<p>Supplementary Table 3</p><p>Con trol Human Human FANTO LncRNA Stran LncRNA GenCode Position (FP IL1b (FPKM) Gencode Name Body Map Body Map M number d Class Number KM Number Name eRNA ) XLOC_0000 chr1:778587-793065 + 2.3 2.36005 LincRNA ENSG00000 RP11-206L10.11 . . . 03 377 228794.4 4 XLOC_0000 chr1:998476-1001791 + 0.3 1.88678 Pseudoge ENSG00000 RP11-465B22.3 . . . 13 825 ne 217801.5 95 XLOC_0001 chr1:9233846-9252222 + 2.8 1.49779 LincRNA ENSG00000 RP3-510D11.2 . . . 01 859 234546.2 9 XLOC_0002 chr1:22351819-22358062 + 1.8 1.16701 LincRNA ENSG00000 LINC00339 XLOC_000 linc- . 89 956 218510.3 732 HSPG2 9 XLOC_0005 chr1:39325641-39342454 + 2.7 1.65458 Antisense ENSG00000 RP5-864K19.4 . . . 93 496 228436.2 9 XLOC_0006 chr1:39507977-39513981 + 1.6 0.944742 LincRNA . . XLOC_000 linc- . 15 533 152 MACF1-2 5 XLOC_0006 chr1:41898869-41930479 + 1.0 0.540618 LincRNA . . XLOC_000 linc- . 95 047 160 GUCA2B 1 XLOC_0007 chr1:43390943-43439830 + 0.4 1.19544 LincRNA ENSG00000 SLC2A1-AS1 . . . 22 254 227533.1 35 XLOC_0007 chr1:44513009-44542306 + 5.2 4.78485 LincRNA ENSG00000 RP5-1198O20.4 . . . 53 686 230615.2 6 XLOC_0008 chr1:46908508-46948163 + 1.4 0.776173 LincRNA ENSG00000 LINC00505 XLOC_000 linc- . 31 694 225667.1 170 DMBX1 1 XLOC_0008 chr1:51443540-51477175 + 2.9 1.81668 LincRNA . . XLOC_000 linc-FAF1- . 52 375 833 1 3 XLOC_0009 chr1:59180564-59181401 + 0.3 1.90473 LincRNA . . XLOC_000 linc-FGGY- . 92 323 218 4 79 XLOC_0010 chr1:59486083-59508449 + 1.7 1.09247 LincRNA ENSG00000 RP4-794H19.4 . . . 15 893 230812.1 4 XLOC_0015 chr1:89873116-89891927 + 0.5 5.96536 Pseudoge ENSG00000 GBP1P1 . . . 18 858 ne 225492.2 2 XLOC_0015 chr1:94792769-94800291 + 1.9 4.57882 LincRNA ENSG00000 RP11-148B18.3 XLOC_000 linc- . 88 071 226835.1 301 ABCD3-1 3 XLOC_0015 chr1:95392966-95429184 + 2.5 2.12831 LincRNA ENSG00000 RP4-639F20.1 XLOC_000 linc- . 95 553 235501.1 304 TMEM56- 8 3 XLOC_0016 chr1:96208581-96227515 + 1.2 2.87229 LincRNA ENSG00000 RP11-286B14.2 . . . 10 109 271252.1 XLOC_0017 chr1:101544309- + 1.5 2.1641 LincRNA ENSG00000 RP11-421L21.3 . . . 19 101552822 955 233184.2 1 XLOC_0018 chr1:113498995- + 1.4 1.4722 LincRNA ENSG00000 RP11-31F15.1 . . . 82 113511291 885 226419.2 6 XLOC_0019 chr1:116082085- + 0.5 2.05392 LincRNA . . . . . 57 116088417 512 95 XLOC_0020 chr1:119573396- + 4.1 2.06279 Antisense ENSG00000 RP11-418J17.1 . . . 27 119726625 883 231365.1 6 XLOC_0020 chr1:120904664- + 1.0 1.06632 Pseudoge ENSG00000 HIST2H3DP1 . . . 85 120910305 765 ne 213244.3 5 XLOC_0020 chr1:121091626- + 2.6 2.41491 LincRNA ENSG00000 AL592494.5 . . . 93 121136919 062 227082.1 5 XLOC_0021 chr1:143913830- + 5.7 3.87511 Pseudoge ENSG00000 SRGAP2B . . . 66 144048991 120 ne 196369.6 3 XLOC_0021 chr1:144598516- + 2.4 2.3641 Pseudoge ENSG00000 RP11-640M9.2 . . . 88 144609914 876 ne 225241.3 XLOC_0022 chr1:145096307- + 47. 55.5743 LincRNA . . . . . 32 145119491 942 8 XLOC_0022 chr1:145382754- + 1.1 3.29549 LincRNA . . . . . 40 145383571 159 3 XLOC_0022 chr1:146626687- + 90. 80.3722 Antisense ENSG00000 RP11-337C18.8 XLOC_000 linc- . 61 146651766 586 237188.3 385 CHD1L-1 1 XLOC_0022 chr1:147751388- + 2.1 1.38053 LincRNA ENSG00000 RP11-495P10.6 . . . 81 147760095 564 234283.1 2 XLOC_0022 chr1:148928251- + 1.8 0.764077 LincRNA ENSG00000 RP11-14N7.2 XLOC_001 linc- . 93 148954459 203 232527.3 009 PPIAL4F-1 3 XLOC_0024 chr1:151810686- + 1.0 0.546612 Antisense . . . . . 13 151811665 166 7 XLOC_0024 chr1:151811839- + 4.1 3.66661 Antisense ENSG00000 AL450992.2 . . . 14 151824315 344 234614.1 9 XLOC_0024 chr1:152221970- + 1.7 1.56929 LincRNA ENSG00000 FLG-AS1 . . . 43 152223217 703 237975.2 3 XLOC_0024 chr1:152627932- + 0.4 14.6233 LincRNA ENSG00000 LINC00302 XLOC_000 linc-LCE2D . 80 152628889 212 176075.6 411 91 XLOC_0025 chr1:155533056- + 37. 48.4699 Antisense ENSG00000 RP11-243J18.2 . . . 35 155721690 503 227673.1 1 XLOC_0026 chr1:159930940- + 5.7 4.29194 LincRNA ENSG00000 RP11-48O20.4 . . . 02 159948646 104 224259.1 4 XLOC_0028 chr1:176187675- + 0.6 1.19258 Pseudoge ENSG00000 RP11-195C7.2 XLOC_000 linc- . 82 176317855 06 ne 232463.1 471 PAPPA2-1 XLOC_0030 chr1:186393736- + 1.2 1.24092 LincRNA . . . . . 55 186404456 055 9 XLOC_0030 chr1:186649747- + 0.7 4.33362 LincRNA ENSG00000 RP5-973M2.2 . . . 97 186654651 430 273129.1 88 XLOC_0031 chr1:192484855- + 0.2 1.2721 LincRNA ENSG00000 RP5-1011O1.3 XLOC_001 linc- . 11 192533053 571 236069.1 133 FAM5C-2 49 XLOC_0033 chr1:207540496- + 2.0 5.19924 LincRNA . . . . . 48 207549020 128 XLOC_0033 chr1:211564862- + 11. 11.0784 Pseudoge ENSG00000 SNX25P1 . . . 93 211605865 960 ne 236809.2 5 XLOC_0034 chr1:219347189- + 207 63.6557 LincRNA ENSG00000 RP11-135J2.3 XLOC_001 linc- . 50 219501046 .86 223842.1 207 GPATCH2- 1 XLOC_0036 chr1:222763330- + 1.2 0.839124 LincRNA ENSG00000 RP11-378J18.3 XLOC_000 linc-MIA3- . 05 222766883 475 225265.1 576 1 2 XLOC_0036 chr1:224180499- + 1.4 1.3736 LincRNA ENSG00000 RP11-504P24.4 . . . 18 224208266 830 185495.6 1 XLOC_0036 chr1:225888343- + 2.5 2.08314 LincRNA ENSG00000 RP11-145A3.1 XLOC_001 linc-ENAH . 36 225925896 706 227496.1 231 9 XLOC_0039 chr1:247517260- + 0.7 1.4553 LincRNA . . XLOC_000 linc- . 14 247521512 091 648 NLRP3-3 65 XLOC_0039 chr1:703947-762575 - 2.4 2.24795 LincRNA ENSG00000 RP11-206L10.9 XLOC_000 linc- . 40 545 237491.4 008 SAMD11-4 1 XLOC_0040 chr1:3653573-3663923 - 2.4 1.5964 LincRNA ENSG00000 TP73-AS1 . . . 08 069 227372.6 3 XLOC_0041 chr1:16793578-16805433 - 1.9 0.713471 Pseudoge ENSG00000 CROCCP3 . . . 37 773 ne 080947.10 9 XLOC_0041 chr1:16943388-16971194 - 5.7 4.83419 LincRNA ENSG00000 CROCCP2 . . . 49 615 215908.5 3 XLOC_0041 chr1:17011093-17013964 - 21. 20.5595 Pseudoge ENSG00000 ESPNP . . . 58 969 ne 268869.1 2 XLOC_0042 chr1:23604933-23620014 - 1.4 1.34875 LincRNA ENSG00000 RP5-1057J7.6 XLOC_000 linc- . 21 351 261326.2 734 HTR1D 2 XLOC_0043 chr1:28905072-28908382 - 15. 15.2207 LincRNA ENSG00000 SNHG12 . . . 22 29 197989.9 XLOC_0043 chr1:32704674-32706111 - 1.0 0.412666 Pseudoge ENSG00000 MTMR9LP . . . 83 02 ne 220785.3 XLOC_0044 chr1:37920479-37948615 - 1.1 3.91064 LincRNA ENSG00000 RP11-422J8.1 XLOC_000 linc- eRNA 80 011 233621.1 787 GRIK3-2 7 XLOC_0045 chr1:39987857-40008313 - 1.4 2.46082 LincRNA ENSG00000 RP11-69E11.4 . . . 07 294 182109.3 XLOC_0045 chr1:40012505-40025342 - 1.3 1.71574 LincRNA ENSG00000 RP11-69E11.4 . . . 18 427 182109.3 7 XLOC_0046 chr1:47846304-47874016 - 0.7 1.10438 LincRNA ENSG00000 RP11-511I2.2 XLOC_000 linc-STIL-2 . 69 107 225762.1 822 61 XLOC_0046 chr1:47874121-47903334 - 1.1 0.432375 Antisense ENSG00000 RP11-511I2.2 XLOC_000 linc-STIL-2 . 70 155 225762.1 822 3 XLOC_0049 chr1:56880628-56925281 - 0.4 2.46429 LincRNA ENSG00000 RP4-710M16.2 XLOC_000 linc- . 49 164 223956.1 214 PRKAA2-1 54 XLOC_0049 chr1:59349249-59377695 - 1.0 0.324291 LincRNA ENSG00000 RP11-63G10.3 . . eRNA 94 750 272226.1 9 XLOC_0050 chr1:65437492-65468317 - 1.2 4.67309 Pseudoge ENSG00000 SLC2A3P2 . . . 41 302 ne 185031.6 XLOC_0053 chr1:89006045-89273429 - 0.4 1.72515 Antisense ENSG00000 RP11-76N22.2 . . . 04 133 237505.2 48 XLOC_0053 chr1:91248564-91254989 - 1.1 1.67762 LincRNA ENSG00000 RP4-665J23.1 XLOC_000 linc-CDC7 . 91 632 233593.2 293 3 XLOC_0053 chr1:91297301-91317175 - 1.3 1.09066 LincRNA ENSG00000 RP4-665J23.1 XLOC_000 linc-CDC7 . 95 597 233593.2 293 5 XLOC_0054 chr1:93691222-93739064 - 1.4 1.71818 Antisense ENSG00000 RP4-717I23.3 . . . 53 075 223745.3 9 XLOC_0054 chr1:93791326-93811287 - 4.5 4.25173 LincRNA ENSG00000 RP4-717I23.3 XLOC_000 linc- . 77 695 223745.3 918 TMED5 XLOC_0056 chr1:100724075- - 1.8 0.653495 LincRNA ENSG00000 RP11-305E17.6 XLOC_000 linc-DBT-3 . 01 100731683 054 224616.1 939 4 XLOC_0057 chr1:111905991- - 0 2.499 Pseudoge ENSG00000 CHIAP3 . . . 53 111911108 ne 234020.1 XLOC_0060 chr1:119349587- - 1.9 9.23502 LincRNA . . . . . 31 119409083 256 5 XLOC_0061 chr1:144518606- - 1.9 1.97455 Antisense ENSG00000 RP11-640M9.1 . . . 47 144521345 797 236943.2 1 XLOC_0061 chr1:146494290- - 2.0 1.92586 Pseudoge ENSG00000 NBPF13P . . . 91 146495720 936 ne 227242.2 5 XLOC_0061 chr1:146527977- - 14. 34.1757 Pseudoge ENSG00000 NBPF13P . . . 93 146542193 281 ne 227242.2 7 XLOC_0063 chr1:153761245- - 0.0 2.95862 LincRNA . . . . eRNA 85 153762791 864 682 XLOC_0067 chr1:173408867- - 1.1 1.34484 LincRNA ENSG00000 RP11-296O14.3 . . . 59 173431580 083 203739.3 3 XLOC_0067 chr1:173830721- - 17. 11.4845 LincRNA ENSG00000 GAS5 XLOC_000 linc- . 84 173837141 587 234741.3 467 ZBTB37 1 XLOC_0068 chr1:175873617- - 0.8 1.65357 LincRNA ENSG00000 RP11-318C24.2 XLOC_001 linc-TNR-2 . 14 175877940 601 227740.1 099 81 XLOC_0068 chr1:180918817- - 1.1 1.19915 Antisense ENSG00000 RP11-46A10.5 . . . 75 180925073 273 243155.1 7 XLOC_0071 chr1:201452654- - 0.6 1.12183 LincRNA ENSG00000 RP11-134G8.7 . . eRNA 92 201485577 347 224536.1 2 XLOC_0072 chr1:205658191- - 2.0 1.22425 LincRNA . . . . . 67 205681581 923 4 XLOC_0073 chr1:207970992- - 3.9 2.97588 LincRNA ENSG00000 C1orf132 XLOC_001 linc-YOD1- eRNA 44 207999455 997 203709.5 181 2 1 XLOC_0073 chr1:208028011- - 1.1 1.06073 LincRNA ENSG00000 C1orf132 . . . 53 208042402 779 203709.5 7 XLOC_0073 chr1:210404824- - 1.5 2.9157 Antisense ENSG00000 SERTAD4-AS1 . . . 97 210407067 922 203706.4 8 XLOC_0074 chr1:210463634- - 0.2 1.34162 LincRNA . . XLOC_001 linc-IRF6 . 00 210466365 934 188 09 XLOC_0074 chr1:212398629- - 1.7 0.713506 LincRNA ENSG00000 RP11-15I11.3 XLOC_001 linc-INTS7 . 19 212408088 695 226251.1 191 XLOC_0074 chr1:213009355- - 3.3 1.27945 LincRNA ENSG00000 FLVCR1-AS1 XLOC_001 linc- . 31 213031499 301 198468.3 197 C1orf227- 1 1 XLOC_0074 chr1:219259841- - 1.9 0.742316 LincRNA ENSG00000 RP11-135J2.4 . . . 69 219323400 036 228063.1 4 XLOC_0074 chr1:219589002- - 1.7 2.2518 LincRNA . . XLOC_001 linc- . 78 219589815 418 209 GPATCH2- 2 8 XLOC_0074 chr1:219597501- - 2.0 6.20003 LincRNA ENSG00000 RP11-95P13.1 XLOC_000 linc- . 80 219613213 487 230024.1 567 IARS2-2 2 XLOC_0075 chr1:222212915- - 1.2 2.03043 LincRNA ENSG00000 RP11-400N13.3 XLOC_001 linc- . 89 222238159 932 232679.1 215 DUSP10-2 9 XLOC_0076 chr1:224148739- - 1.0 1.10603 LincRNA . . . . . 49 224150419 899 XLOC_0076 chr1:224161555- - 0.8 1.55074 LincRNA . . . . . 57 224164705 947 02 XLOC_0078 chr1:235096832- - 0.1 1.12895 LincRNA ENSG00000 RP11-443B7.1 XLOC_000 linc- . 81 235100692 291 238005.2 627 GGPS1-1 56 XLOC_0079 chr1:238635649- - 3.2 2.07717 LincRNA ENSG00000 RP11-177F15.1 XLOC_001 linc-ZP4-1 . 32 238649582 278 231877.1 272 9 XLOC_0080 chr1:247350550- - 2.6 3.91837 LincRNA ENSG00000 RP11-488L18.10 . . . 32 247374185 974 259865.1 6 XLOC_0080 chr10:1068687-1073896 + 0.9 1.40944 Antisense ENSG00000 IDI2-AS1 . . . 63 986 232656.3 09 XLOC_0082 chr10:20105109- + 76. 77.3556 Pseudoge ENSG00000 AMD1P1 . . . 42 20648712 824 ne 228339.1 7 XLOC_0083 chr10:27854924- + 0.7 1.38642 LincRNA . . . . . 49 27867588 047 28 XLOC_0084 chr10:30397102- + 1.0 1.4629 Antisense . . . . . 21 30411761 840 9 XLOC_0084 chr10:30485570- + 1.7 1.65484 LincRNA . . . . . 52 30495964 254 2 XLOC_0084 chr10:30974223- + 32. 39.5892 Pseudoge ENSG00000 SVILP1 . . . 71 30978375 457 ne 234814.3 3 XLOC_0085 chr10:38658006- + 1.3 0.826135 Pseudoge ENSG00000 HSD17B7P2 . . . 62 38669044 2 ne 099251.10 XLOC_0087 chr10:67330280- + 8.6 4.62393 LincRNA ENSG00000 RP11-222A11.1 XLOC_008 linc- . 95 67449270 198 228065.6 500 LRRTM3-3 8 XLOC_0089 chr10:74927928- + 1.3 0.823181 Antisense ENSG00000 DNAJC9-AS1 . . . 54 75105290 590 236756.4 5 XLOC_0089 chr10:75255476- + 3.1 2.46135 Antisense ENSG00000 RP11-137L10.6 . . . 60 75257968 781 221817.5 XLOC_0090 chr10:77055501- + 2.3 2.53528 Pseudoge ENSG00000 HMGA1P5 . . . 09 77121514 013 ne 233313.2 XLOC_0090 chr10:77191281- + 0.7 1.65377 LincRNA ENSG00000 RP11-399K21.10 . . . 27 77211897 211 236842.1 2 XLOC_0091 chr10:81677835- + 1.6 0.847622 Pseudoge ENSG00000 MBL1P XLOC_008 linc- . 32 81681741 030 ne 242600.2 531 C10orf57- 1 2 XLOC_0091 chr10:88753116- + 1.9 1.53513 Pseudoge ENSG00000 BMS1P3 . . . 68 88769995 456 ne 240089.2 5 XLOC_0091 chr10:89102740- + 2.2 1.74072 LincRNA ENSG00000 LINC00863 . . . 79 89114919 176 224914.2 3 XLOC_0092 chr10:93284331- + 1.1 0.677805 LincRNA . . XLOC_008 linc- . 89 93335376 459 562 TNKS2-2 XLOC_0093 chr10:97889491- + 6.7 5.25127 LincRNA . . . . . 37 97928287 410 7 XLOC_0093 chr10:100209111- + 0.6 1.40533 LincRNA . . . . . 84 100213468 476 23 XLOC_0094 chr10:104593023- + 0.3 2.05774 Antisense ENSG00000 CYP17A1-AS1 . . . 74 104594458 842 203886.4 85 XLOC_0096 chr10:119806495- + 1.1 0.526931 LincRNA ENSG00000 CASC2 . . . 74 119859452 956 177640.11 7 XLOC_0097 chr10:123499939- + 1.2 1.06278 LincRNA ENSG00000 RP11-500G22.2 . . . 52 123711472 455 226864.1 XLOC_0100 chr10:1095490-1102645 - 1.6 1.33968 Antisense . . . . . 05 543 4 XLOC_0100 chr10:4248108-4271817 - 2.2 1.06196 LincRNA ENSG00000 LINC00702 XLOC_008 linc-KLF6- . 