Electronic Supplementary Material s45

Electronic supplementary material

Title of the article: Genetic structure and diversity analysis revealed by AFLP markers on different Glycyrrhiza glabra L. an endangered medicinal species from South of Iran and implications for conservation

Journal: Biochemical Genetics

Authors: Atieh Hakimi1ь, Maryam Zolfaghari1ь, Karim Sorkheh*2ь

1Department of Horticultural Sciences, Faculty of Agriculture, Shahid Chamran University of Ahvaz, P. O. Box. 61355/144, Iran

2Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Shahid Chamran University of Ahvaz, P. O. Box. 61355/144, Iran Supplementary Table S1. The Plant materials, species names and their geographical origin of Glycyrrhiza glabra L. accessions utilized within this study Longitude Species No Latitude N Origin Accession code E name . Glycyrrhiza glabra 48°, 24َ 11 32°, 22َ 55 Dezfol DEZ1 1 Dezfol Glycyrrhiza glabra DEZ2 48°, 24َ 11 32°, 22َ 55 2 Dezfol Glycyrrhiza glabra DEZ3 48°, 24َ 11 32°, 22َ 55 3 Dezfol Glycyrrhiza glabra DEZ4 48°, 24َ 11 32°, 22َ 55 4 Dezfol Glycyrrhiza glabra DEZ5 48°, 24َ 11 32°, 22َ 55 5 Dezfol Glycyrrhiza glabra DEZ6 48°, 24َ 11 32°, 22َ 55 6 Dezfol Glycyrrhiza glabra DEZ7 48°, 24َ 11 32°, 22َ 55 7 Dezfol Glycyrrhiza glabra DEZ8 48°, 24َ 11 32°, 22َ 55 8 Dezfol Glycyrrhiza glabra DEZ9 48°, 24َ 11 32°, 22َ 55 9 Dezfol Glycyrrhiza glabra DEZ10 48°, 24َ 11 32°, 22َ 55 10 Glycyrrhiza glabra 49°, 36َ 0 31°, 17َ 0 Ramhormoz RAMZ11 11 Ramhormoz Glycyrrhiza glabra RAMZ12 49°, 36َ 0 31°, 17َ 0 12 Ramhormoz Glycyrrhiza glabra RAMZ13 49°, 36َ 0 31°, 17َ 0 13 Ramhormoz Glycyrrhiza glabra RAMZ14 49°, 36َ 0 31°, 17َ 0 14 Ramhormoz Glycyrrhiza glabra RAMZ15 49°, 36َ 0 31°, 17َ 0 15 Ramhormoz Glycyrrhiza glabra RAMZ16 49°, 36َ 0 31°, 17َ 0 16 Ramhormoz Glycyrrhiza glabra RAMZ17 49°, 36َ 0 31°, 17َ 0 17 Ramhormoz Glycyrrhiza glabra RAMZ18 49°, 36َ 0 31°, 17َ 0 18 Ramhormoz Glycyrrhiza glabra RAMZ19 49°, 36َ 0 31°, 17َ 0 19 Ramhormoz Glycyrrhiza glabra RAMZ20 49°, 36َ 0 31°, 17َ 0 20 Glycyrrhiza glabra 48°, 41َ 0 31°, 19َ 0 Ahvaz AHZ21 21 Ahvaz Glycyrrhiza glabra AHZ22 48°, 41َ 0 31°, 19َ 0 22 Ahvaz Glycyrrhiza glabra AHZ23 48°, 41َ 0 31°, 19َ 0 23 Ahvaz Glycyrrhiza glabra AHZ24 48°, 41َ 0 31°, 19َ 0 24 Ahvaz Glycyrrhiza glabra AHZ25 48°, 41َ 0 31°, 19َ 0 25 Ahvaz Glycyrrhiza glabra AHZ26 48°, 41َ 0 31°, 19َ 0 26 Ahvaz Glycyrrhiza glabra AHZ27 48°, 41َ 0 31°, 19َ 0 27 Ahvaz Glycyrrhiza glabra AHZ28 48°, 41َ 0 31°, 19َ 0 28 Ahvaz Glycyrrhiza glabra AHZ29 48°, 41َ 0 31°, 19َ 0 29 Ahvaz Glycyrrhiza glabra AHZ30 48°, 41َ 0 31°, 19َ 0 30 Glycyrrhiza glabra 48°, 18َ 14 30°, 20َ 24 Abadan ABAD31 31 Abadan Glycyrrhiza glabra ABAD32 48°, 18َ 14 30°, 20َ 24 32 Abadan Glycyrrhiza glabra ABAD33 48°, 18َ 14 30°, 20َ 24 33 Abadan Glycyrrhiza glabra ABAD34 48°, 18َ 14 30°, 20َ 24 34 Abadan Glycyrrhiza glabra ABAD35 48°, 18َ 14 30°, 20َ 24 35 Abadan Glycyrrhiza glabra ABAD36 48°, 18َ 14 30°, 20َ 24 36 Abadan Glycyrrhiza glabra ABAD37 48°, 18َ 14 30°, 20َ 24 37 Abadan Glycyrrhiza glabra ABAD38 48°, 18َ 14 30°, 20َ 24 38 Abadan Glycyrrhiza glabra ABAD39 48°, 18َ 14 30°, 20َ 24 39 Abadan Glycyrrhiza glabra ABAD40 48°, 18َ 14 30°, 20َ 24 40 Glycyrrhiza glabra 48°, 11َ 8 30°, 25َ 