Universidade Federal De Pernambuco Centro De Ciências Biológicas Departamento De Genética
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UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO CENTRO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS DEPARTAMENTO DE GENÉTICA PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM GENÉTICA E BIOLOGIA MOLECULAR DISSERTAÇÃO DE MESTRADO ANÁLISE DA DIVERSIDADE GENÉTICA POPULACIONAL NAS ESPÉCIES Chamaesyce hirta (L.) Millsp., Chamaesyce thymifolia (L.) Millsp. (EUPHORBIACEAE) E Xylopia frutescens AUBL. (ANNONACEAE) ATRAVÉS DE FINGERPRITING DE DNA EM FRAGMENTOS DA FLORESTA ATLÂNTICA DE PERNAMBUCO DIEGO SOTERO DE BARROS PINANGÉ RECIFE 2009 UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO CENTRO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS CENTRO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS DEPARTAMENTO DE GENÉTICA PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM GENÉTICA E BIOLOGIA MOLECULAR DISSERTAÇÃO DE MESTRADO ANÁLISE DA DIVERSIDADE GENÉTICA POPULACIONAL NAS ESPÉCIES Chamaesyce hirta (L.) Millsp., Chamaesyce thymifolia (L.) Millsp. (EUPHORBIACEAE) E Xylopia frutescens Aubl. (ANNONACEAE) ATRAVÉS DE FINGERPRITING DE DNA EM FRAGMENTOS DA FLORESTA TLÂNTICA DE PERNAMBUCO. DIEGO SOTERO DE BARROS PINANGÉ Dissertação apresentada ao Programa de Pós-graduação em Genética e Biologia Molecular da Universidade Federal de Pernambuco como requisito para obtenção do grau de Mestre em Genética pela UFPE Orientador: Profª. Drª. Ana Maria Benko Iseppon Co-orientador: Prof. Dr. Marccus Vinicius Alves RECIFE 2009 Pinangé, Diego Sotero de Barros Análise da diversidade genética populacional nas espécies Chamaesyce hirta (L.) Millsp., Chamaesyce thymifolia (L.) Millsp. (Euphorbiaceae) Xylopia frutescens Aubl. (Annonaceae) através de Fingerpriting de DNA em fragmentos da Floresta Atlântica de Pernambuco / Diego Sotero de Barros Pinangé. – Recife: O Autor, 2009. 91 f., il., fig., tab. Dissertação (mestrado) – Universidade Federal de Pernambuco. CCB. Departamento de Genética, 2009. Inclui bibliografia e apêndice 1. Genética de populações 2. Fingerprinting de DNA 3. Floresta Atlântica I Título. 575.17 CDU (2.ed.) UFPE 576.58 CDD (22.ed.) CCB – 2009- 121 SUMÁRIO Página Lista de Tabelas........................................................................................... i Lista de Figuras..................................................................................... ii Lista de Abreviações.................................................................................. iii Resumo................................................................................................. 1 1. Introdução Geral............................................................................... 2 2. Revisão da literatura.......................................................................... 4 2.1. Mata Atlântica.............................................................................. 4 2.1.1. Distribuição e Ocorrência....................................................... 5 2.1.2. Fragmentação...................................................................... 6 2.1.3. Fragmentos Urbanos e Peri-urbanos....................................... 8 2.2. A Família Euphorbiaceae e o Gênero Chamaesyce............................ 10 2.2.1. Biologia e Estudos Ecológicos.................................................. 12 2.3. A Família Annonaceae e o Gênero Xylopia........................................ 13 2.3.1. Biologia e Estudos Ecológicos................................................... 15 2.4. Análises Genéticas em Populações Vegetais.................................... 17 2.5. Marcadores Moleculares................................................................. 20 2.5.1. Marcador DAF..................................................................... 22 2.5.2. Marcador ISSR....................................................................... 23 2.6. Análise de Diversidade e Parentesco................................................ 24 3. Referências Bibliográficas.................................................................... 27 4. Manuscrito de Artigo Científico........................................................... 39 5. Manuscrito de Artigo Científico........................................................... 58 6. Conclusões........................................................................................... 85 7. Abstract.............................................................................................. 86 8. Apêndice........................................................................................................ 