D13808F · ISSN 0947-0867 www.biospektrum.de BIO spektrum Das Magazin für Biowissenschaften
2011Sonderausgabe
Tagungsband zur VAAM-Jahrestagung 2011 Karlsruhe, 3.–6. April 2011 10.003 sign-berlin.de LightMix requires alicense. requires RocheLtd.Useofthesemethods owned byRocheMolecularSystems,Inc.and F. Hoffmann-La bypatents covered detectionare Roche. Homogenousamplificationmethods withreal-time This LightMix Molecular Systems, Inc. and F. Hoffmann-La Roche Ltd. Use of these methods requires alicense. RocheLtd. Useofthese methods requires Molecular Systems, Inc.and F. Hoffmann-La This LightMix Fax +1(877)696-5456 Tel. +1(877)696-5446 Adelphia, NJ07710 PO Box190 USA 009-6Kps' acm HV8HHV-8 HHV-4 HHV-8 HHV-5 HHV-6 Kaposi'ssarcoma 40-0198-16 HHV-6A/B Roseolovirus HHV-3 EBV HHV-1/2/3 40-0282-16 CMV Cytomegalovirus HSV+VZV 40-0562-16 virus Epstein-Barr HHV-1/2 40-0186-16 DuplexHSV+VZV VZV 40-0358-16 Varicella zostervirus HSV-1/2 40-0211-16 Herpessimplexvirus 40-0378-16 TIB MOLBIOLLLC ® ® kit is sold under license from RocheDiagnostics.LightCycler kit issoldunder licensefrom kit is sold under license from RocheDiagnostics.LightCycler kit issoldunderlicensefrom ® a 4 07879 9499 Fax +4930 Tel. +4930 78799455 D-12103 Berlin 22–23 Eresburgstraße DEUTSCHLAND Kits - I OBO GmbH MOLBIOL TIB ® is a trademark from Roche. Homogenous amplification methods with real-time detection are covered bypatents ownedbyRoche covered detection are Roche.Homogenous amplification methodswithreal-time is atrademark from ® is atrademarkfrom Herpes VirusDetection herpes virus affecting human beings. affecting herpes virus transplantations. We offer LightMix transplantations. We offer asinorgan but canbecriticalincasesofimmunesupression fatal inhealthyindividuals, usuallynot Infections are atanytime. reactivate inthebodyandmay remains long infections.Thevirus their abilitytoestablishlife- knownfor are Herpes viruses Fax +39010362 1938 Tel. +39010 3628388 I-16132 Genova RosannaBenzi,10 Largo ITALIA TIB MOLBIOLs.r.l. Fax +3491344 6670 Tel. +3491 3446642 E-28050 Madrid Fuencarral Calle IsabelColbrand10,Nave130 ESPAÑA ® detection Kitsforevery TIB MOLBIOLsl 3
Vereinigung für Allgemeine und Angewandte Mikrobiologie (VAAM) Tagungsband zur VAAM-Jahrestagung 2011 3. bis 6. April in Karlsruhe
Conference President: Reinhard Fischer
Scientific Committee: Karlsruhe Institute of Technology (Campus South): Reinhard Fischer, Natalia Requena, Jörg Kämper, Christoph Syldatk, Tilman Lamparter, Josef Winter, Clemens Posten; Karlsruhe Institute of Technology (Campus North): Ursula Obst; Max Rubner Institute: Rolf Geisen; BASF SE: Claus Bollschweiler, Marvin Karos, Oskar Zelder; nadicom GmbH: Bernhard Nüßlein
3 Inhalt 263 Author index 4 Welcome address of the President of the Karlsruhe 275 Personalia aus der Mikrobiologie 2010 Institute of Technology (KIT) 277 Promotionen 2010 Horst Hippler 282 Impressum 4 Greeting of the President of the VAAM Axel Brakhage 6 Welcome address of the Organizing committee 8 General Information 11 Sponsors and Exhibitors of the Annual Meeting of the VAAM 14 Einladung zur Mitgliederversammlung der VAAM 14 Industrial Symposium 14 Karrieresymposium 16 Aus den Fachgruppen 22 Institutsportraits 25 Conference Programme Overview 28 Conference Programme 31 Mini-Symposia of the Special Groups of the VAAM 35 Short Lectures
44 Abstracts Oral Presentations/Postersessions 44 Invited Speaker ISV 50/52 Anaerobic metabolism AMV/AMP 63/65 Archaea ARV/ARP 69/73 Cell biology CBV/CBP 82/90 Environmental microbiology EMV/EMP 121/127 Fungal biology and FBV/FBP biotechnology 136/137 Functional genomics FGV/FGP 142/144 Food microbiology FMV/FMP 149/154 Green and white biotechnology GWV/GWP 168/171 Microbial diversity MDV/MDP Zum Titelbild: 177/182 Microbial pathogens and MPV/MPP pathogenicity Der filamentöse Pilz Aspergillus niger wird zur Phytaseproduktion ein- 198/199 New techniques in microbiology NTV/NTP gesetzt. Das linke Bild zeigt eine Myzelflocke. Das rechte Bild zeigt 204/207 Open topics OTV/OTP Lactobacillus paracasei und Streptococcus mutans. Das probiotische 220 Physiology PSV/PSP Bakterium soll zum Kariesschutz eingesetzt werden (pro-t-action™). 228/229 Regulation RGV/RGP L. paracasei verklumpt mit S. mutans so dass die Bakterien leicht aus 241 Systems biology SBP dem Mund gespült werden können. 243/245 Symbiotic interactions SIV/SIP Das Karlsruher Schloss (unten) ist das Zentrum des Karlsruher Fächers. Karlsruhe wurde am 17. Juni 1715 von Markgraf Karl Wilhelm 250/254 Stress responses SRV/SRP von Baden-Durlach an der Stelle gegründet, an der er der Sage nach bei der Jagd geschlafen und von seiner neuen Stadt geträumt hatte, daher der Name - Karlsruhe. Das Zentrum bildet das klassizistische Residenzschloss, zu dem strahlenförmig 32 Straßen führen.
BIOspektrum | Tagungsband 2011 4 WELCOME ADDRESS
Welcome address of the President of the Karlsruhe Institute of Technology (KIT)
ó On behalf of the Karlsruhe about 8.700 administrative employees and bring the cream of the crop together for out- Institute of Technology I am about 384 Professors KIT is now one of the standing research goals. Therefore we are delighted to welcome you to largest research and education centers in honored to welcome every single participant the Annual Conference of the Europe and it is well equipped to tackle all of the VAAM 2011 at Karlsruhe. This annual Association for General and kinds of scientific problems. conference provides insights into the latest Applied Microbiology – the KIT research is primarily based on the capa- developments of General and Applied Micro- VAAM 2011. cities and knowledge of the scientists. In 157 biology and gives the chance for the interna- In the last five years the appearance of institutes – thereof 27 Helmholtz-institutes – tional research community to amplify their Karlsruhe in the international educational our scientists work in an excellent and world- knowledge. In this spirit we wish you inter- landscape has changed dramatically. After wide unique scientific infrastructure. This esting and fruitful discussions. Enjoy your three years of preparation, on October 1st gives us the opportunity to cooperate on com- stay! ó 2009, the state Technical University Karlsru- pletely new levels with other research cen- he, Fridericiana, and the federal Research ters, universities and industry partners. At Center Karlsruhe, became one legal unity. KIT research, teaching and innovation are lin- This newly created institution is a complete ked closely. We see our strength in the con- novelty in the German science system where nection between people, infrastructure and state and federation have very different sove- know-how. reign rights. Two strong and equal partners The work of every single scientist at KIT have merged by creating an organization contributes to the KIT idea – to create new Prof. Dr. Horst Hippler which has the potential to influence and chan- possibilities for research; to cooperate on new President of the Karlsruhe Institute ge the research community profoundly. With levels with scientists all over the world; to of Technology
Greeting of the President of the VAAM to the Annual Meeting 2011
ó Dear Microbiologists, tists have been recruited to present their com GmbH and the BASF SE, as well as the the VAAM is committed to recent data in plenary talks. These plenary many assistants for their great effort in promote both fundamental sessions will also include overviews of the preparing this interesting meeting. I am real- and applied microbiological current state of the art in various aspects of ly pleased about the offer of child care during research and, as a result, microbiology. As president of the VAAM, I the program, that will allow parents with has established considerable am particularly glad that the meeting attracts young children to attend the VAAM meeting. contacts with companies. so many junior members, who will be offered I would also like to express my gratitude to all This connection is mirrored by the annual the possibility to present their work. participants, whose scientific contributions meeting, this year to be held in Karlsruhe In addition, the meeting will host the tra- are essential for the success of such a meet- and organised by scientists of both the Karls- ditional career symposia, to highlight career ing. I am sure that the meeting in Karlsruhe ruher Institute of Technology and the BASF paths and encourage professional develop- will be of the highest scientific quality and SE. This inter-disciplinary environment is ment. will also give the opportunity for enjoyable also emphasised by the research areas cov- I would also like to invite you to the general scientific exchange and interactions. ó ered this year. These topics include cell biol- assembly of VAAM members, where we will ogy, environmental microbiology, food micro- elect a new executive board and new honorary biology, microbial interactions, stress members will be proposed and elected. Here, response and white biotechnology. This very the presentation of awards and PhD lectures interesting program reflects our success in will take place. attracting both national and international sci- On behalf of the VAAM, I would like to entists. Because the VAAM now has more thank the president of the meeting, Reinhard than 3300 members, we expect more than Fischer, all the members of the organizing 1000 participants to attend the annual meet- committee of the Karlsruher Institute of Tech- Prof. Dr. Axel Brakhage ing in Karlsruhe. World-wide leading scien- nology, the Max Rubner Institute, the nadi- President of the VAAM
BIOspektrum | Tagungsband 2011 5
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Welcome address of the organizing committee
ó It is a great pleasure for scientific society, we continuously rely on the opportunity to experience the city beyond us to welcome you to the excellent students who are fascinated by the science. If you have one or two extra days of annual meeting of the VAAM microbial world, and we do hope that this time, you can travel around Karlsruhe: with- at the Karlsruhe Institute of meeting in Karlsruhe will help to stimulate in a few minutes you can cross the Rhine and Technology (KIT). More than their enthusiasm. be in France; or Strasbourg and the beautiful 900 abstracts from all fields The entire meeting will be held without dis- wine villages in Alsace or Pfalz are only one of microbiology have been traction in the same building, at the hour away. submitted and promise a very interesting and Stadthalle, which will allow direct interaction We will do our best to organize a most fruitful meeting. The topics of the main ses- with all participants during the breaks interesting and enjoyable meeting in Karls- sions reflect the broad microbiological between sessions. Posters will be located in ruhe! ó research interests in Germany and are rep- the break area, and thus will attract the most resented by leading national and international attention of the participants. Reinhard Fischer, Jörg Kämper, scientists of the field of microbiology. In addi- The location of the Stadthalle, in the center Tilman Lamparter, Clemens Posten, tion to the plenary sessions, a large number of Karlsruhe, is within walking distance of Natalia Requena, Christoph Syldatk, of concurrent sessions have been set up, the castle, KIT’s South Campus, the city’s Josef Winter, Ursula Obst, Rolf Geisen, where primarily young scientists will be pedestrian area and the large and modern Claus Bollschweiler, Marvin Karos, encouraged to highlight their results. As a shopping center Ettlinger Tor, which offers Oskar Zelder, Bernhard Nüßlein
The Karlsruhe Institute of Technology (KIT) con- sists of Campus South (formerly University of Karlsruhe) and Campus North (formerly Research Center Karlsruhe) (right). Whereas Campus South is located in the gardens of the castle, Campus North lies about 10 km north of the city. 1, Presidential Office; 2, Future building for Bio- logical Sciences (currently under renovation); 3, Engler Bunte Institute; 4, Organic Chemistry; 5, Inorganic Chemistry; 6, Physics; 7, Institute for Functional Interfaces. The Max Rubner Institute is located in the east part of the city, just 5 minutes away from Campus South.
