Templates for in Situ Hybridization Rna Probes

SUPPLEMENT - DNA SEQUENCES

Due to the imprecisions arising from sequencing/assembly mistakes or polymorphisms, the sequences published below are in accordance with the published genome assemblies and may not be identical to the actual sequence of cloned fragments (unless indicated otherwise by the term “VERIFIED SEQUENCE”). “N”s indicate gaps in sequencing.

TEMPLATES FOR IN SITU HYBRIDIZATION RNA PROBES

Moocci.Mesp 5’RACE (VERIFIED SEQUENCE):

ATACTAAATTCATCAGTATATATATCATCTATATCTATACAGTGGGTAATAAGTCTTAATAGATATCGGACAA AGTAAAAACTGCATATTGAAGCGTTTGAAAAAAGTTGTTCAATTCAATAGAAACAAGCAAATTTAATCATTG TAGAAAAACGTTAAACAACTTTTTAAACATTTTAACAAAATGGACCAAAGTGTACTGGGAGCTTTTTCTTCAA TATCTGGACAGCAGGAAACCGGTTTTGGGAACATGCCGTCAAAAACAACGTTTATAAATTACCCAAACATC GGAAATATTTTTATTGAAACAGAATCGAATTTTTTAGAAAGAAATAACCAGAGTTTTGATACGATTAAACAT TCTACCATGAAGTCAAAGCGACCACAAAATAAAAACAAGAAAATGACTAATCGGCAATTTGGTGATGATAT TACAAATTTTGGGCCTTTTCAAAGACAGTTACCAAGAGTTGAGACTTGCAACCATGTTCCTTTAACAAATGA AAACTTTTCTCCAACATACAATTATAAATCACTGAGAAATGACAACGACGAAACAATGTTTCCAAACTCAAA AAGAGCGAGAACTGAAATCCACGATCCATCGGCGATAAGATCGTCAAGATCAAATAAGGCTATGTTTTCGA GACGTAAAATTGCGAGCGAAAGAGAGAAGCTCCGAATGCAGAAGATATCCAATCAATTCCAAGTATTGAA AAGTGTCCTGCCGCCTACCAGATTCGCAGGAAACGGAAGGGTAACGAAAATCGAAATTCTCCACCAAGCGA

TGGATTA

Moocci.Ets.b probe (VERIFIED SEQUENCE):

ATAGCTTTGATAGTGGCAGTGATTGCCAACAAGAACTTGGATGTCATATACCAACACCCCTACCTCCAGTAT CTAATCCTTCAGTGTTCAGAAGAAGTTGTTCTCAAGATGAAAGTGGAGGCAAGGTTCAGTTACACACAATG ACTCCACTAAGGGAAGAAGAGTCCTCAATGTACCCACACCTTGAACACCTTCACAGATCCCAGTCAAATGTT CCATCCAGTTTGCCATGTGTCAGTAACCAAAGTCGAAGGCCATCTGACATCTCTCACCCATTTCCAACCCCAA CCACCCCTAATCTACCTCCATTTCCCCAACCCCAAGATGGAAAATGTGTTACACCATCTGACCCCAGACACCC TCCAGGACCCCAAGATAACTGGCAAGATCTGTATTACGCTAACCTTGCTAATTACCATCACCACCAACATAT GGAAAACATCAAGCGTCAGGAAATAGCTCGAGGTAAACAATGTAACAGTAGTATCCTGTCATATAAACGTT GTGTTGACGTCACAAACTACTTCCTTTATGGAATTATATGTGACTTGTGTATTGTTTATATAGTTTATATTAAC GTTAATTGCTAAAGTGAATCATTGGTTTATTTTCTCTATTTAAAAGTCTCTTGATTTTTAGATAAGCTTCATGG TAATATTCATGGAAATCATCCTGTACCTCACCCTGCTTATCCAAATGTTAAGCATGAAAATGTTCCACACCAG GGTTACTGGGGTCCCCAGCAGCACCCACAGTTCCACCAACAGACAATGAAACCCTATGGTATGGAAGAGCG TGCCATGAAGGACCGGCAGTACTTCGGGCCACCAGGAATGTTCCCACCTGGTGGAGAATTTCCAAGCAATC CTGTAATACCTGGAG

Moocci.FoxF probe:

AATTTACACTGCAGTTCGTCGCTTGCGATCATGAGTCCAACCACACATGAGATGCGAGGATCTCTCAGTCAG CCTCTTCACCACTCGATACCTTCTGTTCAGAATCAGTCAGCACCTTCGTTACAAAACCAGCAGCATATTAACC CTTTACAACACCAGGATCAAATACCAGGACAAGGAGGACCAATGGATGCGTACAGAGGAAGAGCGTTATC AGATAATACTCACCAGGGTCTCCACATCAGCCATTCTCATGATGCTCTTGGCCTTCAGCAGCAGATGCAATA TCAGCACCAACACAACGCTTTGTACAGATCCCAATCTATGATTCCGCAACCTGGAGTTCATCTACCTCCGAGC GTCGATAGCGTGGTGGCTCCACCTCGGCCAGGAAGCAACGAAATTCCGCACAATATCTCAATGGAACGAAA AACCTCACAAAGTTCTCCGATCTCCGAGAGTCGCCACCCTTTGTCCGACACCAGCTTGGATGACAGCAACGC GAACAATAATAGTAACAACAGAACACTGTCAGAAGATCCAGAAATTTCTGCAGATTTGAACAATACGGCTG CCTCAATGACGACAGGATCAGAAGCTTCAACATCCACTGAAGAAGATGGAAGCGATGGAGGAGTCGCAGT TAATAAAAAGAGTGGTGGTTCATCTAACGCCGCGGGACACAGACGACCAGAAAAACCCCCTTATTCGTATA TCGCACTGATTGTAATGGCGATTCAAAGTTCACAAACCAAAAAATTAACGTTGAGTGAAATTTACAACTTCT TGCAAAGCAAATTTGAATTTTTCCGAGGTTCTTATCAAGGATGGAAAAACTCTGTAAGACATAACCTATCAT TAAATGAATGTTTTATCAAATTGCCAAAAGGTCTTGGCCGTCCGGGAAAAGGACATTACTGGACCATCGATC CCGCTAGCGAATTCATGTTCGAAGAAGGATCTTTTCGAAGACGACCACGGGGATTTCGACGAAAGTGTCAA GCTCTTAAACCTTATGGCATTTTCGGTGGACCTCCACCAGGTTTAATGGGGCCACAAAGTTATCCACATCCT GATATGTTTCCCCAAGTAAGTGGGTTACCTCATGGTCATATGCCACCTCCACGCCACCAGCCCAATTTAATG GGATTTGACCCATCTGGAATGGGATTCTTAAATGGAGGAGCAGCTCCTATCGCTTCAAACAGAAGTCCAAC GTCGCCACTTACTCCAAAGCCACCGGGAACCCCACATTCGCCAAGTAATCACACTGGGAGATTATACGGATC ACCAAGTGCCGTAACCGGGCCGAGTCCCAACGATAGCAGGGCGTCCCAAATTTTGCATTCCCCAGCTAGCA TGACAACAGCCAATCCACACTATCCTTCGGCCATGTTTAGTTGGCCAAGTCCAGGACCTCATCCCGGAACAT ACATTCGCCACGACGCAACTTCAACGGCCGCATCTATTACAGAAACACAAAATCATTTCATGAACGCTGCAG GTTCGCGAATCGAACACCATCCATTTTACGCTTCCGCTGACCGAGCTAACATCGCTTAT

Moocci.Hand-r probe (VERIFIED SEQUENCE):

ATTATAAAACTTAAGCATCAAAGTAATAAAATTAAAAAATGTTCACCGAAAATTTCTCGGACTACCTCCAAA ACATTCCAAGCTCACGGTATTCAGTTGCCAGGCAACACGCCAACTTGAATGACGTTAATAGTGGATTCAACC AAGCGCAAAACTACGGAGATGAGAATTTTAGCTTCGGCACGAACAAAAGTTTTCAAAAACCTCAGGTGACA AACCGGTGTTCTGATTGGAGTAGCACCCGACCACGTGTTTTGCAAGATATTACATCACAGCTAAACGAATGC GGCGCACCTTTCGGGGCAACTTTTAACAACGTTCAGACTAGCTATACCGAGAACTTCAACGAATGTAGCGG GTTCGAGCCATGGCCAAAGCAAGTCCACCAACACCAAATCTTTCCCGAACAAAATTTGCAACAAATTGAACC ACAATGGAAACAGCAAAGCTCTTGGGCGCCATCTCGGGAGCAGTCGACGATGTACCAGAGTCACAGGATG CGCACGAACAGGCGTAAGCGCGAACGGAACATGAACATCAACCACGCGTTCGAGTCTCTGCGGTGCCGCA TCCCAAACCTGCCGACCGACACGAAGGTTTCAAAAATCCGCATCCTCCAGTTGGCGTGCGAGTACA Moocci.Gata4/5/6 5’RACE (VERIFIED SEQUENCE):

ATTGGAGTATTTGGTTGTATTAAGACATATAGTTTTTAATTTTGATTTTATTTAAGTTGGTATTAAATTTTGTT GAAAATGTATGTGCAAGAAAAAAATGGGGGACAAAACGATAAACTAGCTCATGTGTACTTCCCCCCATCTA CACAACTCTACACCAGCTCAAGGAAGCAAAATCCTGATACGAAGGCTTATCTCATAGAACCGGCGGATTTTA ATCAAAATGCGGGAGATATCCACATCACCCCACCAGCTCAGAGCAGACAAATTAAACATGAATCTGAATCTT CATGGAATGACTCATCTGCCAGCACAACGTCAAACAACAATACGCCCTCTCGTGGCTCTCCCAACGTGAGCA ACAGAAGCGCTACGCAAAATCCCAGGTCCAATAACAGCCCAATTGAAGACTCCGGAGTGGAAGAGGATCG TGGCTCGGATAACGCAACAACAGATACCAGTGGCCGCCACAGTCTAGGAAGTAGCAATGGAAGTCTGACA GAAAACACAAGTTATGATTCTGCAAATCAACAACAAATTCTACCTTACGCGAGTGCACGGTATGTTACGCAA TACTCCACTCAGCCATTTCCTCATGATTACCAGAATAAAACTGGAAGTATTTCACCTGGATTGGATTTGTCAG GAAGCTATGCAAACGAGGGGGTAAATTATTCGTCCTCAATCAACTATAATTCATACCCTACAAACCCCACAT TTGTAGCGGGGTCAAATTATGGATCATCGTACCCTTTGCCTTCATATGCCCCCAGCAGCCACCAAACCAATC CGGCTTTACACCACACCACTGGTTTGGCTCTAAGTGGATCCACAACTCAACATGCAAGTACTGCGACTGGAC TTCCCCAAGGTTACCCATACCCTTCCACACAAGAAATGTGGGGTCTTGGAGCCACAGGCGGAGCCTATGAC GCCACAACAGCAATGGCGTATCAAATGCAACTAAGACCGACTGCTCTATCTCAATTTGGGGGATACCAAGA GCAACGTGAATGTGTGAATTGTGGAGCCGCGTCAACTCGAGTTTGGCGACCAGATTCCTTGGGTCATTTCCT GTGCGACACGTGCGCCATTGCAGCAGGTCAACATGGACGTTCCTCCTCTTCACTGAAGGCCAAAGGAAAAC TGAACTCCTGTCGTAATCAAATTTGCTCAAATTGTTCAACGACTGTGACAACTTTATGGCGAAGAAGCCCAG AAGGAAACTCG

Moocci.Nk4 3’RACE (VERIFIED SEQUENCE):

TCGACCGCGTACAAGACGAAAGCCAAGGGTTCTTTTCTCACAAGCGCAAGTTTTTGAACTTGAACGACGATT TAAACAACAACGTTATCTGTCAGCCCCAGAACGCGAACATTTGGCTCAGATGTTAAAGTTGACTTCAACCCA GGTTAAAATTTGGTTTCAAAACCGGCGATACAAATGCAAACGACAACGTCAAGATAAAAGCTTAGAACTTG TAGGCGCCTGTCCACCACGACGTGTTGCTGTTCCAGTGCTAGTAAGAGATGGAAAACCCTGTTTGGGAGGA CCAATGGCAGGTGGTAACCCTTCCCTACAAGCTCCATACTCTGCTCCTTATAATGTCACTGTCACTCCATACC ATAGTTATCCAAGTTCATATAATTCTTGTGGGTACAATTCTTATCCCCAGCCAAACCCTCACGCCAATTACGC AAGTAGCGCAGCTACATATGCCCCAACAGCAGGTTACAACCTTGGTGGACCTTCAATTGCTTCCAATCCATC AGTCGGGAGCGTTGGTGGAATTCCAGCTGGACCTATACATCAATCTGGCCAAATGACTATGGGACCATCCC ATTTCGCACCCTCCATGACAAGTCAAGTACCTCAACGCAACCCGCATGGTACAAGCGACTATATGTATAAGC TTGGATTATGTACATAAAATTAAAGCTTTACTTTAATACAATGACGTGCTGCAAGGATTTTCGTGCAAAACG TAGATTTTTCACGCAGTTTTGCGAATAATACGGGCTGCTGAAATTTGGAAAGTGCAATCTATACGTGCCTTA TCAGTGATATTAACGCAATCATGCAGAAAATTCGCAGCTAAATTCCCCATGACAATACTTGAAACAAATATT TTGTTAATTATTTTTACATTCATTTATTGATATATTTAAGTATAACAGTGTAATAATGAATGTATGACTAAACT GCTTGCAATTTTTACAACTTTACTTTCCATTTTTTACTCGTATGGTGATTATTTTTTAAATAAATGTGTTGCTTT AATTTTTAAAAAAAAAAAAAAA Moocci.RhoD/F 5’RACE (VERIFIED SEQUENCE):

