UNIVERSITÉ D’ORAN ES-SENIA FACULTÉ DES SCIENCES DE LA NATURE ET DE LA VIE DÉPARTEMENT DE BIOTECHNOLOGIE Mémoire de MAGISTER en Biotechnologie Option : Intérêt des Microorganismes en Agriculture et en Agroalimentaire Présenté et soutenu publiquement par : Melle Fatima MESFEK Thème : Étude écologique et taxonomique des champignons forestiers et morphologie des ectomycorhizes du chêne vert dans la wilaya de Relizane. Soutenu le : 18 / 03 / 2014 Devant le jury composé de : Pr. Hadjadj Aoul S. Université d’Oran Président Pr. Fortas Zohra Université d’Oran Rapporteur Pr. Bellahcene M. C. U. Ain Temouchent Examinateur Dr. Merabet C. Université d’Oran Examinatrice - The task of an ecologist - There is an old story about a man who, returning home one night found his neighbour searching the ground beneath a street lamp. “Can I help you find something?” he asked. “I lost my key” replied the neighbour. “Do you know about where you dropped it?”, “Yes” replied the neighbour “over there” pointing to a dark corner of the street. “If you dropped it over there then why are you looking here” asked the man. “Because this is where the light is” replied the neighbour. The task of the ecologist is not to bring the search to where the light is, but to bring the light to where the search is. (in O’Hanlon, 2011). Remerciements Ce mémoire est le fruit de 4 ans de travail réalisé au Laboratoire de Biologie des Microorganismes et de Biotechnologie de l’Université d’Oran sous la direction du Professeur FORTAS Zohra. Je tiens à lui exprimer mes plus vifs remerciements et ma profonde gratitude pour son encadrement durant toute la période de mon travail, ses précieux conseils, sa rigueur scientifique et sa patience lors de la rédaction de mon mémoire qui m’a permis de découvrir le monde merveilleux des mycorhizes. Qu’elle trouve ici l’expression de mon profond respect, ma reconnaissance et toute mon admiration pour ses qualités scientifiques et humaines. Je remercie Pr. HADJAJ-AOUL S., responsable du Laboratoire d’Ecologie végétale à l’Université d’Oran pour l’honneur qu’il me fait en acceptant de présider le jury. Je le remercie infiniment pour son aide précieuse pour l’identification des plantes. Mes remerciements s’adressent aussi au Pr. BELLAHCENE M., du Centre Universitaire d’Ain Témouchent et à Mme MERABAT C., Maître de Conférences à l’Université d’Oran d’avoir accepté d’examiner ce modeste mémoire de Magister. Mes vifs remerciements s’adressent également aux membres du District d’Ain Tarik en particulier à leur chef M. Rahmani AEK. qui m’ont toujours facilité l’accès aux stations d’étude, aux gardes forestiers M. Douici Dj., M. Abdsadouk S., M. Guelab M. et M. Douis L. qui m’ont toujours accompagné dans sur le terrain ainsi qu’à M. Mimoune F. pour sa collaboration efficace à l’enquête mycologique sans oublier Fatima, Zoulikha, Alia et les deux Amel, pour leur gentillesse et leur accueil chaleureux. Je remercie aussi M. Abou M., ancien chef de la Circonscription d’Ammi Moussa moral et tout son personnel pour leur soutien et leur modestie ainsi que M. Abdsadouk A., chef du District de Ramka pour m’avoir autorisé à prospecter les belles forêts de Ramka malgré leur accès difficile et tous les membres de la Conservation des Forêt de la W. Relizane : M. Douici H., M. Benyamina K., M. Abdallah A., M. Hamme Cherif, M. Hatalla, M. Hakiki. Un grand merci au Laboratoire Régional des Analyses du Sol d’El-Matmar en particulier, au pédologue Farid pour son aide dans l’interprétation des résultats des analyses du sol ainsi qu’à Kharoubi M. et sa famille sans oublier M. Bouamrane M-F. Chef du Secteur de A. N. R. H, de la W. de Relizane et le technicien M. Boumendjel T. pour son aide précieuse dans le traitement des données climatologiques. J’exprime mes reconnaissances aux M. Moukhbi et M. Houara de l’Université Abdelhamid Ibn Badis (Mostaganem) pour leur aide dans l’identification de quelques espèces végétales. Mes sincères remerciements s’adressent à Mme Dib-Bellahouel S., pour ses encouragements et son aimable gentillesse ainsi qu’à tous les membres du laboratoire de LBMB pour leur esprit de collaboration et leur bonne humeur en particulier Fatima, Ismahene, Saléha, Dahbia et Rahma dont leur compagnie m’a permis de surmonter les moments difficiles. Enfin mes plus sincères remerciements iront à tous ceux que je n’ai pas cités et qui ont contribué de près ou de loin à la réalisation de ce travail. Dédicace s A ma très chère Maman Tu représentes pour moi la source de tendresse, le symbole de la bonté, et l’exemple du dévouement qui n’a pas cessé de m’encourager et de prier pour moi.Tes prières m’ont été d’un grand secours pour mener à bien mes études. A mon très cher Papa Pour tes sacrifices pour mon éducation, ma formation et mon bien être. Ce travail est le fruit de