Dihydrogen Bonds: a Study

Dihydrogen Bonds: a Study

DIHYDROGEN BONDS: A STUDY David HUGAS GERMÀ ISBN: 978-84-694-2209-0 Dipòsit legal: GI-190-2011 http://hdl.handle.net/10803/7921 This work is licensed under the Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 3.0 Unported License. To view a copy of this license, visit http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ or send a letter to Creative Commons, 171 Second Street, Suite 300, San Francisco, California, 94105, USA. Universitat de Girona Master of Science Thesis Dihydrogen Bonds: A study by David Hugas Germ`a Girona, summer 2010 Doctoral programme of\Qu´ımica te`orica i computacional" Supervisor: Dr. S´ılvia Simon Rabasseda Co-Supervisor: Prof. Dr. Miquel Duran Portas Mem`oria presentada per optar al t´ıtol de Doctor per la Universitat de Girona This work is licensed under the Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 3.0 Unported License. To view a copy of this license, visit http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ or send a letter to Creative Commons, 171 Second Street, Suite 300, San Francisco, California, 94105, USA. Departament de Qu´ımica Institut de Area` de Qu´ımica F´ısica Qu´ımica Computacional La doctora S´ılvia Simon i Rabasseda, professora d'Universitat a l'Area` de Qu´ımica F´ısica de la Universitat de Girona i el professor doctor Miquel Duran i Portas, catedr`atic d'Universitat a l'Area` de Qu´ımica F´ısica de la Universitat de Girona CERTIFIQUEN QUE: En David Hugas i Germ`a, llicenciat en Qu´ımica per la Universitat de Girona, ha realitzat sota la seva direcci´o,a l'Institut de Qu´ımica Com- putacional i al Departament de Qu´ımica de la Facultat de Ci`encies de la Universitat de Girona el treball d'investigaci´oque porta per nom: \Dihydrogen Bonds: A Study" que es presenta en aquesta mem`oria per optar al grau de Doctor per la Universitat de Girona. I perqu`econsti a efectes legals, signen aquest certificat: Dra. S´ılvia Simon i Rabasseda Prof. Dr. Miquel Duran i Portas Girona, a 23 de juny de 2010 Als meus pares, als meus avis, al meu cos´ıi als meus oncles. Agra¨ıments A les mires del cel, ones ultraviolades, infraroges. Entre el submarinista i el peix que no sap on va, entre els ossos calcificats, c`el·lules. Bullen part´ıcules d'H2O al s`otil despintat, entre sistemes solars, entre l'espai perdut. L'astronauta camina amb la seguretat de saber que els ampers s´on el voltatge partit resist`encia. Camina sense escr´upols per ser com ´es, i no s'expressa [obertament perqu`eno pot. Es´ aix´ı, l'astronauta, i es mira el cel desconcertat: ones alfa, ones gamma. | Ant`onia Font C`apsula d'emerg`encia (2004) Massa temps. Cada any que passa, miro enrera i veig que la llicenciatura queda m´eslluny i que encara no he acabat el doctorat. Per`otot t´ecoses bones i dolentes. Les dolentes les deixarem per un altre dia, que si estic escrivint aquest apartat ´esque la tesi est`aa punt de comen¸car el llarg, tedi´os,feixuc i burocr`atic proc´es que acabar`a,en el menor temps possible|creuem els dits| en la seva defensa final. Llavors ja veurem qu`epassa. Amb una etapa tan llarga han passat moltes coses. I molta gent, molt´ıs- sima. De tot tipus, de molts llocs, per molts motius, de molts car`acters, de moltes relacions, coneguts per efecte directe de la recerca o coneguts pel sim- ple fet de ser viu. Ara tots ells formen part de la meva vida, encara que sigui poqu´ıssim. N'hi ha que no coneixia, n'hi ha que ja no hi son, n'hi ha que es quedaran una estona i n'hi ha que hi seran sempre. I tots ells tenen alguna cosa a veure amb mi i amb aquest compendi, i per b´eo per mal, amb major o menor mesura, m'han canviat. Me'n deixar´emolts. No m'ho tingueu en compte. Els primers de la llista s´onels meus pares. M'han animat a seguir endavant i a sortir dels sotracs amb paci`encia, afabilitat i amor. S´onels millors del M´on, encara que soni infantil. I no ´es perqu`enom´es en tingui uns! Els avis, els que hi s´oni els que no. Una em va cuidar de petit, em vestia i em feia els dinars. L'altra m'ha ensenyat a escoltar. Un em va despertar la curiositat per les coses i l'altre ´es el que em continua demostrant com ser tossut per seguir endavant. Els segons de la llista s´onels directors de tesi i els caps visibles de l'Institut de Qu´ımica Computacional. La S´ılvia Simon, que aquesta ser`a,espero, la seva primera tesi dirigida i presentada. No deixa de ser un petit honor. Tot el que hi ha aqu´ıdins i que sigui on s´oc,ella tamb´en'´es culpable. En Miquel Duran, co-director de la tesi, per tenir idees m`agiques de com orientar la recerca. En Miquel Sol`a,per haver confiat en mi a l'assignar-me la beca. I a la cap absoluta de l'IQC: La Carme