Gérer ses références bibliographiques avec

Elsa Poupardin / Strasbourg Mars 2012

A partir du travail de Marie Laure Malingre Plan

 Présentation / Installation / Interface  Récupérer des références, les organiser, créer une bibliographie, tri et recherche,  Plugin d’insertion pour traitement de texte  Captures web  export, marqueurs  Compte Zotero en ligne : Fonctions collaboratives

2 Quels besoins ?

 Importer automatiquement des lots de références résultant de recherches documentaires (bases de données ou pages web)

 Exploiter facilement de gros corpus de références

 Récupérer ses références  pour la rédaction d’un travail scientifique (citations, bibliographie en fin d’article)  pour l’élaboration rapide d’une bibliographie, d’un produit documentaire spécifique (liste des publications d’un établissement, d’un labo, listes d’acquisition, etc.)

 Pouvoir appliquer à ses références un style de présentation conforme aux normes (thèse, revues scientifiques)

 Faire une saisie unique des données et adapter ensuite en fonction de la publication à éditer

3 Les outils de bibliographie Deux types d’outils de gestion de bibliographie :

 Outils en « local » : (gratuit), biblioexpress (gratuit), Zotero (gratuit), Jabref (gratuit), OOo (gratuit), … Endnote, Refmanager…  Outils en « ligne » : Basilic (gratuit) CiteULike (gratuit) (gratuit) , Wikindx, WizFolio Web 2.0. EndNote Web, Zotero 3.0

4 Qu’est-ce que Zotero ?

Un outil de gestion de références et de signets Site de référence : http://www.zotero.org

  Une extension (plugin) de Firefox Téléchargement de la version 3.0  À partir de la version 2 de Firefox  Depuis la version 2, synchronisation et accès aux références en ligne via  Open source : logiciel libre et gratuit un serveur  Avec Firefox 6  Lancé en octobre 2006 par le Centre for History and New Media) de l’Université  Annonce du 22/09/2010 : George Mason (USA)  « Zotero Everywhere »   Soutenu par divers organismes, dont la Zotero indépendant Andrew W. Mellon Foundation  API / gestion web et mobiles de bibliothèques Zotero  « ZoteroCommons »

5 Prérequis logiciels  Zotero nécessite l’installation du navigateur Firefox. Flock et Netscape sont aussi compatibles, pas Internet Explorer ni Opera  Pour Windows, Mac, ou

Pour Chrome : Zotero Standalone

6 Quelques ressources sur Zotero

 Le site de Zotero, http://www.zotero.org  En particulier fr/quick start guide  Le blog francophone de Zotero, http://zotero.hypotheses.org  Manuel Zotero (Hospices Civils de Lyon), http://portaildoc.chu- lyon.fr/hcldoc/uploads/media/manuel_Zotero.pdf  Fiche Zotero / ECLORE, http://www.projet-plume.org/ressource/eclore  FAQ Zotero / URFIST de Nice, http://wiki- urfist.unice.fr/wiki_urfist/index.php/ZOTERO_un_Logiciel_de_bibliographie_2. 0  Supports pédagogiques (nombreux sur Slideshare)  Perrine Helly, http://www.slideshare.net/phelly/zotero-formation-de- formateurs  François Magnan, http://www.urfist.cict.fr/IMG/ppt_zotero.ppt  … 7 Qu’est-ce que Zotero ?

8 9 Premières références Zotero

Récupération d’un lot de références : cliquer sur le dossier  Récupération de références

 Ex : requête « téléphonie mobile » sur ScienceDirect ou sur le SUDOC, (http://www.sudoc. abes.fr/)

10 Premières références Zotero

 Récupération de références

Sélectionner les références que l’on souhaite récupérer

11 Premières références Zotero.

 Récupération de références

Récupération du fichier PDF associé à la référence

12 Des problèmes pour récupérer les références ?

 Problème :  Pas d’icône zotero dans la barre d’adresse  Échec de l’enregistrement  Ex : Dans ScienceDirect

 Une solution :  Enregistrer les résultats sous forme d’un fichier au format RIS ou BibTeX  Importer ensuite le fichier dans Zotero  Si dans les Préférences, on a coché « Utiliser Zotero pour les fichiers RIS/ téléchargés », on aura un import automatique dans Zotero

