Bộ Giáo Dục Và Đào Tạo Viện Hàn Lâm Khoa Học Và Công Nghệ Việt Nam Học Viện Khoa Học Và Công Ngh B

Total Page:16

File Type:pdf, Size:1020Kb

Bộ Giáo Dục Và Đào Tạo Viện Hàn Lâm Khoa Học Và Công Nghệ Việt Nam Học Viện Khoa Học Và Công Ngh B BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ ----------------------------- BẠCH NGỌC MINH NGHIÊN CỨU, THU NHẬN PROTEIN TỪ SINH KHỐI RONG NƯỚC LỢ (Chaetomorpha sp.) ĐỂ ỨNG DỤNG TRONG CÔNG NGHIỆP THỰC PHẨM LUẬN ÁN TIẾN SĨ CÔNG NGHỆ SINH HỌC Tp. Hồ Chí Minh - 2020 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ ----------------------------- Bạch Ngọc Minh NGHIÊN CỨU, THU NHẬN PROTEIN TỪ SINH KHỐI RONG NƯỚC LỢ (Chaetomorpha sp.) ĐỂ ỨNG DỤNG TRONG CÔNG NGHIỆP THỰC PHẨM Chuyên ngành: Công nghệ Sinh học Mã sỗ: 9 42 02 01 LUẬN ÁN TIẾN SĨ CÔNG NGHỆ SINH HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: 1. PGS.TS Hoàng Kim Anh 2. PGS.TSKH Ngô Kế Sương Tp. Hồ Chí Minh - 2020 i LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan đây là công trình nghiên cứu khoa học độc lập của riêng tôi dưới sự hướng dẫn khoa học của PGS.TS Hoàng Kim Anh và PGS.TSKH Ngô Kế Sương. Các số liệu sử dụng phân tích trong luận án có nguồn gốc rõ ràng, đã công bố theo đúng quy định. Các kết quả nghiên cứu trong luận án do tôi tự bố trí thí nghiệm, phân tích số liệu một cách trung thực, khách quan. Các kết quả này chưa từng được công bố trong bất kỳ nghiên cứu nào khác. Nghiên cứu sinh Bạch Ngọc Minh ii LỜI CẢM ƠN Để hoàn thành được luận án tiến sĩ này, tôi xin tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến PGS.TS Hoàng Kim Anh và PGS.TSKH Ngô Kế Sương đã tận tình hướng dẫn trong suốt quá trình nghiên cứu thực nghiệm và quá trình chỉnh sửa nội dung của luận án. Tôi chân thành cảm ơn Ban lãnh đạo và các đồng nghiệp tại Viện Sinh học Nhiệt đới đã tạo điều kiện thuận lợi để giúp tôi hoàn thành luận án này. Tôi đặc biệt cảm ơn PGS.TS Nguyễn Thị Phương Thảo và các bạn trong Phòng Quản lý Tổng hợp đã hỗ trợ tôi trong các thủ tục hành chính dể hoàn thành quá trinhg học tập và thực hiện luận án này. Tôi xin gửi lời cảm ơn đến Học viện Khoa học và Công nghệ đã hỗ trợ tôi về mặt hành chính và tạo điều kiện thuận lợi cho tôi trong quá trình học tập và thực hiện luận án tại Học viện. Tôi cũng xin cảm ơn các đồng nghiệp trong Phòng Công nghệ Biến đổi Sinh học, nơi tôi công tác, đã hộ trợ tôi hết mình trong công việc và tạo nhiều điều kiện thuận lợi để tôi có thời gian học tập và thực hiện luận án. Tôi chân thành gửi lời cảm ơn đến các đơn vị hợp tác: Đại học Khoa học Tự nhiên Tp.Hồ Chí Minh, Bệnh viện 115, Trung tâm phân tích Kỹ thuật cao Sài Gòn, Viện Công nghệ Nano, Trung tâm Sâm và Dược liệu đã hỗ trợ tôi trong quá trình thực hiện luận án. Cuối cùng, tôi xin gửi lời cảm ơn sâu sắc đến gia đình, đã luôn bên cạnh và là nguồn động viên to lớn cho tôi để hoàn thành quá trình học tập và nghiên cứu. Trân trọng Bạch Ngọc Minh iii MỤC LỤC Trang LỜI CAM ĐOAN .......................................................................................................... i LỜI CẢM ƠN ............................................................................................................... ii MỤC LỤC ................................................................................................................... iii DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU, CHỮ VIẾT TẮT ...................................................... vii DANH MỤC CÁC BẢNG ........................................................................................ viii DANH MỤC CÁC HÌNH VẼ, ĐỒ THỊ ....................................................................... x MỞ ĐẦU ...................................................................................................................... 1 CHƯƠNG 1. TỔNG QUAN ........................................................................................ 3 1.1. Tổng quan về rong ........................................................................................................... 