Les Composés Phénoliques De La Vigne
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Université Bordeaux Segalen Année 2011 Thèse n° 1910 THÈSE pour le DOCTORAT DE L’UNIVERSITÉ BORDEAUX 2 Mention : Sciences, Technologie, Santé Option : Oenologie Présentée et soutenue publiquement Le 15 décembre 2011 Par Carole LAMBERT Née le 18 octobre 1985 à Saint Jean d’Angély Étude du rôle des stilbènes dans les défenses de la vigne contre les maladies du bois Membres du Jury M. C. Bertsch, Professeur à l’Université de Haute-Alsace ..................... Président Mme. M. Adrian, Professeur à l’Université de Bourgogne .................... Rapporteur Mme. F. Fontaine, Maître de conférences à l’Université de Reims ........ Rapporteur Mme. S. Cluzet, Maître de conférences à l’Université Bordeaux 2 ....... Examinateur M. J.M. Mérillon, Professeur à l’Université de Bordeaux 2 ................... Directeur de thèse Remerciements Ce travail a été initié en 2008 au Groupe d’Etude des Substances Végétales à Activité Biologique. Je remercie ceux qui m’ont confié ce sujet et qui l’ont guidé : M. Jean-Michel Mérillon et Mme Stéphanie Cluzet. Je tiens, par ces quelques mots, à leur témoigner ma sincère reconnaissance pour leur disponibilité, leur investissement et leurs encouragements bienveillants. Mes remerciements vont également à l’ensemble des membres du jury pour leur collaboration à l’examen de ce travail et leur participation à la soutenance. Mesdames Marielle Adrian de l’Université de Bourgogne et Florence Fontaine de l’Université de Reims ont accepté d’être rapporteurs et Monsieur Christophe Bertsch de l’Université de Haute-Alsace a présidé ce jury. L’intérêt que vous avez porté à ce travail a permis une discussion enrichissante. Trouvez ici l’expression de ma profonde reconnaissance. Ce travail n’aurait pu se faire sans les collaborations établies au cours de cette thèse. Je remercie, Agnès Destrac-Irvine, Jean-Pascal Goutouly, Isabelle Merlin et Eric Gomes de l’UMR EGFV ainsi que Marie-France Corio-Costet, Gwenaëlle Comont, et Sébastien Gambier de l’UMR SAVE. Agnès, Jean-Pascal, je vous remercie d’avoir relu le manuscrit. Merci également aux membres du GESVAB qui se sont investi dans cette thèse : Tristan Richard, Pierre Waffo-Téguo, Jonathan Bisson et Yorgos Papastamoulis. Votre implication dans ce travail a été décisive. Jonathan, bonne chance pour la fin de ta thèse. Je remercie particulièrement Gérard Fondeville et Antonio Palos-Pinto pour leur aide et leur bonne humeur . Cette thèse est aussi le fruit du travail des étudiants qui ont effectué leur stage au GESVAB : Sabrina Dutrey, Vanessa Chadeffaud, Sylvia Lucas et Ian Li-Kim-Kiook. Merci pour votre implication et votre sympathie. Merci à tous les membres actuels et anciens du GESVAB. Au-delà de l’expérience professionnelle, ces trois années ont été humainement riche. Cela aura été un vrai plaisir de partager la vie quotidienne avec vous. J’espère retrouver cette ambiance de travail dans le futur. Je fais un clin d’œil particulier à Merian Nassra. Nous avons commencé ce dur labeur ensemble et partagé des moments de complicité : ta sagesse aura éclairé nos conversations. Je te souhaite bonne chance pour la fin de ta thèse et pour la suite. Merci à Nadège Telef-Micouleau et Stéphanie Krisa pour m’avoir initiée respectivement à la zumba et au théâtre et pour les échanges sympathiques qui ont jalonnés ces trois ans. Je remercie les membres du laboratoire de Biochimie du Raisin de la Faculté d’Œnologie de Bordeaux qui en premier m’ont formée à la recherche : Laurence Gény pour m’avoir accueillie dans le laboratoire et Annie l’Hyvernay pour m’avoir appris à « maniper ». Je remercie tout particulièrement Séverine Gagné et Soizic Lacampagne. Soizic, Séverine, merci infiniment pour votre soutien et votre amitié. Vous êtes des exemples pour moi et j’espère que l’avenir vous sourira à la mesure de vos talents de chercheur ! Je salue également tous les membres de l’ISVV que j’ai côtoyé pendant mes années d’étude. Je réserve mes derniers remerciements à mes proches. A mes amis, Sabrina, Frodo et leur petit Axel, Rémi, Marion, Laurent et Nathalie. A mes parents qui m’ont permis de faire ces études dans des conditions idéales et m’ont toujours écoutée et soutenue.Un remerciement particulier à papa pour ta passion pour les cours de botanique. A ma sœur, son mari et leur petit garçon pour avoir égayé ma thèse de moments de bonheur. A mes grand-parents, mon oncle et ma tante pour les instants partagés (le scrabble, les blagues, l’appel de la forêt, les papotages…). A mon Ludo, puisses-tu me supporter encore longtemps, merci pour notre vie à deux. Sommaire INTRODUCTION ...................................................................................................................... 