BenoˆıtSimon-Bouhet Curriculum Vitæ

Coordonn´ees Etat´ Civil N´ele 12 f´evrier1978 `aPoitiers (86).

Adresse professionnelle Adresse personnelle LIENSS UMR 6250 CNRS-ULR Le Bonnodeau, Institut du Littoral et de l’Environnement Avenue du clavier, 2 rue Olympe de Gouges 17 140 Lagord - FRANCE 17 000 La Rochelle

T´el´ephone Fax M´el . Labo : (+33) 5 46 50 76 42 . (+33) 5 46 45 82 64 . [email protected]

Situation Actuelle Maˆıtrede Conf´erences`al’Universit´ede La Rochelle . Section : 68, Biologie des organismes. . Prise de fonctions : le 1er septembre 2007 . Laboratoire de rattachement : Littoral, Environnement et Soci´et´eS(UMR 6250, Universit´ede La Rochelle-CNRS).

Cursus Universitaire S´ejourpost-doctoral `al’universit´ede Berkeley 2006-2007 . Sujet de recherche : d´eveloppement d’un outil de simulation, d’aide `al’interpr´etationet de test de sc´enarios´evolutifs et d´emographiquescomplexes grˆace`ala th´eoriede la coalescence. . Cadre institutionnel : mise en place d’une collaboration entre le CRELA (UMR 6217, Universit´e de La Rochelle-CNRS-IFREMER) et le Montgomery Slatkin’s Research Group, Universit´ede Californie, Berkeley. . Financement : bourse post-doctorale du conseil g´en´eralde Charente-Maritime (17).

Doctorat sp´ecialit´eBiologie Evolutive´ et Ecologie´ 2002-2006 . Titre : Expansion d’aire et processus d’introductions biologiques en milieu marin : le cas de Cyclope neritea (Nassariidae) sur les cˆotesfran¸caises. . Date et lieu de soutenance : 4 juillet 2006 - Universit´ede La Rochelle (17). . Mention : tr`eshonorable avec les f´elicitationsdu jury1. . Financement : allocation de recherche minist´erielle(MENRT).

D.E.A. Exploitation Durable des Ecosyst`emesLittoraux´ 2002 . Date et lieu de soutenance : 3 juillet 2002 - Universit´ede La Rochelle (17). . Mention - Classement : tr`esbien - 1er/ 17.

1Composition du jury : Guy Bachelet (DR CNRS), Station Marine d’Arcachon (pr´esident), J´erˆomeGoudet (Pr. As- soci´e),Universit´ede Lausanne (rapporteur), Serge Gofas (Pr. MNHN), Universit´ede M´alaga(rapporteur), Fr´ed´erique Viard (CR1 CNRS, HDR), Station Biologique de Roscoff (directrice), Pascale Garcia (MCF, HDR), Universit´ede La Rochelle (co-directrice). . Stage de Recherche : statut des populations atlantiques fran¸caisesde Cyclope neritea (L.) : expan- sion ou introduction ?

MaˆıtriseBiologie des Populations et des Ecosyst`emes´ 2001 . Lieu : Universit´ede La Rochelle (17). . Mention - Classement : bien - 1er/ 91. . Stage de Recherche : ´etudede la dynamique du microphytobenthos sur les vasi`eresintertidales.

Licence Biologie des Organismes et des Populations 2000 . Lieu : Universit´ede La Rochelle (17). . Mention - Classement : assez bien - 6e/ 88.

D.E.U.G. Sciences de la Vie 1997-1999 . Lieu : Universit´ede Poitiers (86). . Mention - Classement : bien - 7e/ 250.

Classe Pr´eparatoireaux Grandes Ecoles´ d’Ing´enieurs 1996-1997 . Lieu : Lyc´eeCamille Gu´erin,Poitiers (86). . Sp´ecialit´e : Math´ematiques,Physique, Sciences de l’Ing´enieur.

Baccalaur´eatS´erieS 1996 . Lieu : Lyc´eePilote Innovant du Futuroscope, Poitiers (86). . Mention : bien.

