul.008G022900.1 PTHR13634 - RIBOSOME BIOGENESIS PROTEIN BRIX 8 1887864 1890109 343295

PTHR31319:SF10 - ZINC FINGER PROTEIN CONSTANS- BARC-PV-0003450 Phvul.008G022925 Phvul.008G022925.1 8 1896308 1897677 351739 RELATED

BARC-PV-0003450 Phvul.008G022950 Phvul.008G022950.1 K14820 - ribosome biogenesis protein BRX1 (BRX1, BRIX1) 8 1901214 1905135 356645

155

K11130 - H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3 (NOP10, BARC-PV-0003450 Phvul.008G022975 Phvul.008G022975.1 8 1907535 1911538 362966 NOLA3)

BARC-PV-0003450 Phvul.008G023000 Phvul.008G023000.1 K14820 - ribosome biogenesis protein BRX1 (BRX1, BRIX1) 8 1915107 1917523 370538

PF06876 - Plant self-incompatibility response (SCRL) protein BARC-PV-0003450 Phvul.008G023100 Phvul.008G023100.1 8 1926485 1926986 381916 (SCRL)

BARC-PV-0003450 Phvul.008G023200 Phvul.008G023200.1 PTHR34450:SF1 - DEFENSIN-LIKE PROTEIN 226-RELATED 8 1929549 1930171 384980

BARC-PV-0003450 Phvul.008G023300 Phvul.008G023300.1 PTHR34450:SF1 - DEFENSIN-LIKE PROTEIN 226-RELATED 8 1933941 1934453 389372

BARC-PV-0003450 Phvul.008G023400 Phvul.008G023400.1 PTHR33228:SF3 - PROTEIN GLUTAMINE DUMPER 7 8 1944141 1945058 399572

BARC-PV-0003450 Phvul.008G023700 Phvul.008G023700.1 K00033 - 6-phosphogluconate dehydrogenase (PGD, gnd, gntZ) 8 1954462 1957229 409893

BARC-PV-0003450 Phvul.008G023800 Phvul.008G023800.1 PTHR22952:SF201 - BASIC LEUCINE-ZIPPER 42-RELATED 8 1960551 1961414 415982

(M=79) PF01535//PF13041//PF14432 - PPR repeat (PPR) // PPR BARC-PV-0003450 Phvul.008G023900 Phvul.008G023900.1 repeat family (PPR_2) // DYW family of nucleic acid deaminases 8 1974646 1978175 430077 (DYW_deaminase)

PTHR35705:SF1 - WPP DOMAIN-INTERACTING TAIL- BARC-PV-0003450 Phvul.008G024000 Phvul.008G024000.1 8 1978629 1983581 434060 ANCHORED PROTEIN 1

K14207 - solute carrier family 38 (sodium-coupled neutral amino BARC-PV-0003450 Phvul.008G024100 Phvul.008G024100.1 8 1992355 1995948 447786 acid transporter), member 2 (SLC38A2, SNAT2)

156

BARC-PV-0003450 Phvul.008G024200 Phvul.008G024200.1 (M=36) PF03140 - Plant protein of unknown function (DUF247) 8 1996339 1998018 451770

(M=197) PF01535//PF13041 - PPR repeat (PPR) // PPR repeat BARC-PV-0003450 Phvul.008G024300 Phvul.008G024300.1 8 1999723 2003178 455154 family (PPR_2)

(M=197) PF01535//PF13041 - PPR repeat (PPR) // PPR repeat BARC-PV-0003450 Phvul.008G024400 Phvul.008G024400.1 8 2004322 2008280 459753 family (PPR_2) BARC-PV-0003450 Phvul.008G024500 Phvul.008G024500.1 PTHR23308:SF2 - KANADAPTIN 8 2009363 2017455 464794

PTHR10102//PTHR10102:SF3 - DNA-DIRECTED RNA BARC-PV-0003450 Phvul.008G024600 Phvul.008G024600.1 POLYMERASE, MITOCHONDRIAL // SUBFAMILY NOT 8 2018354 2030767 473785 NAMED

PTHR33184:SF11 - BETA-1,3-N- BARC-PV-0003450 Phvul.008G024700 Phvul.008G024700.1 ACETYLGLUCOSAMINYLTRANSFERASE FAMILY 8 2033100 2034300 488531 PROTEIN

BARC-PV-0003450 Phvul.008G024800 Phvul.008G024800.1 KOG1552 - Predicted alpha/beta hydrolase 8 2034736 2038491 490167 BARC-PV-0004385 Phvul.008G110200 Phvul.008G110200.1 PTHR33103:SF4 - EMB 8 12483495 12491473 486569 BARC-PV-0004385 Phvul.008G110400 Phvul.008G110400.1 PTHR33103:SF4 - EMB 8 12504335 12505926 465729 BARC-PV-0004385 Phvul.008G110500 Phvul.008G110500.1 PTHR33103:SF4 - EMB 8 12527353 12528978 442711 BARC-PV-0004385 Phvul.008G110600 Phvul.008G110600.1 PTHR33103:SF4 - EMB 8 12538618 12540288 431446 BARC-PV-0004385 Phvul.008G110700 Phvul.008G110700.3 PTHR33103:SF4 - EMB 8 12550618 12556175 419446 BARC-PV-0004385 Phvul.008G110800 Phvul.008G110800.1 PTHR33103:SF4 - EMB 8 12556102 12557187 413962 BARC-PV-0004385 Phvul.008G110900 Phvul.008G110900.1 PTHR33103:SF4 - EMB 8 12561354 12561830 408710 BARC-PV-0004385 Phvul.008G111000 Phvul.008G111000.1 PF15011 - Casein Kinase 2 substrate (CK2S) 8 12582551 12588816 387513

BARC-PV-0004385 Phvul.008G111100 Phvul.008G111100.1 PTHR14155:SF135 - RING-H2 FINGER PROTEIN ATL63 8 12599137 12601627 370927

BARC-PV-0004385 Phvul.008G111200 Phvul.008G111200.1 PTHR13620 - 3-5 EXONUCLEASE 8 12624223 12625446 345841 BARC-PV-0004385 Phvul.008G111300 Phvul.008G111300.1 PTHR33103:SF4 - EMB 8 12640328 12643772 329736

157

PTHR15852:SF20 - CHAPERONE PROTEIN DNAJ-LIKE BARC-PV-0004385 Phvul.008G111400 Phvul.008G111400.1 8 12647136 12651869 322928 PROTEIN BARC-PV-0004385 Phvul.008G111500 Phvul.008G111500.1 PF00139 - Legume lectin domain (Lectin_legB) 8 12658909 12659979 311155 BARC-PV-0004385 Phvul.008G111600 Phvul.008G111600.1 PF00560 - Leucine Rich Repeat (LRR_1) 8 12695718 12699577 274346 BARC-PV-0004385 Phvul.008G111700 Phvul.008G111700.1 3.2.1.15 - Polygalacturonase / Pectinase 8 12704332 12705929 265732 (M=35) PF00560//PF13855 - Leucine Rich Repeat (LRR_1) // BARC-PV-0004385 Phvul.008G111800 Phvul.008G111800.1 8 12731112 12735272 238952 Leucine rich repeat (LRR_8)

