REPUBLIQUE DE COTE D’IVOIRE –––––-----––––––------ Union-Discipline-Travail Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Laboratoire de Zoologie et Biologie Animale Année Universitaire 2017-2018 THESE Présentée pour l’obtention du Titre de Docteur de L’Université Félix HOUPHOUËT-BOIGNY 0p Spécialité : Entomologie et Gestion des Ecosystèmes KOFFI Alexandre Franklin Numéro d’ordre 2165 / 2018 INSECTES NÉCROPHAGES SUR SUBSTRAT DE PORC (Sus scrofa domesticus L.) EN ZONE GUINÉENNE DE CÔTE D’IVOIRE : DIVERSITÉ, DYNAMIQUE DES POPULATIONS ET INTÉRÊT EN EXPERTISE MÉDICO-LÉGALE Soutenu publiquement Commission du Jury le, 20 Décembre 2018 M. TANO Yao Professeur Titulaire UFHB Président M. ABOUA Louis Roi N. Maître de Conférences UFHB Directeur Mme. YEBOUÉ N’Guessan Lucie Maître de Conférences UJLoG Rapporteur Mme. YAPO ETTÉ A. Hélène Professeur Titulaire UFHB Examinateur Insectes nécrophages sur substrat de porc (Sus scrofa L.) en zone guinéenne de Côte d’Ivoire… Dédicaces DÉDICACES Je dédie cette Thèse : A mes frère et sœurs ainés, AMANY Georges, KOFFI Soumaley Gisèle Epse DJABO, KOFFI Massan Reine, KOFFI Adrienne Kacou Bla et KOFFI Jeanne Konan Bla ; Qu’ils recoivent ici, l’expression de mes chaleureux et sincères remerciements pour leurs encouragements et leur indéfectible soutien moral. A mes enfants KOFFI Kevin Ange-Alexandre, KOFFI Yoann Christian Emmanuel, KOFFI David Marc-Yvann, KOFFI Qetsia et KOFFI Daniel Esdras ; Merci pour votre inestimable et affectueux soutien. Au Professeur FOUA-BI Kouahou, Entomologiste émérite qui m’a initié à la recherche scientifique et m’a donné le goût de l’Entomologie ; Merci infiniment Professeur. Thèse de Doctorat de l’Université Félix HOUPHOUËT-BOIGNY KOFFI Alexandre Franklin Insectes nécrophages sur substrat de porc (Sus scrofa L.) en zone guinéenne Côte d’Ivoire… Remerciements REMERCIEMENTS Cette thèse est le fruit de quatre années d’étude dont la réalisation a été possible grâce au soutien de plusieurs institutions. Que ces institutions trouvent ici l’expression de ma profonde gratitude : L’Université Félix Houphouët-Boigny (UFHB) qui a bien voulu, à travers son administration, m’autoriser à reprendre mon cursus, là où je l’avais provisoirement suspendu ; Le Programme d’Appui Stratégique à la Recherche Scientifique (PASRES – Côte d’Ivoire) qui m’a fait confiance et a financé ces travaux de recherche dans le cadre du Projet PASRES n° 130 ; Le Centre Suisse de Recherche Scientifique de Recherche en Côte d’Ivoire (CSRS), qui a hébergé les fonds alloués à ce projet de thèse PASRES n° 130 ; L’Institut National d’Hygiène Publique (INHP – Treichville), dont je suis issu et qui a autorisé l’utilisation d’un des laboratoires du Service de Lutte Anti Vectorielle pour les manipulations en salle ; Les Directions du Centre National de Recherche Agronomique (CNRA – Adiopodoumé Km 17, Route de Dabou), du Zoo National d’Abidjan (ZNA) et du Centre National de Floristique (CNF) de l’Université Félix Houphouët-Boigny de Cocody, qui ont accepté que leurs sites hébergent les expériences de ces travaux de thèse en milieu naturel. Cette thèse a été également réalisée grâce au soutien de plusieurs Responsables Administratifs Universitaires, Enseignants et Chercheurs des Universités de Côte d’Ivoire et de France; qu’ils trouvent ici l’expression de mes sincères remerciements : Monsieur KOUAMELAN Essétchi Paul, Professeur Titulaire, Doyen de l’UFR des Biosciences pour les facilités administratives qu’il m’a accordées ; Monsieur N’GORAN Eliezer, Professeur Titulaire, Directeur du Laboratoire de Zoologie et Biologie Animale de l’UFR des Biosciences, pour ses encouragements ; Monsieur TANO Yao, Professeur Titulaire, Président de l’Université NANGUI ABROGOUA (UNA), qui malgré ses nombreuses occupations, m’a fait l’immense honneur de présider la commission du jury de cette thèse ; merci infiniment Professeur pour vos constants encouragements ; Monsieur ABOUA Louis Roi Nondenot, Maître de Conférences (Laboratoire de Zoologie et Biologie Animale), Directeur Scientifique de cette thèse. Je lui suis infiniment reconnaissant pour la confiance qu'il m'a accordée et les discussions enrichissantes que nous avons eues. Outre ses qualités humaines, je salue la qualité de son encadrement, sa disponibilité pour répondre à mes questions, sa vigilance scientifique, ainsi que sa patience dans les corrections de mes écrits ; Thèse de Doctorat de l’Université Félix HOUPHOUËT-BOIGNY KOFFI Alexandre Franklin Insectes nécrophages sur substrat de porc (Sus scrofa L.) en zone guinéenne Côte d’Ivoire… Remerciements Madame YEBOUE N’Guessan Lucie, Maître de Conférences (UJLoG de Daloa), pour ses observations pertinentes et avisées dans les corrections apportées à ce document de thèse. Merci Madame pour votre disponibilité