Comp´etences Biologie Mol´eculaire . Techniques : de la strat´egied’´echantillonnage et l’organisation de campagnes de collecte, au g´enotypage multilocus. Extraction d’ADN, cr´eationd’amorces mitochondriales ou nucl´eairessp´eci- fiques, s´equen¸caged’ADN sur s´equenceur`acapillaire (e.g. ABI) et `a´electrophor`ese(e.g. Li-Cor). . . . Logiciels de G´en´etique : . Pr´eparationet Alignement de S´equences: Chromas, Bioedit, Clustal... . Statistiques Descriptives : Arlequin, DNAsp... . Phylog´eniesIntrasp´ecifiques: Mega, Phylip, Network, TCS . Analyses Multilocus : Genepop, Genetix, Fstat, hierFstat, Structure, Geneland, GeneClass... . Programmation (Simulations, Mod`elede Coalescence) : Delphi (Pascal), R Autres Comp´etencesen Informatique . Syst`emesd’Exploitation : Windows, LINUX (Mandriva, Ubuntu, Fedora), MacOS . Statistiques : plusieurs packages R, XLstats, Mathlab, Minitab, Statgraphics... . Bureautique :LATEX, Open Office, MS Office . Image : Adobe Photoshop et Illustrator, The Gimp, Flash... Langues . Fran¸cais : langue maternelle . Anglais : courant. Score TOEIC2 : 935/990 (mars 2006)

Publications Parues Facteur d’Impact compris entre 0,75 et 4,30. 1. Simon-Bouhet B., P. Garcia-Meunier & F. Viard (2006). Mitochondrial gene genealogies provide evidence for multiple geographical origins for Cyclope neritea (Nassaridae) popula- tions recently recorded in France. Molecular Ecology, 15 : 1699-1711

2Test Of English for International Communication 2. Simon-Bouhet B., C. Daguin, P. Garcia-Meunier & F. Viard (2005). Polymorphic microsa- tellites for the study of newly-established populations of the gastropod Cyclope neritea. Mole- cular Ecology Notes, 5 : 121-123 3. Bachelet G., B. Simon-Bouhet, C. Desclaux, P. Garcia-Meunier, G. Mairesse, X. de Mon- taudouin, H. Raign´e,K. Randriambao, P. Sauriau & F. Viard (2004). Invasion of the eastern coasts of the Bay of Biscay by the nassariid gastropod Cyclope neritea : origin and effects on resident fauna. Marine Ecology Progress Series, 276 : 147-159 4. Blanchard G. F., B. Simon-Bouhet & J.-M. Guarini (2002). Properties of the dynamics of intertidal microphytobenthic biomass. Journal of Marine Biology Association of the Uni- ted Kingdom, 82 : 4077/1-2

Publications Soumises et en Pr´eparation 1. Garcia-Meunier P., P.-Y. Pascal, V. Becquet & B. Simon-Bouhet. Invasion by the marine gastropod Ocinebrellus inornatus in France. IV : Is there a relationship with the low genetic diversity of the local drill, Ocenebra erinacea ? Submitted in Journal of Sea Research 2. Simon-Bouhet B., P. Garcia-Meunier & F. Viard. A fast PCR-based method to discriminate two close species of the genus Cyclope. Submitted in Journal of Molluscan Studies 3. Simon-Bouhet B., P. Garcia-Meunier, V. Becquet & F. Viard. Mitochondrial DNA not sui- table for phylogeographic studies ? A comparison between mitochondrial and microsatellite markers for the introduced nassariid Cyclope neritea. Submitted in Evolution 4. Simon-Bouhet B., P. Garcia-Meunier, V. Becquet & J. Pigeot. (In prep.) Distribution and statuts of Cyclope neritea (Gastropod nassariidae, L) populations near its range limit : pros- pection and sampling around the iberian peninsula. 5. Simon-Bouhet B., P. Garcia-Meunier & F. Viard. (In prep.) Microstructure of Cyclope ne- ritea (Gastropod nassariidae, L) : fine scale analysis of diversity patterns in native and invaded ranges. 6. Simon-Bouhet B. (In prep.) An R package implementing two neutrality tests (K -test and H -test) and a theoretical population simulation tool using coalescence reconstructions.