PTHR11556:SF16 - FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATASE, BARC-PV-0004385 Phvul.008G112000 Phvul.008G112000.1 8 12767412 12770776 202652 CHLOROPLASTIC BARC-PV-0004385 Phvul.008G112100 Phvul.008G112100.1 PTHR11709:SF9 - LACCASE-7-RELATED 8 12786964 12790245 183100 BARC-PV-0004385 Phvul.008G112200 Phvul.008G112200.1 PTHR11709:SF9 - LACCASE-7-RELATED 8 12847993 12852719 122071

BARC-PV-0004385 Phvul.008G112300 Phvul.008G112300.1 PTHR11764:SF18 - AMYRIN SYNTHASE LUP2-RELATED 8 12875376 12875721 94688

PTHR23012:SF87 - RING/FYVE/PHD ZINC FINGER- BARC-PV-0004385 Phvul.008G112400 Phvul.008G112400.1 8 12920518 12923637 49546 CONTAINING PROTEIN

PTHR21290//PTHR21290:SF29 - SPHINGOMYELIN BARC-PV-0004385 Phvul.008G112500 Phvul.008G112500.1 8 12948344 12953482 21720 SYNTHETASE // SUBFAMILY NOT NAMED

BARC-PV-0004385 Phvul.008G112600 Phvul.008G112600.1 PF12043 - Domain of unknown function (DUF3527) (DUF3527) 8 12990686 12995560 20622

BARC-PV-0004385 Phvul.008G112700 Phvul.008G112700.1 KOG3591 - Alpha crystallins 8 13049063 13049849 78999

BARC-PV-0004385 Phvul.008G112800 Phvul.008G112800.1 PTHR12483:SF24 - COPPER TRANSPORTER 1-RELATED 8 13085771 13086733 115707

PTHR33122:SF4 - BIFUNCTIONAL INHIBITOR/LIPID- BARC-PV-0004385 Phvul.008G112900 Phvul.008G112900.1 TRANSFER PROTEIN/SEED STORAGE 2S ALBUMIN-LIKE 8 13096130 13097071 126066 PROTEIN

158

PTHR13068:SF28 - MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION BARC-PV-0004385 Phvul.008G113000 Phvul.008G113000.1 8 13109194 13110659 139130 TERMINATION FACTOR FAMILY PROTEIN-RELATED

PTHR33107:SF5 - KUNITZ FAMILY TRYPSIN AND BARC-PV-0004385 Phvul.008G113100 Phvul.008G113100.1 8 13120876 13121651 150812 PROTEASE INHIBITOR PROTEIN-RELATED

PTHR12483//PTHR12483:SF41 - SOLUTE CARRIER FAMILY BARC-PV-0004385 Phvul.008G113200 Phvul.008G113200.1 8 13126235 13126940 156171 31 COPPER TRANSPORTERS // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR10641:SF526 - TRANSCRIPTION FACTOR MYB113- BARC-PV-0004385 Phvul.008G113300 Phvul.008G113300.1 8 13141867 13143831 171803 RELATED

BARC-PV-0004385 Phvul.008G113500 Phvul.008G113500.1 (M=40) PF00582 - Universal stress protein family (Usp) 8 13219256 13220618 249192

PTHR11260//PTHR11260:SF314 - GLUTATHIONE S- BARC-PV-0004385 Phvul.008G113600 Phvul.008G113600.1 TRANSFERASE, GST, SUPERFAMILY, GST DOMAIN 8 13221659 13223083 251595 CONTAINING // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR11260//PTHR11260:SF314 - GLUTATHIONE S- BARC-PV-0004385 Phvul.008G113700 Phvul.008G113700.1 TRANSFERASE, GST, SUPERFAMILY, GST DOMAIN 8 13237819 13238946 267755 CONTAINING // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR33101:SF1 - ROP GUANINE NUCLEOTIDE BARC-PV-0004385 Phvul.008G113800 Phvul.008G113800.1 8 13249956 13254120 279892 EXCHANGE FACTOR 7

159

BARC-PV-0004385 Phvul.008G113900 Phvul.008G113900.1 (M=66) PF14368 - Probable lipid transfer (LTP_2) 8 13258029 13259010 287965

PTHR11654:SF79 - PROTEIN NRT1/ PTR FAMILY 5.5- BARC-PV-0004385 Phvul.008G114200 Phvul.008G114200.1 8 13354718 13361738 384654 RELATED

PTHR11850:SF82 - BEL1-LIKE HOMEODOMAIN PROTEIN BARC-PV-0004385 Phvul.008G114300 Phvul.008G114300.1 8 13367166 13373327 397102 8-RELATED

K14684 - solute carrier family 25 (mitochondrial phosphate BARC-PV-0004385 Phvul.008G114400 Phvul.008G114400.1 8 13404744 13411703 434680 transporter), member 23/24/25/41 (SLC25A23S)

PTHR13068:SF28 - MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION BARC-PV-0006098 Phvul.008G113000 Phvul.008G113000.1 8 13109194 13110659 496720 TERMINATION FACTOR FAMILY PROTEIN-RELATED

PTHR33107:SF5 - KUNITZ FAMILY TRYPSIN AND BARC-PV-0006098 Phvul.008G113100 Phvul.008G113100.1 8 13120876 13121651 485038 PROTEASE INHIBITOR PROTEIN-RELATED

PTHR12483//PTHR12483:SF41 - SOLUTE CARRIER FAMILY BARC-PV-0006098 Phvul.008G113200 Phvul.008G113200.1 8 13126235 13126940 479679 31 COPPER TRANSPORTERS // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR10641:SF526 - TRANSCRIPTION FACTOR MYB113- BARC-PV-0006098 Phvul.008G113300 Phvul.008G113300.1 8 13141867 13143831 464047 RELATED

BARC-PV-0006098 Phvul.008G113500 Phvul.008G113500.1 (M=40) PF00582 - Universal stress protein family (Usp) 8 13219256 13220618 386658

160

PTHR11260//PTHR11260:SF314 - GLUTATHIONE S- BARC-PV-0006098 Phvul.008G113600 Phvul.008G113600.1 TRANSFERASE, GST, SUPERFAMILY, GST DOMAIN 8 13221659 13223083 384255 CONTAINING // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR11260//PTHR11260:SF314 - GLUTATHIONE S- BARC-PV-0006098 Phvul.008G113700 Phvul.008G113700.1 TRANSFERASE, GST, SUPERFAMILY, GST DOMAIN 8 13237819 13238946 368095 CONTAINING // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR33101:SF1 - ROP GUANINE NUCLEOTIDE BARC-PV-0006098 Phvul.008G113800 Phvul.008G113800.1 8 13249956 13254120 355958 EXCHANGE FACTOR 7

BARC-PV-0006098 Phvul.008G113900 Phvul.008G113900.1 (M=66) PF14368 - Probable lipid transfer (LTP_2) 8 13258029 13259010 347885