3 1.1.1. Tổng quan về rong biển ..................................................................................................... 3 1.1.2. Rong lục .............................................................................................................................. 5 1.1.3. Rong Chaetomorpha ........................................................................................................... 7 1.2. Protein thu nhận từ rong .................................................................................................. 8 1.2.1. Đặc điểm protein thu nhận từ rong .................................................................................... 8 1.2.2. Thành phần acid amin trong rong .................................................................................... 10 1.2.3. Protein có hoạt tính sinh học ........................................................................................... 11 1.2.4. Khả năng tiêu hoá của protein ......................................................................................... 12 1.3. Kỹ thuật thu nhận protein .............................................................................................. 13 1.3.1. Kỹ thuật trích ly protein ................................................................................................... 13 1.3.2. Kỹ thuật tinh sạch protein ................................................................................................ 15 1.3.2.1. Phương pháp kết tủa ...................................................................................... 15 1.3.2.2. Phương pháp thẩm tích .................................................................................. 17 1.3.2.3. Phương pháp sắc kí ........................................................................................ 18 1.3.2.4. Phương pháp lọc membrane .......................................................................... 18 1.4. Phân tích tính chất của chế phẩm protein concentrate ................................................. 19 1.4.1. Tính chất sinh học của chế phẩm protein concentrate ................................................... 19 1.4.2. Tính chất chức năng của chế phẩm protein concentrate ................................................ 20 1.4.2.1. Khả năng hòa tan của protein ........................................................................ 21 iv 1.4.2.2. Khả năng hấp thu nước của protein ............................................................... 21 1.4.2.3. Khả năng tạo gel ............................................................................................ 21 1.4.2.4. Khả năng tạo bọt ............................................................................................ 22 1.4.2.5. Khả năng tạo và làm bền nhũ tương .............................................................. 22 1.4.3. Giá trị dinh dưỡng của chế phẩm protein concentrate ................................................... 23 1.4.3.1. Tiêu hóa protein và hấp thu protein ............................................................... 23 1.4.3.2. Đánh giá giá trị dinh dưỡng của protein trong điều kiện in vitro .................. 24 1.4.2.3. Đánh giá giá trị dinh dưỡng của protein trong điều kiện in vivo .................. 24 CHƯƠNG 2. VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP ........................................................ 27 2.1. Vật liệu nghiên cứu ........................................................................................................ 27 2.1.1. Đối tượng nghiên cứu ...................................................................................................... 27 2.1.2. Dụng cụ, thiết bị, hoá chất ............................................................................................... 27 2.2. Sơ đồ nghiên cứu ........................................................................................................... 