87 A minha Vó Iracema, núcleo e força propulsora da alegria do Clã Sotero. Dedico. Agradecimentos Primeiramente, gostaria de iniciar agradecendo a minha mãe Nilde Maria de Sotero Caio e minhas irmãs Daniella Sotero de Barros Pinangé e Dayse Rosângela Sotero Pinangé, pelo constante e inapelável apoio durante todo o processo aqui realizado, uma vez que sem elas esse caminho ficaria ainda mais árduo. Gostaria de agradecer ao Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) pela concessão do auxílio financeiro, essencial na realização do trabalho em pauta. Ao Horto de Dois Irmãos e a Usina de São José por permitirem o acesso às áreas de coleta, Reserva Ecológica de Dois Irmãos e os fragmentos de Mata (Zambana, Pezinho e Piedade) respectivamente, sendo indispensáveis na consolidação desta pesquisa. À Prefeitura da Cidade do Recife por ter disponibilizado a Guarda da Brigada Municipal para nos acompanhar nas coletas dos fragmentos urbanos da região metropolitana do Recife, em especial na Ilha do Bananal, ponto de coleta fundamental neste trabalho. À minha orientadora Ana Maria Benko Iseppon, por mais uma vez ter acreditado em mim, disponibilizando a continuidade de meu processo acadêmico. Agradeço pela paciência, pelos ensinamentos, sempre disposta a me ajudar tanto no meu crescimento profissional quanto pessoal, deixando-me orgulhoso em participar de um grupo tão importante. Neste caso tornou-se uma amiga singular e por isso serei eternamente grato. Ao meu co-orientador Marccus Vinicius Alves, fundamental na indicação dos materiais a serem estudados, pelos ensinamentos em campo, pela paciência e conselhos prestados desde o início de sua colaboração. Adicionalmente, gostaria de ressaltar seu importante apoio na reta final da minha dissertação, bem como os conselhos dados para planos futuros. Aos membros do MTV (Morfo-Taxonomia Vegetal) Anderson Alves, Bruno Amorim e Catarina Pinheiro pela ajuda e ensinamentos nas coletas realizadas ao longo do trabalho. Aos membros da Banca Ariadna Lopes, Valdir Balbino e Rodrigo Torres pelas fundamentais sugestões, auxiliando no enriquecimento das abordagens do presente trabalho. Em especial gostaria de agradecer ao Profº Rodrigo pela intensa ajuda e colaboração durante a realização das análises do presente trabalho. À Professora Ana Christina Brasileiro Vidal pelas colaborações, ensinamentos, e conselhos, sempre se mostrando harmoniosa em suas colocações. Gostaria de registrar a importância da minha noiva Nara Diniz Soares Pessoa, pois de início, de uma amiga de turma do Mestrado 2007, logo me mostrou um belo caminho de companheirismo, cumplicidade, amor e paz imprescindíveis, tornando-me um homem muito feliz em tê-la ao meu lado. De fato, esteve presente na alegria e na tristeza. Gostaria ainda de agradecer a sua filha Laís Diniz por ter-me apresentado a amizade mais pura que pude receber. Aqui registro meus sinceros agradecimentos a elas. A todos os meus familiares representados na figura da minha Vó e matriarca do clã Sotero – Dona Iracema Sotero (Don Soterone!), pelo carinho, atenção amor, torcida e fé, tornando-me muito felicitado em estar rodeado de pessoas tão boas. Em especial gostaria de agradecer aos primos-irmãos Rafael Sotero e Rodrigo Sotero, pois desde o início de minha caminhada acompanharam-me com a mais genuína força e carinho. Aos irmãos Geyner Cruz e Diego Pontes por todos os momentos de companheirismo, dedicação, amizade, auxílio e aprendizado, sendo mais do que importantes na construção desta caminhada, a eles um muito obrigado! Á Helena Macedo e Islene Araújo, pela amizade e por serem importantes na vida dos irmãos supracitados. A Mário Correia, por ter participação ímpar nos ensinamentos laboratoriais que culminaram no meu crescimento profissional, sendo possível a concretização dos projetos propostos no início dessa caminhada, e pela incansável amizade, agradeço. Ainda neste parágrafo gostaria de agradecer a Heidi Lacerda pela amizade, auxílio, apoio e incentivo prestados desde os tempos da graduação, mostrando uma infinita capacidade de fazer o bem. A Amaro de Castro e Ebenézer Bernardes, inicialmente colegas de laboratório, mas que tão logo tornaram-se amigos/tutores, por toda a atenção, amizade e apoio prestados desde o início da minha participação no grupo LGBV. Fico grato pela participação ímpar deles na minha vida acadêmica e pessoal. Aos colegas do Laboratório de Genética e Biotecnologia Vegetal: Kyria Bortoleti, Hayana Azevedo, Luciene Silva, Isaac Cansansão, Alberto Vinícius, Giovane Feitosa, Bruno Leite, Rafaela Oliveira, Rodrigo Oliveira, Lidiane Amorim, Nina Mota, Ana Carolina, Jaílson Gitaí, Luis Belarmino, Agatha Silva, Derovil Santos, Claudete Marques, Vanessa Souza e Valéria Fernandes pelos momentos importantes gerados na interação laboratorial, gerando ensinamentos mútuos em diversas esferas. Em especial a Santelmo Vasconcelos e Karla Barbosa pela amizade, incentivos, apoio e carinho construídos. À turma do Mestrado 2007 pelo ótimo relacionamento gerado durante o período das aulas, em especial a Petra Barros, Gabriela Souto, Felipe Alecrim e Will Barros pelo estreitamento gerado decorrente das afinidades durante as infindáveis leituras de artigos