PTHR11654:SF79 - PROTEIN NRT1/ PTR FAMILY 5.5- BARC-PV-0006098 Phvul.008G114200 Phvul.008G114200.1 8 13354718 13361738 251196 RELATED

PTHR11850:SF82 - BEL1-LIKE HOMEODOMAIN PROTEIN BARC-PV-0006098 Phvul.008G114300 Phvul.008G114300.1 8 13367166 13373327 238748 8-RELATED

K14684 - solute carrier family 25 (mitochondrial phosphate BARC-PV-0006098 Phvul.008G114400 Phvul.008G114400.1 8 13404744 13411703 201170 transporter), member 23/24/25/41 (SLC25A23S)

BARC-PV-0006098 Phvul.008G114500 Phvul.008G114500.1 PF04759 - Protein of unknown function, DUF617 (DUF617) 8 13489196 13490306 116718

BARC-PV-0006098 Phvul.008G114600 Phvul.008G114600.1 PF11891 - Domain of unknown function (DUF3411) (DUF3411) 8 13497731 13502184 108183

BARC-PV-0006098 Phvul.008G114700 Phvul.008G114700.1 PTHR12859 - PRA1 PROTEIN 8 13510463 13515743 95451 BARC-PV-0006098 Phvul.008G114800 Phvul.008G114800.2 PTHR33103:SF4 - EMB 8 13570598 13573978 35316

161

BARC-PV-0006098 Phvul.008G114900 Phvul.008G114900.1 PTHR33103:SF4 - EMB 8 13574862 13576577 31052 BARC-PV-0006098 Phvul.008G115000 Phvul.008G115000.1 PTHR33103:SF4 - EMB 8 13591815 13593454 14099

1.2.1.41//2.7.2.11 - Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase / BARC-PV-0006098 Phvul.008G115100 Phvul.008G115100.1 Glutamyl-gamma-semialdehyde dehydrogenase // Glutamate 5- 8 13619711 13628240 13797 kinase / Gamma-glutamyl kinase

PTHR10826//PTHR10826:SF12 - COMPLEMENT BARC-PV-0006098 Phvul.008G115200 Phvul.008G115200.1 8 13633052 13636049 27138 COMPONENT 1 // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR24096:SF134 - LONG CHAIN ACYL-COA BARC-PV-0006098 Phvul.008G115400 Phvul.008G115400.1 8 13658310 13660096 52396 SYNTHETASE 2

PTHR27005:SF11 - WALL-ASSOCIATED RECEPTOR BARC-PV-0006098 Phvul.008G115500 Phvul.008G115500.1 8 13661070 13663788 55156 KINASE-LIKE 15-RELATED BARC-PV-0006098 Phvul.008G115600 Phvul.008G115600.1 PTHR34670:SF3 - EXPRESSED PROTEIN 8 13711214 13711992 105300

PTHR13902//PTHR13902:SF5 - SERINE/THREONINE- BARC-PV-0006098 Phvul.008G115700 Phvul.008G115700.1 PROTEIN KINASE WNK WITH NO LYSINE -RELATED // 8 13777513 13783413 171599 SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR22870//PTHR22870:SF202 - REGULATOR OF BARC-PV-0006098 Phvul.008G115800 Phvul.008G115800.1 CHROMOSOME CONDENSATION // SUBFAMILY NOT 8 13794316 13808308 188402 NAMED

BARC-PV-0006098 Phvul.008G115900 Phvul.008G115900.1 K08081 - Tropinone reductase 1 (TR1) 8 13824002 13826946 218088

1.1.1.206//1.1.1.236 - Tropinone reductase I / Tropinone reductase BARC-PV-0006098 Phvul.008G116000 Phvul.008G116000.1 8 13872188 13874086 266274 // Tropinone reductase II / Tropinone reductase

BARC-PV-0006098 Phvul.008G116100 Phvul.008G116100.1 K08081 - Tropinone reductase 1 (TR1) 8 13887624 13891737 281710

162

BARC-PV-0006098 Phvul.008G116200 Phvul.008G116200.2 K08081 - Tropinone reductase 1 (TR1) 8 13907377 13915796 301463 BARC-PV-0006098 Phvul.008G116300 Phvul.008G116300.1 K08081 - Tropinone reductase 1 (TR1) 8 13936505 13938168 330591 BARC-PV-0006098 Phvul.008G116400 Phvul.008G116400.1 K08081 - Tropinone reductase 1 (TR1) 8 13963642 13964304 357728 BARC-PV-0006098 Phvul.008G116500 Phvul.008G116500.1 K08081 - Tropinone reductase 1 (TR1) 8 13976426 13980291 370512

BARC-PV-0006098 Phvul.008G116600 Phvul.008G116600.1 1.1.1.206 - Tropinone reductase I / Tropinone reductase 8 13987225 13993670 381311

BARC-PV-0006098 Phvul.008G116801 Phvul.008G116801.1 K08081 - Tropinone reductase 1 (TR1) 8 14022315 14035975 416401

BARC-PV-0006098 Phvul.008G117000 Phvul.008G117000.2 1.1.1.206 - Tropinone reductase I / Tropinone reductase 8 14077148 14093355 471234

(M=81) PF14111 - Domain of unknown function (DUF4283) BARC-PV-0006098 Phvul.008G116900 Phvul.008G116900.1 8 14077611 14078377 471697 (DUF4283)

BARC-PV-0004651 Phvul.008G100800 Phvul.008G100800.1 PTHR24326:SF115 - WUSCHEL-RELATED HOMEOBOX 3 8 15908285 15909390 216587

PTHR11972:SF54 - RESPIRATORY BURST OXIDASE BARC-PV-0004651 Phvul.008G100700 Phvul.008G100700.2 8 15913839 15918300 211033 HOMOLOG PROTEIN H-RELATED

PTHR11709//PTHR11709:SF70 - MULTI-COPPER OXIDASE // BARC-PV-0004651 Phvul.008G100500 Phvul.008G100500.2 8 15942185 15944857 182687 SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR11709//PTHR11709:SF70 - MULTI-COPPER OXIDASE // BARC-PV-0004651 Phvul.008G106475 Phvul.008G106475.1 8 15971589 15973879 153283 SUBFAMILY NOT NAMED

BARC-PV-0004651 Phvul.008G100400 Phvul.008G100400.1 PTHR11709:SF66 - LACCASE-17 8 16001509 16004021 123363

BARC-PV-0004651 Phvul.008G100300 Phvul.008G100300.2 PF06232 - Embryo-specific protein 3, (ATS3) (ATS3) 8 16006536 16008281 118336

BARC-PV-0004651 Phvul.008G100200 Phvul.008G100200.1 PTHR33142:SF6 - EXPRESSED PROTEIN 8 16040114 16040632 84758

163

BARC-PV-0004651 Phvul.008G100100 Phvul.008G100100.1 PTHR14221:SF7 - WD-40 REPEAT PROTEIN-RELATED 8 16065927 16069881 58945

PTHR24128:SF14 - E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE BARC-PV-0004651 Phvul.008G099700 Phvul.008G099700.1 8 16099732 16103739 25140 XBAT31-RELATED