à toute épreuve ; Madame YAPO ETTÉ Hélène, Professeur Titulaire, Directrice de l’Institut de Médecine Légale d’Abidjan (IML), pour ses encouragements et ses précieux conseils. Malgré vos nombreuses occupations, vous n’avez pas hésité à siéger dans la commission du jury de cette thèse. Recevez Madame, à travers ces quelques lignes, l’expression de ma profonde gratitude ; Monsieur KOUASSI Kouassi Philippe, Professeur Titulaire (UFHB), Président du Conseil Scientifique de l’UFR des Biosciences, qui malgré ses nombreuses charges, a accepté de corriger ce document. Merci Professeur pour vos observations et vos suggestions qui ont apporté une valeur scientifique ajoutée à ce document de thèse ; Monsieur AKPESS Akpa Alexandre, Maître de Conférences (UFHB), qui par ses remarques pertinentes, a contribué à apporter une claire lisibilité dans la rédaction de ce document de thèse. Merci Docteur pour les échanges fructueux que nous avons eu et pour votre fraternelle et spontanée disponibilité ; Madame OUALI N’GORAN Mauricette S. W., Maître de Conférences (UFHB), qui n’a pas hésité à me consacrer du temps et à me donner de précieux conseils pour la rédaction de ce document de thèse. Je tiens ici Docteur, à vous exprimer toute ma gratitude ; Monsieur BLAHOUA Kassi Georges, Maître-Assistant (UFHB), qui malgré ses nombreuses occupations, a consacré un temps précieux à corriger ce document de thèse. Merci Docteur pour vos minutieuses et précieuses observations ; Monsieur Damien CHARABIDZÉ, Maître de Conférences (Université de Lille II), Responsable du Laboratoire d’Entomologie Médico-légale de l’Institut de Médecine Légale de Lille (France), pour ses conseils avisés, depuis la conception du projet PASRES n° 130, jusqu’à la rédaction scientifique des différents articles publiés, en passant par la mise en œuvre des expériences sur le terrain. Je vous prie de bien vouloir recevoir ici, l’expression de mes vifs et chaleureux remerciements. Enfin, j’adresse mes chaleureux et sincères remerciements à tous mes collaborateurs chercheurs, techniciens et étudiants, mes amis et connaissances qui n’ont nommément pas été cités dans ce document, pour l’aide et le soutien de quel que nature que ce soit, qu’ils m’ont apporté de près ou de loin. Thèse de Doctorat de l’Université Félix HOUPHOUËT-BOIGNY KOFFI Alexandre Franklin Insectes nécrophages sur substrat de porc (Sus scrofa L.) en zone guinéenne de Côte d’Ivoire… Abréviations-Figures-Tableaux TABLE DES MATIERES TABLE DES MATIERES………………………………………………………………… i LISTE DES ABBREVIATIONS………………………………………………………….. v LISTE DES FIGURES…………………………………………………………………….. vi LISTE DES TABLEAUX…………………………………………………………………. xiii INTRODUCTION……………………….………………………………………………… 1 CHAPITRE 1 : GENERALITES…………………………………………………………. 5 1.1. Faune entomologique impliquée dans le processus de colonisation d’un cadavre de mammifère exposé à l’air libre……………………………………………………. 6 1.1.1. Diversité spécifique de la faune entomologique nécrophage d’un cadavre de mammifère exposé à l’air libre……………………………………………………… 6 1.1.1.1. Ordre des Diptères………………………………………………………………….. 6 1.1.1.2. Ordre des Coléoptères……………………………………………………………… 15 1.1.1.3. Ordre des Hyménoptères…………………………………………………………… 23 1.1.1.4. Ordre des Lépidoptères…………………………………………………………….. 23 1.1.2. Processus de colonisation par les insectes d’un cadavre de mammifère exposé à l’air libre…………………………………………………………………………………. 25 1.1.2.1. Détection d’un cadavre exposé à l’air libre et déclenchement des pontes…………. 25 1.1.2.2. Succession des insectes sur un cadavre exposé à l’air libre et notion d’escouades….. 26 1.2. Rôle des insectes nécrophages dans le processus de décomposition d’un cadavre…. 28 1.2.1. Utilisation de l’écosystème-cadavre en fonction du régime alimentaire……………. 28 1.2.2. Effets de l’activité des insectes nécrophages sur la décomposition des cadavres……. 33 1.3. Décomposition d’un cadavre de mammifère en tant que matière organique………. 34 1.3.1. Modification post mortem d’un cadavre de mammifère……………………………. 34 1.3.1.1. Refroidissement du corps (algor mortis)……………………………………………. 35 1.3.1.2. Rigidité cadavérique (rigor mortis)…………………………………………………. 35 1.3.1.3. Lividités cadavériques (livor mortis)………………………………………………. 35 i Thèse de Doctorat de l’Université Félix HOUPHOUËT-BOIGNY KOFFI Alexandre Franklin Insectes nécrophages sur substrat de porc (Sus scrofa L.) en zone guinéenne de Côte d’Ivoire… Abréviations-Figures-Tableaux 1.3.1.4. Déshydratation……………………………………………………………………... 36 1.3.1.5. Autolyse……………………………………………………………………………. 36 1.3.1.6. Putréfaction………………………………………………………………………… 36 1.3.1.7. Squelettisation……………………………………………………………………… 37 1.3.2. Classification des stades de décomposition d’un cadavre…………………………… 37 1.3.3. Paramètres influençant la décomposition d’un cadavre…………………………….