28 2.3. Phương pháp bố trí thí nghiệm ...................................................................................... 30 2.3.1. Xác định các nhóm protein trong rong ............................................................................ 30 2.3.2. Khảo sát ảnh hưởng của quá trình xử lý nguyên liệu đến hiệu suất trích ly protein .... 31 2.3.3. Khảo sát ảnh hưởng của các yếu tố đến quá trình trích ly protein tan trong nước có sự hỗ trợ của enzyme cellulase ....................................................................................................... 31 2.3.4. Tối ưu hóa quá trình trích ly protein tan trong kiềm có sự hỗ trợ của enzyme ............ 33 2.3.5. Khảo sát ảnh hưởng của các yếu tố đến quá trình trích ly nhóm protein tan trong kiềm bằng dung môi NaOH ................................................................................................................. 34 2.3.6. Tối ưu hóa quá trình trích ly nhóm protein tan trong kiềm bằng dung môi NaOH ...... 34 2.3.7. Nghiên cứu quá trình tinh sạch protein ........................................................................... 35 2.3.7.1. Khảo sát quá trình kết tủa đẳng điện ............................................................. 35 2.3.7.2. Khảo sát quá trình kết tủa protein bằng ethanol ............................................ 35 2.3.7.3. Khảo sát quá trình kết tủa protein bằng muối (NH4)2SO4 ............................. 36 2.3.7.4. Nâng cao hàm lượng protein bằng phương pháp thẩm tích .......................... 36 2.3.8. Nghiên cứu các đặc điểm hình thái và cấu trúc của chế phẩm protein từ rong ............ 36 2.3.9. Xác định tính chất sinh học của các chế phẩm protein concentrate .............................. 37 2.3.9.1. Thử nghiệm hoạt tính kháng khuẩn ............................................................... 37 2.3.9.2. Thử nghiệm khả năng kháng oxy hoá ........................................................... 37 v 2.3.10. Xác định tính chất
Recommended publications
  • An Analysis of the Community Composition of the Xiphophora Gladiata Dominated Subzone of the Tasmanian Sublittoral Fringe
    Papers and Proceedings ol the Royal Society of Tasmania, Volume 123, 1989 191 AN ANALYSIS OF THE COMMUNITY COMPOSITION OF THE XIPHOPHORA GLADIATA DOMINATED SUBZONE OF THE TASMANIAN SUBLITTORAL FRINGE by E. L. Rice (with five tables and nine text-figures) RICE, E.L., 1989 (31:x): An analysis of the community composition of the Xiphophora iladiata dominated subzone of the Tasmanian sublittoral fringe. Pap. Proc. R. Soc. Tasm. 123: I 91-209. https://doi.org/10.26749/rstpp.123.191 ISSN 0080-4703. Biological Sciences Branch, Department of Fisheries and Oceans, Halifax Research Laboratory, PO Box 550, Halifax, Nova Scotia B3J 2S7, Canada; formerly Department of Botany, University of Tasmania The rocky shore sublittoral fringe of the oceanic coasts of Tasmania contains a subzone dominated by the large brown alga Xiphophora iladiata. The community composition of this subzone is here examined at fourteen sites. The phytal and fauna! assemblages are analysed by principal co-ordinate, classification and nodal analyses. This subzone is found to have a high species richness. including species which had been thought to occupy only higher or lower tidal levels. It is suggested that both plant and animal assemblages are strongly influenced by wave exposure, freshwater run-off and geography. Key Words: marine community composition, sublittoral fringe, Xiphophora, multivariate analyses. INTRODUCTION (Bennett & Pope 1960). Thus, on the oceanic coasts of Tasmania it is possible to define a Xiphophora The rocky shores of southeastern Australia are subzone, dominated by X. g/adiata, which marks known to be occupied primarily by barnacles and the highest limit of the sublittoral fringe on very molluscs in the upper intertidal (Underwood 1981), exposed shores and represents the upper sublittoral while algae dominate at midshore level and below.