PTHR23315:SF69 - U-BOX DOMAIN-CONTAINING BARC-PV-0004651 Phvul.008G105675 Phvul.008G105675.1 8 16161181 16176479 36309 PROTEIN 12-RELATED

BARC-PV-0004651 Phvul.008G099400 Phvul.008G099400.1 (M=41) PF02701 - Dof domain, zinc finger (zf-Dof) 8 16248222 16249847 123350

PTHR14155:SF180 - RING/U-BOX DOMAIN-CONTAINING BARC-PV-0004651 Phvul.008G099300 Phvul.008G099300.1 8 16271031 16271907 146159 PROTEIN-RELATED

BARC-PV-0004651 Phvul.008G099200 Phvul.008G099200.1 K03969 - phage shock protein A (pspA) 8 16293285 16300509 168413

PTHR32212:SF112 - FBD / LEUCINE RICH REPEAT BARC-PV-0004651 Phvul.008G124400 Phvul.008G124400.1 8 16608575 16610205 483703 DOMAINS CONTAINING PROTEIN-RELATED

BM211 Phvul.008G100800 Phvul.008G100800.1 PTHR24326:SF115 - WUSCHEL-RELATED HOMEOBOX 3 8 15908285 15909390 295482

PTHR11972:SF54 - RESPIRATORY BURST OXIDASE BM211 Phvul.008G100700 Phvul.008G100700.2 8 15913839 15918300 289928 HOMOLOG PROTEIN H-RELATED

PTHR11709//PTHR11709:SF70 - MULTI-COPPER OXIDASE // BM211 Phvul.008G100500 Phvul.008G100500.2 8 15942185 15944857 261582 SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR11709//PTHR11709:SF70 - MULTI-COPPER OXIDASE // BM211 Phvul.008G106475 Phvul.008G106475.1 8 15971589 15973879 232178 SUBFAMILY NOT NAMED

BM211 Phvul.008G100400 Phvul.008G100400.1 PTHR11709:SF66 - LACCASE-17 8 16001509 16004021 202258

164

BM211 Phvul.008G100300 Phvul.008G100300.2 PF06232 - Embryo-specific protein 3, (ATS3) (ATS3) 8 16006536 16008281 197231

BM211 Phvul.008G100200 Phvul.008G100200.1 PTHR33142:SF6 - EXPRESSED PROTEIN 8 16040114 16040632 163653

BM211 Phvul.008G100100 Phvul.008G100100.1 PTHR14221:SF7 - WD-40 REPEAT PROTEIN-RELATED 8 16065927 16069881 137840

PTHR24128:SF14 - E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE BM211 Phvul.008G099700 Phvul.008G099700.1 8 16099732 16103739 104035 XBAT31-RELATED

PTHR23315:SF69 - U-BOX DOMAIN-CONTAINING BM211 Phvul.008G105675 Phvul.008G105675.1 8 16161181 16176479 42586 PROTEIN 12-RELATED

BM211 Phvul.008G099400 Phvul.008G099400.1 (M=41) PF02701 - Dof domain, zinc finger (zf-Dof) 8 16248222 16249847 44455

PTHR14155:SF180 - RING/U-BOX DOMAIN-CONTAINING BM211 Phvul.008G099300 Phvul.008G099300.1 8 16271031 16271907 67264 PROTEIN-RELATED

BM211 Phvul.008G099200 Phvul.008G099200.1 K03969 - phage shock protein A (pspA) 8 16293285 16300509 89518

PTHR32212:SF112 - FBD / LEUCINE RICH REPEAT BM211 Phvul.008G124400 Phvul.008G124400.1 8 16608575 16610205 404808 DOMAINS CONTAINING PROTEIN-RELATED

PF00069//PF00954//PF01453//PF08276 - Protein kinase domain BM211 Phvul.008G124300 Phvul.008G124300.1 (Pkinase) // S-locus glycoprotein domain (S_locus_glycop) // D- 8 16672270 16675230 468503 mannose binding lectin (B_lectin) // PAN-like domain (PAN_2)

K10807 - ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M1 BARC-PV-0004115 Phvul.009G115100 Phvul.009G115100.1 9 17766012 17770864 497696 (RRM1)

165

K13691 - pathogen-inducible salicylic acid glucosyltransferase BARC-PV-0004115 Phvul.009G115200 Phvul.009G115200.1 9 17778751 17781100 484957 [EC:2.4.1.-] Glc b1-2 SA (SGT1)

PTHR10625//PTHR10625:SF127 - HISTONE DEACETYLASE BARC-PV-0004115 Phvul.009G115300 Phvul.009G115300.1 9 17788877 17800273 474831 // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR23500:SF96 - MONOSACCHARIDE-SENSING PROTEIN BARC-PV-0004115 Phvul.009G115500 Phvul.009G115500.1 9 17803621 17809366 460087 2

2.4.1.101 - Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N- BARC-PV-0004115 Phvul.009G115600 Phvul.009G115600.2 acetylglucosaminyltransferase / 1,2-N- 9 17816902 17840770 446806 acetylglucosaminyltransferase

PTHR32116:SF3 - GALACTURONOSYLTRANSFERASE 3- BARC-PV-0004115 Phvul.009G115700 Phvul.009G115700.1 9 17842035 17845570 421673 RELATED

BARC-PV-0004115 Phvul.009G115800 Phvul.009G115800.1 PTHR32002:SF3 - PROTEIN NLP1-RELATED 9 17846862 17850344 416846

BARC-PV-0004115 Phvul.009G115900 Phvul.009G115900.1 PTHR10177:SF250 - CYCLIN-B2-3-RELATED 9 17893851 17896737 369857

PTHR10183//PTHR10183:SF323 - CALPAIN // SUBFAMILY BARC-PV-0004115 Phvul.009G116000 Phvul.009G116000.1 9 17900898 17904975 362810 NOT NAMED

PTHR23423//PTHR23423:SF23 - ORGANIC SOLUTE BARC-PV-0004115 Phvul.009G116100 Phvul.009G116100.1 9 17905008 17910191 358700 TRANSPORTER-RELATED // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR14194//PTHR14194:SF81 - NITROGEN METABOLIC BARC-PV-0004115 Phvul.009G116200 Phvul.009G116200.1 REGULATION PROTEIN NMR-RELATED // SUBFAMILY 9 17913699 17918320 350009 NOT NAMED

166

BARC-PV-0004115 Phvul.009G116300 Phvul.009G116300.1 PTHR22595:SF34 - BASIC ENDOCHITINASE B 9 17922084 17922905 341624

BARC-PV-0004115 Phvul.009G116500 Phvul.009G116500.2 PTHR22595:SF34 - BASIC ENDOCHITINASE B 9 17939587 17940715 324121

BARC-PV-0004115 Phvul.009G116600 Phvul.009G116600.1 PTHR22595:SF34 - BASIC ENDOCHITINASE B 9 17970100 17971179 293608

BARC-PV-0004115 Phvul.009G116700 Phvul.009G116700.1 PTHR22595:SF34 - BASIC ENDOCHITINASE B 9 18008357 18009527 255351

BARC-PV-0004115 Phvul.009G116900 Phvul.009G116900.1 K01872 - alanyl-tRNA synthetase (AARS, alaS) 9 18025630 18031726 238078