13 L’interface de travail de Zotero

L’interface de Zotero : en 3 panneaux

La bibliothèque et ses collections

La liste des références d’une collection donnée

Le détail de la référence sélectionnée

+ la barre d’outils et le panneau des marqueurs

14 L’interface de travail de Zotero

Liste des signets / références Une référence

Bibliothèque et ses collections

Panneau des marqueurs

15 + Requêtes L’interface de travail de Zotero

 La barre d’outils

16 L’interface de travail de Zotero

 La barre d’outils  Créer une nouvelle collection (ou une sous-collection)

 Créer un nouveau groupe

 Actions : Importer, exporter une bibliothèque, créer une chronologie, gérer les préférences …

 Nouvel élément : créer un type de document et faire le lien vers le fichier de texte intégral

 Créer un nouvel élément à partir de la page courante = à partir de la page ouverte dans le navigateur en utilisant les métadonnées du site; une capture d’écran est liée à la notice 17 L’interface de travail de Zotero

 Créer une référence à partir  Recherche dans la base de l’identifiant du document  Recherche avancée (ISBN, DOI ou PMID)  Boîte de recherche simple

 Créer une note  Synchronisation des données  Indépendante avec le serveur Zotero  Liée à une référence  Passage en mode plein écran  Attacher  Une capture de la page courante  Fermeture de l’interface  Le lien vers la page courante Zotero  Une copie d’un fichier  Le lien vers le fichier

18 Importer des références  Sites « Zotero compatibles » :  voir http://www.zotero.org/translators  ex : ScienceDirect, Google Scholar et Books, PubMed, Amazon, Revues.org, Citeseer, Bases Ebsco Host, SUDOC …  Plateformes de partage de références comme CiteUlike  Icone dans la barre d’adresse

 Sites partiellement compatibles (ex : HAL)

 Récupération sur les sites compatibles  de références multiples (en cliquant sur le dossier jaune dans barre d’adresse)

 référence par référence (en cliquant sur l’icône de document)

19 Source des images : Maire - AgroParisTech-Engref, Montpellier Importer des références

 Import d’un ensemble de références

 Import de références individualisées

 Alimenter la base en choisissant diverses sources Créer une entrée dans Zotero. Clique droit de la souris sur l’élément  Importer refs à partir d'un pdf et choisir Retrieve Metadata from Télécharger un fichier pdf. PDF. Cette fonctionnalité ne marchera que si le créateur du pdf a structuré son

20 document Importer des références

 Références de pages web

 Création d’un élément à partir de la page web courante (métadonnées)  Capture d’écran  État de la page à un moment donné

 Choisir la collection adéquate

21 Importer des références

 Références de pages web

 Attacher à une référence existante :  Une capture de la page courante  Un lien vers la page courante  La copie d’un fichier local  Le lien vers un fichier

22 Manipuler les captures de pages web

Il est possible d’annoter et de surligner les captures web

23 Exercices de capture de références

 Trouver et classer entre 20 et 50 références.  Catalogue du Sudoc, rechercher des (références de…) articles de périodiques, livres, matériel audio-visuel, de thèses  Capturer des références sur la librairie Amazon, ou autre catalogue de votre choix : Revue.org, Youtube, Flickr, etc...  Comment faire sur FNAC ou GIBERT ?  Veiller à vérifier les références finales...

24 Exercices de capture de documents  Sur archivesic, tel thèses (ou autres sites compatibles) et sur des sites non compatibles : http://alor.univ-montp3.fr/cerce/r8/a.c.htm et www.melissa.ens-cachan.fr/spip.php?rubrique160  récupérer des docs. pdf, (avec leurs références) en testant les différentes méthodes de récupération : avec document ouvert, ou en le téléchargeant sur l'ordinateur, puis le stocker dans zotero  Faites de simples liens vers des pages web  Au total, 5 documents récupérés avec leurs références et 5 liens

25 Importer des références

 Importer des fichiers de références depuis d’autres logiciels

 Ex : formats RIS, bibteX

 Utiliser le menu Actions > Importer, après avoir fait une procédure d’export de fichier sous l’autre outil bibliographique

