Supplementary Materials

Supplementary Table 1. Primer sequences for all coding exons of 32 double-strand DNA repair genes and conditions for PCR amplification.

Gene Name Exon Name Primer Sequence Tm Cycle Number ABL1 E1AF TCCCTCTACGCTCGCTGACC 55 35 ABL1 E1AR GAGGAAAACCATGAGCAGAA ABL1 E1BF GGCCCCCGACGTGCTG 60 40 ABL1 E1BR CGGCGAGGCCTAGGAA ABL1 E2F GCTTCTGAGAATAAAACTAA 55 35 ABL1 E2R CCACTAGCTGCCCACAACCC ABL1 E3F AATCAATGAAAAAGAACGAA 55 35 ABL1 E3R CAATCCGACAGCAGGACCTC ABL1 E4F CTCTTTGAGCTTGCCTGTCT 63 35 ABL1 E4R CGCCTTGCCCCACGTACCCT ABL1 E5F AAGCTCCATTTTGCATTAAC 55 35 ABL1 E5R CTGGGGGTGCGGCGCGAGAC ABL1 E6F CAGTTGTTTGTTCAGTTGGG 55 35 ABL1 E6R CTGTGACTCCATGGCGCAGG ABL1 E7F AGCAGTGGTGGATTTGTGAA 55 35 ABL1 E7R AAAAACCCTCCTGTAGTCAG ABL1 E8F GAGGTCTGCTGCAAAGGTAA 55 35 ABL1 E8R CATATACTCGTGAGAACAGG ABL1 E9F AGAACTGCTAGCCCCGTATT 55 35 ABL1 E9R ACTGCAGGTACCCCGGGATG ABL1 E10F CCACACCAAGCCAACACCAG 65 35 ABL1 E10R GGAAGAGCAGTGGGGTTGGG ABL1 E11AF AGCGATTCTCCTCTGTCAGC 63 38 ABL1 E11AR GTCAAACTGTCTTCCCGTGG ABL1 E11BF CATGGGGCCAAGGACACGGA 55 40 ABL1 E11BR CACAGCATCAACCAGACTCG ABL1 E11CF AGGGAAGGCTGGAGGAAAGC 63 38 ABL1 E11CR AGCTCCGACGGGCCTGACAC ABL1 E11DF CCTCGGGCCTCCCCCAC 63 35 ABL1 E11DR GGCTTGGCAGCGTCACTGTT ABL1 E11EF GCAGGGAAGGCTGGAGGAAA 60 40 ABL1 E11ER AATCCACATAGCTCACGCAGAAC ABL1 E11FF CGCTGTGCCTCGCCATCT 60 40 ABL1 E11FR CCTGACACCTGACCCCTGA ATF2 E3F AGTGACTAGTTTTGGGGTGA 55 35 ATF2 E3R AGTGACTTGTTTTGTATGGA ATF2 E4F TTAAAATATGTACTCTAAAGTGTC 55 38 ATF2 E4R AATTTCTTGCCAAAAGTTTC ATF2 E5F GTGGTTTTACATGTTGTGGA 55 35 ATF2 E5R ACCAGACTATATTATTTACAGAGA ATF2 E6&7F GAATTAACAACTGACTGAACC 55 35 ATF2 E6&7R ACTGTTCCTCCCCCTTACT ATF2 E8F TTGTATTTTTAAATGCCACCC 55 40 ATF2 E8R ACAAACTTAATTCATGTATATGTTC ATF2 E9F TTTAAATGATATGATTATAGGAGT 55 35 ATF2 E9R AATTCAATTTCATAAGCCAGT ATF2 E10F AAATTATTACAACAGCAGTAAAG 55 35 ATF2 E10R ACATTAATTCAAAACAGCC ATF2 E11F TTCATGATGATCTTTAAGGAC 55 35 ATF2 E11R TGCTGAATAATAAAAACAACAC ATF2 E12F CCCCCTTTGACACCCTTTAC 55 35 ATF2 E12R TGGAGGCCCAACTAGGAA ATF2 E13F ATATGTTTAGTCTGTGGTAAGGT 55 35 ATF2 E13R TTTTTAAAGTAGCAGCTCAGT ATF2 E14F TGGTGCATTCTTACCGATT 55 38 ATF2 E14R TGGTCTTTCCTTGATTTCCCT ATR E1F CCGGGTCCTATGCAGAAAAG 55 35 ATR E1R GAGAGCACGTGAAACCCAAG ATR E2F TCAACATTGACACTGAACAC 55 38 ATR E2R CTACATGGAGAAAATGCTAC ATR E3F CACAGTCTGGTTTCTTAACA 55 35 ATR E3R GTGAATGCATGAATAACAGC ATR E4F TAGCACTTCGGATATACTTG 55 35 ATR E4R CATACTTAACTAGTAACCTG ATR E5F TCTAATACATTCTTGCTGCC 55 35 ATR E5R GCACTCCCTTGGCTACATTT ATR E6F ATTGCATATGAATATCTCTC 55 35 ATR E6R TAAATCCAAGTTCATTACAG ATR E7F TACTCACAATTTCTTTTGGC 55 35 ATR E7R TATTCCAAACACGCACTTAG ATR E8F CCTCAGACCATCGTTTATAG 55 35 ATR E8R CAGAGTAAGACTCCGTCTCA ATR E9F CTCACTGACACTTAGCTGAC 55 35 ATR E9R CCTGCATACATAGCCAGACA ATR E10F CTAGGCTTTGTTTTACCAGT 55 35 ATR E10R TCAAGGCTTCAGTCTAATTC ATR E11&12F AACTTAGGATTCTTCATGGC 55 35 ATR E11&12R CACCATTTTTAACAGCAAGC ATR E13F GCAGCATTTGTGTTCTTCCT 55 35 ATR E13R CTGCTGTTGCCTATAGTCCA ATR E14F GTCTGATTATGTCATCTGTG 55 35 ATR E14R ACTGAATTGCAAACCTCAAG ATR E15F TATTTTATAGTATGGAGTGGAC 55 40 ATR E15R GGATAGGCTATAATTTACTCA ATR E16F GGAGACCTACCAGGATAGAA 55 35 ATR E16R AGCAGCCAGAAAATGACCAA ATR E17F CTACATGTGAAGATATATGC 55 35 ATR E17R GAATGTTTGTAGCTAGATGC ATR E18F TACTGGGTGGGAAGCACTTG 55 35 ATR E18R GAACCCAATTTCCCTCAAAG ATR E19F TTCCATGTTTAAAGCTGCCT 55 38 ATR E19R GTGACAGTTTCCACATTACC ATR E20F GCTGAGCATCTTAGACATAG 55 35 ATR E20R GGAACTTGGGAACAATTCTG ATR E21F CAGGCCTTTGGAAATGGTTG 55 35 ATR E21R GATTCCTAATTCTCAGTCAG ATR E22F CTAGCTCAGGAAAACATACT 55 35 ATR E22R TGTCTGGTTCTAGGTGAAGC ATR E23F CCATGGAAAAAGCAGTACAC 55 35 ATR E23R CCAGTAATGACTATATCCAC ATR E24F CTGCTTCACTGTGGACTTAC 56 38 ATR E24R TGTTGGTCAGGCTGATCTCG ATR E25F CTGAGGTAGTCAACTGAAGG 55 35 ATR E25R GTGTGTGCTAGGCATTCAGA ATR E26F CTCACATGCTACTCTTTGAC 56 38 ATR E26R ATAGCCATACATAGGTCTAC ATR E27F AACATGCCTGGCCAATTGTG 57 35 ATR E27R AAGGGAAGAGCTAATTGGTG ATR E28F GGAGCAAGACTCTCTGAACA 55 35 ATR E28R GACTGGCCACATTAATTTTC ATR E29F GCCATGAAACAAATGCTTAC 55 35 ATR E29R TCCAGAGTTCCTATTCAGGG ATR E30F CCCAAGCTATTATTGAAGTG 55 35 ATR E30R CTCCATTCAGATGCAATAAC ATR E31F TGGATAGTTTCTGGATAGAG 55 38 ATR E31R ATCTCCTGACCTCATGATCC ATR E32F CCTGGACCACAGAGTGAGAC 55 38 ATR E32R AGGTGACATTTATAGGCCAG ATR E33F TTCTACCAAAGACAACTGTG 57 40 ATR E33R TAAGAAATACAAACACCCCC ATR E34F GTATTGGGAACAGAGGCTTT 55 38 ATR E34R TATGATGACATTTCCCTGGC ATR E35F GAGATGAAGCAATGTTTCAG 55 38 ATR E35R ATGTGCTTTGCCATATAGAC ATR E36F TTACTTCCCAGCATAGCGTG 55 35 ATR E36R GCTAAGACATGTGATAACAG ATR E37F GGAATGTAGAACTAAGTGAG 55 38 ATR E37R TTAGACTGTCCAGCCAAATC ATR E38F AATTGGCAAGTGACCTAACC 55 35 ATR E38R GACGCCCTGGAACTTGTATC ATR E39F TGGCAATATTTGTATGGCTC 55 35 ATR E39R CCCAACATCAGTTTATAAGC ATR E40F CACAGACTGCTGAACCTTTG 55 35 ATR E40R CTTCACAAATAAGATTCACG ATR E41F TCACTACATAATATAGCTGG 55 38 ATR E41R GCAACTCTGAAATAAAAGCA ATR E42F GCTTCCTTCCTACCATTCAG 55 38 ATR E42R TAGTACCCACACTGTATATG ATR E43&44F GGCTGATGTGATTAATGGAT 55 35 ATR E43&44R CTGCTACTAACAGGTATGTC ATR E45F GAATCTGGACATGAAGTTCT 55 35 ATR E45R