Rapports 1. Simon-Bouhet B. (2006). Expansion d’aire et processus d’introductions biologiques en mi- lieu marin : le cas de Cyclope neritea (Nassariidae) sur les cˆotesfran¸caises. Th`ese, 280pp 2. Simon-Bouhet B. (2002). Statut des populations atlantiques fran¸caisesde Cyclope neritea : expansion ou introduction ? Rapport de D.E.A., 69pp. 3. Simon-Bouhet B. (2001). Dynamique de biomasse de diatom´eesbenthiques au cours d’exon- dations diurnes. Rapport de Maˆıtrise, 12pp.

Congr`esInternationaux, S´eminaires 1. Simon-Bouhet B., P. Garcia, V. Becquet & F. Viard The genetic paradox of invaders : the example of a marine gastropod as a clue to understand the consequences of multiple introduc- tions. The Buffon Legacy (Dijon, France, September 2007) 2. Simon-Bouhet B. Range expansion and biological introductions in marine ecosystems : the example of Cyclope neritea (Nassariidae) along the French coasts. Statistics and Genomics Seminar (Berkeley, USA, March 2007) 3. Viricel A., P. Garcia-Meunier, P. Rosel, A. Strand, B. Simon-Bouhet & V. Ridoux. Mito- chondrial DNA analysis of a mass-stranded common dolphin (Delphinus delphis) group. 16th Biennial Conference on the Biology of Marine Mammals (San Diego, USA, December 2005) 4. Simon-Bouhet B., P. Garcia-Meunier & F. Viard. Mitochondrial gene genealogies provide evidence for multiple origins of the mollusk Cyclope neritea (Nassariidae) recently recorded in France. 4th International Congress of the European Malacological Societies (Napoli, Italy, October 2005) 5. Viricel A., B. Simon-Bouhet, V. Becquet Buren, V. Ridoux & P. Garcia-Meunier. Mitochon- drial DNA analysis of a mass-stranded common dolphin (Delphinus delphis). South-eastern ecology and evolution conference (Atlanta, USA, March 2004) 6. Simon-Bouhet B., P. Garcia-Meunier & F. Viard. Recurrent introductions and natural spread : two explanations for the actual distribution of the gastropod Cyclope neritea. 39th European Marine Biology Symposium (Genova, Italy, July 2004) 7. Bachelet G., C. Desclaux, P. Garcia-Meunier, X. de Montaudouin, P.-G. Sauriau, B. Simon- Bouhet & F. Viard. The nassarid gastropod Cyclope neritea, a recent invader in the Bay of Biscay : origin and consequences on biodiversity. 38th European Marine Biology Symposium (Aveiro, Portugal, Septembre 2003) 8. Simon-Bouhet B., P. Garcia-Meunier, A. Viricel & F. Viard. Origin of the French Atlantic populations of Cyclope neritea (L.) : introduction versus expansion. 3rd International Congress of the European Malacological Societies (La Rochelle, France, June 2003) 9. Viard F., L. Dupont, C. Martel, D. Mc Glashan, B. Simon-Bouhet, & P. Garcia-Meunier. A comparison analysis, based on molecular ecology and population genetics, of the invasion by three gastropods in areas of oysters cultivation. 3rd International Conference on Marine Bioinvasions (La Jolla, USA, March 2003)

Autres Activit´esde Recherche Reviewer pour des parutions internationales de rang A . Molecular Ecology. . Aquatic Ecology.

Exp´eriencesd’Enseignements Moniteur C.I.E.S.3 puis A.T.E.R.4 2002-2006 Plus de 350 heures de cours, Travaux Pratiques et Travaux Dirig´esont ´et´edispens´ees(voir le descrip- tif ci-dessous). Pr´eparationet pr´esentation de cours, supervision de travaux de groupe, pr´eparation, cr´eationet ´evaluation de devoirs `ala maison et de partiels, d’examens. . .