39 Khoramshahr KHORAM41 41 Khoramshahr Glycyrrhiza glabra KHORAM42 48°, 11َ 8 30°, 25َ 39 42 Khoramshahr Glycyrrhiza glabra KHORAM43 48°, 11َ 8 30°, 25َ 39 43 Khoramshahr Glycyrrhiza glabra KHORAM44 48°, 11َ 8 30°, 25َ 39 44 Khoramshahr Glycyrrhiza glabra KHORAM45 48°, 11َ 8 30°, 25َ 39 45 Khoramshahr Glycyrrhiza glabra KHORAM46 48°, 11َ 8 30°, 25َ 39 46 Khoramshahr Glycyrrhiza glabra KHORAM47 48°, 11َ 8 30°, 25َ 39 47 Khoramshahr Glycyrrhiza glabra KHORAM48 48°, 11َ 8 30°, 25َ 39 48 Khoramshahr Glycyrrhiza glabra KHORAM49 48°, 11َ 8 30°, 25َ 39 49 Khoramshahr Glycyrrhiza glabra KHORAM50 48°, 11َ 8 30°, 25َ 39 50 Glycyrrhiza glabra 50°, 15َ 0 30°, 36َ 0 Behbahan BEHB51 51 Behbahan Glycyrrhiza glabra BEHB52 50°, 15َ 0 30°, 36َ 0 52 Behbahan Glycyrrhiza glabra BEHB53 50°, 15َ 0 30°, 36َ 0 53 Behbahan Glycyrrhiza glabra BEHB54 50°, 15َ 0 30°, 36َ 0 54 Behbahan Glycyrrhiza glabra BEHB55 50°, 15َ 0 30°, 36َ 0 55 Behbahan Glycyrrhiza glabra BEHB56 50°, 15َ 0 30°, 36َ 0 56 Behbahan Glycyrrhiza glabra BEHB57 50°, 15َ 0 30°, 36َ 0 57 Behbahan Glycyrrhiza glabra BEHB58 50°, 15َ 0 30°, 36َ 0 58 Behbahan Glycyrrhiza glabra BEHB59 50°, 15َ 0 30°, 36َ 0 59 Behbahan Glycyrrhiza glabra BEHB60 50°, 15َ 0 30°, 36َ 0 60 Glycyrrhiza glabra 48°, 15َ 0 32°, 12َ 0 Haftapeh HAFT61 61 Haftapeh Glycyrrhiza glabra HAFT62 48°, 15َ 0 32°, 12َ 0 62 Haftapeh Glycyrrhiza glabra HAFT63 48°, 15َ 0 32°, 12َ 0 63 Haftapeh Glycyrrhiza glabra HAFT64 48°, 15َ 0 32°, 12َ 0 64 Haftapeh Glycyrrhiza glabra HAFT65 48°, 15َ 0 32°, 12َ 0 65 Haftapeh Glycyrrhiza glabra HAFT66 48°, 15َ 0 32°, 12َ 0 66 Haftapeh Glycyrrhiza glabra HAFT67 48°, 15َ 0 32°, 12َ 0 67 Haftapeh Glycyrrhiza glabra HAFT68 48°, 15َ 0 32°, 12َ 0 68 Haftapeh Glycyrrhiza glabra HAFT69 48°, 15َ 0 32°, 12َ 0 69 Haftapeh Glycyrrhiza glabra HAFT70 48°, 15َ 0 32°, 12َ 0 70 Glycyrrhiza glabra 48°, 20َ 0 32°, 27َ 0 Andimeshk ANDM71 71 Andimeshk Glycyrrhiza glabra ANDM72 48°, 20َ 0 32°, 27َ 0 72 Andimeshk Glycyrrhiza glabra ANDM73 48°, 20َ 0 32°, 27َ 0 73 Andimeshk Glycyrrhiza glabra ANDM74 48°, 20َ 0 32°, 27َ 0 74 Andimeshk Glycyrrhiza glabra ANDM75 48°, 20َ 0 32°, 27َ 0 75 Andimeshk Glycyrrhiza glabra ANDM76 48°, 20َ 0 32°, 27َ 0 76 Andimeshk Glycyrrhiza glabra ANDM77 48°, 20َ 0 32°, 27َ 0 77 Andimeshk Glycyrrhiza glabra ANDM78 48°, 20َ 0 32°, 27َ 0 78 Andimeshk Glycyrrhiza glabra ANDM79 48°, 20َ 0 32°, 27َ 0 79 Andimeshk Glycyrrhiza glabra ANDM80 48°, 20َ 0 32°, 27َ 0 80 Glycyrrhiza glabra 48°, 51َ 0 32°, 30َ 0 Shoshtar SHOSHT81 81 Shoshtar Glycyrrhiza glabra SHOSHT82 48°, 51َ 0 32°, 30َ 0 82 Shoshtar Glycyrrhiza glabra SHOSHT83 48°, 51َ 0 32°, 30َ 0 83 Shoshtar Glycyrrhiza glabra SHOSHT84 48°, 51َ 0 32°, 30َ 0 84 Shoshtar Glycyrrhiza glabra SHOSHT85 48°, 51َ 0 32°, 30َ 0 85 Shoshtar Glycyrrhiza glabra SHOSHT86 48°, 51َ 0 32°, 30َ 0 86 Shoshtar Glycyrrhiza glabra SHOSHT87 48°, 51َ 0 32°, 30َ 0 87 Shoshtar Glycyrrhiza glabra SHOSHT88 48°, 51َ 0 32°, 30َ 0 88 Shoshtar Glycyrrhiza glabra SHOSHT89 48°, 51َ 0 32°, 30َ 0 89 Shoshtar Glycyrrhiza glabra SHOSHT90 48°, 51َ 0 32°, 30َ 0 90 Supplementary Table S2 Oligonucleotide adapter and primer names and sequences for (20 selective ampliﬁed fragment length polymorphism primer combinations (assay units