CATATGTAGGGGCCAATAAT ATR E46F GTATACACTTAGAGATGGCA 55 38 ATR E46R AGAGATGAGAACTATAGCTG ATR E47F AATTCCAAATTATTAACATCTG 60 40 ATR E47R TGAGAACGTAAATTTATGTTGT ATRX E1F TGTGCTTTGGAGGAGGTAGCC 55 35 ATRX E1R CCCAAACACCCGACTCAGA ATRX E2F TTTCTTTCTACACCCACAACT 55 35 ATRX E2R AAAATAAATGGTTACCTCC ATRX E3F ATAGTGTGAGAATGGGTTTG 55 35 ATRX E3R ATGCTCTACTTGGTTAATCG ATRX E4F TAGGCACATAAATAGCATCT 55 35 ATRX E4R AATAACTTTTTGTCCCTTC ATRX E5F TTTATGTTCTTTGGGTATTGT 55 35 ATRX E5R GCCATGTTTGGTCGTTTGT ATRX E6F GCAATGTTGGCTTTATCTG 55 35 ATRX E6R GTAAGCACATCCGATTTTC ATRX E7F CAAAATGCTGACTAAAGTAA 55 35 ATRX E7R CGGTATGAAATATCAACAG ATRX E8F AGATTTTCCCCAGTGTTTTT 55 35 ATRX E8R CGATACTATGAAAGACAAACC ATRX E9AF TGAGTTTTGTTGGGAATAATGTTT 60 38 ATRX E9AR TTCTTTGGAGAAAATCTGGATG ATRX E9BF TTGTTGGACTTGGTCACTGC 60 35 ATRX E9BR TCTGAATTATCTGTTGCCTGCT ATRX E9CF AAAAACTGATTGAGACCACAGC 60 35 ATRX E9CR TGTTCTTTGTTCCTCTGTTGGA ATRX E9DF GAAAAACCTTGTGCTTTGGAA 60 35 ATRX E9DR CCTCCTCTGTTGTCTTTTGAAG ATRX E9EF GGATGGCAGCAGTGGAAC 60 35 ATRX E9ER TCGCCTCAAGGGTGTAGTCT ATRX E9FF TGGTCTGAACCCCAAGTTAGA 60 35 ATRX E9FR CTCATCCTGCTCACCTCTTTG ATRX E9GF TGCCAAAATCTAAGCAATCAGA 60 35 ATRX E9GR TGCTGTGTTTCTCATCTTCAG ATRX E9HF GCATGAGTAAAATTGGTGCTG 60 38 ATRX E9HR TTTGGTTTTGAGATGCTTGC ATRX E9IF TCCTAAGAAGCAGCAAGCAA 60 38 ATRX E9IR CTTTTCTCCATCAGTTGTTCCA ATRX E9JF GGCACTGAAAAGTTACCTGAGC 55 35 ATRX E9JR AATTTCTTCTTTCCCTCAATTCT ATRX E9KF TTGGAAAGAGTTCAAGGAAGAGA 57 35 ATRX E9KR AAGAAGATGAGGATGTAATGTCAGC ATRX E9LF TCTGATGCTGAGGAAAGTTCTG 57 40 ATRX E9LR AACTCAAGAGGGGGAAGTACA ATRX E10F GACCCCACTTAGTTTGCTTTA 55 35 ATRX E10R TGCTTGCTGTTCCGTTGC ATRX E11F TGGCACATTTATTTCTATT 55 35 ATRX E11R ATTTCTTGGTCAGATATTCTT ATRX E12F CAAAATAGATATACGAGGCA 55 35 ATRX E12R CTAGGATTACAGGCATAAGC ATRX E13F ATGTCGAGTCAGTGGTAAAT 57 35 ATRX E13R GGCATGGTCATTCAGATT ATRX E14F TGCATACAGAGGTAGAACAG 55 35 ATRX E14R ACAGAGAGGTAACAGCATAA ATRX E15F TAATGGAATATGAAATGGATAA 60 40 ATRX E15R GCAACAGAGCAAGACCCT ATRX E16F GGTAAGACTGACCATTGCTTGA 57 35 ATRX E16R GCTGCCTCACACCCAAATA ATRX E17F TGGTTATGTTTTTGATGTGTT 57 38 ATRX E17R TTCTTGTTCACTGCTTTATCT ATRX E18&19F AAGCAAAACAAAGCTATAA 55 35 ATRX E18&19R ACCACAACAAAGACCAGAT ATRX E20F CAAATACGGGAGCAGATAAAA 55 35 ATRX E20R ACAGCAGACTAAGATGAACC ATRX E21F GGGGAATTTTTCTAAGTCT 55 35 ATRX E21R AAATATGTTGGGATTGTTATA ATRX E22F GTTTTCTTATATGTTTAGTGCC 55 35 ATRX E22R GAAAAAGAACAACAGACATAG ATRX E23F CCAAAAGTGTTTATGTCACAAG 55 35 ATRX E23R AGTTTATTCTGCTTCCAATAG ATRX E24&25F CGTGCCAATTAACTTATTC 55 35 ATRX E24&25R AAAGGCAACATTCATTAGA ATRX E26F CCCATCAGTTTCTTTCTTACTC 55 35 ATRX E26R AGCAATAAAAACATAATCAAAA ATRX E27F TGCTGGGATTTTTGTTACA 55 35 ATRX E27R AGTTTTGTTTCTTTTGTTGCTA ATRX E28F CCAGTAAGCAGAGCGATA 55 35 ATRX E28R GTGGTTAGGGAGTGATGACA ATRX E29F AAAAACTAAGTATCAAAAAGTC 60 35 ATRX E29R TGTTTCCCTCTCTGTAATAC ATRX E30F CGTATTTATCCTTGATTAAGT 55 35 ATRX E30R CACGTTGGTTTGTTAAGC ATRX E31F TAGCAATCAGGTTTTAGTTTCT 55 35 ATRX E31R CTGTTTCAAATGTGACCC ATRX E32F GAATGTGGATTCTTTTCTAAAC 55 35 ATRX E32R GGAACCCTCAACAACAAG ATRX E33F TAAAACCGACTGCTCTAAG 55 35 ATRX E33R TTGGAGGTTGGAATAAGACA ATRX E34F CCGAATATCTTAAAATACCTT 57 35 ATRX E34R TTATCAATGACTATCCATCCC ATRX E35F TGTTTTCCTTTTGGTATGGT 55 35 ATRX E35R TTCTGTTAAGTCATTGATTCCT CLSPN E1F AAAGCCCCCTCTGGATTGGT 55 40 CLSPN E1R TGCCCGGCCTTCTAAGC CLSPN E2F TTGATGATCCCACGATGATT 55 35 CLSPN E2R CCGCAACCTATTCCTAA CLSPN E3F GGACTAGGAGGAAGATCA 55 35 CLSPN E3R TACCCAAGCAATAGCAA CLSPN E4F TGATCCAAATTGCCATA 55 35 CLSPN E4R AAGGTCAGAAGCAGTTGATT CLSPN E5&6F TCTTCAGCTAAAGCATCCTC 55 35 CLSPN E5&6R TGCCTCAAAGTTTACTGG CLSPN E7F TAGTGATGGCTTTGGTTATT 55 35 CLSPN E7R TTATGCCAGATGTTTGCTAC CLSPN E8F TAGCAAACATCTGGCATAA 55 35 CLSPN E8R AAAAGCTACCAGGATAATCAC CLSPN E9F CAGGAGTTAGTAGCAAGGG 55 35 CLSPN E9R GCCTCCAAGGAAAAAGATTCTA CLSPN E10F AAAGCCCAGAATACTAGAGTC 55 35 CLSPN E10R ACAAAACAACGTAATTGCC CLSPN E11&12F ATATTTCAGGCTACCAGTG 55 35 CLSPN E11&12R ATCAAAGCTGAGGGACAA CLSPN E13F TTGCCTATGAATTTTATCTGAC 55 35 CLSPN E13R GCAAAGAGAGGAGGAGA CLSPN E14F CCCCTCAACTACAATTTCC 55 35 CLSPN E14R AGCAGTACCCAGCACCATTC CLSPN E15F TCTTGATCTCCTGACCTCGTG 57 38 CLSPN E15R TGATACTTGGGTGTGGTAAGC CLSPN E16F AGCTGGCATGACTTTAGAT 57 38 CLSPN E16R TTCTCAGAAAAGGTGCAA CLSPN E17&18F ATAACTTGGCTGACTACTTG 55 35 CLSPN E17&18R AATACACCTGAAGGAATGGAC CLSPN E19&20F GCTTTTCTTTGCTTCCATATT 55 35 CLSPN E19&20R CCCGTAACTGATTGCTTT CLSPN E21F ATGGATGGGAAAAGTTTACA 55 35 CLSPN E21R AGCTAAGGGACAGTCTCATAA CLSPN E22F TCACAATCCAGGCCATGCTAAC 55 35 CLSPN E22R CAATCCAGGGGGCTAGAC CLSPN E23&24F TGGCTTTAGCATATTGATTTAG 55 35 CLSPN E23&24R CAACATTGCAGCATAGAGG CLSPN E25F TTGCTTGAGAGCTAATTGAAGG 55 35 CLSPN E25R GATCATTGGCTGGAGTGTCA EEF1E1 E1F ATGCGGGAGGTTCTTGTTCTG 55 35 EEF1E1 E1R CCGCGCCGCCTCTCCTT EEF1E1 E2F CAATGTTATTACCAGTTTCATC 55 40 EEF1E1 E2R TTAACAGTTCATGCATTTCAG EEF1E1 E3F TGGCAATATTTTGTTTTCT 55 38 EEF1E1 E3R TTTAAAAATCATTCTCAACACT EEF1E1 E4F TTTTCAACTTCTATCTCCTACT 57 40 EEF1E1 E4R AAAATTCTATCAACTTCAACA FAAP24 E2F CTGGCTTGGAGTGGAATGCAGG 60 40 FAAP24 E2R CAGGGGAGGAAAGGGCTG FAAP24 