Nr. Name Größe [ha] Landkreis bzw. kreisfreie Stadt 1 Südharz 2.409 Nordhausen 2 Südharzer Gipskarst 2.872 Nordhausen 3 Ellersystem - Weilröder Wald - Sülzensee 1.902 Eichsfeld, Nordhausen 4 Kyffhäuser - Badraer Schweiz - Helmestausee 3.781 Nordhausen, Kyffhäuserkreis 5 Dickkopf - Bendelebener Forst - NSG Gatterberge 1.226 Kyffhäuserkreis 6 Helme-Unstrut-Niederung 1.765 Kyffhäuserkreis 7 Bleicheröder Berge 1.271 Nordhausen, Eichsfeld 8 Westliche Hainleite - Wöbelsburg 1.170 Nordhausen, Kyffhäuserkreis 9 Hainleite - Westliche Schmücke 7.548 Kyffhäuserkreis, Sömmerda 10 Hohe Schrecke - Finne 5.732 Kyffhäuserkreis, Sömmerda 11 Untereichsfeld - Ohmgebirge 11.006 Eichsfeld 12 Werrabergland südwestlich Uder 8.433 Eichsfeld 13 Südliches Eichsfeld 1.967 Eichsfeld, Unstrut-Hainich-Kreis 14 Hainich 15.036 Wartburgkreis, Unstrut-Hainich-Kreis 15 Gera-Unstrut-Niederung um Straußfurt 5.508 Unstrut-Hainich-Kreis, Sömmerda 16 Ackerhügelland westlich Erfurt mit Fahnerscher Höhe 12.052 Wartburgkreis, Gotha, Erfurt, Sömmerda 17 Ackerhügelland nördlich Weimar mit Ettersberg 18.703 Sömmerda, Erfurt, Weimarer Land, Weimar 18 Werra-Aue zwischen Breitungen und Creuzburg 2.578 Wartburgkreis, Schmalkalden-Meiningen 19 Thüringische Rhön 19.949 Wartburgkreis, Schmalkalden-Meiningen 20 Herpfer Wald - Berkeser Wald - Stillberg 2.207 Schmalkalden-Meiningen 21 Gleichberge 1.831 Hildburghausen 22 Grenzstreifen am Galgenberg - Milzgrund - Warthügel 199 Hildburghausen 23 Rodachaue mit Bischofsau und Althellinger Grund 563 Hildburghausen 24 Thüringer Wald zwischen Ruhla und Großer Inselsberg 2.210 Wartburgkreis, Gotha, Schmalkalden-Meiningen 25 Mittlerer Thüringer Wald westlich Oberhof 1.037 Gotha, Schmalkalden-Meiningen 26 Mittlerer Thüringer Wald 18.372 Schmalkalden-Meiningen, Suhl, Ilm-Kreis, Hildburghausen 27 Westliches Thüringer Schiefergebirge 11.914 Hildburghausen, Saalfeld-Rudolstadt, Sonneberg 28 Nördliches Thüringer Schiefergebirge mit Schwarzatal 7.152 Saalfeld-Rudolstadt 29 Ohrdrufer Muschelkalkplatte und Apfelstädtaue 10.397 Gotha, Ilm-Kreis 30 Große Luppe - Reinsberge - Veronikaberg 2.483 Ilm-Kreis 31 Muschelkalkgebiet südöstlich Erfurt 3.433 Erfurt, Ilm-Kreis, Weimarer Land 32 Ilmtal zwischen Bad Berka und Weimar mit Buchfarter Wald 1.921 Weimar, Weimarer Land 33 Muschelkalkhänge der westlichen Saaleplatte 10.824 Ilm-Kreis, Saalfeld-Rudolstadt, Weimarer Land, Saale-Holzland-Kreis, Jena 34 Langer Berg - Buntsandstein-Waldland um Paulinzella 4.300 Ilm-Kreis, Saalfeld-Rudolstadt 35 Muschelkalk-Landschaft westlich Rudolstadt 1.570 Saalfeld-Rudolstadt 36 Vordere und Hintere Heide südlich Uhlstädt 6.183 Saalfeld-Rudolstadt, Saale-Orla-Kreis 37 Frankenwald - Schieferbrüche um Lehesten 7.209 Saalfeld-Rudolstadt, Saale-Orla-Kreis 38 Hänge an der Bleilochtalsperre 927 Saale-Orla-Kreis 39 Plothener Teiche 2.880 Saale-Orla-Kreis 40 Auma-Aue mit Wolcheteiche und Struthbach-Niederung 877 Saale-Orla-Kreis, Greiz 41 Pöllwitzer Wald 2.030 Greiz 42 Elstertal zwischen Greiz und Wünschendorf 1.602 Greiz 43 Zeitzer Forst 397 Saale-Holzland-Kreis, Gera 44 Nordöstliches Altenburger Land 3.398 Altenburger Land.