Terrestrial herbivorous mammals in a mosaic of Cerrado, Atlantic Forest and land-use changes Cyntia Cavalcante Santos 2019 Terrestrial herbivorous mammals in a mosaic of Cerrado, Atlantic Forest and land-use changes Cyntia Cavalcante Santos Tese apresentada como requisito para a obtenção do título de Doutor em Ecologia, pelo Programa de Pós-Graduação em Ecologia e Conservação, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul, Brasil, em Cotutela pela Universidade de Angers, França. Orientadores: Dr. Fabio de Oliveira Roque Dr. Olivier Pays Dr. Pierre-Cyril Renaud 2019 2 THESE DE DOCTORAT DE L'UNIVERSITE D'ANGERS COMUE UNIVERSITE BRETAGNE LOIRE ECOLE DOCTORALE N° 604 Sociétés, Temps, Territoires Spécialité : « (Environmment) » Par « Cyntia Cavalcante SANTOS » « Terrestrial herbivorous mammals in a mosaic of Cerrado, Atlantic Forest and land-use changes » Thèse présentée et soutenue à « Campo Grande, MS, Brazil », le « 05/06/2019 » Unité de recherche : Thèse N° : Composition du Jury : BALTZINGER, Christophe | Rapporteur DA SILVA PINTO JORGE, Maria Luisa | Examinateur FISCHER, Erich Arnold | Rapporteur LEANDRO DE SOUZA, Franco | Examinateur MORAES TOMAS, Walfrido | Examinateur PAYS-VOLARD, Olivier | Directeur RENAUD, Pierre-Cyril | Co-directeur ROQUE, Fabio de Oliviera | Co-directeur KEUROGHLIAN, Alexine | Membre invité 3 4 ACKNOWLEDGEMENTS À VIDA com tudo o que ela nos traz! Aos meus orientadores, Fabio de Oliveira Roque, Olivier Pays Volard and Pierre-Cyril Renaud, pelo apoio e tempo dedicado ao meu projeto (e à sua evolução! rs). Gratidão a cada um de vocês pelo privilégio de tê-los ao meu lado e por se tornarem meus conselheiros e amigos ao longo destes anos. Vocês me mostraram como ser uma profissional melhor. A vocês minha admiração por fortalecer a premissa de que ciência se faz com ética, respeito, muita paciência e coragem. Toda minha gratidão por me ensinar os caminhos para abrir minha mente, por me incentivarem a acreditar em mim mesma! Uma honra ter sido sua aluna! Ao Dr. Hervè Fritz e Dr. Jean Paul Metzger, membros do comitê externo de acompanhamento do projeto pela Universidade de Angers, França, que colaboraram e incentivaram meu progresso de forma profissional, ética e humana. Foram seus aportes (e muita paciência) durante as reuniões que contribuíram imensamente para a melhoria deste trabalho! Ao Dr. Jean Paul Metzger and Dr. Jacques Baudry, por compartilharem sua sabedoria sobre ecologia da paisagem e por seu tempo doado ao meu projeto, e pelo incentivo. Aos profissionais e amigos geniais, Damien Arvor, Maurício Silveira, Clement Harmange, Christophe Amiot Vera Pfarnnerstill e Francisco Valente-Neto, pela ajuda com o processamento de imagens, programação no R e análises estatísticas. Jamais teria avançado tanto sem as soluções que vocês encontraram para a análise dos dados. À CAPES, Fundect-MS e Capes-Cofecub pelas bolsas de estudos entre 2015 a 2018, essenciais para o desenvolvimento de tudo que fiz durante esses quatro anos. Ao Dr. Franco Leandro Souza e Dr. Olivier Pays, coordenadores do Projeto PELD Planalto da Bodoquena: redes de interações em longo prazo. Aos Programas de Pós-Graduação, PPGEC – UFMS e UMR 6554 LTGE-Angers que me deram suporte físico, logístico e recursos, e à estrutura que cada laboratório traz consigo, por meio dos seus coordenadores Erich Fischer, Rafael Guariento e Cyril Fleurant, e por sua equipe administrativa. Também sou grata à Rosilene Bejarano e Fabio Júnior, do PPGEC, os quais ocupei grande parte do tempo para resolver os problemas burocráticos desta aventura da cotutela. 5 Ao Oilson, Wellington, Fernanda, Sr. João, Jociney, e todos da equipe do campus UFMS-Bonito, que me ajudaram e acolheram durante os 18 meses entre idas e vindas. Ao Sandro, Fernando, Nayara, e aos funcionários e voluntários do ICMBio do PARNA Serra da Bodoquena pelo apoio logístico e planejamento, cedendo informações, material e os brigadistas para o campo. À Fundação Neotrópica, na pessoa do Dr. Nicholas Kaminski pelo apoio logístico em uma época crucial para meu trabalho de campo. Aos proprietários rurais, suas famílias e funcionários dos municípios de Jardim, Bonito e Bodoquena, que me receberam prontamente e que permitiram que eu desenvolvesse meu trabalho em suas fazendas. Grata pelas informações, boas conversas e refeições! Aos amig@s muito especiais, que ao longo dessa jornada deram muito para mim, me acolheram, me toleraram e me abraçaram! Em especial ao Caio Sant’Ana, Renata Rocha, Ricardo Koroiva & Vanessa, Alexine Keuroghlian, André Nunes, Ana Piovesan, Isabel Melo, José Ochoa-Quintero, Clarissa Araújo, Mauricio Silveira, Mayara Scur, Leonardo Avelino, Nina Finley. Ao Senhor Almir Mendes, nosso motorista de aventuras em campo, grande conhecedor das estradas e ‘acessos’ aos pontos de estudo! Não