Niveaux D.E.U.G. et Licence G´en´etiquefondamentale haplo¨ıde 24 heures Probabilit´es,statistiques descriptives, distributions continues et discontinues 24 heures G´en´etiqueMend´eliennehaplo¨ıde et diplo¨ıde 54 heures Evolution´ du dimorphisme sexuel 36 heures Niveau Maˆıtrise Statistiques multivari´ees 67 heures G´en´etiquedes populations 30 heures Marqueurs mol´eculaireset dynamique des populations 110 heures Biologie ´evolutive 9 heures

Tuteur, D´epartement de Biologie Automne 2004 Tutorat, `ala biblioth`eque universitaire, pour des ´etudiants de premi`ereann´ee: utilisation des res- sources bibliographiques et des outils de recherche disponibles en ligne (inter or intranet, Medline,

3Centre d’Initiation `al’Enseignement Sup´erieur. 4Attach´eTemporaire d’Enseignement et de Recherche. Current Contents, Science direct, ASFA.. . ) `al’Universit´ede La Rochelle. 10 heures

Encadrement de stages 2003-2004 Pendant mon doctorat, j’ai supervis´eles stages de deux ´etudiants : 1. Un ´etudiant de D.E.A. (P.-Y. Pascal) travaillant sur “le rˆoledes esp`ecesmarine endog`enes dans le processus d’invasion d’esp`ecesmarines exog`enes”. 6 mois 2. Une ´etudiante de D.E.U.G. (M. Alain) travaillant sur “l’influence de la temp´eratureet de l’origine g´eographiquesur la fertilit´ede Cyclope neritea”. 1 an

R´ecompenses et Financements Bourse de Post-Doctorat 2006-2007 Financement d’un an attribu´epar le Conseil G´en´eralde Charente-Maritime. Young Investigator Award Octobre 2005 R´ecompense d´ecern´ee par les Soci´et´esEurop´eennesde Malacologie. Douze jeunes chercheurs ont ´et´e r´ecompens´espour la qualit´ede leur contribution orale lors du 4eCongr`esInternational des Soci´et´es Europ´eennesde Malacologie (Naples, Italie). Prix de la Soci´et´eFran¸caise de Malacologie Juin 2003 L’un des 7 b´en´eficiairesde ce prix r´ecompensant des jeunes chercheurs pour la qualit´ede leur pos- ter et de leur pr´esentation orale au cours du 3eCongr`esInternational des Soci´et´esEurop´eennes de Malacologie (La Rochelle, France). Bourse de Doctorat 2002-2005 Allocataire de Recherche du “Minist`erede l’Education´ Nationale, de l’Enseignement Sup´erieuret de la Recherche” (Bourse MENRT). Attribution sur crit`eres universitaires. Bourse de Moniteur 2002-2005 Financement de trois ans du “Minist`erede l’Education´ Nationale, de l’Enseignement Sup´erieuret de la Recherche” en tant que moniteur du Centre d’Initiation `al’Enseignement Sup´erieur(C.I.E.S.). Bourse de D.E.A. 2001-2002 Bourse au m´eritedu “Minist`erede l’Education´ Nationale, de l’Enseignement Sup´erieuret de la Re- cherche”. Attribution sur crit`eresuniversitaires.

Autres Qualifications et Activit´es Qualifications . Titulaire du permis B. . Niveau IV Capacitaire et Initiateur de plong´eede la F´ed´erationFran¸caised’Etudes´ et de Sports Sous Marins (F.F.E.S.S.M.). Equivalent au monitorat de plong´eeinternational premier degr´e(1* CMAS). . Plongeur Nitrox. . Dive Master PADI . Attestation de Formation aux Premiers Secours (A.F.P.S.) et habilitation oxyg´enoth´erapie.

Sports, Activit´es Nage avec palmes, plong´eesous-marine, plong´ee-sp´el´eologie,roller, ski, badminton, photographie. . .