ATTGGAGTATTTGGTTGTATTAAGGTTTAAAATAAGCTGTATTAAAATAAAAATGTAGAAACTAAAAGCCTT TAGTTACGTATGTTTTCTTGAGGGAAGAATCGGGAATAAAACGTATTGGAAACTTTTATATTGAATTTATTTA TGACGAAAACAAATCGATGAAACACGATGGAGAGGAAAAATAACAACAATAGAAAATTTTCTGAGCATATT TATATCAGCAGCGTTGATTCAAAAACCTGCCGAGCTAAGCCGCACAACACCGATAAAGACGGCGATTTACC GCGGATTAAAATCGTTGTCGTAGGCGACGGGGGAAGCGGGAAAACTTCACTTTTTATTGTATTCACCCAGC GAGAGTTTCCGGAGGTATATATACCCACTGTATTCGAAAACCACACTGCCGAAGTTGAATTTCACACAAAGC GACTTTTTCTACTTCTATGGGACACAGCGGGCCAAGAAGATTATGATCGGTTACGGCCTTTATCTTATGACG ATTCTGACGTCATACTCATATGTTATGACGTCATGAATCCATCCAGTTTTGAAAATGTAAAGGTTCGCTGGG AGCCTGAAATTCGGCAC

Moocci.Tbx1/10 5’RACE (VERIFIED SEQUENCE):

ATTGGAGTATTTGGTTGTATTAAGTTCACTTTTCATTTAATTAAGTATTTTATAACATCGAAGATTTACCGGTA AGGACGCTGAGTTAAAAGCGTTAAAAAACGGCGATCTGTCGTGATTTTTTCGGGTGTTTAATGCTAAAGTAT TCTAGCTAACATTTAGTGAATCTGAAAAAGATATATAACAACATCTTCTGCAATAGAAATATTCCCCGGACA GTCTGTTAAACAAGACAATCCAACGGACAGTTTCAAAGGTATTCCAGGCATTGACTTTACCCAAATTAGAGC TACAAAAGGGTTAAACCAGATTTTAATTTATTACCCCAACCCCTTAAATGACAAGCGGGATTGGAATGATGG GGCCTAGTGGGGGCCATTACCCGCCCCATTACGAGTACACGCTTTCTCATCAGGATTATGGAACGGAGTGT CAACAATATAACGAATATTCTATGCAGTACCAACGTGCGGAATTCCAACACCGTACGCCATCTCGTGATGAG AATTCCCAGCCAATGAGTGAGAAAAACCACAATAACTTTTCACCCAAGAATCATTCAAGTTTAAGAGTGGAA AATTTTCATGAACGGGAAGAGAAACCGTCACAAAGCGACATACAAAACGTTGGTTACAACAACAACACTTA CGATGATAAAATAAGCTCCATGGCGCAAGCGCGACAATTATTAAACATGCAGACCGCTGAGCACGCCACTA GTGGACACATCGACAATAAGTACGCACGGAGTAGCTGTTCGATGAGCGATGACGTCAATAATGTGGCGTT GTTGGAAGCGAGTGTGTCCAAACCCCTGTCGCCATTCAAAGCGGACGCGCTACAAAATCACAACCACAACA ACAACAGTAACATGAGTCGTATCTCGCCGAACGAAAACGACTCCACCATGTCCCCTAAAATGGAAGGGTCT CCAAGTATGGTGTCATCACGAACTGATATGACGTCAATGAATGATGAAATGCGTGATGACGTCATGGACAC GCAAGGGAAAGAGGCGGGCAAAAAGAATCACAAGGTGTCGTCAGTGTACGCTCGATTGGAAATGAAGAA TCTTTGGGATGAATTCAACGAACTTGGAACCGAAATGATAGTCACTAAAGCCGGAAGACGGATGTTCCCAA CATTTCAAGTCAAGTTGTTCGGGATGGACCCAAACGCTGATTACATTCTCATGATGTCGTTTGCAACGGTGG ACGACAAGCGGTACCGATATGCATTTCATAGTTCCAATTGGTTGGTAGCGGGGAAGGCGGATCCTTCAATG CCTCCACGAATCCACGTACACCCTGACTCCCCCGCCAAAGGATCTCATTGGATGAAACAGATCGTTTCCTTTG ACAAACTTAAACTTACCAATAATCTACTGGATGACAATGGACACATCATCTTGAATTCGATGCACCG

Moocci.Ebf probe:

GCCGGTTTGCATAGAGCTCATTTTGAAAAGCAGCCGCCAAGCAATCTTCGCAAAAGCAACTTCTTTCATTTT GTTTTGGCTTTGTACGATAGGCAAGGTCAACCCGTGGAAGTCGAAAGAACAGCTTTTGTCGATTTCGTTGAA GGGGAACGAGAAGTTGTTACAACTAGTGGCGAGAAAACAAACAATGGAATTCACTACCGTTTGCAGTTACT CTACCACAATGGAATGCGAACGGAACAAGATTTATTCGTTCGGCTTATTGATTCGGTCACAAAACAAGCAAT TTCCTACGAAGGACAAGACAAAAATCCTGAAATGAGGAGAGTATTGCTAACGCATGAAATAATGTGCAGCC GGTGTTGTGACAAGAAAAGTTGTGGAAATAGAAATGAAACACCTTCCGACCCTGTTGTGATCGACAGATAT TTCCTGAAATTTTTTTTAAAGTGCAATCAAAATTGTTTAAAGAACGCTGGAAATCCCAGAGACATGCGACGG TTTCAGGTTGTTATCTCAACCACAGTTCACGTGGATGGACACGTTCTTGCTGTGTCCGACAACATGTTCGTCC ACAACAACTCTAAACATGGGAGAAGAGCGAGAAGGATGGAACCTTCTGACGCAACACCCGTTATTAAAGC ATTAAGCCCAAGTGAAGGTTGGACTACAGGCGGCGCAACTGTTATTATAGTGGGCGACAACTTTTTTGATG GATTGCAAGTTGTCTTTGGTTCTATGATAGTTTGGAGCGAGCTGGTGACACAACATGCAATAAGAGTGCAG ACACCGCCAAGACATGTGCCTGGTGTAGTAGAAGTAACATTGTCGTATAAGAACAAACAATTTTGCAAAGG TTCTCCAGGAAGATTTGTGTACACAGCCCTGAATGAACCTACTATTGATTACGGGTTTCAGAGACTGTTAAA AGCTATTCCAAGACATCCCGGCGACCCTGAACGTTTACCAAAGGAAATCGTACTAAAGCGAGCGGCTGATG TTATGGAAGCTGTGATGACAAGGTCTTATAACCAAGTCCCGGCGCCTCCTCCAGCTCCTATCCACAACGCAT TTAACGGTTCGTCACCATCCATGATGACAGGAAATGTTAATGGTTACAACCACCACATGCCGTCTGCACAAT ATGGATTAGCAACACCTGATCGACTGGATTCCGCCAACGGTAGCGACTCCGGTAAAATATTTTTAGGAAAC AAATTGGGCGGTAAAAATCTCAATTTATATATTTTAAGTATACTTTTATTTTCCAACTAAATCGAAGTATAGT TATAAAATTGTAGCTATTTATCTTTTTTTTATTATCTAGGTTATTCAAGAGGGAGTGCTTCTCCAAAAACTGGT TATTCGCCACAAGGAACACCCCATAGTACTGCCAATGTTGGATTATCTACTGTTGGGGGTAATGTCCCGCCT TATGGCAATGCCATGAATGGGTATTCATGCAATCCCACTTTCACCAATATGACAAATTCAACATCCAACATGT TTACTGGTGGTGGATTGTTTCCAACTTCTCCAAACGCATGTATGAATGCATTGCCAACATGCGGAAGCACAC CAGGTATATTTTCATTTTCTCCAGCAAACATGATATCAGCTGTAAAGCAAAAAAGTGCTTTTGCGCCGGTAG TTCGTACTCACAACTCGCCGTCTCCAA

Moocci.Dlx.a 3’RACE (VERIFIED SEQUENCE):

GCCGGAAACCCCGCACCATCTACACCAGCTTCCAATTGCAACAGTTAATACGACGGTTCCAACGCACGCAAT ACCTTGCGTTGCCGGAACGCGCAGAACTCGCTGCTTCGCTCGGAGTTACTCAAACACAGGTTAAAATTTGGT TCCAGAATCGAAGATCGAAATGTAAGAAAATTTTAAAACAGCAGATTCTTCACAACAAACAATCTGGAACAT CAGGAGGAAACGACTTCTTTGTTTCTCATCCCAACTCCTCCAGGATGTCTTTTCCGGGTGTAATTGGATCGCA AATGGGAAGCGAGTTAGCGGCGAACCAAACGACCGCGGATCAAAACCCATACCGTTACAACCAACATAAC AGCCCTCAGCAATGGGGTGTTCATGGGTTGCCACATCACTCGCATTTTTCAAACCGTGAACAATTTTCATCTT CTATAGGACAAAACAGCTTAAACACCAACAGAAGTAATCTCGACTCATGGTCAATGGTAATACCGAATTCAA CAAAACGGTCGTGGAGTTATTCTGACTTTCCTCAAAGTCCAACTGCAAATCCACAAATAGGTGCTTCATATA CCCACCGCAATTTTCTATCGACCACCAATGATATAGGCAGACACCCGCAAATGGATTCGAACCCATACTCTG TACCGTCGTTGGATCACAACTCAGCAATGTTTCAAAATAATCCAACGTTACCTTGGAGTTAAAATAACAAGG ATTTATTTTTAACCGTAAACAATTACATACAATTAAATAAACTTTATTGTTTACTTTTATGTCTTATATCTTCAC GCATGGTTTAATATTAGTATGCCGGTTCTTATGTTATATGATTTTTTTAATAAAAAAAAAAAAAAA

Moocci.Tbx6-r.a probe (VERIFIED SEQUENCE): GTCGGAACAGAAATGATTGTAACAAAAACTGGACGACGAATGTTTCCAGGCTACAGAATAAAAATCACAG GTCTTGACCCGGGTGCAAAATATTGCGTTATGATGGACATCGTAAACGTAGATGACAATCGTTATAAATTTC AGCATGGTGAATGGACAGTTGCTGGAAGAGGAGAACCTCATCTTCCCCAAAGATATTTTCTTCATCCAGATT CACCTGCAACTGGAAATAAATGGATGAAAGAACCTATTTCATTTCATAAAGTAAAACTAACAAACTCTGTAG GACAAGACATAGATGGAAAGGTTGTTTTGAATTCGATGCACCGGTATCAGCCGCGTGTTCATGTGGTCCAA TCAGATGACCCATATTCTGTTCACACTCAACCCATGTACACTTTTGCTTTCCCACAAACAGTTTTTATAACCGT AACCGCATACCAAAACGCAGAGGTA

Moocci.Tbx6-r.b 5’RACE (VERIFIED SEQUENCE):

ATCATTTACGTTTCGTTTATATCTTAAATTATTTTAATATACTAACAAATATGGAGAATTTAATTTCGATCAAC GCTGAGAAATTTAAAAATTTACCGGTACAAGATGTTTACAACAAAGCAGAATGCACGGCTTTACAAGGAGA TATAATGAAATACCAGAAAAATTTTAATTCGGTGCAGAATTACAACAGTCCAATCCAAAATGATCAATGGAA CACCGATTATCAACACAATTTACCAGAAGCTACGTACGGAAATCAAACTGAAATCCTAAACAGCTACCACGT GGGTGGGATCAACGTGACTTTATGTCAAGCTGACCTATGGCAACAGTTTCATAGAGAAGGAACAGAAATG ATTTTGACTAAAAATGGAAGAAGGATTTTTCCTGGATTTCGCATAAAATTAAGCGGACTAAAACCCGACGG ATACTATTGCGTTTATCTCGATGCAATTAGTTTAGATAATCATAGATACAAATTTCAAGATGGTGAATGGAT GATAGCTGGAAAAAGTGAACCACAACCACCACGCAGATTGGCTTTTCATCCAGATTCTGCATCTCTTGGTAG CGCATGGATGAAAAATACAGTTTCGTTTCATAAAGTTAAGCTGAGCAATTCTGTTTCTTGTCGCGATAAAAA TGCTTTAATTTTAAATTCTATGCATCGTTATCGACTACGAGTTCATGTAGTAGAATGCTCTGATATTTCCATG GCGCATTTGTTACCTTCGCACTGTACAGTTTTCAATGAAACAAGTTTTGTGACAGTTACTGCTTATCAAAATC ATGAAGTTACAAAACTTAAAATTGCAAACAATCCCTATGCTAAGGGTTTTCGAAAAGATGGCGCTAGAGGT TCAAAGTCTCTTTCAAGCTCGGATAACGAATATGAGAGTTCTAGCAAACGACCAAATATCTCCTCCTTTACA GGCGGTCATCAGCA