BIOspektrum | Tagungsband 2011 Durchflusszytometrie | Zellanalytik | Diagnostik
Durchflusszytometrie | Zellsortierung ALLGEMEIN
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Diagnostik für HIV / TB / Malaria Reagenzien / Kits & Zubehör
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Kontakt Partec GmbH | Am Flugplatz 13 | D-02828 Görlitz | Deutschland | Fon +49 3581 8746-0 | Fax +49 3581 8746-70 | [email protected] | www.partec.com 8 GENERAL INFORMATION
General Information Annual Conference 2011 of the VAAM
Venue From motorway A65 www.vaam2011.de. Registrations after this date Stadthalle Karlsruhe The A65 turns into the B10. Continue on the are possible only on-site. Beside cash payments Festplatz 9 B10. Take exit 2 and continue towards the we also accept credit cards at the conference 76137 Karlsruhe congress centre (Kongresszentrum). reception desk (Master/ Euro, VISA, American Germany Address for navigation systems: Kongress- Express and JBC) as well as EC-Cards. zentrum, Festplatz 9, Karlsruhe. Address for correspondence Mixer Conventus Congressmanagement & Car park The Mixer will take place on Tuesday, 05 April Marketing GmbH There is space for approximately 1,000 vehi- 2011 at 19:30 at the “Weinbrenner-Saal” at Isabelle Lärz/Martin Singer cles in the underground parking at the con- the Main Floor in the Stadthalle Karlsruhe. Carl-Pulfrich-Straße 1 gress centre. Accompanying persons may purchase a 07745 Jena, Germany Address for navigation systems: Park ticket for the mixer at the conference reception Phone +49 (0)3641 311 63 -20/-10 House 1 – Hermann-Billing-Straße 1, Karls- desk. Fax +49 (0)3641 311 62 41 ruhe; Park House 2 – Beiertheimer Allee 9, www.vaam2011.de Karlsruhe. Posters [email protected] Posters are to be presented in English and in Hotel reservation the format DIN A0 (84.1 cm × 118.9 cm, Opening hours We have reserved a contingent of rooms at unlaminated). Authors are asked to attach to Sunday 03.04.2011 14:30 – 19:30 special rates in Karlsruhe. Please find the the posters the time when they will be avail- Monday 04.04.2011 07:30 – 19:00 reservation fax on our conference homepage able for discussion. The posters will have to be Tuesday 05.04.2011 07:30 – 19:00 www.vaam2011.de. fixed by pins. Materials will be provided. Wednesday 06.04.2011 08:00 – 12:00 Hotel rooms may also be looked through: The posters may be hung from 14:00 on www.karlsruhe.de Sunday, 03.04.2011 and should be removed Travelling to Karlsruhe before 12:00 on Wednesday, 06.04.2011. By train Registration and conference fees The poster sessions will be held on: Karlsruhe is a hub for ICE, InterCity, EuroCity Online registration is possible till 28 March • Monday, 04.04.2011, 15:15 – 17:30 and InterRegio connections and is located 2011 through the conference homepage • Tuesday, 05.04.2011, 15:30 – 17:30 directly on the ICE route from Hamburg to Basel through Frankfurt. The west-east route, from Karlsruhe to Munich through Stuttgart, Registration fees (all days) begins here. It takes about 3 hours with a TGV VAAM-Members train from Paris to arrive in Karlsruhe. N The congress centre is in walking distance Regular 170 N (10 min) from the main station. Student* 85
By public transport in Karlsruhe Non-members You can take tram S1, S4, S11, and 2 from the Regular 240 N main station to the tram stop “Kongresszen- Student* 110 N trum.” From the city centre, take any of the same trams to the tram stop “Kongresszen- Fee for day tickets (Monday, Tuesday, Wednesday) trum” or tram 5 to the tram stop “Kon- Member 90 N zerthaus”. Non-member 115 N Student member 40 N From motorway A5/A8 Student non-member 70 N From the A8 from Stuttgart continue onto the A5 toward Frankfurt. Take exit 45 “Karlsruhe- * Please provide confirmation and quote VAAM 2011 as the reference. Mitte” and continue on the B10. Follow the sign-posting to Karlsruhe. From the B10, take Social programme exit 2 towards the city centre and follow the Welcome reception** (03 April 2011) included signs to the congress centre (Kongresszen- Mixer** (05 April) included trum). Address for navigation systems: Kon- ** Registration required. gresszentrum, Festplatz 9, Karlsruhe.
BIOspektrum | Tagungsband 2011 9
Presentation of the Honory located at our media check-in to check their tact your chair person before your session Award, PhD Awards, and Poster presentations in advance. begins and advise of any changes or special Prizes Please submit your presentation in at least wishes. The presentation of the Honory Award will 120 minutes before your lecture will start. take place on 04.04.2011 at 11:00. You are asked to clearly label your CD/mem- Presentation Form and Submission of The presentation of the PhD Thesis prizes ory stick and the file with your short lecture Presentation will take place on 05.04.2011 at 18:30. code number and the name of the person giv- PDF and PowerPoint presentations are per- The presentation of the Poster Prizes will ing the talk. All presentations will be loaded mitted. Open Office formats may also be used. take place on 06.04.2011 at 11:30. onto our computers and will be deleted after Required technical equipment will be avail- All awards will be presented in Brahms- the talks. able at the congress. Please make sure that Saal, Stadthalle. any required CODEC files for any videos are General Tips for Authors and also submitted. Short lectures Presenters The use of Macintosch or Open Office for- The length of short lectures has been fixed at Presentation Submission mats as well as the use of a personal laptop for 10 minutes plus 5 minutes for discussion. Due Follow the signs or ask at the check-in desk a presentation is not planned, but possible. to the fact that there will be up to 7–8 paral- how to find the media check-in. If necessary, please contact us by 23 March lel sessions please adhere to the total time of 2011 at [email protected]. 15 minutes per presentation. Time Allotment For video and audio files please submit Short lectures are to be held in English. To ensure smooth running of the entire AVI, WMV and MPG files only as a separate Data projectors are available in each of the programme, all speakers are encouraged file. lecture halls. In each lecture hall there will be to adhere to their allocated speaking time. Please note: If you use a USB stick to an assistant for technical support. We ask all The chair persons of the sessions are save your files, do not protect it with soft- lectures to make use of the computer facilities urged to cancel discussions in delay. Con- ware.
Bars und Restaurants
BIOspektrum | Tagungsband 2011
10 GENERAL INFORMATION L0SCHI p b p Flehingen
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S5 nach Heidelberg (S-Bahn Rhein-Neckar) S4 nach Öhringen
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p Turmberg Oberausstr. Spielberg b p Langensteinbach St. Barbara
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Schlossplatz S11 R91, S3 nach Heidelberg Karlsdorf Bf. Grötzingen Langensteinbach Bf. b ü Bildungszentrum Bruchsal Gewerbliches
Friedrichschule 1 ü 8
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Blankenloch Tolna-Platz 2 j Friedrichstal Mitte Friedrichstal Blankenloch Kirche Blankenloch Blankenloch Süd Blankenloch Spöck Hochhaus Nord Friedrichstal Blankenloch Nord Blankenloch Mühlenweg Blankenloch w Reitschulschlag Büchig Spöck Richard-Hecht-Schule Friedrichstal Saint-Riquier-Platz Friedrichstal S2 j
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Fächerbad R92 R2 1 4 5 2
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Baumeisterstr. R43 nach Offenburg R74 nach Stuttgart S41 nach Eutingen i. Gäu
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Schloss Rüppurr 2 5 3 6 2 Herrenstr.
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Konzerthaus Klosterreichenbach Neureut-Heide str.