E3F AAATCTGCCTATTATTGCCATC 48 40 FAAP24 E3R GGGATTACTGGCGTGAG FAAP24 E4F GGCACGAAGTGATAGCATTC 55 40 FAAP24 E4R ACAGGACTACCACGAAGGTGTA FAAP24 E5F GCTCACGTGCTGTTGCTTTC 65 40 FAAP24 E5R CCACAAACACCAGGATCTTGTT H2AFX E1AF AGAGGTGTGTCCTGGGGGCTT 65 40 H2AFX E1AR AGCTCCTCGTCGTTGCGGATG H2AFX E1BF GGCCCGCGACAACAAGAAGA 60 40 H2AFX E1BR TTTGTGGTGGCATGGGGAG HUS1 E1F CGCGACGCTTTTCTGTTACC 55 35 HUS1 E1R CCATCCCCGTTCTGATCC HUS1 E2&3F TTTCCACCGAGAAGTTGAT 55 35 HUS1 E2&3R AGGAGGAACTGACTCTAATGC HUS1 E4F GGTTTGTTTTGTTGTTGC 55 40 HUS1 E4R AGTCATGCCATTTAATGTG HUS1 E5F GGCCCTTGTCATTACTAGAG 55 40 HUS1 E5R GCCGTCCCACCAAATACTTC HUS1 E6F TGTGTGAAAGCTGTTGCC 55 40 HUS1 E6R TCCAAAGCAAAATATAACCC HUS1 E7F TCAGGATGCTAAAATCAGT 55 35 HUS1 E7R ATGCAATCTGTTAGACTAGAGT HUS1 E8F AGGGAAGACAGATGCCTAAAAC 55 38 HUS1 E8R CATGCCAACTCCAGCGAC LIG4 E2AF AGTTGAATCTTATCTTTTAC 57 38 LIG4 E2AR TGCTCAAGTGCTGAACTCTG LIG4 E2BF AACGACCTTTTAGACTCAAT 55 35 LIG4 E2BR AGTCTCATGCCCTAGCTTTT LIG4 E2CF ATTCTGATCTGCAAACTTGT 55 35 LIG4 E2CR CTTATCTTTTCAATTCGTGG LIG4 E2DF ATTAAAGCAGCAGAGATCGT 55 35 LIG4 E2DR TTCCTTCAGTTGGTTCAAGT LIG4 E2EF CAGCCTCGCTTTATGATTCA 55 35 LIG4 E2ER GGCATAGATTTTTAAGATAC MRE11 E2F TTGTGCAGCGTAAATCAT 60 35 MRE11 E2R TCACAGTTGACGAGCTTTAG MRE11 E3F GATGAACTCTAAGGCTAAA 60 35 MRE11 E3R AGGGAATATGGTAGATAGTG MRE11 E4F TTTTTATCTCTTTCATCTGTAGTTT 55 35 MRE11 E4R ACAGCAAATACCATACACAAGT MRE11 E5F GCAGTTTGCCTATGATTGC 63 35 MRE11 E5R GCTTGTATGAATGTGAAAAGTC MRE11 E6F TTCATGCAGATACCTACTTTTACA 60 35 MRE11 E6R AAAGAATCACACATGGACATAAACA MRE11 E7F TTTTTAAGCCGAAGTAAGA 55 38 MRE11 E7R TGAAAGATTAAGGGCATT MRE11 E8F CTTTAGTGAATGGAGAAAGAAAGA 60 35 MRE11 E8R GGCCTTAAACCTATGAGATGA MRE11 E9F AGCTTTCGTTTGCACATCAC 60 35 MRE11 E9R CAGTGTCCTTACAGGCTTCA MRE11 E10F GCTGCTATTCAGCCAAGTT 60 35 MRE11 E10R GAGCACTCTCCTCACTACTTTTCA MRE11 E11F TTCAAAGTATCAAGCATAAACACTG 63 35 MRE11 E11R AAGATTCCTTCACAAATCCTA MRE11 E12F GCCTTACCTTCTCCACTGACA 55 35 MRE11 E12R CATTTTGAGGATTCATTTTGTT MRE11 E13F CTTTGCTTTTTCTGGTTCCTG 60 35 MRE11 E13R TCTCAGAGCTACTCTTAAAGACAGAC MRE11 E14F ATTGTAGCCCCTTGTTTTAT 60 35 MRE11 E14R AAGCAGCCATCCTAAGC MRE11 E15F CTTTCTCCTTCTTCTCCCTCTT 60 40 MRE11 E15R TTCCACTCAACTGCCAAGTG MRE11 E16F TTGTATGAAATAAACCTTAGCTG 60 38 MRE11 E16R TGATTACCTTGGTCTTTCTAATG MRE11 E17F AGAAGTATGCAAGTTTTTCTAAGT 63 35 MRE11 E17R CTTCCAGCTTTAATGTTCCA MRE11 E18F CGTGTAATTCATTTCTTCATTTTCA 63 35 MRE11 E18R CCCTTGGTCTGTTTTCATTCC MRE11 E19F AGAAAGGCACACTTGATGAAT 60 35 MRE11 E19R TCACGCAATTCCCATGTAAC MRE11 E20F TGGTATTGTTTTGCCCATAAG 60 35 MRE11 E20R GCATGTTTCTCAGTGCCATT NBN E1F ACTTCGAGGTGAAATCCTTATCTTCAT 55 35 NBN E1R ATTTTCCCGGTAGCGACTGCCTC NBN E2F ACTTACATGTATGTGTGTGTTCGTGT 55 35 NBN E2R TCACTAGTTTCCAGTAAGGGGG NBN E3F CTTTTCTTTTGAAAACTTTTTCTCTGAGAAG 55 35 NBN E3R ATTGATTTTAAAATGGACAGCTTTGT NBN E4F TTAAAGTACTAAAAATTGCCATCTCTGC 55 35 NBN E4R GTTCTTATGTTAAAAATAAGTTATTTGAAT NBN E5F AACTTAAAACTTTTCTTTAAAAAATGCT 55 35 NBN E5R CAAGATGTCACTTATATGATAGCAT NBN E6F TGTCAGATAGTCACTCCGTTTACAA 55 35 NBN E6R GCTAAATTTTCCTAAAGAATACAT NBN E7F TTTCCCAAATCAAATTCTTAT 55 40 NBN E7R GTAAAAAACTGCAAGTAGGAG NBN E8F TGCTTTATCTTGACATTATCTGAA 55 35 NBN E8R AGCATTATTTTATTGATTCGTTAG NBN E9F TAGTCTAACAATTTTAAGTGACCAG 55 35 NBN E9R CGTACTATTGTTATTATTCTATCAA NBN E10F TTCTCTATTAAAGTTGCTGTAAACTTG 55 40 NBN E10R GATAACTTCTCTCATGTCTCTGAAA NBN E11F AACTAAATGGTTACTTAGCTGTGTTC 55 35 NBN E11R GAGAGGTATAGTACATAGAAGCTTAGAA NBN E12F AAGGCCAAGAAGTGATAGAAACATACC 55 35 NBN E12R TTTATACAGATTTGGCTTACGGGGACT NBN E13F TTCCCAAATGACAAGTGACTTTTCT 55 35 NBN E13R TATCACAAGAGGTCAGTGTTTGAAAT NBN E14F AAAAAATGGTCATTTTTGTTTGTTAATAT 55 35 NBN E14R AGTGAGGCCCAGAAACTTGCTTAAAT NBN E15F GGAAATCTCTAAGATGACAGTGACCT 55 35 NBN E15R TTTAGTTCTGTTCATAGAAATTAAGAA NBN E16F AAGTGTGACTACAGTTTGAAAGTTC 55 35 NBN E16R ATAGTGTATAGAAGCGATTTAAGTT POLQ E1F GCTTAGGGCCTACTAGTTTTG 57 40 POLQ E1R AAGTAGCTCTTCTTAACGTATTG POLQ E2F GAGTCTATGGCTTTCGGGTTA 60 35 POLQ E2R CCGTGGGGTGAGGACAC POLQ E3F TGAAGGGCTAACTGTAAAA 55 35 POLQ E3R CGAACCACAACTACCTCAA POLQ E4F GGCCCTTAGTGATTGGTT 63 35 POLQ E4R GCTTTTGGCAGTAGCCTCTT POLQ E5F AATTTCAAGTTTTTTCACC 55 35 POLQ E5R AGCTCCACTTCATTCCATC POLQ E6F AGCATTACACAATATACCCA 63 35 POLQ E6R GCATTTTTCAGACACTTCC POLQ E7F GTACCAAAGGGCATAACCAA 60 35 POLQ E7R AAAATGAAATCAAACACACAG POLQ E8F GCTTTTAAACTGATGTGAGA 55 35 POLQ E8R AAATGTACTAAGCATGAAGG POLQ E9F GGATTATATAGTATGCAGCAGT 60 35 POLQ E9R GTATGAGGAATTTTGGAGGT POLQ E10F GAAGCAGACTCTCAAATCC 55 35 POLQ E10R GCTGCTACAATTAAATTCAAAC POLQ E11F GCAAAGTAAGGCAACTTAAAATCT 55 35 POLQ E11R AGGCATAAAAGAGCAAATGG POLQ E12F GCTGGGATTACAGGCATGAG 65 35 POLQ E12R CTGAGCAGTCATACAACCTCACT POLQ E13F TTTGAATGTTTGTTCCTCTGT 55 40 POLQ E13R TGTTCTGTTAGGGTATCTTTG POLQ E14F CATGCCTGGCTTTTGTCTT 60 35 POLQ E14R GGAGAGCCCAGAGACCTT POLQ E15F GCCTTTCCAGTTCTTAGTCA 60 35 POLQ E15R TAACTCGACCTCAAATCACA POLQ E16F CCTTGGGCCTTGTTAAATC 60 38 POLQ E16R AGCCCATGTAGGTAAAGGT POLQ E17AF CTTGCCTTACGAATGAATGA 60 40 POLQ E17AR TGCACTATATTTGGTGAATGCT POLQ E17BF CACACATTTATATCCCAAAC 55 35 POLQ E17BR TCGAAAACTTCTGCTCATCT