Moocci.Lhx3/4.a 5’RACE (VERIFIED SEQUENCE):

ATTTGGTTGTATTAAGAAATATTAAAACTATTTGTTTGAACTTTGTAAAGTTTGTTTAATCGATATCGAAAAC AATGGAGACAGTTTCTTCGAAATGCCTCGGCGAAAACTTTTACACTCGATATGATGATACAAACAAAATGGC GGACAGTGAAATAGACATATCTCGCGAAAATTCTAATCACATGTTTAATGACGTCACAAGTGCGATGTTTGC AGAGGAATGTGACGACACTGAGGTTTATGAAGATGACATCTTGTTTGATAATGATGAAGTCATTAAAACAA ACTTATCGTCGTTTGTTGGAAATCACAAGAAAGATTATTTTTCAACTTCCACGCCGCAAAGAGGTACAAAAA CAAAACAATCTTCCGGGTTAACAAGCGGGTTACCAGCAAAAATGAATCCTTCGTTAGATAAAAATGTGAAC AACAAAAATGTTTTGTACTCCCTTCTAGAAAATGGAAAAAAAATTTCAAATAACTTTTCAAAGTGCACTGGTT GTGGACACCACATATTAGACAGGTTCATACTGAAGGTACAGGATAAACCGTGGCACGCAAAGTGTTTAAAG TGCCACGAGTGTTTGTGCCAGTTATCGGAGAAGTGCTACTCCCGAGATAACTATGTTTTTTGCAAAGAAGAC TTTTTTAAAAGATTTGGTACGAAATGTGCTGCGTGTGGACAGGGCGTTCCACCTACGGAAGTTGTGCGAAG AGCTCAAGAAAACGTTTATCATCTCGACTGTTTTTGTTGTTTTATTTGCAACGAGAAAATGGACACGGGAGA TCATTTCTATTTAATCGAAGACGGAAGACTTGTTTGTAAAAACGATTACGAGCAAGTCAAAGCGAGAGATAT TGATTTTGAAAGTGGATCCAAACGACCAAGGACAACAATATCAGCCAAACAGTTGGAAACTTTGAAGTCAG CCTATAACCAAAGTTCGAAACCGGCGCGACATGTGCGCGAACAACTGAGCGTGGATACAGGGCTTGATAT GAGGGTGGTCCAGGTTTGGTTTCAAAATCGACGAGCAAAAGAAA

Moocci.Lhx3/4.b 3’RACE (VERIFIED SEQUENCE):

TAAAAGTTTATAAATCCATTTTTGAAAAAAAAACAATAACTATGGAATCTTTTATGTTTGAAAGTCCGACAAA GTTCAATTATTTAGTAACAAATGACTCAGGTTACAGCTCTATCCAAAGAACTCCAGACATGTTTACCCAATAC TGTGATAATTTCGTAGAATTGGAAGAAATATGTCCCATACCGTTTCCTACACTGAATCAGGATGATGCAGAA GAACCAATACCAGTTAAAGAAACGCAAAGTATTTCGAATATATCCAAGTTGCTTGCAAAGATACCAAAATGT GCAGGATGCGACCTTCATATATTTGATAGTGAATTAATTCAACTCCCAAACCAATCTTGGCATGAAAAATGC ATTCAATGTTCCGAATGTTCTTGTCCGTTGGATGAAAATTGTTTTGTTCATGACAATCTTCTTTTCTGCCGCAA CCACTTTTACATGAAATTTGGAGCTGTATGTGCTGCATGCGGCGAAAGAATGTCTCCAAAAGAAATAGTTCG TAGAGCAGAAGAGAAAGTTTATCATGTACAGTGCTTTAAATGTACTCTATGCCAAAAACAAATGGGTAACG GAGATTGTTTTTACATGACTAAAGATTGTAGAATAATTTGTAGCCAAGATCACAGTAATTTACAATCTGAAG ATTTAGCCGAAATGGAGATTAAACGCCCAAGATCCATAATAACAAACAAACAATTGGACGTTCTCAACTCAA TTTACAATCAGAACGCAAAACCACCTCGTCACATCAGGGAGCAACTGAGTCGATCGACTGGTCTCG

Moocci.Aldh1a probe

CTAACAATGGTGAAACAATGGACATTATCAATCCTTCAAAAGAAACAATTATTACCAGTGTGTATTCTGCAA CGAAGGAAGACGTCGGTAAAGCTGTCGATGCCGCAACTGCCGCTTTCTCGCTTGATGCACCGTGGCGGAAG ATGGATGCGTCCGAACGCGGCAATTTGTTGCTGAAATTGGCGGACGCAATTGACGCAAATAAACATTATTT GGCGTGTTTGGAGAGCTTGAACGCCGGTAAACCTTACACACATTCATTCTTCATGGATACTCTCGGAATATC GAAAATACTGCGCTACTACGCCGGTTGGACGGATAAAATGCACGGAAAAACTTTTCCGGTAGATGGCGACT ACCTCAGCTATACCAAAGTCAACCCAGTCGGAGTTTGTGGACTAATTCTACCGTGGAATATGCCCTTGATAT CGCTAGCAATGAAATTGGCACCAGCATTGTGTTGTGGCAACACTGTCATTGTTAAACCTTCCGAAAACACGC CACTAACGGCGCTCTATGTCGCCTCATTAGCCATGGAAGTCGGGTTTCCTGCTGGTGTGATCAACGTGTTAC CTGGTGGGCCATCTAGCGGTGCAGCTTTGGCTGAGCACCGAGGCTTGGCGAAAATTTCTTTAACTGGTTCA ATAAAAACCGGGCAGATCGTGAGCAAAGCTGCTTCTGACAACTTTAAAAGACTGACTTTGGAGCTGTCTGG AAAGTGCGCTAATATAATATTTGCTGATACCAACGTGGACAGCGCAGTAGAGCAAGCTCATCAAGCGTCAT TCATGAACCAAGGTCAAATGTGTACGTCCGGAGCTCGTACTTTCGTTCACGAGGACATCTACGAAGAATTCG TCACCAAAAGTGTTGCCCGTGCACAAAGGCGAATGGTTACAGATCCTTTCCAACTGTTTTGTGAACAGGGAC CTCAGGTTAC

M. occulta probe templates were cloned from genomic DNA, as cDNA was lacking at the time of probe preparation. Thus, some of the following sequences will contain introns in addition to exons. Mooccu.Mesp probe:

CCGATGTATTTACTGACCGAGTTCCAAACAAACAAACCTTTATTGCGTATCCTGGGTCTACTGCTTCACATTT CCCTGCTACAAATATCAGCTGTCAATCAAATGGTTTTGTAATCAAAAGAAACCCACTGCGTGACGTCACAAA TGCGAATCACTGTTATAATTATGGAACGACAGGCAAACGAAAATTGGATCTTGAGAATTCATCGCCAAATA AAAGATCAAAGTTTAACAGCTCAAAGACGAAGAAACCAAAAGTAAAATCCCGTCGTGAAATTGCAAGTGAC CGTGAA

Mooccu.FoxF probe:

ATTTCTTGCAAAGTAAATTCGAATTCTTTCGTGGGTCATATCAAGGATGGAAGAATTCAGTTCGACACAATC TTTCATTGAACGAATGTTTCATCAAACTTCCTAAAGGTCTTGGACGTCCAGGCAAAGGACACTACTGGACAA TTGATCCAGCAAGTGAATTCATGTTTGAAGAAGGTTCATTTAGACGTCGTCCGCGTGGCTTCAGACGTAAAT GTCAAGCGTTGAAGCCGTACGGGATATTCGGTGGACCTCCACCTGGTTTGATGGGTCCACAAAGTTACCCA CACCCTGATATGTTCCCACAGGTCGGTGGAATACCACACGGACATATGCCACCGCCCAGACACCAGCACAA TCTTATGGGATTTGACCCATCCCAGATGGGATTCCTGAACGGAGGATCGGTCCCAGCCAACAGGAGTCCAA CTTCACCCTTGACACCAAAACCACCCAGCACGCCTCATTCGCCAAGTGCGCAGGCCGTTCGCGCATATGGAT CACCGAACTCAGGAAACAGCGGACATCATTTGGAAAGCCGACCATCACAGGTGCTACATTCACCGGCAGGT ATGCCGACACCAAACCCTCACTACCCGACAGCTGCCATGTTCAATTGGCCAACACCAGCCGGTCCGCATGCA GGAGCATACATTCGTCATGACGTCACAAGCACCGCTTCCTCACTGGCGGACGCACAGAGTGCTCATTTGATT AATGGAGCACCGAGGATGGACCATCATGGTTTCTACGCACCATCAGAGCGAGGGAACCATGTATCATACGA TGGTAAGTTGAATATTGTGTTTATTCCAAACAAAATGGCGGGCGGATACGTTCGAATTTTACAAGCGCATTT TTGGTAGCGTCTCATTAAAGCGCTAATCTGCAAAGGAATAAGAAACAAACTCTAATTGAAACAATGGATTA ATTCCTGTAATTTGCAGTTTCAAATTTCGTAATTACGGGATATAAAAATTATTATGACATAACAATGGTTTTA TTGACATTTGGCAGATAATTGCGTTTATTATCGTTTCATAATCGCACAATCTGCTAATTTTCGAAATGGGCAA TTTTTTTATCGGCAAATTTGCGAGCTAAATCGCTATCGGGTTACCAAATCGTAGCTGTCAAAAATTGTCACAA GAAATCTTCTAAACCGAAATTGTCCATTCGGGAATTAGAAATGCTACTGGTCAAGATAATTGTTACATCACA TTGGTCATTGTGACAGAGGACGATTATTAAACAATTAAGAAATAAAAATAAACGAATTTTAATTGTTTCAAT CAACTTGTCGAATTATTCACAATTAGTGCGTCTAAACAAACAAAGGTAAAATAATTATAATTTCTATGATGTA TTTCTATACTAATAACTATCATTTTGACGCAATAATCACGCAATTGTCCCTTGGAACGCCTCCCCAAACCTCAC GATTACGATAAATTCTACTATTTACGACTGAATAAATTCGCATTGGGTGGTAAAGTTGAAAAATTTCCGGAC CAGTATTATCAATTTTTAAGGCATTTATGTAATCTGTGTATAATTGCTTGCGTTGTATCTTGCCTCGGGTCATA CGAAGTACAATAAAACGATATTTAAAAAAGGAAAAATCTGATAAATTTCGATCAACAGATAACAGAAAAAT GTACAACTGCGAAGCAGTCTTAATTACCAAAGCGTCGAAGTTCATCTCATATTGTTGACGAACAGCATTTCA ATGTTTAACGATATACGAGATTGCCGTACATTAACGGCAGGTTATTGAACAATTTCAACGGATTTACCGTAA CAAATTTCATCATTACGGTGCGATTTTTTGTCAGTTTTTCGAATTTATTTCAAAGATTTTTAATCTTAAAATCG ACTGATTAATACCCCGTTACGTCACAATACGCGGCATATATAAAACGGCAATAATTATAAAATTAAACGAGA TTTGTGCAATGCAATTAAGTCGGTTATTGAAGCTTTTGATCTTACAATTGGATATTTAACCGCGACACGTGCT CACGACGAAAGTTACGACTCCAATAACCAAAAGTACGACAGATATTCATCCCGAAGGATGTGTCCTTAATTA TCACGTCATAATCGACACACTTTCGCGTATGCTGCGGTGCATTGTGATGAAATAAACAAATATATTTAAAAG CAATTTGTTTTTGAACGCAAAACAAGTTTTCAATTTTACGGCGAAAAAAACTTCGCTCGTCCAAAACGCGCA TGAATAAATTATCGGCTAAGGGCGCCAACAATTCGGAGTGCAAAAAAATTCAAATCGAAAATAAAATTAGT TGTTTCTTGGAGCTTATATGGATCCCCTGATGTTGCTCTGCCACCCACAATGTTCCGCTTTTGGTAAAACCCA TGGAAATATGACGCCAGTGAACCGACGATATTTAAAACATTTCTTCAATTTGGTTATCCGCGCTAATCGCCG AACTTTATCTCCATTTCGTCCCAGCTTTTTGCGGAATGCGTTTTTGACGGAATCCAGATCCGCTGGAACCAGA TTTAAAAAATGCAATATCAACACGTCATAATGCGAATTATAACGTAACAATTTAATCGCATTATGTCTAAATA ATCACCATCAACTCTCATGGCAATCACTGAAAAATCAAAATTCACATGAGCAACTTTGTAAAATCCAAAAGC AATCTTTAAGGGGCAGTAGAGCTACCTACTAATCCACGAGGTTTTAACAGAGCTTATTACCCTGCTTTCCCGT TAGTCCCAACGTAAGATTGGTAAATTAACAGATCAAAAATCACCAAACAGATTCGTCAAACAGAATCGTAA ATAGTTGTAACTGACAAAACAACCTACTTTCATAAGACCACAGGCATTATAAATCCTGACAAACAGGCATTT CACATCGCCTGTACTTTGCACATTAGATACTTGTAATTAATTGCCAGAAGAATTTCATTATAATAATACCATG TCTAAAACTACACATTGAAATTCAAAAAAATAAACCTCGTTTTTTTAACAGGAAGCGGAATGAAATTTAAAA CGGAANNNNNNNNNNGCAAACAGGCATTTCACACCGCCTGTACTTTACACATTAAATACTTGTAATTAATT GCCAGAAGAATTTCATTATAATAATATCATGTCTAAAAATACACATTGAAATTCAACAAAATAAACCTCGTTT TTTTTTAACAGGAAGCGGAATGAAATTTAAAACGGAATGCGCCGTGGATTCTTATGGTGTTGGTGAAAGAA AAGGACCTTACCCTGCTCTACCACAAGGCTTACCCAACACATCAGTATACCCAACTAACTACTATGACACTAA AAGTTGCGCAGTATGAACAACTAATATCTAACAATCGTTGTGACGTCATAAGAGCAATATTATTTATG