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p p b 2E Durmersheim Bf. (Schwarzwald) Forbach b j Rheinsheim b p Muggensturm q
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S41 R4 S31 j S41 p
Bietigheim b S31 S32 Gausbach
b 5
p S4
Ötigheim p
p Langenbrand Yorckstr. b
j
Städtisches Klinikum/ Moltkestr. Hochstetten Hochstetten Altenheim Hochstetten Grenzstr. Schulzentrum Linkenheim Rathaus Linkenheim Friedrichstr. Linkenheim Süd Linkenheim Str. Leopoldshafen Frankfurter Leopoldshafen Leopoldstr. Leopoldshafen Viermorgen Eggenstein Schweriner Str. Eggenstein Spöcker Weg Eggenstein Bf. Eggenstein Süd Kirchfeld Adolf-Ehrmann-Bad Bärenweg Str. Welschneureuter Haus Bethlehem Kurt-Schumacher-Str. August-Bebel-Str. Knielinger Allee S11 S1 S11 S1 1S11 S1
S1 b
Landesbau- sparkasse 1
Au im Murgtal im Au 2E Sophienstr. b Europahalle/ Europabad p j p
b j b Gaggenau Mercedes-Benz Werk Rastatt Beinle
p b p p p Gaggenau Bf. Kuppenheim b Bischweier Bad Rotenfels Schloss Bad Rotenfels Bf./Rotherma Bad Rotenfels Weinbrennerstr. Bannwaldallee
b
ü S41 R9 R92 R9 Hübschstr. p S31 p p b Weinbrennerplatz b
ü 2E Händelstr. b p j j p b p b 6 S2 Hardecksiedlung Hörden
Kühler Krug
Merkur- bergbahn S5 S52 Ottenau Siemensallee
Oberreut S4 b Rastatt Bf.
Obertsrot
Philippstr. Albert-Braun-Str. Hertzstr. S32 Hilpertsau p
Kußmaulstr. Lassallestr. R4 p ü 5 Weisenbach 1 p Mühlburger Feld p Siemensallee Gernsbach Bf. b Oberreut Zentrum l p Badeniaplatz j S51 ü 2E
2 R51 Rastatt KA-West
Gernsbach Mitte b b Entenfang k p b (verkehrt nur zu be- (verkehrt Feierabendweg p b h Neureuter Str. Wilhelm-Leuschner-Str. Haueneberstein 1 stimmten Veranstaltungen) e Baden-Baden ü b b p p f ü b S5 S525 ü Germersheim Lameyplatz )
p R92, S3 nach Speyer b
Sinzheim Nord R92 Bühl Rebland p
Germersheim Mitte/Rhein Sinzheim Bf. S3 Starckstr. b d p
b Germersheim Süd/Nolte 6
b Mühlburg West S2 Bühl
b
Sondernheim S52 Achern R4 nach Offenburg R44 nach Ottenhöfen Siemens p Baden-Baden p
Bellheim Am Mühlbuckel S51 r Herweghstr. S52 ü Bellheim Bf. r Eggensteiner Str. Wörth Achern
Lingenfeld S5 f Eckenerstr. p Messe-Express Rülzheim Bf. S51 R51 5 b Rheinbergstr. p f Rheinhafenstr. M Rülzheim Freizeitzentrum S r p
KA-Mühlburg Maxau
Thomas-Mann-Str. Germersheim Bf. Stadtwerke Messe (Messe-Express) Rheinzabern Bf. p
p
A
S2 f 6 Karl-Delisle-Str. Landau Rheinzabern Rappengasse Mauerweg p S51 S52 j 5 Rheinhafen
Maximiliansau Eisenbahnstr. R51 Dornröschenweg
Rheinzabern Alte Römerstr. S5 Rheinhafen
b p p p p b j ü
ü S2 P Knielingen D 5 Ankerstr.
KA- Knielingen Maximiliansau West Jockgrim Bf. S52 ü
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Rietburgbahn Daxlanden
A S51 t Kirchplatz
Wörth Bf. p
6
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Hammweg R52
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Rappenwört
Wörth Mozartstr. Wörth b p
Rheinstetten 6
Maximiliansau Waidweg
S5 Kandel p R51 ü Im Rüsten
Nußbaumweg
R51 nach Neustadt
w Hammäcker
Insheim Rohrbach Steinweiler Winden Altrheinbrücke Maikammer-Kirrweiler Edenkoben Edesheim Knöringen-Essingen Landau Hbf b R51 R51 R53 R51 R51 Hagenbach Mörsch Am Hang
Mörsch Römerstr.
Mörsch Merkurstr. Mörsch Bach West 4 Rappenwört Mörsch Rheinaustr. b b p p p p p Forchheim Hauptstr. Forchheim
Mörsch Narzissenstr.
R53 Hallenbad Forchheim
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Neuburg (Rhein)
Forchheim Oberfeldstr. Forchheim
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p Mörsch Rösselsbrünnle
b R55 R54
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Schaidt Berg (Pfalz)
p Lauterbourg
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p Barbelroth
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b b Forchheim Messe/Leichtsandstr. Forchheim
aduWest Landau Lauterbourg (F) p S
p
b Rheinstrandsiedlung p
Park + Ride
Kapsweyer b
p Busanschluss Godramstein
Drusweiler b 100 Tarifwabe Stadtbahnlinie p
w
Schweighofen Straßenbahnlinie Linie / Haltestelle Wörth Bienwaldhalle Wörth Rathaus Kapellen- Siebeldingen-Birkweiler Wörth Bürgerpark Regionalbahnlinie
Stadtmobil Station
Wörth Alte Bahnmeisterei
Wissembourg (F) Wissembourg Wörth Badallee
Albersweiler
Bergzabern
p Endhaltestelle/ -bahnhof
Wörth Badepark
Bad nwie mTrifels am Annweiler Wörth Dorschberg Bike + Ride (nur Karlsruhe) R52 nach Strasbourg Strecke außerhalb KVV-Tarif Strecke
4 Rinnthal Bedienung nur in Pfeilrichtung t Bad Bergzabern D 5 Wissembourg D R53 nach Strasbourg R55 nach Pirmasens Rintheim 5 b j % ü t p Herausgeber und Gestaltung: GmbH © Karlsruher Verkehrsverbund Stand: 04.11.2010/Änderungen vorbehalten Liniennetzplan gültig ab 12. Dezember 2010
BIOspektrum | Tagungsband 2011 SPONSORS & EXHIBITORS 11
Sponsors and Exhibitors of the Annual Meeting of the VAAM 2011 (as of 01.03.2011)
Main sponsor Sponsoren/Sponsors Eurofins MWG Operon (Ebersberg) BASF SE (Ludwigshafen) www.eurofinsdna.com www.basf.com
Sponsor Poster Prizes DFG – Deutsche Forschungsgemeinschaft (Bonn) nadicom GmbH (Karlsruhe) www.dfg.de www.nadicom.de Evonik Degussa GmbH (Hanau/Wolfgang) Sponsors PhD Awards www.corporate.evonik.de BASF SE (Ludwigshafen) Bayer Schering Pharma AG (Berlin) Federation of European Microbiological Societies (FEMS) Evonik Degussa GmbH (Hanau/Wolfgang) www.fems-microbiology.org New England Biolabs GmbH (Frankfurt a. M.) Sanofi Aventis Deutschland GmbH (Frankfurt a. M.)
Exhibitors alphabetically MP BIOMEDICALS GmbH (Illkirch/F) 26 QIAGEN GmbH (Hilden) 18 3M Medica Zweigniederlassung der 3M New England Biolabs GmbH (Frankfurt) 16 SERVA Electrophoresis GmbH (Heidelberg) 19 Deutschland GmbH (Neuss) 46 Nippon Genetics Europe GmbH (Düren) 6 TIB MOLBIOL Syntheselabor GmbH (Berlin) 20 4titude (Berlin) 17 Oxoid Deutschland GmbH (Wesel) 15 Analytik Jena AG (Jena) 21 Abbott GmbH & Co. KG (Wiesbaden) 43 Partec GmbH (Münster) 38 ZYMO Research Europe GmbH (Freiburg) 22 AES CHEMUNEX GmbH (Bruchsal) 40 PerkinElmer LAS (Rodgau) 35 IBA GmbH (Göttingen) 23 Affymetrix UK Ltd., USB Europe PreSens Precision GmbH (Regensburg) 44 Agilent Technologies (Waldbronn/CH) 24 (High Wycombe/UK) 25 Pyro Science (Aachen) 3 Affymetrix UK Ltd., USB Europe 25 Agilent Technologies (Waldbronn/CH) 24 QIAGEN GmbH (Hilden) 18 MP BIOMEDICALS GmbH (Illkirch/F) 26 Analytik Jena AG (Jena) 21 R&D Systems GmbH (Wiesbaden) 1 Meintrup DWS Laborgeräte GmbH AppliChem GmbH (Darmstadt) 31 Sarstedt AG & Co. (Nümbrecht) 10 (Lähden-Holte) 27 Applied Maths NV (Sint-Martens-Latem/BE) 5 SERVA Electrophoresis GmbH (Heidelberg) 19 ELGA Labwater/VWS Deutschland GmbH BioValley (Illkirch/FR) 29 Spektrum Akademischer Verlag (Heidelberg) 36 (Celle) 28 Bruker Daltonik GmbH (Bremen) 7 Süd-Laborbedarf GmbH (Gauting) 11 BioValley (Illkirch/FR) 29 Cameca (Unterschleissheim) 42 Technologie-Lizenz-Büro (TLB) (Karlsruhe) 8 Leibniz Institut DSMZ – Deutsche Sammlung Deutsche Forschungsgemeinschaft (Bonn) 39 Thermo Fisher Scientific (Langenselbold) 45 von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH ELGA Labwater/VWS Deutschland GmbH (Braunschweig) 30 TIB MOLBIOL Syntheselabor GmbH (Berlin) 20 (Celle) 28 ZYMO Research Europe GmbH (Freiburg) 22 AppliChem GmbH (Darmstadt) 31 Eurofins MWG Operon (Ebersberg) 13 metaBIOn international AG (Martinsried) 32 GATC Biotech AG (Konstanz) 47 by booth number miacom diagnostics GmbH (Düsseldorf) 33 GBRCN c/o JKI (Braunschweig) 49 R&D Systems GmbH (Wiesbaden) 1 MoBiTec GmbH (Göttingen) 34 GE Healthcare Europe GmbH (München) 48 Infors GmbH (Einsbach) 2 PerkinElmer LAS (Rodgau) 35 IBA GmbH (Göttingen) 23 Pyro Science (Aachen) 3 Spektrum Akademischer Verlag (Heidelberg) 36 Implen GmbH (München) 4 Implen GmbH (München) 4 Keyence Deutschland GmbH (Neu-Isenburg) 37 Infors GmbH (Einsbach) 2 Applied Maths NV (Sint-Martens-Latem/BE) 5 Partec GmbH (Münster) 38 Ingeniatrics Tecnologías S.L. (Seville/ES) 41 Nippon Genetics Europe GmbH (Düren) 6 Deutsche Forschungsgemeinschaft (Bonn) 39 IUL Instruments GmbH (Königswinter) 9 Bruker Daltonik GmbH (Bremen) 7 AES CHEMUNEX GmbH (Bruchsal) 40 Keyence Deutschland GmbH (Neu-Isenburg) 37 Technologie-Lizenz-Büro (TLB) (Karlsruhe) 8 Ingeniatrics Tecnologías S.L. (Seville/ES) 41 Leibniz Institut DSMZ – Deutsche Sammlung IUL Instruments GmbH (Königswinter) 9 von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH Cameca (Unterschleissheim) 42 (Braunschweig) 30 Sarstedt AG & Co. (Nümbrecht) 10 Abbott GmbH & Co. KG (Wiesbaden) 43 LGC Standards (Wesel) 12 Süd-Laborbedarf GmbH (Gauting) 11 PreSens Precision GmbH (Regensburg) 44 MACHEREY-NAGEL GmbH & Co. KG (Düren) 14 LGC Standards (Wesel) 12 Thermo Fisher Scientific (Langenselbold) 45 Meintrup DWS Laborgeräte GmbH Eurofins MWG Operon (Ebersberg) 13 3M Medica Zweigniederlassung der 3M (Lähden-Holte) 27 MACHEREY-NAGEL GmbH & Co. KG (Düren) 14 Deutschland GmbH (Neuss) 46 metaBIOn international AG (Martinsried) 32 Oxoid Deutschland GmbH (Wesel) 15 GATC Biotech AG (Konstanz) 47 miacom diagnostics GmbH (Düsseldorf) 33 New England Biolabs GmbH (Frankfurt) 16 GE Healthcare Europe GmbH (München) 48 MoBiTec GmbH (Göttingen) 34 4titude (Berlin) 17 GBRCN c/o JKI (Braunschweig) 49
BIOspektrum | Tagungsband 2011 12 GENERAL INFORMATION · SPONSORS & EXHIBITORS
C C
47 43 48
BIOspektrum | Tagungsband 2011 13
Ausstellungsplan Ebene 2/Obergeschoss
Jahrestagung der Vereinigung für Allgemeine und Angewandte Mikrobiologie 03.–06. April 2011
2.06 2.07 2.10 2.09 2.08 2.05
Johannes-Brahms-Saal
25 42 26 41 27 40
49 C C
28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39
C = Catering = Poster
BIOspektrum | Tagungsband 2011 14 GENERAL INFORMATION
Einladung zur Mitgliederversammlung der VAAM
ó Hiermit lade ich alle Mitglieder der VAAM 6. Wahl des Präsidiums (Präsident, 1. Vize- denten entsprechend der Geschäftsordnung zur Mitgliederversammlung ein. Sie wird am präsident, Schatzmeister, Schriftführer) (siehe Homepage der VAAM) zur Wahl zum Dienstag, den 5. April 2011, um 17.30 Uhr und des Beirats (geheime Wahl während Präsidenten vorschlagen wird. Ordentliche in der Stadthalle in Karlsruhe stattfinden. der Mitgliederversammlung) und studentische Mitglieder haben auf der 7. Ehrenmitgliederwahl Mitgliederversammlung gleiches Stimm- Vorläufige Tagesordnung: 8. Verschiedenes recht. 1. Festlegung der Tagesordnung und Geneh- Im Anschluss findet die Verleihung der migung der Niederschrift der Mitglieder- VAAM-Promotionspreise 2011 statt. Reisekostenzuschüsse für studentische versammlung vom 30. März 2010 in Han- Mitglieder können bei fristgerecht einge- nover (siehe BIOspektrum 4/10, Seiten 460 Hiermit bitte ich alle Mitglieder, Vorschläge gangenen Anträgen und bei Vorliegen der und 461) zur Wahl des Präsidiums und des Beirats sonstigen Voraussetzungen nur persönlich 2. Bericht aus dem Vorstand, u.a. Haushalt beim Präsidenten einzureichen (bis 14 Tage am Dienstag, den 5. April 2011, von 15.00 2010 und Haushaltsplan 2011, Ort und Zeit vor der Mitgliederversammlung), wobei Vor- – 17.00 Uhr sowie am Mittwoch, den 6. der nächsten Jahrestagung, Aktivitäten der schläge für das Präsidium von zehn VAAM- April 2011, von 10.00 – 12.00 Uhr im Fachgruppen, VBIO Mitgliedern und für den Beirat von drei Mit- Tagungsbüro abgeholt werden. ó 3. Neustrukturierung der Mitgliedsbeiträge gliedern unterschrieben sein müssen. Ich 4. Bericht der Kassenprüfer möchte auch darauf hinweisen, dass der Vor- Hubert Bahl 5. Entlastung des Vorstandes stand der VAAM den jetzigen 1. Vizepräsi- Schriftführer Symposium by Eurofins MWG Operon (Ebersberg) Tuesday, 5 April 2011, 16:00–17:30, Clubroom
Latest developments in NGS Sequencing and quantitative expression profiling is sequencing of any genomic region of choice, ó Eurofins MWG Operon, a global genomics offered with specially designed 3’-fragment as well as the proprietary complete exome service provider with the longest experience cDNA libraries, but also with standard mRNA sequencing is offered. In a exclusive world- for Roche/454 sequencing technology in the sequencing protocols. Non-coding cDNA wide strategic partnership with Genomatix market has updated his sequencing machine libraries with longer than the standard 29 bp Software GmbH high quality data mapping park and is offering now sequencing with allow the analysis of non coding RNAs that and data mining of target enriched sample Roche GS Junior and enhanced TAT service. are not detectable with alternative sequenc- sequencing and data analysis is available. Built around meanwhile 3 Roche sequenc- ing technologies. A selected number of examples will be pre- ing machines Eurofins MWG Operon offers a As a certified NimbleGen service provider sented during the seminar. ó broad portfolio for de novo sequencing of viral, for targeted enrichment and sequencing, the bacterial and fungal genomes, as well as bioin- formatics analysis services like SNP identifi- cation, strain comparison and annotation of Karrieresymposium genomes. Sequencing experience with bar-coded Montag, 4. 4. 2011 samples allows multiplexing of different sam- 15.45 – 17.15 Uhr ples like BAC clones, phages or small genomes, but also multiplexing of different Clubraum types of libraries in one lane, like shotgun Ulrike Gerischer, Göttingen and long paired-end libraries. Wissenschaftskoordinatorin am MPI für biophysikalische Chemie As transcriptome analysis and expression profiling by next generation sequencing “Akademische Laufbahn: Plan B” becomes more and more important, the con- Anja Störiko, Hofheim struction and sequencing of cDNA libraries Wissenschaftsjournalistin for the identification of full length mRNAs and expression profiling is an important part Formulieren statt Forschen of the portfolio. Meanwhile the protocols for “Von den Biowissenschaften in den Journalismus” normalised cDNA and small RNA libraries, Zwingenberg originally developed for GS FLX sequencing, Martin Langer, Ute Dechert, B.R.A.I.N are now also available for Illumina HiSeq 2000 technology. “Wachstum mit Weißer Biotechnologie: Illunima HiSeq 2000 services have become Karrieren und Chancen bei BRAIN” part of our broad product portfolio. Qualitative
BIOspektrum | Tagungsband 2011 EINLADUNG/INVITATION
Jahrestagung der Vereinigung für Allgemeine und Angewandte Mikrobiologie Annual Conference of the Association for General and Applied Microbiology (VAAM) 18–21 MARCH 2012• TÜBINGEN
Topics • Bacterial Differentiation • Microbial Pathogenicity • Cell Envelope • Microbial Survival Strategies • Human Microbiota • Secondary Metabolites • Metabolic Regulation and Signalling • Soil Microbiology pictures © by IMIT © by pictures www.vaam2012.de 16 AUS DEN FACHGRUPPEN DER VAAM
Fachgruppe: Fungal Biology and Biotechnology/ Experimentelle Mykologie
