STEFANO BIFFANI Istituto di Biologia e Biotecnologia Agraria (IBBA) Associazione Italiana Allevatori
…di cosa parleremo 1. Il ruolo di AssoNapa 2. Progetto CHEESR – Sottomisura 10.2 PSRN 2014-2020 3. Gli strumenti selettivi oggi – Indici Tradizionali 4. Gli strumenti selettivi domani – Indici Genomici
Master sulla riproduzione e sulla genetica caprina
1 …di cosa parleremo
1. Il ruolo di AssoNapa
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Ruolo di Asso.Na.Pa. nel sistema zootecnico italiano
Svolge per il Ministero delle Politiche Agricole Alimentari e Forestali le seguenti attività: • L'istituzione, il funzionamento e la gestione dei Libri Genealogici e dei Registri Anagrafici attraverso l'Ufficio Centrale; • Miglioramento genetico degli Ovini e dei Caprini • Tutela della Biodiversità e valorizzazione degli allevamenti.
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2 Numero di razze allevate per Regione
REGIONE RAZZE OVINE RAZZE CAPRINE Abruzzo 20 5 Basilicata 15 14 Calabria 5 14 Campania 4 7 Emilia Romagna 17 5 Friuli Venezia Giulia 5 4 Lazio 15 12 Liguria 4 5 Lombardia 9 10 Marche 11 2 Molise 5 1 Piemonte 14 13 Puglia 11 7 Sardegna 9 11 Sicilia 18 10 Toscana 15 7 Trentino Alto Adige 8 6 Umbria 11 5 Valle D'aosta 1 6 Veneto 9 4 Master sulla riproduzione e sulla genetica caprina
…di cosa parleremo
2. Progetto CHEESR – Sottomisura 10.2 PSRN 2014-2020
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3 Conservation, Health and Efficiency Empowerment of Small Ruminant PSRN (CHEESR) SALVAGUARDIA DELLA BIODIVERSITA’ PSRN 2014-2020 (Biodiversità) – Sottomisura 10.2
MASTER SULLA RIPRODUZIONE E SULLA GENETICA CAPRINA
Introdurre nell’ambito del comparto ovi-caprino nazionale una serie di azioni legate alla raccolta e all’utilizzo di dati fenotipici e OBIETTIVI GENERALI molecolari allo scopo di rendere l’allevamento sostenibile e competitivo.
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4 Ovini: 48 razze Caprini: 35 razze
11 casi studio
OBIETTIVI su cui si svilupperanno attività GENERALI innovative tramite azioni di caratterizzazione fenotipica e genetica che potranno poi essere estese a tutte le altre razze
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Razze di Libro Razze di Registro Genealogico: Anagrafico: • Pecora Sarda • Pecora Istriana • Pecora • Gentile di Puglia Comisana • Capra Garganica • Pecora Massese • Capra • Pecora Nicastrese OBIETTIVI Fabrianese GENERALI • Pecora delle Langhe • Capra Camosciata delle Alpi • Capra Saanen
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5 OBIETTIVI 72 razze su cui si svilupperanno GENERALI attività nuove basate su dati anagrafici e fenotipici tradizionali
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• Introduzione della valutazione GENOMICA per la razza Sarda, Comisana, Massese, Camosciata delle Alpi e Saanen (velocizzare il progresso genetico) ATTIVITA’ PREVISTE NEL Verranno genotipizzate: PSRN - 2400 Camosciata delle Alpi (in popolazione) - 1200 Saanen (in popolazione) - 1500 Pecore Sarde (in popolazione e Centro Arieti) - 400 Comisane (Centro Genetico) - 200 Massesi (Centro Genetico)
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6 Caratterizzazione GENOMICA di 6 tipi genetici autoctoni a limitata diffusione
Razze interessate: Pecora Istriana, Pecora delle Langhe, Pecora Fabrianese, Pecora Gentile di Puglia, Capra Nicastrese e Capra Garganica.
ATTIVITA’ PREVISTE NEL Criteri del campionamento per la genotipizzazione: PSRN - Scelta dei soggetti fatta sulla base delle informazioni disponibili L.G. e R.A. - 100 campioni/individui per razza prelevati da più allevamenti - 2 razze per anno
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• Calcolo della consanguineità e del rischio estinzione,
ATTIVITA’ adozioni di piani di PREVISTE NEL PSRN accoppiamento per tutte le razze di RA;
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7 • Raccolta di fenotipi in stazione di controllo • nematodi gastrointestinali • benessere (e.g. sanità della ATTIVITA’ PREVISTE NEL mammella, locomozione, BCS), PSRN • efficienza produttiva e riproduttiva (n. parti, n. ritorni in calore, n. nati);
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• Costituzione BioBanca • salvaguardia delle risorse
ATTIVITA’ genetiche attraverso la PREVISTE NEL PSRN raccolta e la conservazione di materiale rappresentativo della
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8 Istituzioni Scientifiche UniMi, CNR, AssoNaPa Allevatori SUPPORTO UniSS, UniNA, TECNICO/SCIENTI UniPG FICO
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3. Gli strumenti selettivi oggi – Indici Tradizionali
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9 Miglioramento genetico
1. Fenotipo = Genotipo + Ambiente 1. Fenotipo : performance osservata 2. Genotipo : geni che controllano l’espressione del carattere 3. Ambiente : tutto ciò che non è genetico (alimentazione, clima, zona, età, …)
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Miglioramento genetico I geni passano da una generazione all’altra mentre l’ambiente può variare indipendentemente dalla nostra volontà !
