ÉRICA MANGARAVITE ESTRUTURA E DIVERSIDADE GENÉTICA NO COMPLEXO Cedrela fissilis (MELIACEAE) ESTIMADAS COM MARCADORES MICROSSATÉLITES Dissertação apresentada à Universidade Federal de Viçosa, como parte das exigências do Programa de Pós- Graduação em Genética e Melhoramento, para a obtenção do título de Magister Scientiae. VIÇOSA MINAS GERAIS - BRASIL 2012 i Ficha catalográfica preparada pela Seção de Catalogação e Classificação da Biblioteca Central da UFV T Mangaravite, Érica, 1987- M277e Estrutura e diversidade genética no complexo 2012 Cedrela fissilis (Meliaceae) estimadas com marcadores microssatélites / Érica Mangaravite. – Viçosa, MG, 2012. viii, 32f. : il. ; (algumas col.) ; 29cm. Orientador: Luiz Orlando de Oliveira. Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Viçosa. Referências bibliográficas: f. 26-32 1. Cedrela fissilis - Genética. 2. Cedrela fissilis - Distribuição geográfica. 3. Filogeografia. 4. Genética florestal. 5. Diversidade de plantas - Conservação. 6. Genética de populações. 7. Microssatélites (Genética). I. Universidade Federal de Viçosa. Departamento de Biologia Geral. Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento. II. Título. CDD 22. ed. 583.77 ÉRICA MANGARAVITE ESTRUTURA E DIVERSIDADE GENÉTICA NO COMPLEXO Cedrela fissilis (MELIACEAE) ESTIMADAS COM MARCADORES MICROSSATÉLITES Dissertação apresentada à Universidade Federal de Viçosa, como parte das exigências do Programa de Pós- Graduação em Genética e Melhoramento para a obtenção do título de Magister Scientiae Aprovada em 5 de Setembro de 2012. _________________________________ _________________________________ João Augusto Alves Meira Neto Christina Cleo Vinson (Coorientadora) __________________________________________ Luiz Orlando de Oliveira (Orientador) i Aos meus pais, José Carlos e Maria Julia, Ao namorado, Diego Volpini, Aos irmãos, Igor e Vítor, Dedico! ii AGRADECIMENTOS À Universidade Federal de Viçosa (UFV), pela oportunidade de realizar o mestrado em Genética e Melhoramento e de cumprir este trabalho. À CAPES e ao CNPq, pela concessão de bolsa e financiamento. Ao Laboratório de Biotecnologia do Cafeeiro, pelo uso do Sequenciador. Ao Prof. Braz e aos colegas Cristiano e Rogério pela ajuda nas coletas. À Magali, por todo material de Cedrela coletado durante o seu doutorado. Ao professor Luiz Orlando, pela orientação, dedicação, paciência, por todos os ensinamentos e por depositar tanta confiança em mim. Aos co-orientadores, Christina e Everaldo. Em especial, à Christina, pela dedicação, companheirismo, amizade, paciência e por todos os ensinamentos. A todos os professores que colaboraram com a minha formação acadêmico-profissional neste um ano e meio. Aos amigos do Laboratório de Biologia Molecular e Filogeografia, Juliana, Vanderson, Christina, Thaís, Alberto, Thamyres, Alexander, Ana Paula, Amanda, Hugo, Flávio, Lucas, Gislaine, Lis, Rafaela, Larissa, Camila; aos que não estão mais no laboratório, Silvana, Magali, Lídia, Cassiana e Carol; ao primeiro e único estagiário, Vitor, e aos amigos que adquiri de em Viçosa depois que vim para cá, Bárbara, Luis Felipe, Iara, David, Thomas, Cláudia, Kátia e Brenda; a todos, pelo companheirismo, amizade, pelas boas gargalhadas, pelas confraternizações e ajuda fornecida, direta ou indiretamente, durante o período do meu trabalho, muito obrigada por poder contar com vocês! Aos amigos que conheci antes de vir para Viçosa, Samuel, Ariádine, Fernanda, Alan e Leandro; muito obrigada pelo estágio, curso, apoio e amizade, colaborando para que a minha vinda para cá desse tudo certo! Às irmãs acadêmicas e amigas de Alegre, Angélica e Sara, juntamente com os professores Marcia e Adésio, pela amizade e continuação dos trabalhos iniciados na minha graduação. Aos amigos Thaís (Thatha) e Guilherme, pela companhia e boas risadas! Às minhas amigas de sempre da Sister&cia Franciele (Fran), Michelle (Irmã Mi) e Schalana (Schal), muito obrigada pelo carinho, confiança, companheirismo e pela iii amizade eterna. À minha amiga-irmã, Lidiane (Lidi), a irmã que Deus me deu, fonte de amor e sinceridade, muito obrigada pelo companheirismo e pelos dez anos de amizade. Aos meus irmãos, Igor e Vítor, pela alegria e amor, indispensáveis em minha vida, sou eternamente apaixonada por vocês. À minha cunhada Julyara muito obrigada pelo carinho e amizade! Ao meu namorado, Diego, por estar ao meu lado nestes sete anos de namoro, me acompanhando e apoiando sempre em todas as minhas decisões. Por ser compreensivo e paciente! Por me mostrar a importância da fé em cada dia! Muito obrigada pela amizade, carinho e principalmente por me mostrar o verdadeiro amor! Aos meus pais, José Carlos e Maria Julia, pelos exemplos de vida, pelos conselhos, carinho, pelos ensinamentos de fé e honestidade, pelo amor sem tamanho, por sempre me apoiarem e