ó Es ist das Ziel unserer Fachgruppe, jun- deen) gewonnen, der einen Vortrag über gen Nachwuchswissenschaftlern, d.h. Dokto- Oomyceten und ihre Pathogenität halten wird. randen, Post-Docs und Habilitanden, zweimal Anschließend werden Kurzvorträge von Dok- im Jahr ein Forum zur Diskussion eigener toranden stattfinden, die anhand der einge- Ergebnisse zu bieten. reichten Abstracts ausgewählt wurden. Im Jahr 2010 wurde dieses Ziel mit dem Im Anschluss an das Minisymposium wird Herbst-Symposium “Biotransformation by die Fachgruppensitzung stattfinden. Auf der Fungal Cells or Fungal Enzymes” in Senften- Tagesordnung steht die Wahl der Fachgrup- Sprecher: berg und mit dem Minisymposium “Fungi in pensprecher. Zudem sollen Ideen für künfti- Klaus-Peter Stahmann, the Environment” im Rahmen der Früh- ge Veranstaltungen diskutiert werden, ins- Hochschule Lausitz jahrstagung in Hannover erreicht. besondere Themenvorschläge für ein Mini- Email: [email protected] Zur Frühjahrstagung in Karlsruhe fin- Symposium zur VAAM-Frühjahrstagung 2012 det das Fachgruppensymposium “Fungal in Tübingen. Development and Pathogenicity Mechanisms” Für den Herbst 2011 ist bereits die Tradi- statt. Der frisch habilitierte Nachwuchswis- tionstagung “Molecular Biology of Fungi” in senschaftler Matthias Brock (Jena) wird es Planung. Vom 11.–14. September lädt dazu Stellvertetende Sprecherin: zusammen mit Stefanie Pöggeler (Göttingen) Michael Bölker nach Marburg ein. Informa- Ursel Kües, am Montag, den 4. April 2011, leiten. Als Gast- tionen unter: [email protected] Universität Göttingen sprecher wurde Dr. Pieter van West (Aber- burg.de ó Email: [email protected] Fachgruppe: Funktionelle Genomanalyse
ó Die Fachgruppe ‚Funktionelle Genoma- Metagenomik zur Charakterisierung von Can- bei der die Wahl der Fachgruppenvertreter nalyse’ wird bei der Jahrestagung in Karlsru- didatus-Stämmen aus Metagenomsequenzen für die nächsten Jahre stattfinden wird. ó he ihr zwölftes Minisymposium abhalten, mit (F. Meyer, Argonne National. Laboratory, USA) dem Thema “Standards for Large Scale (Meta-) und kombinierter Genom-Proteom-Analyse Genomics and Metadata”. Die Veranstaltung (L. Wöhlbrand, ICBM, Oldenburg) runden das Sprecher: wird einen Einblick in die Arbeit des “Geno- Programm ab. Hans-Peter Klenk, mic Standards Consortium” bieten (FO Glöck- Die Mitglieder der Fachgruppe sowie Inter- Deutsche Sammlung von ner, MPI Bremen), sowie neue Wege der Publi- essenten an der künftigen Gestaltung der Mikroorganismen und kation und Verbreitung standardisierter Fachgruppenveranstaltungen werden im Zellkulturen (DSMZ), Genominformation aufzeigen (G. Garrity, Anschluss an das Symposium zur Mitglie- Braunschweig Univ. Michigan, USA). Beispiele angewandter derversammlung der Fachgruppe eingeladen, Email: [email protected] Fachgruppe: Hefen
ó Hefen haben eine große Bedeutung in der mit dem Thema “Infectious agents and model Biotechnologie, und sie sind als Eukaryoten organisms in medical research” durchgeführt. Sprecher: wichtige Modellorganismen in der Zellbiolo- Des Weiteren haben Mitglieder der Fach- Karl-Dieter Entian, gie. Darüber hinaus nimmt die Bedeutung gruppe Hefen das Jubiläumssymposium zum J.W. Goethe-Universität einiger Hefen als human- und pflanzenpa- 10-jährigen Bestehen des französischen Hefe- Frankfurt thogene Infektionskeime stetig zu. Die Fach- konsortiums Genolevure (10.11.2011) mit orga- Email: [email protected] gruppe Hefe fasst die Mitglieder der VAAM nisiert. furt.de zusammen, die mit Hefen als Mikroorga- In 2011 soll im Herbst eine gesonderte Fach- nismus an diesen Fragestellungen arbeiten gruppentagung stattfinden. Für 2013 wird und umfasst zurzeit 69 Mitglieder. Bei der unter Mitwirkung der Fachgruppe Hefe erst- letzten VAAM-Tagung in Hannover wurde malig seit 1976 die internationale Hefekonfe- Stellvertretender Sprecher: gemeinsam mit Fachgruppe Eukaryotische renz wieder in Deutschland (Frankfurt) statt- Bernd Schäfer, RWTH Aachen Krankheitserreger der DGHM ein Symposium finden. ó Email: [email protected]
BIOspektrum | Tagungsband 2011 17
Fachgruppe: Mikrobielle Pathogenität (gemeinsam mit der DGHM – Deutschen Gesellschaft für Hygiene und Mikrobiologie)
ó Die Fachgruppe “Mikrobielle Pathoge- “Regulation und Signaltransduktion in Pro- setzung der Veranstaltungsreihe 2012 ist in nität” zählt zu den ältesten Fachgruppen der karyoten” der VAAM (“Cell-cell communica- Planung. VAAM und ist ebenfalls die älteste und mit tion”) statt. Zudem wurde aus der Fachgrup- 2011 wird sich die Fachgruppe schwer- 350 Mitgliedern auch die größte Fachgruppe pe heraus eine Vielzahl qualitativ hochwer- punktmäßig mit der Organisation der DGHM- der DGHM. Molekulare Mechanismen der tiger Poster präsentiert. Zukunftsweisend war Jahrestagung in Essen und der VAAM-Jah- Erregervirulenz stellen den wissenschaft- die gemeinsame Fachgruppensitzung der restagung in Karlsruhe beschäftigen. Im Rah- lichen Schwerpunkt dar. Neben klassischen zuvor nur lose interagierenden Fachgruppen men dieser Veranstaltungen sollen auch wei- Themen der mikrobiellen Pathogenität (Toxin- “Mikrobielle Pathogenität” der DGHM und tere Möglichkeiten gemeinsamer Aktivitäten funktionen, Adhäsion, Regulation von Viru- VAAM. Hier wurden die großen Gemeinsam- und Initiativen diskutiert werden. ó lenzgenen) ist die zelluläre Mikrobiologie eine keiten dieser beiden Fachgruppen herausge- bedeutende Forschungsrichtung; Fragen zur arbeitet und der Wille bekräftigt, sich zukünf- Wechselwirkung zwischen mikrobiellen Erre- tig als gemeinsame Fachgruppe zu verstehen gern und eukaryotischen Wirtszellen stehen und für ein engeres Zusammengehen der bei- Sprecher VAAM: dabei im Mittelpunkt. den Fachgesellschaften einzutreten. Andreas Peschel, Universität Wie auch in den Jahren zuvor hat die Fach- Ein wichtiges sichtbares Zeichen für diese Tübingen gruppe aktiv zentrale Veranstaltungen zu Fra- enge Zusammenarbeit war die Ausrichtung Email: Andreas.Peschel@ gen mikrobieller Pathogenität mitgestaltet. der alle zwei Jahre stattfindenden Fachgrup- med.uni-tuebingen.de So war die Fachgruppe im März des Jahres pentagung in Bad Urach vom 21.6. bis 2010 wesentlich an der erfolgreichen Orga- 23.6.2010. Die Tagung bot bereits zum fünf- nisation und Durchführung der gemeinsamen ten Mal gerade jungen Nachwuchswissen- Jahrestagung von DGHM und VAAM beteiligt. schaftlern aus Medizin und Naturwissen- Gemeinsam wurden drei Sessions zu wichti- schaften die Möglichkeit, ihre Ergebnisse in Stellvertretende Sprecherin: gen aktuellen Themen wie “Pathogen-indu- entspannter und diskursiver Atmosphäre zu Petra Dersch, HZI Braun- ced host cell signalling”, “The cell envelope in präsentieren und zu diskutieren. Als Zeichen schweig bacterial infections” und “Bacterial metabo- der besonderen Bedeutung der Förderung Email: petra.dersch@ lism and infection” ausgerichtet. Daneben junger Wissenschaftler wurde im Rahmen helmholtz-hzi.de fanden gemeinsame Sessions mit der Fach- der Tagung zum zweiten Mal der “Sanofi- gruppe “Gastrointestinale Infektionen” der Aventis Förderpreis” verliehen. Preisträger Sprecher DGHM: DGHM (“Microbial pathogenesis and gastro- sind Dipl. Biol. Inga Jensch, Greifswald und Volker Kempf, Universität Frankfurt; intestinal infections”) und der Fachgruppe Dipl. Biol. Marc Burian, Tübingen. Die Fort- Sven Hammerschmidt, Universität Greifswald;
www.VAAM.de Aktuelles über • Wissenschaft im Allgemeinen und Mikrobiologie im Besonderen • Tagungen und Workshops • Institute und Fachgruppen und vieles mehr finden Sie auf der VAAM-Homepage.
Schauen Sie doch mal rein!