19 062 233117.2 700 2 4 XLOC_0100 chr10:4276289-4286146 - 3.0 2.39321 LincRNA ENSG00000 LINC00702 XLOC_008 linc-KLF6- . 32 759 233117.2 701 1 9 XLOC_0100 chr10:4693099-4700247 - 0.8 1.3004 LincRNA ENSG00000 LINC00704 XLOC_008 linc- . 53 815 231298.2 362 AKR1E2-1 69 XLOC_0101 chr10:5317547-5328142 - 0.8 1.9453 Pseudoge ENSG00000 AKR1C7P . . . 08 473 ne 215267.4 87 XLOC_0103 chr10:18802237- - 1.4 1.0761 Antisense ENSG00000 RP11-383B4.4 . . . 45 18830740 578 225527.1 XLOC_0104 chr10:25279059- - 0 1.03969 LincRNA . . . . . 41 25351246 XLOC_0105 chr10:28808737- - 8.4 6.49201 LincRNA ENSG00000 WAC-AS1 . . . 06 28820772 956 254635.1 9 XLOC_0105 chr10:31605335- - 1.3 1.2788 Antisense ENSG00000 ZEB1-AS1 . . . 79 31608060 622 237036.4 3 XLOC_0106 chr10:33178524- - 2.0 2.23861 LincRNA . . . . . 14 33187638 147 XLOC_0107 chr10:43007054- - 3.0 1.87775 Pseudoge ENSG00000 ZNF37BP . . . 12 43046615 377 ne 234420.3 4 XLOC_0111 chr10:75459480- - 8.5 6.16859 Pseudoge ENSG00000 BMS1P4 . . . 12 75478135 994 ne 242338.2 4 XLOC_0111 chr10:75480294- - 3.6 4.63933 Pseudoge ENSG00000 BMS1P4 . . . 14 75487244 534 ne 242338.2 6 XLOC_0111 chr10:75493017- - 4.9 7.59095 LincRNA . . . . . 16 75536024 567 6 XLOC_0111 chr10:80703082- - 6.3 3.31202 LincRNA ENSG00000 ZMIZ1-AS1 XLOC_008 linc- . 86 80722609 756 224596.3 863 POLR3A-1 4 XLOC_0112 chr10:81477107- - 4.9 4.96663 LincRNA ENSG00000 RP11-119F19.2 . . . 55 81569392 087 226381.3 6 XLOC_0113 chr10:89076441- - 6.2 7.41849 LincRNA ENSG00000 NUTM2A-AS1 . . . 34 89102298 682 223482.3 4 XLOC_0115 chr10:101405432- - 0.7 1.878 LincRNA ENSG00000 RP11-483F11.7 . . . 63 101419029 207 229278.1 63 XLOC_0116 chr10:106061587- - 0.1 2.30482 Antisense . . . . . 36 106065086 976 72 XLOC_0116 chr10:106110780- - 0.3 2.32445 LincRNA ENSG00000 CCDC147-AS1 XLOC_008 linc- . 41 106113335 474 231233.1 937 ITPRIP-1 92 XLOC_0116 chr10:110930813- - 0.1 1.07001 LincRNA . . . . . 71 110964109 703 75 XLOC_0117 chr10:116552178- - 2.6 3.22935 Pseudoge ENSG00000 TAF9BP2 XLOC_008 linc- eRNA 61 116621238 750 ne 215760.2 957 ABLIM1-1 8 XLOC_0117 chr10:118590561- - 1.4 0.756474 LincRNA ENSG00000 RP11-539I5.1 . . . 86 118609810 931 225302.1 5 XLOC_0119 chr10:128101773- - 3.4 2.32781 LincRNA ENSG00000 LINC00601 XLOC_008 linc- . 47 128148058 168 235180.1 985 ADAM12 7 XLOC_0121 chr11:8987385-8989682 + 1.1 1.16677 LincRNA ENSG00000 TMEM9B-AS1 . . . 00 795 254860.1 1 XLOC_0121 chr11:10879770- + 4.4 4.8172 Antisense ENSG00000 CTD-2003C8.2 XLOC_009 linc- . 32 10900813 62 250041.2 065 USP47-3 XLOC_0121 chr11:13984432- + 1.2 1.10727 LincRNA ENSG00000 RP11-21L19.1 . . . 70 14290449 341 254418.1 1 XLOC_0122 chr11:18610338- + 4.0 4.47658 Pseudoge ENSG00000 RP11-504G3.4 XLOC_009 linc- . 30 18625523 144 ne 256282.1 389 UEVLD 6 XLOC_0123 chr11:26849887- + 0.6 1.85909 LincRNA . . . . . 07 26876549 346 79 XLOC_0123 chr11:27528390- + 1.6 1.37063 LincRNA ENSG00000 BDNF-AS XLOC_009 linc- . 25 27535595 974 245573.3 092 METT5D1 9 XLOC_0124 chr11:35038376- + 0.0 1.04754 LincRNA . . . . eRNA 96 35054428 519 299 XLOC_0125 chr11:45377019- + 1.3 0.418016 LincRNA ENSG00000 RP11-430H10.1 XLOC_009 linc- . 69 45378356 937 254427.1 120 SLC35C1-5 9 XLOC_0126 chr11:59383622- + 0.3 1.0675 LincRNA ENSG00000 AP000442.1 . . . 60 59387921 210 255139.1 51 XLOC_0127 chr11:64013307- + 10. 14.7543 Antisense ENSG00000 RP11-783K16.5 . . . 71 64015669 094 256940.1 1 XLOC_0128 chr11:65190220- + 50. 45.3741 LincRNA ENSG00000 NEAT1 . . . 05 65213012 798 245532.4 2 XLOC_0130 chr11:82783117- + 2.0 2.13748 LincRNA ENSG00000 RAB30-AS1 XLOC_009 linc- . 80 82799004 627 246067.3 233 PCF11-2 7 XLOC_0132 chr11:87078182- + 1.0 0 LincRNA . . . . . 18 87083856 069 3 XLOC_0133 chr11:94800003- + 6.5 4.40991 Pseudoge ENSG00000 SRSF8 . . . 97 94804314 276 ne 180771.10 9 XLOC_0134 chr11:94966057- + 1.2 1.40934 LincRNA ENSG00000 RP11-712B9.2 . . . 13 94967229 876 245552.2 8 XLOC_0134 chr11:102251554- + 1.7 6.39946 LincRNA . . . . . 78 102261900 492 9 XLOC_0135 chr11:102917615- + 0.5 4.63491 Antisense . . . . . 25 102962923 376 29 XLOC_0135 chr11:112161030- + 2.6 2.88679 LincRNA . . . . . 99 112165508 560 8 XLOC_0136 chr11:114332438- + 2.0 1.21843 LincRNA . . . . . 68 114339861 073 3 XLOC_0136 chr11:114344162- + 1.5 0.753449 LincRNA . . . . . 71 114353855 420 9 XLOC_0136 chr11:114371275- + 2.4 2.09813 Pseudoge ENSG00000 NXPE2P1 . . . 82 114435843 399 ne 255982.1 8 XLOC_0138 chr11:121107905- + 1.6 0.660911 Pseudoge ENSG00000 RP11-775A1.2 . . . 01 121116704 621 ne 254515.1 5 XLOC_0138 chr11:124670576- + 1.2 1.09802 LincRNA ENSG00000 RP11-677M14.7 . . . 97 124679313 735 245498.2 6 XLOC_0139 chr11:125962203- + 0.4 23.7498 LincRNA ENSG00000 RP11-673E11.2 XLOC_009 linc- . 21 125978095 393 261257.1 320 FAM118B 07 XLOC_0140 chr11:2016399-2019050 - 147 109.977 LincRNA ENSG00000 H19 . . . 30 .44 130600.11 9 XLOC_0140 chr11:5680484-5683866 - 1.3 1.33242 LincRNA . . . . . 99 267 1 XLOC_0142 chr11:9777555-9779383 - 2.0 1.22533 LincRNA ENSG00000 SBF2-AS1 XLOC_009 linc- . 85 533 246273.2 371 TMEM41B 3 XLOC_0146 chr11:35038376- - 0.0 1.47552 Antisense . . . . eRNA 08 35054428 347 015 XLOC_0147 chr11:49455144- - 2.1 4.0711 Pseudoge ENSG00000 RP11-61N20.3 . . . 55 49456058 527 ne 226268.2 6 XLOC_0148 chr11:58901039- - 1.5 0.89158 Pseudoge ENSG00000 AP001258.5 XLOC_009 linc- . 01 58904262 221 ne 255381.1 445 GLYATL2 1 XLOC_0148 chr11:62619472- - 10. 11.3273 LincRNA ENSG00000 SNHG1 . . . 68 62623358 600 255717.2 4 XLOC_0148 chr11:63448941- - 2.4 2.14527 Antisense ENSG00000 C11orf95 . . . 78 63531576 876 188070.8 6 XLOC_0149 chr11:66238709- - 0.9 1.09239 Antisense ENSG00000 CTD-3074O7.5 . . . 81 66247704 363 255517.2 22 XLOC_0150 chr11:67481385- - 1.0 0.516026 Pseudoge ENSG00000 FAM86C2P XLOC_009 linc- . 20 67771589 298 ne 160172.6 181 ALDH3B1- 1 1 XLOC_0150 chr11:72522741- - 1.0 1.14931 Antisense . . XLOC_009 linc- . 79 72525354 582 498 STARD10 1 XLOC_0151 chr11:82868148- - 1.6 1.86784 Antisense ENSG00000 RP11-727A23.5 . . . 78 82904678 037 247137.4 6 XLOC_0155 chr11:107175812- - 1.4 1.02397 LincRNA ENSG00000 RP11-819C21.1 XLOC_009 linc- . 33 107186366 330 261098.1 544 GUCY1A2 6 XLOC_0155 chr11:110962945- - 6.3 0.866295 LincRNA ENSG00000 RP11-89C3.4 XLOC_009 linc- . 52 110968055 164 271584.1 549 ARHGAP2 2 0-2 XLOC_0156 chr11:118476724- - 0.4 1.00961 Antisense . . . . eRNA 19 118529056 463 91 XLOC_0157 chr11:122104817- - 2.1 4.64704 LincRNA ENSG00000 RP11-820L6.1 XLOC_009 linc- . 75 122238580 376 255090.1 307 UBASH3B- 1 2 XLOC_0159 chr11:125793401- - 0.2 1.2109 LincRNA ENSG00000 RP11-680F20.9 XLOC_009 linc-PUS3- . 77 125800822 008 255027.2 594 2 28 XLOC_0160 chr11:133890833- - 0.7 19.3298 LincRNA ENSG00000 RP11-713P17.3 XLOC_009 linc-JAM3- . 45 133917442 434 204241.3 341 2 62 XLOC_0160 chr12:83767-91221 + 1.5 1.33735 Pseudoge ENSG00000 ABC7- . . . 68 257 ne 226210.3 42389800N19.1 XLOC_0162 chr12:7262020-7264377 + 3.3 3.53363 LincRNA ENSG00000 C1RL-AS1 . . . 25 857 205885.3 1 XLOC_0162 chr12:7267515-7271591 + 2.5 2.46841 LincRNA ENSG00000 C1RL-AS1 . . . 27 523 205885.3 4 XLOC_0162 chr12:7272731-7310979 + 6.1 7.59697 Antisense ENSG00000 C1RL-AS1 XLOC_010 linc-RBP5- . 28 855 205885.3 001 2 5 XLOC_0162 chr12:8382301-8395455 + 1.2 0.786201 Pseudoge ENSG00000 FAM86FP . . . 62 328 ne 164845.12 5 XLOC_0162 chr12:9447033-9453710 + 1.4 1.77148 Pseudoge ENSG00000 RP11-22B23.1 . . . 90 878 ne 111788.9 5 XLOC_0163 chr12:9745353-9770063 + 1.3 1.3126 Antisense . . . . . 14 958 6 XLOC_0163 chr12:9855072-9866376 + 0.0 1.888572 LincRNA ENSG00000 RP11-75L1.1 . . . 26 654 256582.1 88 XLOC_0164 chr12:13076910- + 1.5 2.96559 Antisense ENSG00000 RP11-392P7.6 . . eRNA 82 13153261 195 247498.5 3 XLOC_0165 chr12:14721025- + 2.3 1.69817 Antisense ENSG00000 RP11-695J4.2 . . . 32 14818870 873 256751.1 1 XLOC_0167 chr12:25557338- + 0.3 1.36201 Pseudoge ENSG00000 TUBB4BP1 . . . 52 25605277 125 ne 255988.1 95 XLOC_0170 chr12:46780768- + 16. 12.0087 LincRNA ENSG00000 RP11-446N19.1 XLOC_009 linc- . 22 47270629 942 272369.1 723 FAM113B- 3 3 XLOC_0172 chr12:48747116- + 1.2 1.59086 LincRNA ENSG00000 RP11-370I10.6 . . . 88 48837821 002 257735.1 9 XLOC_0174 chr12:54519906- + 3.0 6.04331 LincRNA ENSG00000 RP11-834C11.4 . . . 65 54526627 484 250742.1 5 XLOC_0174 chr12:56122972- + 2.7 2.0225 Antisense ENSG00000 RP11-644F5.11 . . . 86 56125008 727 258056.1 6 XLOC_0174 chr12:56225178- + 1.3 1.13429 Pseudoge ENSG00000 TMEM198B . . . 90 56236773 677 ne 182796.8 3 XLOC_0176 chr12:65996581- + 1.2 1.79898 LincRNA ENSG00000 RP11-230G5.2 XLOC_009 linc- . 30 66002490 900 250748.2 788 HMGA2 2 XLOC_0176 chr12:67716916- + 1.3 1.79344 LincRNA . . . . . 60 67743440 795 7 XLOC_0177 chr12:68322843- + 2.3 1.65709 LincRNA ENSG00000 GS1-410F4.4 XLOC_009 linc- . 36 68415832 527 255772.1 792 RAP1B-5 5 XLOC_0180 chr12:90354075- + 0.0 1.99163 Pseudoge ENSG00000 RP11-654D12.1 XLOC_009 linc- . 06 90465585 465 ne 258290.1 828 CLLU1-7 498 XLOC_0180 chr12:90485171- + 0.0 1.83942 LincRNA ENSG00000 RP11-567C2.1 XLOC_009 linc- . 58 90507675 346 257194.2 829 CLLU1-6 874 XLOC_0181 chr12:92539860- + 1.2 1.08222 LincRNA ENSG00000 RP11-796E2.4 . . . 02 92541264 512 245904.2 6 XLOC_0182 chr12:102675067- + 0 10.4673 LincRNA . . . . . 05 102676048 XLOC_0184 chr12:120639112- + 7.8 3.09507 LincRNA ENSG00000 PXN-AS1 . . . 57 120647677 417 255857.1 XLOC_0185 chr12:132907669- + 0.0 1.37522 LincRNA ENSG00000 RP13-895J2.7 . . . 64 132908802 320 255916.1 968 XLOC_0186 chr12:6547939-6553126 - 1.3 1.14894 LincRNA ENSG00000 CD27-AS1 . . . 61 101 215039.2 7 XLOC_0186 chr12:6560074-6560747 - 4.1 9.79103 Antisense ENSG00000 CD27-AS1 . . . 68 901 215039.2 4 XLOC_0187 chr12:8382301-8395455 - 1.2 0.887129 Pseudoge ENSG00000 FAM86FP . . . 03 811 ne 164845.12 9 XLOC_0187 chr12:9381199-9382950 - 0 3.01365 LincRNA ENSG00000 RP11-118B22.4 . . . 12 256427.1 XLOC_0187 chr12:10740721- - 1.9 1.35718 Pseudoge ENSG00000 KLRAP1 XLOC_009 linc-PRH2- . 55 10753880 813 ne 256667.2 663 1 XLOC_0189 chr12:24160799- - 5.5 4.81767 LincRNA . . . . . 74 24298161 056 1 XLOC_0189 chr12:24298301- - 3.9 3.45942 LincRNA . . . . . 75 24362765 928 2 XLOC_0191 chr12:26348384- - 0.1 4.0208 Antisense ENSG00000 RP11-283G6.5 . . . 62 26424796 337 255750.1 53 XLOC_0193 chr12:31267625- - 0 1.36645 Pseudoge ENSG00000 RP11-551L14.1 . . . 09 31270542 ne 177359.13 XLOC_0194 chr12:47781827- - 0.0 1.11176 LincRNA . . . . . 45 47787677 320 559 XLOC_0195 chr12:49681018- - 1.3 0.24335 LincRNA ENSG00000 RP11-161H23.9 XLOC_010 linc- . 31 49687077 891 258334.1 069 TUBA1A-3 9 XLOC_0196 chr12:54377711- - 2.1 1.01424 LincRNA ENSG00000 HOXC-AS3 . . . 59 54378821 19 251151.2 XLOC_0197 chr12:58325385- - 27. 16.4496 LincRNA ENSG00000 RP11-620J15.3 XLOC_010 linc- . 48 58329964 737 257698.1 102 CTDSP2-1 7 XLOC_0199 chr12:67300788- - 1.3 1.20833 LincRNA ENSG00000 RP11-123O10.4 XLOC_010 linc- . 21 67331986 707 256248.1 109 GRIP1-1 1 XLOC_0200 chr12:72065447- - 4.5 0 Antisense . . . . . 92 72079801 415 7 XLOC_0202 chr12:89441932- - 0.2 1.57043 LincRNA ENSG00000 RP11-13A1.3 . . . 26 89447746 251 257156.1 38 XLOC_0203 chr12:92652498- - 1.1 0.928723 LincRNA . . XLOC_010 linc-BTG1- . 19 92682330 143 151 1 1 XLOC_0203 chr12:93583761- - 1.2 0.917545 LincRNA ENSG00000 RP11-511B23.1 XLOC_009 linc- . 27 93585311 277 257345.2 840 NUDT4-1 9 XLOC_0203 chr12:93936247- - 1.3 1.72428 Antisense ENSG00000 SOCS2-AS1 . . . 45 93971322 384 246985.3 7 XLOC_0204 chr12:100559569- - 1.2 0.938554 Pseudoge ENSG00000 GOLGA2B . . . 15 100570862 042 ne 238105.3 1 XLOC_0205 chr12:112277135- - 3.6 3.8756 LincRNA ENSG00000 MAPKAPK5-AS1 XLOC_010 linc-BRAP- . 82 112279783 750 234608.3 202 2 5 XLOC_0208 chr13:21872277- + 1.2 1.10132 Pseudoge ENSG00000 GRK6P1 . . . 19 21906750 476 ne 215571.4 8 XLOC_0208 chr13:24304355- + 1.3 0.708714 Antisense ENSG00000 C1QTNF9B-AS1 . . . 59 24466225 649 205861.7 9 XLOC_0209 chr13:31443220- + 1.9 2.04135 LincRNA ENSG00000 TEX26-AS1 XLOC_010 linc- . 32 31473057 245 224743.2 338 C13orf33- 3 1 XLOC_0209 chr13:32420853- + 1.3 2.17077 Pseudoge ENSG00000 EEF1DP3 . . . 40 32535721 660 ne 229715.4 6 XLOC_0211 chr13:42916696- + 3.3 0 Pseudoge ENSG00000 FABP3P2 . . . 07 42958604 000 ne 233259.3 1 XLOC_0211 chr13:44716445- + 1.2 1.44463 Antisense ENSG00000 SMIM2-AS1 . . . 35 44722156 195 227258.1 8 XLOC_0212 chr13:52027453- + 2.2 1.34108 Antisense ENSG00000 INTS6-AS1 . . . 68 52037077 673 236778.3 5 XLOC_0215 chr13:92001273- + 0.6 1.38164 LincRNA ENSG00000 MIR17HG . . . 29 92021299 966 215417.6 72 XLOC_0219 chr13:38626832- - 1.6 1.98106 LincRNA ENSG00000 LINC00571 . . . 49 38633852 223 223685.1 5 XLOC_0219 chr13:38635521- - 6.4 3.9889 LincRNA ENSG00000 LINC00571 . . . 52 38802218 924 223685.1 7 XLOC_0221 chr13:41031620- - 0.9 1.67638 LincRNA ENSG00000 LINC00598 . . . 09 41097506 617 215483.4 92 XLOC_0221 chr13:41400661- - 1.2 0.80678 Pseudoge ENSG00000 SUGT1P3 . . . 64 41447905 299 ne 239827.4 6 XLOC_0221 chr13:41448019- - 2.3 1.41259 Pseudoge ENSG00000 SUGT1P3 XLOC_010 linc- . 