PTHR21680:SF0 - COILED-COIL DOMAIN-CONTAINING BARC-PV-0004115 Phvul.009G117000 Phvul.009G117000.1 9 18034149 18036525 229559 PROTEIN 124

PTHR10615//PTHR10615:SF117 - HISTONE BARC-PV-0004115 Phvul.009G117100 Phvul.009G117100.5 9 18038144 18045736 225564 ACETYLTRANSFERASE // SUBFAMILY NOT NAMED

PF04539//PF04545 - Sigma-70 region 3 (Sigma70_r3) // Sigma- BARC-PV-0004115 Phvul.009G117301 Phvul.009G117301.1 9 18055340 18060107 208368 70, region 4 (Sigma70_r4)

BARC-PV-0004115 Phvul.009G117500 Phvul.009G117500.1 PTHR22812 - CHROMOBOX PROTEIN 9 18066025 18072588 197683

BARC-PV-0004115 Phvul.009G117600 Phvul.009G117600.1 K14168 - cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1 (CTU1, NCS6) 9 18082340 18083826 181368

PTHR11229:SF5 - 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3-1, BARC-PV-0004115 Phvul.009G117700 Phvul.009G117700.1 9 18084463 18085947 179245 CHLOROPLASTIC

K00963 - UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase (UGP2, BARC-PV-0004115 Phvul.009G117800 Phvul.009G117800.1 9 18093006 18102032 170702 galU, galF) BARC-PV-0004115 Phvul.009G117900 Phvul.009G117900.1 PTHR31942:SF13 - MLO-LIKE PROTEIN 15 9 18102865 18108436 160843

167

PTHR11669//PTHR11669:SF13 - REPLICATION FACTOR C / BARC-PV-0004115 Phvul.009G118000 Phvul.009G118000.1 DNA POLYMERASE III GAMMA-TAU SUBUNIT // 9 18109569 18114318 154139 SUBFAMILY NOT NAMED

BARC-PV-0004115 Phvul.009G118100 Phvul.009G118100.1 K10753 - histone chaperone ASF1 (ASF1) 9 18115648 18117704 148060 PTHR24031:SF181 - DEAD-BOX ATP-DEPENDENT RNA BARC-PV-0004115 Phvul.009G118200 Phvul.009G118200.1 9 18126555 18131287 137153 HELICASE 50

BARC-PV-0004115 Phvul.009G118400 Phvul.009G118400.1 PTHR31742:SF1 - RPA-INTERACTING PROTEIN 9 18145646 18148222 118062

5.4.3.8 - Glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase / BARC-PV-0004115 Phvul.009G118500 Phvul.009G118500.1 9 18149072 18151326 114636 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase

PF00320//PF06203 - GATA zinc finger (GATA) // CCT motif BARC-PV-0004115 Phvul.009G118600 Phvul.009G118600.1 9 18151706 18153038 112002 (CCT) BARC-PV-0004115 Phvul.009G118700 Phvul.009G118700.1 K18460 - exportin-7 (XPO7, EXP7) 9 18154156 18186586 109552

BARC-PV-0004115 Phvul.009G118800 Phvul.009G118800.1 PTHR21704:SF19 - EXPRESSED PROTEIN-RELATED 9 18191509 18193754 72199

BARC-PV-0004115 Phvul.009G118900 Phvul.009G118900.1 PTHR19139:SF152 - AQUAPORIN PIP2-7 9 18195199 18196718 68509 K10532 - heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase BARC-PV-0004115 Phvul.009G119000 Phvul.009G119000.1 9 18204426 18209327 59282 (HGSNAT)

BARC-PV-0004115 Phvul.009G119100 Phvul.009G119100.1 PTHR33876:SF1 - EXPRESSED PROTEIN-RELATED 9 18216209 18218305 47499

PTHR10044//PTHR10044:SF112 - INHIBITOR OF APOPTOSIS BARC-PV-0004115 Phvul.009G119200 Phvul.009G119200.1 9 18221469 18222789 42239 // SUBFAMILY NOT NAMED

168

PTHR22814:SF155 - HEAVY METAL-ASSOCIATED BARC-PV-0004115 Phvul.009G119300 Phvul.009G119300.1 9 18245179 18246232 18529 ISOPRENYLATED PLANT PROTEIN 26

BARC-PV-0004115 Phvul.009G119400 Phvul.009G119400.1 PTHR23421:SF52 - BETA-GALACTOSIDASE 11-RELATED 9 18248056 18252334 15652

BARC-PV-0004115 Phvul.009G119500 Phvul.009G119500.2 K10736 - minichromosome maintenance protein 10 (MCM10) 9 18266199 18269378 2491

BARC-PV-0004115 Phvul.009G119566 Phvul.009G119566.1 PTHR23421:SF52 - BETA-GALACTOSIDASE 11-RELATED 9 18270739 18274950 7031

BARC-PV-0004115 Phvul.009G119632 Phvul.009G119632.1 PTHR23421:SF52 - BETA-GALACTOSIDASE 11-RELATED 9 18282295 18286473 18587

BARC-PV-0004115 Phvul.009G119700 Phvul.009G119700.1 PTHR11254:SF73 - E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE TRIP12 9 18298545 18308897 34837

BARC-PV-0004115 Phvul.009G119800 Phvul.009G119800.1 PTHR10774:SF50 - SYNAPTOTAGMIN-1-RELATED 9 18311026 18316757 47318

PTHR10641//PTHR10641:SF30 - MYB-LIKE DNA-BINDING BARC-PV-0004115 Phvul.009G119900 Phvul.009G119900.1 9 18327850 18329164 64142 PROTEIN MYB // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR10795//PTHR10795:SF442 - PROPROTEIN BARC-PV-0004115 Phvul.009G120000 Phvul.009G120000.1 CONVERTASE SUBTILISIN/KEXIN // SUBFAMILY NOT 9 18360475 18363226 96767 NAMED

PTHR11913:SF16 - ACTIN-DEPOLYMERIZING FACTOR 5- BARC-PV-0004115 Phvul.009G120100 Phvul.009G120100.1 9 18367766 18368802 104058 RELATED

PTHR11071:SF203 - PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS BARC-PV-0004115 Phvul.009G120200 Phvul.009G120200.1 9 18371555 18378981 107847 ISOMERASE BARC-PV-0004115 Phvul.009G120300 Phvul.009G120300.1 PTHR31279:SF13 - PHI-1-LIKE PROTEIN 9 18379966 18381079 116258

169

PTHR21576:SF17 - MAJOR FACILITATOR FAMILY BARC-PV-0004115 Phvul.009G120400 Phvul.009G120400.1 9 18385144 18388632 121436 PROTEIN

PTHR31490:SF3 - GLYCOSYL HYDROLASE FAMILY 10 BARC-PV-0004115 Phvul.009G120500 Phvul.009G120500.1 9 18398676 18405429 134968 PROTEIN