    [Show full text]
  • Redalyc.Nuevos Registros De Algas Verdes Marinas (Ulvophyceae)
    Acta Botánica Mexicana ISSN: 0187-7151 [email protected] Instituto de Ecología, A.C. México Quiroz-González, Nataly; León-Álvarez, Daniel; Rivas-Acuña, Ma. Guadalupe Nuevos registros de algas verdes marinas (Ulvophyceae) para Tabasco, México Acta Botánica Mexicana, núm. 118, enero-, 2017, pp. 121-138 Instituto de Ecología, A.C. Pátzcuaro, México Disponible en: http://www.redalyc.org/articulo.oa?id=57449640007 Cómo citar el artículo Número completo Sistema de Información Científica Más información del artículo Red de Revistas Científicas de América Latina, el Caribe, España y Portugal Página de la revista en redalyc.org Proyecto académico sin fines de lucro, desarrollado bajo la iniciativa de acceso abierto 118: 121-138 Enero 2017 Artículo de investigación Nuevos registros de algas verdes marinas (Ulvophyceae) para Tabasco, México New records of marine green algae (Ulvophyceae) from Tabasco, Mexico Nataly Quiroz-González1,3 , Daniel León-Álvarez2 y Ma. Guadalupe Rivas-Acuña1 RESUMEN: 1 Universidad Juárez Autónoma de Ta- Antecedentes y Objetivos: El conocimiento de la ficoflora en el estado de Tabasco es escaso, se basco, División Académica de Ciencias Biológicas, 0.5 km carretera Cárdenas, tienen 38 registros de Rhodophyta, siete de Ochrophyta, y solo cinco de Chlorophyta. Además, a 86000 Villahermosa, Tabasco, México. nivel nacional es el estado costero con el menor número de publicaciones del tema. Se desarrolló el 2 Universidad Nacional Autónoma de presente trabajo para contribuir al conocimiento de la flora algal del estado, particularmente al de México, Facultad de Ciencias, Herbario, Chlorophyta. Laboratorio de Ficología y Sección de Al- gas, 04510 CDMX, México. Métodos: Se revisó material procedente de los herbarios de la Facultad de Ciencias de la UNAM 3 Autor para la correspondencia: (FCME) y de la Universidad Juárez Autónoma de Tabasco (UJAT).
    [Show full text]
  • Seaweed Species Diversity from Veraval and Sikka Coast, Gujarat, India
    Int.J.Curr.Microbiol.App.Sci (2020) 9(11): 3667-3675 International Journal of Current Microbiology and Applied Sciences ISSN: 2319-7706 Volume 9 Number 11 (2020) Journal homepage: http://www.ijcmas.com Original Research Article https://doi.org/10.20546/ijcmas.2020.911.441 Seaweed Species Diversity from Veraval and Sikka Coast, Gujarat, India Shivani Pathak*, A. J. Bhatt, U. G. Vandarvala and U. D. Vyas Department of Fisheries Resource Management, College of Fisheries Science, Veraval, Gujarat, India *Corresponding author ABSTRACT The aim of the present investigation focused on a different group of seaweeds observed K e yw or ds from Veraval and Sikka coasts, Gujarat from September 2019 to February 2020, to understand their seaweeds diversity. Seaweed diversity at Veraval and Sikka coasts has Seaweeds diversity, been studied for six months the using belt transect random sampling method. It was Veraval, Sikka observed that seaweeds were not found permanently during the study period but some species were observed only for short periods while other species occurred for a particular season. A total of 50 species of seaweeds were recorded in the present study, of which 17 Article Info species belong to green algae, 14 species belong to brown algae and 19 species of red Accepted: algae at Veraval and Sikka coasts. Rhodophyceae group was dominant among all the 24 October 2020 classes. There were variations in species of marine macroalgae between sites and Available Online: seasons.During the diversity survey, economically important species like Ulva lactuca, U. 10 November 2020 fasciata, Sargassum sp., and Caulerpa sp., were reported.
    [Show full text]
  • Seaweeds of California Green Algae
    PDF version Remove references Seaweeds of California (draft: Sun Nov 24 15:32:39 2019) This page provides current names for California seaweed species, including those whose names have changed since the publication of Marine Algae of California (Abbott & Hollenberg 1976). Both former names (1976) and current names are provided. This list is organized by group (green, brown, red algae); within each group are genera and species in alphabetical order. California seaweeds discovered or described since 1976 are indicated by an asterisk. This is a draft of an on-going project. If you have questions or comments, please contact Kathy Ann Miller, University Herbarium, University of California at Berkeley. [email protected] Green Algae Blidingia minima (Nägeli ex Kützing) Kylin Blidingia minima var. vexata (Setchell & N.L. Gardner) J.N. Norris Former name: Blidingia minima var. subsalsa (Kjellman) R.F. Scagel Current name: Blidingia subsalsa (Kjellman) R.F. Scagel et al. Kornmann, P. & Sahling, P.H. 1978. Die Blidingia-Arten von Helgoland (Ulvales, Chlorophyta). Helgoländer Wissenschaftliche Meeresuntersuchungen 31: 391-413. Scagel, R.F., Gabrielson, P.W., Garbary, D.J., Golden, L., Hawkes, M.W., Lindstrom, S.C., Oliveira, J.C. & Widdowson, T.B. 1989. A synopsis of the benthic marine algae of British Columbia, southeast Alaska, Washington and Oregon. Phycological Contributions, University of British Columbia 3: vi + 532. Bolbocoleon piliferum Pringsheim Bryopsis corticulans Setchell Bryopsis hypnoides Lamouroux Former name: Bryopsis pennatula J. Agardh Current name: Bryopsis pennata var. minor J. Agardh Silva, P.C., Basson, P.W. & Moe, R.L. 1996. Catalogue of the benthic marine algae of the Indian Ocean.