tes efforts. Aucune dédicace pour mes chers parents ne saurait être assez éloquente pour exprimer tous les sacrifices que vous n’avez donné depuis ma naissance jusqu’à l’âge adulte. Puisse Dieu, le tout puissant, vous préserve et vous accorde longue vie, santé et bonheur Inch’allah. Je dédie ce travail à mes très chères sœurs Halima et Souhir Et mes très chers frères Omar, Abdelkrim, Abdenour et Ilyes avec tous mes vœux de bonheur, de santé et de réussite. A ma très (trop) chère amie Dalila et son mari Abdelkrim en témoignage de mon amitié et de tous nos souvenirs inoubliables, je te souhaite une vie pleine de santé et de bonheur. A ma très chère grand-mère et mon très cher grand-père Je leur exprime mon profond amour et une longue vie pleine de santé et bonheur. A tous les membres de la famille Mesfek et Bouderhem Avec mon profond respect et mon affection. A mes très chères amies : Houria, Noura, Mama, Roumaissaa, Miassa, Halima, Rachida, Razika,Meriem, et Habiba. Avec toute mon affection et mes pensées, vous êtes pour moi des sœurs et des amies sur qui je peux compter. Table des matières Liste des tableaux ...................................................................................................................................... i Liste des figures ......................................................................................................................................... ii Introduction générale .............................................................................................................................. 1 Chapitre 1 : Synthèse Bibliographique 1. Les champignons dans les écosystèmes forestiers .............................................................................. 3 1.1. Organisation taxonomique des champignons .................................................................................... 3 1.1.1. Classification classique .................................................................................................................... 3 1.1.2. Classification phylogénétique .......................................................................................................... 4 1.1.3. Caractéristiques du groupe Dikarya: les ascomycètes et les basidiomycètes .................................. 5 1.1.3.1. Ascomycètes ................................................................................................................................. 5 1.1.3.2. Basidiomycètes ............................................................................................................................. 8 1.2. Modes de vie des champignons forestiers.......................................................................................... 9 1.2.1. Saprophytes ..................................................................................................................................... 9 1.2.2. Parasites ........................................................................................................................................... 10 1.2.3. Symbiotique ..................................................................................................................................... 10 1.2.3.1. Mycorhizes ................................................................................................................................... 10 1.2.3.2. Champignons associés aux termites ............................................................................................. 11 1.2.3.3. Lichens ......................................................................................................................................... 13 1.3. Identification des champignons forestiers .......................................................................................... 14 1.3.1. Méthodes classiques ....................................................................................................................... 15 1.3.1.1. Caractères macroscopiques ......................................................................................................... 15 1.3.1.2. Caractères microscopiques .......................................................................................................... 15 1.3.1.3. Caractères organoleptiques .......................................................................................................... 16 1.3.1.4. Autres caractères ........................................................................................................................ 16 1.3.2. Méthodes moléculaires ................................................................................................................... 16 1.4. Exploitation des champignons forestiers ..........................................................................................