2.4.1.218 - Hydroquinone glucosyltransferase / Hydroquinone:O- BARC-PV-0004115 Phvul.009G120600 Phvul.009G120600.1 9 18408418 18410170 144710 glucosyltransferase

PTHR22950//PTHR22950:SF242 - AMINO ACID BARC-PV-0004115 Phvul.009G120700 Phvul.009G120700.2 9 18440456 18447087 176748 TRANSPORTER // SUBFAMILY NOT NAMED

BARC-PV-0004115 Phvul.009G120800 Phvul.009G120800.1 PF07800 - Protein of unknown function (DUF1644) (DUF1644) 9 18456337 18462405 192629

BARC-PV-0004115 Phvul.009G121000 Phvul.009G121000.1 1.7.1.1 - Nitrate reductase (NADH) / Nitrate reductase (NADH(2)) 9 18504833 18508892 241125

BARC-PV-0004115 Phvul.009G121100 Phvul.009G121100.1 K02952 - small subunit ribosomal protein S13 (RP-S13, rpsM) 9 18514098 18515188 250390

PTHR23086:SF33 - PHOSPHATIDYLINOSITOL 4- BARC-PV-0004115 Phvul.009G121200 Phvul.009G121200.1 9 18542337 18546686 278629 PHOSPHATE 5-KINASE 1-RELATED

PTHR10972:SF67 - OXYSTEROL-BINDING PROTEIN- BARC-PV-0004115 Phvul.009G121300 Phvul.009G121300.1 9 18564376 18570606 300668 RELATED PROTEIN 1D

6.3.4.11 - Biotin--[methylcrotonoyl-CoA-carboxylase] ligase / BARC-PV-0004115 Phvul.009G121400 Phvul.009G121400.2 9 18594528 18599733 330820 Biotin--[methylcrotonoyl-CoA-carboxylase] synthetase

PTHR12197:SF165 - HISTONE-LYSINE N- BARC-PV-0004115 Phvul.009G121500 Phvul.009G121500.1 9 18604139 18610730 340431 METHYLTRANSFERASE ASHR1

K08866 - serine/threonine-protein kinase TTK/MPS1 (TTK, BARC-PV-0004115 Phvul.009G121600 Phvul.009G121600.1 9 18611939 18615610 348231 MPS1)

170

(M=197) PF01535//PF13041 - PPR repeat (PPR) // PPR repeat BARC-PV-0004115 Phvul.009G121800 Phvul.009G121800.1 9 18631541 18635666 367833 family (PPR_2) BARC-PV-0004115 Phvul.009G121900 Phvul.009G121900.1 K12162 - ubiquitin-fold modifier 1 (UFM1) 9 18636622 18639841 372914 (M=47) PF12776 - Myb/SANT-like DNA-binding domain BARC-PV-0004115 Phvul.009G122000 Phvul.009G122000.1 9 18642100 18644551 378392 (Myb_DNA-bind_3)

BARC-PV-0004115 Phvul.009G122100 Phvul.009G122100.1 PTHR33163:SF3 - MEMBRANE PROTEIN YCF1-RELATED 9 18650604 18651028 386896

PTHR22950:SF3 - AUXIN TRANSPORTER-LIKE PROTEIN 2- BARC-PV-0004115 Phvul.009G122200 Phvul.009G122200.1 9 18659626 18662481 395918 RELATED

PTHR11544//PTHR11544:SF57 - COLD SHOCK DOMAIN BARC-PV-0004115 Phvul.009G122300 Phvul.009G122300.1 9 18686132 18687149 422424 CONTAINING PROTEINS // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR28259:SF1 - UPF0695 MEMBRANE PROTEIN BARC-PV-0004115 Phvul.009G122400 Phvul.009G122400.1 9 18692318 18695366 428610 YOR390W-RELATED

PF01535//PF13041//PF13812//PF14432 - PPR repeat (PPR) // PPR repeat family (PPR_2) // Pentatricopeptide repeat domain BARC-PV-0004115 Phvul.009G122500 Phvul.009G122500.1 9 18698176 18700500 434468 (PPR_3) // DYW family of nucleic acid deaminases (DYW_deaminase)

PF00069//PF01453 - Protein kinase domain (Pkinase) // D- BARC-PV-0004115 Phvul.009G122600 Phvul.009G122600.1 9 18701135 18703714 437427 mannose binding lectin (B_lectin)

BARC-PV-0004115 Phvul.009G122700 Phvul.009G122700.1 PTHR31636:SF25 - SCARECROW-LIKE PROTEIN 26 9 18715588 18717093 451880

PTHR11751//PTHR11751:SF317 - SUBGROUP I BARC-PV-0004115 Phvul.009G122800 Phvul.009G122800.1 AMINOTRANSFERASE RELATED // SUBFAMILY NOT 9 18745867 18749179 482159 NAMED

171

PTHR11751//PTHR11751:SF317 - SUBGROUP I BARC-PV-0004115 Phvul.009G122900 Phvul.009G122900.1 AMINOTRANSFERASE RELATED // SUBFAMILY NOT 9 18757255 18759758 493547 NAMED

BARC-PV-0004725 Phvul.009G119700 Phvul.009G119700.1 PTHR11254:SF73 - E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE TRIP12 9 18298545 18308897 492014

BARC-PV-0004725 Phvul.009G119800 Phvul.009G119800.1 PTHR10774:SF50 - SYNAPTOTAGMIN-1-RELATED 9 18311026 18316757 479533

PTHR10641//PTHR10641:SF30 - MYB-LIKE DNA-BINDING BARC-PV-0004725 Phvul.009G119900 Phvul.009G119900.1 9 18327850 18329164 462709 PROTEIN MYB // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR10795//PTHR10795:SF442 - PROPROTEIN BARC-PV-0004725 Phvul.009G120000 Phvul.009G120000.1 CONVERTASE SUBTILISIN/KEXIN // SUBFAMILY NOT 9 18360475 18363226 430084 NAMED

PTHR11913:SF16 - ACTIN-DEPOLYMERIZING FACTOR 5- BARC-PV-0004725 Phvul.009G120100 Phvul.009G120100.1 9 18367766 18368802 422793 RELATED

PTHR11071:SF203 - PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS BARC-PV-0004725 Phvul.009G120200 Phvul.009G120200.1 9 18371555 18378981 419004 ISOMERASE BARC-PV-0004725 Phvul.009G120300 Phvul.009G120300.1 PTHR31279:SF13 - PHI-1-LIKE PROTEIN 9 18379966 18381079 410593 PTHR21576:SF17 - MAJOR FACILITATOR FAMILY BARC-PV-0004725 Phvul.009G120400 Phvul.009G120400.1 9 18385144 18388632 405415 PROTEIN

PTHR31490:SF3 - GLYCOSYL HYDROLASE FAMILY 10 BARC-PV-0004725 Phvul.009G120500 Phvul.009G120500.1 9 18398676 18405429 391883 PROTEIN

2.4.1.218 - Hydroquinone glucosyltransferase / Hydroquinone:O- BARC-PV-0004725 Phvul.009G120600 Phvul.009G120600.1 9 18408418 18410170 382141 glucosyltransferase