    [Show full text]
  • Taxonomic Study of Coenocytic Green Algae Commonly Growing on the Coast of Karacid
    View metadata, citation and similar papers at core.ac.uk brought to you by CORE provided by Aquatic Commons Pakistan Journal of Marine Sciences, Vol.5(1), 47-68, 1996. TAXONOMIC STUDY OF COENOCYTIC GREEN ALGAE COMMONLY GROWING ON THE COAST OF KARACID R. Aliya and Mustafa Shamed Deparilnent of Botany (RA), Deparilnent of Botany I Institute of Marine Sciences (MS), University of Karachi, Karachi-75270, Pakistan ABSTRACT: Twelve commonly occurring coenocytic and siphonaceous species of marine benthic algae, i.e., Bryopsis pennatti:cLamouroux, Caulerpa chemnitzia (lEsper) Lamouroux, Ca. faridii Nizamuddin, Ca. manorensis Nizamuddin, Ca. racemosa (Forsskal) J. Agardh, Ca. taxifolia. (Vahl) C. Agardh, Chaetomorpha antennina (Bory de Saint-Vincent) Kiitzing, Cladophora uncinella Harvey, Codium decorticatum (Woodward) Howe, Co. flabellatum Nizamuddin, Co. iyengarii B0rgesen, and Valoniopsis pachynema (Martens) B0rgesen, belonging to four different orders of the class Bryqpsidophyceae, division Chlorophyta, were collected from the intertidal region of different coastal areasi·11ear Karachi (Pakistan) and investigated taxonomically. Codium decorticatum is a new report from this region and Co. decorticatum, Co. flabellatum and Co. iyengarii are described for the first time from the coast of Pakistan. KEY WORDS: Chlorophyta - Bryopsidophyceae- morphology- cell structure- reproduction- ecological notes - marine al.f(ae - northern Arabian Sea - Pakistan. INTRODUCTION The green seaweeds occupy a large area of the Karachi. coast and show great variation in type and species. It was not until the 1930s that any systematic taxonomic study was carried out on the marine algal flora of the Karachi coast. B0rgesen (1934) provided the first account of a few species from this coast. After a synaptical study by Anand (1940) on marine Chlorophyta of Karachi, Prof.
    [Show full text]
  • C, N, P, S Content of the Chlorophyta Chaetomorpha Linum (Müller) Kützing in a Vast High Density Mat of a Mediterranean Non-Tidal Lagoon
    Knowl. Manag. Aquat. Ecosyst. 2020, 421, 38 Knowledge & © M. Lenzi et al., Published by EDP Sciences 2020 Management of Aquatic https://doi.org/10.1051/kmae/2020030 Ecosystems Journal fully supported by Office www.kmae-journal.org français de la biodiversité RESEARCH PAPER C, N, P, S content of the Chlorophyta Chaetomorpha linum (Müller) Kützing in a vast high density mat of a Mediterranean non-tidal lagoon Mauro Lenzi1,*, Marco Leporatti-Persiano2 and Paola Gennaro3 1 Lagoon Ecology and Aquaculture Laboratory (LEALab À WWF Oases), Strada Provinciale Giannella 154, 58015 Orbetello, Italy 2 Orbetello Pesca Lagunare, Via Leopardi 9, 58015 Orbetello, Italy 3 ISPRA, Italian Institute for Environmental Protection and Research, Leghorn, Italy Received: 1 July 2020 / Accepted: 17 August 2020 Abstract – In a Chaetomorpha linum high density mat extending over 300 hectares, between 2017 and 2019 samples were collected for C, N, P, S tissue content determination, biomass (b) was estimated, sediment samples collected for labile organic matter (LOM) determination, and water chemical-physical variables measured. The latter showed extreme conditions with a wide range of values and with zero oxygen for long periods. N-NO3:SRP atomic ratio showed extreme P-limitation. Tissue macronutrients showed very variable values, highlighting a strong P-limitation and relatively high level of S. With exception of nitrogen, no significant differences were detected for each macronutrient between the months and between the stations, neither was any correlation found between macronutrients and LOM and b data-set. The growth and survival of the mat occurred despite the scarcity of P,which probably reached with very low frequency the surface layer of the mat, the one capable of performing photosynthesis, where it was quickly re-assimilated and utilised.