1 CHAPITRE 1 : Étude bibliographique ....................................................................................... 5 I. La vigne, sensible aux maladies cryptogamiques ............................................................... 5 I.1. Les maladies du bois de la vigne ................................................................................. 7 I.1.1. L’importance des maladies du bois en France ..................................................... 7 I.1.2. L’eutypiose ........................................................................................................... 9 I.1.3. Le syndrome de l’esca ........................................................................................ 10 I.1.4. Le Black Dead Arm ............................................................................................ 16 I.1.5. Facteurs influençant l’expression des symptômes de maladie du bois .............. 18 I.1.1. Méthodes de lutte ............................................................................................... 20 II. Mécanismes de défense de la vigne face aux champignons ............................................. 22 II.1. Les défenses passives/constitutives ........................................................................... 22 II.2. Les défenses actives ................................................................................................... 23 II.2.1. Les récepteurs ..................................................................................................... 24 II.2.2. Les éliciteurs ...................................................................................................... 25 II.3. La signalisation cellulaire .......................................................................................... 28 II.4. Les réponses de défense induites ............................................................................... 29 II.4.1. La synthèse de protéines PR ............................................................................... 29 II.4.2. La synthèse de phytoalexines ............................................................................. 31 II.4.3. Le renforcement pariétal .................................................................................... 31 II.4.4. La réponse hypersensible ................................................................................... 32 II.5. La résistance systémique ........................................................................................... 33 II.5.1. La résistance systémique acquise ....................................................................... 33 II.5.2. La résistance systémique induite ........................................................................ 34 III. Les composés phénoliques de la vigne ............................................................................. 34 III.1. La biosynthèse des composés phénoliques ............................................................ 35 III.2. Les flavonoïdes ...................................................................................................... 37 III.2.1. Les anthocyanes .............................................................................................. 37 III.2.2. Les flavanols et les tanins ............................................................................... 38 III.2.3. Les flavonols ................................................................................................... 39 III.3. Les non flavonoïdes ............................................................................................... 40 III.3.1. Les acides phénols .......................................................................................... 40 III.3.2. Les stilbènes ................................................................................................... 41 III.4. Les stilbènes, phytoalexines de la vigne ................................................................ 44 III.4.1. Activité antifongique des stilbènes ................................................................. 44 III.4.2. Induction des stilbènes et résistance ............................................................... 45 III.4.3. Effet toxique des stilbènes : mode d’action .................................................... 46 III.4.4. Détoxification des stilbènes par les champignons .......................................... 47 IV. Mécanismes de défenses et maladies vasculaires : cas de la vigne .................................. 48 IV.1. Les mécanismes de défense dans le bois ............................................................... 48 IV.1.1. Le CODIT ....................................................................................................... 48 IV.1.2. Le modèle « zone de réaction » ...................................................................... 50 IV.1.3.