82 41461964 060 ne 239827.4 579 MRPS31 7 XLOC_0221 chr13:41486155- - 2.0 1.51069 Pseudoge ENSG00000 SUGT1P3 . . . 97 41496146 260 ne 239827.4 4 XLOC_0222 chr13:45258902- - 0.3 1.3517 LincRNA ENSG00000 LINC00407 XLOC_010 linc- eRNA 61 45290099 799 237585.1 372 KIAA1704 47 XLOC_0223 chr13:50548921- - 1.3 1.21716 LincRNA . . . . . 66 50557525 056 2 XLOC_0223 chr13:50571130- - 11. 7.33117 LincRNA . . XLOC_010 linc- . 72 50699556 220 389 RNASEH2 1 B-2 XLOC_0224 chr13:52741183- - 3.2 2.20318 Pseudoge ENSG00000 MRPS31P5 . . . 58 52768573 481 ne 243406.2 6 XLOC_0229 chr14:22788454- + 1.0 0.441127 LincRNA . . . . . 37 22789283 960 3 XLOC_0229 chr14:22933246- + 1.1 0.997883 LincRNA ENSG00000 TRAJ60 . . . 40 22934850 026 249446.2 5 XLOC_0234 chr14:53622876- + 0.9 1.27647 LincRNA ENSG00000 RP11-547D23.1 . . . 30 53635089 573 258731.1 29 XLOC_0237 chr14:64108790- + 3.6 0.940421 LincRNA . . . . . 00 64118204 335 1 XLOC_0237 chr14:69328336- + 2.0 0.375775 Pseudoge ENSG00000 RP11-723P16.3 . . . 43 69329195 707 ne 270975.1 2 XLOC_0237 chr14:71164588- + 1.4 0.699799 LincRNA ENSG00000 RP6-65G23.1 XLOC_010 linc-PCNX eRNA 90 71179825 539 258689.1 866 XLOC_0238 chr14:73929077- + 0.2 1.56993 Antisense ENSG00000 RP1-240K6.3 XLOC_011 linc- . 20 73933619 848 251393.3 068 NUMB 17 XLOC_0238 chr14:77425975- + 0.4 1.98968 LincRNA ENSG00000 RP11-7F17.7 XLOC_010 linc- . 83 77432557 428 258602.1 881 KIAA1737- 97 2 XLOC_0240 chr14:94959361- + 0.1 1.7013 Antisense . . . . . 29 94964321 225 87 XLOC_0241 chr14:101383059- + 15. 15.9263 LincRNA ENSG00000 AL132709.5 XLOC_010 linc-DIO3- . 27 101427505 225 225746.4 934 6 4 XLOC_0241 chr14:101434993- + 63. 76.4738 LincRNA ENSG00000 RP11-909M7.3 . . . 38 101448689 055 271417.1 6 XLOC_0241 chr14:101473626- + 1.2 1.93621 LincRNA . . . . . 42 101499772 077 5 XLOC_0241 chr14:101519879- + 1.3 1.91696 LincRNA . . . . . 51 101526921 526 2 XLOC_0243 chr14:24408145- - 2.2 1.24199 Antisense . . . . . 48 24423392 147 8 XLOC_0244 chr14:35020973- - 1.2 0.104883 LincRNA ENSG00000 RP11-671J11.4 . . . 40 35026463 829 259135.1 2 XLOC_0244 chr14:35385039- - 2.9 1.47123 Pseudoge ENSG00000 RP11-73E17.3 . . . 51 35451755 865 ne 258493.2 8 XLOC_0244 chr14:35862864- - 0.0 2.44857 LincRNA . . . . . 83 35867358 337 287 XLOC_0245 chr14:42056652- - 0.9 2.70922 LincRNA ENSG00000 CTD-2298J14.2 . . . 39 42075504 004 258636.1 55 XLOC_0245 chr14:50500383- - 0.6 3.29792 Pseudoge ENSG00000 PDLIM1P1 . . . 96 50507672 501 ne 270788.1 67 XLOC_0247 chr14:52649279- - 0.3 1.03484 LincRNA . . . . . 12 52655863 231 22 XLOC_0247 chr14:53490200- - 21. 21.9324 Pseudoge ENSG00000 RP11-368P15.2 . . . 61 53620024 123 ne 258993.1 3 XLOC_0250 chr14:65620141- - 1.8 6.98621 LincRNA . . . . eRNA 14 65637448 995 XLOC_0251 chr14:71759465- - 2.1 2.47198 LincRNA ENSG00000 RP1-261D10.2 XLOC_011 linc- . 83 71777388 702 259146.2 064 MAP3K9-1 7 XLOC_0252 chr14:75079546- - 1.2 1.0851 LincRNA ENSG00000 CTD-2207P18.2 . . . 39 75083568 138 258976.1 2 XLOC_0256 chr15:25264092- + 1.9 1.318 LincRNA ENSG00000 SNHG14 XLOC_011 linc- . 59 25267441 521 224078.8 183 GABRA5-7 6 XLOC_0256 chr15:25294163- + 1.1 1.16821 LincRNA ENSG00000 SNHG14 . . . 65 25306886 449 224078.8 7 XLOC_0256 chr15:25309936- + 7.1 6.1926 LincRNA ENSG00000 SNHG14 . . . 69 25351423 750 224078.8 9 XLOC_0256 chr15:25352633- + 6.8 5.48723 LincRNA ENSG00000 SNHG14 . . . 79 25353187 301 224078.8 1 XLOC_0256 chr15:25354142- + 4.0 3.93802 LincRNA ENSG00000 SNHG14 XLOC_011 linc- . 80 25366065 652 224078.8 185 GABRA5-5 2 XLOC_0257 chr15:25756883- + 1.7 1.73045 LincRNA ENSG00000 AC124997.1 XLOC_011 linc- . 30 25803767 732 235731.1 405 UBE3A 4 XLOC_0257 chr15:28912705- + 1.1 0.872184 Pseudoge ENSG00000 RP11-578F21.2 . . . 94 28914177 085 ne 254398.1 7 XLOC_0258 chr15:28982959- + 1.8 1.84687 Antisense ENSG00000 RP11-578F21.6 . . . 01 29004586 386 261480.1 8 XLOC_0258 chr15:30395911- + 1.1 0 Pseudoge ENSG00000 ULK4P3 . . . 13 30402607 037 ne 178081.8 XLOC_0259 chr15:36003926- + 1.0 0.163776 LincRNA ENSG00000 DPH6-AS1 . . . 57 36150446 569 248079.2 XLOC_0259 chr15:38656159- + 0.2 1.40212 LincRNA . . . . . 81 38665564 480 4 XLOC_0261 chr15:40331500- + 2.0 2.27217 LincRNA ENSG00000 SRP14-AS1 XLOC_011 linc- . 12 40352362 139 248508.2 219 BUB1B 5 XLOC_0261 chr15:41576164- + 13. 11.5747 LincRNA ENSG00000 OIP5-AS1 XLOC_011 linc-EXD1 . 56 41598796 702 247556.2 448 5 XLOC_0262 chr15:45825678- + 0.0 1.72905 LincRNA ENSG00000 RP11-519G16.3 . . . 42 45848355 859 259354.1 807 XLOC_0267 chr15:78190102- + 0.9 1.37157 Pseudoge ENSG00000 CSPG4P13 . . . 00 78194959 318 ne 260139.2 48 XLOC_0267 chr15:81474680- + 1.7 0.220379 Antisense . . . . . 55 81614195 796 4 XLOC_0267 chr15:83419321- + 2.6 2.45575 Antisense ENSG00000 RP11-752G15.6 XLOC_011 linc- . 74 83426033 883 250988.3 333 WHAMM- 2 1 XLOC_0268 chr15:84749018- + 1.3 1.02494 Pseudoge ENSG00000 EFTUD1P1 . . . 12 84773891 992 ne 259404.1 1 XLOC_0268 chr15:89584278- + 1.9 1.14021 LincRNA ENSG00000 RP11-326A19.4 XLOC_011 linc- . 87 89622914 004 260123.1 344 ABHD2 8 XLOC_0269 chr15:100347865- + 11. 5.94215 LincRNA . . XLOC_011 linc-ASB7- . 75 100422749 362 383 4 9 XLOC_0270 chr15:102306219- + 1.4 0.193086 Pseudoge ENSG00000 DNM1P47 . . . 39 102306677 414 ne 259660.2 9 XLOC_0270 chr15:102515123- + 1.7 1.81833 Pseudoge ENSG00000 WASH3P . . . 49 102516757 937 ne 185596.12 2 XLOC_0270 chr15:20867317- - 0.4 2.35798 LincRNA ENSG00000 RP11-403B2.7 . . . 63 20961425 422 260409.1 33 XLOC_0270 chr15:23185269- - 4.1 5.14916 Pseudoge ENSG00000 WHAMMP3 . . . 94 23212472 573 ne 187667.6 XLOC_0270 chr15:23281891- - 2.6 2.30159 Pseudoge ENSG00000 HERC2P2 . . . 99 23295987 812 ne 140181.10 5 XLOC_0271 chr15:32812777- - 5.8 5.82092 Pseudoge ENSG00000 RP11-632K20.7 . . . 68 32828866 358 ne 223509.4 8 XLOC_0273 chr15:38330295- - 0.0 1.94247 LincRNA ENSG00000 RP11-1008C21.1 XLOC_011 linc- . 05 38365459 983 259225.2 213 SPRED1 273 XLOC_0273 chr15:38330295- - 0.5 7.43766 LincRNA ENSG00000 RP11-1008C21.1 XLOC_011 linc- . 07 38365459 321 259225.2 213 SPRED1 9 XLOC_0273 chr15:40985298- - 1.2 1.0118 Antisense ENSG00000 RAD51-AS1 . . . 62 40987276 241 245849.2 4 XLOC_0274 chr15:44826662- - 5.4 2.92891 LincRNA ENSG00000 EIF3J-AS1 . . . 32 44829071 826 179523.4 7 XLOC_0277 chr15:61927478- - 1.5 0.497728 LincRNA ENSG00000 RP11-507B12.2 XLOC_011 linc-RORA . 00 61945508 091 259616.1 491 1 XLOC_0278 chr15:67709270- - 1.4 0.324459 Antisense ENSG00000 IQCH-AS1 . . . 31 67793136 231 259673.1 7 XLOC_0281 chr15:84954220- - 2.2 0.122311 Pseudoge ENSG00000 DNM1P51 . . . 10 84957517 684 ne 235370.5 7 XLOC_0281 chr15:85049565- - 6.5 5.54066 Pseudoge ENSG00000 LINC00933 XLOC_011 linc- . 12 85113762 688 ne 259728.1 339 ZSCAN2-2 1 XLOC_0282 chr15:89339410- - 3.1 3.41877 LincRNA ENSG00000 RP11-343B18.2 XLOC_011 linc-DET1- . 32 89342290 784 259676.1 570 2 8 XLOC_0284 chr16:2014947-2015510 + 2.7 2.22435 LincRNA ENSG00000 SNHG9 . . . 03 219 255198.3 6 XLOC_0285 chr16:14393350- + 1.8 2.41523 LincRNA ENSG00000 RP11-65J21.3 XLOC_011 linc-BFAR . 25 14422671 078 262454.1 650 1 XLOC_0286 chr16:21312463- + 1.7 2.79615 Pseudoge ENSG00000 CTD-2547E10.3 . . . 04 21358608 009 ne 257403.2 2 XLOC_0286 chr16:29097913- + 1.5 1.14653 Pseudoge ENSG00000 RRN3P2 . . . 94 29128104 976 ne 103472.5 9 XLOC_0288 chr16:31711899- + 1.4 4.20848 LincRNA ENSG00000 CTD-2358C21.4 . . . 24 31717488 276 261731.2 9 XLOC_0288 chr16:31993259- + 5.9 3.20768 Pseudoge ENSG00000 RP11-1166P10.1 . . . 38 31995463 748 ne 260628.1 7 XLOC_0289 chr16:56651381- + 47. 133.375 Pseudoge ENSG00000 MT1L . . . 31 56652154 386 ne 260549.1 XLOC_0294 chr16:79635230- + 2.5 1.78519 LincRNA . . . . . 55 79639631 353 6 XLOC_0294 chr16:79747725- + 4.3 1.62331 LincRNA ENSG00000 RP11-345M22.2 XLOC_011 linc- . 61 79781054 207 261390.1 797 DYNLRB2- 1 3 XLOC_0296 chr16:86715542- + 0.3 1.08415 LincRNA . . XLOC_011 linc- . 15 86730050 962 815 MAP1LC3 87 B-6 XLOC_0296 chr16:88729748- + 2.2 0.801275 LincRNA ENSG00000 SNAI3-AS1 . . . 77 88741609 394 260630.2 2 XLOC_0297 chr16:90038990- + 2.1 2.57212 Pseudoge ENSG00000 AFG3L1P . . . 08 90052087 573 ne 223959.4 2 XLOC_0297 chr16:90056770- + 1.7 1.3879 Pseudoge ENSG00000 AFG3L1P . . . 15 90063045 368 ne 223959.4 7 XLOC_0297 chr16:2203370-2205360 - 1.5 1.42544 Antisense ENSG00000 RP11-304L19.5 . . . 77 680 260260.1 7 XLOC_0297 chr16:3177432-3192775 - 4.1 3.10569 Antisense ENSG00000 RP11-473M20.14 . . . 99 999 263072.1 3 XLOC_0298 chr16:10522758- - 0.8 8.20796 Antisense . . . . . 74 10592329 180 83 XLOC_0299 chr16:21495693- - 7.0 5.35506 Pseudoge ENSG00000 SLC7A5P2 . . . 78 21531804 309 ne 258186.2 8 XLOC_0299 chr16:21813869- - 1.8 1.90019 Pseudoge ENSG00000 RRN3P1 . . . 84 21821304 934 ne 248124.3 5 XLOC_0299 chr16:21821399- - 1.4 1.37413 Pseudoge ENSG00000 RRN3P1 . . . 85 21825190 529 ne 248124.3 3 XLOC_0299 chr16:21827738- - 2.1 2.53109 Pseudoge ENSG00000 RRN3P1 . . . 87 21831762 691 ne 248124.3 4 XLOC_0300 chr16:25114642- - 1.1 0.349916 LincRNA ENSG00000 RP11-449H11.1 . . . 20 25122787 214 260448.1 9 XLOC_0301 chr16:33500666- - 1.3 1.68098 Pseudoge ENSG00000 BMS1P8 . . . 76 33509663 260 ne 260518.1 2 XLOC_0303 chr16:54952961- - 17. 19.8653 LincRNA ENSG00000 CRNDE XLOC_011 linc-IRX3- . 12 54963012 289 245694.4 950 5 3 XLOC_0304 chr16:70010227- - 4.0 4.70471 Pseudoge ENSG00000 PDXDC2P . . . 53 70048487 201 ne 255185.1 XLOC_0304 chr16:70051950- - 5.1 5.37833 Pseudoge ENSG00000 PDXDC2P . . . 67 70100044 629 ne 255185.1 2 XLOC_0304 chr16:70247413- - 1.1 0.753593 Pseudoge ENSG00000 RP11-296I10.6 XLOC_011 linc-NOB1 . 78 70258934 979 ne 261556.4 997 5 XLOC_0305 chr16:72318609- - 1.0 0.749326 LincRNA . . XLOC_012 linc- . 16 72425649 599 003 PMFBP1-2 6 XLOC_0305 chr16:72574479- - 8.8 3.81672 LincRNA ENSG00000 AC004158.2 . . . 48 72698894 641 261008.2 9 XLOC_0305 chr16:74358417- - 3.3 2.52347 LincRNA ENSG00000 AC009120.6 . . . 73 74402234 826 259972.1 7 XLOC_0307 chr16:87098044- - 2.2 0.979191 LincRNA . . . . . 91 87099101 804 1 XLOC_0308 chr16:88210935- - 1.2 1.65364 LincRNA ENSG00000 RP11-863P13.1 XLOC_011 linc- . 03 88220364 007 260162.2 826 ZNF469-3 8 XLOC_0309 chr17:4891063-4894104 + 0.8 1.07287 Antisense ENSG00000 RP5-1050D4.5 . . . 13 389 262227.1 32 XLOC_0309 chr17:5015219-5017670 + 3.8 3.17776 Antisense ENSG00000 AC012146.7 . . . 17 814 234327.3 7 XLOC_0309 chr17:5095341-5126811 + 2.2 0.481684 Antisense ENSG00000 RP11-333E1.1 . . . 18 469 261879.1 XLOC_0310 chr17:14285012- + 0.0 2.30413 LincRNA ENSG00000 AC022816.2 XLOC_012 linc- . 59 14326180 952 230647.1 116 ZNF286A- 417 6 XLOC_0311 chr17:16342173- + 201 207.254 Antisense ENSG00000 C17orf76-AS1 . . . 10 16344913 .54 175061.13 7 XLOC_0311 chr17:20254246- + 2.8 2.80348 Pseudoge ENSG00000 CCDC144CP . . . 92 20336381 877 ne 154898.11 6 XLOC_0312 chr17:28927892- + 2.7 2.33793 Pseudoge ENSG00000 LRRC37BP1 . . . 83 28964592 181 ne 250462.4 5 XLOC_0312 chr17:29058984- + 3.2 3.67669 Pseudoge ENSG00000 SUZ12P XLOC_012 linc- . 92 29106781 063 ne 264538.2 162 ATAD5-2 4 XLOC_0313 chr17:29335686- + 1.6 0.836037 Pseudoge ENSG00000 RP11-271K11.5 . . . 15 29386706 225 ne 265798.2 XLOC_0313 chr17:29956710- + 0.0 1.20545 LincRNA ENSG00000 RP1-41C23.1 XLOC_012 linc- . 42 29965823 949 266877.1 166 SUZ12-3 079 XLOC_0314 chr17:33895072- + 2.0 1.34694 LincRNA ENSG00000 RP11- . . . 08 33901400 086 267321.1 1094M14.11 XLOC_0314 chr17:35848670- + 0.3 1.12454 LincRNA . . . . . 27 35849330 585 77 XLOC_0315 chr17:40107297- + 1.3 0.737208 LincRNA . . . . . 09 40117727 214 7 XLOC_0315 chr17:40576908- + 2.3 1.76819 LincRNA . . . . . 17 40588410 335 5 XLOC_0315 chr17:41277613- + 2.0 1.73344 Pseudoge ENSG00000 CTD-3199J23.6 . . . 48 41292983 373 ne 267681.1 7 XLOC_0318 chr17:66097699- + 8.5 6.48596 Pseudoge ENSG00000 LRRC37A16P . . . 76 66129608 359 ne 267023.1 4 XLOC_0320 chr17:74553849- + 10. 14.1196 Antisense ENSG00000 SNHG16 . . . 07 74562561 327 163597.10 4 XLOC_0320 chr17:76840091- + 0.2 1.31911 Pseudoge ENSG00000 RPL9P29 . . . 65 76843218 787 ne 267355.2 9 XLOC_0321 chr17:6018-50202 - 1.1 2.33501 LincRNA ENSG00000 AC108004.2 XLOC_012 linc- . 53 715 273172.1 064 C17orf97- 9 3 XLOC_0322 chr17:1607632-1619558 - 34. 65.7719 LincRNA ENSG00000 MIR22HG . . . 00 150 186594.8 6 XLOC_0322 chr17:6918075-6923151 - 1.9 1.7479 Antisense ENSG00000 RP11-589P10.5 XLOC_012 linc- . 68 986 262089.1 373 TEKT1-1 XLOC_0323 chr17:8123887-8126218 - 1.4 1.51787 LincRNA ENSG00000 LINC00324 . . . 12 821 178977.3 4 XLOC_0323 chr17:10563455- - 1.3 1.81144 LincRNA ENSG00000 CTC-297N7.8 . . . 50 10583143 226 273290.1 8 XLOC_0325 chr17:18414392- - 2.9 2.58043 Pseudoge ENSG00000 AC107983.4 . . . 16 18499571 024 ne 227077.2 4 XLOC_0325 chr17:18501941- - 8.2 4.4326 Pseudoge ENSG00000 AC107983.4 . . . 33 18528939 291 ne 227077.2 5 XLOC_0329 chr17:43351775- - 1.2 0.621694 LincRNA . . . . . 34 43394363 545 3 XLOC_0329 chr17:45095045- - 3.9 2.54183 Antisense ENSG00000 RP11-156P1.3 . . . 