Mooccu.Hand-r probe:

AACGCTACTGAGTGGGTTCCCAACCAACAACCTCGTGCTTTACAAGATATCACGTCACAAATGAACGCTGGT TATTCAAACATCCCATCAAAGCCATGCAACTTGCCAAGATGGAAACAATCTGTAACAGCCATTAATCAGATA TCACCAGAAAGTCATATGAGGTGTGCGCCGATCCACTGGGAACATGAAAATAATATCCAAAATTGTGAAGA GTTTCCACCCCAGCAATCCACTGGTTGGATTCATGAAAAGCCACCTTGTGGAACGACAACTTTCCAAAATCA TCGCTTGAGGACCAACAGGAGAAAACGTGAAAGAAACATTAACATTAACAATGCGTTTGATGTGCTTCGGA ATCGAATCCCAAACTTACCACAAGACACTAAAATATCGAAGATTCGAATCTTACAATTGGCATGTGAGTACA TTCGTCATCTTGGTAAAACATTGGAGGAAGATGACGAGAAGAATCAACATTGCTTCACGAATGAACATGTT CTTGAAAGTGAAGCCGAAACCAACACCGAATTCACCATCAACCCACTAACAGTTCGCGCCAAACGACGACG AATCGATTGGAGTCGGATACAGAACGAAATTGAACGACACGAAA

Mooccu.Aldh1a probe (VERIFIED SEQUENCE):

GAAGACGTGGACAAAGCTGTGCAAGCTGCAAAAGCATCCGCTCACGTCGACTCCAAGTGGAGGAAGATGG ATGCCTCTGATAGAGGAAGTTTGATGATGAAGTTGGCGGATGCTATTGATGAAAACAAACATTATCTTGCT GTAAGATGATGAAAATATTGCAAATAATTCCTTTTTGACACAGATTTTTAGTGTTTGGAAAGCTTGAACAGC GGGAAACCTTACACACATACGTTTTTCATGGATACCACCGGGATATCAAAAATTATGCGGTATTATGCGGGA TGGACAGATAAAATACATGGAAAAACTTTACCTGTCGATGGGGATTATTTATGCTTCACGAACGTCGTGCCA TTGGGAGTTTGTGGATTGTTGTTACCAGTGAGTTGTAATAAAAACAAATCGATTGTGTCACAGTCAATTTAT TGTTATTTTCAAAGTGGAACATGCCGTTAATCTCGTTGGGCATGAAGTTGGCTCCAGCACTTTGTTGTGGGA ACACTGTCGTTTTAAAACCATCCGAATACACACCACTGACAACATTGTACATTGCGTCACTTGCCAAACAAGT TGGCTTTCCTGAAGGTGTTATAAACGTCGTGCCAGGAGGACCAGAGACCGGAAAAGCAATAA Ciinte.Dlx.a probe:

ATGGCAACTGTAACCGAGACGGTGAACCAGCAGATCCCGAATCCAATTGACGACACTTCAGGCGCGTCATC AAACTCAACTACGTCACCAGGCAATGACGTCAGACCGTGGGTGCATGACGTCAAACGGGAACCCCCAGAA ACTAATTGCTACCAACAGCACGCCACAAGTAGCAATATACCAGAACAGCCATATCATCACGGACTTTTTCCT ATGAACAGTTTCAACGCTCAGTACAATAACAACAACCAAAAACCCGCTGTAACACCGGAAAATGGCCGAGG TTATTCATACAACCATTATAGCTACCCGGGTACTACCTTGCCAAATCATCATGTACCACAAGATACATCGCCC TCGTTTTTGGAAAGGAAAAGAATACACGAACCGGGGTTCGAAGCTGGGCACTTCGTGTCCAAAGCAACAAA CAATTTCTCGCACCGAACGCCTTATTTTCACGAAACCCCGAATTACAACGTAAACCATCACCAGCCACCCATG CGAGGAGTTTCAAGTCCTCGGAGTGTGGACTCCCAGGAGCAGGTGTTTCAAAACAATCCAAGTGTGCCAGG AATTTCGGAAGCGGAGGAAAAGTTTAATCAATCATTGAGTGGAAACAGTTTCTATGGCGACCATGACGAAA ACGCCAGAGACTCCGACACGGATACTCCGTCGGTACAAAATGGCGACGGCGGACGAGTGAAGGGCAAAA AGACTAGGAAACCACGCACAATATACACGAGCTACCAACTCCAGCAGCTCGTTCGAAGGTTTCAAAGAACT CAGTATCTTGCTCTACCAGAAAGAGCAGAACTAGCTGCTTCACTTGGAGTAACTCAAACCCAGATCAAAATA TGGTTTCAAAACCGACGTTCGAAGTATAAGAAGCTTTTAAAGCAGCAACTTTTACATAAGCATCATGGTGCG GCTGATATCATGTCAATGGGCTTTGGGTTCGGCGGACAGCAGATCGACGAGCAATCAGGACCATACATGAC GTCGCCTTACTCGGAACAATATACACCCGAGAGCCAGGGGTGGGATAATGAAATGACAAGAAGTAGGAAT GACCCATATCATCAGCGTCAGCAACCGCTGGTGGATCAAAACCAGTACCCGGTGAATATTAAGGAGTCTGG AGAGTTACCTGACTGCCGTATGGCGGTCCCACAGCTGCATTGGGAAGCCCAGTACCCAATGAATCCTAACC ACGCGAGTCCTTATTCGAACATACCTGCTACACCACACATGGGGATCCCACTTAACGGGAGAAACCTACCAG GTGTAGTGGATTCGCACCATACTGACCCGGGCACAGCGGGCATGCGAAGAGACGGTATTTTGCAATGGGG CAGTCCATAGAT

CIS-REGULATORY SEQUENCES FROM MOLGULA SPECIES

Coordinates are relative to base “A” of the predicted start codon (highlighted in green when included in sequence) encoded in the mRNA-like strand of the gene in question, and are imprecise due to sequencing gaps and/or polymorphisms between sequenced genome and those of individuals used for cloning of sequences. Primers used to PCR-amplify the sequences from genomic DNA are underlined. XhoI site used to stitch together Moocci.FoxF TVC enhancer to the basal promoter of Moocci.FoxF is highlighted in cyan. For expression of secreted or transmembrane molecules such as extracellular ligands and their receptors, we modified the drivers as to not include the start codon or follow it with a stop codon.

Moocci.Mesp -1148/+21:

5’GTGTTTAGCGATCACGGTTCAAGTTTAGGCTACATCGCTTTTTCCATCGGTTTGCCTAAACTTGCATGCTGT ATACAGTATTAAGAAGGTCTTGTTTAACAATGTTCCTTAAATGTTATTGACATACAAAGCAAACTTTGTGTTA AAAGCCTACTTTAATGTGAAGACCAACATAAAAAAATTATCGGATAGTATAACTTACTCAAAAAAGTTAAGT CTTTGTCCTCTTTGCAAAGCTGCAGTAACTTTATCGAATCCCCCAAGATACACGGATGTTCTGATGATAACTA GAAGCATCCCCACTATCATTACTCCAGCTTGTACAACGTCTGTCCATATCACACCTTTTAAACCACCCTGGAA ATTAAATCATTATTATTATTAAAGATAAAAACCATTTATAAGCCTATTTACAATACAGTTCCAAATTTAATCTG CCAATTCGATTGAACGTTTTTCAATGAAGTAAAATATCTCTCACAATCTTGTATTGAGCCTTTAAAATAGCCT TTTAAATGAAAATCTATATCTGACAAAATAGGCTTTGACGTGATTTGAACGCCGTACCTCATGCTCGTATAA ATACCTAATTTGTTGCGGAATTTCTACTTCAATATAAAAAGTATGCAAATACATACATAATAGTTATTGAAAA GAATTTAAATCATCAAATTTTATGTCTGTTGTAGCCTAAATAGTGTTTTATTTAAGTAAATCTACACTGCGCTT CAGTTCAAACCAACCGTGCCTTGAACTACGGGCAGTGCGGTTGCTATAGACGTTATGCTTACGTAAACTAGT GCAAAGAATTTGTTGGAAAGTGTTAATTGATATCCGACCACCGACTGTGTTATCTTATCGTTTTGATAGATA AGAGCTGATAACACTGATAATAGACTAATTAACTATAGCAGTTAATTTTTATTAAAATTTTCACTTTTCGGAC ATGAAAATTTGTCTAAAACCCAAACTTCCAAACTTCATCTATATAAGGAAAGAATTTTATTGAAATGGCATAC TCAATTCATCAGTATATATCATCTATATCTATATACGGTGGGTAATACGTCGTAATTGATATCGGACAAAGTA AAAACTGCATATTGAAGCGTTAGAAGAAAGTTGTTCAATTCAACATTTTAACAAAAT G GACCAAAGTGTACT GGGA3’

Moocci.FoxF -1517/+21:

5’TTGTCGTACGACCACTTAGCTTAATTACTACGTATTAACGAATAATAGTAACCAGTAAGTGCTTTAATCAC AGGACACCTATTAATTAATGGTGAAGGGCGTTATATCTCATTAAGGCGGAGTTCTCTGAACTTTTAATTCCT AATATAACTTTCTATATACCTGGTTCCGTTAATCTGCGGTTTTTTAAATAATAAAAAAGTTCAAGGTTCAAAA ATTCAGGTGAAGAGTTTTATGACTTGTTTTTCAGAAATGTTTGTTAATGATTTTTATGGCTAGTGACGTCACA CCATCTATTTTCATACAGTAAAATTTAGCAACGTCAGCGAACGAGTAACAGGCAGTAAAACGTCGTTAATAT TCTCCTACATTGGAGCAATTAGCAGATACATTGGGTCGGAAGGGTGACCACATTAAACCTAGGTTCAGTCC AGTGTCATAGTCGGTACGTTCGCGGAAGAACTAATTAACGCGAGCGGATAATAAAACTGGCGGCGCAGTG GAGCGACGAATATTTGAGTTCTGTATCAGCACAGATCCGTGCAAAAAAATGCGTAGTAAAGAAAAAGCGTC GGATTTGGTAAAGTCTCGTCATCGAGATATGTAATTTTGCGATGAGTAGTTCATATTCATTATCTTCCCGATA GGTGCGATATAGTGGTGTAGATTTAAAGAGAGATGAAATAATATTGTTTACGACGTAATGTAAACTAGTTG GAATGTTTATTTACCAACAAGAATTTACGCTGGATATATAAGATTATAGTTTACACTGTATATAAACAATAAA AAAATTGGAAACATTTTAAAGAAAAGTATAAATTTTCTAAAGAAGTTGATTTTTAGGGGAGTAATATCTCAA TTTTGTTAATTTTTATTGGTCCAAATATATTTCAAATTAGACGCATTAGAAATAATTTTCGCCCACTTCGCAAT ATGTTAAATTAGATTTTAATTTAACCGGTAAGCGTTTTGGTCAAAACAGGGCAGGAAATTTAGGGACCTGTG TTTATTGTTGATTCGCAGTATATGACCGATATAGTATTAAAAGAATATTCCACGAATATAATTTGCAGTATCA GTCAGTTTCGACGGTAACAGTAGCTGTTGAAAACAAAATGGATTCCACTAATAGCCGGTTACATATAACAAT TATATATTGAATTTAGCAAGTGTTTAATAGATTGTCAATCTAATCCAATAATTACCAGTTAAAATATTATGCC AGATTTTGAAAGGTATTTGTATACAGTTAAGCTTGTTTTATAACAGTGATATGTTTTTGTTGCAGTCTTATAA GTTCCGCTACAACAGTAATACGGAAACTATAAAAATCAAAGTAGTTAGATAAATATTCTATACGCAACTTGT AATTTTAATAATATTTATTTAATTCTTTTGTTATTTTAAAAAAAGTTCAACTATATATAAAGAGTTATAAATAT TAATATCATTACTTACAATTTTTACTAAATCAACCAACAAGCTTCAGAAAGAAAAGAGTTTTAATATTT CA AT G ATTGAAATGGACGGAAAT3’

