<p> Additional file 2.</p><p>Below diagonal, FST: the proportion of genetic diversity due to allele frequency differences</p><p> among populations. Above diagonal, Dest: estimator of actual differentiation. High values are in</p><p> bold and imply a degree of differentiation among populations.</p><p>El Za Tama Gue Chi Talpa Manantl Ver Penns Mic Illi Ala</p><p>Progr cap Qui ulipa rrer apa Jalisc an Ma mon ylvani higa noi bam Tenn</p><p> eso a che s o s o Jalisco ine t a n s a essee Ohio 0.0 0.0 0.0 0.0</p><p>El 01 000 0.001 0.01 0.0 0.000 32 0.02 0.019 0.04 29 0.00 0.00 0.00</p><p>Progreso 4 1 2 75 306 006 0.0005 7 15 2 37 4 02 82 16 0.0 0.0</p><p>0.044 0.0 0.000 0.02 0.0 0.005 45 0.02 0.019 0.06 46 0.00 0.00 0.01</p><p>Zacapa 4 007 5 39 231 1 0.0040 4 50 4 00 1 74 65 00 0.0 0.0 0.0 0.00</p><p>0.026 25 0.02 0.0 0.006 31 0.01 0.006 0.02 14 0.00 0.00 0000</p><p>Quiche 3 3 0 66 227 0 0.0048 9 10 1 80 1 95 06 8 0.0 - 0.0 0.0</p><p>Tamauli 0.047 16 0.0 0.02 0.0 0.010 40 0.01 0.010 0.03 24 0.01 0.00 0.00 pas 4 3 097 90 216 2 0.0092 3 67 9 97 4 64 44 15 0.3 0.0 0.0</p><p>0.351 05 0.3 0.333 0.0 0.018 91 0.08 0.032 0.04 43 0.01 0.04 0.03</p><p>Guerrero 7 9 536 9 033 3 0.0186 1 33 8 34 4 54 29 73 0.3 0.0 0.0</p><p>0.408 53 0.3 0.04 0.037 74 0.05 0.011 0.02 20 0.04 0.02 0.02</p><p>Chiapas 6 1 793 0.369 35 8 0.0420 5 86 7 61 3 39 99 39 0.0 0.0 0.0</p><p>Talpa 0.025 82 0.0 0.103 0.35 0.4 38 0.02 0.039 0.05 45 0.01 0.00</p><p>Jalisco 6 5 986 9 11 611 0.0000 7 39 8 45 4 0 14 89 Manantl 0.0 0.0 0.0 an 68 0.1 0.102 0.37 0.4 0.015 44 0.02 0.037 0.06 51 0.00 0.01 0.01</p><p>Jalisco 0.066 5 133 4 42 767 4 9 86 9 40 7 00 28 26 0.1 0.0</p><p>0.184 93 0.1 0.203 0.34 0.3 0.331 0.01 0.020 0.01 14 0.03 0.00 0.01</p><p>Maine 7 4 817 8 92 021 8 0.3736 18 3 00 8 62 74 90 0.1 0.1 0.0</p><p>0.228 94 0.1 0.152 0.50 0.4 0.359 06 0.012 0.00 04 0.03 0.00 0.00</p><p>Vermont 5 9 364 3 82 729 4 0.4046 6 7 52 1 04 27 17 Pennsylv 0.152 0.1 0.1 0.125 0.17 0.1 0.242 0.2673 0.0 0.13 0 0 0.03 0.00 0.00 28 78 ania 4 107 6 2 298 4 5 6 50 001 06 0.2 0.0 -</p><p>Michiga 37 0.2 0.222 0.22 0.1 0.350 71 0.16 0.014 0.05 0.00 0.00 n 0.254 5 108 1 29 306 9 0.4004 8 14 4 0 02 30 57 0.2 0.0 - -</p><p>0.213 02 0.1 0.185 0.21 0.1 0.306 69 0.14 0.040 0.07 0.04 0.00 0.00</p><p>Illinois 3 2 672 1 02 384 1 0.3498 4 08 1 03 08 03 15 0.0 - 0.3 0.2</p><p>0.056 87 0.1 0.132 0.29 0.3 0.003 02 0.41 0.201 0.32 74 0.01 0.01</p><p>Alabama 4 8 351 7 12 864 2 0.0118 2 3 7 79 8 29 35 0.0 0.0 0.0</p><p>Tenness 0.061 57 0.0 0.047 0.32 0.3 0.174 51 0.02 0.019 0.08 48 0.17 ee 7 2 239 8 05 099 9 0.2116 1 56 3 18 5 87 0 0.0 -</p><p>0.059 64 0.0 0.042 0.39 0.3 0.146 0.1 0.04 0.082 0.15 0.1 0.18 0.02</p><p>Ohio 2 8 204 4 88 982 8 0.2014 06 65 2 16 17 93 19</p>