BIOspektrum | Tagungsband 2011 18 AUS DEN FACHGRUPPEN DER VAAM
Fachgruppe: Qualitätssicherung und Diagnostik
ó Die Fachgruppe beschäftigt sich mit eine solche gerade angetreten haben, sind Zukünftig will die Fachgruppe weiterhin aktuellen Fragen und Entwicklungen aus dem eingeladen, an diesem Erfahrungsaustausch mindestens einmal jährlich zusammenkom- Themenbereich Qualitätssicherung und Dia- teilzuhaben. men. Hierzu sollen möglichst auch Wissen- gnostik. Zur mikrobiologischen Qualitätssi- Zur Jahrestagung der VAAM 2010 in Han- schaftler und Kollegen aus der Industrie ange- cherung gehören beispielsweise Prüfungen nover fand eine Fachgruppensitzung gemein- sprochen werden, die in thematisch ähnlich von Rohstoffen und Medien (z. B. Wasser) für sam mit der entsprechenden Fachgruppe der ausgerichteten anderen Fachgruppen aktiv die Herstellung von pharmazeutischen Wirk- DGHM statt. Sechs Vorträge aus dem The- sind. Dabei wird an eine Vertiefung der Kon- stoffen oder die Überwachung von Reinräu- menbereich molekularer Diagnostik (PCR) takte zur DGHM und dem Curriculum der men. Wenn es hier zu Grenzwert-Über- und Fragen der Qualitätssicherung stießen pharmazeutischen Mikrobiologen (CPM) als schreitungen kommt, müssen aufgrund der auf ein breites Interesse. Insgesamt nahmen auch Kooperationen mit weiteren Fachver- mikrobiologischen Analyseergebnisse Lösun- etwa 30 Teilnehmer an dieser Veranstaltung bänden gedacht. Zudem soll hierdurch u. a. gen für korrigierende und vorbeugende Maß- teil. Durch das gemeinsame und offene Dis- die regelmäßige Kommunikation zwischen nahmen gefunden werden. Erfahrungen dazu kutieren der Themen verlief dieses Treffen den Mitgliedern aktiviert werden. Das näch- werden innerhalb der Fachgruppe diskutiert, sehr erfolgreich, da sich zudem die Mitglieder ste Treffen findet im September 2011 in und anhand derer können Lösungen erarbei- der beiden Fachgruppen einander besser ken- Frankfurt in den Räumen der Provadis-Hoch- tet werden. nenlernen konnten. schule statt. ó Die Identifizierung (un)bekannter Kolonien Im November fand das jährliche und gut auf einer Agarplatte in möglichst kurzer Zeit besuchte Treffen der VAAM-FG in Berlin statt. ist eine ständige Herausforderung nicht nur Hier diskutierten 25 Teilnehmer anhand von in der Industrie und daher ein Schwerpunkt acht Vorträgen “Probleme und Erfahrungen Sprecher: innerhalb der Fachgruppe. Die Erfahrungen mit diagnostischen Systemen”, und die Teil- Steffen Prowe, Beuth Hoch- mit sich ständig weiterentwickelnden dia- nehmer knüpften untereinander neue Kon- schule, Berlin gnostischen Systemen tauschen wir ebenfalls takte. Email: steffen.prowe@beuth- aus. Hier ergeben sich auch immer wieder Im Rahmen dieses Treffens wurden hochschule.de Kontakte zur Forschung und Entwicklung auch Fachgruppensprecher und -stellver- sowie zu Unternehmen aus dieser Branche. treter neu gewählt. So wurden der lang- Mikrobiologen und andere Fachkollegen, jährige Fachgruppenleiter Dr. Gerhart die sich für derartige Fragestellungen inter- Heinz und sein Stellvertreter Dr. Michael essieren, sind als neue Mitglieder in der Fach- Rieth verabschiedet und mit Prof. Dr. Steffen Stellvertretender Sprecher: gruppe herzlich willkommen. Auch VAAM- Prowe (Leitung) und Dr. Andreas Seiffert-Stö- Andreas Seiffert-Störiko, Mitglieder, die sich für eine entsprechende riko (Vertreter) ein neues Sprecherteam Sanofi-Aventis Deutschland Position in der Industrie interessieren oder gewählt. Email: Andreas.Seiffert- [email protected] Fachgruppe: Regulation und Signaltransduktion in Prokaryoten
ó Im Rahmen der Fachgruppe fand im Ok- niedermolekulare Verbindungen, die der Sig- ma c-di-GMP in der Phototaxis von Synecho- tober des vergangenen Jahres das 28. Sym- nalübertragung innerhalb von Zellen dienen. cystis komplettiert. posium “Mechanisms of Gene Regulation” Dabei beeinflussen Second Messengers eine Im Anschluss an dieses Fachgruppensym- statt, das dankenswerter Weise Gottfried Vielzahl von intrazellulären Signaltrans- posium findet die diesjährige Mitgliederver- Unden, Universität Mainz, organisierte. Auch duktionsprozessen, was gleichzeitig der Sig- sammlung unserer Fachgruppe statt, zu der dieses Mal hatte dieses Symposium einen nalverstärkung und –integration dient. Zur ich Sie herzlich einlade. ó äußerst großen Zuspruch, was sich in fünf Thematik der Second Messenger ist es uns Plenarsprecher/innen und mehr als 100 teil- gelungen, zwei in diesem Gebiet internatio- nehmenden Doktoranden/innen und Post- nal führende Wissenschaftler zu Über- doktoranden/innen widerspiegelte. Das näch- sichtsvorträgen einzuladen: Urs Jenal, Bio- ste 29. Symposium wird 2012 in München zentrum Basel, Schweiz, wird über c-di-AMP Sprecherin: unter der Leitung von Thorsten Mascher, im Zusammenhang mit Beweglichkeit, Zell- Kirsten Jung, München, organisiert werden. zyklus und Differenzierung sprechen. Ludwig-Maximilians-Univer- Während der VAAM-Tagung 2011 in Karls- Andrew Camilli, Tufts University School of sität München ruhe findet ein interessantes Symposium Medicine, Boston, USA, wird über die Bedeu- Email: [email protected] zum Thema “Second Messengers” statt, eine tung von Second Messengern in Vibrio cho- Gemeinschaftsveranstaltung unserer Fach- lerae berichten. Das Programm des Sympo- Stellvertretender Sprecher: gruppe und der Fachgruppe “Mikrobielle siums wird mit einem Kurzvortrag von Sven Franz Narberhaus, Universität Bochum Pathogenität”. Second Messenger sind DeCausmacker, Universität Gießen, zum The- Email: [email protected]
BIOspektrum | Tagungsband 2011 19
Fachgruppe: Struktur und Mikroskopie
ó Die Fachgruppe widmet sich Themen der Makromolekülkomplexe. Inzwischen eröffnet biellen Cytoplasmas, die nur mit fortschritt- mikrobiellen Strukturforschung und Metho- sich auch die Möglichkeit, die strukturellen licher Rechnerarchitektur zu bewältigen sind den der Mikroskopie und bietet mit ihren Daten in Simulationen (von Teilen) des Cyto- und einen faszinierenden Ausblick auf Minisymposien Einblicke in aktuelle Ent- plasmas zu nutzen und seine Dynamik auf zukünftige Entwicklungen bieten. Die Vor- wicklungen. In diesem Jahr behandelt das molekularem Niveau zu untersuchen. Drei tragenden sind führende Experten in ihren Fachgruppen-Symposium “Die Struktur des Übersichtsvorträge befassen sich mit der Forschungsgebieten, die nicht unbedingt im Cytoplasmas”. Das mikrobielle Cytoplasma gegenwärtigen Forschung zu diesen Aspek- Zentrum der Mikrobiologie angesiedelt sind, steht schon lange im Verdacht, geordneter zu ten: uns aber Zugang zur inneren Struktur und sein, als es sich uns vermeintlich darbietet. Julio Ortiz (MPI für Biochemie, Martins- Organisation mikrobieller Zellen verschaffen. Die Schwierigkeit besteht darin, die Anord- ried) wird über die Bildung von Ribosomen- Im Anschluss an das Symposium veran- nung und Interaktion der Makromoleküle Clustern in stoffwechselaktiven und hun- stalten wir ab 19.30 Uhr im gleichen Raum sichtbar zu machen und ihre dynamische Ent- gernden Bakterien berichten, die mit Kryo- ein Mitgliedertreffen der Fachgruppe. ó wicklung zu verfolgen, sodass auch weiträu- Elektronentomographie nachgewiesen und in mige Strukturen und Muster im Kontext der ihrer 3D-Struktur untersucht wurden. Johan Fülle von Proteinkomplexen in intakten Zel- Elf (Universität von Uppsala, Schweden) ver- len erkennbar werden. Fluoreszenzmikros- folgt mit Einzelmolekül-Nachweisen im Fluo- kopie und ihre hochauflösenden Varianten reszenzmikroskop die Diffusion und Reak- Sprecher: (STED, PALM, STORM) können Informationen tionskinetik markierter Proteine in Zellen Harald Engelhard, über die Lokalisation markierter Proteine in und simuliert ihr Verhalten. Zan Luthey- MPI für Biochemie, Mikroorganismen liefern, die Methode der Schulten (University of Illinois, Urbana, USA) Martinsried Kryo-Elektronentomographie die dreidimen- gibt einen Einblick in die jüngsten Ergebnisse Email: sionale Verteilung und Struktur größerer ihrer Simulationen der Dynamik des mikro- [email protected] Fachgruppe: Symbiotische Interaktionen
ó Die derzeit jüngste VAAM-Fachgruppe der Fachgruppe umfassen beispielsweise die künftigen Gestaltung der Fachgruppe sind (gegr. Dezember 2009) umfasst aktuell ca. Stoffwechselinteraktionen zwischen mikro- dazu herzlich eingeladen. 60 Mitglieder aus Universitäten, For- biellen Symbionten und Wirt sowie der Weitere Informationen unter: http://www. schungseinrichtungen und der Industrie. Pri- Mikroorganismen untereinander, die Bedeu- helmholtz-muenchen.de/en/symbiotic-inter- märes Ziel der Fachgruppe ist es, einen regel- tung des Quorum Sensings für die Bakterien- actions/home-aims/index.html ó mäßigen Kontakt und Austausch zwischen Wirt-Interaktion und die Aufklärung der deutschen und internationalen Arbeitsgrup- Interaktionen im bakteriellen Biofilm des pen zu fördern, die Arbeiten der Fachgruppe gesunden Wirtes. Dabei stehen die Vorstel- international sichtbar zu machen und lungen der jeweiligen Modellsysteme, der Sprecher: gemeinsame Fortbildungsveranstaltungen Abgleich der Symbiose-Systeme untereinan- Ute Hentschel-Humeida, für den wissenschaftlichen Nachwuchs der und die angewendeten Methoden im Zen- Universität Würzburg durchzuführen. Die Forschungsaktivitäten trum der Aktivitäten. Nach dem ersten Email: ute.hentschel@uni- sind, ebenso wie die Fachgruppe selbst, an VAAM-Fachgruppen-Treffen im November wuerzburg.de der sich neben Mikrobiolog/inn/en auch 2009 in München fand das zweite Meeting Mediziner/innen und Tiermediziner/innen im September 2010 in Würzburg statt. An aktiv beteiligen, stark interdisziplinär aus- diesem Treffen nahmen über 90 Teilnehmer gerichtet. Im Vordergrund stehen die vielfäl- teil und präsentierten ihre Arbeiten in 25 Stellvertretender Sprecher: tigen Interaktionen von Mikroorganismen Vorträgen und 22 Postern. Die Fachgruppe Andreas Schwiertz, mit tierischen oder pflanzlichen Wirten, die präsentiert sich im Jahr 2011 auf der VAAM- Institut für Mikroökologie pathogen, mutualistisch oder kommensal Jahrestagung in Karlsruhe. Die Mitglieder Email: andreas.schwiertz@ ausgeprägt sein können. Die Themenfelder der Fachgruppe sowie Interessenten an der mikrooek.de
BIOspektrum | Tagungsband 2011 20 AUS DEN FACHGRUPPEN DER VAAM
Fachgruppe: Umweltmikrobiologie