69 45134992 071 262879.1 XLOC_0329 chr17:45148978- - 1.8 1.40281 LincRNA ENSG00000 RP11-156P1.3 . . . 85 45177580 971 262879.1 9 XLOC_0330 chr17:45534147- - 1.2 0.863539 Pseudoge ENSG00000 MRPL45P2 . . . 23 45569881 679 ne 228782.3 9 XLOC_0330 chr17:45968185- - 1.6 0.914883 LincRNA ENSG00000 RP11-6N17.4 . . . 48 45973637 737 264920.1 2 XLOC_0330 chr17:45973838- - 1.6 1.25069 Antisense ENSG00000 AC003665.1 . . . 49 46018747 534 234494.3 3 XLOC_0331 chr17:48247501- - 1.3 0.0622485 Pseudoge ENSG00000 HILS1 . . . 02 48258586 609 ne 188662.5 9 XLOC_0331 chr17:55149421- - 1.8 1.20073 LincRNA ENSG00000 RP11-166P13.3 XLOC_012 linc-COIL- . 70 55162411 004 263004.1 530 2 XLOC_0332 chr17:58160894- - 5.0 12.6891 LincRNA ENSG00000 CTD-2319I12.1 XLOC_012 linc- . 06 58165757 422 261040.2 538 HEATR6-2 5 XLOC_0332 chr17:62745791- - 1.5 2.07442 Pseudoge ENSG00000 RP13-104F24.1 . . . 61 62749178 724 ne 266820.1 XLOC_0332 chr17:62750142- - 6.1 6.88441 Pseudoge ENSG00000 RP13-104F24.1 . . . 62 62771304 473 ne 266820.1 3 XLOC_0332 chr17:62776899- - 2.2 2.55895 Pseudoge ENSG00000 PLEKHM1P . . . 68 62833299 965 ne 214176.5 3 XLOC_0333 chr17:62964154- - 2.7 2.43176 Pseudoge ENSG00000 AMZ2P1 . . . 05 62971551 482 ne 214174.4 1 XLOC_0333 chr17:66686917- - 2.9 11.0901 LincRNA ENSG00000 RP11-118B18.1 . . . 43 66691401 622 267659.1 7 XLOC_0334 chr17:70017943- - 2.9 1.73143 LincRNA ENSG00000 AC005152.2 XLOC_012 linc-SOX9- . 11 70023288 870 234899.5 299 2 1 XLOC_0334 chr17:70067191- - 1.4 1.32324 LincRNA ENSG00000 AC005152.2 XLOC_012 linc-SOX9- . 34 70071807 837 234899.5 300 1 5 XLOC_0334 chr17:70071857- - 2.2 1.25598 LincRNA ENSG00000 AC005152.2 XLOC_012 linc-SOX9- . 36 70078996 791 234899.5 300 1 4 XLOC_0334 chr17:70080048- - 8.9 18.3499 LincRNA ENSG00000 AC005152.2 XLOC_012 linc-SOX9- . 39 70116925 995 234899.5 300 1 7 XLOC_0334 chr17:70080048- - 1.0 0.940165 LincRNA ENSG00000 AC005152.2 XLOC_012 linc-SOX9- . 41 70116925 304 234899.5 300 1 9 XLOC_0334 chr17:70416093- - 1.2 1.21055 LincRNA ENSG00000 LINC00511 XLOC_012 linc- . 81 70589000 927 227036.2 568 ABCA5-3 XLOC_0339 chr18:3466229-3478952 + 1.3 0.589663 LincRNA ENSG00000 RP11-838N2.4 XLOC_012 linc- . 26 487 266835.1 747 MYOM1-2 1 XLOC_0339 chr18:5238078-5246501 + 4.6 5.7811 LincRNA ENSG00000 LINC00667 . . . 40 087 263753.2 XLOC_0341 chr18:32870276- + 3.3 3.48333 Pseudoge ENSG00000 ZNF271 . . . 12 32897287 446 ne 257267.1 4 XLOC_0341 chr18:44790051- + 1.1 1.383 LincRNA . . . . . 84 44810875 975 8 XLOC_0342 chr18:53833409- + 0.0 2.20493 LincRNA ENSG00000 CTD-2008L17.1 XLOC_012 linc- . 44 53838003 528 267327.1 687 WDR7-1 565 XLOC_0344 chr18:9318635-9334169 - 1.0 0.565297 LincRNA ENSG00000 RP11-888D10.3 XLOC_012 linc- . 91 463 264964.1 755 LAMA1-4 3 XLOC_0345 chr18:12039392- - 2.1 1.03507 Pseudoge ENSG00000 RP11-703I16.3 . . . 06 12048926 860 ne 266995.1 2 XLOC_0348 chr18:53865316- - 0.1 1.71416 LincRNA . . . . . 72 53893620 179 71 XLOC_0350 chr18:67332445- - 1.1 4.03935 Antisense ENSG00000 RP11-543H23.2 . . . 07 67392454 112 266840.1 9 XLOC_0351 chr19:2328703-2339960 + 3.0 3.20757 LincRNA . . . . . 00 710 9 XLOC_0351 chr19:2340967-2345305 + 2.3 0.378754 LincRNA . . . . . 02 852 8 XLOC_0351 chr19:2351432-2353933 + 1.9 1.4754 LincRNA ENSG00000 LLfos-48D6.1 . . . 07 106 273116.1 9 XLOC_0351 chr19:4909513-4941934 + 3.5 2.5544 LincRNA . . . . . 44 542 6 XLOC_0352 chr19:12098436- + 2.1 4.15975 Antisense ENSG00000 CTD-2006C1.2 . . . 92 12146480 223 219665.4 3 XLOC_0353 chr19:12305858- + 0.7 1.04578 LincRNA ENSG00000 CTD-2666L21.1 . . . 08 12348222 748 234773.2 56 XLOC_0353 chr19:14247855- + 0.7 1.73585 Antisense ENSG00000 CTB-55O6.12 . . . 63 14304723 685 267169.1 9 XLOC_0354 chr19:20368525- + 7.1 3.82365 Pseudoge ENSG00000 AC078899.3 . . . 92 20370009 881 ne 269274.1 XLOC_0355 chr19:28284306- + 4.9 3.89131 Pseudoge ENSG00000 AC005357.1 XLOC_013 linc- . 54 28301882 324 ne 266906.1 283 ZNF681-5 5 XLOC_0357 chr19:37288441- + 4.2 4.04387 LincRNA ENSG00000 CTD-2162K18.5 . . . 33 37341170 154 267254.1 5 XLOC_0357 chr19:38307947- + 1.2 0.998527 LincRNA ENSG00000 AC016582.2 . . . 70 38323091 597 225868.2 9 XLOC_0358 chr19:42901314- + 2.3 1.22657 Antisense ENSG00000 LIPE-AS1 . . . 52 42912856 068 213904.4 1 XLOC_0359 chr19:44694701- + 1.0 0.639881 LincRNA . . XLOC_013 linc- . 13 44703104 474 093 ZNF227 1 XLOC_0360 chr19:52197578- + 0.9 1.34876 LincRNA ENSG00000 hsa-mir-125a . . . 64 52207092 859 269959.1 14 XLOC_0361 chr19:53700353- + 2.5 1.71251 LincRNA ENSG00000 CTD-2245F17.3 . . . 09 53719695 300 269051.1 7 XLOC_0361 chr19:56879602- + 6.2 5.07099 Pseudoge ENSG00000 ZNF542 . . . 69 56891393 639 ne 240225.6 1 XLOC_0361 chr19:56989418- + 2.7 1.96261 Antisense ENSG00000 ZNF667-AS1 . . . 76 57007841 808 166770.6 2 XLOC_0362 chr19:58892833- + 2.0 1.70791 LincRNA . . . . . 39 58897869 578 1 XLOC_0362 chr19:59086685- + 2.8 2.75133 Pseudoge ENSG00000 RPL23AP79 . . . 64 59116602 619 ne 213753.6 XLOC_0364 chr19:10762539- - 2.0 1.54501 LincRNA ENSG00000 ILF3-AS1 XLOC_013 linc- . 75 10764544 322 267100.1 222 AP1M2 3 XLOC_0365 chr19:17596874- - 0.9 1.50464 Antisense ENSG00000 CTD-3131K8.2 . . . 83 17632097 638 269439.1 41 XLOC_0367 chr19:23239345- - 0.9 1.9797 LincRNA ENSG00000 RP11-15H20.6 XLOC_013 linc- . 00 23448008 988 213971.3 018 ZNF726-5 66 XLOC_0367 chr19:27731916- - 13. 10.3394 LincRNA . . . . . 15 27740280 012 3 XLOC_0367 chr19:28258403- - 2.0 1.50219 Pseudoge ENSG00000 AC005357.1 XLOC_013 linc- . 43 28268784 547 ne 266906.1 283 ZNF681-5 8 XLOC_0367 chr19:32880730- - 0.6 1.11252 Antisense ENSG00000 AC007773.2 XLOC_013 linc- . 66 32896443 607 267213.3 300 TSHZ3-6 16 XLOC_0368 chr19:36031201- - 1.3 0.879627 Antisense ENSG00000 AD000090.2 . . . 28 36036418 762 236144.2 XLOC_0374 chr1_gl000192_random:3 - 1.3 0.554967 LincRNA . . . . . 12 54710-397660 951 2 XLOC_0374 chr2:3606099-3610115 + 1.9 2.28757 Antisense ENSG00000 AC108488.3 XLOC_001 linc-RPS7- . 59 967 234171.1 323 1 7 XLOC_0376 chr2:19100476-19251982 + 1.3 1.1848 LincRNA ENSG00000 AC092594.1 XLOC_001 linc- . 80 002 236204.1 374 RHOB-7 3 XLOC_0377 chr2:25194985-25202221 + 2.2 1.10879 LincRNA ENSG00000 DNAJC27-AS1 XLOC_001 linc-EFR3B . 32 084 224165.1 398 3 XLOC_0378 chr2:30569482-30582371 + 1.8 1.16067 LincRNA ENSG00000 AC109642.1 XLOC_001 linc- . 37 350 235997.2 412 LCLAT1-1 6 XLOC_0379 chr2:39664480-39827363 + 3.5 2.42173 LincRNA ENSG00000 AC007246.3 . . . 58 057 231312.2 3 XLOC_0380 chr2:46871684-46879692 + 1.1 0.889644 LincRNA . . XLOC_001 linc-SOCS5 . 48 596 457 2 XLOC_0382 chr2:65710010-65919669 + 0.7 1.0662 LincRNA ENSG00000 AC012370.3 XLOC_002 linc- . 38 747 234255.4 135 SPRED2-3 58 XLOC_0386 chr2:87754303-87883362 + 54. 70.0468 LincRNA ENSG00000 LINC00152 . . . 65 239 222041.6 4 XLOC_0387 chr2:95873143-95888872 + 1.5 0.731502 LincRNA ENSG00000 AC092835.2 . . . 35 655 233757.2 2 XLOC_0388 chr2:98289789-98319989 + 0.9 2.42461 LincRNA ENSG00000 AC017099.3 . . . 05 092 228486.5 48 XLOC_0388 chr2:107103525- + 6.0 5.70801 Pseudoge ENSG00000 CD8BP . . . 99 107125909 389 ne 254126.2 7 XLOC_0392 chr2:113993023- + 3.8 5.9968 Antisense ENSG00000 RP11-65I12.1 . . . 11 114034254 645 258395.1 XLOC_0392 chr2:114341679- + 0.9 1.04209 Pseudoge ENSG00000 DDX11L2 . . . 67 114357851 221 ne 236397.2 9 XLOC_0393 chr2:128145785- + 1.4 1.59323 Antisense ENSG00000 AC068282.3 . . . 95 128147876 710 236682.1 1 XLOC_0394 chr2:128619205- + 2.4 3.8502 LincRNA . . . . . 06 128651349 645 1 XLOC_0394 chr2:132271398- + 1.1 0.802598 Pseudoge ENSG00000 AC093838.4 . . . 52 132279126 499 ne 152117.13 8 XLOC_0395 chr2:145780653- + 2.8 2.68689 LincRNA ENSG00000 TEX41 . . . 46 145942522 705 226674.4 6 XLOC_0398 chr2:162931381- + 0.7 1.00628 LincRNA ENSG00000 AC008063.2 . . . 22 162934450 802 230918.1 31 XLOC_0398 chr2:162949700- + 0.6 1.13505 LincRNA ENSG00000 AC008063.3 XLOC_001 linc-GCA-2 . 23 162951548 863 233397.1 731 34 XLOC_0398 chr2:168149496- + 3.0 3.5352 LincRNA ENSG00000 AC074363.1 XLOC_001 linc- . 49 168730549 043 228222.1 742 B3GALT1 6 XLOC_0401 chr2:171649386- + 1.1 0.946131 LincRNA ENSG00000 AC007405.6 . . . 62 171655588 522 239467.1 5 XLOC_0403 chr2:179278401- + 1.7 1.21274 Antisense ENSG00000 AC009948.5 . . . 01 179315400 179 223960.2 5 XLOC_0403 chr2:179459826- + 2.8 2.28809 Antisense ENSG00000 TTN-AS1 . . . 30 179496198 451 237298.4 8 XLOC_0407 chr2:191399622- + 1.1 1.01711 LincRNA ENSG00000 AC093388.3 . . . 00 191435539 437 233654.1 6 XLOC_0407 chr2:196603472- + 1.0 0.774732 Antisense . . . . . 57 196622911 529 4 XLOC_0408 chr2:202835756- + 0 1.04083 LincRNA . . . . . 38 202845480 XLOC_0409 chr2:207661812- + 3.4 3.78119 LincRNA ENSG00000 AC008269.2 XLOC_001 linc-CPO-2 . 07 207734815 251 229321.1 822 4 XLOC_0409 chr2:207743510- + 1.2 1.41609 LincRNA . . XLOC_001 linc-CPO-1 . 39 207791470 062 823 7 XLOC_0409 chr2:208104033- + 0.2 1.26093 LincRNA ENSG00000 AC007879.5 XLOC_002 linc-KLF7- . 68 208113615 870 223725.2 473 2 34 XLOC_0411 chr2:218142867- + 0.8 2.9568 Antisense ENSG00000 AC009492.1 XLOC_001 linc- . 12 218160680 172 233143.1 864 RUFY4-2 61 XLOC_0412 chr2:225016338- + 0.1 1.18994 Pseudoge ENSG00000 AC019109.1 . . . 10 225035395 534 ne 224826.1 1 XLOC_0412 chr2:225102634- + 0.0 2.29395 LincRNA . . . . . 24 225115967 149 379 XLOC_0413 chr2:228520421- + 0.1 3.84837 LincRNA . . . . . 04 228523892 806 99 XLOC_0414 chr2:242626493- + 3.0 1.87061 LincRNA ENSG00000 AC133528.2 . . . 70 242634156 372 228989.1 5 XLOC_0414 chr2:243030830- + 2.4 1.31407 Pseudoge ENSG00000 AC093642.5 . . . 83 243061941 471 ne 220804.4 XLOC_0415 chr2:243064101- + 1.2 0.700854 Pseudoge ENSG00000 AC093642.5 . . . 01 243101572 841 ne 220804.4 2 XLOC_0415 chr2:8142787-8144459 - 0.0 1.67768 LincRNA ENSG00000 LINC00299 XLOC_001 linc-ID2-2 . 52 299 236790.1 332 976 XLOC_0420 chr2:36580757-36582747 - 2.3 1.65857 LincRNA ENSG00000 RP11-490M8.1 XLOC_002 linc- . 01 979 260025.1 048 FAM98A-3 8 XLOC_0420 chr2:38421248-38468349 - 7.7 11.6519 LincRNA ENSG00000 AC009229.5 . . . 34 755 227292.1 7 XLOC_0424 chr2:64989523-64995661 - 0.2 1.46934 LincRNA . . . . . 24 441 16 XLOC_0425 chr2:70257040-70313601 - 4.1 3.71593 LincRNA ENSG00000 PCBP1-AS1 . . . 86 544 179818.9 2 XLOC_0426 chr2:74153943-74209862 - 2.1 4.84241 Antisense ENSG00000 DGUOK-AS1 . . . 60 798 237883.1 5 XLOC_0427 chr2:81883247-81885379 - 0.4 2.22109 LincRNA . . . . . 25 717 44 XLOC_0427 chr2:85614050-85619333 - 1.5 1.05859 Antisense ENSG00000 RP11-717A5.2 . . . 48 739 273196.1 2 XLOC_0429 chr2:98163528-98167878 - 3.1 3.24435 Pseudoge ENSG00000 ANKRD36B . . . 30 025 ne 196912.8 XLOC_0429 chr2:98167944-98206744 - 4.4 5.7372 Pseudoge ENSG00000 ANKRD36B . . . 31 021 ne 196912.8 8 XLOC_0430 chr2:101339479- - 0.0 1.47531 LincRNA . . XLOC_001 linc- . 02 101359483 800 591 NPAS2-1 317 XLOC_0430 chr6:143267747- 0.9 59.511 LincRNA ENSG00000 RP11-439L18.1 - - . 77 143280112 595 232618.1 18 XLOC_0431 chr2:108943626- - 3.1 1.81349 Pseudoge ENSG00000 SULT1C2P1 . . . 52 108970643 212 ne 237223.2 8 XLOC_0431 chr2:110969103- - 17. 20.3968 LincRNA ENSG00000 LINC00116 XLOC_002 linc- . 99 110970123 754 175701.6 263 NPHP1-3 7 XLOC_0432 chr2:111963612- - 41. 52.2653 LincRNA ENSG00000 MIR4435-1HG XLOC_001 linc- . 18 112252629 160 172965.10 625 MERTK-2 9 XLOC_0433 chr2:114363031- - 4.8 3.67137 Pseudoge ENSG00000 RPL23AP7 . . . 18 114384745 257 ne 240356.2 5 XLOC_0433 chr2:114632728- - 1.7 0.737257 LincRNA . . . . . 36 114641302 473 2 XLOC_0434 chr2:135624654- - 1.2 0.624214 Antisense ENSG00000 AC016725.4 . . . 56 135676255 421 224043.3 9 XLOC_0436 chr2:151560131- - 0.1 3.03823 LincRNA . . . . . 78 151567657 762 8 XLOC_0436 chr2:152127077- - 0.3 10.9272 LincRNA . . . . . 98 152196200 918 8 XLOC_0441 chr2:177494329- - 5.5 4.68787 LincRNA ENSG00000 AC017048.4 XLOC_002 linc-EVX2- . 03 177502603 659 224577.1 408 8 3 XLOC_0442 chr2:186898388- - 3.3 3.83106 LincRNA ENSG00000 AC097500.2 XLOC_001 linc- . 79 187173382 574 237877.2 781 ZC3H15 XLOC_0444 chr2:189757751- - 0.0 1.51344 LincRNA . . . . . 81 189765861 134 959 XLOC_0445 chr2:190147030- - 1.7 0.922382 Pseudoge ENSG00000 KRT18P19 XLOC_002 linc- . 40 190203182 283 ne 213601.3 433 COL5A2 5 XLOC_0445 chr2:190252753- - 1.0 0.259826 LincRNA . . XLOC_002 linc- . 75 190260012 536 433 COL5A2 6 XLOC_0449 chr2:216601201- - 1.6 0.909054 LincRNA ENSG00000 LINC00607 . . . 89 216642209 250 235770.1 4 XLOC_0450 chr2:216706938- - 1.7 0.836894 LincRNA ENSG00000 LINC00607 . . . 24 216708800 288 235770.1 1 XLOC_0450 chr2:216781666- - 1.1 1.07807 LincRNA ENSG00000 AC093382.1 . . . 44 216807071 363 226276.1 2 XLOC_0452 chr2:228132458- - 1.1 0.279691 Antisense ENSG00000 AC097662.2 . . . 02 228170366 345 236432.3 8 XLOC_0453 chr2:232371935- - 1.4 0.875137 LincRNA . . . . . 30 232379098 223 1 XLOC_0453 chr2:234774050- - 1.7 0.714469 Pseudoge ENSG00000 MSL3P1 . . . 53 234777051 959 ne 224287.2 2 XLOC_0457 chr20:18548051- + 18. 