26 Créer et manipuler des références

Une référence complète : onglet info

27 Créer et manipuler des références

 Créer une nouvelle référence

28 Créer et manipuler des références

 La référence

 Onglet Info = les différents éléments de la référence  Localiser : résolveur de lien  Afficher … : la capture d’écran, le fichier, la page

 Onglets Marqueurs = possibilité d’apposer des tags (mots clés libres) sur une référence

 Onglet Connexe = possibilité de faire un lien entre deux éléments (référence, notes)

29 Créer et manipuler des références

 La référence

 Bouton « Afficher » / Onglet Info  Afficher : Afficher le fichier, Afficher la page ou la capture d’écran liés à une référence

 Bouton « Localiser » / Onglet Info  Pour lancer le résolveur de lien OpenURL à partir des données bibliographiques de l’élément  Voir les préférences générales de Zotero pour le paramétrage du serveur de résolution

30 Créer et manipuler des références

Les types de référence

 Menu déroulant

 34 types de références

31 Créer et manipuler des références  Ensemble de champs pour chaque type de référence

32 Créer et manipuler des références

 Entrée manuelle de nouveaux éléments et / ou modification des éléments importés

 Zone de modification des éléments

33 Créer et manipuler des références

 Modifier une référence

Ajout de données supplémentaires

Modification d’un champ

34 Classer, organiser, gérer ses références

 Ma bibliothèque

Contient toutes les références

35 Classer, organiser, gérer ses références Clic droit

 Gestion des collections de la bibliothèque  Créer une collection / des sous-collections  Nouvelle sous-collection  Renommer la collection  Supprimer la collection  Exporter la collection  Classer les références

C’est la collection sélectionnée qui reçoit les références importées Déplacement d’éléments par glisser- déposer dans une collection 36 Classer, organiser, gérer ses références

Gestion de la base personnelle

 Modification de références  Gestion du texte intégral  Recherche dans la base  Tri des notices  Ajout de notes de lecture  Ajout de tags (marqueurs)  Export de la bibliothèque de références  Lien de deux notices

37 Classer, organiser, gérer ses références

 Enrichir ses références : annoter ses collections de références Ajouter un tag

Afficher les tags et rechercher par tag

38 Classer, organiser, gérer ses références

 Créer une note indépendante ou liée à une  Zone de création de référence la note

39 Classer, organiser, gérer ses références

 Capturer la page courante : page figée  Enregistrer le lien vers la page courante : l’URL de la page  Stocker une copie du fichier : lien plus pérenne (stockage dans un sous-répertoire du dossier système de zotero  Lien vers un fichier : lien vers fichier stocké en local (Mes documents, bureau)

40 Classer, organiser, gérer ses références

Glisser / Déposer du PDF sous la référence sélectionnée

41 Classer, organiser, gérer ses références

 Recherche dans la bibliothèque de références

Fenêtre de Possibilité recherche d’enregistrer avancée, la recherche accessible par la barre d’outils

42 L’interface de travail de Zotero

Actions > Préférences dans la barre d’outils

1er onglet : Préférences générales

43 L’interface de travail de Zotero

Actions > Préférences dans la barre d’outils

2ème onglet : Sync, pour synchroniser les données de la bibliothèque sur le serveur Zotero et créer une bibliothèque en ligne

44 L’interface de travail de Zotero

Actions > Préférences dans la barre d’outils

3ème onglet : Recherche, pour l’indexation et la gestion des documents en texte intégral

45 L’interface de travail de Zotero

Actions > Préférences dans la barre d’outils

4ème onglet : Exportation, pour paramétrer les options de copie rapide et l’encodage des caractères

46 L’interface de travail de Zotero

Actions > Préférences dans la barre d’outils

5ème onglet : Styles, pour choisir les styles à afficher par défaut dans le gestionnaire de bibliographie