Moocci.FoxF -1517/-425 + basal promoter of Moocci.FoxF (“Moocci.FoxF[TVC]”, VERIFIED SEQUENCE):

5’TTGTCGTACGACCACTTAGCTTAATTACTACGTATTAACGAATAATAGTAACCAGTAAGTGCTTTAATCAC AGGACACCTATTAATTAATGGTGAAGGGCGTTATATCTCATTAAGGCGGAGTTCTCTGAACTTTTAATTCCT AATATAACTTTCTATATACCTGGTTCCGTTAATCTGCGGTTTTTTAAATAATAAAAAAGTTCAAGGTTCAAAA ATTCAGGTGAAGAGTTTTATGACTTGTTTTTCAGAAATGTTTGTTAATGATTTTTATGGCTAGTGACGTCACA CCATCTATTTTCATACAGTAAAATTTAGCAACGTCAGCGAACGAGTAACAGGCAGTAAAACGTCGTTAATAT TCTCCTACATTGGAGCAATTAGCAGATACATTGGGTCGGAAGGGTGACCACATTAAACCTAGGTTCAGTCC AGTGTCATAGTCGGTACGTTCGCGGAAGAACTAATTAACGCGAGCGGATAATAAAACTGGCGGCGCAGTG GAGCGACGAATATTTGAGTTCTGTATCAGCACAGATCCGTGCAAAAAAATGCGTAGTAAAGAAAAAGCGTC GGATTTGGTAAAGTCTCGTCATCGAGATATGTAATTTTGCGATGAGTAGTTCATATTCATTATCTTCCCGATA GGTGCGATATAGTGGTGTAGATTTAAAGAGAGATGAAATAATATTGTTTACGACGTAATGTAAACTAGTTG GAATGTTTATTTACCAACAAGAATTTACGCTGGATATATAAGATTATAGTTTACACTGTATATAAACAATAAA AAATTTGGAAACATTTTAAAGAAAAGTATAAATTTTCTAAAGAAGTTGATTTTTAGGGGAGTAATATCTCAA TTTTGTTAATTTTTATTGGTCCAAATATATTTCAAATTAGACGCATTAGAAATAATTTTCGCCCACTTCGCAAT ATGTTAAATTAGATTTTAATTTAACCGGTAAGCGTTTTGGTCAAAACAGGGCAGGAAATTTAGGGACCTGTG TTTATTGTTGATTCGCAGTATATGACCGATATAGTATTAAAAGAATATTCCACGAATATAATTTGCAGTATCA GTCAGTTTCGACctcgagGCAGTCTTATAAGTTCCGCTACAACAGTAATACGGAAACTATAAAAATCAAAGTA GTTAGATAAATATTCTATACGCAACTTTTAATTTTAATAATATTTATTTAATTCTTTTGTTATTTTAAAAAAAGT TCAACTATATATAAAGAGTTATAAATATTAATATCATTACTTACAATTTTTACTAAATCAACCAACAAGCTTCA GAAAGAAAAGAGTTTTAATATTTC A ATG ATTGAAATGGACGGAAAT3’

Moocul.FoxF (VERIFIED SEQUENCE) -1337/+6:

5’GTAGAATGGCTGGTGCTTTGTGAGCGAAAACTTGCCGAATTACTCGCTGCAAAATTCGTAACGGATTAAG ATCATCTTCGCCAACGGCAAGAGCTTTTGACAGGGCTGTTCTCTTGACGGATGGCGGAATAATTAATGTACC ATTCGATAGGAGCTGATTAGACCTCGCTGTTGCGATGCATATGCTCAATGTTTATAGTAAAAACATTCGGAG CCAGAAAACTAATCAGCTAACTCCGCGATTTCATGTCACATGCCCAAGAAAAATTAACTCGGGCATCCGGAC GACTTCAATTAGACCAGCGCGAATTAGCTCCGTTAATAGCGAGATAATTATTACGTATTAAAAAACCACAAT TGGGGAATTATGCGGCTATAATTAGCAGACAAGGTGCTAAATGTCCATCGCGGTTGTTCTGATCTTAAAAA ATCTTTCTTATTAATTCCTATAAAAACACATTTTGATATGACAGCTTGTGCGGTGGGTTTTACGATTTACTTCT GCAAAAGTTCATCCGGCGAAAATGTCGTAAATCTTTACCAGTTCAATTCGTAAGTAATTAAAAAATACGAGA GGTCATGAGGTGGTGGGCTAACGCGAAGTTCAGGCGGTATATAGCATGGTACGTTCGCGGAAAATCGCAC ACCGTTTCATAGTTTTACGACAGCCCCGTGGCGAGCCAGGCGGAACCAATTCGAAAAAATGCCGTAAAAGA AAAGTTTAAATCATCTCCGAACATCGACAAATTGAACTTCACAGACAGCCAGAAACAGTGAAATCGTCAGG AGAGCAAAAGCAAAATTCATCCGCAAATTTTATTGTTTGTTTACGAACTTTTGTAACCAAAATTGTTGTTTAT TTATCGGCTGATATGGCGAaGTGGATGGATAATTTGGTCGGTGGACGATAAAATCAAAAACGCTATTAAAA TTAAATAAACCAGGGACTTTACTAATTCAACATGAGTCGACCAGGAAGAGACGAGACCTGTTAAGTCTTTTT GTTAATTATCACAACGGGAAAGTAGGTCCTAACGATTAGAGAAAGGCAGAACAAAATGGCGAGAGTTTAA CTACCGGCCTCATGTGCAATTGTTACTTTAGATAACGTTTGTCGATTGCCAGGTATAATTACAATCAAAATAT CCAAGTAAATTGTTGCAAAACAAAAACTTTGTTTTCATTAACAAGTTTAGCGCAGTAAATCGGAAGGATTTG AAAGGTTTATATCAATAGAAAATTTACATTTTAATTAACATCGTTTTTGTTTCAGTATATAAAGTGTTACAGC GTAAATACTTGATTAGAATAACCAGCAT CAATCCCAAAGTGTGAA ATG GAA3’

Moocci.Tbx6-r.b -1226/-36 (VERIFIED SEQUENCE):

5’TATGCAAGAGTTGGTATCTTGCATAAAATTGTAATCTTTACAAAGATAATATTTCTCTGGTTTTTGTTGTAA ATTATTAGTAAAAATGTTGCATTAAAATAAAACATTTTCGCCTTTTTATCAATTATTTTGTCAATTTAAAATAA CAAAAATGTTTAGAAATTTAAAACAAATAACTATAAAATAAATACGCTATAAAATAAAGTATTTTACAATAA AACATGAAATTTTTTTTTGAATTTTGCAAATTAATAATTTACCGTCGGGTTATGCGCATAGAGCAACATTGCA ATAGAATAATATTAACCAAGAAATAAATTGTTAAAAATATAAAAAAATGTTTATGCAAATTTTATCAAAAGA TATTTGAAATTTGAATTAAAAAAATATATTTTGAAATATAAAAAAGTTTCTAATTGATGATTGCTGAGGCCTG TTCTTAATTGCTTTGTCGTTTAATTAGATCCTAATTACATGTGTAACAATGTGACTAATTGCTTTTGCTTGTGA ATTGAGCATTTTCCATAAAATTTGTCTATTTTTAATTACTAGTTGTATGTATATTTCTAATAATTTTATTGTGTC TTTATTTTAATTACTTCCTTTTGACAAACTTTTGTTGTCAAGTTTTCACTGATAATTAATTACCAAATTACTTTT TTATTTTAAATTATATGAACATTTGTTGAGGGTGTAAACATATTGTTGTGTTTGATTAATATATAAAAAATTTT ATGTAAATGGAAAAATGGGTTGAAAATAGTTAAAGATACAATTGCATTAAAAATATTATATATATATATTAT ACATTTGCATCTAATAATATTTCAAAATTTTAAAAGTGTCAATGCTAAATTCAAAATGTAATCAAAGCAATAC CGGTACTGCATGTGTTATCACTGATAACTAGACAAGAGAAGTTGAAAATACGAGTGTGAATGTCTCAGTAG TCGAGCTACGCATTATCAGTATCCCGTCGTCGTTTCTCGAGCATTTCCAAAGCACTACCGACGTTAGGTGAA GACACTGATAAAGATAGCTGTCTTGGCCGCCGCAACTGCGAAACCCTCGCTACAAGTTTTACATCACAAAAT ACCATCAAATAAAAATGTTTGAAAAAGTTCAAGTCCTGCCGAGTGAAGTAGTATATAACGCTTTACAAATGT TTCAACATCATCATTTACGTTTCGT3’

Moocci.Hand-r -1226/+21(VERIFIED SEQUENCE):

5’AGGAAGTACTGTACCAACCTCATATTGGAGATTATACCCTTCAGAATTAAACAGCCTGTTCTTGAGCGCGG ACTATCTGGTAGCCAGTACAATACCTTTTTACAGCATCGTAGAATTTAAGTACGGTCATAAAAACAAGAAAT TGCTGGCACGGTCGATACTTGAACCCGTACTATTTGGTCTCCAAGTCAGTGTAGAAACACGATGAATCCTTA CAACACTGTAGCATGCATACCGACGGGAAGTGCTACAACTGATACTTGAACCCTGAGCGCCTAGTCTCGAA ATCAAAAGCTGCACATGCTTAAGCTGCTTAACAAAAGCGCTTTTGTTAAGCCTCGTTCTAATGGCACCAAAA AGTGCCTGCAACGAGATTCGGCGACGCATGAAGACATGAATTTCTTAGTTTTGTAGGTGTGTTGCGGCCTTT CGGGCTAGGCCTACAATAATTCTCCACTGACAATTATCGTGGACGACCGGGAAAAGTCCCAAGTCGCTATT ATGCTTACGCAAACTTTCAAACAGGGGTTGGTTATTTGCGATGTACATGAGATCCAGGCTTTACCGGGGAAT GACAGCTAAAAAATGTCTAAGAATATACTTGGTGCAAACAAGCCAGTTCAAAGGAACCATACTTAAAACTTT TAATCTTTCGTAGTGTGAACGAGATTTTATATCATATATTTAAAGTAAGCTAAAGTCAAAAACAACAAAACA ACTTCACCTCAAATGGCGTAAAAAACGTAATAACCAAGAAAGTCCCAAAAATTTTGCGCAATTTTTAAGTTA TTTAACAAAACCTGCTTTAATAAAAATAATAACAAACCCTAACATCTTGTGACCAGCTTGTTCAACAAATTCT ACAAAATATTGACATAAAATTAAAGAAAATAAAGATTTACCAACACAATATTACATAACATAGACAGTAAAC GATACAGATAATTTCCTGGGAAACAGAATGTCGTAGAATCGCACAAACAATTCCACCTGGCGAAGTTGAGC GGGCAGATGCGCGTGTTTGTTTTATTTTAAGCAAAACAATGCTGAAGAATAGAATCTTGCGCGACCAATTTC TTCATCGGTTCACCTTAATTAAGCAAGCAATTAGCACCGCAAACAAAGTCGGTTAATTAAAGCTTTCCTGCC ATCAAATTTTGACACTCGTCTTAATTACTTTTTTCGTCGTCATAATTTATATATAAACCGACGTGGAAAATTTA AATCATTATAAAACTTAAGCATCAAAGTAATAAAATTAAAAA ATG TTCACCGAAAATTTCTCC3’

Moocul.Hand-r -3060/-19:

5’TTTCTTAATCACGTCTCGTTCCTTGTATACATAAATTGGTGATTTAATTCCAGCATATGGATTGCGAATTTG TTTTAGTTTAAGTTCTTTGAGGTGTTCCGGTTTGAGGAGATATTCCTGCATTGCTCGTACAGCCGTAACAGTG TTATTCTCCGTGTATTTTTCATTAAAATCCCGTTGATTTTGTATATATTTCTTAACAACTTTCGCAATAGTTCCA TCTTTCTTTTTTGTGTCTGTTGTTTTTTCAGAATCTTCGGTTTTTTCTTTGTCTGATGAACTTGATGACAAAGTC CGTTGATAGCAGTTTTGAGGAATAAACAATTTCTTACATTTTGTCACAGTATTTCTTGTAAAAGTTCTTTTTGT ACATAAAATTGCCGACTTAGAACAAATATTCAACATTTGAATTGTTATTGAAACTTTTCCAGTCTTTCGTTTTC AGGTAATTGTTGATTAAGCTCGTCAATTAACGACAAAGTATGATCAAGATTTAAGCGAACTTTTCGCAACAA AGTTGACGTTTCTTCAATTTTCTTTGTGTATTCTGCGTGTTTTGCAAACTTCTTTTGTCGCTCAGTGTATGCTT GCATTAAATTGACAGCAAGTAAATCTAGGGTTTTAATTTTTTCTGTTAATCGACTTTGATCTTTTGTAACCAGT TCAGCACAATCTTTAAGATAATTTTGCAATATCAAACAAACTTTTAAAACTGCTTCTTTATCCAAACCAGAAA CCAGGTCTCCTTCTTCAATCTTCCCACCTTCTTGCAAAATTGCAGACTTTAAGATTGGTAGAAAACTTGGGCA GTAAGACAACCTTTCAACGTGTTGATTTTCGTCTTGATTTAATCCACCTTCCGCAGTTCCTTGTGCAACGACT ACTATTCCACTGGGTATATTTTGCTGTGAATGATTTGAATTGGTCTTTGCCGTGCTATGACTTTGTTCATTTCC CATTTTAAGTTAAAACATTGCACCAAATCTCAAAAGGCTGAATTCTGTCTGCTGTTCAGTGTTTACTTTTTAC GAAATCAACTATGGGAGAAGGGGTTGTGAACATTGGTTATTACATTTAGACTGTAGATTGTCATAGTTTCGT GGAAAATAAGTAATCTTTGCCGAAAGCTGTCATGAACAAAGATTAGCTTATCTCAAGTCTGTATTATATAGG GCTTGGCTAGATTTGAGCAACACTTTGAGTTAACTAAACTTTTTGTTTTAATTATAGTAGGCATATGTCTTCA GTTCGTGATTTATAAAAGGCTTGGGATCATGTAGAATGGATAGGGTTATTGTGGTATAATTTGAATAGCAT GAAATTCGACCTGTCCTTTTTTAGTTATCTAATTGCACCCGATCTATCGCTTAAAGTATAAGAATATAGTTTTA AGAATTGTCAGTAGCGGGCTTCAAACCCCGTCTCTTCCGCACCCAAGGCGAGCACACTATCAGTTCTGTCCC CAAACACATAAGTATAAATAACGATATACCATCGATAGACAATACAAAAATATAATATTATTCTCTTCCATAA TAAAACTTCAGAAATAATAGAATGCGACTTCTTCAATAAAATCATTCATTGTCGTAAGTGGTCGTAAGATAG TAAAACTTGATCTGGAAACCTGAATAAATTTTTAGTTGTGTTGCAGCGAAGAAGTCTGTAGCATGTAGTCCA AGAGATCACGAACTTTGATTTCTGGCCGTTTCTTAAAAACGGCAATGAATGATTACCTCATAACGTGTAGCC AATAGCCTAATGCACGCTTTACCTCTAATAAATCGCCCAATACCTTGAATGCGGGAGCCTTGAATTCAACAA GTTTGTGTAAGCTAATACTTGCCTATACTATTGGCAATCTATAACCACCGCCTAGAAAACTACACGCCTGGC GTTACGAAAATCACCGCTCACCGCATGGTATGATATTGATACTGCGCAGTACATTTTACTCTCTCGACACTTG ACAATGTAAAAATGGCCCAAAAGAACCCTTCTCGACCCATGGTAATTAGAATAATATTTTGCAAACAAATAG TCAAATAGACCATTAACGTTTCGCACAAGCCTGATTTCAAGTTAATTTGCTCCGCCAGCAATTTATATTTATC ATATGGCTACTTATCAAAAAGTGTCCACAAGGTGGTATATATGACGAAGACATAATTAGGCATTTCCATCCT CTATAACATTACATTAAATTTTAACATTAAGAACATAGGCCTACAGCCCTACACAAAAATAATTTCACTTTTT GAGAGTTGTGTAGGCCTATCTGCCAATTTATACCAATAAATTTGTTTCTATAACATCCGATCATAAAACAGTT TGTTTTGCCAGATCAAGGATTAAATATAAAATAAATGTGTTAATGACATCAGAAATACTACAAGTGATAACG GACGCAAGTCTTGGCCTTGCAAGGGCATTAACGGTGGTCTATAGGATTAATTAACTTGCGTATTTAACCATT TCATTTACACCTCATCAAAACCTGTAGGACTCTTATACACTTCATAGCGATTTCAACTAAAAAATGTTGAAAA GCAATATAAGACACCTTTGACTGGAAACAAAACAATAATGTTATTGTTATAAAGCTGTTGTTTAGATATGTC GAATATTTTCTCAGCTTTTTTCGTTTATTAATATCGTAATACATAAATGGCATTAAAATGTGACAGCTTACTTA CCCTCAAACATGAAAACAAAACACAGACTTATTACCATGTTGTTTAACTGCATTGCAAACATATTCACCTGTC GTCTGTCAATTCGCATATGTCATTGTTTGTGTTTGTTACGTCATAATGTTGTAGTGAATACGCTACGGAAACT GAAATTTCGTCGAGCGTGCAATCTAGGCGAGAATAATTAGCGCAACGCAAACAACGTTTCTTAATTAATATC TTTTCCTATTTATCAATTAAATTTTAACAGCTTTTATTTTTTCGCACAATTTTCAATTGTAGGCCTATAAATAGC GAAGTTATATGCAATGAAGTACACTTTTATTTAGTGCATCTTCTCAGTTCAACA3’

Moocci.Sox1/2/3 -1977/-20:

5’TTTTATTTGGGCGTAGAATTGGAAATATTTTATTATTAGAGACGTCTATCAAACTAGTGTTAATTAAAACAT ATAGTGTCAATAAACATTAATACAGTTTCAAATTTAACCTAGAGTTTCTTTTACGTTACTTTTAAAACGATAC GAGCCTTTATATGGTATAATTGTTAAATTTTCTGTAAAAGTTCAAACGTAAAGTTTCTTTTGTAGTTCCTTTAT GGGTTGAAATTTATCCCTACCCCTATATATTTGCTTACTAAATGGACATTACCCTACCGTACTTCAAAGTTACC AAATGGGGAAATTACGAATGTAGGCATGACTCAATCGGTTTTATTTTCGTTCGTGAAACTAATGGCCAAAAA ATCTGTCAATGAAGAATTTTTTTTGCTTTTACAGCTCATATATTTGTCGTAGTTCACACCGTTACATATGTATA TATACTGCTGCACTATGCTGGAATTTTAAAATTTTGTATTTGATGGCAAGAGAGAATAAAGCGTTGGGGAAT ATCAATGTTTGGATTAAGATTTTCGTTAAATTCATTATTGCCGTTAGGTTATTTATTTTTATAGCAAATCTATG TCAATAAAATTGCAATATACATTAAAATATAATTCATCATAACAGTAAGCGATGAGTGACAATGCGGTTTCA CTGGCGTCGGGTTAGAGTAAGGGTGAGGCGGTATTCGTTGACTGACAATTATAACCGTGATATCGTAACGA TATTCAATTTTCTTCTCGTATAAAATTGACTTTTGGGAATGTTGCAGGGTAAATTGGTGCGAAAAAAGTAAA TATCAATTTATAAAGATATGGATTGTTAGACTCTCGTTAACTTACGTGAGAAGTACTTGATCTCTAACTGAAG AGTGGAAAGTGTTCTGCTCGCCATAGCGTCCCGATGTTAAGACTAACAAACTAGTCCTTGTCTTGGCGAAAC TTATGACGTTAAAATCGTCAGTTAAAATATAATCGTTGGCATTACCATTACCCTCTATTCCATTTCATTCCATT CCGACTAAAACACACCCGTTTCGCCAAGGAAAAACACTCGGCCGAAAATAGCTTGCCGGGTTAAGCAGATA GGCGAGACACACTTAAGCAACACCGTAACGTTTCTTCACGCTAAAACTTTCGGCCAGCCCATAAAGCACAGA AATCTTTATTTAGAAATTAGAACGTGTCGAACTTATCATAATGAAATGAGACTATTTAGTTTATCGCTATATT GATCAAATTTTGGAAGCAAAGTTGATAATATATCATAAGATAAGGGTAATATAGTTAATATAGAATATTACG ATAAGAAATTTTTGGCTAAGTAACATTCTAAAATATTACGAAGCAAAATTTGCAAGTGATAGCGTAGCTGTT ATCGGCAAGGTTCCGCTGGGTATCTCCGTACGCTATTATTTATCGCGTAAGAAAAAATGTGTATCTTTCCATA CTCTCATTGCTTGGTTTGTTTAATCAAACTGCGAGCAAAAAAATGCGATGTGTAGAGTAGGATAAAGAGCG AGCGGAGAAGTTATTCAGCGGTAGTTCCAATTGTGAATCATTGTTCAACGGTCACTAGTGTTTAAGTGACAG TGCATCAATAGCTGCGCATTCAAAACGAGAATAGTCTTTGTTAGTTGACGAACAATTGGTCGTTAAATCGTA AGGGTATTGAAGTGTATGTATAGCCAATGTAACATGTAGTACAGTCGGACAATGTTATTGTCTTCTATGAAT TTTATTATTTGTTTGAAAATATTTTATAGTGTAGTTTATACAAGTGATAGTAATTTACACAATAGCCGATTATG AAAGTGATAAATATTAATTTCAAATTAATAATAGTTTCGTTTTATTTAGATTTTCTGAAACAATTAAATATTAT TCTTAAATTATTGGACAAAGAAAAGTAAAACAATTTAACGAAACAACCTACTCGATCTCAAATCTTCGGGA3’

Moocci.Ebf -3294/+12(isoform “a”):

5’AGACAGCCCATGATGATCTCTTGTTAAATTGTCGAGTTAATCTTGGTTGGATCAAAGTCACGTGACTAATA TAGGCTACTTTGTGTTTATAGCTATTATAGATAAACTAGAAACTACTAACAAAGATGAATAAGATTTGGTTT ACATCAGGTTTGACATGAATTAAAGCTAATCCGGTAACAAAATTTAAAGCAAACCGATTATCACCTGATTTA TTTGTATATAGTTTGGTCACGTGACCAGTGGCGCGTATTTAAAAAATACCGGGTATTCTTGTTACCATACTAA GTGAATTACGTGTTACCATACTAAGTGAATTTACAGATAGAATACAACTGATAACTTCTTGGTAATTTTCAAA GATATTCTTGGTCGGCCAAAAGTCTCCTGACTTATATGGTTCTTTTTGCAATTTACCCCATATCTTATAAAATG CTGCATGGACAGAACGTCATAAAATTTGACATGTATATAGTCCATCAAACTATCTGTCCAAAAAATGAAACT AAAATTTTCAGCGAATTAAAAACAGCAAGGCAAAGTGACAAACGAAATAGCTTGACCTTTAGCCTATAACCT AACCGATTTAGCAAATAATATAAAATGTTTGTTTCAAGTGGTCCAAAATATTTTTTATTCTACAATCAACTTCT ATCGATTGAAAGCTAATACTTAAAGAGATGATATAACGAAATCAGGTTTACCATTCAGTTACAGTTATTTAA TGAAGTAACTTATGCTTTTCACAGAACAGCAACCTACCCTACATGCTAAACCGATAGGTCTATACCCAGTTTT AAAATTTTGTCTATATGCTATGCATGCCTGTATATACTCTAACCAACCATCTTCATTTTTTATTTATTGCCACAT ATAATTAGAGATGGCAGTTCATTTATTTTGGGAGAATGTTTAGTATAGAAAAGTGAGCGGAGCGAACATTT ATCCACCAACATTGCCACTAAGTGTATTGGCAACCGACCCGCTGCATGCAGAGCGTAGGAATGCACAAAAT TAAGACACTCCCTATTTATTATATTTAGTAGATTATAATCTACTAAATATGCCGATGCGTTACGTCGCGCCTT GAACAGCGGTTATCACGGTTTTTATACGTAAACTACTACCACTTAAATAAGGAAATTTATCCGACAGCGTAT TGAACTTTCTTAATCGAACAAAGTTTTTCCAAAACATTTCTATAGACATTTAAAATTTTATGCTTAATTTTATG TACCGCATGCTATTTATCCTTTTTACTTTTGCTTAATTTCTAGATCTTTTAATGGCAAGATTTATCACCGTCAGC ACCTTGCACTTATTTAAAATTCGTATTATTACTCTTATATTTTTTTTTAATTTATTCGCAGTATTTGGATGTCTTT ATGGCGTGTATGGCGTTACTCGTCATTGAAGAGAATATTATGTCGATGGCAAAAACCAGATTAAATAAACT AAACTTGGATAATATATCATTTTTTAATGTGAAAAACGGTGCATGACTATATGTGAGATTAAAAAAAAAGTT TTAGGGATATAATACTGCCCTTGAATTATCCTTTTACAAACTGAACAATTCTACTGTTATAAGAGCTGTTTGT AGTTTTGGATTAGGTATAATCTTAATAAAGTATTTTAAAGCCAGTAGTAATTGGGGAATATTTGTAGTAGGA TTAAAAATTTATTATAGTTAAACATAATTTTTCAAATGAACCACGTTAATTTGTCACATACTGTTTGTGATAGA ACAAAAAAATATCATTTTAAGCTCAGTTAAAATTCTTTTAAGATATTATGGCTGATCATTTTGTTCAATATCGC GACATATGGGCGGATTCGTATTAATAATGCATTTAAATATCGACCGATTTTGAGCGTTTGCGTTCTCTCGAA ATACTCTGAGATTTTTGACTATCATTGTTTTGATACATTATGCTTTCAATCTATTGCCTCGTAATTCTGTTCACT CGGACAGACAAACACACAAACGCTTGATTTTAGAATAGTACAAGCGGATATTTAAAACATGTTTTTTGTTAT TGTACACAACTTTTCTATTTAAAGTTGAACACAAAATTTAATAGTTCTCTAATATTTCAGACGTACAAAAAAA TTAAATAAAAAAAAAGTGAATATACATAAACAGATTGTAATATTGTTTGATAACGGCTGGATTAATAATTTC AATAACATTGCCATTTTGTATTGAACTCTGAAATCTGGCCAATACACATCAAGTGCATTTAGTGATTACGGAC TTGTATTTGTTGTCGCCCTCTTTTATTGTGTATTCAAGAGTATAAACATATTCATTATAAAAATAGTCATCTTT AAATGCTTAAAATTAAAAACTAGAAAGTAATTTTTACTAAGTAAGTACGCTATAATATAGGATATATACACA CTAACTTGGATTTGTAGGTAACAGAAAAAAAACATCTATTTTCAAACAGAGTGTATCATAGTCATTAGTATA AAAATGAAGTAAAAGTAAGGATAAAGTAAGTCTCTAAACAATGATAATTCACTAATCGTGTATAAGGATAA CTTTTGGTTTCATTGTTAAAAGTAAATTTAAATTTGGTTAATGTTACACGACATAACGTCAGCGAAAAAACGC CATATTGTATTAATTATTGGGTAATTCGTTTCGGGGTCGTGAAATCTTTAACGAGTAAATAGATAAATATAAT GTCCCGTCGCCTGATAACAATGGACGCGTGACATTTGTTTATTGTTTATATTTACAGTAAAAACAACATATTG TAGGAAAAGATGGCAGATTTCTTCGTCTGACTCGCAGTTCTACAACGTTGTGTAAAAAGAATTAAACATTCC CTAAAGAAATACTGCTTATAATAAAACAAACAAAAATAAAAAGTCGCGAGAGAAAGTTATGAGATAGTTTT TCATTGGTCGATAGATTTATATCAGATATCTCGAGCGAGTTTTATAAACGTCCCCAACGGTACGGCTGAGTT GATCGAGGTAGGCCCATGGGCATTGCAGATGGTTACTCTTTGATTAGAACCACATCCAACTATACAATCATC TCAGGAGGAATTAAAAATAATGCTTGAAAAATATCATTCAAGTTACGCAAGATGCCCATGCTTGTCCCTCGA GTTCATTGTGACAAAAAACTTGCCGTTGGAAAATGCAGAAAAATTATGTCAGAAAAAATTTTTAAATTAAAG TCAAGATTTAGGTTTTAAAGTTTGCAATAAATACATTTTTGTTTTACAGTTGTTAATCTAATTTAAAGCAATAT TTCGGGATAATTA GGTCGATAT ATG GCGTCTCTT3’