POLQ E17CF AAATAAAGAGAAGCCAGGAG 55 35 POLQ E17CR ATTTGTAATGGGAATGATGT POLQ E17DF CCCGTTTACCTTAGATGAGA 60 38 POLQ E17DR AGGTACTGGTTAATTGGATG POLQ E17EF AAGTGCTGATACAAAATGG 55 40 POLQ E17ER CAAAATCACAGAGGACTAAA POLQ E17FF AATCAGAAGGCCAGCATGAG 60 38 POLQ E17FR TTCAGCAGGAAAAGGAATGT POLQ E17GF CAGAAGAGCTTAGTCCAACA 60 35 POLQ E17GR GACATTCTCCTTCTACACCA POLQ E17HF TGATTCCTCAAAAGAGAAC 55 35 POLQ E17HR AGCTTCAACCATCTGAAC POLQ E17IF TTGTTCCAATGATGAATCT 55 40 POLQ E17IR GTTTGAAATAACTTCTTGTTCT POLQ E17JF GGACTGCAAAGGATTTTAGA 55 35 POLQ E17JR CTTAGAAGCAGATGTTGGA POLQ E17KF TGAAACCTCATCCCTCTTACCT 60 38 POLQ E17KR TTTTGCACCGCCACTCCT POLQ E17LF TTATCACAGGATGGATTAC 55 38 POLQ E17LR CAGAGGAGATACATACTACAAC POLQ E18F GATGGGAAGCCTGGAAAGA 60 35 POLQ E18R CCTGGGCAAAAGAGTGACAT POLQ E19F TGCATGTAATTTTTGCCTTAAAA 60 38 POLQ E19R TGGTGCATGATATTCTATTCTGG POLQ E20F AAAATGAGTGAGGTTAGAAATGAGC 60 35 POLQ E20R AAAAATGCCAGAAACTTGGTT POLQ E21F TCTAGCCACTTAGCCAATGA 60 35 POLQ E21R TCTATATCCCTAGCCCCATGA POLQ E22F TTTTCTGAATGATAATCCTTG 55 40 POLQ E22R GTTCTGCCCTGCTCTGTG POLQ E23F CTTGCTGTGGAATTTGGA 55 35 POLQ E23R CAAAATTGGATATTGTTTATACT POLQ E24F GCATTTTTAAGATAATCCAG 55 35 POLQ E24R ATTAATACAGATACAGAGAAACAG POLQ E25F CTACCACACCCAGCCCTCA 60 40 POLQ E25R GCTTCAAAGCTATCAGCCAC POLQ E26F TTGGATTGTGTGATATAGAAACTTTG 60 40 POLQ E26R CTCAGATGAACTGTGCTTTGAA POLQ E27F CGCATCCTAATGAACCCTTT 60 40 POLQ E27R CCTGATGAAAACTTCTGACTAATTGA POLQ E28F GCCAGTGAATGAAGTGAAGGA 60 35 POLQ E28R TGCCAGTAATCCCTAAAACG POLQ E29F TGAAACCATGTTGGCATATCT 60 38 POLQ E29R TTCCCATTTACATTTCTGATACAA POLQ E30F CGACCAGCAAGTAGTTATTTTCC 60 35 POLQ E30R ATGGAATGGACACAAGCATT POLQ E31F TTTGGGAAACATTCTTTGAC 60 40 POLQ E31R TGACTGCATCTGCACAGG RAD1 E4F AGAAGTTGTTGGCCCCAGGAG 53 40 RAD1 E4R CCGGGAGAGAAAAAAAATTCAAG RAD1 E5F CATGGGATTAGCACAGTATT 55 35 RAD1 E5R TGAAAAATGAATTGGCATTAG RAD1 E6F AAGCTGAAC CCAGAACTAT AA 55 35 RAD1 E6R AAGTGGGAAGATGGAGTACAGA RAD1 E7F TTTGTGTACATGTCTGTTT C 55 35 RAD1 E7R TTTAACCTCCTCTTTATCACC RAD1 E8F TTTGCTACTTTTTATCCTTTACT 55 35 RAD1 E8R CTTCCCCATTGTGCTTCT RAD50 E1F GATTCGCGGGTCTCACGTCC 60 35 RAD50 E1R TAAACTGAAGGCGGCTACTG RAD50 E2F TTTTATCTTTTATAGTTTCC 50 40 RAD50 E2R ACAAAATTGTACTAGCACCA RAD50 E3F TTTTTCTTTTTGTTCCCTCA 57 40 RAD50 E3R AACAGAAATTCAAATATCAT RAD50 E4F CAGTATGAATTGATTAAGCA 55 40 RAD50 E4R TACAAAGTCTATTTAAGGGT RAD50 E5F TAGTGACAGCATAATATCCC 57 35 RAD50 E5R AAAACATCATGCTGTATACC RAD50 E6&7F GCCTGGACCTGGAGTATCTT 63 35 RAD50 E6&7R TAGTAGGAAAAACGACCAAA RAD50 E8F TGAATCTGCAGCTATCTCAA 53 35 RAD50 E8R TAGAGAATATGATGCAAACA RAD50 E9F TTCAGTGTACATATATTCCT 45 40 RAD50 E9R TTATTAGATTATTCAAACAA RAD50 E10F GGAACATTCTGAGGAGTAGT 56 38 RAD50 E10R GCTATTTTAAGTACCAGACA RAD50 E11F TTGTTCTTGATATAATGTGG 53 40 RAD50 E11R AGGTAAGCATGAAATAAGAG RAD50 E12F TGTCTTGTTTTTGCCTACTC 53 40 RAD50 E12R TTCAAAGGTGTCAAAGTATC RAD50 E13F TATAGAAAAAGATACAACCG 57 35 RAD50 E13R GTACAGTGAAGGTAAATCCC RAD50 E14F CCTAAAAATACATAACCTCA 53 38 RAD50 E14R TATTCTGCCTTAAACTACAA RAD50 E15F AAAATAAATGATAAGAGCAA 50 38 RAD50 E15R GCAATGTCAAAGTCTCTATG RAD50 E16F GGATTCCATAGACCGATAAA 53 35 RAD50 E16R AAAAACATGTATGGATATTC RAD50 E17F CTGTGAAGTCTGACCCCTAA 55 35 RAD50 E17R ACGTGGTGCTATGAACATAA RAD50 E18&19F ACCCAATGTTCATAACTTCC 60 35 RAD50 E18&19R ATCATAAGCAAAACAGACCT RAD50 E20F CTTGCTGTCACCAGTTGCCT 55 35 RAD50 E20R ACATTCCAGTAATAAAGACG RAD50 E21F TTGCTAAGGAGAATGATACT 55 35 RAD50 E21R GAAAATCCCCAGTCTAATAC RAD50 E22F TGAAGTACCAATGACTTCCTTTT 59 40 RAD50 E22R GGTAATGCTGGCATGATGAG RAD50 E23F CATCTGTTGTTCCTAGGCTT 60 35 RAD50 E23R CCCCAGGCTTTTGAGATACC RAD50 E24F CCCTGCTGAAAAGATCATGT 60 35 RAD50 E24R CCCCAAATGTGAGATACTTA RAD50 E25F CAAATCAAAGAAGGGGTTAT 55 35 RAD50 E25R TACACTTTCTGAGGACCTAC RAD51 E2F AACAGAGAGGCACAATAAGA 55 40 RAD51 E2R CCAAAATTAGCAACTAACCA RAD51 E3F AAGCACCTCTGTGAAGTATG 55 35 RAD51 E3R TTCCCTTTTGTACTATTCCC RAD51 E4F TTTTTGCCATCAAGATCACT 55 40 RAD51 E4R TTCACAACACAGGATAAAGG RAD51 E5F TGATGAGCTCCAAGAACATT 55 40 RAD51 E5R ATGCTTGCTTATTTGATTAG RAD51 E6F ATTATAAAGATGTCATGAGG 55 40 RAD51 E6R CATTGATAAGTGTAGCCATA RAD51 E7F ACTTCTTCCCTACCTATTCA 55 38 RAD51 E7R AGGGAAGGACTCTTAAGAAC RAD51 E8&9F GAATATGAGATTTTAGGGTG 53 35 RAD51 E8&9R TAATATGACATTCCGAAAAG RAD51 E10F AGCTCTGTTACAAAGTCAGG 55 40 RAD51 E10R TTAGGCTGCAGCACTTAAGG RAD51C E1F CCCCTTCCGCTTTACGTCTG 65 35 RAD51C E1R GAGGCGAGAGAACGAAGACTG RAD51C E2F TCCTAGCATCACTGTTGTC 45 35 RAD51C E2R ATATGTTATTAAACCCACCC RAD51C E3F GTCATTATCTGGAGTTCAAA 55 35 RAD51C E3R GGCACAAATGCAAATTACTT RAD51C E4F TGTTATTAAAAAGCATTGTT 45 40 RAD51C E4R TACTTGGTTAGTTACATTTC RAD51C E5F GTAAATAAGAGAGAAGGTCC 53 40 RAD51C E5R TTTATACAGTCTTGACTTTG RAD51C E6F AGAGATGGGGTTTCACAATCT 57 35 RAD51C E6R CTTTCATGAAGCGTATAGTA RAD51C E7F ATATTTGATCAGAGGCGTTC 53 40 RAD51C E7R TCATTCAGTATAATTAACCC RAD51C E8F TCTCTCCTTTTTGTGTTCT 53 40 RAD51C E8R TATCAAAATCCCACTCTAATC RAD51C E9F CCCACCTCAGCCTCCCA 57 35 RAD51C E9R GGTATTTTTCCCATTCACTTCA RAD51L3 E1F GTGCCGCCTCCTCCTCTCTC 60 35 RAD51L3 E1R GGGGCCTGCCCAGGTTGT RAD51L3 E2F TCACACTGGCCTCCTGAGAC 60 35 RAD51L3 