47 L’interface de travail de Zotero

Actions > Préférences dans la barre d’outils

6ème onglet : pour définir des proxies

48 L’interface de travail de Zotero

Actions > Préférences dans la barre d’outils

7ème onglet : Raccourcis clavier

49 L’interface de travail de Zotero

Actions > Préférences dans la barre d’outils

8ème onglet : Préférences avancées

50 Sauver vos données

On peut faire une sauvegarde de la bibliothèque dans le format Zotero RDF mais cela ne donne pas une copie exacte de votre base. Il est préférable de localiser votre bibliothèque Zotero (Préférences  Avancées), de fermer Firefox et de copier les données de votre répertoire Zotero vers un emplacement de sauvegarde, de préférence sur un autre périphérique de stockage. Styles bibliographiques et Zotero Avertissement Il conviendra avant tout de bien cerner les besoins en terme de présentation de références bibliographiques... Il faudra trouver le style proposé par Zotero le plus proche de ces besoins

53 Deux genres de styles de citation gérés par Zotero

 a) Styles de citation au format auteur date. Sources citées dans le texte, généralement entre parenthèses, avec nom de l’auteur et date de publication. En Afrique, le paludisme est responsable de la mort de plus d'un million de personnes à chaque année. Lutter contre ce fléau demande la concertation de plusieurs intervenants. (Organisation mondiale de la par santé, 2000, p. 5-7) ex. => Une bibliographie finale complète les références en fin du document (ordre alphabétique nom d'auteur)

54 1/Numéros dans le corps du texte

2/ Citations : références biblio. de la page ou de la section classés selon ordre d'apparition dans le texte 3/ Bibliographie complète et finale 55 b) Styles de citation avec numérotation proposés par Zotero  Eléments 1 et 2 (cf diapo précédente) Chicago Manual of Style : note without bibliography Modern Humanities Research Association (Note without Bibliography)

Eléments 1 et 2 et 3(cf diapo précédente) Modern Humanities Research Association (Note with Bibliography) Chicago Manual of Style : full note with bibliography Chicago Manual of Style : note with bibliography

 Eléments 1 et 3 (cf diapo précédente) American Medical Association Biblio finale classée IEEE selon ordre alpha. National Library of medecine auteurs Nature Journal

Biblio finale classée selon ordre apparition dans le texte 56 a) Styles au format (auteur date) proposés par Zotero

 American Political Association  American Psychological Association  American Sociological Association  Chicago Manual of Style author date format  Harvard reference format 1 (author date)  Modern Langage Association

Quelques styles français : https://www.zotero.org/trac/ticket/1216 Ou sur http://zotero.hypotheses.org/category/styles 57 Produire une bibliographie

 Générer automatiquement une bibliographie

En utilisant le menu contextuel à partir de la collection souhaitée (clic droit) : « Créer une bibliographie… »

58 Produire une bibliographie

 Formater sa bibliographie  Utilisation des styles fournis par Zotero

Voir dans les Enregistrement préférences en format RTF le style par ou HTML défaut

59 Produire une bibliographie

60 Produire une bibliographie Le Gestionnaire de styles

Pour chercher d’autres styles dans le Répertoire Zotero de Styles Pour récupérer un style stocké en 61 local Produire une bibliographie  Styles Zotero

 Choix de styles par défaut dans l’interface (15 styles)

 Voir aussi http://www.zotero.org/styles  Possibilité d’installer d’autres styles  Aperçu du style en positionnant la souris sur le lien

 Pas d’interface graphique de modification ou de création de style

 Création de style avec le langage CSL  Le générateur CSL de Zotero : chrome://zotero/content/tools/csledit.xul  Utilisation possible aussi de Simple Style Generator http://www.somwhere.org/csl/  Projet de styles francophones de Zotero : https://www.zotero.org/trac/ticket/1216

62 Produire un rapport Option du menu contextuel : « générer un rapport à partir de la collection

63 Styles supplémentaires site Zotero

 Des nouveaux styles sont proposés sur une page de dépôt : http://www.zotero.org/styles : ils s’installent automatiquement (clic sur Install)  Passer le curseur de la souris sur ces styles permet d'avoir un aperçu du style..