PROTEIN CODING SEQUENCES

Predicted START and STOP codons indicated by highlighting.

Primers used to PCR-amplify the sequences from cDNA libraries/clones (or in rare cases, directly from genomic DNA) are underlined.

Moocci.Ets.b full length (VERIFIED SEQUENCE)

5’ ATG GAAATGGCGGATCAACATGTTGTGCCAACGTTTGAACAAAGCATCCCTCCTATTGGAATAAAAGAGG AATCAGATTTTTTCGCTGATGAATTTGAAAATGGTGGGAAGAAATTTTCTTATGAAAGTTTATCAACTCCTAC TTTTCCATTTGGTACTGCAAATGGAAATTTACCACAAACTGCATTTCCTATGCCTGAAAAATTTTCCCACAAA AAGCAAGCTGAGTGTTTGGATGTTTTGAATGAACAAGAAAACAGAAAAGGATCCATGTTGCAGCTAATGG GTGAACCAGGATTAAACCCAGTATTTAAAATGACTCCGCCAAGAGAGTTGAATACTGTCCCCATTGACAAG GTCAATACGAATATCAAAGATACATCGCCTACTCTAGAGAAATTGTCTAATGGGATTGAAAGTACACAGTTA AAAGATGAGTTAGAAAATGATGCTATGAAAAGTGGAAACAAAAAGAAAAAACCACGACTGTTGTTACGCC TCCCTTCACATGATGATGCAGCTCAGGAAGTACCTACTGGTCAAGAATATGGGACAGAATCAAATGTGCAG TACAATACAAGTGGCTCAAATACACCCGTAGATGAAGTCCCTTCAATGGATAATGTGCTCACGAAGTCAATT GAAGAAGTTCCGAAAACTCCACTTTTTCCTCTTGTTACTTCGGGTACTGGAGCAAAGATCAACGATGCTATC ATACAGACATTTGAATCTTTTAAATCTGTCATTAATGAAAAAAGAATGCCTAAGGACCCAAGGCGCTGGCAA GTTGAAGATGTTTTGCAATGGACACGCTGGATTGTTCGGGAGTTCAGCATCCCATCGTTTGACGAAACTAAT TTTAGAATGTCAGGCAGTCATCTTTGCGGTTTAAAAAAGGAGGCATTTTTGAAACTTTGCCCCCCATTTGTTG GAGAAATTTTGTGGGAGCATCTGGAACAACTTCAAAAAGATGAAATGGGTTCTACTGAAACAGGTCAGCCT GCTATTCCACCATTCAATTGCAGTATGAACAACAACAAATCGTTGCCATCACATAGCTTCAATGCACCATTGA CACCAATCTCACCGCAGTATCCACCAAATCCATCTTATGGAAAGTCAAATCTGCACAGAAGCATGTCTGTGA AACAAGAAACAATGAGTGGTCCGTCCCGCTTCCCCACACACCCACTTACACACTCACATAGCTTTGATAGTG GCAGTGATTGCCAACAAGAACTTGGATGTCATATACCAACACCCCTACCTCCAGTATCTAATCCTTCAGTGTT CAGAAGAAGTTGTTCTCAAGATGAAAGTGGAGGCAAGGTTCAGTTACACACAATGACTCCACTAAGGGAA GAAGAGTCCTCAATGTACCCACACCTTGAACACCTTCACAGATCCCAGTCAAATGTTCCATCCAGTTTGCCAT GTGTCAGTAACCAAAGTCGAAGGCCATCTGACATCTCTCACCCATTTCCAACCCCAACCACCCCTAATCTACC TCCATTTCCCCAACCCCAAGATGGAAAATGTGTTACACCATCTGACCCCAGACACCCTCCAGGACCCCAAGA TAACTGGCAAGATCTGTATTACGCTAACCTTGCTAATTACCATCACCACCAACATATGGAAAACATCAAGCG TCAGGAAATAGCTCGAGATAAGCTTCATGGTAATATTCATGGAAATCATCCTGTACCTCACCCTGCTTATCCA AATGTTAAGCATGAAAATGTTCCACACCAGGGTTACTGGGGTCCCCAGCAGCACCCACAGTTCCACCAACA GACAATGAAACCCTATGGTATGGAAGAGCGTGCCATGAAGGACCGGCAGTACTTCGGGCCACCAGGAATG TTCCCACCTGGTGGAGAATTTCCAAGCAATCCTGTAATACCTGGAGCTTTCTTAACCGGATATAATGGAAGT GGACCTATTCAACTGTGGCAGTTCTTAATCGAGCTGTTGACTGACAAATCCTGCCAACACTTTGTAACTTGG ACTGGGGATGGTTGGGAATTCAAGATGCTCGATCCTGATGAGGTTGCAAGAAGATGGGGAAGAAGAAAA AATAAACCGAAGATGAATTATGAAAAACTATCAAGAGGACTTCGGTATTATTACGACAAAAACATCATTCAA AAGACGGCTGGAAGGCGATATGTTTACCGATTTGTATGCGACCTTCAAAGTCTCCTTGGTTATTCGCCAGCC GAACTACATCAAATGTTGGATGTAAAAC CCGAAGATAAAATCACTGGAGAT TAA3’

Moocci.Ets.b DBD (DNA-binding domain, to insert in between NLS and VP16/WRPW domain)

5’CCATCCAGTTTGCCATGTGTCAGTAACCAAAGTCGAAGGCCATCTGACATCTCTCACCCATTTCCAACCCC AACCACCCCTAATCTACCTCCATTTCCCCAACCCCAAGATGGAAAATGTGTTACACCATCTGACCCCAGACAC CCTCCAGGACCCCAAGATAACTGGCAAGATCTGTATTACGCTAACCTTGCTAATTACCATCACCACCAACATA TGGAAAACATCAAGCGTCAGGAAATAGCTCGAGATAAGCTTCATGGTAATATTCATGGAAATCATCCTGTA CCTCACCCTGCTTATCCAAATGTTAAGCATGAAAATGTTCCACACCAGGGTTACTGGGGTCCCCAGCAGCAC CCACAGTTCCACCAACAGACAATGAAACCCTATGGTATGGAAGAGCGTGCCATGAAGGACCGGCAGTACTT CGGGCCACCAGGAATGTTCCCACCTGGTGGAGAATTTCCAAGCAATCCTGTAATACCTGGAGCTTTCTTAAC CGGATATAATGGAAGTGGACCTATTCAACTGTGGCAGTTCTTAATCGAGCTGTTGACTGACAAATCCTGCCA ACACTTTGTAACTTGGACTGGGGATGGTTGGGAATTCAAGATGCTCGATCCTGATGAGGTTGCAAGAAGAT GGGGAAGAAGAAAAAATAAACCGAAGATGAATTATGAAAAACTATCAAGAGGACTTCGGTATTATTACGA CAAAAACATCATTCAAAAGACGGCTGGAAGGCGATATGTTTACCGATTTGTATGCGACCTTCAAAGTCTCCT TGGTTATTCGCCAGCCGAACTACATCAAATGTTGGATGTAAAACCCGAAGATAAAATCACTGGAGAT3’

Moocci.Tbx6-r.a (VERIFIED SEQUENCE)

5’ ATG CAGAGTACAGAAATAGCAAACTTTCCGTGGTCTTACGGACAATCTATTACCACCACTGAAACAACTA GCTTTAAAGAAAATGGAGAACATTCAACTGAAGATTTAGTTTCATTAGCGTTTGCAGAAACAGAAAGAAAA TCTGAGGAAAATGCTTCTATAATATTTCCAGCTCCTTTCCAGCATCCTTTATTTGACGACAAAAAAGAAGAGA AGGATAATGCGTATATATCCCAGTTTTCTGCTTCACAGCATAATCTTTCAAATTACGACCACGTATCGCCAAA TGATCAAAGTTTTAAACCCACAGACATACAACTTGAACTGTGTGACAGAGATCTGTGGGATCAGTTTTCAAA AGTCGGAACAGAAATGATTGTAACAAAAACTGGACGACGAATGTTTCCAGGCTACAGAATAAAAATCACAG GTCTTGACCCGGGTGCAAAATATTGCGTTATGATGGACATCGTAAACGTAGATGACAATCGTTATAAATTTC AGCATGGTGAATGGACAGTTGCTGGAAGAGGAGAACCTCATCTTCCCCAAAGATATTTTCTTCATCCAGATT CACCTGCAACTGGAAATAAATGGATGAAAGAACCTATTTCATTTCATAAAGTAAAACTAACAAACTCTGTAG GACAAGACATAGATGGAAAGGTTGTTTTGAATTCGATGCACCGGTATCAGCCGCGTGTTCATGTGGTCCAA TCAGATGACCCATATTCTGTTCACACTCAACCCATGTACACTTTTGCTTTCCCACAAACAGTTTTTATAACCGT AACCGCATACCAAAACGCAGAGGTCACAAAATTAAAAATTGACAACAATCCGTTTGCAAAAGGATTTAGAG ATGACGGAGCAAGGTCTAAAAAGAACCGTTGTGAAGGAAACAATTTTCAAAATGACGTTCAGTTTGTTCAA CAACAAAAAGTTCAATTGTTACAAAACGAAAAAGTTTCACCACAACCACAATACACTCCATGGAAAACACAG CCATATGTGTACCAGAATTCACAATACAATAGTCATTTTACGAACAATTTTCCACAAAGCTTTTGCAACTGGA CCAAGCAACGTTCAGAATTGGAACAGTTCATACCTGTTTATGAAGATCAAATGAATTTTCATTTGCAATATA AACAATGCGAACAATCTTATTACCAAAATAACGTGTCCCCAACAAATATAACATCCACACCTCAAAAACGAT TTATTCCTTGTCCACCTGAATCAAACCCTATACCAATGCCAAAGCCGCATTCTCAAGAATACCCACAAATCGA AGCCGCCCAATCAACAGACAGCGGGATTGGTTGGTCCCCACCTACGTCTTCCGACGACGACACGTCATTAAT ATCCGTTGGAGGACCAGAACAGTTTGAAGGAGTACTTAATAGTAATAACGAAGGAGCTAATAGCGTTCAGT TTGAAAGCAACAACAGTTTTTCGCAAGATTGCAGTTCACTTACAAGCGAAGTTTCTAATCAAGATCCGCAAG ACTTTCAAAATTTAGATT GTCCAGATGAGTGGTCTTAC TAA3’