    [Show full text]
  • Mangrove Associated Seaweeds in Sundarban Biosphere Reserve, West Bengal, India
    Int. J. Adv. Res. Biol. Sci. (2020). 7(12): 53-62 International Journal of Advanced Research in Biological Sciences ISSN: 2348-8069 www.ijarbs.com DOI: 10.22192/ijarbs Coden: IJARQG (USA) Volume 7, Issue 12 -2020 Research Article DOI: http://dx.doi.org/10.22192/ijarbs.2020.07.12.007 Mangrove associated seaweeds in Sundarban Biosphere Reserve, West Bengal, India Sudhir Kumar Yadav* and Kaju Majumdar Botanical Survey of India, Salt Lake City, Kolkata – 70006, West Bengal *Corresponding author: [email protected] Abstract Seaweeds refer to the marine macro algae and constitute an important component of the marine biodiversity. The Sundarban Biosphere Reserves is one of the renowned mangrove forests and a UNESCO heritage site in the Bay of Bengal. The present paper deals with a preliminary study on marine macro algae found in association with mangroves in the Sundarban mangrove area. During the present survey, eight species of seaweeds, comprising of six species under Chlorophyceae and two species under Rhodophyceae have been documented and described in detail. Keywords: Marine Biodiversity, Seaweeds, Sundarban, Taxonomy. Introduction terrestrial or aquatic, are prerequisite for effective conservation. The perusal of literature pertaining to India, with a coastline of c. 7500 km length, is the marine macro algal diversity of the Indian coast endowed with a variety of coastal habitats that support reveals that the diversity of seaweeds in West Bengal significant coastal plant diversity including marine coast is very less as compared to the southern parts of algae (seaweeds, microbes), seagrasses and the Indian coastlines. Among the Indian maritime mangroves. The marine macro algae are popularly states, Tamil Nadu coast shows the highest diversity of known as seaweeds.
    [Show full text]
  • 1 Chaetomorpha Philippinensis (Cladophorales, Chlorophyta), A
    Chaetomorpha philippinensis (Cladophorales, Chlorophyta), a new marine microfilamentous green alga from tropical waters 1 1,2 2 FREDERIK LELIAERT *, DIOLI ANN PAYO , HILCONIDA P. CALUMPONG AND OLIVIER 1 DE CLERCK 1 Phycology Research Group, Biology Department, Ghent University, Krijgslaan 281- S8, 9000 Ghent, Belgium 2 Silliman University Marine Laboratory, Silliman University, Dumaguete City, 6200, Philippines * Corresponding author ([email protected]). Fax number: +32 9 264 8599 Running title: Leliaert et al.: Chaetomorpha philippinensis sp. nov. 1 Abstract A new marine microfilamentous green alga, Chaetomorpha philippinensis Leliaert sp. nov., is described as an epiphyte on Chaetomorpha vieillardii from shallow subtidal habitats in the Philippines. Phylogenetic analyses of large subunit rDNA and rDNA ITS sequences show that the new tropical species is sister to the cold-water C. norvegica, from which it is genetically clearly distinct but morphologically almost indistinguishable. Chaetomorpha philippinensis is characterized by minute, straight or curved, unbranched, erect filaments up to 300 µm long and 7-17 µm in diameter, attached by a basal, hapteroid holdfast. Filaments in culture are similar in morphology but grow considerably longer with slightly larger cells. The cylindrical cells are multinucleate with up to 8 nuclei (up to 18 in culture). Cells contain a single, parietal, lobed chloroplast with numerous small perforations and one to several pyrenoids. Zoosporangia develop by transformation of apical and subapical cells with zoids emerging through a domed pore in the apical, middle or basal part of the cell. KEY WORDS: Cladophorophyceae, cryptic species, marine green algae, molecular phylogeny, seaweeds, Siphonocladales, Ulvophyceae 2 INTRODUCTION Chaetomorpha is a common and widespread green seaweed genus in the order Cladophorales, characterized by attached or unattached, unbranched filaments.