22.1203 LincRNA ENSG00000 LINC00493 . . . 98 18550202 256 232388.2 3 XLOC_0458 chr20:21106643- + 9.4 7.30602 LincRNA ENSG00000 RP4-777D9.2 . . . 52 21227260 385 232712.2 5 XLOC_0458 chr20:22634093- + 1.1 0.0198333 LincRNA ENSG00000 RP11-359G22.2 XLOC_013 linc- . 76 22666209 226 230400.1 486 SSTR4-3 7 XLOC_0459 chr20:25677644- + 1.4 0.530997 Pseudoge ENSG00000 VN1R108P . . . 18 25716812 707 ne 230772.1 2 XLOC_0459 chr20:25731841- + 2.5 1.00544 LincRNA ENSG00000 RP13-401N8.1 XLOC_013 linc- . 41 25733380 221 226465.1 708 ZNF337- 9 10 XLOC_0460 chr20:37075328- + 2.4 1.76678 LincRNA ENSG00000 SNHG11 XLOC_013 linc- . 94 37079566 278 174365.15 520 RALGAPB 9 XLOC_0461 chr20:42839616- + 1.3 1.58927 LincRNA ENSG00000 OSER1-AS1 . . . 37 42854812 922 223891.1 XLOC_0461 chr20:46653889- + 1.9 0.827303 LincRNA . . XLOC_013 linc- . 87 46680019 676 547 ARFGEF2- 3 8 XLOC_0461 chr20:46680131- + 1.2 0.923008 LincRNA . . XLOC_013 linc- . 98 46687285 510 547 ARFGEF2- 6 8 XLOC_0462 chr20:47895142- + 14. 13.0781 LincRNA ENSG00000 ZFAS1 . . . 19 47905765 964 177410.8 2 XLOC_0462 chr20:49962279- + 0.3 1.15407 LincRNA . . . . . 69 49986371 361 83 XLOC_0463 chr20:57090527- + 1.2 2.6278 LincRNA ENSG00000 RP5-907D15.3 . . . 15 57148810 356 254620.1 XLOC_0463 chr20:58713521- + 1.7 0.959479 LincRNA ENSG00000 RP5-1043L13.1 . . . 58 58729661 115 228340.1 3 XLOC_0464 chr20:1033422-1039924 - 3.0 0 LincRNA . . . . . 46 714 XLOC_0465 chr20:1786361-1790866 - 0.6 1.0557 LincRNA ENSG00000 RP5-968J1.1 . . . 03 741 230839.1 02 XLOC_0465 chr20:1868257-1880764 - 2.8 3.34772 LincRNA . . . . . 24 636 9 XLOC_0466 chr20:5477728-5485151 - 1.2 0.68923 LincRNA ENSG00000 LINC00654 XLOC_013 linc- . 03 453 205181.5 449 C20orf196 3 -1 XLOC_0466 chr20:6746592-6747267 - 1.5 0.861066 LincRNA . . . . . 15 267 5 XLOC_0467 chr20:22576660- - 1.4 0.133054 LincRNA ENSG00000 RP4-788L20.3 XLOC_013 linc- . 98 22588286 816 237396.1 685 FOXA2-2 1 XLOC_0469 chr20:34192486- - 0.1 1.14236 Pseudoge ENSG00000 FER1L4 . . . 31 34194455 592 ne 088340.11 21 XLOC_0469 chr20:37046782- - 1.1 2.04028 LincRNA ENSG00000 SNORA71B . . . 75 37059159 69 235408.2 XLOC_0469 chr20:37059238- - 0.7 1.75497 LincRNA ENSG00000 SNORA71B XLOC_013 linc- . 76 37063381 616 235408.2 739 KIAA1755- 21 4 XLOC_0472 chr20:61193628- - 0.4 1.74351 LincRNA . . XLOC_013 linc- . 43 61200537 780 602 SLCO4A1- 33 2 XLOC_0473 chr21:15399766- + 3.0 2.67554 Antisense ENSG00000 AP001347.6 . . . 41 15516779 161 224905.2 5 XLOC_0474 chr21:17300556- + 1.4 0.386129 LincRNA . . . . . 14 17335218 134 9 XLOC_0477 chr21:17999826- + 2.8 0.627205 LincRNA ENSG00000 AP000473.5 . . . 32 18006264 288 228798.1 XLOC_0477 chr21:26934114- + 0.2 13.3313 Antisense ENSG00000 LINC00515 XLOC_014 linc- . 94 26976653 667 260583.1 038 TMPRSS15 17 -16 XLOC_0479 chr21:35541900- + 1.0 0.471983 LincRNA ENSG00000 LINC00310 XLOC_013 linc- . 06 35564339 203 227456.3 923 KCNE2-3 XLOC_0479 chr21:35665985- + 0.9 4.75285 LincRNA ENSG00000 AP000318.2 . . . 42 35697214 034 214955.5 22 XLOC_0479 chr21:36118019- + 0.8 1.9054 LincRNA ENSG00000 AP000330.8 XLOC_013 linc-CBR1- . 62 36156944 830 234380.1 928 2 49 XLOC_0480 chr21:37817942- + 2.4 0.540231 Pseudoge ENSG00000 PSMD4P1 . . . 04 37870038 326 ne 223741.1 4 XLOC_0480 chr21:43188194- + 0.2 3.07771 LincRNA . . XLOC_013 linc- eRNA 72 43194760 369 950 UMODL1- 9 2 XLOC_0480 chr21:43406832- + 2.1 9.52715 Antisense ENSG00000 ZNF295-AS1 . . . 78 43431780 537 237232.3 7 XLOC_0481 chr21:46269498- + 0.6 23.6698 Antisense . . . . . 41 46300233 144 33 XLOC_0481 chr21:46707988- + 4.5 3.08554 LincRNA ENSG00000 BX322557.10 XLOC_013 linc- . 51 46713790 879 215447.3 981 COL18A1- 3 4 XLOC_0483 chr21:26796229- - 0.1 2.3311 LincRNA ENSG00000 LINC00158 . . . 45 26825140 443 185433.4 83 XLOC_0484 chr21:28984539- - 0.0 2.23055 LincRNA ENSG00000 AP001607.1 XLOC_013 linc- . 23 29019990 718 234052.1 896 USP16-9 199 XLOC_0485 chr21:29812591- - 11. 9.81988 LincRNA ENSG00000 LINC00161 XLOC_013 linc- . 19 30047487 447 226935.2 901 USP16-4 XLOC_0487 chr21:36103222- - 0.3 1.00174 LincRNA ENSG00000 LINC00160 XLOC_013 linc-CBR1- . 19 36107256 450 230978.1 927 3 82 XLOC_0488 chr21:43470814- - 0.2 3.23699 LincRNA . . XLOC_013 linc- . 27 43475824 556 952 UMODL1- 65 1 XLOC_0488 chr21:46419024- - 1.6 1.70244 LincRNA ENSG00000 LINC00162 XLOC_014 linc- . 82 46424480 844 224930.2 121 ITGB2-3 4 XLOC_0489 chr22:17528285- + 1.3 0.519363 LincRNA ENSG00000 CECR7 . . . 34 17542463 27 237438.2 XLOC_0490 chr22:22652434- + 18. 21.3918 Pseudoge ENSG00000 LL22NC03- . . . 12 22673571 888 ne 272779.1 80A10.6 6 XLOC_0490 chr22:22675766- + 0.8 1.05694 LincRNA . . . . . 20 22677365 298 56 XLOC_0490 chr22:25817227- + 2.3 1.91598 Pseudoge ENSG00000 CRYBB2P1 XLOC_014 linc- . 54 26120781 346 ne 100058.8 323 LRP5L-1 9 XLOC_0490 chr22:26908481- + 1.1 0.938483 LincRNA ENSG00000 CTA-445C9.14 . . . 91 26910704 527 261188.1 1 XLOC_0490 chr22:27068758- + 3.5 5.33304 LincRNA ENSG00000 MIAT XLOC_014 linc- . 92 27176185 376 225783.2 327 CRYBB1-1 XLOC_0491 chr22:29190552- + 1.6 1.87794 LincRNA ENSG00000 CTA-292E10.6 XLOC_014 linc-XBP1 . 88 29444480 041 226471.2 334 5 XLOC_0492 chr22:31365300- + 18. 18.0237 LincRNA ENSG00000 TUG1 XLOC_014 linc-SMTN . 19 31374989 302 253352.4 209 1 XLOC_0494 chr22:51222179- + 10. 8.16756 Pseudoge ENSG00000 AC002055.4 . . . 88 51239725 359 ne 184319.11 8 XLOC_0495 chr22:24001830- - 4.6 3.05676 Pseudoge ENSG00000 AP000347.2 XLOC_014 linc-RGL4- . 69 24034133 514 ne 272578.1 177 1 5 XLOC_0495 chr22:24034240- - 1.7 1.19428 Pseudoge ENSG00000 AP000347.2 . . . 75 24059515 539 ne 272578.1 5 XLOC_0496 chr22:30608614- - 0.1 1.95953 LincRNA . . . . . 46 30609027 045 98 XLOC_0496 chr22:35588412- - 0 1.45129 Pseudoge ENSG00000 COX7BP1 . . . 93 35627034 ne 243453.1 XLOC_0497 chr22:36526651- - 0.1 1.06295 LincRNA . . . . . 02 36529733 685 23 XLOC_0498 chr22:45529624- - 3.0 3.52648 LincRNA ENSG00000 CTA-217C2.1 XLOC_014 linc- . 67 45559769 660 226328.2 394 PHF21B 4 XLOC_0504 chr3:23710334-23711913 + 0.0 1.59485 LincRNA . . . . . 03 888 147 XLOC_0504 chr3:27674249-27689076 + 37. 31.5503 LincRNA ENSG00000 RP11-222K16.1 . . . 66 694 271943.1 4 XLOC_0505 chr3:28798613-28799613 + 1.2 0.364047 LincRNA ENSG00000 LINC00693 . . . 48 289 228214.2 7 XLOC_0507 chr3:40807595-40952516 + 0.2 1.79425 LincRNA ENSG00000 RP11-761N21.1 XLOC_002 linc- . 08 295 231873.1 622 CTNNB1-2 7 XLOC_0507 chr3:40807595-40952516 + 0.3 1.36133 LincRNA . . XLOC_002 linc- . 64 819 622 CTNNB1-2 27 XLOC_0508 chr3:44040801-44164067 + 1.8 1.07735 LincRNA ENSG00000 RP4-555D20.2 XLOC_002 linc- . 03 830 261786.1 629 C3orf77 9 XLOC_0509 chr3:47192854-47217774 + 1.0 0.874661 LincRNA ENSG00000 KIF9-AS1 XLOC_002 linc- . 08 917 227398.3 636 KLHL18-3 1 XLOC_0509 chr3:50242703-50251944 + 1.5 0.0675862 LincRNA . . . . . 88 624 7 XLOC_0509 chr3:50305078-50313282 + 3.7 3.86641 LincRNA . . . . . 94 710 2 XLOC_0511 chr3:64608107-64996819 + 2.7 1.97071 LincRNA ENSG00000 ADAMTS9-AS2 XLOC_003 linc- . 05 428 241684.1 149 ADAMTS9 9 -2 XLOC_0512 chr3:67224330-67226702 + 0.1 1.2488 LincRNA . . . . . 96 863 09 XLOC_0513 chr3:67705134-67891203 + 4.3 2.97275 LincRNA ENSG00000 RP11-81N13.1 XLOC_002 linc- . 00 000 241316.2 693 FAM19A1- 3 1 XLOC_0514 chr3:73871646-73929434 + 0.0 1.32436 LincRNA ENSG00000 RP11-20B7.1 XLOC_002 linc- . 28 399 242741.1 705 FRG2C-8 67 XLOC_0516 chr3:106959534- + 2.3 1.3021 LincRNA ENSG00000 LINC00883 XLOC_003 linc-CBLB- . 26 106968104 353 243701.1 206 7 6 XLOC_0519 chr3:125932944- + 1.5 0.315797 LincRNA . . XLOC_002 linc- . 93 125966855 230 796 CCDC37-4 8 XLOC_0520 chr3:125985672- + 1.7 0.30563 LincRNA ENSG00000 RP11-71E19.1 XLOC_002 linc- . 06 126010335 867 250934.1 798 CCDC37-2 6 XLOC_0521 chr3:139108632- + 2.9 2.40143 Pseudoge ENSG00000 RP11-553K23.2 . . . 62 139396803 774 ne 214280.3 XLOC_0524 chr3:152203323- + 1.2 0.259236 LincRNA ENSG00000 RP11-362A9.3 . . . 29 152205115 705 243305.1 9 XLOC_0525 chr3:156804948- + 0.6 1.12429 LincRNA ENSG00000 LINC00881 XLOC_002 linc-PTX3- . 15 156806490 150 241135.1 892 4 84 XLOC_0525 chr3:156892905- + 3.4 3.2144 LincRNA ENSG00000 RP11-550I24.2 . . . 26 157033993 703 243176.1 9 XLOC_0527 chr3:177159527- + 0.5 1.2006 LincRNA ENSG00000 LINC00578 XLOC_002 linc- eRNA 74 177470284 886 228221.1 931 KCNMB2- 09 5 XLOC_0528 chr3:177483416- + 0.0 1.54077 LincRNA . . XLOC_002 linc- . 07 177484716 791 932 KCNMB2- 83 3 XLOC_0528 chr3:177545591- + 1.6 5.35371 LincRNA ENSG00000 RP11-91K9.1 XLOC_002 linc- . 09 177615946 053 231574.1 934 KCNMB2- 2 2 XLOC_0529 chr3:183165416- + 9.5 9.19109 Pseudoge ENSG00000 LINC00888 . . . 31 183173796 720 ne 240024.1 8 XLOC_0529 chr3:184432882- + 1.3 0.559581 LincRNA ENSG00000 RP11-329B9.4 XLOC_002 linc-VPS8- . 40 184458213 892 272970.1 951 3 4 XLOC_0529 chr3:185677739- + 4.3 6.78991 Pseudoge ENSG00000 RP11-443P15.2 . . . 69 185689876 594 ne 171658.4 5 XLOC_0529 chr3:185691693- + 2.9 2.92137 Pseudoge ENSG00000 RP11-443P15.2 . . . 75 185698799 752 ne 171658.4 4 XLOC_0534 chr3:195390722- + 1.3 3.43562 LincRNA ENSG00000 LINC00969 . . . 55 195393045 923 242086.4 4 XLOC_0534 chr3:195400411- + 1.9 1.6734 LincRNA ENSG00000 LINC00969 . . . 58 195414925 704 242086.4 9 XLOC_0534 chr3:195415169- + 10. 11.8102 LincRNA ENSG00000 LINC00969 XLOC_002 linc- . 66 195438831 077 242086.4 997 MUC20-1 5 XLOC_0536 chr3:9404663-9529762 - 3.2 5.85872 Antisense ENSG00000 SETD5-AS1 . . . 34 725 206573.4 3 XLOC_0536 chr3:12953725-13205629 - 2.1 1.88682 LincRNA . . . . eRNA 96 445 4 XLOC_0537 chr3:14984557-15106835 - 27. 30.1888 LincRNA ENSG00000 FGD5-AS1 . . . 41 619 225733.1 9 XLOC_0541 chr3:39942101-40216035 - 2.5 2.3921 Antisense . . . . . 65 888 2 XLOC_0542 chr3:40338409-40351031 - 0.9 2.46003 LincRNA . . . . . 01 472 67 XLOC_0543 chr3:46556814-46648554 - 13. 5.42389 Antisense . . . . . 26 846 1 XLOC_0544 chr3:62180737-62303523 - 2.1 0.565457 LincRNA ENSG00000 PTPRG-AS1 . . . 90 210 241472.2 9 XLOC_0546 chr3:75475600-75484312 - 2.4 2.11619 Pseudoge ENSG00000 FAM86DP . . . 47 061 ne 244026.2 1 XLOC_0549 chr3:106991577- - 1.9 1.01512 LincRNA ENSG00000 LINC00883 XLOC_003 linc-CBLB- . 58 107140189 842 243701.1 206 7 7 XLOC_0552 chr3:125546076- - 1.4 1.06911 Pseudoge ENSG00000 ENPP7P4 . . . 18 125567418 432 ne 241278.1 5 XLOC_0552 chr3:125590880- - 1.1 1.26088 Pseudoge ENSG00000 ENPP7P4 . . . 40 125609177 300 ne 241278.1 3 XLOC_0552 chr3:125626012- - 2.2 1.65045 Pseudoge ENSG00000 ENPP7P4 . . . 52 125634617 351 ne 241278.1 6 XLOC_0553 chr3:128592200- - 1.2 0.542919 LincRNA . . . . . 09 128598269 147 5 XLOC_0553 chr3:129103429- - 1.6 1.16132 Pseudoge ENSG00000 RP11-529F4.1 . . . 32 129239295 791 ne 244932.2 6 XLOC_0553 chr3:131081207- - 1.2 1.3529 LincRNA ENSG00000 RP11-933H2.4 . . . 63 131099574 928 250608.1 XLOC_0553 chr3:134101261- - 0.0 1.66552 Pseudoge ENSG00000 HMGN1P9 . . . 91 134112946 874 ne 248377.1 032 XLOC_0554 chr3:137745520- - 1.2 0.647818 LincRNA . . . . . 17 137816689 862 9 XLOC_0555 chr3:145701437- - 1.1 1.0952 LincRNA . . . . . 17 145710978 227 6 XLOC_0556 chr3:156465853- - 1.2 0.611389 LincRNA ENSG00000 LINC00886 . . . 79 156469447 333 240875.1 6 XLOC_0559 chr3:178626152- - 3.6 3.94667 LincRNA . . . . . 00 178722317 085 5 XLOC_0559 chr3:178626152- - 1.6 1.83775 LincRNA . . . . . 06 178722317 481 4 XLOC_0559 chr3:180284598- - 1.8 0.742316 Pseudoge ENSG00000 RP11-496B10.1 . . . 44 180302365 941 ne 241946.1 5 XLOC_0560 chr3:194535851- - 0.0 1.10831 LincRNA . . . . . 97 194539577 107 32 XLOC_0561 chr3:195685913- - 2.7 2.85763 Pseudoge ENSG00000 SDHAP1 . . . 16 195717169 297 ne 185485.10 7 XLOC_0561 chr3:197330569- - 4.6 5.07124 Pseudoge ENSG00000 AC024560.3 . . . 56 197354758 096 ne 214135.4 9 XLOC_0561 chr4:124399-156992 + 3.3 3.18908 LincRNA ENSG00000 ZNF718 . . . 86 199 250312.2 4 XLOC_0562 chr4:206392-248841 + 4.5 5.02096 Pseudoge ENSG00000 ZNF876P . . . 23 704 ne 198155.5 5 XLOC_0562 chr4:1243646-1247825 + 1.1 0.84234 LincRNA ENSG00000 CTBP1-AS2 . . . 88 822 196810.4 1 XLOC_0563 chr4:2936616-2965147 + 2.3 2.30265 Antisense ENSG00000 NOP14-AS1 . . . 15 078 249673.2 9 XLOC_0563 chr4:4543837-4587913 + 1.3 0.42836 Antisense ENSG00000 STX18-AS1 XLOC_003 linc- . 39 826 247708.3 863 STX18-1 6 XLOC_0563 chr4:6675796-6678011 + 3.7 2.97639 LincRNA ENSG00000 RP11-539L10.3 . . . 86 588 251580.1 5 XLOC_0565 chr4:11370163-11374658 + 4.1 3.33795 Pseudoge ENSG00000 RNPS1P1 . . . 63 453 ne 250896.1 2 XLOC_0566 chr4:16248711-16262617 + 1.1 0.387674 LincRNA ENSG00000 TAPT1-AS1 . . . 09 280 263327.2 6 XLOC_0566 chr4:16289222-16324811 + 1.1 0.702634 LincRNA ENSG00000 TAPT1-AS1 XLOC_003 linc- . 25 555 263327.2 469 CLRN2-3 3 XLOC_0569 chr4:52808472-52870014 + 0.4 4.48214 Pseudoge ENSG00000 RP11-61F5.1 . . . 58 918 ne 243929.1 3 XLOC_0569 chr4:53525612-53532354 + 2.4 1.8855 LincRNA ENSG00000 USP46-AS1 . . . 77 411 248866.1 1 XLOC_0569 chr4:53578622-53582444 + 1.8 1.54265 LincRNA ENSG00000 DANCR . . . 