FACULTAD DE CIENCIAS DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGÍA USO DEL PROBIÓTICO Shewanella putrefaciens Pdp11 EN EL CULTIVO DE Solea senegalensis: IMPLICACIONES SOBRE LA MICROBIOTA INTESTINAL SILVANA TERESA TAPIA PANIAGUA TESIS DOCTORAL 2015 Directores: Dr. Miguel Ángel Moriñigo Gutiérrez Ilustración: Cecilia Moreno Dra. María del Carmen Balebona Accino AUTOR: Silvana Teresa Tapia Paniagua http://orcid.org/0000-0002-3656-5009 EDITA: Publicaciones y Divulgación Científica. Universidad de Málaga Esta obra está bajo una licencia de Creative Commons Reconocimiento-NoComercial- SinObraDerivada 4.0 Internacional: Cualquier parte de esta obra se puede reproducir sin autorización pero con el reconocimiento y atribución de los autores. No se puede hacer uso comercial de la obra y no se puede alterar, transformar o hacer obras derivadas. http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/legalcode Esta Tesis Doctoral está depositada en el Repositorio Institucional de la Universidad de Málaga (RIUMA): riuma.uma.es FACULTAD DE CIENCIAS DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGÍA USO DEL PROBIÓTICO Shewanella putrefaciens Pdp11 EN EL CULTIVO DE Solea senegalensis: IMPLICACIONES SOBRE LA MICROBIOTA INTESTINAL Memoria presentada por Dña. Silvana Teresa Tapia Paniagua para optar al grado de doctora. Directores: Dr. Miguel Ángel Moriñigo Gutiérrez Dra. María del Carmen Balebona Accino Noviembre, 2015 FACULTAD DE CIENCIAS DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGÍA D. JUAN JOSÉ BORREGO GARCÍA, Catedrático de Microbiología y Director del Departamento de Microbiología de la Facultad de Ciencias de la Universidad de Málaga. INFORMA QUE: La Licenciada Dña. Silvana Teresa Tapia Paniagua ha realizado en los laboratorios de este Departamento el trabajo experimental conducente a la elaboración de la presente memoria de Tesis Doctoral. Y para que así conste, expido el presente informe, Noviembre, 2015 Fdo: Juan José Borrego García Esta Tesis ha sido realizada en el Departamento de Microbiología de la Universidad de Málaga, bajo la dirección de sus directores, el Dr. Miguel Ángel Moriñigo Gutiérrez, Catedrático de Microbiología de la Universidad de Málaga, y la Dra. Mª Carmen Balebona Accino, Profesora Titular de Microbiología de la Universidad de Málaga, que dan su conformidad a la Memoria de la Tesis titulada: “Uso del probiótico Shewanella putrefaciens Pdp11 en el cultivo de Solea senegalensis: implicaciones sobre la microbiota intestinal” presentada por la Doctoranda Dña. Silvana Teresa Tapia Paniagua para optar al Título de Doctora. Noviembre, 2015 Dr. Miguel Ángel Moriñigo Gutiérrez Dra. María del Carmen Balebona A mi madre, a Silvana, David y Eva AGRADECIMIENTOS Esta tesis no habría salido a la luz sin la inestimable ayuda de de personas que de una u otra manera han participado en ella directa o indirectamente. En primer lugar a mis directores Miguel Ángel Moriñigo y María del Carmen Balebona. Gracias por vuestro trabajo, por vuestro buen hacer, por la amabilidad, la paciencia y comprensión, por estar siempre ahí y hacer del laboratorio mi segunda casa. Estos agradecimientos son extensibles a Eduardo Martínez Manzanares, que hace ya casi 13 años que me llamó a su despacho para in- vitarme a formar parte de este maravilloso grupo y en el que espero me pueda quedar muchos más. Gracias al resto de componentes del Departamento. A su director D. Juan José Borrego por permitirme realizar la tesis y al resto de profesores (Antonio de Vicente, Mari Carmen Alonso, Dolores Castro, Francisco Cazorla, Alejandro Pérez y Esther García Rosado), así como a Carmen Vila y María Muñoz, por la ayuda prestada en todo momento. Mi agradecimiento también a la Dra. Inés García de la Banda y a la Dra. Carmen Lobo, ambas del Instituto Español de Oceanografía de Santander, por su colaboración, por su ayuda y por el trabajo mano a mano tan gratificante y enriquecedor que, pese a la distancia, no ha supuesto una barrera. Junto a ellas, gracias también a Dra. María José Prieto y al Dr. Juan Jurado, ambos de la Universidad de Córdoba. A la Dra. Mari Ángeles Esteban de la Universidad de Murcia que junto con su equipo se han llevado a cabo colaboraciones que han dado fruto publicaciones que tanto han enriquecido el trabajo. Gracias en especial a mi grupo. A todas las personas que me he cruzado en estos años y con los que he compartido ratos maravillosos que han protagonizado momentos muy especiales. Gracias a mis “maestros”, ya doctores desde hace años, que me iniciaron en el mundo de la microbiología: la Dra. Mariana Chabrillón, la Dra. Patricia Díaz Rosales y el Dr. Salvador Arijo. A aquellos que coincidimos en los comienzos pero que hace unos años que ya alcanzaron sus metas (Dra. Rosa Rico y Dr. Pablo Rosas), como aquellos que decidieron tomar otros rumbos (especialmente a Juanma León Rubio, Lucía Narváez y Beatriz Gil), y a aquellos que todavía están inmersos en ella (en especial a Jose Alberto