    [Show full text]
  • Biodiversity & Endangered Species
    International Journal of Biodiversity & Endangered Species Vasquez-Carrillo C and Sullivan Sealey KS. Int J Biodivers Endanger Species: IJBES-106. Research Article DOI: 10.29011/ IJBES-106.100006 Diversity and Extent of Coastal Submerged Aquatic Vegetation in an Unexplored Coastal Upwelling Region of the Caribbean Sea C. Vasquez-Carrillo*, K. Sullivan Sealey Coastal Ecology Laboratory, Department of Biology, University of Miami, FL, USA *Corresponding author: C. Vasquez-Carrillo, Coastal Ecology Laboratory, Department of Biology, University of Miami, FL, USA. Tel: +16085145833; Email: [email protected] Citation: Vasquez-Carrillo C, Sullivan Sealey KS (2018) Diversity and Extent of Coastal Submerged Aquatic Vegetation in an Unexplored Coastal Upwelling Region of the Caribbean Sea. Int J Biodivers Endanger Species: IJBES-106. DOI: 10.29011/ IJBES- 106.100006 Received Date: 11 September, 2018; Accepted Date: 01 October, 2018; Published Date: 08 October, 2018 Abstract The Tropical North Western Atlantic (aka the wider Caribbean) is a large marine ecoregion with patterns of marine species’ diversity that both need elucidation and protection. The wider Caribbean is facing rapid changes associated with anthropogenic activities of coastal alteration, pollution loading and weather patterns, with losses of biodiversity expected. Submerged Aquatic Vegetation (SAV) is a key component of marine communities adding both structural complexity and species diversity to the wider Caribbean. This study aimed to examine SAV species assemblages and their extent at a unique coastal ecosystem in the Southern Caribbean Sea. This ecosystem remains unexplored for its nearshore marine biodiversity due to its remoteness and harsh environmental conditions. The study took place at ten survey sites in shallow nearshore waters of northeastern La Guajira peninsula of Colombia.
    [Show full text]
  • Phenotypic Plasticity and Taxonomy of Cladophora Gracilis (Griffiths)
    Acta Oceanol. Sin., 2020, Vol. 39, No. 10, P. 162–170 https://doi.org/10.1007/s13131-020-1586-0 http://www.hyxb.org.cn E-mail: [email protected] Phenotypic plasticity and taxonomy of Cladophora gracilis (Griffiths) Kützing (Cladophorales, Chlorophyta) in the western Yellow Sea with the implication of its DNA barcode Bingxin Huang1, 2, 3, Linhong Teng2, Jingjing Jiang1, 3, Lanping Ding1, 2, 3* 1 Collage of Life Sciences, Tianjin Normal University, Tianjin 300387, China 2 Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China 3 Tianjin Key Laboratory of Animal and Plant Resistance, Tianjin 300387, China Received 18 April 2019; accepted 20 September 2019 © Chinese Society for Oceanography and Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature 2020 Abstract Due to extensive morphological plasticity, the taxonomy of Cladophora species remains unclear. As one of the widely distributed species, C. gracilis was reported to hold many varieties, which make it difficult to identify the species. This study explored the morphology diversity of nine C. gracilis samples collected along the coast of western Yellow Sea. Some samples showed extremely varied characteristics, by which one cannot classify them correctly. Hence, 18S rDNA and nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacer regions (ITS) sequences were employed to delimit species. For 18S rDNA, sequence similarity ranged from 99.6% to 100%. For ITS region, the similarity ranged from 98.7% to 100%. Molecular data strongly suggested that the morphologically heterogeneous samples were actually the same species. Characteristics comparison of the samples revealed that the taxonomy criteria including branching pattern and density, thallus color, height and texture varied widely, influenced by environmental conditions and age of alga.