80 546 226950.2 1 XLOC_0570 chr4:68566999-68656219 + 5.7 4.29641 Pseudoge ENSG00000 GCOM2 . . . 65 827 ne 227725.2 1 XLOC_0570 chr4:68660437-68670814 + 1.8 0.829915 Pseudoge ENSG00000 GCOM2 . . . 98 485 ne 227725.2 1 XLOC_0571 chr4:68904285-68905489 + 11. 10.1781 Pseudoge ENSG00000 GCOM2 . . . 43 718 ne 227725.2 7 XLOC_0571 chr4:74135360-74170012 + 2.0 1.10003 LincRNA ENSG00000 RP11-692D12.1 . . . 68 378 250220.1 1 XLOC_0573 chr4:85741233-85929985 + 1.5 1.36735 LincRNA . . . . . 98 879 5 XLOC_0575 chr4:100054266- + 1.5 1.22733 Antisense ENSG00000 RP11-696N14.1 . . . 48 100077627 764 246090.2 1 XLOC_0577 chr4:119199873- + 2.3 1.87338 Antisense ENSG00000 SNHG8 . . . 40 119204897 899 269893.2 XLOC_0577 chr4:119401464- + 1.4 2.6817 Pseudoge ENSG00000 CEP170P1 . . . 45 119414358 289 ne 154608.9 6 XLOC_0577 chr4:119757865- + 1.7 2.04261 LincRNA . . XLOC_003 linc- . 65 119772778 997 665 SYNPO2-2 5 XLOC_0577 chr4:120375975- + 1.7 1.2729 Pseudoge ENSG00000 RP11-33B1.1 . . . 87 120550085 933 ne 245958.2 XLOC_0580 chr4:144480637- + 2.6 0.318109 Pseudoge ENSG00000 GUSBP5 . . . 57 144531015 505 ne 236296.3 7 XLOC_0581 chr4:144729487- + 0.6 1.4476 Pseudoge ENSG00000 RP11-780M14.1 XLOC_004 linc- . 41 144741804 271 ne 250345.2 107 FREM3 54 XLOC_0581 chr4:144779635- + 1.5 3.02038 Pseudoge ENSG00000 RP11-780M14.1 . . . 58 144888296 134 ne 250345.2 9 XLOC_0582 chr4:154869980- + 6.4 14.0821 LincRNA . . . . . 67 155122950 894 4 XLOC_0583 chr4:155127365- + 0.5 1.01296 Antisense . . . . . 68 155224132 657 82 XLOC_0585 chr4:174430853- + 2.6 2.5457 LincRNA . . XLOC_003 linc- . 67 174432142 217 783 KIAA1712- 9 4 XLOC_0585 chr4:174447778- + 0.3 1.84638 Antisense ENSG00000 HAND2-AS1 . . . 70 174512356 595 237125.4 43 XLOC_0587 chr4:189659524- + 3.2 4.82623 Pseudoge ENSG00000 RP11-756P10.3 . . . 36 189663157 298 ne 180015.11 9 XLOC_0587 chr4:770695-775638 - 3.1 3.81293 LincRNA ENSG00000 RP11-440L14.1 . . . 75 031 249592.1 XLOC_0588 chr4:3952902-3957196 - 2.8 0 Pseudoge ENSG00000 FAM86EP . . . 19 034 ne 251669.1 XLOC_0588 chr4:9132526-9154033 - 1.2 0.556386 Pseudoge ENSG00000 ENPP7P10 . . . 73 073 ne 249767.1 1 XLOC_0590 chr4:14986929-14995262 - 0.9 1.28821 LincRNA ENSG00000 CPEB2-AS1 . . . 49 233 247624.2 9 XLOC_0593 chr4:24455480-24474340 - 1.6 1.7205 LincRNA . . XLOC_003 linc- . 30 643 908 PPARGC1 4 A XLOC_0593 chr4:24763373-24765607 - 1.1 0.0987755 LincRNA . . . . . 45 790 3 XLOC_0596 chr4:74568381-74588776 - 0.0 4.84785 LincRNA ENSG00000 AC112518.3 XLOC_003 linc-IL8-1 . 73 117 228277.1 573 882 XLOC_0597 chr4:77830049-77870708 - 1.0 1.14586 LincRNA . . XLOC_003 linc- . 50 429 991 ANKRD56- 7 1 XLOC_0600 chr4:109538177- - 1.1 0.499027 LincRNA ENSG00000 RPL34-AS1 . . . 27 109541532 176 234492.4 2 XLOC_0600 chr4:114351762- - 5.2 5.29754 LincRNA . . . . eRNA 80 114357556 207 XLOC_0601 chr4:115256035- - 1.2 2.66234 LincRNA . . XLOC_004 linc-ARSJ . 17 115286136 747 049 7 XLOC_0601 chr4:120355777- - 2.1 1.50613 Pseudoge ENSG00000 RP11-33B1.2 . . . 50 120375770 838 ne 248280.1 XLOC_0602 chr4:123651643- - 1.4 1.0931 Pseudoge ENSG00000 CETN4P . . . 11 123653594 798 ne 224786.1 6 XLOC_0606 chr4:142244712- - 2.7 2.22537 LincRNA ENSG00000 RP11-362F19.1 . . . 47 142253770 924 248810.1 2 XLOC_0607 chr4:145564119- - 0.8 1.01046 LincRNA ENSG00000 HHIP-AS1 . . . 25 145567158 866 248890.1 16 XLOC_0608 chr4:158573954- - 0.0 2.14144 LincRNA ENSG00000 RP11-364P22.2 XLOC_003 linc- . 42 158598790 131 249275.1 759 TMEM144 208 -1 XLOC_0609 chr4:174087806- - 1.6 1.14299 LincRNA ENSG00000 RP11-10K16.1 . . . 76 174249092 583 245213.2 6 XLOC_0609 chr4:174284931- - 2.1 1.18489 Antisense ENSG00000 RP11-798M19.6 XLOC_003 linc-SAP30 . 83 174291879 355 272870.1 780 6 XLOC_0610 chr4:184413344- - 2.2 0.928806 LincRNA ENSG00000 RP11-367N14.2 . . . 64 184425626 669 232648.3 5 XLOC_0611 chr4_gl000194_random:5 - 2.8 3.64098 LincRNA . . . . . 78 3607-115069 641 5 XLOC_0612 chr5:8457800-8460190 + 44. 57.6557 LincRNA ENSG00000 RP11-480D4.2 XLOC_004 linc-CCT5- . 80 450 249159.2 284 8 3 XLOC_0612 chr5:9546406-9553232 + 1.5 0.644405 LincRNA ENSG00000 SNHG18 . . . 83 661 250786.1 6 XLOC_0614 chr5:17604295-17606015 + 0.2 3.83248 Pseudoge ENSG00000 RP11-432M8.8 . . . 22 273 ne 249357.2 6 XLOC_0614 chr5:17743886-17791828 + 1.9 1.24204 LincRNA ENSG00000 RP11-454P21.1 . . . 23 545 249937.1 XLOC_0614 chr5:21459593-21475202 + 7.6 5.58109 Pseudoge ENSG00000 GUSBP1 . . . 44 655 ne 183666.12 5 XLOC_0614 chr5:27475700-27486171 + 2.8 0.843 LincRNA ENSG00000 LINC01021 XLOC_004 linc-CDH6- . 90 101 250337.1 323 5 6 XLOC_0615 chr5:32828826-32890967 + 2.4 0.699052 Pseudoge ENSG00000 CTD-2218G20.1 . . . 21 580 ne 251062.1 8 XLOC_0615 chr5:35366494-35422974 + 0.1 3.58667 LincRNA . . . . . 82 720 64 XLOC_0616 chr5:41281482-41350879 + 0.1 2.55131 Antisense . . XLOC_004 linc-C6 . 61 387 799 34 XLOC_0617 chr5:43013739-43067530 + 1.3 1.02076 LincRNA ENSG00000 CTD-2035E11.5 XLOC_004 linc- . 06 471 272144.1 364 ZNF131-3 7 XLOC_0618 chr5:52405704-52411150 + 2.4 1.80243 Antisense ENSG00000 CTD-2366F13.1 XLOC_004 linc-FST . 01 026 247796.2 382 1 XLOC_0619 chr5:59827821-59843475 + 0.2 1.22449 LincRNA ENSG00000 PART1 XLOC_004 linc- . 04 880 152931.7 399 NDUFAF2- 08 3 XLOC_0619 chr5:60476212-60477989 + 1.3 2.3811 LincRNA ENSG00000 CTC-436P18.1 . . . 28 972 251279.1 2 XLOC_0619 chr5:64327144-64365959 + 3.8 16.4397 LincRNA . . XLOC_004 linc- eRNA 56 159 407 PPWD1 7 XLOC_0621 chr5:76414261-76443815 + 1.3 0.459709 LincRNA ENSG00000 ZBED3-AS1 . . . 69 353 250802.2 1 XLOC_0622 chr5:83877293-83899494 + 0.6 1.36878 LincRNA . . . . . 80 479 17 XLOC_0623 chr5:87564789-87594967 + 2.7 2.01271 LincRNA ENSG00000 CTC-498M16.4 XLOC_004 linc- . 22 679 271904.1 456 POLR3G- 5 11 XLOC_0624 chr5:95308147-95715995 + 1.5 0.990353 Pseudoge ENSG00000 FABP5P5 XLOC_004 linc-ELL2 eRNA 79 981 ne 213716.3 933 8 XLOC_0630 chr5:111496541- + 2.0 1.40692 Antisense ENSG00000 RP11-526F3.1 . . . 37 111755225 748 251076.1 2 XLOC_0630 chr5:115783139- + 1.7 0.892345 Antisense ENSG00000 CTB-118N6.3 . . . 90 115806943 713 248445.1 3 XLOC_0635 chr5:141704726- + 2.8 3.2891 LincRNA ENSG00000 AC005592.2 XLOC_004 linc- . 22 141961462 280 231185.2 587 ARHGAP2 8 6-4 XLOC_0638 chr5:158527577- + 3.4 1.80523 LincRNA ENSG00000 RP11-175K6.1 . . . 09 158535901 237 245812.2 5 XLOC_0638 chr5:159895208- + 0.0 9.34461 LincRNA ENSG00000 MIR146A . . . 23 159922844 597 253522.2 088 XLOC_0639 chr5:171006805- + 0.5 1.08651 LincRNA . . . . . 20 171007589 801 26 XLOC_0639 chr5:177378726- + 0.0 1.04646 Pseudoge ENSG00000 OR1X5P . . . 87 177387043 328 ne 214351.5 867 XLOC_0640 chr5:180619093- + 2.4 7.55652 Antisense ENSG00000 CTC-338M12.5 . . . 50 180621685 831 250222.1 4 XLOC_0640 chr5:180688236- + 0.9 1.38522 LincRNA ENSG00000 TRIM52-AS1 . . . 62 180691786 743 248275.1 01 XLOC_0640 chr5:1572065-1586302 - 3.5 2.85402 Pseudoge ENSG00000 SDHAP3 . . . 93 981 ne 185986.10 8 XLOC_0640 chr5:1597513-1629733 - 3.3 2.90344 Pseudoge ENSG00000 RP11-43F13.1 . . . 99 765 ne 188002.6 XLOC_0642 chr5:16437064-16448804 - 0.5 1.49028 LincRNA ENSG00000 RP1-167G20.2 XLOC_004 linc- . 13 860 249737.1 303 BASP1-3 06 XLOC_0643 chr5:38466286-38468506 - 2.0 1.76617 LincRNA ENSG00000 CTD-2263F21.1 . . . 97 686 251257.1 9 XLOC_0644 chr5:38686194-38796576 - 1.1 2.50054 LincRNA ENSG00000 RP11-122C5.1 XLOC_004 linc-OSMR . 01 783 249911.1 346 6 XLOC_0644 chr5:38843603-38845909 - 2.5 3.20887 LincRNA ENSG00000 RP11-122C5.3 . . . 39 062 250629.1 3 XLOC_0646 chr5:57545844-57555400 - 0.4 2.98545 LincRNA . . . . . 52 823 17 XLOC_0647 chr5:64782094-64782753 - 0.3 1.22469 LincRNA ENSG00000 CTD-2116N20.1 XLOC_004 linc- . 50 180 250081.1 847 ADAMTS6 63 XLOC_0648 chr5:72542093-72570795 - 1.8 1.9884 LincRNA ENSG00000 RP11-60A8.1 XLOC_004 linc-BTF3- . 50 268 249743.1 423 5 6 XLOC_0649 chr5:79780526-79842124 - 1.0 0.935896 LincRNA ENSG00000 CTD-2015H6.3 . . . 41 208 249042.1 9 XLOC_0649 chr5:80533385-80597343 - 2.6 1.71528 Antisense ENSG00000 CKMT2-AS1 . . . 57 244 247572.3 XLOC_0651 chr5:90596973-90610312 - 1.2 11.9774 LincRNA ENSG00000 LUCAT1 XLOC_004 linc- . 46 54 248323.1 468 NR2F1-7 XLOC_0651 chr5:92746727-92916889 - 2.7 3.92486 LincRNA ENSG00000 NR2F1-AS1 XLOC_004 linc- . 48 514 237187.4 475 NR2F1-1 2 XLOC_0653 chr5:99854042-99870684 - 1.3 0.0194418 LincRNA ENSG00000 CTD-2001C12.1 . . . 31 152 247877.2 1 XLOC_0654 chr5:108655310- - 102 135.339 LincRNA ENSG00000 CTD-2587M2.1 . . . 98 108745772 .92 249476.1 XLOC_0657 chr5:127350422- - 5.2 2.50472 LincRNA ENSG00000 CTC-228N24.3 . . . 78 127418798 531 245937.3 9 XLOC_0659 chr5:135465416- - 1.0 0.205029 Antisense ENSG00000 SMAD5-AS1 . . . 19 135518912 062 164621.5 6 XLOC_0660 chr5:139482534- - 2.2 2.71245 Antisense ENSG00000 LINC01024 . . . 17 139488340 211 245146.2 1 XLOC_0661 chr5:144733545- - 0.4 2.16266 LincRNA ENSG00000 CTC-806A22.1 XLOC_005 linc-YIPF5- . 29 144769347 732 250842.1 039 2 99 XLOC_0661 chr5:145039239- - 0.7 1.46613 LincRNA ENSG00000 CTB-73N10.1 XLOC_005 linc-YIPF5- . 38 145214926 968 248125.1 041 3 87 XLOC_0661 chr5:146556638- - 1.1 0.294413 LincRNA ENSG00000 CTC-255N20.1 XLOC_005 linc- . 63 146563169 884 250343.1 046 PPP2R2B- 3 2 XLOC_0662 chr5:150294822- - 9.2 9.45466 Pseudoge ENSG00000 ZNF300P1 . . . 83 150333973 180 ne 197083.7 8 XLOC_0662 chr5:150348010- - 0.0 2.27183 LincRNA . . . . . 90 150377882 239 596 XLOC_0664 chr5:177041064- - 1.5 1.03053 LincRNA ENSG00000 RP11-1277A3.1 . . . 93 177099238 825 247679.2 9 XLOC_0666 chr6:2246002-2397846 + 4.6 3.32386 LincRNA ENSG00000 GMDS-AS1 XLOC_005 linc- . 15 842 250903.4 127 WRNIP1-2 3 XLOC_0666 chr6:2397921-2398996 + 0.6 1.21283 LincRNA ENSG00000 GMDS-AS1 XLOC_005 linc- . 74 320 250903.4 127 WRNIP1-2 73 XLOC_0666 chr6:2399113-2434707 + 0.9 7.87007 LincRNA ENSG00000 GMDS-AS1 XLOC_005 linc- . 75 589 250903.4 127 WRNIP1-2 27 XLOC_0667 chr6:3752338-3754624 + 1.1 0.971587 Pseudoge ENSG00000 RP11-420L9.2 . . . 34 593 ne 219992.2 2 XLOC_0667 chr6:7673545-7676259 + 0.1 1.56789 LincRNA . . . . . 80 667 88 XLOC_0667 chr6:8435856-8559663 + 2.5 1.4391 LincRNA . . . . . 93 755 4 XLOC_0669 chr6:14704157-14709984 + 0.1 1.6542 LincRNA . . . . . 90 487 49 XLOC_0670 chr6:21873759-22196308 + 1.6 1.48668 Pseudoge ENSG00000 RP11-524C21.1 XLOC_005 linc- . 63 411 ne 219404.2 639 MBOAT1- 8 2 XLOC_0672 chr6:26426668-26466203 + 1.8 4.86318 Pseudoge ENSG00000 BTN2A3P . . . 05 190 ne 124549.10 8 XLOC_0672 chr6:26988142-26990720 + 0.5 1.42234 LincRNA ENSG00000 LINC00240 . . . 41 734 224843.2 79 XLOC_0673 chr6:28234763-28246288 + 7.3 4.84344 Pseudoge ENSG00000 RP5-874C20.3 . . . 14 137 ne 197062.7 8 XLOC_0673 chr6:34664746-34665240 + 7.3 3.85429 LincRNA ENSG00000 RP11-140K17.3 . . . 55 444 272288.1 4 XLOC_0673 chr6:35936578-35968897 + 0.2 2.65398 Pseudoge ENSG00000 DPRXP2 . . . 94 187 ne 271304.1 98 XLOC_0674 chr6:41040714-41095311 + 15. 19.7516 Pseudoge ENSG00000 ADCY10P1 . . . 89 268 ne 161912.13 XLOC_0676 chr6:52442099-52447757 + 3.9 3.50065 LincRNA ENSG00000 TRAM2-AS1 . . . 03 111 225791.2 9 XLOC_0676 chr6:52529231-52534103 + 10. 3.78112 Pseudoge ENSG00000 RP1-152L7.5 XLOC_005 linc- . 06 517 ne 216775.2 323 TMEM14A 8 -1 XLOC_0676 chr6:53493079-53496446 + 3.6 3.00556 LincRNA ENSG00000 RP11-345L23.1 XLOC_005 linc- . 19 234 235899.1 327 LRRC1-1 6 XLOC_0676 chr6:57139795-57141891 + 0.8 1.65879 LincRNA . . . . . 54 903 97 XLOC_0676 chr6:72313651-72490122 + 1.3 1.98925 LincRNA . . . . . 98 844 3 XLOC_0677 chr6:73951075-74019883 + 1.1 0.777968 Pseudoge ENSG00000 RPSAP41 . . . 11 122 ne 239626.1 3 XLOC_0677 chr6:75994707-76000820 + 2.1 1.73405 LincRNA ENSG00000 RP1-234P15.4 . . . 70 558 225793.2 7 XLOC_0678 chr6:80194708-80413410 + 6.5 2.23866 LincRNA . . XLOC_005 linc- . 18 244 361 SH3BGRL2 9 -1 XLOC_0679 chr6:81289828-81357379 + 2.7 1.85341 LincRNA . . . . . 13 062 3 XLOC_0682 chr6:90539642-90581376 + 10. 7.46548 LincRNA . . . . . 20 246 XLOC_0682 chr6:99968591-99983754 + 2.0 1.2494 LincRNA ENSG00000 TSTD3 . . . 66 260 228439.3 1 XLOC_0682 chr6:105585177- + 1.3 1.05075 LincRNA ENSG00000 BVES-AS1 . . . 97 105595380 255 203808.6 5 XLOC_0684 chr6:111596861- + 1.1 0.967829 LincRNA ENSG00000 RP5-1112D6.4 XLOC_005 linc- . 14 111599533 515 230177.1 426 WISP3-3 8 XLOC_0684 chr6:112337892- + 0 2.38924 LincRNA . . . . . 56 112353718 XLOC_0685 chr6:119497178- + 2.8 4.08007 LincRNA . . XLOC_005 linc-GJA1- . 37 119748361 354 448 3 2 XLOC_0687 chr6:126307584- + 30. 16.7933 LincRNA . . XLOC_005 linc- . 46 126521571 344 459 CENPW-1 4 XLOC_0690 chr6:132455027- + 2.6 3.19306 LincRNA ENSG00000 LINC01013 XLOC_005 linc- . 15 132490685 493 228495.1 465 TAAR9-1 4 XLOC_0690 chr6:138014249- + 0.1 1.85035 LincRNA . . . . . 77 138023121 545 71 XLOC_0691 chr6:146183785- + 1.1 0.733724 Antisense ENSG00000 RP11-545I5.3 . . . 77 146199372 718 235652.3 3 XLOC_0694 chr6:157097173- + 3.1 0.557848 LincRNA ENSG00000 RP11-230C9.2 . . . 