incentivarem meus estudos, pela confiança e pela disposição em me ajudar durante toda a realização do meu trabalho. Eu amo vocês infinitamente, e espero um dia poder retribuir todo o amor! À Deus! Meu Pai, muito obrigada! Ao Senhor Jesus, obrigada por tantas bênçãos! Pelo seu amor sincero e gratuito, mesmo diante das minhas imperfeições, por me conduzir sempre para a direção certa, colocando pessoas especiais que enchem minha vida de alegria! Obrigada por ter feito TUDO SEMPRE dar certo! Por todos os dons concedidos! Obrigada pelo Teu Espírito Santo que sempre me acompanha, passo a passo, na minha caminhada! Obrigada, Nossa Senhora, Mãesinha linda, pelo amor infinito, pela intercessão de cada dia, pelo seu colo nos momentos em que fraquejei, pelo seu exemplo de fé e serviço! Senhor Deus, o meu pedido de hoje é apenas: ensina- me a Te agradecer! iv BIOGRAFIA ÉRICA MANGARAVITE, filha de José Carlos Soares Mangaravite e Maria Julia de Medeiros Mangaravite, nasceu na cidade de Cachoeiro de Itapemirim, Espírito Santo (ES), em 13 de outubro de 1987. Concluiu o Ensino Fundamental em 2001, na Escola Estadual de Ensino Fundamental e Médio “Waldemiro Hemerly” em Rio Novo do Sul-ES e o ensino médio em 2004, na Escola de Ensino Médio “Guimarães Rosa”, em Cachoeiro de Itapemirim- ES. Graduou-se no Curso de Ciências Biológicas da Universidade Federal do Espírito Santo, na modalidade bacharelado, em fevereiro de 2011. Em março de 2011, iniciou o curso de mestrado no Programa de Pós-graduação em Genética e Melhoramento, área de concentração Genética Vegetal, na Universidade Federal de Viçosa. v SUMÁRIO RESUMO ..................................................................................................................................... vii ABSTRACT ................................................................................................................................ viii INTRODUÇÃO ............................................................................................................................ 1 MATERIAL E MÉTODOS .......................................................................................................... 3 1. Estratégia de Amostragem .................................................................................................... 3 2. Extração de DNA e análise de marcadores microssatélites .................................................. 3 3. Análise de dados ................................................................................................................... 7 3.1. Análises dentro de populações .......................................................................................... 7 3.2. Análises entre populações ................................................................................................. 7 RESULTADOS............................................................................................................................. 9 1. Diversidade genética dos locos microssatélites .................................................................... 9 2. Diferenciação entre populações ............................................................................................ 9 3. Estrutura genética populacional .......................................................................................... 12 DISCUSSÃO .............................................................................................................................. 19 1. Avaliação da diversidade entre e dentro das populações .................................................... 19 2. Avaliação da diversidade e estrutura entre e dentro das áreas de distribuição.................... 20 3. Implicações para conservação ............................................................................................. 23 CONCLUSÕES .......................................................................................................................... 25 REFERÊNCIAS .......................................................................................................................... 26 vi RESUMO MANGARAVITE, Érica, M.Sc., Universidade Federal de Viçosa, setembro de 2012. Estrutura e diversidade genética no complexo Cedrela fissilis (Meliaceae) estimadas com marcadores microssatélites. Orientador: Luiz Orlando de Oliveira. Coorientadores: Christina Cleo Vinson e Everaldo Gonçalves de Barros. O conhecimento de como a variação genética está dividida nas populações pode ter implicações importantes na biologia evolutiva, ecológica e na conservação. A espécie Cedrela fissilis (Meliaceae) é uma espécie arbórea associada à Floresta Estacional e Ombrófila. Além disso, esta espécie é considerada “ameaçada” na lista vermelha de espécies da IUCN devido à perda de habitat e ao
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