172

PTHR22950//PTHR22950:SF242 - AMINO ACID BARC-PV-0004725 Phvul.009G120700 Phvul.009G120700.2 9 18440456 18447087 350103 TRANSPORTER // SUBFAMILY NOT NAMED

BARC-PV-0004725 Phvul.009G120800 Phvul.009G120800.1 PF07800 - Protein of unknown function (DUF1644) (DUF1644) 9 18456337 18462405 334222

BARC-PV-0004725 Phvul.009G121000 Phvul.009G121000.1 1.7.1.1 - Nitrate reductase (NADH) / Nitrate reductase (NADH(2)) 9 18504833 18508892 285726

BARC-PV-0004725 Phvul.009G121100 Phvul.009G121100.1 K02952 - small subunit ribosomal protein S13 (RP-S13, rpsM) 9 18514098 18515188 276461

PTHR23086:SF33 - PHOSPHATIDYLINOSITOL 4- BARC-PV-0004725 Phvul.009G121200 Phvul.009G121200.1 9 18542337 18546686 248222 PHOSPHATE 5-KINASE 1-RELATED

PTHR10972:SF67 - OXYSTEROL-BINDING PROTEIN- BARC-PV-0004725 Phvul.009G121300 Phvul.009G121300.1 9 18564376 18570606 226183 RELATED PROTEIN 1D

6.3.4.11 - Biotin--[methylcrotonoyl-CoA-carboxylase] ligase / BARC-PV-0004725 Phvul.009G121400 Phvul.009G121400.2 9 18594528 18599733 196031 Biotin--[methylcrotonoyl-CoA-carboxylase] synthetase

PTHR12197:SF165 - HISTONE-LYSINE N- BARC-PV-0004725 Phvul.009G121500 Phvul.009G121500.1 9 18604139 18610730 186420 METHYLTRANSFERASE ASHR1

K08866 - serine/threonine-protein kinase TTK/MPS1 (TTK, BARC-PV-0004725 Phvul.009G121600 Phvul.009G121600.1 9 18611939 18615610 178620 MPS1)

(M=197) PF01535//PF13041 - PPR repeat (PPR) // PPR repeat BARC-PV-0004725 Phvul.009G121800 Phvul.009G121800.1 9 18631541 18635666 159018 family (PPR_2) BARC-PV-0004725 Phvul.009G121900 Phvul.009G121900.1 K12162 - ubiquitin-fold modifier 1 (UFM1) 9 18636622 18639841 153937 (M=47) PF12776 - Myb/SANT-like DNA-binding domain BARC-PV-0004725 Phvul.009G122000 Phvul.009G122000.1 9 18642100 18644551 148459 (Myb_DNA-bind_3)

173

BARC-PV-0004725 Phvul.009G122100 Phvul.009G122100.1 PTHR33163:SF3 - MEMBRANE PROTEIN YCF1-RELATED 9 18650604 18651028 139955

PTHR22950:SF3 - AUXIN TRANSPORTER-LIKE PROTEIN 2- BARC-PV-0004725 Phvul.009G122200 Phvul.009G122200.1 9 18659626 18662481 130933 RELATED

PTHR11544//PTHR11544:SF57 - COLD SHOCK DOMAIN BARC-PV-0004725 Phvul.009G122300 Phvul.009G122300.1 9 18686132 18687149 104427 CONTAINING PROTEINS // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR28259:SF1 - UPF0695 MEMBRANE PROTEIN BARC-PV-0004725 Phvul.009G122400 Phvul.009G122400.1 9 18692318 18695366 98241 YOR390W-RELATED

PF01535//PF13041//PF13812//PF14432 - PPR repeat (PPR) // PPR repeat family (PPR_2) // Pentatricopeptide repeat domain BARC-PV-0004725 Phvul.009G122500 Phvul.009G122500.1 9 18698176 18700500 92383 (PPR_3) // DYW family of nucleic acid deaminases (DYW_deaminase)

PF00069//PF01453 - Protein kinase domain (Pkinase) // D- BARC-PV-0004725 Phvul.009G122600 Phvul.009G122600.1 9 18701135 18703714 89424 mannose binding lectin (B_lectin)

BARC-PV-0004725 Phvul.009G122700 Phvul.009G122700.1 PTHR31636:SF25 - SCARECROW-LIKE PROTEIN 26 9 18715588 18717093 74971

PTHR11751//PTHR11751:SF317 - SUBGROUP I BARC-PV-0004725 Phvul.009G122800 Phvul.009G122800.1 AMINOTRANSFERASE RELATED // SUBFAMILY NOT 9 18745867 18749179 44692 NAMED

PTHR11751//PTHR11751:SF317 - SUBGROUP I BARC-PV-0004725 Phvul.009G122900 Phvul.009G122900.1 AMINOTRANSFERASE RELATED // SUBFAMILY NOT 9 18757255 18759758 33304 NAMED

174

PTHR23084//PTHR23084:SF136 - BARC-PV-0004725 Phvul.009G123000 Phvul.009G123000.1 PHOSPHATIDYLINOSITOL-4-PHOSPHATE 5-KINASE 9 18763827 18766280 26732 RELATED // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR22763:SF39 - RING/U-BOX DOMAIN-CONTAINING BARC-PV-0004725 Phvul.009G123100 Phvul.009G123100.1 9 18789716 18792217 843 PROTEIN

PTHR31423:SF3 - PROLYL-TRNA SYNTHETASE BARC-PV-0004725 Phvul.009G123200 Phvul.009G123200.1 ASSOCIATED DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1- 9 18793078 18799793 2519 RELATED

PTHR31985:SF37 - ETHYLENE-RESPONSIVE BARC-PV-0004725 Phvul.009G123300 Phvul.009G123300.1 9 18807532 18808594 16973 TRANSCRIPTION FACTOR ERF014

PTHR22811//PTHR22811:SF68 - TRANSMEMBRANE EMP24 BARC-PV-0004725 Phvul.009G123400 Phvul.009G123400.1 DOMAIN-CONTAINING PROTEIN // SUBFAMILY NOT 9 18819459 18821586 28900 NAMED

PTHR33558:SF1 - GLUTAREDOXIN-LIKE PROTEIN BARC-PV-0004725 Phvul.009G123500 Phvul.009G123500.1 9 18823120 18830529 32561 C5ORF63

BARC-PV-0004725 Phvul.009G123600 Phvul.009G123600.2 (M=74) PF00892 - EamA-like transporter family (EamA) 9 18834186 18839664 43627

BARC-PV-0004725 Phvul.009G123700 Phvul.009G123700.1 (M=74) PF00892 - EamA-like transporter family (EamA) 9 18862391 18866019 71832

BARC-PV-0004725 Phvul.009G123900 Phvul.009G123900.1 (M=74) PF00892 - EamA-like transporter family (EamA) 9 18914905 18918223 124346

BARC-PV-0004725 Phvul.009G123950 Phvul.009G123950.1 (M=74) PF00892 - EamA-like transporter family (EamA) 9 18952741 18955680 162182