24 157098295 241 271551.1 6 XLOC_0694 chr6:158187092- + 0.9 2.48429 LincRNA . . XLOC_005 linc-SNX9 . 31 158217344 423 516 15 XLOC_0698 chr6:14875558-14877423 - 0.0 1.58611 LincRNA . . . . . 62 829 864 XLOC_0698 chr6:19806422-19811851 - 1.4 0.561298 LincRNA ENSG00000 RP1-167F1.2 XLOC_005 linc-ID4-1 . 86 414 226786.2 193 5 XLOC_0699 chr6:25080488-25138907 - 11. 7.94537 Pseudoge ENSG00000 CMAHP . . . 20 121 ne 168405.10 2 XLOC_0700 chr6:27325608-27343032 - 2.8 2.00299 Pseudoge ENSG00000 ZNF204P . . . 54 684 ne 204789.3 9 XLOC_0701 chr6:40854994-40857146 - 0.2 1.64382 LincRNA . . XLOC_005 linc- . 92 791 715 LRFN2-1 15 XLOC_0703 chr6:48036929-48079248 - 1.5 0.645016 LincRNA . . . . . 23 630 7 XLOC_0703 chr6:51274648-51275317 - 56. 314.391 Pseudoge ENSG00000 RP3-437C15.1 . . . 49 062 ne 232702.2 4 XLOC_0704 chr6:58271991-58287707 - 8.1 5.65271 LincRNA . . . . . 71 552 3 XLOC_0705 chr6:75346057-75443928 - 1.0 0.0637928 LincRNA ENSG00000 RP11-554D15.4 XLOC_005 linc- . 79 005 224583.1 348 SENP6-6 9 XLOC_0707 chr6:77856652-78078981 - 4.4 2.64941 LincRNA . . XLOC_005 linc- . 48 509 768 IMPG1-1 1 XLOC_0710 chr6:82554339-82605761 - 1.1 0.741563 LincRNA ENSG00000 RP11-379B8.1 XLOC_005 linc-TPBG- . 50 718 226453.1 366 2 8 XLOC_0711 chr6:86374367-86388496 - 13. 11.156 LincRNA ENSG00000 SNHG5 . . . 82 234 203875.6 3 XLOC_0712 chr6:96006587-96025239 - 3.4 1.35332 LincRNA ENSG00000 MANEA-AS1 . . . 37 224 261366.1 6 XLOC_0714 chr6:112605582- - 0.6 1.67847 Pseudoge ENSG00000 RP11-506B6.5 . . . 33 112610269 374 ne 216663.3 86 XLOC_0714 chr6:113938137- - 0.0 1.14421 LincRNA ENSG00000 RP11-367G18.1 XLOC_005 linc- . 46 113946289 140 230943.1 810 LAMA4-2 7 XLOC_0714 chr6:113946487- - 0.0 2.17102 LincRNA ENSG00000 RP11-367G18.1 XLOC_005 linc- eRNA 49 113975857 468 230943.1 810 LAMA4-2 708 XLOC_0717 chr6:127175941- - 0.2 2.24546 LincRNA . . XLOC_005 linc- . 97 127215669 166 460 RSPO3 55 XLOC_0720 chr6:138175998- - 1.1 2.8659 LincRNA ENSG00000 RP11-356I2.4 XLOC_005 linc- . 67 138186493 051 237499.2 479 TNFAIP3-1 2 XLOC_0721 chr6:141168506- - 5.4 3.20995 LincRNA ENSG00000 RP3-460G2.2 . . . 38 141219545 371 234147.1 8 XLOC_0721 chr6:143360554- - 1.9 2.33521 LincRNA ENSG00000 RP1-45I4.3 . . . 60 143363440 948 227192.1 1 XLOC_0722 chr6:147167519- - 1.3 1.4306 LincRNA ENSG00000 RP11-497D6.5 XLOC_005 linc- eRNA 28 147293203 834 272397.1 495 STXBP5-2 7 XLOC_0722 chr6:147167519- - 1.4 1.82876 LincRNA ENSG00000 RP11-497D6.5 XLOC_005 linc- eRNA 55 147293203 087 272397.1 495 STXBP5-2 2 XLOC_0724 chr6:159586993- - 0.3 1.33782 LincRNA ENSG00000 RP11-13P5.2 XLOC_005 linc- . 11 159588613 053 233682.2 522 FNDC1-1 33 XLOC_0724 chr6:160007870- - 0.0 3.7715 LincRNA ENSG00000 RP3-393E18.2 XLOC_005 linc- . 56 160013184 848 237927.1 900 TAGAP-1 209 XLOC_0724 chr6:160898178- - 1.9 1.18576 Pseudoge ENSG00000 LPAL2 . . . 71 160977144 617 ne 213071.6 6 XLOC_0725 chr6_cox_hap2:2752099- - 35. 36.9063 LincRNA . . . . . 68 2753128 006 XLOC_0725 chr6_cox_hap2:2835106- - 31. 42.7233 LincRNA . . . . . 69 2837726 538 8 XLOC_0725 chr6_dbb_hap3:2534447- - 1.7 2.47793 LincRNA . . . . . 77 2535480 735 XLOC_0725 chr6_mann_hap4:266998 - 1.7 2.38362 LincRNA . . . . . 82 1-2671584 995 XLOC_0725 chr6_mcf_hap5:2617060- - 37. 36.638 LincRNA . . . . . 86 2704524 049 6 XLOC_0725 chr6_qbl_hap6:1208116- + 0.5 1.09796 LincRNA . . . . . 90 1210166 277 08 XLOC_0725 chr6_qbl_hap6:2661929- + 2.3 2.14781 LincRNA . . . . . 96 2676693 366 4 XLOC_0726 chr6_qbl_hap6:2617460- - 2.6 5.80173 LincRNA . . . . . 04 2618499 993 7 XLOC_0726 chr6_ssto_hap7:1032091- - 1.7 1.51649 LincRNA . . . . . 09 1033953 175 XLOC_0726 chr7:591021-770227 + 1.7 2.60213 Antisense ENSG00000 AC147651.4 . . . 24 003 237181.1 XLOC_0726 chr7:1200019-1205669 + 2.0 1.49328 LincRNA ENSG00000 AC091729.9 . . . 29 732 229043.2 8 XLOC_0726 chr7:1606967-1615669 + 1.8 0.737665 Antisense ENSG00000 PSMG3-AS1 . . . 34 747 230487.3 2 XLOC_0726 chr7:2482181-2483511 + 1.9 1.11676 LincRNA ENSG00000 AC004840.9 XLOC_005 linc-LFNG . 51 943 175873.3 968 9 XLOC_0726 chr7:2930288-2932310 + 0.0 1.29678 LincRNA . . . . . 63 855 585 XLOC_0727 chr7:6770030-6793571 + 2.5 3.23337 Pseudoge ENSG00000 PMS2CL . . . 18 213 ne 187953.6 9 XLOC_0728 chr7:17414371-17507370 + 1.6 2.26291 LincRNA ENSG00000 AC019117.1 . . . 61 001 236318.1 2 XLOC_0729 chr7:19592362-19628875 + 1.0 0.14373 LincRNA ENSG00000 AC007091.1 . . . 81 491 223838.1 7 XLOC_0730 chr7:22893876-22901318 + 1.8 2.76303 LincRNA ENSG00000 AC005682.5 . . eRNA 38 443 228649.4 2 XLOC_0730 chr7:25878714-25888251 + 0.7 1.01164 LincRNA . . XLOC_006 linc- . 74 757 016 NFE2L3-1 28 XLOC_0730 chr7:27135742-27141203 + 0.8 1.24485 Antisense ENSG00000 HOTAIRM1 . . . 85 629 233429.5 18 XLOC_0731 chr7:30174486-30226478 + 6.7 8.78362 LincRNA ENSG00000 AC007036.6 XLOC_006 linc- . 40 293 227017.1 034 ZNRF2 9 XLOC_0731 chr7:30256337-30273686 + 1.0 2.06383 LincRNA . . . . . 54 350 8 XLOC_0733 chr7:39773059-39818967 + 1.2 0.576825 LincRNA ENSG00000 LINC00265 XLOC_006 linc- . 54 272 188185.7 416 VPS41-3 8 XLOC_0734 chr7:41743563-41750728 + 0.3 3.12811 LincRNA ENSG00000 INHBA-AS1 . . . 04 334 224116.2 71 XLOC_0735 chr7:45964203-45968791 + 0.6 1.18671 LincRNA . . . . . 02 287 57 XLOC_0735 chr7:46072766-46076950 + 0 1.02754 LincRNA . . . . . 05 XLOC_0736 chr7:64408060-64409790 + 1.0 1.51977 LincRNA . . . . . 14 922 4 XLOC_0736 chr7:65217889-65229576 + 1.8 1.92863 Pseudoge ENSG00000 CCT6P1 . . . 47 233 ne 228409.1 9 XLOC_0736 chr7:66767591-66796469 + 5.7 4.9121 Pseudoge ENSG00000 PMS2P4 XLOC_006 linc-SBDS- . 87 880 ne 067601.6 485 4 7 XLOC_0737 chr7:72300007-72307265 + 64. 67.8424 Pseudoge ENSG00000 SBDSP1 . . . 16 903 ne 225648.1 8 XLOC_0738 chr7:78954080-79092253 + 13. 28.3723 Antisense ENSG00000 MAGI2-AS3 XLOC_006 linc- . 35 940 234456.3 507 MAGI2-3 3 XLOC_0739 chr7:84335287-84388592 + 0.6 3.39278 LincRNA . . . . . 67 998 94 XLOC_0741 chr7:93690218-93697178 + 1.0 2.15037 LincRNA ENSG00000 AC003092.1 . . . 17 560 236453.1 7 XLOC_0742 chr7:98895298-98895600 + 0 5.10982 Pseudoge ENSG00000 MYH16 . . . 22 ne 002079.8 XLOC_0742 chr7:99517273-99520812 + 1.4 0.762312 LincRNA . . XLOC_006 linc- . 66 400 187 ZKSCAN1- 8 2 XLOC_0742 chr7:100951562- + 1.1 0.314558 LincRNA ENSG00000 RP11-132A1.4 . . . 99 100954190 019 232445.1 XLOC_0744 chr7:114762272- + 0.8 1.17473 LincRNA ENSG00000 AC068610.3 . . . 91 114765872 611 225535.2 66 XLOC_0747 chr7:128171544- + 11. 11.2506 Pseudoge ENSG00000 RP11-274B21.1 . . . 23 128269470 234 ne 242588.2 8 XLOC_0747 chr7:128271599- + 2.6 2.30811 LincRNA . . XLOC_006 linc- . 50 128285417 763 242 FAM71F2- 7 1 XLOC_0748 chr7:133781951- + 0.5 1.13737 LincRNA . . XLOC_006 linc- . 20 133787047 086 259 LRGUK-1 18 XLOC_0748 chr7:133803999- + 15. 19.0816 LincRNA . . . . . 28 133948697 223 XLOC_0749 chr7:139953048- + 0.4 6.3814 LincRNA . . . . . 56 139957857 201 58 XLOC_0750 chr7:143521109- + 1.3 0.594743 Pseudoge ENSG00000 RP11-307I2.1 . . . 30 143599248 753 ne 232145.1 5 XLOC_0751 chr7:155005908- + 0.3 1.20011 LincRNA . . XLOC_006 linc- . 21 155019377 639 303 INSIG1-2 89 XLOC_0752 chr7:4684757-4701106 - 0.5 3.80146 Antisense . . . . . 04 360 25 XLOC_0752 chr7:7591079-7592579 - 1.7 0.144651 LincRNA ENSG00000 RP5-1159O4.1 XLOC_006 linc- . 58 055 272894.1 350 COL28A1 4 XLOC_0753 chr7:17522222-17523142 - 1.9 1.09746 LincRNA ENSG00000 AC019117.1 . . . 54 686 236318.1 4 XLOC_0754 chr7:19178631-19187338 - 2.0 1.76045 LincRNA . . . . . 04 447 7 XLOC_0754 chr7:20085136-20118050 - 6.5 1.10649 LincRNA . . . . . 13 971 7 XLOC_0754 chr7:20368217-20369253 - 1.0 1.21592 LincRNA ENSG00000 CTA-293F17.1 . . . 21 062 271133.1 3 XLOC_0755 chr7:22927739-22944037 - 0.2 1.12287 LincRNA ENSG00000 AC005682.8 . . . 01 471 235664.1 21 XLOC_0756 chr7:25627606-25790627 - 4.5 6.0714 LincRNA ENSG00000 AC003090.1 . . . 05 386 223561.2 3 XLOC_0760 chr7:41676661-41715590 - 0.8 3.40018 LincRNA . . . . . 37 139 31 XLOC_0760 chr7:41743563-41750728 - 0.5 2.99909 LincRNA ENSG00000 INHBA-AS1 . . . 41 946 224116.2 15 XLOC_0761 chr7:43999383-44027526 - 1.1 0.899493 Pseudoge ENSG00000 AC004985.12 . . . 13 808 ne 241057.1 7 XLOC_0761 chr7:44027586-44058820 - 5.8 3.76134 Pseudoge ENSG00000 POLR2J4 . . . 29 773 ne 272655.1 5 XLOC_0761 chr7:45022628-45026250 - 3.8 9.6932 LincRNA ENSG00000 SNHG15 . . . 55 973 232956.4 3 XLOC_0761 chr7:45763208-45808593 - 5.5 4.27723 Pseudoge ENSG00000 SEPT7P2 . . . 62 139 ne 214765.4 6 XLOC_0763 chr7:65888290-66057375 - 17. 18.5862 Pseudoge ENSG00000 RP4-756H11.1 XLOC_006 linc- . 15 529 ne 232491.1 133 KCTD7-2 3 XLOC_0763 chr7:65888290-66057375 - 0.7 1.42484 LincRNA ENSG00000 GS1-124K5.3 XLOC_006 linc- . 24 891 223473.1 133 KCTD7-2 26 XLOC_0763 chr7:66756141-66767397 - 1.0 0.590946 Pseudoge ENSG00000 PMS2P4 . . . 83 182 ne 067601.6 2 XLOC_0764 chr7:72474155-72476485 - 6.5 3.53441 Pseudoge ENSG00000 STAG3L3 . . . 26 724 ne 174353.13 9 XLOC_0764 chr7:74298021-74304787 - 2.0 1.13982 Pseudoge ENSG00000 STAG3L2 . . . 68 51 ne 160828.13 XLOC_0765 chr7:75608764-75623961 - 5.3 4.89093 LincRNA ENSG00000 TMEM120A . . . 00 014 189077.6 7 XLOC_0765 chr7:77312336-77325581 - 1.6 1.01136 LincRNA ENSG00000 RSBN1L-AS1 . . . 56 551 214293.4 9 XLOC_0765 chr7:80553659-80558813 - 0.0 1.37605 LincRNA . . . . . 79 868 848 XLOC_0766 chr7:86954620-86974850 - 10. 9.41238 LincRNA ENSG00000 TP53TG1 XLOC_006 linc- . 72 550 182165.13 516 C7orf23 4 XLOC_0767 chr7:89945470-89950267 - 0.0 1.8159 LincRNA ENSG00000 AC002064.5 . . . 02 219 225498.1 028 XLOC_0768 chr7:93904914-94021537 - 3.3 1.68296 LincRNA . . XLOC_006 linc-BET1- eRNA 08 190 525 1 5 XLOC_0769 chr7:97595345-97601668 - 4.9 3.3489 Pseudoge ENSG00000 AC004967.7 . . . 05 093 ne 243554.1 6 XLOC_0769 chr7:99927460-99933030 - 2.7 2.51092 Pseudoge ENSG00000 PMS2P1 . . . 54 278 ne 078319.7 XLOC_0769 chr7:100657663- - 0.4 2.73196 Antisense ENSG00000 RP11-395B7.4 . . . 69 100662204 162 227053.1 77 XLOC_0769 chr7:102895256- - 1.4 1.07585 Pseudoge ENSG00000 DPY19L2P2 . . . 91 102915641 199 ne 170629.10 4 XLOC_0770 chr7:104533967- - 0.1 1.17321 Antisense . . . . . 41 104553691 211 1 XLOC_0770 chr7:104556361- - 0.0 1.12243 LincRNA ENSG00000 RP11-325F22.5 . . . 50 104561443 840 225329.1 428 XLOC_0770 chr7:104594167- - 3.4 8.59256 LincRNA ENSG00000 LINC01004 XLOC_006 linc-MLL5 . 66 104646316 747 228393.3 195 3 XLOC_0771 chr7:107380222- - 0.4 1.00545 Antisense ENSG00000 AC002467.7 . . . 02 107402615 233 241764.3 78 XLOC_0773 chr7:129244383- - 1.1 0.604904 LincRNA ENSG00000 RP11-448A19.1 XLOC_006 linc- . 02 129250779 215 273329.1 604 TNPO3-3 1 XLOC_0773 chr7:130546147- - 1.0 0.879461 LincRNA ENSG00000 MIR29B1 . . . 33 130554024 439 226380.3 9 XLOC_0773 chr7:130557540- - 11. 15.9649 LincRNA ENSG00000 MIR29B1 XLOC_006 linc- eRNA 37 130794735 753 226380.3 253 MKLN1-1 6 XLOC_0773 chr7:130557540- - 1.9 3.25467 LincRNA ENSG00000 MIR29B1 XLOC_006 linc- eRNA 38 130794735 208 226380.3 253 MKLN1-1 3 XLOC_0773 chr7:134102965- - 1.6 1.93149 LincRNA ENSG00000 RP11-38M8.1 . . . 87 134115130 051 273297.1 1 XLOC_0775 chr7:143075825- - 0.9 1.39788 LincRNA ENSG00000 AC093673.5 . . . 53 143078109 930 232533.1 09 XLOC_0776 chr7:149169675- - 2.2 2.73096 Pseudoge ENSG00000 ZNF767 XLOC_006 linc- . 32 149321738 400 ne 133624.9 288 KRBA1-1 1 XLOC_0776 chr7:149169675- - 2.4 2.15159 Pseudoge ENSG00000 ZNF767 XLOC_006 linc- . 33 149321738 500 ne 133624.9 288 KRBA1-1 8 XLOC_0776 chr7:149169675- - 1.9 1.23121 Pseudoge ENSG00000 ZNF767 XLOC_006 linc- . 59 149321738 937 ne 133624.9 288 KRBA1-1 6 XLOC_0777 chr7:155020985- - 1.8 2.34201 LincRNA . . . . . 13 155022081 002 6 XLOC_0777 chr7_gl000195_random:4 - 5.4 7.11898 LincRNA . . XLOC_014 - . 93 3008-86678 970 513 4 XLOC_0778 chr8:2584508-2692093 + 3.9 1.76098 LincRNA ENSG00000 GS1-57L11.1 XLOC_006 linc- . 28 705 253853.1 980 ERICH1-9 4 XLOC_0780 chr8:11190195-11197344 + 0.8 1.19933 Pseudoge ENSG00000 TDH XLOC_006 linc-BLK . 57 093 ne 154316.10 710 14 XLOC_0780 chr8:12294697-12458905 + 5.0 4.40288 LincRNA ENSG00000 RP11-419I17.1 XLOC_006 linc- . 95 128 270154.1 721 C8orf79-2 2 XLOC_0781 chr8:17658850-17679894 + 10. 1.93975 LincRNA ENSG00000 RP11-156K13.1 XLOC_006 linc-PCM1 . 80 883 253944.1 726 8 XLOC_0782 chr8:17942203-17953412 + 2.1 2.35613 Antisense ENSG00000 CTD-2547L16.1 . . . 07 120 245281.2 8 XLOC_0783 chr8:27558697-27566722 + 1.0 0.732292 LincRNA . . . . . 36 244 5 XLOC_0783 chr8:30601675-30624719 + 15. 13.6523 Pseudoge ENSG00000 RP11-465K4.4 . . . 84 206 ne 271081.1 9 XLOC_0783 chr8:32785488-32907849 + 1.7 1.00417 LincRNA ENSG00000 RP11-11N9.4 . . . 94 284 247134.2 XLOC_0785 chr8:52811904-52859748 + 1.1 1.5229 LincRNA ENSG00000 RP11-110G21.1 . . . 95 471 228801.5 2 XLOC_0786 chr8:58658687-58661025 + 0.9 1.55023 LincRNA ENSG00000 RP11-388G22.1 XLOC_006 linc- . 80 357 253322.1 809 FAM110B- 55 1 XLOC_0787 chr8:77318806-77345905 + 0.5 4.85246 LincRNA ENSG00000 ZFHX4-AS1 XLOC_006 linc- . 96 048 253661.1 850 ZFHX4-1 81 XLOC_0788 chr8:79717154-79798424 + 0.1 34.5858 LincRNA . . . . . 