ó Die Fachgruppe Umweltmikrobiologie bie- Im September 2011 findet das International gruppenveranstaltung ab 19.30 Uhr die Wahl tet ein breites Forum, das von der Mikrobiel- Symposium on Subsurface Microbiology des neuen Sprechers stattfinden, zu der wir len Ökologie bis zu umweltrelevanten Stoff- (ISSM) in Garmisch-Partenkirchen statt, zu herzlich einladen. ó wechselwegen oder praktischen Anwendun- dem alle Mitglieder herzlich eingeladen sind gen reicht. Ein Ziel der Fachgruppe ist, den (www.issm2011.com). Hier wird mikrobielle intensiven Austausch zwischen diesen Fach- Ökologie von marinen Sedimenten über tie- bereichen zu fördern und mit Veranstaltungen fe terrestrische Habitate bis zu flachen zu neuen Themen zu unterstützen. Grundwasserleitern diskutiert. Für 2012 ist Sprecher: Umweltmikrobiologie ist bereits bei den es geplant, zusätzlich zu einem Fachgrup- Karl-Heinz Engesser, Plenarvorträgen ein Schwerpunkt dieser pensymposium auf der VAAM-Jahrestagung Uni Stuttgart VAAM Tagung. Zusätzlich findet am Montag, eine spezielle Fachgruppentagung zu orga- Email: karl-h.engesser@ 04. April, von 17:30 bis 19:30 ein Fachgrup- nisieren. Interessierte können sich gerne mit iswa.uni-stuttgart.de pensymposium zum Thema “Relevance of eco- Themenvorschlägen an den Sprecher wen- logical principles in environmental micro- den. Stellvertretender Sprecher: biology” statt. Mit Christoffer van der Gast, Bisher wurde die Fachgruppe von Prof. Rainer Meckenstock, UK, und Alban Ramette, MPI Bremen als ein- Engesser geleitet, der mit der VAAM-Tagung Helmholtz-Zentrum München geladene Redner sowie weiteren Beiträgen 2011 auf eigenen Wunsch ausscheiden möch- Email: rainer.meckenstock@helmholtz- verspricht dieses sehr interessant zu werden. te. Deshalb wird im Anschluss an die Fach- muenchen.de Der VAAM-DECHEMA-Gemeinschaftsausschuss: Biotransformationen
ó Im November 2008 haben die seit 1996 nisse in Produkte umzusetzen. An biokata- Für 2011 sind die Beteiligung an einer bestehende VAAM-Fachgruppe “Biotransfor- lytischen Verfahren führt dabei kein Weg vor- DECHEMA-Vortrags- und Diskussionstagung mationen” mit zuletzt 130 gemeldeten Mit- bei, sie bilden die Grundlage der modernen zum Thema “Bioverfahrenstechnik an Grenz- gliedern und der DECHEMA-Arbeitsaus- Industriellen Biotechnologie. Das sehr inter- flächen” vom 30.05. bis 01.06.2011 in Pots- schuss “Grundlagen der biotechnologischen disziplinäre Forschungsgebiet der Biotrans- dam geplant, sowie die Durchführung einer Stoffproduktion” in Frankfurt am Main formationen erlebt zurzeit ein rasantes internationalen interdisziplinären Sommer- gemeinsam den neuen Gemeinschaftsaus- Wachstum, dem auch moderne Methoden wie schule für Promovierende und junge Wissen- schuss “Biotransformationen” gegründet. Metagenomanalyse und Protein-Engineering schaftler aus der Industrie zum Thema “Bio- Gewählte Sprecher sind von DECHEMA-Sei- große Impulse verleihen. Durch den Zu- katalyse” vom 22. bis 25.08.2011 in Bad te zurzeit Prof. Dr. Andreas Liese (TU Ham- sammenschluss der beiden Gremien der gro- Herrenalb. ó burg-Harburg) und von VAAM-Seite Prof. Dr. ßen Fachgesellschaften kann dieses Arbeits- Christoph Syldatk (Karlsruher Institut für gebiet nun wesentlich besser und effektiver Technologie KIT). Im gemeinsamen Aus- vertreten werden und es können Forscher schuss sind neben Mitgliedern aus der Indus- aus Universitäten, Forschungseinrichtungen trie maßgeblich auch Vertreter der Gesell- und der chemisch-pharmazeutischen Indus- schaft Deutscher Chemiker (GDCh) und der trie nun noch enger zusammengeführt wer- Sprecher VAAM: Gesellschaft für Fettwissenschaften (DGF) den, was bereits in einer Reihe von Veran- Christoph Syldatk, engagiert. Dieses Zusammengehen ver- staltungen gemeinsam mit anderen Aus- Universität Karlsruhe schiedener Fachdisziplinen lag nahe: Die schüssen der DECHEMA und Fachgruppen Email: wachsende Nachfrage nach ökonomischen, der VAAM geschehen ist, über die im Bio- [email protected] ökoeffizienten und ressourcenschonenden spektrum berichtet wurde. Ziel dabei ist vor Prozessen in der Chemie-, Pharma-, Energie- allem, durch spezielle Symposien für Dokto- Sprecher DECHEMA: und Lebensmittelindustrie erfordert ver- randen, Habilitanden und Juniorprofessoren Andreas Liese, TU Hamburg-Harburg stärkte Anstrengungen, Forschungsergeb- junge Forscher zu fördern. Email: [email protected]
BIOspektrum | Tagungsband 2011 33/5 August 2010
Executive Editors: Rudolf Amann, Bremen, Germany Ramon Rosselló-Móra, Esporles, Spain Aims & Scope Karl-Heinz Schleifer, Freising, Germany Scope of the Journal: Systematic and Applied Microbiology deals with various aspects of microbial diversity and systematics of prokaryotes. It focuses on Bacteria and Archaea; eukaryotic microorganisms will only be considered in rare cases. The journal perceives a broad understanding of microbial diversity and encourages the submission of manuscripts from the following branches of microbiology: ISSN 0723-2020 System. Appl. Microbiol. 33(2010)5 pp. 237–290 Systematics: Theoretical and practical issues dealing with classifi cation and
www.elsevier.de/syapm taxonomy, i.e. (i) new descriptions or revisions of prokaryotic taxa, including descriptions of not-yet cultured taxa in the category Candidatus (ii) innovative methods for the determination of taxonomical and genealogical relationships, (iii) www.elsevier.com/locate/syapm evaluation of intra-taxon diversity through multidisciplinary approaches, (iv) ISSN 0723-2020 identifi cation methods. Applied Microbiology: all aspects of agricultural, industrial, and food micro- From the Contents Volume 33, Issue 5 biology are welcome, including water and wastewater treatment. p Prediction of whole-genome DNA G + C content Comparative biochemistry and genomics: studies concerning biochemical/ within the genus Aeromonas based on housekeeping metabolic and genomic diversity of cultured as well as yet-uncultured Bacteria gene sequences and Archaea. p Meiothermus granaticius sp. nov., a new slightly Ecology: descriptions of the microbial diversity in natural and man-made ecosys- thermophilic red-pigmented species from the Azores tem; studies quantifying the size, dynamics, and function of microbial populations; p innovative research on the interaction of micro-organisms with each other and strains Agrobacterium radiobacter K84 and Agrobac- their biotic and abiotic environment. terium tumefaciens AKE10 into the species Rhizobium rhizogenes
Executive Editors: Please send subscription orders to: Karl-Heinz Schleifer, München HGV Hanseatische Gesellschaft für Verlagsservice mbH Aboservice Rudolf Amann, Bremen Holzwiesenstr. 2 Ramon Rosselló-Móra, Esporles 72127 Kusterdingen, Germany Tel.: +49 - (0) 70 71 / 93 53 - 16 Fax: +49 - (0) 70 71 / 93 53 - 35 Complimentary access to articles published in issue 1 [email protected] of each volume via SciVerse ScienceDirect www.sciencedirect.com
Call for Papers You are invited to submit your manuscripts online to http://ees.elsevier.com/syapm/ Building Insights. Breaking Boundaries. Elsevier. 22 INSTITUTSPORTRAIT
Microbiology in Karlsruhe’s technical environment
ó The University of Karlsruhe, presently microbiological interests, ranging from basic gramming of the maize plant by U. maydis, known as the Karlsruhe Institute of Technol- research with bacteria and fungi, pathogenic and the utilization of carbon sources by the ogy (KIT), was founded in 1825 as a poly- and symbiotic interactions, to applied aspects fungus during pathogenic development. technical school. In 1832, the first biological and bioengineering, offer a broad education discipline, the school of Forest Science, was for the students and the possibility to trans- Prof. Dr. Natalia Requena. incorporated into the Polytechnical School. form ideas into products at KIT. We are very Molecular biology of plant-fungal The chair of Botany, held by Alexander Braun happy to host the annual VAAM meeting this interactions (1833 – 1846), lectured topics in botany and year in Karlsruhe! Botanical Institute, Dept. of Plant- zoology. In 1872, Pharmacy was added, and Microbe Interactions, Faculty of before the end of the 19th century, the Botany Prof. Dr. Reinhard Fischer, Chemistry and Biosciences; and Zoology departments were split into two Cell biology of filamentous fungi http://www.iab.kit.edu/heisenberg/ teaching units. In 1890, Walter Migula, a pio- Institute for Applied Biosciences, Dept. of Microorganisms often live in association with neer in bacterial systematics, habilitated in Microbiology, Faculty of Chemistry and plants either in mutualistic symbioses or as botany and served as professor until 1904; he Biosciences; www.iab.kit.edu/microbio/ parasites. The focus of the plant-fungal inter- described the important bacterial genus Filamentous fungi are extremely polarized actions group is the arbuscular mycorrhizal Pseudomonas in 1895. Forestry was later eukaryotic cells that continuously elongate symbiosis that involves the fungi of the Glo- moved to Freiburg and Pharmacy to Heidel- their hyphal tips. The Aspergillus research meromycota phylum and most plant roots. berg. After World War II, teaching started group studies the cell biology underlying The colonization of a root by arbuscular my- again, and in 1956 H. Kühlwein was appoint- polarized growth, which is driven by the con- corrhizal fungi involves a deep reorganization ed as the Chair of Botany. Although a profes- certed action of microtubules, actin and the of the plant cell to accommodate the symbiont sor of botany, Kühlwein became internation- corresponding motor proteins that deliver and to provide the fungus with photoassimi- ally recognized for his work on Myxobacte- enzymes for cell wall biosynthesis to the cor- lates. The group of Natalia Requena is inter- ria. One of his Ph.D. students, H. Reichen- tex. Recently, it was discovered that at least ested in unraveling the recognition mecha- bach, continued research with these gliding two different populations of microtubules nisms and involved molecules that character- bacteria at the GBF in Braunschweig. exist in the hyphae of Aspergillus nidulans. ize this symbiosis. How have plants learned to Kühlwein also studied the physiology of some A. nidulans is able to initiate different mor- distinguish between pathogenic and mutua- wood-degrading fungi. phogenetic programs and develop either asex- listic fungi? How have some pathogens learned In 1967, the university was restructured ual or sexual spores. One environmental trig- to