    [Show full text]
  • Marine Algal Flora of Flores and Corvo Islands, Azores
    Biodiversity Data Journal 9: e60929 doi: 10.3897/BDJ.9.e60929 Data Paper Marine algal flora of Flores and Corvo Islands, Azores Ana I Azevedo Neto‡, Manuela I. Parente§, Ian Tittley |, Robert L. Fletcher¶, William Farnham¶, Ana C. Costa§, Andrea Z. Botelho§, Sandra Monteiro§, Roberto Resendes#, Pedro Afonso ¤, Afonso C.L. Prestes‡«, Nuno V. Álvaro , David Mila-Figueras¤, Raul M. A. Neto», José M. N. Azevedo‡‡, Ignacio Moreu ‡ cE3c - Centre for Ecology, Evolution and Environmental Changes/Azorean Biodiversity Group, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Departamento de Biologia, Universidade dos Açores, 9500-321 Ponta Delgada, Açores, Portugal § CIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, InBIO Laboratório Associado, Pólo dos Açores, Universidade dos Açores, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Departamento de Biologia, 9500-321 Ponta Delgada, Açores, Portugal | Natural History Museum, Cromwell Road, London, Code SW7 5BD, United Kingdom ¶ Institute of Marine Sciences, Department of Biological Sciences, University of Portsmouth, Ferry Road, Eastney, Portsmouth, PO4 9LY, United Kingdom # Faculdade de Ciências e Tecnologia, Departamento de Biologia, Universidade dos Açores, 9500-321 Ponta Delgada, Açores, Portugal ¤ IMAR/Okeanos, Departamento de Oceanografia e Pescas, Universidade dos Açores, Rua Prof. Doutor Frederico Machado, 9901-862 Horta, Açores, Portugal « CCMMG (Centro do Clima Meteorologia e Mudanças Globais) & IITA-A (Instituto de Investigação e Tecnologias Agrárias e do Ambiente), Universidade dos Açores,
    [Show full text]
  • Projeto “SALGA- Sustainable Hiking by Nature”: Percurso Pedestre Temático Ligado Ao Conhecimento Das Algas
    Projeto “SALGA- sustainable hiking by nature”: Percurso Pedestre Temático ligado ao Conhecimento das Algas Rafaela Sousa Carvalho 2020 Projeto “SALGA- sustainable hiking by nature”: Percurso Pedestre Temático ligado ao Conhecimento das Algas Rafaela Sousa Carvalho Projeto para a obtenção de Grau de Mestre em Turismo e Ambiente Projeto de Mestrado realizado sob a orientação do professor Doutor João Paulo C. S. Jorge e co- orientação da Professora Doutora Susana Luísa da Custódia Machado Mendes. 2020 Agradecimentos Gostaria a agradecer a todos os que contribuíram direta e indiretamente, para a concretização deste trabalho. Não posso, no entanto, terminar sem deixar algumas palavras de apreço e gratidão a algumas pessoas nomeadamente ao Professor Doutor João Paulo C. S. Jorge, pela disponibilidade, ajuda e paciência ao longo da realização do projeto. À Professora de Licenciatura em Biologia Marinha e Biotecnologia, a Doutora Susana Luísa da Custódia Machado Mendes um especial agradecimento pela co-orientacão e tempo despendido na correção da metodologia deste projeto. Obrigado ao Ginásio Refisica pela disponibilidade em ceder o espaço para a realização dos questionários à população. Foi uma ajuda imprescindível para conseguir o grande numero de amostras. Aos meus amigos e colegas que de uma forma direta ou indireta, contribuíram, ou auxiliaram na elaboração do presente estudo, um obrigada pela paciência e motivação durante a realização deste trabalho. À minha família pela força e pelo carinho que sempre prestaram ao longo de toda a minha vida académica, bem como à elaboração da presente dissertação a qual sem o seu apoio teria sido muito mais difícil. Agradeço também a todos aqueles que se predispuseram a ajudar-me na realização dos inquéritos, enquanto entrevistadores, quer aqueles que se predispuseram em responder ao inquérito.
    [Show full text]