Sequence Name

GACGATGAGTCCTGAG-5َ MseI Adapter TACTCAGGACTCAT-5َ GACTGCGTAGGTGCA-5َ PstI Adapter GAGCATCTGACGCATCC-5َ GATGAGTCCTGAGTAA/N-3-َ 5َ MseI + 1 GACTGCGTAGGTGCAG/N-3-َ 5َ PstI + 1 GATGAGTCCTGAGTAA/CCT-3-َ 5َ MseI + 3-CCT GATGAGTCCTGAGTAA/GCA-3َ-5َ MseI + 3-GCA GATGAGTCCTGAGTAA/CGA-3َ-5َ MseI + 3-CGA GATGAGTCCTGAGTAA/GCT-3َ-5َ MseI + 3-GCT GATGAGTCCTGAGTAA/GTC-3َ-5َ MseI + 3-GTC GATGAGTCCTGAGTAA/GCC-3َ-5َ MseI + 3-GCC GATGAGTCCTGAGTAA/GAG-3َ-5َ MseI + 3-GAG GATGAGTCCTGAGTAA/CAA-3َ-5َ MseI + 3-CAA GATGAGTCCTGAGTAA/CAC-3َ-5َ MseI + 3-CAC GATGAGTCCTGAGTAA/CAG-3َ-5َ MseI + 3-CAG GACTGCGTAGGTGCAG/GCC-3َ-5َ PstI + 3-GCC GACTGCGTAGGTGCAG/GCA-3َ-5َ PstI + 3-GCA GACTGCGTAGGTGCAG/AGC-3َ-5َ PstI + 3-AGC GACTGCGTAGGTGCAG/GTT-3َ-5َ PstI + 3-GTT GACTGCGTAGGTGCAG/ACT-3َ-5َ PstI + 3-ACT GACTGCGTAGGTGCAG/AAC-3َ-5َ PstI + 3-AAC GACTGCGTAGGTGCAG/ACT-3َ-5َ PstI + 3-ACT GACTGCGTAGGTGCAG/ACG-3َ-5َ PstI + 3-ACG GACTGCGTAGGTGCAG/ACC-3َ-5َ PstI + 3-ACC GACTGCGTAGGTGCAG/GTA-3َ-5َ PstI + 3-GTA Supplementary Table S3 Eigen value, percentage of variability explained by each coordinate and accumulated variability for AFLP markers Accumulated variability % Eigen value Principal coordinate coordinate variability 24.74 24.74 22.27 1 47.44 22.69 20.42 2 52.18 4.74 4.26 3 55.08 2.89 2.60 4 57.93 2.85 2.56 5 60.08 2.14 1.93 6 61.99 1.90 1.71 7 63.77 1.78 1.60 8 65.17 1.39 1.25 9 66.37 1.19 1.07 10 67.55 1.18 1.06 11 68.69 1.13 1.02 12 69.73 1.03 0.93 13 70.75 1.02 0.91 14