E2R GCTGGCTTGGGATGGACTTTT RAD51L3 E3F CAAGCCAAAGGGAGCAGA 60 35 RAD51L3 E3R CAAAAGCAGAGCTGAGAGGA RAD51L3 E4F TTTTCCCCTGTCTTCCTCCT 60 38 RAD51L3 E4R CCTCACCCCTAAATCCTCCT RAD51L3 E5F GCAAGGTTTGGTGGGGAG 60 35 RAD51L3 E5R AAGTTTGAAGGCAAGGAATGA RAD51L3 E6F GCCTCTTCCTTCTCAGCCTTAC 60 35 RAD51L3 E6R AGCAAGGAGGGGCAGAACA RAD51L3 E7&8F AGCTTGCTGTATTTGGGATGG 60 35 RAD51L3 E7&8R TTCAGAAGCTGACATTTAAGGG RAD51L3 E9&10F GGCCTCTGTTTTCCTCTCCGT 60 35 RAD51L3 E9&10R GGTCCCCAATGCTTCCCTGT RPA1 E1F GCGCAACTTCTCGGGCCAATAAC 67 40 RPA1 E1R GCTCCCCTCCCCCTCTCTACT RPA1 E2F ACGTATCTCCCTCTTATCATT 55 38 RPA1 E2R TGGAACATAACATACGCA RPA1 E3F CCTGCCACTTCGGTTTAC 55 38 RPA1 E3R ACCAGGTGTGCTTCTACTATTT RPA1 E4F GGTATGAGTAGCTCTCAGAGG 55 35 RPA1 E4R ACGATACAATAAGACAGAAAAA RPA1 E5F CAATGATCATCGGGGAAA 55 38 RPA1 E5R GAGTGCTACAACCTACGCCAAA RPA1 E6F CCCAGAGCATTCCTTCTACCC 55 35 RPA1 E6R CATGATTCCGAAGTCTGACACC RPA1 E7F AGCTTTGCCTCTCATGTT 55 35 RPA1 E7R CTCCGATTTCATAAGTACACTC RPA1 E8F AAGACGAGAAAGGCTGTAGGAA 55 35 RPA1 E8R CACTCCCCAGCATGACAA RPA1 E9F GGCCTGTGTTCTATCCCAGT 55 35 RPA1 E9R GGCGGTGTCAGTTCTAAAGT RPA1 E10F ACTAGGGGTTTCTGTCCGATT 55 35 RPA1 E10R GACACCACCCCGTACACT RPA1 E11F CGTCGGAATGGGAGTCTTG 55 35 RPA1 E11R GGAGGTCCTGTGCGTGTTG RPA1 E12F GATTCCATGTACGCTGATT 55 35 RPA1 E12R TCCCATGCTGATTGTAACC RPA1 E13F GGAAACCTGTGTCTGTCGC 55 35 RPA1 E13R TTTGTGAAGGTGGTTAGGAATG RPA1 E14F TGCCTCTCGGTCCGATCCT 55 35 RPA1 E14R GCCTCCGTGAACACAACCGT RPA1 E15F CCCATCTTCTCAGTGTGTCTTT 55 35 RPA1 E15R TGTGTGGGGTCAGTGTTA RPA1 E16F TGCAAGTTGTCCAGTGGTTTC 55 40 RPA1 E16R GGGTCTGGCAGTGAGTACAGT RPA1 E17F CTGAACCCGTGCGTCTGT 55 35 RPA1 E17R TCGATTCCATTCTGCCTATTTG SFN E1AF TTGGTCCCAGGCAGCAGTTAG 57 40 SFN E1AR ATGGCCTCCTCGGGGCTGTT SFN E1BF CCGCCCACCAACCCCATC 60 35 SFN E1BR TCAGCTCTGCCAGTCCCTCTC SMC1A E1F GAAGGCGAAAATCCCGTTAGG 55 35 SMC1A E1R CCGCGACGTTTCAGGTTACAT SMC1A E2&3F TGGGGACAGAGGAGTAGTCTC 55 35 SMC1A E2&3R GCAAAAACCAGATAGCCAATAA SMC1A E4&5F TGAAGGAGTGGAAATGGGTA 55 35 SMC1A E4&5R GGCTCAGAGGAACCCTAATAA SMC1A E6&7F GAAAAGCCTGGGAACCCT 60 35 SMC1A E6&7R GGATTTGGGATGCTCAACCTA SMC1A E8&9F CCTGGACTGTTCGGCTCT 55 35 SMC1A E8&9R GGCTGCTGGGAAAATCGTGTG SMC1A E10F GTCTGTCCCCCTTTCCATACT 55 35 SMC1A E10R CCTGACCCAATCCCCAACAAG SMC1A E11&12F GCTTGTTGGGGATTGGGT 55 35 SMC1A E11&12R GAAGGGCTAGGTGGTAAGGTG SMC1A E13F AGCAGTGGGAGTCCTAAGCCTA 55 35 SMC1A E13R ATGTGTGGATGGCCTTTG SMC1A E14&15F GCCAATGCAGTCAAGGTAG 55 35 SMC1A E14&15R GGTTTTCCAAGGATGTCAAG SMC1A E16F AGTTTCCCTTTCTTCCCATAGT 55 35 SMC1A E16R CCATTTTTCCTCCCAGTTATT SMC1A E17&18F AAGCTCATTGACGAGTGACTCC 55 35 SMC1A E17&18R CCCACCACCAGCCACAATA SMC1A E19F CTCTCATGGCCAGTCTGCTC 55 40 SMC1A E19R ATAGTCCCACTCCCACCCAA SMC1A E20F GAAGAAGAACCTGCCCTCCGTA 55 35 SMC1A E20R TCATCGTAGGCCCAAGTAGAAG SMC1A E21&22F GTTCCTGCTCTGGATTGTCA 55 35 SMC1A E21&22R GCCTCAGTTCAGTCTCTTCGT SMC1A E23F CTCCCCGCCTCAGTGTCAGC 55 35 SMC1A E23R CTGAAACCCAACCCCGACCT SMC1A E24F CACCTTCCTCTCCCTACCCTA 55 35 SMC1A E24R GGACCTGATTCCCTATGCTC SMC1A E25F GTATGTAGGGAGGAGGGTTTGA 55 40 SMC1A E25R TGGGAGAGGGACAGCTTAGG TERF2 E1F CGGCTCGGAACGCTGTTTCT 50 40 TERF2 E1R TGCATGATGTCCCGGATCTGT TERF2 E2F CGGCTGGAAGAGGCAGTCAA 65 40 TERF2 E2R AAGTAAGCCCAGAGAAGAACACAAA TERF2 E3F ATAATTTTTGGACATAACTTTT 55 40 TERF2 E3R CTGTATCCTCAAAGACCC TERF2 E4F TGTTTGATATTCTGATTACACC 55 40 TERF2 E4R CCCACAAAAAGCAATGAG TERF2 E5F CGGCATTGCAGAAGTTCTCATA 55 35 TERF2 E5R GCACATCCTCAAGGGCACA TERF2 E6F TCCTTCGTTTTATGCCTAGATT 55 35 TERF2 E6R CAGCGACCACCCTAGTGTTT TERF2 E7F GCTGTTTGGATGAGCATCA 55 35 TERF2 E7R AAGCCTTGGTGGTGAGTAAC TERF2 E8F GGGACAGGAAGGAGTACAGG 55 35 TERF2 E8R ACTTTTTCTAGTTCGGAGACA TERF2 E9F GTCTTTTTCTTGTGGTTTGTG 55 35 TERF2 E9R AAGGTTTTTACTGGGTACA TERF2 E10F TCCTGGGATTCTTGAGTTTA 55 35 TERF2 E10R GGGTGACAGAGCGAGACT TP53BP1 E2F TTAGGTTTAGACTGCGTGAG 55 40 TP53BP1 E2R TTGCTGGTTTTCGGTTTA TP53BP1 E3F TTGTTCACAAATAGTAGGTTT 55 40 TP53BP1 E3R GGGGACAGATAGCTTTAA TP53BP1 E4F GATTTTGTATTAAGGTTTGTTGG 55 35 TP53BP1 E4R ATAAACCCCTTCAAACACT TP53BP1 E5F AAAGTGTCCCAAACTATCTG 55 35 TP53BP1 E5R CATGTTAAAGGGAAGTTAGAA TP53BP1 E6F AATGTTGTGGGATGATACCTA 55 35 TP53BP1 E6R CAACTCCAAATGCCAGA TP53BP1 E7F AAAAACATCTGGGACTGTATC 55 40 TP53BP1 E7R CCCTACAGCAAAACTCGTAA TP53BP1 E8F AAAAACATTTGAACTTAGGAACT 55 40 TP53BP1 E8R TTGGAGAAGAGCTGTAACGAC TP53BP1 E9F TGGCAGCTCAGTAGTGTCAAT 55 35 TP53BP1 E9R CTTACTTACGTGGAAAGACTGTC TP53BP1 E10F ATGCAAAACTGTGGCTATG 55 35 TP53BP1 E10R TGTTGCTCCTCTTCTAATCTGA TP53BP1 E11F TGGTTTTGGAACATGAGTAATAT 55 35 TP53BP1 E11R TGTTAGGAGAAACAACTCTTTT TP53BP1 E12AF TCCAAGGATTCGATATAAAAG 55 35 TP53BP1 E12AR CAGTGGCTAAAATACTAATGTC TP53BP1 E12BF CAAAACAAAGGGAGATGATAC 55 35 TP53BP1 E12BR GGCTCTTTCACATCTACAATGAC TP53BP1 E12CF TGGAACATAAGGAACAGGA 55 40 TP53BP1 E12CR AGGTGGAGACAAGAATAATCTAC TP53BP1 E13F GCAGTTCTTATTATTTTTGCTTA 55 35 TP53BP1 E13R TCAGAAATTCTGCCTTAAA TP53BP1 E14F AACAGGCAAATTGATGACCTTGA 55 35 TP53BP1 E14R CCCCAGATAATCTGCAGCTACTA TP53BP1 E15F AGAGTGAAGGTTTAGGTGTGATA 55 35 TP53BP1 E15R CCCTCATCACCAGTAGCTG TP53BP1 E16F CTTTTCTTTTCAAAGTTAACAAT 55 35 TP53BP1 E16R