CURRICULUM VITAE et listes des travaux et des activit´esde Gilles DURRIEU http://web.univ-ubs.fr/lmam/durrieu/index.html - [email protected] Fran¸cais,mari´e,2 enfants. N´ele : 5 ao^ut1969 `aToulouse 1 Synth`esede la carri`ere Sp´ecialit´es: Statistique non param´etrique,Statistique robuste, Statistique s´equ- entielle, Valeurs extr^emes,Environnement, Biologie et g´en´etique,Statistique appli- qu´eeet Analyse de donn´ees. 35 articles parus ou accept´esdans des revues internationales `acomit´ede lecture (c.f. section A.1) 83 communications dont 26 invit´es dans des conf´erencesnationales et internationales (c.f. section A.3) HDR en Math´ematiques (Universit´ede Bordeaux 1) 23 septembre 2009, mention tr`esho- norable Mod´elisationStatistique de gros volume de donn´eesen environnement et g´en´etique Rapporteurs : Philippe Besse, Alain Pav´eet Fran¸coisSchmitt Jury : Philippe Besse, Alain Boudou, Antoine Gr´emare,Jean-Charles Massabuau, Alain Pav´e et Fran¸cois Schmitt Doctorat en Math´ematiquesAppliqu´ees (Universit´eBordeaux 1) 26 septembre 1997, mention tr`eshonorable Contribution statistique `al'´etudede maladie d'origine mitochondriales Directeurs : Jean-Marc Deshouillers Rapporteurs : Xavier Milhaud et Beno^ıtTruong-Van Jury : Jaromir Antoch, Jean-Marc Deshouillers, Jana Jureˇckov´a, Jean-Pierre Mazat, Xavier Milhaud, Paul Morel, Mikhail Nikouline et Beno^ıtTruong-Van DEA de Math´ematiquesAppliqu´eeset Calculs Scientifiques (Universit´eBordeaux 1) en juin 1994, mention Bien Titulaire de la Prime d'Encadrement Doctoral et de Recherche de septembre 2006 `a septembre 2010 Titulaire de la Prime d'Excellence Scientifique depuis octobre 2012 Poste actuel (depuis septembre 2010): Professeur des Universit´es`al'Universit´ede Bretagne- Sud. Chercheur au Laboratoire de Math´ematiquesde Bretagne Atlantique (LMBA), UMR CNRS 6205 Grade actuel : Professeur des Universit´esde premi`ereclasse depuis le 1 septembre 2014 Septembre 1999 - ao^ut 2010 : Ma^ıtrede conf´erences`al'Universit´ede Bordeaux 1 Octobre 1997 - ao^ut 1999 : Stage post-doctoral en math´ematiquesappliqu´ees,INSERM U358, 1 Paris financement contrat europ´eenBIOMED2 BMH4-CT97-2532. Directeur du D´epartement MIS (Math´ematiques,Informatique et Statistique) de l'Universit´ede Bretagne Sud (UBS) depuis ao^ut 2012. Le d´epartement est compos´ed'un total de 31 enseignants chercheurs (10 Pr, 18 Ma^ıtrede conf´erences,2 ATER + 1 PRAG). Le d´epartement MIS est form´eautour des disciplines Math´ematiques,Informatique et Statistique au sein de l'UFR SSI (Sciences et Sciences de l'Ing´enieur).Je pilote les enseignements et je g`erele budget relevant de ces disciplines, par d´el´egationde responsabilit´edu Conseil d'UFR et du directeur de la facult´edes Sciences et Sciences de l'Ing´enieur(UFR SSI) Fr´ed´ericBedel. J'´elabore la politique de formation dans ces disciplines et je g`ereles formations, y compris les enseignements autres que ceux de MIS. Responsable de l'´equipe Syst`emesDynamiques, Probabilit´eset Statistique du LMBA depuis janvier 2012. Cette ´equipe compos´eede 28 enseignants chercheurs et de 24 doctorants constitue l'un des trois groupes de recherche du LMBA. Directeur du Master de statistique de l'UBS depuis septembre 2010. Directeurs de formation : je suis directeur de la Licence et du Master de Math´ematiques, Informatique et Statistique. Th`eseset stage post-doctoral : supervision d'un stage post-doctoral, quatre th`esessoute- nues et trois th`esesen cours. Mohamedou Sow - Soutenue le 20 mai 2011 : D´eveloppement de mod`elesnon param´etriques et robustes : application `al'analyse du comportement de bivalves et `al'analyse de liaison g´en´etique- Codirection avec Laurent Briollais (University of Toronto, Canada) - actuellement chercheur ADERA UMR CNRS 5805. Rapha¨elCoudret - Soutenue le 16 septembre 2013 : Stochastic modelling using large data sets : applications in ecology and genetics - Codirection avec J´er^omeSaracco (Universit´ede Bordeaux 1) - actuellement ing´enieurde recherche en Belgique (entreprise OpenAnalytics). Quang Khoai Pham - Soutenue le 9 janvier 2015 : Estimation de quantiles extr^emeset proba- bilit´esrares d'un processus stochastique : application en environnement - Codirection avec Ion Grama (Universit´ede Bretagne Sud) - actuellement professeur associ´e`al'universit´ede Hanoi au Vietnam. Rabih Damaj - Soutenue le 29 mai 2015 : Inf´erenceStatistique sur le processus de Mino - Codirection avec Evans Gouno (Universit´ede Bretagne Sud). Jonathan Villain - En cours depuis octobre 2012 : Mod´elisationde la toxicit´edes mol´ecules`a l'aide de m´ethodes `anoyau- Codirection avec Ronan Bureau (Universit´ede Caen). Soutenance pr´evue2015. Sami Capderou - d´ebutjanvier 2015 : Estimation statistique non param´etriqueen sciences de l'environnement - Codirection avec Bernard Bercu (Universit´ede Bordeaux). K´evinJaun^atre - d´ebutmai 2015 : Analyse et mod´elisationstatistique de donn´eesde consom- mation ´electrique - Codirection avec Ion Grama (Universit´ede Bretagne Sud). 