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10 1. Stimare il valore genetico di ogni individuo della popolazione (EBV – Indice genetico )
2. Utilizzare l’indice per fare selezione (scegliere ) e per accoppiare gli animali
3. Migliorare le produzioni (progresso genetico )
3. Migliorare le produzioni (progresso genetico ) Cosa influenza il progresso genetico: 1. Accuratezza Indici 2. Intervallo di generazione 3. Utilizzo di tutte le vie selettive (maschi e femmine )
11 AssoNaPa e Selezione • 2015 – impulso e valorizzazione delle valutazioni genetiche
• Caprini: • Saanen e Camosciata
• Calcolo Indici Genetici per • Latte, Grasso e Proteina (Kg e %) • Morfologia • Indice Aggregato Produzione • Indice Aggregato Produzione e Morfologia
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AssoNaPa e Selezione • 2015 – impulso e valorizzazione delle valutazioni genetiche
• Caprini: Saanen e Camosciata
• Indici Aggregati Produzione
• Qualità : 20% Grasso kg + 80% Proteina kg
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12 AssoNaPa e Selezione • 2015 – impulso e valorizzazione delle valutazioni genetiche
• Caprini: Saanen e Camosciata
• Indici aggregati Produzione e Morfologia
• Globale : Qualità + Morfologia • Distanza fra i Garretti (6%) • Profilo della Mammella (6%) • Orientamento dei capezzoli (6%) • Attacco posteriore della mammella (6%) • Posizione impianto della Mammella (6%) • Indice Grasso Kg (15%) • Indice Proteina Kg (55%)
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AssoNaPa e Selezione • 2015 – impulso e valorizzazione delle valutazioni genetiche
• Caprini: • Saanen e Camosciata
• Informazioni disponibili sul sito: • Elenco Completo Soggetti • Informazioni su singolo individui • Valore genetico di tutti i miei animali: • Estratto Genetico • Accoppiamenti con Becchi Aziendali: • Piano Genetico • Accoppiamenti con Becchi FA: • Piano Genetico FA (consanguineitàconsanguineità )
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13 AssoNaPa e Selezione
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AssoNaPa e Selezione
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14 AssoNaPa e Selezione
anagrafica
produzione
morfologia
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15 AssoNaPa e Selezione
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16 AssoNaPa e Selezione
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17 AssoNaPa e Selezione • 2015 – impulso e valorizzazione delle valutazioni genetiche
• Caprini: • Saanen e Camosciata
• Programma x PC controllori/tecnici: • Risultato accoppiamenti • Becchi aziendali e becchi FA • Scelta madri di becco
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18 AssoNaPa e Selezione
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AssoNaPa e Selezione • 2015 – impulso e valorizzazione delle valutazioni genetiche
• Caprini: Saanen e Camosciata
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19 AssoNaPa e Selezione • 2015 – impulso e valorizzazione delle valutazioni genetiche
• Caprini: Saanen e Camosciata
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…di cosa parleremo
4. Gli strumenti selettivi domani – Indici Genomici
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20 La nuova era della selezione Genomica
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La nuova era della selezione Genomica
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21 Come funziona la selezione Genomica? 1. Possibilità di eseguire un test genomico a partire da un campione biologico e di leggere parte del dna
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Come funziona la selezione Genomica?
2. Dare un valore a quello che è stato letto a partire da un fenotipo
-200
+200
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22 Come funziona la selezione Genomica?
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Quali sono i vantaggi della selezione Genomica?
Maggiore Accuratezza
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23 Quali sono i vantaggi della selezione Genomica?
Intervalli di generazione più brevi
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Quali sono i vantaggi della selezione Genomica?
Maggiore intensità di selezione
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24 Quali sono i vantaggi della selezione Genomica?
Scelta ottimale dei fratelli pieni
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Quali sono i vantaggi della selezione Genomica?
Ridimensionamento delle prove di progenie
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25 Quali sono i vantaggi della selezione Genomica? Maggior progresso genetico
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Quando funziona la Genomica?
•Ottimi risultati «entro» razza •Popolazioni di riferimento di grandi dimensioni •Ampio utilizzo dell’inseminazione artificiale
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26 Quando funziona la Genomica? •Scambi internazionali •Buona raccolta fenotipi •Rapporto costo ( chip ) / beneficio ( maggior guadagno )
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Quando funziona la Genomica? •Ovi-caprini ????
•Cosa fare????
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27 Quando funziona la Genomica?
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Quando funziona la Genomica?
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28 Quando funziona la Genomica?
…si ma…popolazioni grandi, schema selettivo strutturato…
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Approccio alternativo !!!!
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29 Approccio alternativo !!!! •Genotipizzo solo alcuni animali (maschi e femmine) •Inserisco queste informazioni nel metodo tradizionale ( dati e anagrafica )
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Approccio alternativo !!!! •Single-step = unico passaggio •Non ho bisogno di popolazione di riferimento •«Inserisco» i genotipi nel calcolo
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30 Approccio alternativo !!!!
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Vale la pena ? •Accuratezza : aumento del 10- 30% rispetto al metodo tradizionale
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31 Vale la pena ? •Posso genotipizzare animali giovani
•Posso valorizzare le femmine
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Vale la pena ? •Posso gestire la rimonta
•Non + necessaria una prova di progenie tradizionale
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32 In concreto
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In concreto •2018 – campagna raccolta campioni • Soggetti scelti sulla base del contributo genetico (tampone nasale) • Soggetti giovani (tampone nasale) • Costi genotipo a carico del progetto CHEESR (adesione allevatori)
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33 In concreto •2018 – campagna raccolta campioni • Utilizzo genotipi • per stima indici Genomici • pannello ridotto per parentela (gestione gruppi di monta)
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La nuova era della selezione Genomica
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34 La nuova era della selezione Genomica
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