64 Styles supplémentaires site Endnote

 Endnote propose de télécharger, à l'adresse http://www.endnote.com/support/enstyles-terms.asp des styles, légalement réservés aux utilisateurs d'Endnote

 Techniquement , ces fichiers de style peuvent être utilisés par Zotero : Préférences, puis choisir

65 Créer un style personnalisé  Réservé à un public averti.  Pb de compatibilité des CSL

 Possible cependant : Pour cela Utiliser un langage XML : le CSL (Citation Style Language) voir dev.zotero.org/creating_citation_styles Puis enregistrer le code produit sous l’extension CSL, ouvrir le fichier CSL (préférences/styles) : le nouveau style s’intègrera

66 Zotero et Word ou Open-Office Utiliser Zotero dans Word ou Open Office  Citer dans un traitement de texte depuis Zotero Barre d’outils Zotero dans Word Créer la bibliographie Modifier les préférences du document

Supprimer les Insérer une codes référence

Rafraîchir Editer une Editer la l’affichage des référence bibliographie références

68 Exercice  Chercher le bon style, comprenez-vous les différentes catégories de style de Zotero ?  Pour les exercices, choisir un style « avec bibliographie »  Dans un document word, insérer plusieurs citations, les modifier,  Constituer une bibliographie finale, puis la modifier  Changez de style en cours de route  Insertion de sources multiples  Se servir de l’éditeur de citation (Clic sur montrer l’éditeur lors de l’insertion d’une citation)

69 Classer, organiser, gérer ses références

 Créer une chronologie  Menu Actions

70 Exporter la bibliothèque

 Menu Actions > Exporter la bibliothèque

 Formats d’export :  Zotero RDF, MODS, RIS, Refer / BibiX, Unqualified Dublin Core RDF, Wikipedia Citation Templates, BibTeX

71 Utiliser Zotero en ligne

 Version 3.0

 Création d’un compte sur le serveur Zotero  Accès à My Library  Groupes  Zotero People

 Possibilité de synchroniser ses références

 Partage des références

72 Utiliser Zotero en ligne

 Fonctions collaboratives : Zotero 3.0 La synchronisation :

 Synchronisation de la bibliothèque / serveur Zotero

 Sauvegarde et consultation en ligne via le site web et compte utilisateur zotero

 Synchronisation des documents attachés avec un serveur WebDav / Zotero Ex Dropbox: http://db.tt/smlfWcY 73 Utiliser Zotero en ligne

Bouton de synchronisation

74 Utiliser Zotero en ligne

 Synchronisation des données

Paramétrage de la synchronisation

75 Utiliser Zotero en ligne

 La bibliothèque en ligne

 Gratuit jusqu’à 100mb

 Attention : problème des PDF partagés en public

76 Utiliser Zotero en ligne

Création de groupes

77 Utiliser Zotero en ligne

Paramétrage du groupe

78 Utiliser Zotero en ligne  Définition du groupe :

 Nom  Description  Statut  Disciplines concernées  Logo, image  Page web  Commentaires

 Gestion des membres

 Options pour la gestion de la bibliothèque

79 Utiliser Zotero en ligne

Un exemple : la bibliothèque du groupe Boîte à outils (pour les historiens)

80 Utiliser Zotero en ligne

Groupes Zotero

81 Utiliser Zotero en ligne

 Création de groupes privés ou publics / interaction avec les bibliothèques propres à des groupes définis

 Réseaux de personnes

 Suivi de bibliothèques publiques par flux RSS

82 Edition et modification des styles Zotero Date 10 février 2011

Un des principal reproche que l’on peut faire à Zotero, contrairement à un logiciel comme Bibus, concerne l’édition et la modification des styles de publication existants afin de réaliser son “propre” style. Il existe un utilitaire qui permet de personnaliser une feuille de style déjà existante . Il faut pour cela utiliser un outil local dans Firefox en tapant “chrome://zotero/content/tools/csledit.xul” dans la barre d’adresse pour permettre l’édition et la modification d’un style pré-existant… Vous trouverez plus de détails dans un tutoriel à l’adresse suivante http://www.thomaslienhard.fr/TutorielZotero.html

J’en profite pour signaler également un autre outil très utile: “chrome://zotero/content/tools/cslpreview.xul”, toujours à taper dans la barre d’adresse de Zotero, qui permet de visualiser dans une même fenêtre une ou plusieurs références bibliographiques dans tous les styles disponibles dans son propre Zotero.