2 Comit´es,Conseils, Commissions : Membre ´eludu Conseil de D´epartement Math´ematiques,Informatique et Statistique de l'UBS depuis septembre 2012 Membre ´eludu Conseil d'UFR Sciences et Sciences de l'Ing´enieur(SSI) de l'UBS depuis d´ecembre 2012 Membre ´elu du Conseil Acad´emiqueRestreint de l'Universit´ede Bretagne-Sud Membre ´elu `ala commission de la recherche de l'Universit´ede Bretagne-Sud Membre du comit´ede direction du LMBA (UBS+Universit´ede Bretagne Occidentale) Membre du bureau de la facult´edes Sciences et Sciences de l'Ing´enieur(UFR SSI) Plusieurs fois membre de Commissions de sp´ecialisteset de Comit´esde s´election(Pr et MCU). 2 Activit´escientifique L'objectif de mes travaux est de d´evelopper des mod`elesn´ecessitant des d´eveloppements ori- ginaux en Statistique ainsi qu'en Informatique pour le calcul efficace des estimations. Mes re- cherches se caract´erisent par de nombreuses articulations avec d'autres disciplines pour l'´etude de syst`emesbiologiques complexes dans les domaines de la g´en´etique(axe 1), de l'environne- ment (axe 2) et de la recherche `al'interface entre les laboratoires de recherche et les entreprises (voir paragraphes 2.3.4 et B.4). 2.1 Pr´esentation des th´ematiquesde recherche : grands axes de re- cherches et apport dans le ou les domaines concern´es Axe 1 : je me suis int´eress´eau d´eveloppement et `al'´etudestatistique d'une proc´edurerobuste et s´equentielle pour construire un intervalle de confiance de longueur pr´ed´etermin´eedu param`etre de r´egressiond'un mod`elelin´eaire.Dans un premier temps, il nous est apparu important de consid´ererdes estimateurs robustes du fait de la pr´esence de valeurs aberrantes dans le domaine de la biologie. Un second aspect qui m'a motiv´eest le nombre et le mode d'acquisition des donn´ees.L'acquisition des donn´eesdans le domaine des puces `aADN est couteuse et il est important dans ce domaine de d´eceler avec pr´ecisionsi un g`eneest diff´erentiellement exprim´eou pas. Nous avons d´evelopp´eune proc´edures´equentielle robuste bas´eesur un estimateur robuste du param`etrede r´egressionafin de construire un intervalle de confiance de longueur donn´ee de ce param`etre.Les m´ethodes de statistique s´equentielle sont tout `afait adapt´ees`ace type de situation o`ule param`etredominant est la pr´ecisionque l'on souhaite obtenir. La variable al´eatoirecruciale qui conditionne notre proc´edureest la variable d'arr^et,qui d´etermine l'arr^et de la prise en compte (i.e., de l'acquisition) de nouvelles donn´ees.Nous avons montr´eque la proc´edure s´equentielle est en fait, pour une longueur d'intervalle de confiance fix´ee,un temps d'arr^et.Nous proposons des estimateurs de la variance asymptotique et sous des conditions de r´egularit´es,nous donnons les propri´et´esasymptotiques (quand l'amplitude de l'intervalle de confiance tend vers z´ero)de la proc´edures´equentielle. Les performances de la proc´eduresont aussi ´etudi´eesnum´eriquement et sur des donn´eesr´eellesrelatives au cancer du sein. L'objectif ´etaitdouble. Il s'agissait d'une part de trouver des marqueurs g´en´etiques`al'exposition `ades oestrog`enes et d'autre part d'identifier une dose minimale `apartir de laquelle les g`enesne sont plus exprim´es.Les travaux regroup´esici sont les suivants : [A.1-7], [A.1-13], [A.1-14], [A.1- 3 15], [A.1-16], [A.1-22] et [A.1-33]. L'article [A.1-7] est une revue des quantiles de r´egression dans le domaine de la g´enomiquepubli´eeen 2014 dans le journal \Human Genetics". L'article [A.1-5] et [A.2-4] concerne la mise en place d'un mod`eleg´en´eralbas´esur des quantiles de r´egressiondans le domaine de la cheminformatique en collaboration avec le Professeur Ronan Bureau de l'Universit´ede Caen. Axe 2 : La protection de l'environnement est l'une des priorit´esde nos soci´et´es.Les animaux marins testent en permanence la qualit´ede leur milieu. Ils repr´esentent donc une voie possible de surveillance de leur ´ecosyst`eme.En observant l'´evolution au cours du temps de leur rythme de vie, on obtient un grand nombre d'informations sur leur environnement. Cette d´emarche a ´et´emise en place avec succ`espar l'´equipe de l'oeil du mollusque (Pierre Ciret, Gilles Dur- rieu, Mohamedou Sow, Damien Tran, Jean-Charles Massabuau) des universit´esde Bordeaux et de Bretagne Sud sur des mollusques bivalves ´equip´es d'´electrodes l´eg`eres(valvom´etrie)qui respectent leur comportement naturel ([A.1-23]). Leur premier r^oleconnu est la d´etection pr´ecoce de pollutions `apartir du d´eveloppement de mod`eledose-r´eponse adapt´eafin d'esti- mer la concentration de contaminant ayant un effet sur les animaux ([A.1-21], [A.1-29] et [A.1-31]).