Moocci.Tbx6-r.b (VERIFIED SEQUENCE)

5’ ATG GAGAATTTAATTTCGATCAACGCTGAGAAATTTAAAAATTTACCGGTACAAGATGTTTACAACAAAG CAGAATGCACGGCTTTACAAGGAGATATAATGGAATACCAGAAAAATTTTAATTCGGTGCAGAATTACAAC AGTCCAATCCAAAATGATCAATGGAACACCGATTATCAACACAATTTACCAGAAGCTACGTACGGAAATCAA ACTGAAATCCTAAACAGCTACCACGTGGGTGGGATCAACGTGACTTTATGTCAAGCTGACCTATGGCAACA GTTTCATAGAGAAGGAACAGAAATGATTTTGACTAAAAATGGAAGAAGGATTTTTCCTGGATTTCGCATAA AATTAAGCGGACTAAAACCCGACGGATACTATTGCGTTTATCTCGATGCAATTAGTTTAGATAATCATAGAT ACAAATTTCAAGATGGTGAATGGATGATAGCTGGAAAAAGTGAACCACAACCACCACGCAGATTGGCTTTT CATCCAGATTCTGCATCTCTTGGTAGCGCATGGATGAAAAATACAGTTTCGTTTCATAAAGTTAAGCTGANC AATTCTGTTTCTTGTCGCGATAAAAATGCTTTAATTTTAAATTCTATGCATCGTTATCGACTACGAGTTCATGT AGTAGAATGCTCTGATATTTCCATGGCGCATTTGTTACCTTCGCACTGTACAGTTTTCAATGAAACAAGTTTT GTGACAGTTACTGCTTATCAAAATCATGAAGTTACAAAACTTAAAATTGCAAACAATCCCTATGCTAAGGGT TTTCGAAAAGATGGCGCTAGAGGTTCAAAATCTCTTTCAAGTTCGGATAACGAATATGAGAGTTCTAGCAA ACGACCAAATATCTCCTCCTTTACAGGCGGTCATCAGCAATATAATCCACAAGGCAATTCAGTTTACCACCAA CCCATTGCTTCGAACTACGGAAACCAGCAACAGCTTTTCCAGCCTTACTATCCACAGCAAACCTACTCAGCCT ATAATCAGAATAATGAAAATCAATTTTATCCCGAAATATTATTACCAAATCTCCAAATTCAAAAAGCAGAAA CTATTCACCAACCGGCTCCAGCAATAGATAGTGATGAAATATTAGACTTCCTCGATGATTTTCAACCAAGCTC GGCAGAGGTTCTTAGTTCTACAGGAAATGTAGACGCTGTAAAAATGCATACGCCTTTACTCGAACAAGTCA CAAATGTATTGGGTTTTGAAAACTTTGACTATACTAAACTTGAAACTATTGAAAACTCAAGATACCCATCTCT AACGGTTCTTGATGAAGGTTATTCTTCGCCAACTTGCTCCAGTTCTCCAGAAAATCATGCGCCAATAAATGG TGTATTT TGA TAA3’

Moocci.Lhx3/4.a (VERIFIED SEQUENCE)

5’ ATG GAGACAGTTTCTTCGAAATGCCTCGGAGAAAACTTTTACACTCGATATGATGATACAAACAAAATGG CGGACAGTGAAATAGACATATCTCGCGAAAATTCTAATCACATGTTTAATGACGTCACAAGTGCGATGTTTG CAGAGGAATGTGACGACACTGAGGTTTATGAAGATGACATCTTGTTTGATAATGATGAAGTCATTAAAACA AACTTATCGTCGTTTGTTGGAAATCACAAGAAAGATTATTTTTCAACTTCCACGCCGCAAAGAGATAACTTTT CAAAGTGCACTGGTTGTGGACACCACATATTAGACAGGTTCATACTGAAGGTACAGGATAAACCGTGGCAC GCAAAGTGTTTAAAGTGCCACGAGTGTTTGTGCCAGTTATCGGAGAAGTGCTACTCCCGAGATAACTATGTT TTTTGCAAAGAAGACTTTTTTAAAAGATTTGGTACGAAATGTGCTGCGTGTGGACAGGGCGTTCCACCTACG GAAGTTGTGCGAAGAGCTCAAGAAAACGTTTATCATCTCGACTGTTTTTGTTGTTTTATTTGCAACGAGAAA ATGGACACGGGAGATCATTTCTATTTAATCGAAGACGGAAGACTTGTTTGTAAAAACGATTACGAGCAAGT CAAAGCGAGAGATATTGATTTTGAAAGTGGATCCAAACGACCAAGGACAACAATATCAGCCAAACAGTTGG AAACTTTGAAGTCAGCCTATAACCAAAGTTCGAAACCGGCGCGACATGTGCGCGAACAACTGAGCGCGGAT ACAGGGCTTGATATGAGGGTGGTCCAGGTTTGGTTTCAAAATCGACGAGCAAAAGAAAAGCGACTAAAAA AAGATGTGGGCAGGCAAAGATGGGGACATTTTTACTCTCAAACTCAAGTCTCAGATGACTCGGTGGATTCA AAACAGGAAATCAAAGACACACAATTTTCCGAACAACAGTCACATTTTATCATAAGTAAAGAAGATATAAGT ATCGCATCTCACGAAAACGACATGTACAAGGACAATGAGGGAAGTTTTACGACGTTCAACCCCGATTTCCCC CAGCACTTTCTCTCGCCATCCAACCACCCTGATACTTCTCAATTCCTCGCGTCTGCAGCACTTAACTTGAGAG TTTCCGAAAACGTGTTGCCTCGGCAACACGAAAACTTCACTTTCATTCCGTTTTCTCCCGAAAGCACAAATTC TGAATTTAGTAAGAGTCCAGAATCTTGGTTAGGTGATTTTGATAAAAAACAAT CATCGTTT TAG TTTGGACA AACG3’

Moocci.Lhx3/4.b (VERIFIED SEQUENCE)

5’ ATG GAATCTTTAATGTTTGAAAGTCCGACAAAGTTCAATTATTTAGTAACAAATGACTCAGGTTACAGCTC TATCCAAAGAACTCCAGACATGTTTACCCAATACTGTGATAATTTCGTAGAATTGGAAGAAATATGTCCCAT ACCGTTTCCTACACTGAATCAGGATGATGCAGAAGAACCAATACCAGTTAAAGAAACGCAAAGTATTTCGA ATATATCCGAGTTGCTTGCAAAGATACCAAAATGTGCAGGATGCGACCTTCATATATTTGATAGTGAATTAA TTCAACTCCCAAACCAATCTTGGCATGAAAAATGCATTCAATGTTCCGAATGTTTTTGTCCGTTGGATGAAAA TTGTTTTGTTCATGAAAATCTTCTTTTCTGCCGCAACCACTTTTACATGAAATTTGGAGCTGTATGTGCTGCAT GCGGCGAAAGAATGTCTCCAAAAGAAATAGTTCGTAGAGCAGAAGAGAAAGTTTATCATGTACAGTGCTTT AAATGTACTCTATGCCAAAAACAAATGGATAACGGAGATTGTTTTTACATAACTAAAGATTGTAGAATAATT TGTAGCCAAGATCACAGTAATTTACAATCTGAAGATTTAGCCGAAATGGAGATTAAACGCCCAAGATCCATA ATAACAAACAAACAATTGGACGTTCTCAACTCAATTTACAATCAGAACGCAAAACCACCTCGTCACATCAGG GAGCAACTGAGTCGATCGACTGGTCTCGATATGAGAGTAGTACAAGTTTGGTTTCAAAATAAACGAGCTAA AGAGAAAAGAACAAGAAATACTAACAGAAGAG GCAGTTGGAATCGCTAT TAA ACA3’ Ciinte.Ets.b (DNA-binding domain used for activator/repressor fusions in this study in yellow)

5 ’ ATG GTAGACCAACATGTTGTACCTTCATCTTTTGATATTAATATTCCCTCAATTAATATTAAGCCTGATGAT GATTTCTTTGACAATGATCTCGACTTTGATGTCAAACTCTCCAATGAAGATTTTTCATCACCAGAAGACTTTG TATCGACTCCTGTGTTGCCAGATGACTTTTTACCAGATTTGAACCACTGTAGTATTAAGCAGTCGTCATTCGA CAAGCAAATTGCATATGAAAACTTATCAGCACACGATGCAAGCCACATACAGTGCAATGAATCAACAGAGT ATTCAAGTTCCTACAACGGCAAACATGAAGTATGTACACCTGTGAAGAACTACCCTGGAAAGGGAAAAGAC ATTTGCAACATCACACCAAATGTGACTCCAAGATCTGCACAGAAGTCGATGCCAGGCACTCCGCTGGAGGA GCTAACGGGTCTACCTGAGAAACTAGCACCAGAAGATGTGCCAAAAACACCGTTGTTCCCACTTATTACACC TGGTACGGGAGCAAAAATGAACGACGCAATCACTCAGTCATTTTCCTCATTCAGGAATATAATGGAAGCAA ACAGCATGTCAAAAGATCCAAAGCTCTGGAGTGCCCCACAAGTGAAAACATGGGCAAGATGGATCGCACA AGAGTTTAGCATCCCATCTTTGGATGAAAGTAATTTCTGCATCTCTGGATCAATGATGTGCAGTCTGAGGAA GGAGAGCTTTTTGCATCTTTGTCCTCCATTTGTGGGCGAGATATTGTGGGAGCATCTTGATAGGTTGCAGTC AGAATGTGGAAATGACACGAGGATACCAGAATGCAGCAACTTAAACCAAAATAACGACAAGATTTCATCAT CTACAACACCTCAGAACCCACCCTCCTGCACCACCAACCCACCTTACCCTACTAGACCTGCACCTCCTTACAC AAAGAACCCAAGCTTCAACCAACCCATACAAAACCACTTTTCCTTGGACCAACCTCCACAATTCAAAGAAGA AAGATACAGACCCCAACATCTTGATACACCAAGCCATTTCAACCCTACTGATGCCCCTCCTGTTGATATGTCT TGTGTAAAAAGAGAGCAACTTCCACACTACCCAAGCCATGCCTTCCCTGTGAACACAAACCGCCGAAACTTC TCCTTCGAACATTCAATGAACATTAAACCTGAACCAATGTCACACATCAATGCTTTTGACATGCACAGGCAG ATGTCGCACCCACACAAGCCAAACCAGCGCTTTGGAATGCATATGGAGAACAGGCGCTCCTCAGAGCCTAT ACTGACACCTTTGAAGCCGTTCTACAGACACAGACCATTATCCCAGCAGATGTCTCACCCCTTCCCAACCCCT ACAACCCCCAACGCACCAGAGCTACCCGGCCACCCCATGCACCTTCCCCCGCATGAAATGGGGGGCCAACA AAACCTTCAAGATCTTTACTACATAAACATAGCAAGTTTACGACATCATCAACAAATTGAAACCATGAAGAG ACACGAGATGGCCAAAGGTAAAATTCAACAGACGATCACGAACCGAAGTTTTGGTGACCAACAAGTCAACC AACATCATATGTTATCCCGTAGTGACTCCGTGGGTTGGAATGGCAACAAGGGGAACATTAATGGTCTACTA ACCCCTGAACCAGAGGATTTTGAAGGTGGTTTTATGCAACACTCCCGAATGAACAGCTGCATGACACAAAA CACAACAGCAGAGTTTCCAAGCAACCCTGTTATACCTGGAGCTTTCCTTACAGGATACAACGGGAGTGGTCC AATCCAACTGTGGCAGTTCCTTATTGAGTTACTGACAGATAGATCTTGCCAACACTTCGTTACATGGACTGG GGATGGCTGGGAGTTTAAGATGATTGACCCAGATGAAGTAGCAAGGAGGTGGGGAAGAAGGAAAAATAA ACCTAAGATGAATTATGAGAAACTTTCAAGAGGATTGAGATATTACTATGATAAGAATATCATACAAAAGA CAGCTGGAAGGCGTTATGTTTACCGGTTTGTTTGTGATCTTCAAAGTTTGCTGGGTTATTCACCAACAGAAC TTCATTCAATGTTGGATGTGAAGCCTGAAGAT CGACTAAGTGATGAT TAA ACAATGTACA3’

REFERENCES FOR PREVIOUSLY PUBLISHED CIONA SEQUENCES

Ciinte.Mesp driver: Davidson et al. 2005

CiinteTbx6-r.b driver: Christiaen et al. 2009 Ciinte.FoxD driver: Shi and Levine 2008

Ciinte.FoxF[TVC] driver: Beh et al. 2007

Ciinte.Hand-r driver: Davidson and Levine 2003

Ciinte.Sox1/2/3 driver: Stolfi et al., submitted

Ciinte.Ebf driver: Stolfi and Levine 2011

Ciinte.Tbx6-r.b (coding): Christiaen et al. 2009

Ciinte.Lhx3/4 (coding): Christiaen et al. 2009

Ciinte.Ebf probe: Satou et al. 2002 (C. intestinalis Gene Collection Release 1 identifier: 02i14)