CACTAACCATTTTGTGAACC TP53BP1 E17F ACTTGCTTAATTGACATGGCT 55 35 TP53BP1 E17R ACAAGGCCTCTGATGCAC TP53BP1 E18F TGTGATTTTGACAGCTTGCAG 55 35 TP53BP1 E18R ATTTGCCACACAGACTCAGA TP53BP1 E19F ATTGTGTTATTATGGCATCT 55 40 TP53BP1 E19R TTAAAATGTCAGCAACCCT TP53BP1 E20F GCAGGTGCTATCAGACTAACTTG 55 40 TP53BP1 E20R TCTCCTCCATTCCCTTGTT TP53BP1 E21F TGTTCTTGTTCTCACCG 55 35 TP53BP1 E21R AAAATCTCTACAAACTCTGCTT TP53BP1 E22F GTGCTAAGGAGCCTAAGACAA 55 35 TP53BP1 E22R CCCAAAAGCAGCTGTTC TP53BP1 E23F GGAAGGGAAGCGGAAAC 55 35 TP53BP1 E23R CTGAAGGAAGAATGAGGCAAAA TP53BP1 E24F CAATGGTGTGTATCCCTC 55 35 TP53BP1 E24R GAAGTGCCTATGTGTCAGA TP53BP1 E25F AGGCATAAGGTAGCAAAT 55 35 TP53BP1 E25R TCATTGCCACTATATTAGGT TP53BP1 E26F TCATTATGGCTGCTGCTTAGG 55 35 TP53BP1 E26R CAATTCTGGATGGGCTTC TP53BP1 E27F AGTTTGTTGGATATTACTTGTCATGC 60 40 TP53BP1 E27R AGATCCCTGGAACAAAGACACTAC TP53BP1 E28F TCTCTTTCTAATGGAGGGCTAAG 60 40 TP53BP1 E28R TAGCAGGGAATAAAACCAGTAAGAC TREX1 E1AF CTAGGGGAGGGGCCGAGT 57 35 TREX1 E1AR GGGGGAAGTCGTAGCGGTCA TREX1 E1BF CAGCGCATGGGCGTCAATGT 57 35 TREX1 E1BR GTGCTGCCAAGAAGGGTAGGA XPA E1F AGTGCGCGTGCGTGGAG 55 40 XPA E1R TGCACACATACGCCAGCGGAG XPA E2F TACAGGCTTACCTACTTCA 60 35 XPA E2R GCATTATTTAGCATCACTTT XPA E3F GCATTGCATACATGCTGA 60 35 XPA E3R TGCCCTAAACCTACACATAAAC XPA E4F TGCTAATTTAACCATGAGA 55 40 XPA E4R ATTAAGAATTTACCAGAGTGA XPA E5F TCGCAAGTCTGAATCACAA 55 38 XPA E5R TGCAAAATGGTAAAACACAA XPA E6F CCTGAATAGCACCACTGAAA 55 38 XPA E6R CTATAAAACAGGTCACTGAACTAA XPC E1F CGTGACTAGGCCTCCAACGAA 60 35 XPC E1R GAACGCGCGCAGCAACC XPC E2F CCATAAGCTGCACTGCC 60 35 XPC E2R CCCAGTGACAAGTAAGAATAGA XPC E3F GGCTCAGAGCTTACTAATCA 60 35 XPC E3R GACTCCAAACAGAATCAAAC XPC E4F CATGCCTCACTTCCTCCTTC 60 35 XPC E4R CCTGGTCCCCTACAAGTTTC XPC E5F CTGGTTTCAGTTCCCCCCTT 60 40 XPC E5R GTCCTTCCCCATCATTCCTT XPC E6F CGGCCTTCCTTCCATGCT 60 35 XPC E6R GCCATGCCCACCACCTGATAC XPC E7F TCACGATTCACTCCCTCTTT 60 35 XPC E7R GGCTGCCATTATCATTAGTT XPC E8F ACAACATTGAACTCATTACATCT 55 40 XPC E8R CTGTCAATTGCTCCTCTTCT XPC E9AF AGCTGGGGACATCTTGATGTATT 60 35 XPC E9AR TCTCCTGGGCCCTCATCTT XPC E9BF GGGAAGAGGAACAAGGGAGG 60 35 XPC E9BR TTTACTGCTTGAAGAGCTTGAGG XPC E9CF AGAAGCCTCTGATCCCTCTG 55 40 XPC E9CR GGCTTGGTGGCGTACTTG XPC E9DF GAGCAGGAGGAAAAGTGGGT 60 35 XPC E9DR CATAGTGCTGGGCATATATAAGG XPC E10F CTAAGGATCATCTCCCTCAAA 60 35 XPC E10R CCTAGGAAGAAGGCTGCTAA XPC E11F TCTCCACTGTCCCGCATTCC 60 35 XPC E11R CCCCCAGCTCTCCCGCTC XPC E12F GGTGCTGAGGAACTGGATG 60 35 XPC E12R TCCTGAGCCCTTCTGATG XPC E13F ATCAGAAGGGCTCAGGACCA 60 35 XPC E13R AGGCCTCAACTCCCAGCA XPC E14F GCCCACTGTCTTCCACAAACT 60 35 XPC E14R CCCGCTTCTGCTGTCCCTC XPC E15F GAGGCTATATTCTAAAGTGGTGT 60 35 XPC E15R CCCTGAGCTTGTCTTCTCTG XPC E16F CTAACCCTCGCCTGTGTCCTC 60 35 XPC E16R CTGTAGTGGGGCAGCAGCAA XRCC2 E1F TTGGTGGCGGGAAAGTTGAGT 57 40 XRCC2 E1R CAGCATCGCGGGCGTCTAGG XRCC2 E2F CCACAGCACCCAGCCTAAA 60 35 XRCC2 E2R ACAACCTGTGTCTCATTTTCC XRCC2 E3AF CCTTGAGCTACTGCATTTTGA 60 35 XRCC2 E3AR AAAAGGCAGAGAGATGGGTGA XRCC2 E3BF GCAGTAGTAGCACCCACTT 60 38 XRCC2 E3BR CTGCAGTGAGCCATGATT XRCC3 E4F TCGGGCCTCCCACAGGCTT 60 35 XRCC3 E4R ACACACCCACCCACACCCTTT XRCC3 E5F ATCCGGTCCCTACCCACCTT 60 35 XRCC3 E5R GACCATGATGCTGGAGCCAC XRCC3 E6F CTTGCTCACCCCCATGAC 60 40 XRCC3 E6R ACTTCCCCCTCCCTGTTCT XRCC3 E7F GCCCGTCTGGAGTCCCCTG 60 35 XRCC3 E7R AACTCTCCCTGCCCTGCTGTG XRCC3 E8&9F TCACCTGGGGCGGGGACT 60 35 XRCC3 E8&9R GGTGCACACACCACATGGCT XRCC3 E10F GTGAGTGCAGCCATGTGGTGT 60 35 XRCC3 E10R GTGTGTCGGGGCTTCTCAGG XRCC4 E2F AGCTGAGAGGCCAGTACAGA 60 35 XRCC4 E2R TGACAGCAATAGCAAGTAAAA XRCC4 E3F TCTCATGTGTAGTCATTTACTT 60 38 XRCC4 E3R CTTCTGAGGTGTTCTGGG XRCC4 E4F CTTAAAACCAGGCTTCTCA 60 35 XRCC4 E4R CTCCGTATTTTTATACCACA XRCC4 E5F TAAGCAGAACTGCATGACTAA 60 35 XRCC4 E5R AGCCTGAACATCCACATCC XRCC4 E6F GCTTACTGATAAATCTGCTGCC 60 35 XRCC4 E6R AAGCCCAAATAAGATATTCAAC XRCC4 E7F GATGTGCATAATTTTGTTGG 60 35 XRCC4 E7R AATGTCATCTCACTTCTTGG XRCC4 E8F TCTCTTCATTTTCTTTTACTCT 57 40 XRCC4 E8R TGCTGACTTGAAATTCTCCT XRCC5 E1F GCTATCTGCCGCTTGTCC 55 35 XRCC5 E1R GCCCCATTCTTTGTCTTGACC XRCC5 E2F GAATACAATAAGCAAGGGAC 55 35 XRCC5 E2R GCTGGACACTATAAGGAGG XRCC5 E3F TGGTTGTCCTGCTCCCTG 55 35 XRCC5 E3R TGAAACTCTGGGGGTGTCT XRCC5 E4F TCAGTGTCCACAATTTCC 55 35 XRCC5 E4R ATTCTCTTCCAGCTCTCTTC XRCC5 E5F AGCTTCTCTCCTCAGTGACC 55 35 XRCC5 E5R AGCGAAAATTCCCATAAACC XRCC5 E6F TTGAAAAGGTTGACTGATGTG 55 35 XRCC5 E6R AAAAGAGAAATTTACGTGGG XRCC5 E7F AAATGCATCATCCAGCACAA 55 35 XRCC5 E7R TAAAAATGTGTACCTGCC XRCC5 E8F GTGCCAGAGAGTGTATTAGG 55 35 XRCC5 E8R AAATGTCTTTTAGGCAACAG XRCC5 E9F GGAACTAATTTCAGCTTGTA 55 35 XRCC5 E9R TCAAATAACAGCTAGGAAAA XRCC5 E10F GTAAGAGGATTTTGAATGGA 55 35 XRCC5 E10R AGCACTACCTCAAAGACCTG XRCC5 E11F AGTATTGAGTTCTGTTGTGA 55 35 XRCC5 E11R AACATTAAGACTTTGGGTTT XRCC5 E12F AGAATTTGGGATCAGTTTTA 55 35 XRCC5 E12R GATTTCCCAAGAACAGTGTG XRCC5 E13F AGGGCCAGGACTGTATAACC 55 35 XRCC5 E13R TTCATCCTTCTTCTCTTACC XRCC5 E14F TAGCCCTCCCACACTAAAGA 55 35 XRCC5 E14R CCCCAATGTTAAATGCAACT XRCC5 E15F TCACAATAGCAATCTGGTTT 55 35 XRCC5 E15R TCCCTCAAGCCCCAACCTTC XRCC5 E16F TTAAGCCATCTTGTATTGCC 55 35 XRCC5 E16R TCCTAAATGCAAAGTCAACC XRCC5 