Núñez, Milena Fumanal, Alberto Medina y Jesús Moriñigo). A todos ellos gracias, puesto que no siempre ha sido fácil tenerme de compañera, ni aguantar mi ritmo de trabajo ni mis despistes y, sin embargo, siempre he obtenido de ellos una gran ayuda. Gracias a mis amigas y compañeras de siempre que decidimos tomar el mismo camino y al acabar la carrera, nuestras vidas siguieron paralelas: Inmaculada de la Viuda, Diana Suarez Boomgard y Eli Tamayo. Gracias también los becarios de diversos departamentos por abrirme las puestas de vuestros laboratorios y conocimientos, en especial a los ya doctores Patricia Nobel, Brau- lio Gallardo, José Mariscal y Melissa Castillo del Departamento de Genética, así como a su técnico Pablo García por su incontable paciencia; al personal del Departamento de Biología Celular (es- pecialmente a Jose Melu y a las niñas del grupo), al de Ecología y al de Bioquímica. En especial a los compañeros del laboratorio 1 y 2 tanto a las generaciones pasadas como a las presentes, por estar siempre dispuestos a echarnos una mano (Guti, Nuria, Claudia, David, María, Nacho, Benji, Alejandro, Estefanía, Dani, Patricia…). 9 Me gustaría dedicar un párrafo aparte para agradecer toda la ayuda prestada por mi gran compañera, amiga, entrenadora, técnica de ordenadores, niñera… y un largo etcétera sin la cual estos últimos años de la tesis no habrían sido lo mismo. Muchísimas gracias Sara Vidal por tu apoyo, ánimos, comprensión y sinceridad que tanta falta me ha hecho en muchos momentos y que me la hayas prestado de forma tan sincera y desinteresada. Espero que todo lo que te he podido enseñar te sirva para hacerte este camino no siempre fácil, algo más sencillo y lleno de éxitos allí donde vayas. También al resto de amigos que sin pertenecer al ámbito científico han estado ahí y especial- mente a Juanma y Natalia por esas “veladas” en las que también era partícipe mi ordenador y a Ceci Moreno, gran ilustradora, por la maravillosa portada que me ha diseñado. No habría tesis suficiente para darle las gracias a mi familia. Especialmente a mis padres, porque de ellos he heredado las cualidades que me han capacitado llegar hasta aquí: la paciencia y capacidad de trabajo de mi padre y el esfuerzo y sacrificio de mi madre a la que especialmente la agradezco el haber conseguido que mis días “duren” más de 24 horas. Gracias por los ánimos y por haberlo hecho todo para que yo pudiera seguir con mi trabajo. Gracias también a mis hijos (Silvana, David y Eva), que han sabido entender que muchos días que su madre se quedaba en casa no era para jugar con ellos, otras muchas horas de más que he tenido que pasar fuera porque sabían que esto era también una pequeña parte de mi vida… y porque no han conocido otra ma- dre que no fuera “predoctora”. Gracias a mi hermana Ada, a mi cuñado Antonio y mis sobrinos (Inmaculada y Antonio Sedeño) que del mismo modo siempre han estado dispuestos con su ayuda a hacerme el camino más fácil. Por último, pero no por ello menos importante, gracias a mi marido Agustín, por haberme introducido en el maravilloso mundo del Análisis de Componentes Principa- les y del análisis multivariante (y en el de la Astronomía, estadística, simuladores de vuelo, música, videojuegos, marketing, y ahora espero que no, en el de los Cerambícidos…), por haber aceptado al ordenador como un componente más del matrimonio, por tus valiosos aportes a mi trabajo, que siempre son de gran ayuda, y por tu paciencia en los cambios a última hora. Muchas gracias a todos. 10 FINANCIACIÓN Los ensayos que constituyen esta Tesis han sido subvencionados a través de diferentes proyectos de la Junta Asesora de Cultivos Marinos (JACUMAR), Ministerio Español de Ciencia y Tecnología (AGL2005-07454-CO2-O2, AGL2008-05119-C02-02, AGL2010- 20052, AGL2011-30381-C03-02) y la Junta de Andalucía (AGR-1842). La Doctoranda ha sido becaria del plan de Formación de Profesorado Universitario (F.P.U.) del Ministerio de Educación, Cultura y Deporte durante el periodo 2008-2013. 11 PUBLICACIONES Los resultados obtenidos a partir de los objetivos planteados en esta Tesis Doctoral han dado origen o son parte de las siguientes publicaciones científicas. Objetivo 1 - Tapia-Paniagua ST, Díaz-Rosales P, García de la Banda I, Lobo C, Clavijo E, Bale- bona M.C, Moriñigo MA (2014). Modulation of certain liver fatty acids in Solea senegalen- sis is influenced by the dietary administration of probiotic microorganisms.Aquaculture , 424:234–238. - Tapia-Paniagua ST, Díaz-Rosales P, León-Rubio JM, García de La Banda I, Lobo C, Alarcón FJ, Chabrillón M, Mancera JM, Varela JL, Ruiz-Jarabo I, Arijo S, Martínez-Manzanares E, Balebona MC, Moriñigo MA (2012). Different effects of the use of the probi-otic Shewanella putrefaciens Pdp11 on the culture of Senegalese sole (Solea senegalensis, Kaup 1858). Aquaculture International, 20:1025-1039. - Tapia-Paniagua ST, Chabrillón M, Díaz-Rosales P, García de la Banda I, Lobo C, Balebona MC, Moriñigo MA (2010).