L´opez. Ja sabeu com n'´esd'important una secret`aria competent en aquests llocs. No tot han sigut DHBs durant aquest temps. Altres projectes d'altra gent que han tingut m´eso menys `exit. Un dels aspectes bons del doctorat ´esla pos- sibilitat de col·laborar amb altres grups i veure altres maneres de fer. S'aprenen moltes coses, altres maneres d'organitzar-se, de treballar i de fer. La primera estada van ser tres mesos a la Universit`adi Torino, amb el professor Piero Ugliengo. Quant de temps fa d'aix`o! El temps vola. Com els articles. La segona estada va ser a Berlin, amb un tema que s´onafant`astic: \Wavepacket dynamics on conical intersections". Gr`acies a en Llu´ıs Blancafort que em va posar en contacte amb la Let´ıcia Gonz`alez a la Freie Universit¨at Berlin, ll`as- tima que no en sort´ıs res publicat, per`otant l'experi`encia professional com personal va ser extraordin`aria. I la ´ultima estada a la Vrije Universiteit Am- sterdam, amb el professor Matthias Bickelhaupt, que sap treure el suc com ning´ude qualsevol tema. Els soldats rasos que han passat pel meu costat (o jo he passat pel seu) durant tot aquest periple, que en definitiva s´onels que m'han hagut d'aguantar. Tots aquells que han passat per l'antic despatx 166 (abans una casa comunal, ara un parell de d´uplex) o voltaven per l'IQC en algun moment o altre. A veure si me'n recordo de tots: la Montse Casas (trufes!), en Miquel Torrent (pobre de mi!), en Xavier Fradera (va marxar, va tornar i va tornar a marxar), en Josep Maria Luis (escolteu les seves teories sobre parelles), en Xavier Giron´es (encara no ho entenc), en Pedro Salvador (CHA-CHA-CHA i CP), en Jordi Poater (cal tenir paci`encia per aguantar-me al costat), l'Eduard Matito (lo cavaller), l'Albert Poater (parlant d'escoltar teories...), en Quim Chaves (Zipi) i en Juanma Barroso (Zape), la Mireia Guell¨ (talons llunyans), en David Asturiol (no tothom pot ser campi´od'Espanya d'slot), la S´ılvia Osuna (divina), la Cristina Butchosa (friki fins i tot pels est`andards IQC), en Dani Mas´o(quan ´erem joves...), en Ferran Feixas (Frodo), l'Anna Dachs i l'Anna Diaz (com en Zipi i en Zape, per`oen femen´ı), l'Eloy Ramos (aquest noi ´esalt), en Sergi Ru´ız (Jap´ot'espera), la Laia Guillaumes (tu saps on et poses, piltrafilla?)... i hi han m´esnoms, que ens hem fet m´es o menys. Hi ha tot el sector experimental, envoltats de fums t`oxics i brut´ıcies estranyes que s'entossudeixen a dir-nos \raros" mentre es dediquen a treballar amb materials perillosos i contaminants. Per`oqu`ehi farem, tothom ´esfeli¸ca la seva manera. Tamb´ehi ha tota la gent que m'he anat trobant a les estades: la Marta Corno, la In´esCorral i en Willem-Jan van Zeist. Finalment, un grapat de gent que es poden contar amb els dits d'una m`a. No han desenvolupat res de la recerca, no han estat en cap article, no tenen cap ´ındex d'impacte en cap revista (b´e, alguns si) per`otenen un gran pes en tot aquest espectacle, una import`ancia fonamental per haver-me ent`es i haver- me donat `anims, girar-me els punts de vista i fer-me veure la part bona de les coses. El cam´ıamb vosaltres ´esm´esf`acil i entretingut. Gr`acies. I ara qu`em´es? List of Publications • D. Hugas, S. Simon, and M. Duran. Counterpoise-corrected potential en- ergy surfaces for dihydrogen bonded systems. Chem. Phys. Lett., 386(4{ 6):373{376, 2004. • D. Hugas, S. Simon, and M. Duran. MH ··· HX dihydrogen bond with M = Li, Na and X = F; Cl; Br: A CP-Corrected PES calculation and an AIM analysis. Struct. Chem., 16(3):257{263, 2005. • D. Hugas, S. Simon, and M. Duran. Electron density topological proper- ties are useful to assess the difference between hydrogen and dihydrogen complexes. J. Phys. Chem. A, 111(20):4506{4512, 2007. • D. Hugas, S. Simon, M. Duran, C. Fonseca Guerra, F.M. Bickelhaupt. Dihydrogen bonding: Donor-acceptor bonding (AH ··· HX) versus the H2 Molecule (A − H2 − X).

View Full Text

Details

  • File Type
    pdf
  • Upload Time
    -
  • Content Languages
    English
  • Upload User
    Anonymous/Not logged-in
  • File Pages
    238 Page
  • File Size
    -

Download

Channel Download Status
Express Download Enable

Copyright

We respect the copyrights and intellectual property rights of all users. All uploaded documents are either original works of the uploader or authorized works of the rightful owners.

  • Not to be reproduced or distributed without explicit permission.
  • Not used for commercial purposes outside of approved use cases.
  • Not used to infringe on the rights of the original creators.
  • If you believe any content infringes your copyright, please contact us immediately.

Support

For help with questions, suggestions, or problems, please contact us