E17F CAAACACAGAAGCATACCCT 55 35 XRCC5 E17R TCCCTGTGATAGTCGCCAAC XRCC5 E18F TTGTTTGGTCTGGGGTGAAT 55 35 XRCC5 E18R AAAAAGGCAAATGACAACTT XRCC5 E19F GAGGTGTGATGGAAACGAAA 55 35 XRCC5 E19R ATTCAACTAAAGACAAAGGT XRCC5 E20F ATGTTTCTTTTGGGCCGTTG 55 35 XRCC5 E20R AGAACACCAGGTGCATATTA XRCC5 E21F ATGCCTTCCAATGTAGAGTC 55 35 XRCC5 E21R CTTGTTTTGTTAGAACTCCC XRCC6 E2F CCTAGAGGTCGGTATTTTTT 55 38 XRCC6 E2R AGAGATAGGCAGGGAAGGT XRCC6 E3F TTCCTTTATGGCCTTTATTT 53 40 XRCC6 E3R TTCTCCATGTTACCAGGTT XRCC6 E4F GGTAGGGATCTTGCCTTATT 55 35 XRCC6 E4R TTCCTTCTCCACAGTCCTCTTT XRCC6 E5F CCACTGACATTCTTCTGATTT 55 35 XRCC6 E5R CAGCACATGCTTATAGTCCC XRCC6 E6F GTCTAGTTTTCAGGGAGCTTTT 55 35 XRCC6 E6R CCCAGCCTGCTTCTGATTT XRCC6 E7F AGCTTGCTTAGGATTATTGGA 55 35 XRCC6 E7R AAAACAACAACAACAAAAGG XRCC6 E8F TCCTCGTAGCCTTCCCATTT 55 35 XRCC6 E8R CTGCACCAGGCAGAGCTT XRCC6 E9F GGGCTAAAAGAGAAGAAAGG 55 35 XRCC6 E9R AGCCCCATTCCCAGAGAC XRCC6 E10F CCAGCACCACAGGACATAAAA 55 35 XRCC6 E10R TCCAGAAAGCCTGAGATTGAC XRCC6 E11F ACCCCGGACCTGTAGTATCT 55 35 XRCC6 E11R GTCTGGGGAATGAGGTTAAGTG XRCC6 E12F ACCCCTCCCACCTTAGCAGTT 57 35 XRCC6 E12R TTTGCCAGCATTTGTTATTGTC XRCC6 E13F GCAGCCCAGATTATACGAG 63 35 XRCC6 E13R GAGGGCTACACCATCACCA XRCC7 E1F GCCAAAGAGGCGCGCTTAC 53 40 XRCC7 E1R CTGCCCGGCTCCAGAACGAC XRCC7 E2&3F CTCCATCTCAAAAAAAATAA 60 35 XRCC7 E2&3R CAATGAGAAAGGAAAATGT XRCC7 E4F ATTTTGGTATTGCTCCTCT 55 35 XRCC7 E4R CATCACCCAAAACACAACT XRCC7 E5F TTGTATTGTGTTTTTTTTCTTG 55 35 XRCC7 E5R CGACTGTAAAATAAGACCTTG XRCC7 E6&7F TTTTCTTCATACATTTTGGTT 57 38 XRCC7 E6&7R GGCATTGCTGGTTAGACTT XRCC7 E8&9F ATGGGGTTAATATAGGTGTC 57 35 XRCC7 E8&9R GCCTCCCTGTAAATAACTGTG XRCC7 E10F GTTTGTTGGTTTTCTGTTCT 55 35 XRCC7 E10R CTGATCAACATCTTTCTGCT XRCC7 E11F GTTCTAGTTTTTCCATGTTTGT 57 35 XRCC7 E11R TGTAAGTGAGCCTGTGCAGT XRCC7 E12F AGCCTGGACAAGAGCGAAA 60 35 XRCC7 E12R TCCCAACAGTGCCTACACTAAA XRCC7 E13F CATGTTAAGCAGCAGGTTAG 60 35 XRCC7 E13R TTTAGGAGTTCAAAAGTTGTGT XRCC7 E14F AAATTGAGAGGTAAAGTTGGG 60 35 XRCC7 E14R TAAGGCATTGCTAATAACTAAGA XRCC7 E15F AGCATGTTCTGGCAGCAGT 60 35 XRCC7 E15R TTATGGCTTTCAATGGTAAATGT XRCC7 E16F CAAACCGGCACATACATCT 60 35 XRCC7 E16R GTGGCACATAATAATCCTGAA XRCC7 E17F CTCGCTGTTGCAATCTTTC 60 35 XRCC7 E17R ATTACAGCCAATAACTAACAAT XRCC7 E18F TAGTTGTTCGATTATGTCCC 60 35 XRCC7 E18R ACGCAAGATTCAACATCC XRCC7 E19F GGCTAGGAACTACTGGATTGGGA 60 35 XRCC7 E19R GGGCATGAGCCACCGCAC XRCC7 E20F TTTCCTGGAGGTTAGTGTGT 60 35 XRCC7 E20R CGATGAAGAGATGGCTCTGT XRCC7 E21F CTAATTACCTGGACTGAACTCT 60 35 XRCC7 E21R AACATATTTTGAACACACTGG XRCC7 E22F ACATTAAATGAATGAATGAG 56 40 XRCC7 E22R TGCATTATGTAAGGTACAGA XRCC7 E23F CAAGTGGGTGGCAAAGAG 60 35 XRCC7 E23R CACATATAGGAGCAAATATTCAG XRCC7 E24F AGGGAAAGATGAATGAAGTG 57 35 XRCC7 E24R CTAATATTGGAATGGCTGA XRCC7 E25F CTTGTCATCAACGTGATAACT 60 35 XRCC7 E25R ATCGTTCCTAACCATCTCC XRCC7 E26F CCCTTTACAGCGTAACATTTC 60 35 XRCC7 E26R ATCGTGCCACTGCATTCC XRCC7 E27F TATGCTCAGAGATAGACCAA 60 35 XRCC7 E27R ATGCAGGAAATATGACACAC XRCC7 E28F GCCTCGGCCTCCCAAAGT 58 38 XRCC7 E28R TCACACGAGCCTTAACTCCTCA XRCC7 E29F GGCCAACACATTTATAATACA 57 35 XRCC7 E29R GGAAAACGAACTCTTCAGAC XRCC7 E30F GTTGCATGTTGGAGAGGGA 57 35 XRCC7 E30R GCACCGTGGTGAAATTAAAGA XRCC7 E31F TGAAACAAGTTGAATGCGTAG 57 35 XRCC7 E31R CCAGAATAAGGCAAGGGTGA XRCC7 E32F CTGAACGTATACCATGCC 57 35 XRCC7 E32R ACCCCTTCTAACAGAAACC XRCC7 E33F ACTCTGCCCACCTCTCCCTT 65 35 XRCC7 E33R AGGAGCAGCTGCAGGAGCAC XRCC7 E34F CTAGCTTAGTGCGTGTGG 55 40 XRCC7 E34R GCATGCTCAATACATAAAGG XRCC7 E35F TGTCAGTGCTATCTGAAGTGGG 53 40 XRCC7 E35R GCAGCATGCAGAGGCGTT XRCC7 E36F GCCATGCAAAGATGTGCC 60 40 XRCC7 E36R TGCCACTGCACTCCAGCC XRCC7 E37F TCGAGGAGTTTTGAAGTAG 55 40 XRCC7 E37R TTTTAAAGACACAAGTTACAGAG XRCC7 E38F GATGTAATATACAAATGTGTCC 60 35 XRCC7 E38R GATTACTGTGCTAGTCTCCC XRCC7 E39F ATGCTTTATTTGCAATGTCT 63 38 XRCC7 E39R TTGTGGATATTTTACTCACCTCT XRCC7 E40F GAAGCAAAAGTAAAACCCAACAA 60 35 XRCC7 E40R TTCCCACAAAACTGAAATGC XRCC7 E41F TTGTGTTTTGTGGATTTTGC 63 40 XRCC7 E41R GGCTGCTCACTTCTTATTACTGA XRCC7 E42F TGAAGTGATTTAGCATTTTTGACTG 63 38 XRCC7 E42R CAACTGTTATCCAATACACCCTAAA XRCC7 E43F CTGTTGTCTGGCATTGTTGG 63 38 XRCC7 E43R TGCAGAATTAAACGAACCACA XRCC7 E44F TGCTTTTCCATGAGCTATTACA 60 38 XRCC7 E44R TGGCAACTTAACGTGTTTGA XRCC7 E45F TGCCAGATTGCTACTAAAACAGA 60 35 XRCC7 E45R AAACAAAACAAAATAACCCATCG XRCC7 E46F CTGGCTTGATGAAAACCTTAGA 63 38 XRCC7 E46R TGGACAGAGAACTGGCTTCC XRCC7 E47F TGCCTTGTCCACTGAATGTT 60 35 XRCC7 E47R AAGCAGTTTGGTTTTGTTTTCAA XRCC7 E48F ACTTTGTCCTTGTTTTCCCATA 60 35 XRCC7 E48R GTCATGCTCTGCCCCTTTAT XRCC7 E49F TTTTGGCTTTAGGTCCAGTCA 63 35 XRCC7 E49R AGCACACCAGCAATGTAGCA XRCC7 E50F ATCACAGGGCTTTCAACAGG 63 35 XRCC7 E50R TCATCATTTACGACACACTACATTT XRCC7 E51F TTTGTCTTCCTGCTTCTTACTTGA 60 38 XRCC7 E51R GCAATCCTCCTGCCTTGG XRCC7 E52F TGTGGAACAACAGAATGGTTT 60 38 XRCC7 E52R TCAAGGGTCATAACAAATCAAAA XRCC7 E53F CAGACATCCCCAGCACCTAC 63 35 XRCC7 E53R TGGCAGCAGAAAGAACACAG XRCC7 E54F ATCCTTTCGGGGCAGGAG 60 38 XRCC7 E54R CCAAGAGCAGGGCTAGTGTT XRCC7 E55F TTGAAACAAAGAAGAAAAAGTTGC 65 35 XRCC7 E55R CAGGAGGAGGTTGAGACTGC XRCC7 E56F TCTAAAGTCTAATGGGAAAACAAGC 63 35 XRCC7 E56R GCAGAAAGCAGAGAAAATGC