175

BARC-PV-0004725 Phvul.009G124000 Phvul.009G124000.1 (M=74) PF00892 - EamA-like transporter family (EamA) 9 18964486 18968574 173927

BARC-PV-0004725 Phvul.009G124100 Phvul.009G124100.1 (M=74) PF00892 - EamA-like transporter family (EamA) 9 18988717 18992504 198158

BARC-PV-0004725 Phvul.009G124200 Phvul.009G124200.1 PTHR15410:SF2 - HIRA-INTERACTING PROTEIN 3 9 19001342 19007371 210783

K03143 - transcription initiation factor TFIIH subunit 3 (TFIIH3, BARC-PV-0004725 Phvul.009G124300 Phvul.009G124300.1 9 19009151 19014946 218592 GTF2H3, TFB4)

PTHR23354:SF75 - LYSM DOMAIN-CONTAINING GPI- BARC-PV-0004725 Phvul.009G124400 Phvul.009G124400.1 9 19016290 19018795 225731 ANCHORED PROTEIN 1

PTHR12172:SF1 - P-LOOP CONTAINING NUCLEOSIDE BARC-PV-0004725 Phvul.009G124500 Phvul.009G124500.1 9 19027475 19037447 236916 TRIPHOSPHATE HYDROLASES SUPERFAMILY PROTEIN

PTHR31964:SF37 - ADENINE NUCLEOTIDE ALPHA BARC-PV-0004725 Phvul.009G124600 Phvul.009G124600.1 9 19045184 19047032 254625 HYDROLASE-LIKE PROTEIN

PTHR11132:SF127 - GDP-MANNOSE TRANSPORTER BARC-PV-0004725 Phvul.009G124700 Phvul.009G124700.1 9 19047169 19051784 256610 GONST5

6.2.1.3 - Long-chain-fatty-acid--CoA ligase / Lignoceroyl-CoA BARC-PV-0004725 Phvul.009G124800 Phvul.009G124800.1 9 19069409 19075269 278850 synthase BARC-PV-0004725 Phvul.009G125100 Phvul.009G125100.1 K03542 - photosystem II 22kDa protein (psbS) 9 19097977 19099652 307418 PTHR31580:SF2 - FILAMENT-LIKE PLANT PROTEIN 1- BARC-PV-0004725 Phvul.009G125200 Phvul.009G125200.1 9 19104833 19109297 314274 RELATED

BARC-PV-0004725 Phvul.009G125300 Phvul.009G125300.1 PTHR13439:SF4 - PROTEIN K12H6.6, ISOFORM B-RELATED 9 19109969 19112348 319410

176

K02984 - small subunit ribosomal protein S3Ae (RP-S3Ae, BARC-PV-0004725 Phvul.009G125400 Phvul.009G125400.1 9 19122312 19124018 331753 RPS3A) BARC-PV-0004725 Phvul.009G125600 Phvul.009G125600.1 PTHR35278:SF1 - F8K7.16 9 19130992 19132931 340433

PTHR14155//PTHR14155:SF112 - RING FINGER DOMAIN- BARC-PV-0004725 Phvul.009G125700 Phvul.009G125700.1 9 19133427 19134035 342868 CONTAINING // SUBFAMILY NOT NAMED

BARC-PV-0004725 Phvul.009G125800 Phvul.009G125800.1 PTHR31683:SF7 - PECTATE LYASE 19-RELATED 9 19134657 19135976 344098

BARC-PV-0004725 Phvul.009G125850 Phvul.009G125850.1 PTHR31683:SF7 - PECTATE LYASE 19-RELATED 9 19156582 19158322 366023

BARC-PV-0004725 Phvul.009G125900 Phvul.009G125900.1 PTHR31719:SF3 - GRAB1-LIKE PROTEIN 9 19183344 19185533 392785

BARC-PV-0004725 Phvul.009G126000 Phvul.009G126000.1 PTHR11669:SF9 - REPLICATION FACTOR C SUBUNIT 5 9 19192365 19198000 401806

BARC-PV-0004725 Phvul.009G126100 Phvul.009G126100.1 (M=466) PF13041 - PPR repeat family (PPR_2) 9 19201172 19203379 410613 PTHR13683:SF316 - ASPARTYL PROTEASE FAMILY BARC-PV-0004725 Phvul.009G126200 Phvul.009G126200.1 9 19210034 19212986 419475 PROTEIN-RELATED

BARC-PV-0004725 Phvul.009G126300 Phvul.009G126300.1 K09519 - DnaJ homolog subfamily B member 13 (DNAJB13) 9 19215521 19217324 424962

PTHR11699:SF171 - ALDEHYDE DEHYDROGENASE BARC-PV-0004725 Phvul.009G126400 Phvul.009G126400.1 9 19219677 19223964 429118 FAMILY 3 MEMBER I1, CHLOROPLASTIC

PTHR31356:SF1 - L-ASCORBATE PEROXIDASE S, BARC-PV-0004725 Phvul.009G126500 Phvul.009G126500.1 9 19233366 19240297 442807 CHLOROPLASTIC/MITOCHONDRIAL-RELATED

BARC-PV-0004725 Phvul.009G126600 Phvul.009G126600.1 PTHR21450:SF8 - F8K7.18 PROTEIN 9 19265555 19271834 474996

177

PTHR18929//PTHR18929:SF109 - PROTEIN DISULFIDE BARC-PV-0004725 Phvul.009G126700 Phvul.009G126700.1 9 19274908 19281799 484349 ISOMERASE // SUBFAMILY NOT NAMED

PTHR14352:SF2 - HAUS AUGMIN-LIKE COMPLEX BARC-PV-0004798 Phvul.010G078100 Phvul.010G078100.1 10 26752955 26762259 473916 SUBUNIT 7

(M=38) PF00076//PF14111 - RNA recognition motif. (a.k.a. BARC-PV-0004798 Phvul.010G066000 Phvul.010G066000.1 RRM, RBD, or RNP domain) (RRM_1) // Domain of unknown 10 26884761 26886600 342110 function (DUF4283) (DUF4283)

BARC-PV-0004798 Phvul.010G078000 Phvul.010G078000.1 4.1.1.1 - Pyruvate decarboxylase / Pyruvic decarboxylase 10 27054887 27059559 171984

PTHR10566//PTHR10566:SF85 - CHAPERONE-ACTIVITY OF BARC-PV-0004798 Phvul.010G077900 Phvul.010G077900.1 BC1 COMPLEX CABC1 -RELATED // SUBFAMILY NOT 10 27295270 27299951 68399 NAMED

PTHR28573:SF1 - SPINDLE AND KINETOCHORE- BARC-PV-0004798 Phvul.010G077700 Phvul.010G077700.1 10 27399799 27409280 172928 ASSOCIATED PROTEIN 1

BARC-PV-0004798 Phvul.010G065700 Phvul.010G065700.1 PF14237 - Domain of unknown function (DUF4339) (DUF4339) 10 27703549 27709144 476678

*Crom. – cromossomo; **Distância em pb entre gene e marcador.

178