teria conseguido ter tanto sucesso sem sua eficiência e disposição. Gratidão pelas risadas e pelo trabalho com seriedade. Para minha turma de estagiári@s guerreir@s e dedicad@s no trabalho de campo, nos dias de sol e chuva, nas madrugadas, nas morrarias e sol à pino, entre armadilhas, transectos e sanduíches de atum, caminhadas exaustivas, banhos frios, mas sempre com corações quentinhos! Gratidão porque me ensinaram muito: Alexane, Amanda, Bruna, Caio, Débora, Fernanda, Gabriel, Guilli, Hudson, Joelma, Karine, Keilé, Kleyton, Luana, Mariane, Nina, Paula, Renata, Reny, Rita, Sean, Thais e Vera. À Hélène & Stephane, Frédérique & Pierre, Emmanuelle, Anne Laure & Olivier, Clement, Alexane, Mathilde Henault, Mathilde Stern, Julie Campagna, Anne-Caroline & Edouard, Beatriz, Julien, Sigrid Giffon, Carla & Damien. Vocês se tornaram amigos durante um ano excepcional de minha vida em Angers e Rennes, e hoje fazem parte de minha história! “Merci beaucoup pour tout les moments passés ensemble!” À minha família, fortaleza e suporte de bons e não tão bons momentos – meus pais Valdeci e Maria do Socorro, por me darem o que era necessário: a oportunidade de 6 estudar e de encontrar meus sonhos. Aos meus irmãos incríveis, Maysa e Jorge, por todo incentivo e apoio ao longo de nossas vidas. Pelas risadas, piadas e diálogos! Ao Kleyton e Yan, que chegaram depois, e que completam nossa família somando a tudo isso momentos especiais. À Álvaro José – meu Amado, seria necessário um capítulo inteiro nessa tese para agradecer o amigo e companheiro paciente e dedicado! Obrigada por ‘voar alto comigo!’ Gratidão à D. Ovandia e Zuleide que estiveram mais próximas de nós nessa jornada. Enfim, eu listaria muitas páginas com tantos amigos, colegas e familiares, dos quais precisei me afastar temporariamente, mas que sempre me incentivaram a continuar. Gratidão a todos e a tudo . Special acknowledgements to Support and Collaborators Alexine Keuroghlian - https://www.facebook.com/peccary.pecari Professor Dr. Rudi Ricardo Laps CAPES - http://www.capes.gov.br/ Capes/Cofecub - http://capes.gov.br/cooperacao-internacional/franca/cofecub CASEST - https://casest.hypotheses.org/ Fundação Neotrópica - https://www.fundacaoneotropica.org.br/ Fundect-MS - http://www.fundect.ms.gov.br/ Grupo Rio da Prata - https://www.riodaprata.eco.br/ RPPN Buraco das Araras - https://www.buracodasararas.com.br/ ICMBio Parque Nacional da Serra da Bodoquena http://www.icmbio.gov.br/portal/unidadesdeconservacao/biomas- brasileiros/cerrado/unidades-de-conservacao-cerrado/2082-parna-da-serra-da-bodoquena Projeto ‘Peld Planalto da Bodoquena: redes de interações ecológicas’ http://peldbodoquena.wixsite.com/home Région Pays de la Loire - http://www.paysdelaloire.fr/ UFMS campus Bonito - https://sedfor.ufms.br/bonito-ms/ UFMS – PPGEC - https://ppgec.ufms.br/ Université d’Angers, LETG – UMR6554 http://www.univ-angers.fr/fr/recherche/poles-et-unites/pole-ll-shs/letg-angers.html http://letg.cnrs.fr/ Aos proprietários rurais dos municípios de Jardim, Bonito e Bodoquena que me receberam, me hospedaram em suas terras e me deram muito do seu tempo. 7 Sumário PRESENTATION AND THESIS STRUCTURE ........................................................................ 14 References ........................................................................................................................... 19 CHAPTER I ................................................................................................................................. 22 GENERAL INTRODUCTION .................................................................................................... 22 Effect of land-use change on terrestrial mammals of the Cerrado: large knowledge deficits in a biodiversity hotspot .................................................................................................................. 22 Methods ............................................................................................................................... 24 Study region.......................................................................................................................... 24 Ecological characteristics of species and their responses to land-use change .................... 28 Results ................................................................................................................................. 30 Mammalian responses .......................................................................................................... 30 Discussion ............................................................................................................................ 36 References ..........................................................................................................................