XRCC7 E57F CAGCACATTCTTTCCCATTTG 63 35 XRCC7 E57R GCCTTCCCTTTCCTTTTCAG XRCC7 E58F TTATGGTACAAATATGCTGATGGT 63 35 XRCC7 E58R CTCACAAAAGCCCAACACTG XRCC7 E59F CAGGGTTGGAGTTGAGCAC 63 35 XRCC7 E59R TGGGGAAGCTATTTTAAGCA XRCC7 E60F AACCAGCAGAGCCAAGTGTC 60 35 XRCC7 E60R GAGCAGTCCCGCAACCT XRCC7 E61F CACTTCGCCCTCATGGTT 60 35 XRCC7 E61R ACCCCTGAACTGGAAACAGA XRCC7 E62F TTGGTGATTTATAGCATTTTTGC 60 38 XRCC7 E62R CCATGTGAAGCCACAGCA XRCC7 E63F TGTTACTCCTTGTGAAGACATGGT 60 35 XRCC7 E63R TGGTCAAATCCAGTGTGCTC XRCC7 E64F AATGTGTGGCAACTTGATTTACT 60 35 XRCC7 E64R TCAGCAGAAAACAAAAGTGTTGA XRCC7 E65F AAGGATTGTTTTTAGTGTGATTGTT 60 38 XRCC7 E65R TATGGGGTTTGTAGGTGGAC XRCC7 E66F TGACCTGTGAAAGTATAGCAAAGAA 63 40 XRCC7 E66R GAAAGAAGGAAATAGGTGGTATGAA XRCC7 E67F TTATTAACCATTCTGAGGCATATTT 60 38 XRCC7 E67R TGGAGTTTCCAACCCATACA XRCC7 E68F TTTGGGCAGGAAGTTTGAAT 60 38 XRCC7 E68R TGACTGAAAGGGACCACGTC XRCC7 E69F CTGGGCAACAGAGTGAGACT 65 40 XRCC7 E69R ACAGCAGGGAGGACAGACAC XRCC7 E70F CTCTAAGGTGGATTGTGTCGTG 60 35 XRCC7 E70R AAGTGGATAAAAGCGGTCAA XRCC7 E71F CCCTATCCCAAAAACAAAAGA 63 35 XRCC7 E71R AGCGTAAAACATTCCTCCAGT XRCC7 E72F TCACAAATGGAAAGCAGAGTTC 60 35 XRCC7 E72R CAAACAAAGAGGAGACCAAAGG XRCC7 E73F CAAGCCAAAAAGGGAAAGTG 60 35 XRCC7 E73R CCGCCAAGTAGAATAAAGACA XRCC7 E74F ACAGAAAGTGCCTGGGAGAG 60 35 XRCC7 E74R ATTCAACAAAGCGACGGCTA XRCC7 E75&76F TTGATTTTTGGAAGATATTTGA 55 38 XRCC7 E75&76R GTCACAACGACTCTGCTATC XRCC7 E77F TTCCAAAGTCCAAACTAAACATC 63 35 XRCC7 E77R AGTGCTGTGCTCCTGACA XRCC7 E78F AAAATACAGGCGGTTGTCTAA 60 35 XRCC7 E78R CGTTCATCAGGACAGGGACT XRCC7 E79F CTCTTTGGCACTGTCTTCAG 63 35 XRCC7 E79R CCTACTGGCTGGGAGCAG XRCC7 E80F CCACGGGACTGTTTTTCTA 60 35 XRCC7 E80R GTTTATTGACCCAGCCAGCA XRCC7 E81F CAGAGTAATGTGGGTTCAATGTT 60 35 XRCC7 E81R TGAGGCAAAGCTAAGAATCAAA XRCC7 E82&83F CAAGATTATTCGATATTTGAGTCT 63 35 XRCC7 E82&83R GATCACGAGAGCACAGCAA XRCC7 E84F GATTTCAAGGGAAGCAGAGTC 60 35 XRCC7 E84R CCATCATACACGAGAGATACCAG XRCC7 E85F TCTGTTTGGGCATGATTGTA 60 40 XRCC7 E85R GCATGTCGGTAGTCCGTTAG XRCC7 E86F CAACAAAGGACAATGACACA 60 35 XRCC7 E86R GAATGCTGCCAACCAAAGTA Supplementary Table 2. Primer sequences and PCR conditions for mutation analysis of RAD50 mutations c.1875C>G and IVS14+1G>A.

Gene Name Exon Name Primer Sequence Tm Cycle Number RAD50 E11F AGACTTGCCAAATTGAAC 60 40 RAD50 E12R AAATCCTGGCTACCACA RAD50 E13F AACTGCGACTTGCTCCAGAT 60 40 RAD50 E15R CCTGGTTGACTTGTTGGACA

The first pair of primers, E11F and E12R, was used for RNA analysis of the RAD50 c.1875C>G mutation by RT-PCR (Figure 1C). The other pair, E13F and E15R, was used for identification of the splicing effect caused by IVS14+1G>A (Figure 1B).

Supplementary Table 3. Occurrence of co-existing variants in both breast and pancreatic cancer samples.

Cancer Type Gene Name Co-existing Variants Breast ATR and TP53BP1 p.Lys764Glu and p.Glu1014Gly Breast CLSPN and POLQ p.Gly6Asp and p.Ala2599Thr Breast TP53BP1 and XPC p.Arg1748Cys and p.Lys481Asn Pancreatic ATR, TP53BP1 and XPC p.Thr1469Ala, p.Thr610Met and p.Ala2599Thr Pancreatic NBN and POLQ p.Asp469Tyr and p.Thr1434Ala Pancreatic POLQ and TREX1 p.Ala2599Thr and p.Glu321Gly Supplementary Materials and Methods

Case and control population

This population is a clinic-based 6-state series of breast cancer cases and healthy controls of

Caucasian women in Minnesota, Iowa, Wisconsin, North and South Dakota and Illinois recruited from 2002 and 2005. All cancer patients included were diagnosed with invasive breast cancer and had no prior history of any other type of cancer. Healthy normal controls were recruited in parallel from women attending the Department of Internal Medicine at the Mayo Clinic. Controls were frequency matched very well to cases in most of the variables used such as height, weight, body mass, smoking and education. Mean age at menopause is older in cases (48 years) than in controls (46.7 years, p<0.01), and more cases (47.8%) than controls (42.5%) reported a family history of breast or ovarian cancer. This is consistent with previous publications that show that young age at menopause and a family history of breast or ovarian cancer are risk factors for breast cancer. Two notable exceptions are that more controls (72.2%) than cases (63.2%) were postmenopausal and more controls (16.1%) than cases (12.3%) were nulliparous. These factors were included as covariates in multivariate analyses of our genotyping data. Eligible women provided informed consent and a sample of blood as a source of DNA and completed a risk factor questionnaire. Supplementary Figure 1. Pedigree of a breast cancer family showing segregation of a POLQ c.3605delT mutation with breast cancer. Individuals with breast cancer are marked with black circles. Genotyping results of POLQ c.3605delT are indicated with either plus sign (mutation- positive) or minus sign (mutation-negative). Age at genotyping was shown. A slashed symbol indicates that the individual has deceased. Br, breast cancer.

Br 62 yr 57 yr

55 yrBr 42 yr 47 yr 45 yr