32 485 47 XLOC_0790 chr8:95566033-95582584 + 3.5 0.630707 Pseudoge ENSG00000 RP11-267M23.6 . . . 15 736 ne 253175.1 5 XLOC_0791 chr8:103817069- + 0.8 1.14272 LincRNA ENSG00000 KB-1732A1.1 XLOC_006 linc- . 28 103822627 478 253669.3 894 ATP6V1C1 78 -3 XLOC_0794 chr8:129009511- + 1.7 1.25056 LincRNA ENSG00000 PVT1 . . . 77 129027298 321 249859.3 4 XLOC_0796 chr8:157448-197313 - 3.0 2.82763 Pseudoge ENSG00000 RPL23AP53 . . . 55 092 ne 223508.5 4 XLOC_0797 chr8:7182277-7212817 - 2.1 0.705585 LincRNA ENSG00000 FAM66B . . . 48 653 215374.5 5 XLOC_0798 chr8:19084676-19093127 - 0.7 6.00324 LincRNA ENSG00000 RP11-618M23.4 . . . 84 587 253280.1 82 XLOC_0799 chr8:25036190-25041997 - 1.5 1.13979 LincRNA . . . . . 64 365 XLOC_0800 chr8:37260657-37351452 - 3.5 4.80532 LincRNA ENSG00000 RP11-150O12.1 XLOC_007 linc- . 60 093 253161.1 053 DUSP26-5 5 XLOC_0802 chr8:54427503-54436571 - 1.1 2.48378 LincRNA ENSG00000 RP11-400K9.3 XLOC_007 linc- . 04 786 254204.1 085 OPRK1-4 8 XLOC_0802 chr8:57406928-57472411 - 17. 12.5698 LincRNA ENSG00000 RP11-17A4.2 XLOC_007 linc-PENK- . 40 312 254254.1 088 2 9 XLOC_0803 chr8:67123874-67170360 - 1.8 1.47781 LincRNA . . XLOC_007 linc-CRH-4 . 81 435 110 8 XLOC_0804 chr8:67834228-67837824 - 252 230.258 Antisense ENSG00000 SNHG6 XLOC_006 linc-CSPP1 . 07 .86 245910.4 829 2 XLOC_0804 chr8:74153616-74162569 - 0.1 1.61941 LincRNA . . . . . 51 275 55 XLOC_0806 chr8:90570147-90627831 - 1.8 17.529 LincRNA ENSG00000 RP11-37B2.1 . . . 08 130 251136.4 8 XLOC_0806 chr8:90627962-90765918 - 1.8 11.0078 LincRNA ENSG00000 RP11-37B2.1 . . . 15 534 251136.4 XLOC_0807 chr8:92080152-92082384 - 24. 24.2617 LincRNA ENSG00000 GS1-251I9.4 . . . 27 550 253738.1 2 XLOC_0808 chr8:97081734-97091800 - 1.0 0.139511 Pseudoge ENSG00000 RP11-44N17.1 . . . 61 998 ne 183663.6 6 XLOC_0809 chr8:104258464- - 1.1 1.02437 LincRNA ENSG00000 RP11-318M2.2 XLOC_006 linc-FZD6 . 92 104344887 463 247081.3 898 4 XLOC_0811 chr8:115806280- - 1.2 0.295534 LincRNA . . . . . 49 115810438 030 3 XLOC_0812 chr8:117266655- - 1.4 2.32415 LincRNA ENSG00000 LINC00536 . . . 28 117416017 798 249917.2 6 XLOC_0813 chr8:118691106- - 0.9 1.8549 LincRNA . . XLOC_007 linc- . 34 118725932 013 189 RAD21-3 04 XLOC_0813 chr8:118744509- - 0.9 1.50222 LincRNA . . XLOC_007 linc- . 51 118758502 092 191 RAD21-4 76 XLOC_0814 chr8:135796359- - 1.2 0.496301 LincRNA ENSG00000 AC083843.1 . . . 89 135817109 222 259820.1 XLOC_0815 chr8:143746920- - 1.2 0.221449 Antisense . . . . . 36 143756249 638 4 XLOC_0815 chr8:144098310- - 2.4 0.638574 Antisense ENSG00000 RP11-273G15.2 . . . 50 144099621 830 247317.3 7 XLOC_0815 chr8:144362784- - 1.1 1.44529 LincRNA ENSG00000 RP13-582O9.5 XLOC_007 linc-LY6H . 52 144364657 033 253716.1 249 3 XLOC_0816 chr8:146198979- - 6.0 4.39062 Pseudoge ENSG00000 ZNF252P . . . 24 146228279 196 ne 196922.6 7 XLOC_0816 chr9:3632466-3652163 + 1.4 1.06954 LincRNA ENSG00000 RP11-509J21.1 . . . 89 905 232104.2 9 XLOC_0817 chr9:3667846-3690724 + 1.0 1.4725 LincRNA ENSG00000 RP11-509J21.4 XLOC_007 linc-RFX3 . 03 762 226669.2 633 7 XLOC_0817 chr9:3734567-3762403 + 0.5 1.45708 LincRNA . . . . . 15 044 47 XLOC_0817 chr9:3781364-3802716 + 0.1 1.63371 LincRNA . . . . . 32 641 78 XLOC_0818 chr9:17018335-17034087 + 1.7 0.619006 LincRNA . . . . eRNA 92 853 1 XLOC_0819 chr9:21682903-21689760 + 10. 93.1486 LincRNA . . . . eRNA 95 598 6 XLOC_0820 chr9:22029519-22049339 + 1.5 0.927605 LincRNA ENSG00000 CDKN2B-AS1 . . . 04 392 240498.2 7 XLOC_0820 chr9:22097053-22112339 + 1.3 1.31975 LincRNA ENSG00000 CDKN2B-AS1 . . . 21 872 240498.2 2 XLOC_0820 chr9:22238152-22304481 + 2.2 6.18761 LincRNA . . . . . 40 179 9 XLOC_0821 chr9:22723322-22767588 + 1.0 0.746879 LincRNA ENSG00000 RP11-370B11.3 . . . 83 072 224549.1 9 XLOC_0822 chr9:33178895-33179959 + 2.0 3.88719 LincRNA ENSG00000 RP11-326F20.5 . . . 73 349 233554.1 XLOC_0823 chr9:37079993-37090745 + 11. 14.0455 LincRNA ENSG00000 RP11-220I1.1 . . . 70 610 233137.2 7 XLOC_0825 chr9:73216375-73219498 + 1.4 1.67997 Antisense . . . . eRNA 96 011 8 XLOC_0826 chr9:79130366-79180730 + 2.2 2.69834 Pseudoge ENSG00000 RP11-214N16.2 XLOC_007 linc- . 48 854 ne 219149.4 415 FOXB2-2 1 XLOC_0826 chr9:79220769-79251773 + 1.9 1.07174 Antisense . . . . . 69 234 8 XLOC_0827 chr9:88420897-88466140 + 1.1 0.857481 Pseudoge ENSG00000 RP11-213G2.3 . . . 11 568 ne 165121.10 7 XLOC_0827 chr9:89366247-89373190 + 1.0 0.965801 LincRNA . . XLOC_007 linc- . 37 812 437 C9orf170- 2 XLOC_0827 chr9:89562974-89604199 + 1.4 0.908906 LincRNA ENSG00000 RP11-276H19.1 XLOC_007 linc- . 45 363 226237.1 438 C9orf170- 8 1 XLOC_0828 chr9:93759915-93764094 + 0.5 1.42824 LincRNA ENSG00000 RP11-367F23.2 . . . 09 322 260454.1 34 XLOC_0828 chr9:96734176-96740453 + 1.4 1.11874 LincRNA . . . . . 52 090 9 XLOC_0828 chr9:96928504-96963227 + 2.9 2.14464 LincRNA ENSG00000 RP11-2B6.2 . . eRNA 69 317 269929.1 2 XLOC_0828 chr9:97440530-97444298 + 1.7 0.250654 LincRNA . . . . . 95 799 3 XLOC_0829 chr9:97853658-97885336 + 3.4 1.17906 Antisense ENSG00000 RP11-80I15.4 . . . 02 768 229065.1 XLOC_0829 chr9:99449337-99491109 + 1.4 0.823042 LincRNA ENSG00000 RP11-535M15.1 . . . 34 894 224848.1 6 XLOC_0831 chr9:113391589- + 0.1 3.26707 LincRNA . . . . . 36 113404403 708 79 XLOC_0832 chr9:116169513- + 1.9 1.81859 Antisense . . . . . 38 116172955 307 8 XLOC_0832 chr9:117366153- + 1.1 1.75801 LincRNA . . . . . 59 117366631 459 5 XLOC_0833 chr9:123555846- + 2.1 1.50043 Pseudoge ENSG00000 RP11-27I1.4 XLOC_007 linc- . 55 123562488 110 ne 214654.5 549 CEP110-2 8 XLOC_0833 chr9:123577184- + 1.1 0.705954 LincRNA ENSG00000 PSMD5-AS1 . . . 60 123639478 805 226752.3 XLOC_0835 chr9:132092284- + 2.7 2.80042 LincRNA ENSG00000 RP11-65J3.1 XLOC_007 linc-IER5L- . 44 132104440 893 233901.1 865 3 5 XLOC_0835 chr9:132251004- + 6.5 4.67258 LincRNA ENSG00000 LINC00963 XLOC_007 linc-IER5L- eRNA 51 132267596 038 204054.7 868 2 XLOC_0835 chr9:132337490- + 1.6 1.12591 LincRNA ENSG00000 RP11-492E3.2 . . . 63 132343755 008 227619.1 7 XLOC_0836 chr9:136890595- + 2.3 1.56398 Antisense ENSG00000 LINC00094 . . . 08 136916855 708 235106.4 8 XLOC_0836 chr9:138799751- + 2.5 2.37094 LincRNA ENSG00000 RP11-432J22.2 . . . 33 138812960 110 238058.1 5 XLOC_0837 chr9:2506424-2523120 - 1.8 2.23558 LincRNA ENSG00000 RP11-91N2.3 . . . 02 680 231052.1 5 XLOC_0837 chr9:4676485-4679479 - 3.2 2.64078 LincRNA ENSG00000 RP11-6J24.6 . . . 66 622 273061.1 6 XLOC_0837 chr9:4880133-4887721 - 0.8 1.25279 Antisense . . . . . 72 460 59 XLOC_0837 chr9:5576765-5628940 - 2.2 1.33872 LincRNA ENSG00000 RP11-574F11.3 . . . 86 658 231509.1 1 XLOC_0841 chr9:38069338-38075256 - 2.4 1.39931 LincRNA . . XLOC_007 linc-SHB . 30 727 686 3 XLOC_0841 chr9:41953960-41956275 - 1.1 0.911941 Pseudoge ENSG00000 RP11-104G3.2 XLOC_007 linc- . 41 653 ne 229273.1 690 FAM75A7- 7 3 XLOC_0841 chr9:66830734-66863336 - 2.6 1.48806 Pseudoge ENSG00000 RP11-318K12.3 . . . 81 344 ne 270092.2 6 XLOC_0841 chr9:67252645-67289861 - 1.1 0.708812 Pseudoge ENSG00000 AQP7P1 XLOC_007 linc- . 84 882 ne 186466.4 374 ANKRD20 3 A1-4 XLOC_0842 chr9:67325416-67340112 - 17. 16.9841 Pseudoge ENSG00000 BMS1P10 . . . 02 933 ne 237238.2 9 XLOC_0842 chr9:68433479-68440347 - 1.9 0.632907 Pseudoge ENSG00000 RP11-764K9.4 . . . 19 237 ne 215548.2 9 XLOC_0845 chr9:94289970-94290507 - 0 1.24414 LincRNA . . . . . 23 XLOC_0847 chr9:99917560-99950861 - 2.2 1.67164 LincRNA ENSG00000 RP11-498P14.5 . . . 14 104 203279.3 XLOC_0847 chr9:99973695- - 4.7 2.22775 Antisense ENSG00000 RP11-498P14.5 XLOC_007 linc- . 26 100013887 871 203279.3 483 C9orf174 5 XLOC_0848 chr9:102567864- - 2.1 1.72994 LincRNA ENSG00000 RP11-554F20.1 XLOC_007 linc-ALG2- . 27 102574135 347 237461.1 808 5 8 XLOC_0850 chr9:115759145- - 3.4 2.63179 LincRNA ENSG00000 ZNF883 . . . 72 115774647 208 228623.2 5 XLOC_0851 chr9:118016154- - 0.9 5.42524 Antisense ENSG00000 RP11-445L6.3 . . . 51 118178107 102 234692.1 52 XLOC_0852 chr9:118402663- - 0.2 2.04231 LincRNA . . XLOC_007 linc- eRNA 35 118431095 741 533 PAPPA-2 63 XLOC_0852 chr9:120602610- - 0.1 1.68919 LincRNA ENSG00000 RP11-281A20.1 XLOC_007 linc- . 75 120605604 780 231901.1 537 CEP110- 86 15 XLOC_0853 chr9:123714543- - 7.9 4.78891 LincRNA . . . . . 08 123837171 498 3 XLOC_0855 chr9:139618805- - 3.1 2.86443 LincRNA ENSG00000 SNHG7 . . . 71 139622634 235 233016.2 3 XLOC_0856 chrUn_gl000218:46649- - 1.2 1.68198 LincRNA . . . . . 80 97434 319 3 XLOC_0857 chrUn_gl000219:51697- - 12. 9.98259 LincRNA . . . . . 33 99642 707 9 XLOC_0858 chrUn_gl000241:14838- - 17. 22.7865 LincRNA . . . . . 01 20767 388 XLOC_0858 chrUn_gl000241:22263- - 8.5 8.53115 LincRNA . . . . . 03 36882 982 7 XLOC_0860 chrX:23093701-23096498 + 39. 38.5606 Pseudoge ENSG00000 FAM3C2 . . . 04 956 ne 174028.6 2 XLOC_0860 chrX:30648241-30649098 + 2.5 1.89134 Pseudoge ENSG00000 FTLP2 . . . 38 967 ne 232368.1 4 XLOC_0861 chrX:45212810-45384096 + 2.4 2.36688 LincRNA ENSG00000 RP11-245M24.1 XLOC_007 linc- eRNA 07 848 229563.2 966 ZNF673-4 6 XLOC_0861 chrX:46359171-46408474 + 0.9 1.82308 Antisense ENSG00000 ZNF674-AS1 XLOC_007 linc-CHST7 . 37 716 230844.2 970 89 XLOC_0862 chrX:53123359-53200164 + 1.4 0.302868 LincRNA ENSG00000 RP11-236P24.3 XLOC_008 linc- . 27 098 234019.1 171 FAM156A- 1 XLOC_0864 chrX:56753678-56846325 + 6.4 5.6669 Pseudoge ENSG00000 UQCRBP1 . . . 48 651 ne 237748.1 7 XLOC_0865 chrX:64271211-64589035 + 2.9 3.05813 Pseudoge ENSG00000 CCT4P2 XLOC_008 linc- . 62 094 ne 225569.1 001 ZC3H12B- 9 1 XLOC_0867 chrX:73164154-73229819 + 7.1 6.89851 LincRNA ENSG00000 RP13-216E22.4 XLOC_008 linc- . 74 94 228906.1 186 NAP1L2-3 XLOC_0868 chrX:74743111-74824842 + 1.2 0.311043 Pseudoge ENSG00000 PCNPP4 . . . 23 636 ne 237089.2 7 XLOC_0872 chrX:102023833- + 2.6 1.71925 LincRNA ENSG00000 LINC00630 . . . 04 102025316 254 223546.2 7 XLOC_0872 chrX:102081667- + 1.3 1.00696 LincRNA . . XLOC_008 linc-BEX4 . 97 102438706 413 033 8 XLOC_0873 chrX:102081667- + 1.0 0 LincRNA . . XLOC_008 linc-BEX4 . 00 102438706 116 033 1 XLOC_0873 chrX:102659744- + 3.6 1.60161 LincRNA . . . . . 05 102754728 654 8 XLOC_0875 chrX:119802396- + 0.3 1.55699 LincRNA . . . . . 28 119852057 945 59 XLOC_0875 chrX:119868870- + 0.3 1.45772 LincRNA . . . . . 36 119873534 371 75 XLOC_0882 chrX:45598253-45632802 - 18. 27.9604 LincRNA ENSG00000 RP6-99M1.2 XLOC_008 linc- eRNA 09 593 270069.1 149 CXorf36-1 2 XLOC_0882 chrX:45659194-45666681 - 1.0 1.90185 LincRNA . . . . . 13 128 8 XLOC_0882 chrX:45673569-45710969 - 3.5 3.77219 LincRNA ENSG00000 RP5-1158E12.3 . . . 17 128 231566.1 4 XLOC_0883 chrX:56736141-56740785 - 0.1 1.90902 LincRNA . . . . . 88 541 49 XLOC_0885 chrX:62646398-62780975 - 7.6 4.78962 LincRNA . . XLOC_008 linc-SPIN4 . 34 923 174 XLOC_0886 chrX:70293193-70315602 - 7.0 0 LincRNA . . . . . 88 866 2 XLOC_0887 chrX:73040530-73063124 - 1.8 2.12314 LincRNA ENSG00000 XIST XLOC_008 linc- . 13 510 229807.5 015 ZCCHC13- 9 2 XLOC_0887 chrX:73371685-73382871 - 1.2 0.848348 LincRNA ENSG00000 RP13-216E22.4 . . . 55 132 228906.1 4 XLOC_0888 chrX:74956551-74966986 - 12. 8.39045 Pseudoge ENSG00000 TTC3P1 . . . 06 423 ne 215105.3 6 XLOC_0888 chrX:77785222-77914960 - 7.6 2.00721 LincRNA . . . . . 51 821 7 XLOC_0888 chrX:79544414-79565735 - 0.7 1.64948 Pseudoge ENSG00000 RP11-217H19.1 . . . 83 420 ne 215104.4 89 XLOC_0889 chrX:90669904-90673852 - 5.6 5.24215 Pseudoge ENSG00000 RP13-24G8.2 . . . 37 447 ne 236413.2 2 XLOC_0892 chrX:119371612- - 1.0 0.513717 LincRNA ENSG00000 GS1-421I3.4 XLOC_008 linc- . 34 119379061 176 228139.1 225 RHOXF1-4 3 XLOC_0892 chrX:124117144- - 1.3 1.0434 Pseudoge ENSG00000 RP1-161N10.1 . . . 79 124338220 453 ne 232599.1 6 XLOC_0894 chrX:128809663- - 1.0 0.273599 LincRNA . . XLOC_008 linc-APLN- . 67 128812329 671 233 1 1 XLOC_0896 chrX:153652728- - 4.8 4.23202 Pseudoge ENSG00000 BX936347.1 . . . 43 153656821 762 ne 197180.1 4 XLOC_0897 chrY:7142092-7245093 + 1.4 1.53364 Pseudoge ENSG00000 PRKY . . . 73 899 ne 099725.10 5 XLOC_0898 chrY:14774177-14972768 + 145 109.438 LincRNA ENSG00000 TTTY15 XLOC_008 linc- . 55 .11 233864.3 323 AMELY-6 3 XLOC_0899 chrY:21729211-21765735 + 6.7 5.46656 Pseudoge ENSG00000 TXLNG2P . . . 97 307 ne 131002.7 7 XLOC_0900 chrY:28810932-28819127 + 3.5 2.05932 LincRNA . . . . . 27 098 1 XLOC_0900 chrY:18750592-18751758 - 0.0 1.07095 LincRNA . . . . . 88 289 092 XLOC_0900 chrY:21034404-21239256 - 1.6 0.866387 LincRNA ENSG00000 TTTY14 XLOC_008 linc-HSFY2 . 89 273 176728.3 326 9 XLOC_0901 chrY:21034404-21239256 - 1.2 0.685891 LincRNA ENSG00000 TTTY14 XLOC_008 linc-HSFY2 . 10 534 176728.3 326 2 XLOC_0901 chrY:21034404-21239256 - 2.0 1.49612 LincRNA ENSG00000 TTTY14 XLOC_008 linc-HSFY2 . 56 335 176728.3 326 7 XLOC_0902 chrY:22628319-22631787 - 1.9 2.92555 LincRNA ENSG00000 TTTY10 . . . 36 811 229236.1 1 XLOC_0902 chrY:22669174-22689226 - 1.6 0.996615 LincRNA ENSG00000 TTTY10 XLOC_008 linc- . 48 479 229236.1 328 KDM5D-2 2</p>