escape the defense response of the plant? and renamed University of Karlsruhe, and sev- ger for these processes is light. The group The group uses as model organisms the arbus- eral new Chairs were appointed, among them recently identified phytochrome as one of the cular mycorrhizal fungus Glomus intraradices a new Chair of Microbiology, W. Zumft. One of important photoreceptors in this fungus, and the hemibiotrophic pathogenic fungus the charms of KIT is that within Campus which shows that phytochrome also functions Magnaporthe oryzae. South (the former University of Karlsruhe) outside the plant kingdom. microbiologists are not only members of the Prof. Dr. Tilman Lamparter, Faculty of Chemistry and Biosciences, but Prof. Dr. Jörg Kämper, Photobiology of plants and bacteria also of the Faculties of Chemical Engineering Molecular Phytopathology Botanical Institute, Faculty of Chemistry (Institute of Life Sciences Engineering), Civ- Institute for Applied Biosciences, Dept. of and Biosciences; http://www.rz.uni- il Engineering, and Geo- and Environmental Genetics, Faculty of Chemistry and Bio- karlsruhe.de/∼db127/ Sciences (Institute of Biology for Engineers sciences; http://genetics.iab.kit.edu/ Agrobacterium tumefaciens is a soil bacteri- and Biotechnology of Wastewater Treatment). The basidiomycete Ustilago maydis is a ubiq- um and a plant pathogen that transfers genes They are also situated at Campus North (for- uitous pathogen of maize and a well-estab- into plants. The photobiology research group merly Forschungszentrum Karlsruhe), at the lished model organism for the study of plant- is interested in the photobiology of A. tume- Institute for Functional Interfaces, and close microbe interactions. This fungus belongs to faciens and of related nitrogen-fixing Rhizo- to Campus South, at the Max-Rubner Insti- the group of biotrophic parasites that depend bia. The two phytochromes of A. tumefaciens tute (formerly Bundesanstalt für Ernährung on living tissue for proliferation and devel- serve as model proteins for biochemical stud- und Lebensmittel). Other microbiology opment. Pathogenic development in U. maydis ies on chromophore protein interaction, pho- research groups are located in the Water Tech- is linked to a dimorphic switch from budding toconversion, modulation of histidine-kinase nology Center (TZW) Karlsruhe or at Geil- to filamentous growth. The main interest of activity and tertiary structure. Initial studies weiler Hof. Since various groups employ the Molecular Phytopathology group is to have led to the discovery of the chromophore microorganisms in a range of technical understand the regulatory networks that link binding site of bacterial phytochromes, which processes, there are many established col- pathogenic development and the morpholog- differs from that of plant phytochromes. laborations with industry. This is also reflect- ical changes of the fungal cell. Expression Agrobacterium tumefaciens contains also two ed in the fact that researchers from the BASF profiling, in combination with reverse genet- photolyases, flavoproteins that repair UV-dam- SE company are integrated into the teaching ic approaches, has led to the identification of aged DNA; these photolyases are also ana- program of the University and are members various novel pathogenicity factors. Another lyzed as recombinant proteins. One of the of this organizing committee. These wide focus of the group is the metabolic repro- photolyases is closely related to plant cryp-
BIOspektrum | Tagungsband 2011 23
tochromes, while the other probably provides KIT, is directed towards practically and tech- circumstances biofilms also represent germ an evolutionary link between photolyases and nically relevant aerobic and anaerobic reservoirs that cause contamination as other DNA repair enzymes. processes for water, wastewater and bio-waste hygienically relevant bacteria. In medicine, treatment, microbial product recovery and bacterial biofilms are the causative agents of Prof. Dr. Christoph Syldatk, soil sanitation procedures. In this context, implant infections and chronic wounds that Institute of Engineering in Life Sciences the following topics are currently under inves- are difficult to treat. As an extremely flexi- (IBLT), Dept. of Technical Biology (Section tigation: bioremediation of soil that was con- ble life form, resistant to a variety of external II); http://tebi.blt.kit.edu/index.php taminated with anti-knocking agents from stressors, natural biofilms are characterized The Section II – Technical Biology research leaded fuel production, biogas and bio-hydro- by our research group by focusing on their group is part of the Faculty of Chemical and gen production from energy crops, bio- and stress and survival strategies, with applica- Process Engineering, and was founded in market waste fractions, degradation of aro- tion fields ranging from environment to 2003 as part of the new Institute of Engi- matic/phenolic compounds in industrial biotechnology and medicine. neering in Life Sciences. It is responsible for wastewater, microbial chitin deproteination providing the fundamentals biology to the and decalcification of shrimp shells of C. cran- Prof. Dr. Rolf Geisen, “Engineering in Life Sciences” (BIW) students, gon (North Sea) or P. monodon (from Indone- Molecular Food Mycology and trains students of “Applied Biology” in sia), and nitrification of saline, ammonia- PD Dr. Charles Franz, enzyme technology and biochemical engi- loaded wastewater. In addition, the fate of Plant Food Fermentation neering. The primary research topics for arsenic and selenium in the groundwater of Max Rubner Institut; around 20 researchers in this group are the Bengal delta and in northern India, and http://www.mri.bund.de/ Microbial Biotechnology and Industrial Bio- the fate and the effect of antibiotics in domes- The Max Rubner Institut is a governmental catalysis. Here, microorganisms can be culti- tic wastewater are investigated. Our research research institute whose task is the analysis vated under S-1- and S-2-conditions, up to 30- is funded by DFG, BMBF, BMZ, AiF and indus- and assessment of health-promoting con- liters per day. These facilities include the pos- try. stituents of foods, as well as food quality and sibility of downstream processing of micro- safety assurance. Within the Department of bial cultures by centrifugation, filtration, cell Prof. Dr.-Ing. Clemens Posten, Safety and Quality of Fruit and Vegetables, disruption and immobilisation of microor- Photo- and Particle Biotechnology which focuses on metabolomics of nutrition- ganisms and enzymes, chromatographic Institute of Engineering in Life Sciences ally important plant secondary metabolites, purification of proteins, and the basic equip- (IBLT), Dept. of Bioprocess Engineering, as well as microbiological safety of plant- ment for molecular biological and genetic Faculty of Chemical Process Engineering; derived products, the group of Prof. Dr. Rolf engineering experiments, such as standard http://bvt.blt.kit.edu/ Geisen is working on the regulation of fun- HPLC-, TLC- and GC-analytical equipment, as Microalgae show enormous potential for the gal mycotoxin production in foods. The role well as a special laboratory dedicated to stud- production of high value products in the phar- of food-relevant environmental conditions and ies on the cultivation of marine sponges and maceutical and cosmetic industries, but are transmittance via signal transduction path- associated microorganisms. increasingly discussed with regards to their ways to regulate transcription of mycotoxin Researchers working in the field of Micro- production of middle and low cost products, biosynthetic genes are being analyzed. The bial Biotechnology are currently developing a such as fine chemicals, food or animal feed. research group of PD Dr. Charles Franz process to produce microbial bio-surfactants. Closed photo-bioreactors are employed to pro- focuses on plant food fermentation and the
They are also investigating aspects of the “in- duce light and CO2 in large scale production. development of starter cultures for malolactic vitro”-cultivation of marine sponges and the In the research group of Clemens Posten, fermentation of wine, to improve the quality role of associated microorganisms, as well as growth and product formation kinetics are of wines. Other research is centred on the the production of special yeast and fungal studied to understand the specific behavior effect of secondary plant compounds on metabolites. In the field of Industrial Bio- of microalgae, such as Porphyridium or human gut microflora biodiversity, as well as catalysis, the focus is on production of unnat- Chlamydomonas, under production condi- the metabolism of these compounds by gut ural α- and β-amino acids, the enzymatic tions. Reactor design is optimized based on bacteria. hydrolysis of linear and cyclic amides, as well intra- and extracellular measurements; thus, as enzymatic modification and synthesis of the reactors are developed “around the cells”. Dr. Andreas Tiehm, surface- and interfacial-active compounds, Environmental Biotechnology including aspects of enzyme immobilisation, Prof. Dr. Ursula Obst, Dr. Beate Hambsch, such as to magnetic carriers, and process Interface Microbiology Drinking Water Microbiology development. Institute for Functional Interfaces, DVGW-Technologiezentrum Wasser Campus North, Faculty for Chemical and (TZW); www.tzw.de Prof. Dr. Josef Winter, Process Engineering; The TZW is part of the Institute for Applied PD Dr. Claudia Gallert, http://www.ifg.kit.edu/58_188.php Water Research of the DVGW, the German Institute of Biology for Engineers and Biofilms are assemblies of adhesive microor- Gas- and Waterworks Association. The Biotechnology of Wastewater Treatment ganisms on surfaces, and are ubiquitous in TZW provides a link between the fundamen- (IBA); http://www.iba.kit.edu the environment. As biological filters, they tal research undertaken at universities The research of IBA, Faculty of Civil Engi- are part of natural and technical large-scale and water treatment companies. It is contact neering, Geo- and Environmental Sciences of processing systems; however, under certain point for authorities, ministries and associa-
BIOspektrum | Tagungsband 2011 INSTITUTSPORTRAIT
Grundlagen der Mikrobiologie
4. Auflage